Entry: PS51411

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PSP1_C
Accession [info] PS51411
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2008 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51411
Associated ProRule [info] PRU00744

Name and characterization of the entry

Description [info] PSP1 C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=82;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6299697; R2=0.0119932; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1981.63658; R2=22.38717; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; N_SCORE=8.5; H_SCORE=14809; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=490; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12929; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-26, -9, -4, -8,  2,-11, -6,  1, -4, -1, -9,  2, -7, -8, -4, -4,-10,-18, -5, -7;
/M: SY='K'; M=  1, -6,-18, -3,  6,-16,-11, -8,-15,  7,-14, -6, -8,  6,  3,  5,  4, -3,-13,-23,-13,  2;
/M: SY='I'; M=  4,-18,-16,-29,-27,  6,-18,-24, 41,-18, 14,  4, -7,-31,-21,-20, -8,  4, 36,-29, -4,-26;
/M: SY='I'; M= -3,-14, -7,-18,-14,  6,-19, -9, 24,-15, 23, 14,-13,-27,-16,-17,-14, -1, 16,-24,  9,-14;
/M: SY='R'; M= -8,-17,-22, -9, -7,-13,-11, -8,-26,  8,-19, -3,-17, -5, 21, 58, -7,-25,-13, -4, -4, -1;
/M: SY='M'; M= -3,-10,-10,-12, -3, -4,-12,-14,  1, -2,  1,  2,-10, -8, -6, -3, -8, -6, -2,-20, -4, -5;
/M: SY='A'; M= 30, -3,-27, -6, -4,-16, -5,-17,  5,  0, -4, 13, -1,-13,  4,-11,  6, 10, 11,-45,-30, -4;
/M: SY='T'; M=  7,  7,-21,  4, -7,-22, -9,-13, -8, -5, -8, -5, 11, -6,  1,-16, 12, 21, -4,-40,-16, -4;
/M: SY='P'; M=  5,  3,-22, 10, 11,-29, -6, -5,-18,  4,-14,-12, -4, 14,  4, -9,  3,  0,-18,-30,-18,  7;
/M: SY='E'; M=  3,  3, -6,  7, 22,-28,-14, -6,-18,  8,-10, -4,  1,  0, 12, -5, -1, -6,-19,-26,-19, 19;
/M: SY='D'; M=  2, 27,-18, 50, 21,-41, -6,-14,-31,  5,-10,-21,  2, -5, -2,-11,  2,-11,-21,-27,-15, 12;
/M: SY='I'; M=  2, -7,-17, -7,-11, -2,-16,-14, 15,-10, 12,  6, -8,-21,-13,-15, -6,  2, 14,-28,  2,-12;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M=  4, -1,-18,  2,  3,-18,-10, -5, -5, -2, -4, -1, -4,-11,  2, -6, -2, -4, -5,-26,-11,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q'; M=  2, -8,-22, -6,  1,-13,-16, -4, -7,  2, -6,  4, -8, -9, 14, 10, -6, -5, -6,-21, -4,  5;
/M: SY='Y'; M= -5,-13,-22,-15,-12,  4,-14,-13,  6, -9,  8,  3,-11,-24, -7, -9,-10, -5,  5, -1,  9,-11;
/M: SY='E'; M=  4,  0,-15,  2, 13,-20,-14,  2,-13,  3, -8,  0, -2, -6,  8, -4,  2, -3,-13,-29,-13, 10;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='Q'; M=  2, -2,-16,  1,  6,-21, -8, -5,-17,  3,-12, -4, -4, -3, 16, 10, -1, -6,-14,-17,-12,  9; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N'; M=  3,  2,-10, -1, -4, -5, -8, -9,  2, -3,  1,  1,  6,-10, -3, -8, -1,  3,  1,-23, -7, -4; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='M'; M= -2,  5,-17,  6,  1,-12,-15,  2, -7, -1,  1,  7,  5,-15, -3, -4, -6, -4,-10,-33, -5,  0;
