Entry: PS51398

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PAW
Accession [info] PS51398
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUL-2008 (CREATED); JUL-2008 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51398
Associated ProRule [info] PRU00731

Name and characterization of the entry

Description [info] PAW domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=196;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=196;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8598983; R2=0.0215293; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=262; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -3,  8,-17,-24,-14,-15, -7,-15,-11, -6,-18, -4,-14, -5, -1,-11,-26,-14,  5;
/M: SY='M'; M= -5,-14,-18,-17,-12,-12,-25,-18,  0,-14,  3,  4, -8,-24,-11,-18, -7,  2,  0,-27,-13,-11;
/M:         M= -5,-11,-23,-12, -7,-22, -6,-15,-13, -5,-12, -7, -8,-17, -4,-14, -4, -2,-12,-27,-16, -5;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-23,-11,-16,-32, 27,-18,-24,-10,-26,-19, -3,-17, -9,-17,  4, -1,-21,-30,-23,-10;
/M: SY='R'; M= -4,-10,-23,-15, -8,-23,-16,-11,-23,  4,-20,-14, -6,-17, -2, 10,  7,  6,-16,-28,-14, -6;
/M: SY='T'; M= -5,-19,-18,-22,-16, -5,-24,-20, -3,-17, -5, -3,-14,-13,-15,-21, -1,  6, -1,-22, -9,-15;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-16, -1, -4,-28,-11,-10,-20, -2,-23,-14, 13,-12, -3,-11, 19, 15,-14,-35,-19, -1;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-22, -9,-16,-25, 15,-18,-18,-15,-19,-14, -1,-18,-13,-22,  0, -3,-17,-30,-21,-12;
/M: SY='S'; M=  3,  1,-17,  0,  0,-29,-11,-10,-24,  2,-23,-15,  6,-11,  1, -8, 21, 11,-17,-35,-20,  3;
/M: SY='T'; M= -4,-14,-12,-17,-13,-11,-20,-18, -5,-15, -3, -1,-10,-23,-12,-20, -1,  3, -3,-28,-13,-12;
/M: SY='E'; M=  0, -3,-24,  0,  3,-23,-17, -1,-22, -6,-22,-14, -1, -4,  0,-13,  2, -1,-18,-30,-11,  2;
/M: SY='W'; M=-16,-24,-34,-22,-10, -3,-21,-16,-25,-15,-20,-13,-20,-22, -6,-19,-16,-14,-23, 43,  6, -7;
/M: SY='R'; M= -8, -7,-30,-12, -1,-30,-19, -7,-28, 14,-25,-16, -4,-13,  3, 22, -3, -6,-22,-32,-16, -1;
/M: SY='Q'; M= -9, -7,-22,-12, -6,-18,-21, -1,-13, -2,-10, -5, -1,-21,  1, -7, -4, -2,-11,-28,-10, -4;
/M: SY='Q'; M= -3,-13,-22,-15,-10,-18,-19, -2,-11, -8,-11, -4, -6,-11,  1,-14, -3, -4,-10,-27, -9, -5;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-30, -9,  3,-31,-23, -4,-26, 15,-23,-13, -6,-13, 13, 20, -4, -6,-21,-28,-14,  5;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-26,  0,-13,-30, 14,-13,-29,-11,-30,-22,  2, -5, -9,-18,  7, -2,-26,-32,-19, -9;
/M: SY='E'; M=-11, -1,-28,  6, 18,-20,-26, -1,-22, -5,-19,-13, -6, -9,  2,-12, -9, -6,-18,-28, -9, 13;
/M: SY='T'; M= -8,-11,-20,-14, -7,-13,-24,-11, -9, -9, -7, -3, -8,-12, -5,-15,  0,  7, -7,-27,-11, -5;
/M: SY='S'; M= -8, -7,-21,-10,-11,-19, -5, -4,-20,-10,-16,-11, -4,-14, -8,-16,  1,  1,-18,-30,-14, -9;
/M: SY='T'; M= -8, -9,-20,-11, -8, -9,-22,-13,-12, -9, -7, -6, -7,-22, -8,-11,  1,  3,-11,-26, -9, -8;
/M: SY='S'; M= -6,  0,-22,  0, -2,-21,-16,-10,-19, -5,-20,-14,  1,-14, -2,-10,  5,  5,-15,-30,-14, -1;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='T'; M= -5, -7,-17, -8, -5,-12,-11, -7,-12, -6,-12, -8, -5, -3, -5, -9,  0,  2,-10,-19, -7, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='L'; M=-10,-17,-14,-19,-13,  5,-23,-10,  4,-16,  9,  8,-15,-21,-12,-17,-13, -3,  2,-15, -1,-14; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-19, -9, -4,-22,-10, -7,-18, 10,-16,-11, -3,-13,  4,  5,  5,  6,-15,-22,-12, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-20, -5,  2,-25,-16,-10,-20,  4,-20,-13,  2,-13,  4, -3,  7, 12,-14,-20,-16,  3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Q'; M= -8, -4,-24, -7,  4,-20,-17, -1,-23,  1,-18, -9,  0,-16, 14, -3,  2, -4,-21,-23, -9,  9;
/M:         M= -9, -9,-25,-11, -8,-18, -8,-11,-15, -7,-16, -8, -4,-18, -3,-11, -5, -4,-14,-24, -9, -5;
/M: SY='K'; M= -9,-10,-26,-10, -1,-26,-23,-15, -9,  7,-15, -9,-10, -9,  0, -5, -8, -5, -8,-31,-18,  0;
/M: SY='F'; M=-11,-28,-21,-30,-22,  7,-29,-13,  4,-20,  5,  6,-23,-16,-16,-24,-14, -7,  0,-19,  1,-20;
/M: SY='I'; M= -9,-26,-19,-29,-29, -6,-32,-28, 27,-20,  6,  9,-15,-27,-22,-29,-18, -6, 22,-29,-10,-23;
/M: SY='Q'; M= -6, -8,-30, -4,  8,-31,-21, -1,-25,  2,-21,-11, -8, 14, 19, -9, -6,-10,-24,-26,-16, 12;
/M: SY='L'; M=-12,-21,-18,-23,-20, -6,-26,-20, -2,-17, 13,  7,-16,-21,-13,-22, -6,  0, -5,-27,-13,-18;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-27, -2,  7,-30,-14, -8,-23,  2,-25,-16,  0, -5,  3, -5, -3, -4,-19,-32,-19,  7;
/M: SY='P'; M= -8, -6,-30, -5, -6,-32,-17,-11,-24, -3,-28,-19, -2, 34,  0,-16, -2, -5,-24,-34,-21, -4;
/M: SY='E'; M=-10,  4,-28,  6, 17,-31,-15, -7,-28,  7,-24,-16,  3, -9,  7, -4, -4, -5,-24,-32,-20, 14;
/M: SY='S'; M= -3,-11,-19,-13,-13,-22,-15,-16,-15, -2,-17,-12, -5, -4, -6,-13, 13,  9,-12,-30,-17, -8;
/M: SY='G'; M= -5, -9,-28,-10, -9,-31, 15,-12,-24, -3,-25,-16, -4,-19, -2, -9, -5,-12,-22,-29,-20, -4;
/M: SY='Z'; M= -2,  7,-25,  9, 17,-34,-16, -1,-31, 10,-28,-17,  6,-12, 16,  0,  8, -1,-25,-31,-18, 18;
/M: SY='N'; M=-12, 23,-23, 14,  8,-38,-11,  2,-31, 13,-35,-21, 34,-18,  5,  4,  3, -5,-29,-37,-20,  6;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-28,-23,-13, 12,-27, 16,-13,-10,-11, -1,-14,-26,  1, -4,-13,-14,-12, -1, 40,-10;
/M: SY='V'; M=  0,-34,-15,-36,-26,  7,-28,-27, 16,-27,  8,  7,-27,-29,-25,-28,-16, -7, 17,-20, -2,-27;
/M: SY='K'; M= -9,  5,-27, -1, 12,-33,-18,  8,-31, 30,-29,-19,  7,-12, 13, 13,  3, -4,-28,-32,-16, 11;
/M: SY='F'; M=-25,-39,-20,-47,-29, 59,-40,-15,  7,-36, 15,  5,-38,-38,-34,-30,-29,-17, -2,  1, 27,-36;
/M: SY='T'; M= -7, -1,-15, -7,  1,-25,-22,-11,-22,  2,-19,-13,  0,-16,  1,  3,  6, 18,-15,-25,-17,  1;
/M: SY='Y'; M=-19,-29,-29,-29,-19, 37,-30, 18, -9,-20,-10,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-19, -9, 17, 75,-19;
/M: SY='D'; M=-13, 38,-30, 48, 12,-44, -7, -4,-36, -5,-38,-31, 31,-10,  1,-15,  8, -4,-34,-45,-25,  7;
/M: SY='I'; M= -7,-38, -1,-39,-34, -4,-35,-36, 32,-30,  8,  8,-28,-28,-30,-35,-23, -7, 31,-30,-11,-30;
/M: SY='I'; M=  0,-29,-16,-31,-25,-10,-30,-27, 24,-22,  7, 11,-20,-25,-19,-28,-15, -1, 24,-29,-11,-20;
/M: SY='K'; M= -7,  4,-24, -4,  0,-30,-15, -4,-27, 15,-27,-17, 12,-17,  5, 10,  9,  3,-23,-29,-17,  2;
/M: SY='D'; M=-15, 39,-32, 48, 10,-45, -1, -3,-37, -6,-39,-31, 35,-15, -1,-14,  3, -7,-36,-44,-26,  5;
/M: SY='T'; M= -4, -6,-13,-13, -7,-22,-22,-16, -9, -3,-11, -7, -2,-17, -5, -7,  6, 19, -3,-30,-17, -6;
/M: SY='Y'; M=-20,-29,-30,-28,-20, 37,-30, 18, -9,-20,-10,  0,-19,-30,-10,-11,-20,-19, -9, 17, 75,-20;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-15, -4, -6,-24, -9, -9,-25, -1,-25,-16,  3,-14,  0, -6, 32, 13,-17,-34,-14,  1;
/M: SY='H'; M=-18, -5,-33,-12,  3,-20,-24, 43,-36, 13,-27,-10,  0,-21, 23, 24, -8,-15,-33,-23,  7,  8;
/M: SY='T'; M= -9,  0,-22,  0, -8,-19,-17,-10,-14, -9,-15,-12,  0,-16, -8,-13,  3,  7,-11,-31,-12, -9;
/M: SY='N'; M= -8,  6,-24,  0, -1,-29,-14,  2,-25,  0,-28,-16, 18, -1,  1, -8,  4, -1,-23,-33,-15,  0;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -9, -8,-25, -7,  1,-20,-26,-11,-10, -2,-14, -8, -7, -9, -1,-11, -9, -4, -9,-28,-12,  1;
/M: SY='D'; M=-12, 26,-31, 34, 12,-40,-11, -2,-32,  4,-33,-25, 18,-13,  5, -7,  2, -7,-31,-39,-22,  9;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -4,-22,-38, 61,-18,-38,-18,-38,-29,  0,-15,-17,-27,  0,-16,-37,-30,-27,-15;
/M: SY='W'; M= -8,-18,-22,-20,-18, -4,-17,-17,-20,-15,-16,-11,-12,-23,-10,-19,  9,  3,-17, 13, -3,-12;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-28, -8,  0,-29,-18, -9,-23,  4,-22,-11, -9, 14, 10, -8, -2, -7,-22,-28,-18,  4;
/M: SY='V'; M=  2,-23,-15,-25,-22,-10,-24,-23, 11,-16, -3,  1,-13,-23,-17,-22, -4,  0, 14,-28, -8,-19;
/M: SY='Q'; M= -4, -4,-26, -7,  0,-33, -7, -6,-25,  9,-24,-13,  0,-17, 13,  4,  1, -7,-21,-28,-17,  6;
/M: SY='P'; M=  0,-20,-22,-16,-12,-31,-18,-21,-15,-12,-23,-16,-17, 39, -7,-25, -6, -4,-13,-34,-23,-10;
/M: SY='Y'; M=-21,-29,-26,-33,-19, 30,-30, -2,-15,-18,-10, -6,-23,-31,-15,-14,-20,-16,-16, 25, 36,-20;
/M:         M=-11,-10,-24,-12, -7,-11,-22, -9,-10, -2,-10, -6, -7,-22, -3, -8, -6, -5,-10,-23, -2, -7;
/M: SY='V'; M=  4,-29,-11,-30,-22, -9,-24,-25, 13,-21,  1,  7,-20,-25,-17,-24, -7, -1, 18,-25, -7,-20;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-26,  2, 13,-26,-16, -1,-30, 13,-28,-18,  3,-10,  9,  1,  1, -7,-27,-29,-15, 12;
/M: SY='N'; M= -7, 26,-20, 11, -4,-34,  1,  5,-28, -1,-34,-18, 50,-20, -2,-11, 11,  0,-27,-36,-17, -3;
/M: SY='I'; M= -7,-36,-17,-37,-32, -3,-37,-33, 38,-27, 15, 20,-25,-30,-25,-33,-24, -7, 34,-27, -7,-26;
/M: SY='E'; M=-12, -5,-25, -3, 23,-11,-26, -2,-27,  3,-20,-13, -9,-18, 11, -3,-11,-12,-23,-20, -5, 20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-39,-20,  0,-27,-29,  3,-39, 28,-29,-19,-10,-29, 10, 64,-10,-11,-30,-28, -6,  0;
/M: SY='V'; M= -7,-23,-12,-28,-16,-16,-31,-13,  7, -1, -6, -2,-17,-24,-11,-11,-13, -5, 11,-30,-10,-15;
/M: SY='V'; M= -3,-19,-17,-17,  0,-18,-32,-23,  6,-13, -6,  0,-16,-22,-10,-16,-10, -1, 15,-30,-14, -2;
/M: SY='D'; M=-14, 24,-33, 37, 28,-37,-18,  0,-37,  5,-34,-27, 11,-12,  9, -4, -2, -9,-33,-37,-20, 21;
/M: SY='K'; M=-13, -2,-29, -6,  5,-20,-22,  8,-29, 11,-25,-16, -2,-13,  6, 11, -3, -2,-25,-27, -6,  4;
/M: SY='D'; M=-13, 14,-31, 22, 12,-32,-16, -6,-30,  2,-28,-21,  5,-14,  5,  0, -2, -4,-26,-33,-16,  8;
/M: SY='W'; M=-18,-20,-31,-24,-13, -4,-26, -9,-16,-15, -8, -2,-12,-25, -6,-19,-18,-12,-16, 25,  5,-11;
/M: SY='N'; M= -9,  8,-24, -2, -8,-23, -4,  1,-21,  1,-27,-14, 24,-20, -3, -9,  0, -8,-22,-28, -8, -6;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='Z'; M= -7, -4,-22, -3, 10,-20,-20, -8,-11, -3, -8,  7, -4,-16,  7, -9, -8, -5, -9,-22,-13, 11; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='V'; M= 14,-28,-11,-28,-19,-18,-21,-30, 15,-20, -4,  0,-19,-21,-20,-24, -6,  2, 25,-30,-14,-19; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='Y'; M=-22,-31,-27,-33,-21, 45,-31, 14, -7,-24, -4,  1,-24,-31,-16,-14,-22,-19,-10, 15, 66,-24; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='L'; M=-17,-34,-20,-36,-29, 11,-36,-22, 18,-27, 31, 20,-30,-35,-21,-29,-25,-10, 10,-20, -4,-27; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='H'; M= -1,-11,-11,-16, -6,-21,-11, 20,-25, -2,-21, -8, -4,-20,  5, -4, -3,-10,-22,-28, -5, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='R'; M=-14,-11,-27,-18, -2,-26,-25, -5,-24, 22,-20,-11, -9,-14,  9, 25, -8, -9,-21,-27,-13,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K'; M=-10, -3,-24, -6,  3,-22,-24,-10,-12,  8,-15, -9,  0,-17,  1, -3, -6, -2,-11,-29,-15,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-28, 14, 20,-23,-21, -3,-29,  6,-26,-19,  3,-14,  5, -2, -4, -7,-25,-28,-11, 15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='P'; M= -7,-12,-29,-10,-15,-29,  9,-16,-27, -9,-27,-20, -9, 15,-10,-18, -1, -9,-27,-31,-22,-12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='S'; M= -4,  1,-18, -1,  1,-25,-16, -9,-20,  0,-19,-13,  4,-12,  1,-10,  5,  3,-16,-31,-16,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-26, 10, 18,-30,-18, -5,-29, 10,-26,-19,  3,-13,  8,  2,  2, -5,-24,-32,-18, 16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M:         M=-13,-13,-11,-15, -4, -8,-23, -9,-16, -9,-15, -8,-11,-18, -8,-13,-10, -8,-14,-20, -5, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M=  9,-11,-21,-12,-20,-32, 36,-18,-26,-14,-26,-18, -3,-17,-12,-22,  7, -5,-23,-29,-24,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N'; M= -8, -1,-22, -5, -4,-16,-18,  2,-18, -7,-15, -5,  5,-20,  0,-10,  3,  0,-16,-23, -4, -2;
/M: SY='I'; M=-10,-36,-20,-36,-35, -2,-38,-35, 41,-28, 20, 23,-28,-30,-25,-36,-27, -9, 33,-28,-10,-27;
/M: SY='Y'; M= -5, -8,-15, -9,-10,-10,-14,  6,-22, -8,-23,-13,  0,-16, -5,-11,  7, -3,-18,-22, 10, -8;
/M: SY='W'; M=-28,-47,-49,-47,-29,  7,-26,-29,-30,-27,-21,-11,-37,-38, -9,-28,-37,-29,-30,138, 17,-19;
/M: SY='K'; M= -4, -8,-24,-12,  1,-25,-21, -1,-17, 15,-17, -8, -6,-16,  6,  3, -4, -7,-15,-28,-12,  1;
/M: SY='F'; M=-28,-37,-20,-45,-29, 69,-39,-12,  2,-38, 11,  1,-38,-39,-37,-30,-29,-19, -8,  5, 33,-38;
/M: SY='D'; M=-14, 33,-31, 41, 20,-41,-11, -3,-35, -1,-36,-27, 27,-14,  5,-10,  1, -7,-33,-41,-24, 14;
/M: SY='L'; M=-18,-37, -6,-40,-28, 13,-37,-25, 12,-28, 27, 17,-34,-37,-22,-28,-25,-11,  6,-15, -2,-29;
/M: SY='K'; M= -3, -2,-25, -5,  1,-33, -9, -9,-24, 15,-25,-15,  0,-14,  5,  4,  4, -1,-20,-31,-19,  2;
/M: SY='S'; M= -4, -6,-19, -8,-13,-20,-18,-17, -5,-10,-13, -8,  2,-15,-10,-19,  5,  2, -3,-34,-16,-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='T'; M= -5,  0,-23,  2, -4,-24,-18,-14,-15, -6,-17,-13, -1, -7, -4,-12,  1,  3,-13,-32,-17, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-29, -2,-13,-38, 48,-13,-38, -9,-37,-27,  7,-18,-10,-17,  0,-15,-36,-31,-26, -8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='K'; M=-13,-11,-28,-19, -3,-23,-25, -2,-17, 25,-10,  0, -8,-17,  9, 13, -9,-10,-19,-24,-11, -1;
/M: SY='S'; M= -5,-11,-21,-15,-10,-20,-20,-11,-13,  5,-17,-10, -5,-14, -2, -2,  7,  2, -9,-29,-10, -7;
/M: SY='V'; M= -7,-40,-16,-41,-33,  0,-39,-37, 37,-30, 15, 15,-31,-31,-28,-33,-25, -6, 38,-21, -6,-30;
/M: SY='E'; M=-11, 11,-31, 14, 30,-36,-20, -2,-35, 21,-31,-22,  6,-12, 14,  9, -5,-10,-30,-33,-21, 25;
/M: SY='K'; M= -8,  4,-25, -3,  6,-33,-17, -2,-28, 32,-28,-18,  6,-12, 12, 14,  7,  1,-25,-30,-16,  7;
/M: SY='I'; M= -7,-39,-16,-39,-32,  1,-39,-34, 34,-29, 20, 16,-32,-32,-27,-32,-24, -6, 33,-25, -5,-29;
/M: SY='V'; M= -4,-11,-19, -9, -1,-19,-26,-19, -2,-10, -9, -3,-10,-19, -7,-16, -5,  1,  4,-30,-14, -2;
/M: SY='I'; M= -9,-40,-18,-40,-37,  1,-40,-38, 44,-30, 20, 18,-31,-31,-29,-37,-28, -8, 38,-28, -9,-30;
/M: SY='R'; M=-11, -7,-29,-15,  0,-28,-20, -5,-28, 26,-25,-17, -6,-20,  8, 29, -2, -5,-22,-28,-14,  1;
/M: SY='M'; M= -9,-31,-19,-37,-25,  0,-33,-22, 23,-22, 21, 37,-24,-30,-13,-22,-19, -5, 18,-19, -5,-19;
/M: SY='S'; M=  1, -7,-22, -5, -6,-25,-13,-15,-16, -8,-22,-15, -5, -2, -7,-15,  6,  2,-12,-33,-16, -5;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-22, -7,-19,-26, 42,-14,-26,-14,-27,-20, -2,-16,-13,-21,  0,-12,-25,-17,-17,-12; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='I'; M= -5,-22,-19,-23,-17,-12,-26,-24, 13,-17,  3, 10,-15,-23,-14,-25, -9, -1, 12,-29,-13,-11;
/M: SY='Q'; M=-11, -1,-26, -2,  5,-21,-23, -4,-16,  1,-14, -5,  1,-19, 12, -6, -7, -7,-16,-23, -9,  8;
/M: SY='K'; M= -8,  1,-23, -4,  8,-23,-21, -2,-21, 10,-20,-10,  4,-15,  9,  1,  1,  3,-18,-26,-11,  9;
/M: SY='F'; M=-13,-20,-19,-25,-17,  6,-29,-10,  3,-17, -3,  0,-14,-24,-16,-20,-14, -7,  0,-21,  2,-16;
/M: SY='D'; M= -1, -1,-26,  2,  1,-26,-13, -5,-20, -6,-20,-13, -1,-16, -2,-10, -4, -7,-17,-32,-14,  0;
/M: SY='N'; M=  0, 17,-23, 17,  1,-37,  1, -5,-30, -4,-33,-23, 22,-14, -1,-13, 11, -1,-26,-35,-21,  1;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-27, -6,-21,-35, 49,-14,-34,-13,-36,-25,  7,-19,-14,-22,  2,-14,-33,-30,-23,-14;
/M: SY='K'; M= -6, -5,-25, -9, -8,-29, -2,-12,-18,  7,-22,-15, -1,-17, -3, -4, -1, -3,-17,-30,-18, -6;
/M: SY='G'; M=  5,-23,-20,-24,-25,-22,  6,-26,  2,-20,-10, -3,-15,-22,-18,-27, -8, -7,  4,-29,-18,-19;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-26, -3, 12,-25,-24, -7,-20, 11,-17, -9, -4,-16,  8,  3, -3, -2,-17,-29,-15, 11;
/M: SY='A'; M= 21,-27,-14,-28,-18,-18,-15,-25, -1,-17,-10, -3,-18,-20,-14,-25, -6, -5,  4, -7,-13,-15;
/M: SY='C'; M= -8, -9,  9,-13, -1,-24,-21,-10,-20,  1,-21,-14, -5,-21, -3, -8, -4, -5,-15,-34,-17,  0;
/M: SY='A'; M=  8,-24,-15,-25,-16,-11,-21,-21,  1,-16,  0,  2,-19,-17,-13,-22, -5, -3,  3,-26,-11,-15;
/M: SY='C'; M=-10, -8, 49,-17,-16,-23,-21,-12,-23,-12,-23,-17,  2,-29,-13,-19, -2, -6,-17,-40,-20,-15;
/M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-29,-23,  8,-24,-16,  3,-19,  6,  5,-22,-26,-15,-22,-14, -7,  0,-12,  7,-21;
/M: SY='N'; M=-10,  1,-27,  2, -3,-24, -7,  2,-22,-10,-20,-13,  4,-12, -2,-17, -7,-10,-22,-30,-11, -3;
/M: SY='D'; M=-10, -2,-26,  5, -4,-23,-22,-16, -7,-13,-13, -9, -4,-11, -6,-20, -8, -3, -7,-31,-14, -4;
/M: SY='N'; M= -2, -6,-20, -9, -9,-18, -8,-13,-13,-11,-15, -9,  3,-19, -9,-18,  1, -2,-12,-29,-14, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-10, 23,-14,  0,-20,-26,-12,-22, -5,-19,-14, -7,-24, -3,-13, -4, -4,-16,-33,-16, -1;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='T'; M= -6,-17,-15,-21,-13,-10,-24,-17,  1, -5, -4,  1,-13,-16, -9,-10, -5,  3,  3,-18, -9,-11; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='N'; M= -6,  1,-13, -4, -1,-16,-10, -3,-12, -1,-12, -4,  8,-14,  3, -4,  1, -1,-11,-19, -8,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='I'; M= -5,-16,-11,-16,-14, -1,-19,-17, 12,-14,  6,  4,-14,-11,-13,-17,-11, -1, 10,-15, -5,-13; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='P'; M= -5, -7,-15, -7, -6,-15,-12, -8, -7, -3,-12, -8, -3, 14, -5, -7, -5, -3, -7,-18,-11, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='N'; M= -3,  1,-12, -1, -1,-14, -7, -4,-11,  2, -9, -6,  4,-10,  1, -3,  1, -2,-11,-16, -9,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='C'; M= -7,-10, 30,-14, -9,-17,-13, -6,-16,-11,-16,-12, -4,-17, -8,-16, -4, -4,-12,-28,-15, -8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='T'; M= -3, -6,-14, -9, -9,-13,-11,-12,-10, -6, -7, -5, -2,-13, -6,-12,  6,  7, -8,-24,-12, -7; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M:         M= -6, -6,-19, -5, -4,-10,-19,-10, -6,-10, -5, -1, -6,-18, -6,-12, -6, -2, -5,-21, -5, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-19,-24,-23,-12,-29,-28, 19,-20,  3,  5,-16,-18,-17,-28,-12,  0, 17,-31,-14,-17;
/M: SY='P'; M=-11, -1,-32,  6,  0,-29,-18,-12,-26, -8,-28,-21, -2, 27, -5,-19, -5, -8,-25,-35,-19, -2;
/M: SY='I'; M=-11,-15,-22,-19,-14, -8,-28,-13,  2, -9, -3,  0,-10,-22,-12,-15,-12, -4,  1,-25, -6,-14;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-20,  3, -5,-34, -3, -9,-26, -4,-30,-19, 14, -3, -3,-13,  7,  0,-22,-36,-22, -3;
/M: SY='G'; M= -7,  4,-27,  2, -5,-35, 16, -8,-30, -1,-27,-18, 10,-18,  3,-12,  0,-10,-30,-30,-22,  0;
/M: SY='T'; M=  1,-16,-18,-16,-15,-17,-18,-19, -1,-14, -5, -3,-12,-18,-12,-21, -1,  4,  2,-30,-15,-12;
/M: SY='M'; M= -8,-18,-21,-19, -9,-11,-18,-17, -6,-11,  3,  4,-16,-23, -7,-17, -8, -2, -7,-24,-12, -7;
/M: SY='T'; M= -5, -8,-20,-10,  4,-21,-25,-15,-10, -2,-10, -5, -7,-17, -1, -8, -3,  9, -4,-28,-17,  3;
/M: SY='F'; M=-18,-35,-20,-38,-27, 23,-36,-22, 16,-29, 17, 11,-32,-33,-23,-29,-26,-12, 10,-13,  8,-27;
/M: SY='E'; M=-12, -1,-21,  0,  5,-17,-24, -6,-20, -1,-19,-14, -4,-12,  0, -9, -5, -1,-18,-27,-10,  3;
/M: SY='I'; M=-12,-21,-22,-26,-20,-10,-30,-15, 11,-10,  3, 10,-12,-23,-12,-16,-17, -9,  8,-26, -8,-17;
/M: SY='P'; M=-10, -1,-30,  3,  4,-31,-16,-10,-23, -5,-26,-16,  0, 14,  2,-16, -6, -6,-21,-31,-18,  5;
/M: SY='A'; M=  6,-15,-20,-16, -7,-21,-16,-14, -8, -4,-13, -4, -9,-16, -1,-11, -2, -3, -4,-26,-12, -4;
/M:         M= -9,-14,-22,-14, -5, -6,-25,-10,-10, -7, -6, -3,-13,-22, -5,-11, -6, -4, -9,-22, -3, -5;
/M:         M=-15, -9,-28, -5, -5,-10,-23, -8,-13,-11, -4,  0, -9,-24, -4,-16,-12,-10,-14,-14, -1, -5;
/M: SY='T'; M= -3, -8,-13,-14,-14,-21,-19,-17, -7, -4,-13, -7, -1,-18, -8, -9, 11, 14, -3,-33,-17,-10;
/M:         M= -9,-15,-19,-16,-17,-13, -3,-17,-16,-13, -8, -8,-11,-25,-11,-17, -6, -6,-16,-23,-14,-14;
/M:         M=-10,-20,-24,-23,-23, -6,  0,-15, -9,-16,-10, -4,-14,-25,-16,-18, -9, -8,-10,-21, -5,-19;
/M:         M=-11, -6,-22, -2, -2,-23,-26,-15, -6, -5, -6, -1, -7,-21, -1,-13, -9, -7, -6,-31,-16, -2;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-20, -3,-13,-24, 15,-12,-16,-10,-19,-13,  0,-15, -8,-15,  0, -6,-15,-25,-17, -9; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M:         M= -5, -6,-15, -4, -8,-12,-15, -7,  0, -9, -6, -2, -3,-10, -7,-14, -5, -4,  0,-21, -7, -7; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -5, -6,-15, -9, -3,-12,-17, -9, -3,  3, -8, -3, -4,-12, -1, -4, -5, -1, -2,-18, -7, -2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='M'; M= -1,-21,-15,-22,-17, -7,-19,-18,  5,-16, 14, 15,-16,-23, -9,-20, -9, -4,  2,-20,-11,-14; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='W'; M=-18,-18,-27,-20,-14,  8,-20, -3,-17,-18,-13, -7,-13,-26, -8,-18,-16,-14,-18, 23, 11,-13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Q'; M= -8, -3,-26, -4, 10,-31,-16, -3,-24, 19,-21,-10, -3, -6, 22,  8, -2, -6,-22,-22,-16, 15; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D'; M=-16, 26,-31, 33,  8,-34,-11, 19,-35, -2,-34,-25, 21, -8,  4, -9,  0, -9,-34,-38,-14,  5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V'; M=  4,-22,-12,-25,-22,-13,-25,-28, 14,-18,  1,  4,-15,-20,-18,-25, -4,  9, 15,-31,-15,-17;
/M: SY='Q'; M=-11, -4,-27, -7,  8,-33,-22,  1,-25, 22,-22, -9, -4, -8, 34, 12, -3, -9,-25,-21,-11, 17;
/M: SY='I'; M=-11,-36,-19,-37,-29,  3,-35,-28, 21,-26, 20, 15,-30,-32,-22,-29,-22, -8, 18,-17, -6,-27;
/M: SY='F'; M=-26,-36,-21,-44,-28, 57,-38,-13,  2,-35, 14,  4,-35,-35,-32,-29,-28,-17, -7,  1, 26,-34;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-31,-11,  2,-35,-16, -4,-34, 32,-29,-20, -5,-17,  9, 33, -5,-11,-30,-31,-18,  2;
/M: SY='T'; M= -1, -3,-18,-10, -4,-25,-19, -9,-16,  0,-15, -8, -1,-13,  8, -1, 11, 23, -9,-27,-16,  1;
/M: SY='D'; M= -6, 12,-22, 14,  6,-34, -6, -7,-31,  4,-30,-22, 13,-14,  2, -8, 10, -1,-27,-33,-21,  6;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-29,-17, -4,-33,-23,  7,-15, 21, 14,-27,-30, -9,-20,-19, -8,  3,-14,-10,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K'; M=-11,  7,-28,  2,  6,-29,-15,  2,-28, 18,-26,-15, 10,-16,  7,  4, -3, -8,-27,-27,-15,  5;
/M: SY='D'; M= -9, 13,-16, 21,  8,-36,  0, -7,-35, -6,-33,-26,  7,-16,  0,-14,  1, -9,-31,-37,-22,  6;
/M: SY='T'; M= -5, -6,-20, -9, -5,-28, -3,-11,-23, -2,-23,-17, -3,-18, -5, -2,  3,  5,-16,-32,-19, -4;
/M: SY='S'; M= -4, -2,-24,  2,  1,-25, -9,-12,-23, -5,-21,-15, -2,-10, -3,-12,  5, -2,-20,-32,-18,  1;
/M: SY='N'; M= -7,  5,-12,  1,  4,-26, -8,  2,-30,  0,-31,-19, 16,-14,  1, -9,  6, -4,-26,-31,-11,  4;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-17,-26,-21,-10,-21,-22,  7,-20, -5, -1,-15,-17,-17,-23, -7, -2, 11,-26, -7,-19;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-24,  6, 25,-19,-18, -5,-27,  4,-21,-16, -4, -5,  6, -4, -7, -7,-23,-24,-14, 19; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S'; M=  0,  2,-13,  2, -5,-32, -1,-11,-28,  0,-28,-20,  7,-11, -1,-11, 23,  8,-23,-37,-22,  0;
/M: SY='F'; M=-22,-38,-21,-44,-29, 42,-38,-19,  8,-32, 16,  9,-36,-37,-30,-26,-28,-15,  1,  0, 17,-33;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-18, -2,  0,-25,-13, -9,-24,  3,-22,-14,  2,-14,  5, -5, 21,  7,-18,-33,-16,  5;
/M: SY='V'; M= -5,-38,-15,-39,-32, -6,-39,-38, 39,-28, 14, 14,-29,-30,-28,-30,-23, -3, 42,-29,-10,-28;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-25, -2, 19,-27,-22, -7,-23, 10,-20,-10, -2,-14, 10,  1, -4, -1,-17,-29,-17, 18;
/M: SY='V'; M= -1,-35,-14,-36,-27, -4,-34,-25, 27,-26, 10, 11,-26,-29,-24,-28,-19, -5, 30,-27, -7,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-22,-11, 14,-24, 13,-16, -9,-12, -3,-11,-26, -4, -9,-13,-14,-18, -1, 30,-11;
/M: SY='W'; M=-23,-37,-38,-38,-23, 12,-29,-21,-18,-26,-10, -1,-31,-31,-11,-26,-28,-20,-20, 77, 16,-18;
/M: SY='K'; M= -3, -3,-24, -9,  0,-32,-10, -5,-25, 21,-23,-11,  1,-14, 11,  8,  7, -2,-23,-29,-18,  5;
/M: SY='D'; M= -7, 13,-26, 16, 15,-36,-10, -6,-33,  3,-33,-23, 13, -1,  4, -9,  6,  0,-28,-36,-23, 13;
/M: SY='T'; M= -7,-12,-19,-18,-10,-14,-23,-14, -9, -3, -6, -3, -7,-21, -5, -8,  0,  6, -7,-23,-12, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 12 in 11 different sequences
Number of true positive hits 12 in 11 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PAW
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
11 sequences

NGLY1_CAEBR (Q5WNE3), NGLY1_CAEEL (Q9TW67), NGLY1_CHICK (Q5ZJM3), 
NGLY1_DANRE (Q503I8), NGLY1_DROME (Q7KRR5), NGLY1_DROPS (Q28YQ7), 
NGLY1_HUMAN (Q96IV0), NGLY1_MACFA (Q4R6F3), NGLY1_MOUSE (Q9JI78), 
NGLY1_RAT   (Q5XI55), PAWC1_CAEEL (Q966B0)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

2G9F; 2G9G; 2I74

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission