Entry: PS51345

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MYOTOXINS_2
Accession [info] PS51345
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2007 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00435
Associated ProRule [info] PRU00677

Name and characterization of the entry

Description [info] Myotoxins family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0165193; R2=0.0079135; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-2314.00786; R2=20.38293; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=883; N_SCORE=9.0; H_SCORE=13095; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=567; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9243; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='Y'; M=-21,-31,-20,-23, 32,-27, 14, -6,-15, -3,  1,-21,-33,-10,-12,-15,-15,-11, 24, 81;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='R'; M=-13,-33, -9,  6,-29,-23,  0,-29, 22,-23,-11, -3,-21, 42, 58, -6,-14,-26,-24,-11;
/M: SY='C'; M=-10,124,-30,-30,-21,-26,-30,-28,-26,-18,-18,-17,-41,-34,-33,-13,-10,-15,-51,-31;
/M: SY='H'; M=-19,-30, -2, -3,-17,-20,101,-35, -7,-18, -3,  8,-19,  4, -1, -8,-17,-35,-53, 14;
/M: SY='K'; M=-13,-27,-11,  0,-17,-24,-14, 16, 44, -8, -3, -4,-15,  3, 16,-11, -7,  1,-22,-12;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='G'; M=  0,-27, -4, 13,-32, 64,-16,-39,-11,-33,-24, -1,-14, -7,-20,  0,-16,-32,-24,-26;
/M: SY='G'; M=  2,-26,-14,-25,-32, 73,-20,-40,-19,-35,-25,  1,-17,-17,-26,  2,-17,-33,-23,-27;
/M: SY='H'; M=-19,-30, -2, -3,-17,-20,101,-35, -7,-18, -3,  8,-19,  4, -1, -8,-17,-35,-53, 14;
/M: SY='C'; M=-10,124,-30,-30,-21,-26,-30,-28,-26,-18,-18,-17,-41,-34,-33,-13,-10,-15,-51,-31;
/M: SY='F'; M=-25,-21,-37,-33, 80,-32,-17,  2,-28, 10,  0,-26,-35,-39,-25,-23,-17, -3, 10, 32;
/M: SY='P'; M=-16,-41,-16, -5,-35,-17,-19,-23,-12,-34,-20,-23, 96,-16,-25,-13, -8,-28,-29,-33;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='E'; M= -7,-25, 15, 55,-29,-24, -5,-27,  7,-23,-19, -4, -5, 13, -3, -1, 14,-19,-31,-21;
/M: SY='K'; M= -9,-24, -9,  4,-22,-22,-12, -7, 49,-16, -9, -2,-15,  6, 20, -8, -5,  5,-24,-14;
/M: SY='I'; M=-14,-28,-35,-34,  2,-40,-35, 56,-28, 19, 15,-25,-23,-25,-32,-23, -8, 32,-23, -6;
/M: SY='C'; M=-10,124,-30,-30,-21,-26,-30,-28,-26,-18,-18,-17,-41,-34,-33,-13,-10,-15,-51,-31;
/M: SY='I'; M=-13,-21,-29,-27,  3,-34,-25, 39,-24, 31, 16,-22,-24,-21,-26,-16,  8, 22,-24, -6;
/M: SY='P'; M=-16,-41,-16, -5,-35,-17,-19,-23,-12,-34,-20,-23, 96,-16,-25,-13, -8,-28,-29,-33;
/M: SY='P'; M=-16,-41,-16, -5,-35,-17,-19,-23,-12,-34,-20,-23, 96,-16,-25,-13, -8,-28,-29,-33;
/M: SY='S'; M= 10,-13, -5, -6,-23,  2, -8,-23, -6,-27,-20,  7,-13,  2,-10, 51, 15,-15,-32,-15;
/M: SY='S'; M= 10,-13, -5, -6,-23,  2, -8,-23, -6,-27,-20,  7,-13,  2,-10, 51, 15,-15,-32,-15;
/M: SY='D'; M=-17,-30, 76, 20,-37,-14, -2,-35, -4,-34,-33, 16,-16, -3,-13, -5, -7,-32,-53,-20;
/M: SY='F'; M=-23,-20,-37,-31, 73,-33,-17,  6,-28, 21,  5,-27,-35,-35,-25,-24,-16,  0,  6, 27;
/M: SY='G'; M=  2,-26,-14,-25,-32, 73,-20,-40,-19,-35,-25,  1,-17,-17,-26,  2,-17,-33,-23,-27;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='M'; M=-10,-18,-33,-22,  0,-25, -3, 15,-15, 23, 72,-19,-20, -7,-13,-20, -9,  8,-23,  1;
/M: SY='D'; M=-17,-30, 76, 20,-37,-14, -2,-35, -4,-34,-33, 16,-16, -3,-13, -5, -7,-32,-53,-20;
/M: SY='C'; M=-10,124,-30,-30,-21,-26,-30,-28,-26,-18,-18,-17,-41,-34,-33,-13,-10,-15,-51,-31;
/M: SY='R'; M=-16,-35,-14, -2,-28,-23, -6,-29, 19,-27,-15,-10, 50,  4, 58,-11,-13,-26,-26,-17;
/M: SY='W'; M=-25,-51,-53,-30, 10,-23,-53,-23,-21,-20,-23,-46,-29,-21,-25,-32,-37,-38,150, 24;
/M: SY='R'; M=-14,-29, -8,  5,-27,-22, -4,-30, 46,-26,-14, -1,-18, 11, 53, -8,-10,-25,-23,-13;
/M: SY='W'; M=-22,-44,-36,-19,  2,-24,-30,-25,  0,-21,-20,-29,-27, -9, 29,-24,-29,-34,135, 16;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='C'; M= -3,110,-21,-21,-21,-16,-22,-26,-19,-21,-19, -8,-31,-19,-25, 17, -1,-15,-44,-26;
/M: SY='C'; M=-12,110,-31,-29, -9,-29,-26, -8,-27, 16, -1,-21,-39,-29,-30,-17,-11, -5,-39,-20;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='K'; M=-12,-26, -4, 10,-28,-19, -7,-28, 57,-27,-15,  3,-12, 11, 27, -6, -6,-24,-21,-15;
/M: SY='G'; M=  2,-26,-14,-25,-32, 73,-20,-40,-19,-35,-25,  1,-17,-17,-26,  2,-17,-33,-23,-27;
/M: SY='S'; M= 10,-13, -5, -6,-23,  2, -8,-23, -6,-27,-20,  7,-13,  2,-10, 51, 15,-15,-32,-15;
/M: SY='G'; M=  1,-22,-19,-26,-20, 56,-25,  0,-21,-13,-10, -7,-21,-20,-26, -4,-10, 16,-28,-21;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 17 in 17 different sequences
Number of true positive hits 17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
17 sequences

MYC1_CRODU  (O57540), MYC2_CRODU  (Q9PWF3), MYC3_CRODU  (O73799), 
MYX1_CRODU  (P24331), MYX1_CROOO  (P12028), MYX1_CROVV  (P01476), 
MYX2_CRODU  (P24332), MYX2_CROOO  (P12029), MYX2_CROVV  (P63175), 
MYX3_CRODU  (P24333), MYX3_CROVV  (P63176), MYX4_CRODU  (P24334), 
MYXC2_CRODM (P86193), MYXC3_CRODM (P86194), MYXC_CROOH  (P01477), 
MYX_CROAD   (P24330), MYX_CRODR   (P63327)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

1H5O; 1Z99; 4GV5

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission