ID   XIN; MATRIX.
AC   PS51389;
DT   01-JUN-2008 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Xin repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=16;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=2; N2=15;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2644210; R2=0.0075506; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=826; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=614; N_SCORE=6.9; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-45; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=31,13,-95,-99,-108,88,-101,-104,-3,-106,-98,-83,-98,-94,-99,-30,-19,-5,-106,-104;
MA   /M: SY='D'; M=-41,8,93,24,-113,8,-83,-112,-83,-112,-106,64,-97,11,-91,-25,-85,-109,-122,-101;
MA   /M: SY='V'; M=-84,-97,-111,-105,-22,-113,-112,16,-102,-35,-73,-105,-107,-105,-30,-94,6,99,-114,-90;
MA   /M: SY='Q'; M=-89,-108,-5,-26,-111,-96,31,-107,58,-104,-93,-7,-96,96,19,23,-16,-105,-107,-92;
MA   /M: SY='T'; M=-28,-101,-26,-82,-103,-27,-5,-98,44,-49,-8,28,-17,35,35,32,47,-30,-110,-95;
MA   /M: SY='T'; M=23,38,-24,-86,-19,-3,-90,-94,18,-96,-11,38,-98,41,-87,16,46,-7,-106,5;
MA   /M: SY='R'; M=-90,25,-92,-83,-99,-102,-90,-37,65,-12,-89,-84,-98,-78,70,0,49,-24,-108,-94;
MA   /M: SY='W'; M=-95,-113,-91,21,13,-102,80,-102,25,-38,-90,-89,-100,58,-13,-8,-96,-105,118,20;
MA   /M: SY='L'; M=-93,-2,-110,-102,-1,-113,-98,27,13,61,55,-104,-108,-96,-12,-101,-90,32,-101,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-105,-101,-118,-113,126,-113,-98,-78,-109,-26,-80,-107,-116,-119,-106,-104,-97,-83,-71,-50;
MA   /M: SY='E'; M=-89,-111,-66,107,-114,8,-84,-114,-73,-107,-101,-85,-88,52,-81,-85,-91,-107,-108,-102;
MA   /M: SY='T'; M=26,-95,-84,-18,-102,-89,2,-96,-86,-100,-94,44,14,-86,-93,46,84,-89,-115,-97;
MA   /M: SY='Q'; M=-90,32,22,49,-39,-29,-86,-33,-3,-4,-89,-21,-96,83,-51,-29,24,-96,-106,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-29,-105,-9,5,-109,-42,-89,-103,-85,-108,-98,43,83,29,-93,51,28,-101,-113,-102;
MA   /M: SY='L'; M=21,18,-14,-100,33,-46,24,-2,-101,61,25,-99,-107,-97,-101,-1,-89,-16,-101,-81;
MA   /M: SY='D'; M=-48,51,74,25,-103,8,-87,-40,-87,-106,-101,27,-20,-84,-94,44,-14,-101,-113,11;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=171(7); /POSITIVE=171(7); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=28;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Xin;
CC   /VERSION=3;
DR   Q91957    , XIRP1_CHICK, T; Q5PZ43    , XIRP1_DANRE, T;
DR   Q702N8    , XIRP1_HUMAN, T; O70373    , XIRP1_MOUSE, T;
DR   A4UGR9    , XIRP2_HUMAN, T; Q4U4S6    , XIRP2_MOUSE, T;
DR   Q71LX6    , XIRP2_RAT  , T;
PR   PRU00721;
DO   PDOC51389;
//