PROSITE entry PS51326

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	AVIDIN_2
Accession [info]	PS51326
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00499
Associated ProRule [info]	PRU00656

Name and characterization of the entry

Description [info]

Avidin-like domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=119;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1501226; R2=0.0061539; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16586.7871094; R2=7.6328535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1032; H_SCORE=24464; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=707; H_SCORE=21983; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='Q';  M= 27,-23,-10,-11,-21,  6,-18,-16,-10,-19,-12, 11,-15, 38, 13,  7,  9,-14,-25,-23;
/M: SY='C';  M=-14, 50,-17, 22,  9,  8,-19,  2,  8,-13,-16,-14, 18, 18,-14,-13,-17,-19,-14,-20;
/M: SY='C';  M= 23, 58,-14,-12,-13,-19,-22, 10,-17, 13, -8, 10,-22, 13,-18,-13,-10, -7,-25,-20;
/M: SY='D';  M= -8,-23, 28,-10,-25,  8,-16,-19, -9,-18,-20, 27, 22, 18,-15, 19, 13,-20,-28,-23;
/M: SY='P';  M= 24,-22,-16,-16, 17,-17,-19, 11,-14, 12, -8,-16, 28,-14,-19,-12, -8, 12,-24,-12;
/M: SY='S';  M= -7,-20,-13,  6,-17,-15,-13,-10, -8, -1, 23,-12, 21,-13,-18, 28, 28,  3,-28,-16;
/M: SY='W';  M=-11,-27,-15,-18,-19, 53,-22,-17,-13,-21,-21,-12,-15,-19,-18, 29,-13,-23, 59,-18;
/M: SY='T';  M=  5,-24,-13,  3,-16,-18,-16,-13,  9, -8, 25, -9,-14,-11,-16,  8, 45, -8,-20, 21;
/M: SY='W';  M=-37,-14,-33,-15, -1, -2,-35,-26,-20,-21,-24,-53,-23,-15,-12,-31,-40,-31,146, 22;
/M: SY='Y';  M=-12,-27,-14, -9, -9,-21,-19,-11, 28,  2, -6,-13,-14, 13, -9, -9, 27,  6,-11, 36;
/M: SY='N';  M=-11,-14, -3,-14,-15, -9,-14,-10, -8,-19,-11, 85,-28,-14,-21, -9, -3,-20,-53,-36;
/M: SY='Q';  M= -7,-15, 15, 43,-33,-21,-12,-25, -4,-17,-16,-13, -9, 63, -4,-13,-16,-28,-17,-18;
/M: SY='C';  M=-17, 33,  9,-13, -5,-21,-18,-10,-15, 31, -7,-17,-23,-14, 11,  0,-11, -8,-13, 25;
/M: SY='G';  M=-12,-31,-14,-20,-26, 68,-23,-16,-14,-22,-18, 15,-14,-21,-22, -7,-17,-25, -5,-30;
/M: SY='S';  M= -4,-21, 12,-12,-15, -7,-14,-16, -7,-20,-25, -9,-16,-14,-14, 62,  1,-17,-31,-21;
/M: SY='T';  M= -6,-20,-11,  8,-21,-19,-19, -9,-12,-10,-11, 18,-14, 16,-19, -4, 56,  9,-33,-18;
/M: SY='M';  M=-11,-19,-22,-18, 19,-21,-11, -1,-10, 31, 69,-15,-32,-19,-17,-21,-10, 11,-20, -2;
/M: SY='T';  M=  5,-22,-17,-20,-11,-19,-20, 21,-15,  7, -7,-11,-18,-11,  7, -7, 42, -1,-21, 18;
/M: SY='I';  M=-11,-19,-31,-28, -7,-17,-24, 69,-22,  0, -5,-11,-26,-21,-27,-15, -9, 23,-26,-13;
/M: SY='W';  M=-10,-19,-13,  6,-19,  8,-20,-15,-11,-14,-15, 15,-14, 14,-17,  7, 43,-15, 61,-13;
/M: SY='T';  M= 26,-23,-11,-11,-18,-14,-20,-11,  6,-15,-10, -9,-15, 18,-12, 23, 27,  6,-31,-22;
/I:         I=-26; MD=-65;
/M: SY='Y';  M=  3,-31,  5,-24,-13,-24,-24,  8,-20,-10,-15, 10,-27,-20,-22,-16,  9, 18,-20, 33; D=-26;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='S';  M= 18,-21, -9,-12,-16, -8,-14,-14, -7,-20,-19, 19, 11,-12,-15, 48,  0,-15,-34,-26;
/M: SY='S';  M= -8,-23, 11,-14, 10,  8,-18,-16, -9,-16,-18, 17,-17, 16, 11, 27, 12,-17,-22,-16;
/M: SY='G';  M=-11,-32, 11,-19,-29, 68,-24,-18,-15,-21,-19, -8,-12,-21,-22, -7,-18,-25, -5,-28;
/M: SY='M';  M= 17,-18,-10, 22,-21,-14,-13,-15, -5,-14, 24, 13,-15, 15,-14, 20, 16,-14,-28,-23;
/M: SY='I';  M=-12,-19,-25,-23, 21,-21,-20, 38,-18, 23, 28,-15,-29,-22,-21,-17, -9, 25,-22, -3;
/M: SY='T';  M= -5,-21,-12,-14,-16,-15,-17,-12,-12,  0,-14, -8,-14, 21,-16, 35, 47,-10,-31,-15;
/M: SY='G';  M=-12,-33,-15,-21,-27, 72,-24,-16,-15,-22,-19, -9,-12,-22,-22, -7,-19,-25, -2,-30;
/M: SY='T';  M=  7,-23, 11,-15,-23,-17,-21,-13,-13,-11,-13, -5,-12, 15,-19, 12, 60, -8,-35,-19;
/M: SY='Y';  M=-34,-42,-21,-24, 30,-29,-11,-13,-18,  5,-13,-33,-24,-17, -7,-20,-17, -6, 19, 89;
/M: SY='I';  M= -9,-18,-17, 19,-17,-19,-17, 32,  5, -6, 26,-10,-17,-13,-20,-10, 29, 10,-26,-16;
/M: SY='N';  M= -7,-18, -8,-15,-15,-10,-16,-12, -9,-17,-16, 54,-20,-14,-19, 35, 30,-15,-41,-26;
/M: SY='H';  M= 23,-28,-13,-10,-18,-17, 34,-19,  9,-18, -9,-17, 30, -5, 24,-10,-14,-15,-18, 15;
/M: SY='A';  M= 35,-22,-11,-17,-13,-14,-22, -3,-13,-12, -9, 13,-22,-13,-17, 16, -3, 31,-35,-22;
/M: SY='Q';  M= 18,-23,-11,  7,-24, 28,-18,-16,-10,-18,-14,-10,-12, 36,-12,  9, 12,-17,-18,-24;
/I:         I=-26; MD=-65;
/M: SY='G';  M= -8,-50,-34,-39,-44, 38,-43,-37,-32,-42,-35,-31,-34,-33, -4,-27,-37,-40,-28,-46; D=-26;
/I:         I=-26; MI=-65; MD=-65; IM=-65; DM=-65;
/M: SY='F';  M= -5,-34,-31, -4, 30,-32,-34,-26,-24,-21,-28,-23,-31,-27,-31,  2, 19,-22,-33,-23; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='C';  M= 11, 33,-24,-26,-29, -3,-34,-25,-27,-12,-25,  9,-34,-26,-32, -1,-21,-25,-39,-39; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='C';  M=-13, 73, 13,-12,-24, 19,-25,-16,-17,-15,-18, 33,-20,-18,-23,-10, 19,-19,-22,-31;
/M: SY='Q';  M=  6,-23, 14, 11,-22,  6,-15,-19,-10,-14,-15,-12,-13, 48, -8,  4,  7,-18,-14, 15;
/M: SY='G';  M= 15,-22,-11,  4,-21, 41,-20,  8,-11,-17,-12, 30,-16,-13,-21, -8,-12,-14,-19,-29;
/M: SY='S';  M=  7,-23,-13, -9,-16,-12,-18, 10, 21,-15,-11, -9,-14, 13,-11, 34, 15,-10,-28,-20;
/M: SY='P';  M=-12,-24,-13, 10,-25,-15,-10,-19, -5,-20,-25,-20, 68, -9,  8,  5,  8, -4,-24,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-33,-18,-19, 17,  3,-14,-14,-15, -3,-15,-21,-19, 17, -9,  5,  9,-11,  7, 67;
/M: SY='P';  M=  5,-27,-14, -9,-25,-15,-11,-13, -9,-18,-23,-23, 72, 17,-14,-15, -9, 13,-25,-20;
/M: SY='L';  M= 18,-16,-14,-17, -3,-20,-21,  1,-18, 37, -1,-17,-25,-16,-21,-15, -6, 23,-26, -4;
/M: SY='H';  M= 20,-23,-12,-16,-16,-15, 29, -7,-13,-13,-10, 15,-17,-13,-18, 19, 26, 17,-36,-20;
/M: SY='G';  M=-12,-33,-15,-21,-27, 72,-24,-16,-15,-22,-19, -9,-12,-22,-22, -7,-19,-25, -2,-30;
/M: SY='W';  M=-23,-22,-21,-17, -4,-13,-21,-20,-13,-13,-18,-29,-20,-10, 24,  5,  6,-18,106, 43;
/I:         I=-16; MD=-40;
/M: SY='F';  M= -6,-32,-30, -2, 25,-34,-32,-15,-25,  0,-20,-29,-35,-28,-27,-26,-23, 14,-22, 17; D=-16;
/I:         I=-16; MD=-40;
/M: SY='N';  M=  8,-34,  6,-26,  9,-25,-30,-25,-22,-23,-25, 26,-33,-24,-27, -1,-18,-23,-33,  6; D=-16;
/I:         I=-16; MD=-40;
/M: SY='N';  M= 10,-34,-20,-27,-31, 16,-31,-24,-22,-29,-24, 24,-28,-24,-31,  2,  8,-24,-39,-41; D=-16;
/I:         I=-16; MD=-40;
/M: SY='P';  M= -3,-35,-25,-27,-32,  3,-29,  2,-23,-26,-26,  8, 26,-25,-33,-18, 19,-21,-39,-35; D=-16;
/I:         I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='V';  M=  4,-25,  7,-19, 13,  5,-21, -7,-13,-10,-13, 15,-22,-15, 10,  3,-10, 21,-16, 17;
/M: SY='T';  M= -7,-22, 26,-12,-20,-15,-20, 18,  3,-12,-14, -7,-15, 12,-16, 22, 29, -8,-30,-18;
/M: SY='G';  M=  3,-26,-16,-15, 11, 33,-19,-11,-13, -4,-16,-14, 21, 16,-15,  6,-11,  0,-14,-16;
/M: SY='P';  M=-10,-25, 10,-15, 27,-16,-17,-16,-11,-12,-22,-12, 46,-15,-19,  9, 37,-13,-24,-13;
