PROSITE entry PS51335
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ELMO |
| Accession [info] | PS51335 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2007 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51335 |
| Associated ProRule [info] | PRU00664 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | ELMO domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=162; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=157; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5759659; R2=0.0136206; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8898.5859375; R2=4.3761907; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=435; H_SCORE=10802; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=289; H_SCORE=10163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='B'; M= -2, 8,-20, 4, 2,-17,-14, -9,-12, -7,-15,-11, 8,-13, -1,-10, 6, 6,-10,-29,-13, 0; /M: SY='H'; M=-11, 1,-21, 1, 6,-23,-18, 57,-28, -5,-19, -6, 5,-17, 9, 0, -6,-15,-26,-29, 5, 4; /M: SY='R'; M= -9,-15,-24,-16, -9,-11,-14, -9, -7, -5, -7, 0,-11,-20, -2, 3, -8, -6, -3,-15, -7, -6; /M: SY='R'; M= -4, 3,-24, 1, 5,-23,-15, -5,-20, 13,-16, -8, 3,-14, 6, 15, -3, -5,-16,-25,-13, 5; /M: SY='L'; M= -2,-21,-21,-25,-16, -4,-25,-14, 12,-13, 17, 12,-19,-22,-13,-11,-17, -8, 10,-22, -4,-16; /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23, 11,-32,-22, 25,-30, 42, 19,-27,-28,-21,-22,-27,-10, 14,-18, 2,-23; /M: SY='Q'; M= -9, -6,-24, -9, -1,-10,-16, -8, -8, -2, -5, -1, -2,-17, 1, -2, -5, -4,-10,-22, -6, -1; /M: SY='D'; M= -4, 8,-23, 10, 4,-22, -7,-10,-26, 4,-21,-16, 3,-12, -1, 1, 3, 2,-17,-26,-14, 1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-33,-23, 8,-33,-21, 29,-29, 38, 19,-26,-27,-20,-23,-26,-10, 16,-18, 4,-23; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='W'; M=-16,-21,-32,-24,-18, 11,-21, -7,-10,-11,-10, -8,-18,-19,-13, -7,-21,-16,-16, 50, 25,-15; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='R'; M= -9, -2,-15, -8, -7, -8,-15, -4,-11, 5,-11, -4, 5,-19, -4, 13, -6, -5, -9,-20, -5, -7; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='A'; M= 8, -8,-16,-11,-10,-11,-11,-15, -2,-10, 1, -2, -8,-16, -9,-12, -3, 0, 1,-22,-11,-10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='L'; M= 9,-17, -8,-20,-14, -6,-16,-13, 3,-18, 11, 3,-15,-19,-13,-17, -7, -4, 4,-22, -8,-14; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='T'; M= -3, -7,-11, -9, -3, -1,-12, -8, -2, -5, -3, 0, -5,-10, -3, -5, 1, 2, 0,-14, -3, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: M= 0, -4,-16, -5, -3, -8, 0, -8,-12, -7,-11, -8, -3, -5, -6, -7, 0, -3, -9,-13, -6, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='P'; M= -5, -6,-26, -3, 1,-24,-12,-15,-20, -4,-23,-15, -6, 27, -5,-10, 5, 7,-18,-30,-20, -4; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: M= -5, -9,-23,-12, -6,-12,-12, -8, -9, -8, -8, -3, -4, -7, -5, -7, -1, 0,-10,-25,-10, -6; /M: SY='E'; M= 0, -2,-21, -1, 9,-23, -6, -4,-22, 3,-21,-13, 1,-11, 5, 0, 9, 2,-15,-28,-15, 6; /M: SY='E'; M= 0, 1,-23, 3, 12,-24,-12,-10,-19, 0,-16,-12, -3, -5, 4, -6, 2, 0,-15,-27,-17, 8; /M: M= -6, -6,-24, -4, -4,-16,-14, -9,-10,-10,-10, -9, -6, 0, -8,-11, -3, -3, -9,-27,-12, -8; /M: SY='K'; M= -8, -4,-14, -4, -2,-19,-11,-10,-24, 6,-25,-15, 0, -3, -1, 3, 2, -4,-19,-26,-13, -2; /M: SY='S'; M= 1, -4,-23, -1, 4,-21, -2, -8,-20, -7,-16,-13, -2, -3, -3,-10, 6, -3,-17,-29,-18, 0; /M: SY='R'; M=-11, -5,-25, -6, -2,-17,-14, -3,-16, 3,-12, -6, -1,-13, -1, 14, -4, -4,-12,-26,-11, -3; /M: SY='V'; M= -8,-13,-21,-16,-15, -1,-21,-14, 2,-10, -2, -1,-11,-21,-13, -7, -5, 5, 6,-18, 4,-16; /M: SY='G'; M= 4, -3,-20, -6, -6,-20, 12,-12,-22,-10,-21,-16, 5,-16, -7, -8, 11, 1,-17,-22,-18, -7; /M: SY='E'; M= -6, 6,-25, 6, 18,-25,-16, -4,-20, 7,-20,-13, 7, -7, 10, 5, 2, -5,-19,-29,-16, 13; /M: SY='H'; M=-13, 2,-28, 4, 16,-26,-19, 25,-25, 10,-20, -5, 3,-12, 19, 11, -4,-11,-24,-26, -5, 16; /M: SY='W'; M=-20,-35,-47,-35,-26, 7,-20,-25,-20,-13,-20,-18,-35,-28,-16,-12,-36,-27,-28,127, 28,-17; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= -3, 0,-24, 1, 16,-24,-13, -8,-21, 10,-17,-11, 0,-10, 7, 5, 0, -4,-16,-26,-15, 11; /M: SY='E'; M=-10, 8,-17, 9, 10,-22,-17, -6,-18, 1,-14,-10, 5,-14, 4, -1, -1, -3,-17,-31,-15, 6; /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-34,-25, 10,-32,-22, 29,-26, 28, 22,-25,-26,-21,-22,-22, -9, 21,-19, 1,-24; /M: SY='G'; M= -1,-11,-31,-10,-19,-30, 65,-20,-39,-19,-30,-20, -1,-14,-19,-20, -1,-19,-30,-21,-30,-19; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-37,-28, 66,-27,-20, 0,-27, 9, 0,-21,-28,-35,-19,-21,-11, -2, 19, 26,-27; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M= -9, -2,-27, -2, 17,-30,-20, 4,-12, 5,-14, 0, -2, -9, 41, 4, -2, -9,-20,-19, -9, 28; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -1, -4,-21, -7,-10,-21, 27,-12,-25,-10,-21,-11, 3,-15, -7, -8, 6, -3,-19,-22,-19, -9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='S'; M= 4, 0,-14, -1, 0,-15,-10, -6,-12, -3,-11, -6, -1,-11, -3, -7, 7, 6, -6,-24,-11, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='D'; M=-11, 33,-21, 41, 11,-28, -6, -1,-28, -2,-26,-23, 21,-10, 0, -8, 8, 0,-22,-35,-17, 5; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='P'; M= -7,-17,-33, -9, -1,-25,-17,-18,-17,-10,-24,-17,-16, 68, -9,-18, -5, -6,-24,-29,-26, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='A'; M= 9,-10,-16,-13, -7,-13,-14, -5, -4,-11, -5, -4, -6,-15, -7,-12, 5, 2, 1,-26, -9, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='T'; M= -1, -2,-11,-10, -8,-11,-17,-15, -8, -9, -7, -5, -1,-11, -5, -9, 15, 35, -2,-28, -9, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M=-17, 38,-27, 55, 18,-35,-11, -1,-32, 0,-25,-24, 14,-10, 2, -8, -1, -9,-24,-36,-18, 10; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='F'; M=-14,-26,-21,-30,-18, 36,-29,-19, 6,-23, 22, 7,-22,-27,-25,-16,-22,-10, 3, -8, 11,-20; /M: SY='R'; M=-14, -7,-28, -7, 3,-21,-19, 10,-27, 19,-19, -9, 1,-18, 11, 47, -7, -8,-20,-22, -8, 3; /M: SY='G'; M= 2, -5,-19, -5, -7,-28, 22, -7,-30, -7,-25,-15, 0,-17, -3, -7, 3,-11,-22,-25,-20, -6; /M: SY='T'; M= 1, -5, 3,-10,-13,-20, 1,-19,-21,-15,-18,-14, -4,-11,-14,-17, 8, 11,-12,-31,-20,-13; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= 2,-11,-28,-12,-19,-27, 61,-20,-35,-20,-24,-17, -2,-20,-19,-20, -1,-18,-26,-20,-28,-19; /M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-27,-19, 8,-29,-17, 17,-18, 20, 16,-23,-25,-17,-13,-19, -8, 16,-18, 2,-18; /M: SY='L'; M=-12,-27,-21,-29,-19, 18,-29,-17, 13,-23, 33, 16,-24,-27,-18,-16,-25,-10, 5,-14, 5,-17; /M: SY='G'; M= 10, -7,-24, -9, -9,-27, 38,-16,-30,-14,-25,-17, -1,-15, -9,-16, 7,-10,-22,-23,-25, -9; /M: SY='L'; M= -5,-27,-19,-28,-19, 5,-26,-19, 18,-26, 37, 17,-26,-27,-18,-19,-22, -7, 11,-22, -3,-19; /M: SY='L'; M=-11,-14,-26,-13, -5, -5,-24,-12, 0,-11, 12, 4,-15,-21, -7, -4,-18,-11, -4,-12, -2, -7; /M: SY='Q'; M= -6, 12,-22, 7, 5,-26,-11, 2,-18, 1,-19, -8, 16,-14, 17, 2, 6, 0,-21,-30,-14, 11; /M: SY='L'; M= -8,-25,-23,-28,-18, 6,-26,-16, 13,-19, 24, 20,-23,-16,-15,-16,-22,-10, 5,-18, -1,-17; /M: SY='V'; M= 2,-23,-16,-26,-20, -2,-25,-18, 15,-19, 16, 8,-22,-25,-19,-15,-12, -3, 20,-25, -7,-20; /M: SY='Y'; M=-14,-11,-27,-13,-13, 9,-20, 14, -9,-12, -4, -3, -9,-24, -7,-10,-13, -9,-14, 5, 31,-11; /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-34,-24, 45,-29,-16, 6,-26, 19, 10,-23,-23,-28,-19,-22,-10, 2, -2, 18,-24; /M: SY='V'; M= 