/M: SY='R'; M=  3, -7,-21, -5,  1,-13,-11,-13,-12,  5,-10,  0, -7, -8, 11, 14, -1, -6, -7,-18, -8,  3;
/M: SY='R'; M=  1, -4,-17,  3,  9,-19,-14,-10,-17,  7,-11, -5,-10, -5, 12, 15, -1, -9,-11,-17, -8,  8;
/M: SY='R'; M=  1, -6,-19, -3,  3, -9,-16, -6,-12,  5, -4,  4, -7, -9,  7,  9, -3, -6, -8,-22, -5,  3;
/M: SY='E'; M=  2, -4, -7,  1, 28,-28,-12, -2,-21, 10,-12, -6, -7,  1, 17,  2,  1,-12,-21,-15,-16, 25;
/M: SY='E'; M=  5, -1,-18,  3,  8,-19,-11,-12,-15,  7,-12, -3, -3, -3,  8,  7,  2, -5,-11,-24,-15,  7;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-13,  3, 15,-18,-12, -9,-15, 10,-10,  0,  1, -5,  9,  4,  0, -7,-13,-21,-12, 12; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A'; M= 24, -2,-24, -4, -4,-13, -4,-18,  6, -4, -2,  7, -2,-13,  1,-13,  6,  9, 10,-40,-24, -5; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='L'; M= -3,-13, -9,-15, -8,  5,-17,-14,  4, -4, 10,  9,-12,-20, -9, -3,-10, -5,  4,-16,  4, -8;
/M: SY='Q'; M=  1, -2,-19,  1,  4,-19,-14, -7,-14,  4,-13, -3, -2, -6, 13, 13, -3, -7,-11,-21,-11,  5;
/M: SY='F'; M= -3,-12,-16,-16, -9, 11,-20,-17,  4, -6,  9, -3, -9,-16, -9,-13, -4,  1,  7,-17,  5, -9;
/M: SY='C'; M= -6,-14, 64,-20, -4,-11,-25,-33, -2,-18,  2, -7, -8,-28,-16,-15, -9, -6,  0,-26,-31, -9;
/M: SY='R'; M=  0,-10,-20, -8, -2,-11,-17,-11,-13,  4,-10,  2, -8,-10, 23, 30, -6, -8, -9,-15, -3,  5;
/M: SY='E'; M=  7,  1,-19,  4, 16,-23, -8, -8,-18, 10,-14, -2, -1, -3, 16,  5,  1, -6,-16,-23,-18, 15;
/M: SY='M'; M= -3,-11, -9,-13, -2, -3,-18,-11, -1,  3,  3, 11,-10,-14, -3,  2, -8, -6, -2,-18, -2, -3;
/M: SY='I'; M=  8,-13,-15,-20,-18,  3,-16,-21, 23,-13,  9,  5, -7,-25,-14,-16, -3,  6, 23,-31, -6,-18;
/M: SY='R'; M=  6, -4,-21,  0,  3,-17,-12,-12,-12,  7,-12,  0, -4, -8, 10, 15,  1, -6, -6,-24,-14,  3;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-15,  6, 20,-24,-12, -4,-21, 10,-11, -5, -3,  0, 12,  1, -1, -9,-20,-20,-14, 17;
/M: SY='H'; M= -5,-10,-24, -9, -4, -9,-20, 26, -4, -8,  3,  9, -9,-11, -1, -2, -8, -6, -7,-28,  4, -3;
/M: SY='G'; M=  2,  4,-26, -3, -3,-22, 15, -6,-12,  1,-16, -4, 10, -6,  0, -6,  0, -6,-20,-23,-22, -2;
/M: SY='L'; M= -8,-12, -3,-14,-12, 17,-18,-14, 18,-17, 27, 11,-18,-29,-20,-17,-13,  0, 11,-15, 20,-14;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='P'; M= -2,  0,-19,  9, 17,-32,-10,  0,-25,  8,-18,-19, -8, 33,  6, -5, -1, -5,-26,-27,-17, 10;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='M'; M=  8,-17,-19,-25,-15, -7,-20,  1, 17,  4, 18, 36, -5,-35,-14, -8,-14,  4, 13,-30, -4,-15;
/M: SY='K'; M=  0, -3,-17, -4, 10,-12,-16,-12,-13, 15,-10,  6, -1, -2,  4,  3, -1, -4,-11,-24,-10,  8;
/M: SY='I'; M= -4,-16,-10,-23,-21, 20,-20,-19, 27,-18, 24,  8,-14,-32,-20,-16,-14, -1, 22,-21, 13,-20;
/M: SY='I'; M=  2,-15,-15,-21,-19,  7,-18,-20, 33,-16, 18,  7,-12,-30,-20,-18,-10,  2, 28,-26,  5,-20;
/M: SY='D'; M= -1, 23,-25, 39,  1,-34,  7,-19,-26, -1,-12,-18,  6,-10, -7, -7,  0,-10,-19,-25,-15, -4;
/M: SY='V'; M= 10,-13, 15,-16,-12, -9,-21,-29, 15,-15,  3,  0, -9,-26,-13,-15, -5,  5, 20,-35,-21,-13;
/M: SY='E'; M=  1,  2, -9, 14, 29,-30,-20,  1,-19,  7, -6, -7, -8, -3,  7, -8, -3,-12,-14,-20,-10, 22;
/M: SY='Y'; M=-24,-25,-37,-23,-20, 37,-25, -4, -5,-10, 18, -9,-22,-23,-11, -4,-13,-12,  4, 16, 44,-19;
/M: SY='Q'; M=  6, -8,-19,-11,  3,-17,-17, -4, -8, -3, -9, -5, -5, -4, 32,  6, -2,  8,-13,-23, -8, 12;
/M: SY='F'; M=-10,-20,-21,-30,-24, 46,-14,-22,  5,-10, 17, -3,-12,-32,-21,-13,-11,-12,  5, -1, 16,-24;
/M: SY='D'; M=  1, 41,-27, 72,  9,-45, -8,-18,-34,  0,-11,-25, 11, -9, -6,-10,  1, -7,-19,-38,-13,  2;
/M: SY='R'; M= -3, -7,-21, -6, -3,-19, 11,-17,-19,  3,-15, -7, -8, -9,  5, 15, -3,-16,-18, -2,-13, -2;
/M: SY='K'; M=  3,  0,-23,  0,  6,-17, -6,-11,-16, 12,-15,  0,  0, -1,  4,  5,  6, -1,-15,-24,-14,  3;
/M: SY='K'; M=  0, -5,-30, -4, 10, -9,-11,-12,-14, 23,-13, 13, -4,  3,  2,  7, -1, -8,-13,-19, -6,  5;
/M: SY='I'; M= -2,-14, -7,-17,-17, 12,-20,-17, 25,-17, 24, 10,-15,-30,-20,-17,-13,  2, 21,-23, 13,-17;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='T'; M=  3,-10,-22,-17,-20, -2,-19,-19, 15,-12,  8,  0, -3,-16,-10,-21,  5, 21, 19,-30,  1,-16; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F'; M= -9,-24,-24,-38,-33, 53,-25,-26, 22,-15, 19, -7,-11,-37,-27,-14,-11, -8, 25, -9, 18,-33;
/M: SY='Y'; M=-29,-24,-49,-15,-18, 24,-27,  8, -8, -9, 19, -5,-26,-18,-10, -3,-13, -8,  4, 22, 58,-18;
/M: SY='Y'; M=-29,-29,-45,-26,-28, 55,-29,-13, -3,-11, 26,-12,-27,-29,-19, -5,-16,-13, 12, 29, 61,-28;
/M: SY='T'; M=  3, -3,-18, -7, -8, -9,-13,-14, -4, -4, -4, -6,  1,-10, -1, -9, 12, 16, -1,-30, -7, -7;
/M: SY='A'; M= 23, -3,-19, -4, -3,-17, -2,-19, -3, -2,-11,  1, -1,-11,  4, -6, 13,  9,  3,-39,-31, -4;
/M: SY='D'; M= -1, 11,-17, 24, 19,-35,-12, -3,-27,  7,-14,-17, -1, 12,  4, -5,  1, -8,-24,-28,-16, 13;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S'; M=  2,  1,-22,  2,  3,-24, -4, -3,-15,  3,-13, -5,  2,  0,  3, -4,  5,  1,-14,-28,-16,  2;
/M: SY='R'; M=-10,-16,-22, -6, -4,-10,-20, -9,-26,  9,-15, -3,-18, -7, 23, 57, -9,-24,-10, -1,  4,  2;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='V'; M=  7,-15,-20,-22,-26,  3,-22,-24, 37,-17,  9,  2, -8,-30,-23,-16, -8,  8, 38,-33,  0,-26;
/M: SY='D'; M= -1, 40,-23, 66,  9,-39,-10,-17,-30,  0, -8,-21, 15,-12, -8,-10, -1, -8,-19,-40,-12,  2;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-28,-43,-36, 84,-25,-28,  2,-11, 20,-16,-12,-38,-28,-11,-11,-17, 10,  7, 29,-36;
/M: SY='R'; M= -5,-14,-20, -9,-10,-10,-17,-11,-22,  7,-18,  0,-11,-11, 22, 59, -5,-20, -7,-10, -5, -2;
/M: SY='E'; M=  4,  1,-13,  6, 17,-27,-13, -8,-19,  7,-13, -9, -3,  4, 16,  3,  1, -4,-18,-23,-16, 16;
/M: SY='L'; M= -8,-13, -5,-15,-13, 21,-21,-10, 20,-16, 36, 19,-17,-32,-20,-18,-19, -1, 11,-19, 25,-13;
/M: SY='V'; M=  8,-14,-18,-17,-19,  1,-22,-21, 26,-15,  8,  3,-12,-28,-10, -8, -8,  8, 28,-29,  2,-16;
/M: SY='R'; M= -3, -7,-24, -2,  4,-16,-10,-14,-24, 18,-19,  2, -9,  4, 14, 31, -3,-14,-17,-13, -8,  5;
/M: SY='D'; M=  2, 10,-17, 24, 16,-29,-12,-12,-21,  5, -7,-12, -4, -2,  2, -7,  0, -8,-14,-23,-11, 10;
/M: SY='L'; M= -9,-12, -5,-15,-13, 20,-20,-11, 23,-19, 36, 17,-18,-30,-20,-20,-19, -1, 14,-18, 27,-13;
/M: SY='F'; M=  6,-10,-29,-16,-12, 12,-12, -6, -1, -6, -1, -3, -3,-19, -5, -8, -1, -4,  3,-24, -6,-12;
/M: SY='R'; M=  1, -8,-24, -5,  0,-11,-11, -9,-20, 11,-17,  2, -6, -6, 15, 30, -1,-12,-12,-17,-10,  2;
/M: SY='Q'; M=  0,-10,-18,-12, -3, -8,-18, -8, -1, -2, -1,  1, -6,-11,  5,  1, -3, -1,  2,-22, -4, -1;
/M: SY='F'; M=-23,-24,-32,-27,-26, 54,-27,-15,  3,-13, 28, -6,-21,-30,-21,-10,-15,-10, 11, 13, 47,-26;
/M: SY='R'; M= -4, -7,-26, -6,  5,-16, -5, -4,-20, 15,-18,  5, -5, -1, 10, 25, -4,-17,-18,-14,-10,  5;
/M: SY='C'; M=  5, -9, 22,-16, -9,-17,-17,-27,  3,-12,  0, -1, -2,-17, -8,-18,  2, 11,  7,-36,-26, -9;
/M: SY='R'; M= -9,-18,-20, -9, -6,-11,-19,-10,-29, 12,-20,  1,-18, -8, 28, 73, -9,-28,-11, -2, -1,  2;
/M: SY='I'; M=  3,-19,-21,-34,-28,  1,-15,-19, 52,-19, 16,  8, -5,-31,-21,-24, -9,  2, 40,-31, -6,-28;
/M: SY='W'; M=-18,-18,-10, -9, 21,-17, -7,-17,-28,  1,-15,-15,-30, -8,  9, -1,-12,-28,-27, 65,  8, 18;
/M: SY='M'; M= -1,-16,-13,-23,-13,  9,-20,  1, 14, -1, 27, 32, -9,-35,-16,-10,-17, -1,  6,-22, 10,-13;
/M: SY='R'; M=  0,-12,-10, -9, -1,-14,-17, -8,-12,  4,-11,  2,-11,-10,  9, 24, -4,-13, -5,-20,-12,  0;
/M: SY='Q'; M=  8, -9,-23, -7, 10,-20,-15, -6,-16,  2,-13, -4, -9, -5, 42, 18, -6, -3,-16,-12, -8, 20;
/M: SY='I'; M= -1,-13,-15,-19,-18,  4,-18,-16, 29,-14, 20, 10, -9,-28,-17,-18,-11,  1, 22,-25,  6,-18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 5 in 5 different sequences
Number of true positive hits 5 in 5 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PSP1 C-terminal
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
5 sequences

PSP1_YEAST  (P50896), TPL_TREPA   (P45685), YAAT_BACSU  (P37541), 
YL177_YEAST (Q06251), YOM2_SCHPO  (Q9C0V4)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission