PROSITE entry PS51324
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | ERV_ALR |
Accession [info] | PS51324 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JUL-2007 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51324 |
Associated ProRule [info] | PRU00654 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | ERV/ALR sulfhydryl oxidase domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=102; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=97; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5420535; R2=0.0166957; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5911.2314453; R2=2.7853107; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=357; H_SCORE=6906; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=238; H_SCORE=6574; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -4, 3,-10, -1, -4,-14, -5, -2,-20, -7,-23,-14, 11,-14, -5, -7, 12, 4,-17,-29, -9, -5; /M: SY='P'; M= -6, -5,-23, -3, -2,-23, -5,-11,-20, -4,-21,-14, -3, 7, -4, -7, 1, -5,-18,-28,-17, -5; /M: SY='P'; M= -7,-16,-21,-17,-12, -6,-19,-19, -6,-15,-10, -8,-12, 12,-15,-17, -7, -3, -7,-21,-12,-15; /M: SY='D'; M= -7, 14,-21, 18, 8,-28, -4, -3,-26, -3,-22,-17, 9,-13, 2, -5, 4, -3,-21,-31,-17, 5; /M: SY='P'; M= -8,-15,-26,-15, -7,-10,-22,-13, -9, -5, -9, -6,-13, 11, -7, -3, -7, 1,-10,-20, -5,-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M= -9, 6,-25, 6, 7,-24,-12, -1,-25, 12,-22,-14, 9,-14, 5, 20, 1, -4,-20,-28,-14, 4; /M: SY='G'; M= -4, -9,-26, -8, -1,-19, 9,-16,-16,-13,-12,-10, -7,-16, -9,-14, -3, -8,-13,-20,-17, -6; /M: SY='W'; M=-16,-31,-29,-34,-25, 29,-27,-16, 4,-24, 13, 4,-28,-29,-23,-18,-27,-14, -3, 35, 26,-23; /M: SY='G'; M= -2,-11,-26,-11,-16,-21, 35,-19,-27,-18,-23,-16, -3, -7,-17,-18, 1, -8,-21,-23,-24,-17; /M: SY='C'; M=-12, -8, 24,-13,-11,-22,-21,-15,-24, -7,-23,-17, -3, 0,-12, -3, -6, -7,-19,-37,-23,-14; /M: SY='G'; M= 13, -5,-19, -8, -8,-22, 14, -3,-23,-11,-22,-14, 2,-12, -7,-12, 12, -2,-16,-26,-17, -9; /M: SY='L'; M= -7,-19,-21,-22,-19, 5,-10,-14, 2,-20, 10, 7,-16,-23,-17,-16,-10, -2, 1,-16, 3,-18; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='T'; M= -7,-13,-19,-18,-14, 6,-22,-15, -1,-10, 4, 1,-10,-20,-14, -9, -6, 7, 0,-18, 2,-14; /M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-30,-21, 20,-28,-20, 13,-26, 28, 13,-22,-26,-22,-19,-19, -2, 8,-15, 4,-21; /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-31,-22, 22,-29,-17, 16,-27, 30, 14,-23,-28,-22,-20,-24, -9, 8,-10, 12,-22; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='T'; M= 7, -8,-12,-15,-11, -8,-15,-14,-11,-11,-10, -8, -6,-15, -9,-12, 9, 17, -5,-14, -5,-10; /M: SY='L'; M= -4,-25,-21,-29,-21, 3,-24,-17, 17,-22, 19, 14,-22,-24,-17,-19,-17, -7, 13,-15, 0,-20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 26, -9,-10,-16,-11,-15, -8,-19, -6,-12,-10, -8, -8,-13,-10,-16, 14, 11, 4,-27,-16,-11; /M: SY='A'; M= 16,-10,-15,-13, -9,-11,-13,-15, -3,-13, -7, -6, -9,-16,-12,-17, 5, 0, 6,-26,-13,-10; /M: SY='N'; M= -3, 0,-22, -4, -2,-16, -6, -5,-18, 0,-18,-11, 6,-16, 1, 3, 4, 0,-16,-22, -8, -1; /M: SY='Y'; M=-10,-17,-15,-20,-18, 14,-25, 6, -3,-14, -1, 0,-14,-26,-13,-11,-12, -6, -5, -1, 32,-18; /M: SY='P'; M= -5,-17,-32,-12, -4,-22,-17,-19,-13, -8,-17,-12,-16, 46,-10,-15, -9, -8,-17,-28,-22,-10; /M: SY='D'; M= -7, 8,-24, 10, 3,-21,-14, -5,-15, 0,-15,-11, 5,-15, 0, -5, 0, -3,-12,-28,-11, 1; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='N'; M= -4, 5,-21, 2, 1,-19, -6, 9,-21, -1,-21,-12, 10,-11, 1, 1, 3, -3,-18,-23,-10, 0; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='P'; M= -8,-11,-24, -5, -1,-20,-12,-14,-15, -7,-17,-12,-12, 33, -7,-13, -7, -8,-18,-24,-19, -6; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='T'; M= -3, 4,-15, 2, -2,-13,-14, -9,-14, -6,-14,-11, 3,-11, -5, -6, 12, 19, -7,-27,-10, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -4, -7,-20, -5, 4,-18,-15, -4,-14, -5,-10, -8, -8, 3, 0, -8, -4, -6,-15,-23,-11, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='B'; M= -8, 7,-18, 7, 6,-21,-14, -2,-18, -1,-16,-11, 6,-10, 6, -3, 1, 0,-16,-27,-11, 5; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -8, 4,-26, 8, 12,-23,-17, -7,-18, -1,-19,-14, 0, 4, 5, -7, 0, -3,-18,-28,-14, 7; /M: SY='R'; M=-11, -8,-27, -9, -1,-19,-19, -6,-14, 13,-11, -1, -5,-16, 9, 18, -9, -7,-13,-20, -7, 3; /M: SY='E'; M= -5, 5,-24, 5, 11,-22,-15, 0,-19, 2,-18,-12, 5, -9, 10, 1, 3, -3,-19,-26,-11, 10; /M: SY='V'; M= -2, -6,-21, -5, -5,-14,-16,-15, -7, -2,-11, -7, -8,-15,-10, -5, -5, -4, 2,-25,-10, -8; /M: SY='L'; M= -6,-25,-22,-29,-22, 10,-26,-14, 12,-21, 17, 13,-23,-25,-18,-18,-19, -7, 8, -2, 8,-20; /M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -4, 8,-19,-17, 3,-19, 7,-14, -8, 0,-14, 6, 7, -2, -3,-15,-25, -9, 6; /M: SY='A'; M= 7, -4,-19, -8, -6,-16,-11, -8,-13, -6,-16,-11, 0,-13, -5, -7, 5, 1, -8,-17,-10, -6; /M: SY='F'; M=-16,-29,-24,-36,-27, 40,-32,-18, 16,-27, 17, 10,-22,-27,-27,-21,-22,-11, 8, 2, 21,-26; /M: SY='L'; M=-10,-22,-19,-25,-16, 8,-24,-13, 5,-17, 17, 9,-18,-24,-13, -9,-18, -8, 2,-16, 2,-15; /M: SY='R'; M=-10, 2,-26, 0, 0,-14,-11, 4,-22, 6,-18,-11, 4,-17, 1, 10, -4, -7,-19,-19, -1, -1; /M: SY='Y'; M= -5, -6,-21,-11,-13, 3,-11, -7,-10,-13,-11, -9, 1,-20,-12,-12, 2, 2,-10, -8, 7,-12; /M: SY='I'; M= -8,-25,-20,-30,-24, 17,-28,-23, 18,-25, 15, 8,-20,-25,-24,-21,-14, -3, 16,-13, 3,-24; /M: SY='R'; M= -2, -8,-25, -8, -3,-20, -4, 1,-24, 0,-23,-13, -2, -1, -1, 2, 2, -5,-19,-21,-12, -4; /M: SY='H'; M= -9, 1,-24, -1, -2,-10,-17, 11,-14, -3,-15, -7, 5,-18, 1, -3, -3, -6,-13,-22, 2, -1; /M: SY='F'; M=-10,-26,-14,-32,-26, 33,-28,-21, 10,-24, 14, 7,-22,-28,-28,-19,-16, -4, 13,-10, 10,-25; /M: SY='F'; M=-15,-26,-24,-31,-24, 31,-30, -9, 14,-23, 20, 14,-22,-28,-21,-18,-22,-10, 5, 1, 29,-23; /M: SY='P'; M= -4,-14,-31, -9, -4,-25,-10,-18,-17,-11,-24,-16,-10, 49,-10,-18, -2, -6,-21,-30,-26,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M= -2, -1,-24, -1, 8,-23, -9, -6,-22, 6,-21,-13, 1,-11, 5, 3, 4, 0,-18,-21,-13, 6; /M: SY='E'; M= -5, -2,-23, -1, 15,-15,-16, -2,-16, -6,-13,-11, -2, -6, 1, -8, 2, -1,-14,-27,-10, 7; /M: SY='C'; M=-10,-20,114,-30,-30,-18,-30,-28,-29,-29,-19,-19,-20,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-47,-26,-30; /M: SY='R'; M= 7, -7,-17,-10, -3,-22,-11,-10,-20, 9,-18,-10, -3,-15, 2, 17, 1, -3,-12,-23,-15, -2; /M: SY='D'; M=-11, 9,-25, 12, 10,-20,-14, -2,-21, 1,-16,-12, 3,-13, 2, -2, -2, -4,-17,-26, -9, 6; /M: SY='H'; M=-14, 8,-27, 10, 8,-24,-13, 54,-30, -5,-23,-10, 12,-15, 7, -2, 0,-12,-27,-32, 2, 5; /M: SY='F'; M=-11,-26,-21,-33,-25, 47,-27,-13, 4,-24, 11, 4,-20,-27,-27,-18,-18, -9, 1, 5, 28,-24; /M: M= -7,-14,-23,-15, -6, -6,-21,-10, -4, -4, -1, 0,-11,-19, -2, 0, -7, -3, -3,-18, -1, -5; /M: SY='E'; M= -5, 3,-24, 3, 11,-24,-13, -1,-23, 11,-20,-12, 4,-11, 8, 8, 2, -2,-18,-27,-13, 9; /M: SY='Y'; M=-12,-21,-27,-26,-20, 13,-27,-12, 11,-17, 6, 11,-17,-23,-14,-15,-19,-11, 2, 5, 17,-18; /M: SY='I'; M= -4,-17,-18,-23,-16, -1,-21,-15, 10,-17, 10, 10,-13,-21,-10,-16,-10, -3, 4,-21, -3,-14; /M: SY='E'; M= 0, 1,-22, 0, 3,-19,-11, -8,-18, 3,-18,-12, 2,-10, -1, -2, 3, 0,-14,-26,-13, 0; /M: SY='K'; M= -6, 1,-22, 0, 6,-18,-15, -4,-19, 8,-18, -9, 5,-14, 4, 8, 3, 0,-14,-27,-12, 4; /M: SY='N'; M= -9, -3,-18, -9,-10, -8,-16, 1, -9, -9,-11, -7, 4,-11, -9, -7, -4, -1,-10,-25, -4,-11; /M: SY='P'; M= -8, -3,-29, 1, 2,-21,-16, -7,-19, -2,-20,-12, -4, 18, -1, -7, -4, -5,-20,-26,-14, -2; /M: SY='P'; M= -7,-16,-20,-16, -9, -7,-24,-17, -2, -8, -3, -3,-15, 1,-13,-12,-11, -5, -2,-22, -7,-13; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='D'; M= -6, 3,-27, 6, 5,-26, -6, -4,-21, -1,-19,-12, 1, -8, 6, -3, -2, -9,-19,-22,-15, 5; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: M= -3, -4,-15, -5, -2, -3, -5, -6,-10, -3, -7, -6, -2, -4, -5, -2, -2, -4, -9,-11, -4, -4; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='V'; M= 1,-23,-13,-27,-22, 0,-23,-24, 12,-19, 7, 5,-21,-20,-21,-19, -9, 0, 18,-16, -6,-22; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='N'; M= -6, 7,-21, 3, 3,-21,-11, 7,-22, 2,-22,-13, 12,-11, 5, 4, 9, 6,-19,-30,-11, 3; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='S'; M= 4, 7,-13, 1, -3,-18, -6, -8,-17, -6,-22,-16, 15,-13, -3, -5, 22, 17,-10,-34,-17, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='R'; M=-10, -3,-28, -4, 1,-24,-12, 0,-26, 18,-22,-11, 3, -8, 7, 31, -5, -8,-21,-23,-12, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='E'; M=-12, 9,-26, 13, 16,-24,-17, -1,-21, 8,-18,-10, 5, -9, 6, 6, -3, -8,-18,-29,-14, 10; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='D'; M= -2, 14,-22, 17, 10,-26, -6, -7,-24, -2,-20,-17, 8,-11, 2, -6, 7, 0,-19,-32,-18, 6; /M: SY='L'; M= -1,-23,-18,-27,-19, 15,-23,-18, 8,-22, 19, 6,-21,-23,-20,-18,-16, -7, 7,-15, 2,-19; /M: SY='V'; M= 1,-14,-10,-20,-17, 5,-18,-17, 1,-17, -4, -3, -9,-21,-18,-16, 0, 3, 7,-21, -3,-17; /M: SY='L'; M= -4,-11,-22,-15, -6, -8,-22,-13, -1, -7, 6, 3,-10,-18, -3, -4, -9, -1, -3,-22, -7, -5; /M: SY='W'; M=-17,-32,-39,-34,-25, 19,-23,-19,-13,-17, -9,-11,-30,-29,-18,-14,-30,-21,-20, 90, 31,-19; /M: SY='L'; M= -7,-25,-21,-29,-20, 9,-25,-20, 11,-25, 29, 12,-24,-26,-19,-19,-21, -4, 5, -9, 1,-19; /M: SY='W'; M=-10,-25, 10,-30,-26, 5,-24,-23,-12,-20,-11,-12,-22,-30,-23,-19,-17,-11, -7, 24, 5,-23; /M: SY='R'; M=-10, 10,-26, 11, 9,-24,-15, -1,-24, 13,-22,-13, 10,-13, 6, 16, -2, -5,-20,-27,-12, 6; /M: SY='V'; M= 3,-24,-17,-30,-22, 7,-25,-23, 16,-19, 11, 8,-20,-23,-21,-19,-11, -4, 19,-19, -3,-22; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20, 95,-30, -7,-20, 0, 10,-20, 10, 1,-10,-20,-30,-30, 19, 0; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 23, 1,-21, -1, 9,-21, 0,-30,-21, 56,-19, 0, -1, 10, 0,-29,-40,-20, 1; /M: SY='E'; M= -2, -6,-19, -8, 3,-13,-14, -6,-13, -2, -9, -2, -6,-15, 1, -4, -4, -5,-11,-22, -8, 1; /M: SY='V'; M= 1,-29,-11,-30,-29, 0,-29,-29, 28,-20, 11, 10,-29,-29,-28,-20,-10, -1, 46,-29,-10,-29; /M: SY='N'; M=-10, 38,-20, 20, 0,-20, -2, 7,-20, -1,-29,-20, 54,-19, -1, -1, 10, 3,-28,-39,-19, 0; /M: SY='E'; M= -3, -3,-25, -3, 10,-21,-14, -8,-18, 4,-12, -9, -4, -8, 5, 4, -4, -6,-16,-23,-12, 6; /M: SY='R'; M=-14, -7,-29, -7, 6,-21,-20, -3,-25, 26,-17, -9, -2,-16, 10, 44, -9, -9,-19,-20, -9, 5; /M: SY='L'; M= -7,-26,-19,-28,-21, 5,-29,-21, 20,-26, 34, 17,-25,-26,-19,-19,-20, -3, 15,-23, -3,-20; /M: SY='G'; M= 5, -1,-24, -6,-10,-24, 25, -7,-25,-11,-23,-12, 7,-13, -9,-12, 2,-10,-21,-25,-21,-10; /M: SY='K'; M= -7, -2,-28, -2, 2,-26, -4,-10,-26, 23,-25,-11, 0,-13, 3, 11, -6, -9,-18,-20,-11, 2; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M=-12, 0,-33, 8, 10,-29,-18, -7,-25, 4,-25,-16, -5, 30, 1, -1, -6, -9,-26,-29,-20, 3; /M: SY='Q'; M= -4,-10,-24,-11, 1,-16,-21, -8, -5, -7, -2, -2, -9,-10, 4, -7, -4, -3, -8,-24, -8, 1; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='F'; M=-10,-20,-19,-25,-20, 24,-24,-15, 1,-17, 4, 0,-15,-24,-21,-13, -8, 4, 4, -8, 14,-20; /M: SY='D'; M= -7, 16,-22, 24, 15,-29,-10, -7,-27, -2,-25,-21, 6, 1, 0, -9, 5, -3,-22,-35,-21, 7; /M: SY='C'; M=-12, -2, 17, -4, -9,-13,-23, -8,-17,-16,-11,-12, -5,-21,-13,-15, -8, -7,-12,-32,-12,-12; /M: SY='P'; M= -4, 1,-26, 3, 7,-25,-12, -9,-20, -4,-19,-14, 0, 11, 3, -7, 3, -1,-20,-30,-19, 3; /M: SY='K'; M= -7, 2,-24, 2, 5,-21,-14,-10,-21, 8,-18,-12, 1, -7, 0, 5, 0, 2,-15,-27,-14, 2; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= -1,-24,-12,-30,-24, 13,-25,-23, 9,-21, 5, 3,-21,-25,-22,-19,-11, -3, 15, -7, 1,-22; /M: SY='K'; M= -9, -3,-27, -4, 0,-19,-12, -7,-17, 2,-18,-11, 0, 2, -2, 2, -5, -6,-17,-25,-13, -3; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= -7, 4,-27, 5, 15,-27,-17, -5,-22, 16,-20,-12, 2, -8, 11, 12, -3, -8,-20,-26,-14, 12; /M: SY='R'; M=-13, -6,-21, -7, -1,-19,-22, -5,-14, 11,-13, -4, -3,-18, 6, 19, -8, -9,-12,-23, -8, 0; /M: SY='W'; M=-16,-24,-34,-26,-20, 18,-25, -3, -7,-14, -8, -6,-23,-27,-10,-13,-21,-13,-15, 54, 45,-15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 36 in 36 different sequences |
Number of true positive hits | 36 in 36 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | ERV/ALR sulfhydryl oxidase |
Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
36 sequences
088R_FRG3G (Q6GZN7), ALR_HUMAN (P55789), ALR_MOUSE (P56213), ALR_RAT (Q63042), ERV1_ARATH (Q8GXX0), ERV1_ORYSJ (Q10Q80), ERV1_SCHPO (O14144), ERV1_YEAST (P27882), ERV2_SCHPO (Q9Y806), ERV2_YEAST (Q12284), FLSO_ASFB7 (Q65163), FLSO_ASFK5 (P0C8G8), FLSO_ASFM2 (Q9JFM9), FLSO_ASFWA (P0C8G9), PG072_MONPV (A0A7H0DN45), PG072_VACCC (P21050), PG072_VACCW (P23373), PG072_VAR67 (P0DOL5), PG072_VARV (P0DOL6), QSOX1_ARATH (Q8W4J3), QSOX1_CAVPO (O08841), QSOX1_CHICK (Q8JGM4), QSOX1_HUMAN (O00391), QSOX1_MOUSE (Q8BND5), QSOX1_ORYSJ (Q6AUC6), QSOX1_PONAB (H2N4I1), QSOX1_RAT (Q6IUU3), QSOX2_ARATH (Q9ZU40), QSOX2_HUMAN (Q6ZRP7), QSOX2_MOUSE (Q3TMX7), QSOX2_XENLA (Q6AX23), V093_FOWPN (Q9J5C7), VF347_IIV3 (Q196W4), VF347_IIV6 (Q91FH7), YR368_MIMIV (Q5UQV6), YR596_MIMIV (Q5UP54)» more
|
PDB [Detailed view] |
23 PDB
1JR8; 1JRA; 1OQC; 2HJ3; 3GWL; 3GWN; 3LLI; 3LLK; 3MBG; 3O55; 3R7C; 3T58; 3T59; 3TD7; 3TK0; 3U2L; 3U2M; 3U5S; 3W4Y; 4E0H; 4E0I; 4LDK; 4P2L » more |