/M: SY='S';  M= 25,-21,-11,-15,-13, 12,-19,-10,-12,  8,-10,-11,-17,-12,-18, 28, 16, -8,-27,-19;
/M: SY='F';  M=-14,-20,-27,-26, 45,-22,-24, 35,-19, 19, -7,-13,-27,-23,-22,-13, 10, 14,-17, -1;
/M: SY='G';  M=  4,-30,-13,-16,-17, 40,-20,-15,  5,-14,-13,-10,-13,-15,-16, 10, 20,-15, -9, 20;
/M: SY='W';  M=-24,-22,-40,-27, 75,-18,-32,-12,-18, -3,-20,-23,-31,-26,-14,-17,-27,-11, 96, 13;
/M: SY='T';  M= -6,-21,-13,-19,-12,-16,-20, -3,-14,  2,-12, 13,-20,-17,-20, 27, 39, 23,-34,-14;
/M: SY='V';  M= -5,-22,-17,-26, -7,-22,-25, 10,-18, -3, -8, 27,-31,-26,-19,-15, -3, 59,-34,-11;
/M: SY='H';  M=  5,-22,-11,-15,-17,-14, 47,-10,-12,-15,-10, 43,-18,-13,-19, 18, 17,  3,-39,-22;
/M: SY='W';  M=-23,-19,-30,-21, 39,-12,-30,-14,-17,-11,-18,-29,-25,-16,  9,-19,  0,  2,115, 12;
/M: SY='D';  M= 19,-20, 29, 22,-25,  4,-19,-21, 22,-18,-10, 13,-12, -8,-14, -8,-12,-18,-25,-25;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
/M: SY='N';  M= -9,-20,-11,-11, 14,  9,-16,-14,-10,-16,-15, 49,-20, 47, -9,  6, -8,-21,-23,-20;
/M: SY='C';  M= -2, 85,-20,-13, 15,  1,-25,-15,-20, -9,-19,-16,-24,-19,-17,  4,-16,-16, -6, 28;
/M: SY='N';  M=-10,-18, -9, 10,-22,  4, 29,-16, -8,-18,-13, 51,-16, 34,-12,  8, -9,-23,-29,-24;
/M: SY='S';  M= 10,-21,-10,-12,-13, -7,-14,-14, -7,-20,-22, -9,-16,-13,-13, 61,  2,-15,-32,-23;
/M: SY='T';  M= 15,-22,-20,-22, 19,-18,-21, 32,-15, -5, 22, -8,-20,-15,-22, -7, 38,  2,-27,-14;
/M: SY='T';  M= -5,-23,-12,-21,-22,-19,-23,-10,-16, -8,-11, -3,-11,-13,-26,  3, 76, -3,-40,-17;
/M: SY='T';  M= 16,-24,-14,-18,-15,  4,-21, -7,-12,-13,-12,-12,-18,-12, 12, 19, 25, 21,-27,-18;
/M: SY='W';  M=-35,-15,-34,-17, 23, -5,-35,-23,-20,-18,-23,-47,-24,-17,-12,-29,-38,-27,141, 20;
/M: SY='T';  M= -4,-23,-14,-20,-15,-17,-21, -4,-14, -9,-14, -8,-17,-16,-20, 29, 52, 23,-35,-15;
/M: SY='G';  M=-12,-33,-15,-21,-27, 72,-24,-16,-15,-22,-19, -9,-12,-22,-22, -7,-19,-25, -2,-30;
/M: SY='Q';  M= -7,-25,-16,-10, 11,-22,-16,-15,-14,-10,-14,-12,-14, 65, -4, -9, 34,-15,-14, 17;
/I:         I=-22; MD=-57;
/M: SY='C';  M= -9, 79,-24,-18,-16, -2,-29,-19,-27,  1,-20,-23,-30,-23,-24,-23,-23,-20, -9, 32; D=-22;
/I:         I=-22; MD=-57;
/M: SY='H';  M=-23,-37, -4,-29,  9, -2, 21,  1,-26,-22,-23,-25,-30,  7, -1,-24,-27, -2,-29,-21; D=-22;
/I:         I=-22; MD=-57;
/M: SY='P';  M=  7,-32,-25,-28,-25,-27,-30,  5,-25, -7,-20,  7, 11,-25,-32,-21,  3,  1,-44,-29; D=-22;
/I:         I=-22; MD=-57;
/M: SY='C';  M=-27, 27,  4,-31,-41, -3,-40,-34,-32,-32,-36,  5,-35,-33,-39, -6, 16,-33,-44,-43; D=-22;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='N';  M=  5,-23, 12,-17,-21, 39,-21, 10,-12,-17,-13, 43,-19,-16,-21, -8,-10,-14,-22,-29;
/M: SY='G';  M= -9,-27,-12,-14,-20, 46,-19,-16, 10,-21,-16, 14,-14,-17,-16, 30, -9,-21,-15,-26;
/M: SY='N';  M= -8,-18, -9, 21,-20, 11,-16,-14, 11,-17,-13, 31,-15, 16,-13, 17, -9, -3,-23,-23;
/M: SY='P';  M= 17,-21, 14, 22,-26,  7,-15,-20, -6,-18,-18,-12, 31, -9,-18, 11,  9,-17,-24,-25;
/M: SY='R';  M= -8,-23,-15,  5,-18,  5,-20,-11,  7,-13,-11,-13,-15, 23, 26, -9, 19, 17,-19,-14;
/M: SY='I';  M=-13,-18,-29,-24, 21,-19,-19, 53,-17, 18, 34,-12,-28,-20,-23,-17,-11,  7,-21, -6;
/M: SY='Q';  M=-10,-24,-11, -9,-16,-16,-14,-13,  8,-14,-14, 30, 21, 33, -9,  5,  9,  0,-21, 15;
/M: SY='T';  M=  6,-24,-12,-20,-22,  7,-23,-11,-15,-10,-11, -4,-12,-13,-25,  1, 68, -5,-34,-19;
/M: SY='M';  M= -9,-18,-15,-14, -8,-18,-15, -4,-13, 27, 30,-13,-22, 15,-16, 18, 13,  6,-25, -6;
/M: SY='W';  M=-37,-14,-33,-15, -1, -2,-35,-26,-20,-21,-24,-53,-23,-15,-12,-31,-40,-31,146, 22;
/M: SY='Q';  M=-13,-20,-16,-13, -9,-20, 22,  9,-16, 22, -5, 11,-19, 33,-14,-14, 15, -7,-19, 18;
/M: SY='L';  M=-17,-15,-16,-15,  0,-21,-14, -2,-16, 44, 32, 10,-27,-17,-20,-19, -8, -3,-17, 22;
/M: SY='T';  M=  6,-24,-17,-21, 19,-19,-23, -6,-13, -8,-12,-10,-18,-13,  8, 11, 44, 19,-27,-11;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-13,-15, -6,-17,-14,-10,-12,  4,-12, 26,-22, 17,  8, 17, -7,  5,-12, 38;
/M: SY='M';  M= 17,-21,-12,  5,-19,  6,-16, -9, -9,-13, 25, 14,-18, 18,-14,  8, 10,  8,-26,-22;
/I:         I=-21; MD=-53;
/M: SY='V';  M=  1,-26, 12,  3,  7,  1,-28, -9,-17,-12,-17,-16,-23,-21,-23,-14,  9, 27,-27,-17; D=-21;
/I:         I=-21; MD=-53;
/M: SY='N';  M=-13,-23,-13,  5,-24,  4,-18,-20,-11,-22,-23, 33, 17,-16,-22, 25, 11,-23,-33,-29; D=-21;
/I:         I=-21; MD=-53;
/M: SY='A';  M=  8,-44,  3,-35,-40,-35,-43,-30,-33,-33,-33,-30,-38,-33,-38, -5,  2, -3,-55,-42; D=-21;
/I:         I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
/M: SY='Q';  M= -6,-45,-30,-28,-45, 26,-36,-35,-30,-38,-32,-29,-30, 37,-25,-27,-32,-40,-29,-42; D=-21;
/I:         I=-21; DM=-53;
/M: SY='Y';  M=-24,-35, 24,  4,-27, -3,-27,-31,  5,-22,-24,  9,-24,-22,-23,-22,-24,-29,-20, 26; D=-21;
/I:         I=-21; DM=-53;
/M: SY='S';  M= 25,-21, 14,  7,-20, 12,-19,  5, -9,-16,-14,-10,-15,-10,-17, 26, -7,-11,-26,-25;
/M: SY='W';  M=-25,-20,-23, -9, -8, 10,-27,-24, 19,-21,-17,-31, 16,-15,-11,-21,-28,-28,124,  9;
/M: SY='P';  M=  5,-26, 10, -3,-21,-13,-16,-20, 37,-21,-11, 16, 38,-11,-10,  7,-10,-20,-27,-23;
/M: SY='H';  M= 17,-25,-13,-11,-20, 10, 43,-16,-11,-19,-14,-11,-13, 17,-13, 38, -6,-17,-27,-22;
/M: SY='I';  M=-10,-21,-20,-22,-14,-17,-19, 41,-13, -6, 22, 15,-21,-13,  9, -9, 35,  2,-29,-15;
/M: SY='N';  M=-13,-15,-13,  5, -8,-17,-14, -8, -9, 26, 27, 28,-23,-11,  8,  5, -8,-10,-25, -8;
/M: SY='V';  M= 26,-25,-12,-11,-15,-18,-23, -5, 20,-12, -5,-12,-16, 14,-11, -8, 10, 29,-29,-18;
/M: SY='G';  M=-12,-31,-14,-21,-26, 69,-23,-16,-14,-22,-18, 12,-13,-21,-22, -7,-18,-25, -5,-30;
/M: SY='Q';  M= 18,-25,-14, -9,-23,  9, 28,  7,-13,-17,-11,-12,-13, 53, -7,  4,-11,-15,-21,-20;
/M: SY='D';  M= -7,-23, 76, -6,-39,-14,-23,-30,-10,-16,-24, 21,-16,-13,-18,-11,-11,-21,-35,-21;
/M: SY='I';  M= -7,-22,-20,-22,-12,-19,-24, 39,  1, -4, -6,-10,-20,-19,-21, -8, 37, 31,-30,-13;
/M: SY='F';  M=-20,-25,-42,-32, 84,-24,-31, -9,-17,  1,-19,-17,-33,-29,-15,-14,-24, -7, 57, 11;
/M: SY='T';  M= -4,-23,-14,-17,-19,-19,-21, -6,-15, -9,-12, -8,-15, 29,-16, 10, 55, 18,-32,-15;
/M: SY='R';  M=-15,-27,-17, -9, 16,-20,-16,-21, 22,-16,-13,-19, 30, 20, 41,-13,-18,-19,-10, 18;
/M: SY='T';  M= -8,-24,-16,-19, -8,-20,-21, -1,  0,  7, -8,-13,-19,-18,-17,  9, 36, 31,-22, 19;
/M: SY='W';  M=-22,-30,-23,  3,-26,  0,-26,-31,  3,-30,-27,-27, 11,-18,  7, 14,-23,-32, 61,-19;
/M: SY='P';  M= -6,-43,-29,-28,-43, -1,-32,-33,-27,-34,-34,-28, 29,  9,-32,-23, 18,-32,-40,-38;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	14 in 14 different sequences
Number of true positive hits	14 in 14 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Avidin-like
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

14 sequences

AFAVI_AFIPF (A0A493R6X0), AVID_CHICK  (P02701), AVR1_CHICK  (O13153),

AVR2_CHICK  (P56732), AVR3_CHICK  (P56733), AVR4_CHICK  (P56734), 
AVR6_CHICK  (P56735), AVR7_CHICK  (P56736), FBP1_STRPU  (P10079), 
FBP3_STRPU  (P49013), HOAVI_HOEPD (A9D857), SAV1_STRVL  (Q53532), 
SAV2_STRVL  (Q53533), SAV_STRAV   (P22629)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

325 PDB

1AVD; 1AVE; 1DF8; 1HQQ; 1HXL; 1HXZ; 1HY2; 1I9H; 1IJ8; 1KFF; 1KL3; 1KL4; 1KL5; 1LCV; 1LCW; 1LCZ; 1LDO; 1LDQ; 1LEL; 1LUQ; 1MEP; 1MK5; 1MM9; 1MOY; 1N43; 1N4J; 1N7Y; 1N9M; 1N9Y; 1NBX; 1NC9; 1NDJ; 1NQM; 1NQN; 1PTS; 1RAV; 1RST; 1RSU; 1RXH; 1RXJ; 1RXK; 1SLD; 1SLE; 1SLF; 1SLG; 1SRE; 1SRF; 1SRG; 1SRH; 1SRI; 1SRJ; 1STP; 1STR; 1STS; 1SWA; 1SWB; 1SWC; 1SWD; 1SWE; 1SWF; 1SWG; 1SWH; 1SWJ; 1SWK; 1SWL; 1SWN; 1SWO; 1SWP; 1SWQ; 1SWR; 1SWS; 1SWT; 1SWU; 1VWA; 1VWB; 1VWC; 1VWD; 1VWE; 1VWF; 1VWG; 1VWH; 1VWI; 1VWJ; 1VWK; 1VWL; 1VWM; 1VWN; 1VWO; 1VWP; 1VWQ; 1VWR; 1VYO; 1WBI; 1Y52; 1Y53; 1Y55; 2A5B; 2A5C; 2A8G; 2AVI; 2BC3; 2C4I; 2CAM; 2F01; 2FHL; 2FHN; 2G5L; 2GH7; 2IZA; 2IZB; 2IZC; 2IZD; 2IZE; 2IZF; 2IZG; 2IZH; 2IZI; 2IZJ; 2IZK; 2IZL; 2JGS; 2MF6; 2OF8; 2OF9; 2OFA; 2OFB; 2QCB; 2RTA; 2RTB; 2RTC; 2RTD; 2RTE; 2RTF; 2RTG; 2RTH; 2RTI; 2RTJ; 2RTK; 2RTL; 2RTM; 2RTN; 2RTO; 2RTP; 2RTQ; 2RTR; 2WPU; 2Y3E; 2Y3F; 3FDC; 3MG5; 3MM0; 3PK2; 3RDM; 3RDO; 3RDQ; 3RDS; 3RDU; 3RDX; 3RE5; 3RE6; 3RY1; 3RY2; 3T6F; 3T6L; 3VGW; 3VHH; 3VHI; 3VHM; 3WYP; 3WYQ; 3WZN; 3WZO; 3WZP; 3WZQ; 3X00; 4BCS; 4BX5; 4BX6; 4BX7; 4CPE; 4CPF; 4CPH; 4CPI; 4DNE; 4EKV; 4GD9; 4GDA; 4GJS; 4GJV; 4I60; 4IRW; 4JHQ; 4JO6; 4OKA; 4U46; 4Y59; 4Y5D; 4YVB; 4Z27; 4Z28; 4Z2O; 4Z2P; 4Z2V; 4Z6J; 5B5F; 5B5G; 5CHK; 5CSE; 5F2B; 5HLM; 5IRU; 5IRW; 5JD2; 5K67; 5K68; 5L3Y; 5LUR; 5MYQ; 5N7X; 5N89; 5N8B; 5N8E; 5N8J; 5N8T; 5N8W; 5N99; 5TO2; 5VCQ; 5VKX; 5VL5; 5VL8; 5WBA; 5WBB; 5WBC; 5WBD; 6ANX; 6AUC; 6AUE; 6AUH; 6AUL; 6AUO; 6AVK; 6ESS; 6ESU; 6FH8; 6FRY; 6GH7; 6HDS; 6HDT; 6HDV; 6J6J; 6J6K; 6LNG; 6M9B; 6QBB; 6QSY; 6QW4; 6RTQ; 6S4Q; 6S50; 6SOK; 6SOS; 6T1E; 6T1G; 6T1K; 6T2L; 6T2Y; 6T2Z; 6T30; 6T31; 6T32; 6TIP; 6UC3; 6UD1; 6UD6; 6UDB; 6UDC; 6UI0; 6UIU; 6UIY; 6UIZ; 6US6; 6VJK; 6VJL; 6VO9; 6VOB; 6VOZ; 6VP1; 6VP2; 6VP3; 6XND; 6Y25; 6Y2M; 6Y2T; 6Y33; 6Y34; 6Y3Q; 7ALX; 7B74; 7DY0; 7EFC; 7EFD; 7EK8; 7EK9; 7KBY; 7KBZ; 7KNL; 7NLV; 7P4Z; 7ZN1; 7ZOF; 7ZX9; 7ZXZ; 7ZYL; 8AQD; 8AQJ; 8AQO; 8AQX; 8AQY; 8CRN; 8CRP; 8GVK; 8P5Y; 8P5Z; 8PXG
» more