ID   R; MATRIX.
AC   PS51370;
DT   01-FEB-2008 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   R domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=18;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=2; N2=17;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3189075; R2=0.0066435; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=831.7242432; R2=0.5957580; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=931; H_SCORE=1386; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=630; H_SCORE=1207; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-34; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-35,-60,-46,-34,-50,-49,-54,-55,82,-54,-39,-34,-22,-42,38,21,-3,-45,-55,-51;
MA   /M: SY='E'; M=0,-47,20,76,-59,-12,-48,-36,-31,-10,36,-47,-46,-41,-51,-47,-49,5,-53,-53;
MA   /M: SY='S'; M=-39,-53,-45,-23,-11,-22,-48,-18,-42,-3,-45,7,-44,-48,-49,86,-15,-47,-60,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-48,-57,-51,-49,-48,-12,-51,-60,-23,-56,-45,-54,-50,-27,104,-46,-59,-52,1,-39;
MA   /M: SY='A'; M=64,31,-2,43,-54,-18,-53,-20,-42,-45,-43,-45,-48,-40,-50,-35,-8,14,-60,-60;
MA   /M: SY='K'; M=-44,-59,-44,-32,-50,-49,-53,-54,90,-51,-21,11,-41,24,31,-41,-49,-54,-53,-50;
MA   /M: SY='A'; M=91,-56,-40,-37,-52,-45,-55,-45,-44,-50,-39,-43,-49,-37,-49,-36,10,-23,-70,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-48,-56,-51,-49,-48,-55,-50,-60,-34,-56,-45,-54,-51,-26,107,-46,-59,-51,-45,-39;
MA   /M: SY='A'; M=79,-53,-40,38,-55,-9,-52,-48,-25,-51,-41,-44,-40,11,-42,-39,-33,-35,-61,-64;
MA   /M: SY='R'; M=-48,-58,-49,-44,-49,-53,-50,-59,35,-56,-43,-52,12,-29,96,-45,-56,-52,-47,-42;
MA   /M: SY='A'; M=89,-61,-44,-49,-56,-5,-59,-49,-48,-55,-43,-47,-52,-41,-53,-40,-42,-41,-71,-72;
MA   /M: SY='R'; M=-52,-59,-53,-3,-53,-54,-54,-64,8,-59,-42,-56,-52,-31,97,-47,-61,-56,-49,-44;
MA   /M: SY='E'; M=-31,-50,-41,89,-75,-34,-53,-70,-20,-58,-57,-57,-49,-44,-59,-55,-63,-70,-58,-66;
MA   /M: SY='R'; M=-58,-67,-61,-60,-58,-57,-61,-70,-44,-66,-55,-64,-60,-36,96,-55,-30,-61,-56,-49;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-69,-57,-43,-67,-62,-67,-57,-59,-56,-58,-50,-21,-57,-69,10,88,-51,-83,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-56,-34,-59,-46,-62,-56,-62,-65,53,-64,32,3,-60,-46,45,4,-35,-64,-66,-61;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-55,-18,76,-75,-65,-58,-62,-13,-61,-59,6,-54,-49,-62,-57,-43,-70,-65,-42;
MA   /M: SY='K'; M=-29,-74,-59,-41,-63,-63,-65,-67,75,-65,25,-57,-56,-53,29,-55,-57,-65,-66,-62;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=11(11); /POSITIVE=11(11); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=R;
CC   /VERSION=6;
DR   Q9SBV9    , CYCLD_ANTCI, T; Q9SBV6    , CYCLD_ANTLN, T;
DR   O49250    , CYCLD_ANTMA, T; Q9SNW8    , DICH_ANTMA , T;
DR   Q93WI2    , TB1_MAIZE  , T; Q8LN68    , TB1_ORYSJ  , T;
DR   A0AQW4    , TCP12_ARATH, T; A1YKT1    , TCP18_ARATH, T;
DR   Q9FYG7    , TCP1_ARATH , T; Q9C758    , TCP24_ARATH, T;
DR   Q93V43    , TCP2_ARATH , T;
DR   Q9SU08    , AUXI1_ARATH, N; Q0WQ57    , AUXI2_ARATH, N;
PR   PRU00702;
DO   PDOC51370;
//