8,-18, -8,-23,-18, -4,-19,-20, 4,-15, 0, -1,-15,-21,-16,-14, -1, 1, 12,-23, -8,-18; /M: SY='E'; M= -3, 1,-24, 4, 20,-25,-17, -6,-22, 10,-17,-12, -1, -9, 11, 7, 1, -3,-17,-27,-15, 15; /M: SY='R'; M= -8, 0,-26, -5, 1,-12,-16, 6,-21, 7,-19,-10, 5,-17, 3, 9, -5, -6,-20,-10, 2, 1; /M: SY='Y'; M=-14,-10,-26, -9, -5, 6,-23, 20,-11, -8, -7, -4, -8,-22, -5, -4, -9, -8,-12, -6, 28, -8; /M: SY='P'; M=-11, -8,-33, -5, 5,-23,-19,-10,-21, 4,-25,-15, -5, 34, 2, 0, -6, -7,-25,-26,-19, 1; /M: SY='E'; M= 0, 9,-24, 13, 14,-28,-14, -8,-23, 3,-20,-16, 2, -4, 5, -3, 3, -2,-18,-29,-17, 8; /M: SY='E'; M= -6, -4,-23, -6, 1, -5,-14, -1,-12,-10, -9, -8, -2,-16, -6, -8, -2, -5,-12,-21, -3, -3; /M: SY='F'; M= -3,-19,-20,-24,-17, 18,-17,-15, -5,-17, 3, -3,-15,-22,-18,-15, -8, -3, -4, -3, 9,-17; /M: SY='Q'; M=-10, -4,-25, -5, 0,-17,-19, 1,-14, 5,-12, -4, -1,-16, 8, 8, -3, -4,-12,-24, -7, 3; /M: SY='R'; M= -4, -1,-27, 0, 12,-26,-13, -5,-24, 18,-20, -8, -2,-12, 10, 19, -5, -9,-19,-23,-14, 10; /M: SY='L'; M= -4,-24,-21,-29,-18, 4,-27,-18, 19,-23, 27, 19,-22,-22,-15,-19,-19, -7, 11,-20, -2,-17; /M: SY='L'; M=-10,-27,-25,-29,-19, 3,-27,-20, 15,-22, 21, 15,-25,-25,-15,-19,-22,-11, 8, 2, 2,-17; /M: SY='Q'; M= -5, -6,-15, -7, 1,-17,-19,-11,-12, 1, -7, -4, -6,-16, 2, 1, -2, 2, -8,-27,-12, 1; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='E'; M= -6, -5,-21, -3, 12, -9,-17, -5,-12, 3, -7, -6, -7, -6, 3, -2, -6, -5,-13,-14, -1, 7; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='N'; M= -4, 6, -5, 1, 1,-20,-10, -2,-15, 0,-16, -7, 9, -8, 8, -3, 1, -4,-16,-24,-13, 4; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='A'; M= 2, -9,-18,-15,-12, -8,-16,-12, 1,-11, 0, 0, -4,-19,-10,-10, -1, 2, 2,-25, -7,-12; /M: SY='S'; M= 10, -6,-16,-11, -5,-12, -4,-13,-15, -8,-15, -8, -2,-13, -5,-11, 13, 8, -8,-25,-13, -4; /M: SY='R'; M= -9, 9,-26, 8, 3,-26,-10, -2,-27, 13,-23,-14, 10,-16, 7, 25, -1, -5,-22,-26,-15, 3; /M: SY='P'; M= -7, -7,-29, -4, 7,-23,-17, -3,-18, 1,-18,-11, -5, 8, 0, 3, -5, -7,-17,-26,-14, 1; /M: SY='E'; M= 2, 3,-25, 8, 11,-26, -7,-11,-21, -4,-18,-16, -2, 2, -2,-11, 1, -6,-18,-29,-20, 3; /M: SY='G'; M= -4, 1,-26, 0, 1,-27, 6, -9,-25, 1,-24,-14, 5, -9, 4, -1, 3, -6,-22,-26,-19, 2; /M: SY='H'; M=-11, -1,-26, -2, -2,-14,-14, 5,-13, -9,-11, -7, 1,-14, -1, -7, -5, -7,-14,-21, -6, -3; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='E'; M=-13, 0,-30, 1, 10,-15,-13, -4,-24, 6,-20,-16, 1,-15, 3, 8, -9,-12,-25, 8, -3, 6; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='Y'; M=-15,-25, -3,-29,-25, 25,-29,-11, 1,-22, 5, 0,-22,-30,-23,-18,-19,-10, 1, 7, 27,-24; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='P'; M= -7,-16,-32,-10, -1,-24,-19,-17,-16,-11,-21,-14,-15, 56, -6,-16, -4, -2,-22,-29,-23, -7; /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-34,-25, 42,-29,-18, 10,-26, 19, 11,-23,-24,-28,-19,-21, -9, 6, -4, 16,-25; /M: SY='A'; M= 17,-13, -8,-21,-15,-10, -9,-19, -4,-13, -7, -2,-11,-16,-13,-14, 4, 3, 4,-24,-13,-14; /M: SY='V'; M= -9,-25,-21,-26,-19, -3,-29,-21, 15,-13, 14, 8,-22,-19,-17, -3,-17, -7, 18,-24, -7,-20; /M: SY='V'; M= 8,-18,-15,-24,-19, -6,-20,-19, 11,-12, 1, 7,-17,-20,-15,-16, -3, 2, 19,-23, -6,-18; /M: SY='S'; M= -1,-10,-13,-11,-11,-14, 5,-14,-19,-14,-17,-13, -4,-19,-10,-11, 10, 2,-13,-17,-11,-11; /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-35,-26, 13,-33,-22, 30,-25, 18, 18,-21,-23,-21,-23,-18, -6, 20,-15, 7,-25; /M: SY='N'; M= -6, 14,-21, 3, 0,-15,-10, 0,-16, 0,-19,-12, 25,-18, 2, 4, 4, 0,-19,-30,-14, 1; /M: SY='L'; M= -8,-25,-12,-29,-23, 9,-25,-16, 11,-22, 13, 7,-20,-27,-22,-16,-16, -9, 12,-18, 1,-23; /M: SY='T'; M= 0, -7, -4,-16,-14, -9,-22,-20, -4,-13, -4, -3, -6,-15,-12,-13, 10, 34, 4,-29,-10,-13; /M: SY='S'; M= -1, 0,-20, -3, -3,-13, -5, -9,-17, -3,-15, -8, 4,-15, -3, -4, 5, 1,-13,-26,-12, -3; /M: SY='I'; M=-11,-14,-26,-19,-10, -4,-25, -7, 9,-15, 4, 9, -9,-20, -4,-14,-12, -9, 1,-12, 2, -9; /M: SY='L'; M= 6,-21,-16,-24,-16, -4,-21,-20, 11,-20, 17, 7,-20,-22,-14,-18, -9, -1, 12,-24, -8,-15; /M: SY='L'; M= -8,-23, -9,-25,-17, 7,-27,-14, 7,-20, 19, 8,-22,-27,-16,-15,-19, -9, 5,-15, 7,-17; /M: SY='D'; M=-11, 14,-26, 21, 21,-26,-17, -3,-21, -2,-12,-13, 3,-11, 9, -6, -2, -5,-19,-31,-15, 15; /M: SY='Q'; M= -5,-11,-23,-14, -3,-12,-21, 4, -3, -9, 1, 9, -9,-17, 10, -7, -7, -6, -7,-22, -3, 3; /M: SY='L'; M= -6,-23,-21,-27,-17, 18,-25,-13, 4,-18, 19, 6,-20,-26,-16,-10,-19, -9, 0, -9, 11,-16; /M: SY='E'; M=-11, 6,-28, 10, 12,-26,-15, -7,-20, 11,-20,-12, 3,-12, 5, 7, -3, -8,-16,-28,-14, 8; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='V'; M= -3, -6,-18, -5, -2,-14,-19, -8, -5, -4, -9, -5, -8,-17, -5, -7, 0, 0, 4,-26, -7, -4; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M= -6, 0,-17, 1, 5,-12, -4, -1,-17, 3,-14, -9, 0, -4, 1, -1, -1, -4,-14,-15, -7, 3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='D'; M= -3, 6,-14, 10, 7,-16, -2, 1,-16, -1,-14,-11, 3, -2, 1, -2, 2, -4,-13,-17,-10, 3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -3, -9,-16, -9, 0, -9,-12,-10, 1, -5, 0, -1, -7,-10, -4, -5, -5, -5, 0,-16, -7, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= 0, -5,-18, -5, 3,-15,-11, -7,-11, 3,-10, -5, -4, 6, 0, 3, -4, -5,-11,-17,-12, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= -2, -2,-19, 1, -7,-17, 11,-12,-16,-11,-12,-11, -3, -5,-10,-13, -1, -5,-12,-20,-16, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M= -5, -4,-18, -6, -2,-11,-14, 1,-15, 8,-14, -7, -1,-12, 4, 13, 1, 3,-11,-14, 2, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: M= -1, -4,-23, -3, -1,-15, -9,-14,-14, -4, -6, -8, -6,-12, -7, -8, -5, -6,-10,-25,-13, -4; /M: SY='A'; M= 7, -1,-19, -4, 0,-18,-14, -8,-13, -1,-12, -8, -3,-14, -1, -6, 1, 0, -7,-25,-12, -1; /M: SY='L'; M= -6,-21, -1,-24,-15, -1,-21,-18, 3,-23, 19, 7,-20,-26,-14,-18,-16, -8, 0,-24, -8,-15; /M: SY='N'; M= -8, 13,-18, 10, 3,-16, -9, -4,-22, -2,-21,-17, 15,-17, -4, -6, 1, -5,-21,-22,-11, 0; /M: SY='D'; M= -8, 8,-19, 9, 8,-24, -7, -3,-25, 1,-20,-15, 8,-15, 5, 2, 1, -6,-22,-28,-14, 5; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-15,-22,-23,-26,-21, 34,-16, -7, -6,-20, 5, 0,-15,-26,-24,-15,-16, -9, -6, -1, 21,-21; /M: M= -8, -4, -4, -6, -9,-13,-18,-11, -9,-11, -8, -7, -6,-21,-12,-11, -7, -6, -3,-29,-12,-11; /M: SY='K'; M=-11, 3,-28, -1, 3,-24,-16, -5,-17, 10,-22,-11, 9, 2, 5, 10, -4, -7,-19,-28,-16, 2; /M: SY='I'; M= -5,-13,-20,-14, -9, -9,-18,-15, 4,-15, 4, 3,-11,-19, -8,-12, -2, 0, 4,-27,-10,-10; /M: SY='F'; M= -9,-20,-22,-25,-13, 14,-26,-18, 6,-15, 9, 3,-15,-22,-17, -9,-13, -5, 4,-15, 2,-15; /M: SY='D'; M=-13, 4,-26, 8, 7,-11,-11, -3,-24, -3,-17,-15, 0,-11, -4, 0, -4, -7,-18,-24, -9, 1; /M: SY='P'; M= -1, -6,-24, -4, 7,-24, -8,-12,-19, -4,-19,-13, -5, 9, 2, -9, 5, 1,-17,-29,-19, 4; /M: SY='L'; M= -4, -6,-21, -7, -8, -7,-20, -4, -2,-16, 7, 2, -9,-20,-11,-14,-10, -5, -1,-25, -5,-10; /M: SY='D'; M=-13, 5,-27, 12, 12,-16,-20, -7,-14, -5, -8,-11, -4,-14, -1, -9, -7, -7,-15,-18, -4, 4; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='Q'; M= -3, -6,-19, -9, -1,-14,-15, -2, -8, -2, -5, 0, -3, -8, 5, 2, -3, -3, -9,-20, -8, 1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: M= 0,-14,-22,-17,-12,-10,-12, -8, -9,-11, -9, -5,-10,-12, -8, -8, -3, 0, -4,-15, -7,-11; /M: SY='F'; M=-17,-29,-13,-37,-28, 42,-28,-20, 1,-26, 6, 2,-23,-29,-29,-20,-23,-13, -2, 20, 21,-26; /M: SY='E'; M= -9, -2, -4, -2, 1, -9,-18, -5,-20, -8,-17,-14, -3,-12, -7,-11, 1, -1,-16,-26, -5, -3; /M: SY='E'; M= 0, -2,-24, -3, 13,-21,-16, -7,-18, 7,-12,-10, -2,-12, 6, 9, -2, -4,-15,-24,-14, 8; /M: SY='L'; M= -9,-27,-13,-30,-22, 18,-29,-17, 12,-26, 28, 11,-26,-30,-22,-19,-23, -8, 9,-13, 10,-22; /M: SY='Y'; M=-20,-15,-27,-18,-15, 26,-26, 39,-11,-16, -5, 0, -9,-26,-11, -9,-16,-14,-15, 1, 43,-15; /M: SY='C'; M= 2,-11, 20,-17,-14,-13,-20,-10,-11,-16,-12, -9, -9,-23,-13,-16, 0, 0, 0,-33,-14,-13; /M: SY='A'; M= 5,-16,-13,-21,-16, -8, -4,-11, -5,-17, -3, 0,-12,-20,-11,-18, -6, -8, -4,-18, -4,-15; /M: SY='A'; M= 7,-19, -8,-25,-20, -6, -9,-22, 2,-22, 4, 0,-15,-21,-18,-22, -7, -6, 2,-22,-11,-20; /M: SY='F'; M= -9,-28,-18,-33,-25, 28,-28,-20, 16,-26, 24, 14,-25,-28,-26,-20,-20, -8, 14,-12, 7,-24; /M: SY='H'; M= -8, -8,-17,-11, -2, -6,-21, 14,-14, -8, -5, -3, -5,-19, 1, -4, -9, -8,-14,-19, 5, -2; /M: SY='L'; M= -3, -9,-20,-10, -6,-11,-18, -2, -5,-10, 5, 3, -7,-19, -4, -6, -7, -4, -5,-26, -7, -5; /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27, 49,-31,-20, 11,-29, 24, 10,-23,-29,-31,-21,-23,-10, 6, -3, 17,-26; /M: SY='H'; M=-11, 1,-16, 1, -7, -3,-20, 4,-14, -8,-10, -8, -2,-21,-11, -9, -8, -7, -8,-23, 1,-10; /M: SY='R'; M= -8, -1,-26, -1, 14,-22,-18, -3,-23, 16,-18,-11, 1,-12, 11, 20, -3, -5,-20,-22, -9, 11; /M: SY='L'; M= -8,-14,-10,-17, -8, -2,-25,-15, -1,-14, 2, -1,-13,-20, -6,-11, -9, -3, -2,-22, -6, -7; /M: SY='W'; M=-20,-38,-46,-39,-29, 14,-21,-27,-17,-20,-15,-17,-38,-30,-21,-20,-38,-27,-26,131, 31,-21; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M=-11, -5,-27, -5, 6,-19,-16, -2,-21, 17,-15, -6, -3,-15, 5, 19, -7, -7,-16,-21, -6, 4; /M: SY='R'; M= -2, 2,-25, 2, 8,-24,-10, -3,-26, 10,-22,-14, 3, -8, 3, 13, 1, -4,-19,-26,-15, 4; /M: SY='R'; M= -9, -3,-24, -3, 3,-17,-14, -6,-16, 3,-12, -2, -3,-10, 5, 6, -2, -2,-14,-25,-11, 3; /M: SY='Q'; M= -5, -7,-27, -7, 1,-24, -2, -2,-20, -2,-16, -8, -4, -6, 5, -3, -3, -8,-19,-24,-14, 2; /M: SY='A'; M= 11, -7, -9,-12, -4,-22,-14,-15,-16, 0,-17,-12, -5, 0, -4, -7, 1, 0,-11,-26,-18, -5; /M: SY='T'; M= -3, 3,-11, -2, -1,-16,-15, -1,-18, -5,-17, -9, 5,-14, -1, -6, 9, 12,-12,-30,-10, -1; /M: SY='I'; M= -9,-20,-24,-24,-20, 3,-18,-15, 11,-17, 2, 4,-14,-23,-15,-14,-11, -8, 9,-15, 5,-19; /M: SY='M'; M= -3, -9,-21,-11, -4, -9, -9, -5, -5,-10, -1, 13, -9,-16, -4,-12, -6, -6, -5,-23, -9, -4; /M: SY='D'; M=-12, 29,-27, 37, 23,-30,-12, 1,-30, 2,-24,-22, 16,-10, 6, -6, 2, -6,-27,-33,-16, 14; /M: SY='F'; M=-15,-22,-22,-28,-23, 40,-23, -9, 1,-21, 5, 3,-16,-26,-24,-16,-13, -4, -2, 3, 29,-22; /M: SY='N'; M= -9, 17,-26, 10, -1,-21, 8, -3,-23, -7,-25,-17, 25,-13, -4, -8, 2, -8,-26,-30,-19, -2; /M: SY='K'; M= -7, -6,-24, -7, -1,-17,-16,-10,-15, 8,-18, -8, -4, -5, -3, 1, -2, 0, -8,-25,-11, -2; /M: SY='V'; M= -8,-22,-20,-25,-23, 2,-29,-10, 20,-18, 5, 8,-18,-26,-17,-17,-12, -5, 23,-19, 6,-22; /M: SY='L'; M= -2,-22,-18,-25,-17, 5,-23,-17, 9,-17, 20, 13,-20,-23,-15,-12,-14, -4, 8,-20, -3,-16; /M: SY='E'; M= -6, -1,-15, 0, 13,-24,-18, -4,-22, 13,-22,-12, -1,-12, 6, 4, 3, -2,-14,-29,-14, 10; /M: SY='K'; M= -1,-10,-21,-10, 1,-15,-19,-10, -7, 2, -6, -4, -9,-16, -3, -1, -4, -4, -2,-26,-11, -2; /M: SY='V'; M= -2,-20,-17,-26,-21, 7,-26,-19, 13,-16, 7, 9,-18,-22,-19,-16, -8, 4, 17,-18, 1,-20; /M: SY='R'; M= -9,-12,-18,-12, -4,-13,-22, -7,-14, 9, -7, -4, -9,-20, -2, 17, -9, -5, -7,-22, -6, -5; /M: SY='E'; M= -2, -7,-24, -7, 9,-16,-19, -7,-13, 2,-13, -9, -6, -7, 0, 1, -2, -5,-10,-24,-11, 3; /M: SY='Q'; M= -5, -4,-24, -3, 7,-20,-15, -6,-16, 3,-13, -6, -4,-14, 14, 2, -1, -5,-15,-24,-11, 10; /M: SY='L'; M= -7,-21,-15,-26,-20, 4,-28,-20, 15,-22, 20, 9,-18,-24,-18,-18,-16, -3, 10,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M= -8, 0,-25, 2, 13,-15,-17, -2,-22, 7,-16,-10, -1,-12, 3, 9, -1, -6,-17,-25,-10, 7; /M: SY='R'; M=-10, 2,-26, 0, 3,-21,-11, 4,-25, 9,-22,-12, 8,-11, 8, 19, 0, -6,-22,-26,-12, 4; /M: SY='T'; M= 0, -7,-20,-10, -3,-16,-18,-14, -5, -3,-10, -6, -5, -7, -5, -7, 0, 2, -2,-28,-14, -4; /M: SY='L'; M= -9,-21,-22,-23,-14, 2,-23,-19, 6,-18, 13, 6,-20, -9,-17,-16,-15, -4, 3,-21, -6,-16; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of true positive hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | ELMO |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
30 sequences
CED12_CAEBR (A8XEZ1), CED12_CAEEL (Q8STE5), ELMD1_BOVIN (Q0IIE6), ELMD1_HUMAN (Q8N336), ELMD1_MOUSE (Q3V1U8), ELMD1_PONAB (Q5NVD7), ELMD2_BOVIN (Q08DZ3), ELMD2_HUMAN (Q8IZ81), ELMD2_MOUSE (Q8BGF6), ELMD3_BOVIN (Q58DT5), ELMD3_CAEEL (Q09292), ELMD3_HUMAN (Q96FG2), ELMD3_MOUSE (Q91YP6), ELMD3_RAT (Q5XIQ2), ELMO1_HUMAN (Q92556), ELMO1_MOUSE (Q8BPU7), ELMO2_BOVIN (A4FUD6), ELMO2_HUMAN (Q96JJ3), ELMO2_MOUSE (Q8BHL5), ELMO2_PONAB (Q5RCC1), ELMO3_BOVIN (A6QR40), ELMO3_HUMAN (Q96BJ8), ELMO3_MOUSE (Q8BYZ7), ELMO3_RAT (Q499U2), ELMOA_DICDI (Q54YW1), ELMOB_DICDI (Q54VR8), ELMOC_DICDI (Q54RS7), ELMOD_DICDI (Q54UP9), ELMOE_DICDI (Q54WH5), ELMOF_DICDI (Q55GR7)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
6IDX; 6IE1; 6TGB; 6TGC; 7DPA |