ID CHORD; MATRIX. AC PS51401; DT 01-AUG-2008 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE CHORD domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=60; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7634766; R2=0.0060944; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8861.1591797; R2=2.0322392; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2008; H_SCORE=12942; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=614; H_SCORE=10109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-47; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130; MA /M: SY='K'; M=-61,-76,-60,-49,-63,-61,-37,-66,67,-60,-59,-53,-68,44,50,-30,28,-4,-67,44; MA /M: SY='N'; M=-65,-74,-45,-54,-75,-60,68,-80,-39,-78,-65,97,-73,-46,71,-51,-55,-79,-89,-62; MA /M: SY='K'; M=-37,-77,-61,-53,14,-4,-59,0,59,-24,-59,19,30,28,33,-37,-13,-64,-70,-16; MA /M: SY='G'; M=0,9,-65,-74,-81,97,-71,-87,-69,-83,-73,-51,-68,-67,-76,-29,-26,-79,-75,-77; MA /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130; MA /M: SY='G'; M=-24,-42,13,-17,-79,77,-62,-80,4,-38,-41,37,-68,-20,-43,-6,-24,-76,-78,-73; MA /M: SY='K'; M=23,-74,-43,-5,-71,-4,-58,-68,66,-14,-40,-35,-66,61,-29,-34,-5,-39,-71,5; MA /M: SY='T'; M=-15,-70,-24,31,-27,-49,-18,-59,22,-32,-5,-38,-65,-52,12,6,63,6,-74,25; MA /M: SY='Y'; M=-74,-77,-79,-78,95,-80,-11,-53,-72,-47,-51,-74,-84,-73,-69,-70,-67,-58,29,102; MA /I: I=-17; MD=-42; MA /M: SY='T'; M=-16,-73,45,12,-74,-68,-60,-19,41,-44,-63,4,-66,12,11,-12,49,-10,-83,-67; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-42; MA /M: SY='P'; M=-50,-82,33,53,-83,39,-63,-77,-18,-64,-72,-24,72,-28,-65,-37,-61,-22,-82,-76; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-42; MA /M: SY='D'; M=-9,-81,41,34,-84,9,-63,-81,10,-47,-73,15,13,-19,20,-30,11,-77,-87,-75; D=-17; MA /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; MA /M: SY='D'; M=-31,-78,68,60,-85,-24,-37,-84,-12,-82,-77,18,-65,-18,-59,29,-15,-78,-90,-73; D=-17; MA /I: I=-17; DM=-42; MA /M: SY='N'; M=-60,-71,-25,-31,-78,-19,-50,-77,-10,-82,-70,101,-72,-51,26,28,-14,-48,-91,-71; D=-17; MA /I: I=-17; DM=-42; MA /M: SY='H'; M=-7,-74,50,33,-75,-55,51,-71,-39,-28,-65,46,36,-25,-60,-3,27,-38,-88,-66; MA /M: SY='D'; M=-11,-78,71,56,-51,16,-56,-81,-3,-80,-74,13,19,-9,-58,-2,-57,-77,-84,-71; MA /M: SY='E'; M=-12,-74,45,68,-78,24,-58,-76,-24,-37,-69,8,-62,-10,-59,-19,36,-70,-83,-71; MA /M: SY='S'; M=50,-19,-14,-8,-73,-43,-64,-45,-20,-48,-37,-25,16,-12,5,54,-14,7,-80,-68; MA /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130; MA /M: SY='H'; M=-34,-31,-35,-36,-6,-74,43,0,2,-3,-23,-12,-71,9,29,-18,37,42,-1,-56; MA /M: SY='Y'; M=-71,-81,-66,-67,22,-76,87,-62,-14,-56,-51,-62,-79,-57,-58,-64,-66,-66,-39,117; MA /I: I=-4; MD=-11; MA /M: SY='H'; M=-119,-130,-102,-103,-117,-120,155,-136,-107,-118,-103,-92,-119,-96,-101,-108,-117,-135,-153,-86; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-11; MA /M: SY='P'; M=-19,-85,-40,-42,-84,-66,-68,-75,-11,-83,-71,-52,111,-62,-19,25,-26,-76,-81,-79; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-11; MA /M: SY='G'; M=-19,-78,-62,0,-84,91,-69,-89,-8,-85,-75,-52,-68,-13,-69,-5,-66,-82,-76,-77; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-11; MA /M: SY='P'; M=27,-76,-49,-10,-74,20,-69,-56,-28,-66,-12,-65,65,35,-30,-56,-32,38,-80,-40; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; MA /M: SY='P'; M=20,-87,-69,-58,-84,-67,-72,-26,-65,-80,-69,-73,117,-67,-76,-61,-60,-72,-80,-82; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='I'; M=-60,21,-84,-80,2,-86,-81,67,-75,-20,-17,-76,-79,-76,-34,-25,-57,66,-77,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='F'; M=-125,-121,-137,-133,128,-132,-117,-98,-128,-90,-100,-126,-135,-138,-125,-80,-116,-103,-90,-68; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='H'; M=-69,-82,-57,-56,-69,-72,139,-86,-57,-71,-58,-47,-72,-49,9,-5,-68,-85,43,-41; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='D'; M=-66,-83,90,81,-88,-71,-55,-87,-49,-82,-80,-46,-63,-45,-59,-58,-61,-82,-92,-74; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='G'; M=16,-9,-68,-71,-76,78,-70,-39,-62,-11,-66,-56,-71,-64,24,-52,2,-69,-77,-73; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='M'; M=-59,-73,-67,-6,-53,-41,-32,-37,4,12,86,-38,-72,21,-60,38,-44,-17,-67,51; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-11; MA /M: SY='K'; M=-63,-77,-56,-43,-79,-71,-58,-79,104,-78,-66,-49,-64,-40,22,-56,-11,-74,-73,-66; MA /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; MA /M: SY='G'; M=-56,-77,-62,7,19,72,-12,-28,-38,-68,-64,-56,-71,-27,-32,5,-63,-70,-57,68; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='W'; M=-123,-147,-147,-127,-86,-122,-141,-119,-119,-117,-119,-142,-127,-119,-122,-129,-134,-133,181,33; MA /M: SY='S'; M=-11,-67,-58,-55,-72,-24,-61,-66,39,-28,-63,-19,-3,-34,-24,76,31,-17,-80,-66; MA /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130; MA /I: I=-24; MD=-61; MA /M: SY='C'; M=-111,157,-131,-131,-121,-126,-131,-128,-127,-119,-119,-117,-142,-134,-133,-114,-111,-116,-151,-132; D=-24; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61; MA /M: SY='K'; M=-62,-30,51,31,-81,-13,-54,-80,66,-78,-24,41,-33,19,-1,-28,-57,-77,-81,-68; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='K'; M=-5,-77,-62,-49,-74,-71,-60,6,74,-67,-59,-55,15,27,55,-58,-43,-3,-75,-65; MA /M: SY='R'; M=-63,-78,-58,-8,-72,-72,42,-35,67,-18,-60,-53,-36,-11,74,-2,-60,-70,-76,-41; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='V'; M=-9,22,-70,-68,-36,-71,-75,-42,-31,-56,-56,-61,-71,-67,-70,36,62,63,-87,-66; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='Y'; M=-61,-73,-68,-66,4,-73,47,-55,7,32,-51,-61,-75,-60,-28,37,28,-17,12,52; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='D'; M=-65,-80,97,55,-86,-68,-56,-85,-53,-82,-80,-11,-65,-50,-62,-19,7,-80,-96,-73; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='F'; M=-78,-77,-92,-85,114,-84,-73,-54,-80,-46,-55,-81,-87,-89,-78,-77,-72,-60,93,-22; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='D'; M=-60,-76,81,32,-83,4,-58,-82,-56,-82,-77,28,-66,-53,-64,32,20,-77,-93,-72; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='E'; M=3,-78,47,78,-80,-71,-59,-75,-51,-20,-68,-54,-63,22,-59,-19,17,-55,-85,-71; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='F'; M=-78,-74,-90,-85,117,-85,-71,-51,-81,-21,-52,-80,-88,-90,-78,-77,-70,-56,33,-22; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='M'; M=-29,-71,-82,-25,-49,-82,-65,-37,-36,62,101,-77,-78,-65,-70,-73,-63,-2,-76,-56; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='K'; M=26,-72,-3,26,-80,-28,-59,-77,53,-78,-69,39,-66,-18,-49,32,5,-70,-82,-71; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='I'; M=-66,-80,-79,-70,-26,-86,-74,88,-70,-10,-41,-72,-76,59,-71,-69,-61,1,-73,-4; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='P'; M=5,-83,-58,40,-82,-70,-66,-72,40,-78,-69,-64,89,-28,-21,-49,-40,-16,-80,-76; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='G'; M=-27,-82,-67,-69,-85,81,-72,-85,-24,-86,-75,-58,74,-68,-75,-55,-28,-82,-78,-81; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-30; MA /M: SY='C'; M=-111,157,-131,-131,-121,-126,-131,-128,-127,-119,-119,-117,-142,-134,-133,-114,-111,-116,-151,-132; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; MA /M: SY='T'; M=27,44,-61,-27,-74,-66,-68,-66,18,-69,-64,-39,-66,-20,-27,2,84,-46,-86,-70; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; MA /M: SY='K'; M=-59,-73,-61,0,-31,-73,-63,-46,55,-48,-19,-37,-68,-18,36,12,46,20,-79,-35; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-30; MA /M: SY='G'; M=-29,-78,-22,-75,-85,98,-72,-91,-71,-87,-77,-31,-70,-68,-78,-42,-44,-84,-77,-79; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-30; MA /M: SY='W'; M=-24,-79,-60,-19,-54,-70,-59,-76,66,-51,-65,-36,19,9,66,-21,-1,-72,70,-61; MA /M: SY='H'; M=-117,-129,-101,-101,-115,-119,157,-134,-106,-116,-101,-90,-117,-95,-100,-106,-115,-133,-151,-84; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=34(17); /POSITIVE=34(17); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CHORD; CC /VERSION=6; DR Q29RL2 , CHRD1_BOVIN, T; G5EEI8 , CHRD1_CAEEL, T; DR Q5ZML4 , CHRD1_CHICK, T; Q7T3F7 , CHRD1_DANRE, T; DR Q9VCC0 , CHRD1_DROME, T; Q9UHD1 , CHRD1_HUMAN, T; DR Q4R7U2 , CHRD1_MACFA, T; Q9D1P4 , CHRD1_MOUSE, T; DR A9YUB1 , CHRD1_PIG , T; Q5RD91 , CHRD1_PONAB, T; DR D4A4T9 , CHRD1_RAT , T; Q6NUA0 , CHRD1_XENLA, T; DR Q9UKP3 , ITBP2_HUMAN, T; Q9R000 , ITBP2_MOUSE, T; DR Q462R2 , ITBP2_PIG , T; Q9SE33 , RAR1_ARATH , T; DR Q6EPW7 , RAR1_ORYSJ , T; 3D 2XCM; 2YRT; PR PRU00734; DO PDOC51401; //