Entry: PS51424

General information about the entry

Entry name [info] ROC
Accession [info] PS51424
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2008 (CREATED); MAR-2015 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51417
Associated ProRule [info] PRU00758

Name and characterization of the entry

Description [info] Roc domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=194;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=189;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8712015; R2=0.0226480; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=757; N_SCORE=20.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K'; M= -7, -7,-25, -9,  1,-25, -5,-12,-24,  7,-20,-14, -6,-14,  5, -1, -1, -1,-16,-28,-21,  1;
/M: SY='S'; M=  4,  0,-20,  1,  3,-27, -6, -9,-23, -4,-27,-16,  1, -5,  5, -8, 10,  1,-17,-32,-22,  3;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-27, -2, 12,-25,-19, -9,-17,  7,-21,-13, -1,-13,  4,  1, -1, -1,-12,-31,-18, 11;
/M: SY='P'; M= -6,-16,-20,-16, -9,-26,-21,-18,-15, -6,-15,-14,-12, 19, -5,-13, -2,  8, -8,-32,-22, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-26, 19,-30,-21, -8,-28,-13, -9,-20, -5, -8,-23,-26, -8,-22,-12,-12,-10, -5, -1,-20;
/M: SY='H'; M=-14,-11,-25,-16, -9,-13,-21,  4,-19, -5,-18,-12, -1, -5, -5, -4, -6,-10,-17,-21,  2, -9;
/M: SY='R'; M=-12, -9,-35,-18, -1,-25,-21, 10,-27, 16,-19,-17, -1,-19,  8, 39,-10,-12,-26,-28,-13, -1;
/M: SY='M'; M= -8,-28,-13,-28,-23, -5,-31,-25, 19,-22, 16, 21,-23,-25,-15,-23,-15, -2, 17,-23,-12,-22;
/M: SY='K'; M=-10, -2,-32,-12,  8,-30,-20, -8,-30, 45,-28,-20,  0,-12, 10, 27, -2,-10,-22,-30,-20,  8;
/M: SY='L'; M=-18,-38,-11,-38,-29,  0,-39,-29, 21,-29, 37, 22,-38,-30,-20,-21,-28,-10, 12,-20,-10,-29;
/M: SY='M'; M=-10,-25,-19,-27,-17, -6,-30,-21,  9, -9, 11, 30,-20,-25, -6,-15,-17, -9,  9,-23,-12,-17;
/M: SY='I'; M=-13,-34,-12,-35,-29,  3,-37,-27, 25,-28, 25, 17,-33,-29,-22,-25,-24, -9, 19,-19, -7,-28;
/M: SY='L'; M=-11,-34,-12,-35,-29,  2,-34,-27, 21,-25, 23, 17,-33,-27,-19,-25,-24, -7, 20,-21, -6,-25;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='H'; M=-12,  7,-28,  6,  8,-25,-14, 21,-28, -2,-30,-17,  9, -9, 18, -4,  4, -9,-25,-29,-11,  9;
/M: SY='E'; M= -6,  3,-29,  7, 18,-30,-15, -9,-27,  9,-29,-21,  0,  2,  6, -4,  7, -2,-23,-33,-22, 14;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-27, -6, -6,-28, 18, -9,-32, -2,-33,-21,  6,-17, -1, -3,  5,-10,-25,-31,-24, -5;
/M: SY='T'; M=  5,-16,-11,-16,-14,-16,-17,-19,  3,-10, -8, -4,-11,-14, -7,-17,  5, 10, 10,-29,-16, -9;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-31,-11,  9,-30,-20, -9,-30, 48,-29,-20,  0,-11, 10, 23, -1,-10,-21,-30,-20,  9;
/M: SY='T'; M=  3, -7,-10, -7, -7,-20,-14,-17,-13, -7,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 20, 37, -6,-30,-20, -7;
/M: SY='T'; M= -1, -7,-15,-10, -8,-19,-14,-13,-12, -5,-15,-11,  3,-14, -5, -5, 13, 17, -9,-30,-18, -7;
/M: SY='L'; M=-17,-38,-10,-38,-30, -1,-39,-30, 24,-29, 35, 18,-38,-29,-21,-22,-28, -9, 15,-21,-10,-29;
/M: SY='V'; M= -6,-31, -4,-33,-27, -8,-30,-26, 14,-21,  9,  4,-30,-25,-19,-20,-19, -7, 15,-16,-10,-23;
/M: SY='Q'; M=-12,  5,-32,  4, 20,-29,-19,  5,-30, 21,-28,-14,  2,-12, 27,  9, -1,-11,-23,-28,-18, 21;
/M: SY='C'; M=  9,-19, 27,-23,-19,-19,-18,-21, -9,-16,-13,-12,-17,-19,-12,-21,  3,  4, -5,-25,-19,-18;
/M: SY='L'; M=-19,-39,-11,-39,-29,  0,-39,-29, 19,-29, 39, 23,-39,-30,-19,-20,-29,-10, 10,-20,-10,-29;
/M: SY='K'; M= -9, -6,-16,-13,  0,-23,-22, -4,-22, 20,-21,-11, -3,-14,  6,  5, -2, -1,-15,-27,-15,  1;
/M: SY='K'; M= -5, -6,-16, -9,  2,-26, -7,-13,-25, 13,-25,-16, -5,-15,  0, -2,  2, -6,-19,-28,-21,  1;
/M: SY='E'; M= -4, -5,-24, -5,  6,-23, -4,-12,-22,  5,-22,-12, -4,-15,  1, -5,  6, -6,-19,-28,-20,  3;
/M: SY='K'; M= -7,-11,-26,-17,  0,-25,-21,-11,-20, 19,-17,-13, -9, -7,  6, 14, -6, -9,-14,-29,-19,  0;
/M: SY='K'; M= -4,-13,-20,-18, -8,-21,-15,-19,-10, 11,-13, -9,-13,-16, -6, -3, -6, -4, -3,-28,-18, -7;
/M: SY='K'; M= -9, -9,-27,-13,  2,-22,-21,-11,-20, 11,-21,-16, -8,  3,  4,  3, -3, -9,-16,-28,-18,  2;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-18, -5,  2,-23, -5,-11,-20,  6,-26,-16,  1,-11,  3, -5, 17,  3,-15,-29,-20,  3;
/M:         M= -7,-18, -9,-24,-17, -4,-18,-16, -9,-12, -6, -7,-14,-24,-13,-10, -6, -5,-10,-20, -9,-17;
/M: SY='S'; M= -4,-10,-22,-13, -5,-10,-11,-11,-18, -6,-21,-14, -7, -5, -4,-13,  1, -7,-15,-24,-12, -4;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='R'; M= -3, -8,-17,-11, -5,-18, -6,-10,-16,  1,-15,-13, -4, -4, -2,  4,  4,  0,-14,-23,-16, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='Q'; M= -3, -2,-18, -2,  0,-18,  0, -5,-17, -2,-16,-10, -1,-11,  7,  0,  4, -5,-15,-19,-15,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='S'; M=  0, -5,-14, -7, -4,-13, -2, -1,-12, -1,-15,-11,  0,-10, -1,  3,  6, -2,-10,-18,-10, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-10, -4, -4,-13, -9, -6, -9, -4,-11, -8,  7, -1, -3, -5,  4,  7, -8,-18,-11, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='S'; M=  5, -6, -9, -7, -6, -7,  6, -9,-13, -6,-17,-11, -3,-10, -6, -9, 11, -2,-11,-15,-10, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M:         M=-13,-14,-22,-11,-14,-17,-20,-15, -4,-19, -3, -3,-17,-10,-12,-20,-13, -8, -5,-30,-17,-15;
/M: SY='N'; M=-13, 13,-29,  7,  8,-29,-14,  5,-28,  2,-32,-19, 21, -8,  6, -3,  5, -1,-25,-35,-18,  6;
/M: SY='S'; M= -2,-12,-19,-12, -6,-19,-14,-16, -6, -5,-14,-10,-10, -9, -3,-13,  3, -4, -3,-28,-18, -5;
/M: SY='S'; M=  8,-11,-14,-11, -6,-20, -7,-17, -9, -3,-19,-12, -8,-13, -6,-13, 10,  0, -3,-30,-18, -4;
/M: SY='T'; M=  1, -9,-11, -9,-10,-21,-13,-19,-13,-10,-14,-12,  0,-11,-10,-11, 12, 42, -4,-30,-21,-10;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-23,  9,  6,-24, -5, -8,-20,  5,-26,-17,  6,-13,  0, -6,  6, -4,-17,-30,-19,  4; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G'; M=  2,-13,-19,-13,-17,-21, 22,-18,-17,-16,-21,-16,-13, -8,-16,-17, -3,-11,-10,-25,-21,-16; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-13,-30,-27, -4,-37,-27, 31,-24, 17,  8,-28,-28,-24,-20,-20, -9, 23,-22,-11,-26;
/M: SY='E'; M=-11, 13,-36, 17, 18,-33,-15, -5,-29,  8,-31,-23,  6,-16,  7, 10, -1, -9,-27,-37,-23, 13;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-12,-26,-24, -5,-35,-25, 28,-23, 13, 11,-25,-25,-18,-25,-16, -4, 24,-22,-11,-22;
/M: SY='Q'; M= -5,  4,-24,  8,  6,-27,-15, -8,-19, -3,-21,-13, -1,-15, 12, -4,  4,  2,-15,-32,-22,  6;
/M: SY='D'; M=-13, 19,-33, 23, 19,-32,-13, -1,-29,  4,-33,-19, 15,-15, 16, -4,  5, -7,-26,-36,-23, 16;
/M: SY='W'; M=-18,-32,-17,-38,-24,  4,-28,-10, -7,-25,-10,-11,-30,-32,-18,-24,-22,-21,-14, 43, 13,-24;
/M: SY='K'; M=-10, -5,-26, -7,  3,-16,-20, -3,-20, 12,-21,-14, -4,-16,  4,  2, -2, -5,-15,-21, -3,  3;
/M: SY='F'; M= -9,-23, -6,-28,-23,  7,-26,-18,  0,-22,  1, -2,-20,-22,-19,-22,-10, -9, -5,-16, -4,-23;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='D'; M=-11,  7,-26, 11,  9,-28,-12, -5,-23, -3,-25,-17,  1, 11,  8, -8, -2, -7,-19,-29,-20,  7; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M:         M= -3, -6,-15, -5, -8,-13, -1,-12, -7, -8,-11, -4, -6,-14, -6, -8,  0, -5, -6,-20,-14, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-18, -7,  1,-19,-12, -9,-15,  8,-17,-13, -4,  6,  1,  1,  2, -3,-11,-22,-15,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='D'; M= -5,  2,-18,  6, -4, -8,  2, -9,-16,-11,-19,-14, -4,-16, -8,-14,  0, -8,-15,-19,-10, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='G'; M= -6,  7,-23, 11,  1,-23, 13, -9,-24, -4,-25,-18,  0,-12, -2, -9,  0,-10,-19,-25,-19, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='S'; M=  0, -1,-17, -3,  3,-19,  0, -7,-20,  9,-23,-16,  2, -9,  2,  3, 12, -2,-17,-22,-16,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='N'; M= -6,  3, -8, -1, -2,-15,-11, -6, -9,  2,-14,-10,  6,-11, -3, -5,  2, -3, -9,-20,-12, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K'; M= -9,  1,-20, -7,  1,-18,-14, -5,-17, 17,-16,-10,  6,-11,  3, 10, -2, -5,-14,-21,-13,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K'; M= -1, -7,-23,-11, -3,-23,  3,-11,-22, 11,-23,-15, -6,-12,  1,  4, -1, -9,-15,-25,-19, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='N'; M= -8,  5,-27,  3,  4,-31,-14, -9,-26,  2,-30,-23,  8,  6,  0, -4,  7,  0,-23,-36,-24,  2;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-16, -9, -6, -9, -4, -6,-14, -3,-14,-11, -1, -7, -5,  2,  0, -1,-13,-16, -9, -6; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-14,-28,-28,-10,-16,-28, 17,-24,  7,  4,-28,-24,-22,-27,-18, -8, 20,-26,-14,-24;
/M: SY='T'; M= -6, -1,-26,  2,  8,-26,-13,-12,-20,  1,-21,-16, -2,-13,  0, -3,  1, 10,-14,-32,-21,  5;
/M: SY='F'; M=-18,-33,-16,-38,-29, 34,-34,-18, 10,-29, 15, 10,-32,-36,-25,-26,-23,-16,  1, -3, 12,-29;
/M: SY='S'; M= -3, -1,-17, -5, -4,-16,-10,  6,-16, -6,-23,-11, 11,-16, -1, -9, 18,  0,-17,-28,-12, -4;
/M: SY='V'; M= -1,-29, -9,-29,-27, -8,-30,-28, 26,-22, 11,  8,-28,-22,-21,-26,-16,  0, 29,-26,-12,-22;
/M: SY='W'; M=-27,-38,-19,-45,-28, 12,-31,-14,-13,-28,-15,-16,-36,-38,-21,-28,-28,-27,-22, 77, 26,-28;
/M: SY='D'; M=-17, 32,-40, 49, 28,-37,-13, -7,-30, -4,-37,-27,  7,-17,  6,-14,  0,-10,-30,-44,-27, 18;
/M: SY='F'; M=-17,-31,-11,-39,-31, 42,-32,-16,  7,-30,  5,  2,-31,-37,-29,-30,-20,-17, -3,  2, 18,-31;
/M: SY='A'; M= 16,-11,-18,-11, -6,-25, 16,-16,-24, -8,-28,-19,-11,-14, -8, -7,  7, -7,-17,-30,-23, -7;
/M: SY='G'; M= -2, -9,-29,-10,-19,-28, 48,-18,-35,-19,-35,-22, -6,-21,-17,-19, -1,-18,-27,-30,-28,-19;
/M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -4,  5,-24,-20,  2,-25,  0,-20, -6,  0, -3, 22,  0, -5,-10,-19,-24,-13,  8;
/M: SY='E'; M= -6,  3,-32,  8, 25,-30,-16, -3,-28,  5,-28,-18, -2, -3, 18,  2,  2, -8,-25,-31,-22, 22;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='V'; M= -4,-16,-16,-15, -9,-15,-23,-19,  6,-12, -4, -3,-16, -7,-10,-18, -6, -3,  8,-26,-14, -7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='Y'; M=-18,-24,-19,-27,-18, 26,-26, 17, -8,-19, -8, -4,-17,-28,-16,-18,-17,-18,-10, 10, 47,-18; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='Y'; M=-13,-17,-21,-20,-11, 13,-24, 11,-13,-15,-15,-11, -9,-25,-13,-15,-10, -9,-13, -2, 29,-12;
/M: SY='S'; M=  1,-10,  4,-11,-12,-22,-16,-11,-14,-12,-19,-17, -7, -9,-10,-18,  6,  6,-10,-30,-18,-12;
/M: SY='T'; M= -2,-17, -2,-18,-17,-11,-23,-18,  0,-15, -6, -8,-10,-18,-15,-18,  2, 19,  3,-22, -9,-16;
/M: SY='H'; M=-14,  3,-27, -1,  2,-14,-16, 41,-27, -7,-29,-18, 10,-19,  8, -5,  0,-12,-26,-22,  8,  1;
/M: SY='Q'; M=-13,  1,-31,  1, 12,-29,-19, 16,-30,  1,-25,-11,  0,  1, 34,  1, -3,-12,-23,-26,-15, 16;
/M: SY='F'; M=-16,-28,-12,-35,-26, 30,-30, -3,  0,-25,  0,  2,-25,-33,-22,-25,-19,-16, -4,  0, 24,-25;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 53,-30,-12,  3,-29,  1,  1,-30,-38,-29,-30,-20,-18, -5,  6, 26,-29;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-16,-27,-23,  1,-22,-23,  5,-25, 12,  8,-28,-28,-18,-21,-18,-12,  0,-19, -8,-23;
/M: SY='S'; M=  6, -4,-11, -6, -6,-20, -9,-14,-13, -6,-21,-14,  6,-12, -6,-11, 20, 19, -8,-31,-19, -6;
/M: SY='E'; M= -5,  4,-28,  6, 12,-31,-15, -8,-26,  2,-29,-20,  2,  3,  6, -6,  3, -2,-21,-34,-23,  9;
/M: SY='R'; M=-12,  5,-35,  2,  3,-30,-10,  3,-30,  8,-29,-23,  8,-19,  4, 21, -2, -9,-29,-34,-19,  1;
/M: SY='A'; M= 19,-16,  2,-17,-12,-20, -8,-19,-10,-11,-19,-14,-14, -5,-11,-16, 12,  0, -6,-29,-20,-12;
/M: SY='L'; M=-12,-33,-11,-33,-28,  1,-35,-27, 21,-26, 23, 12,-32,-27,-22,-24,-22, -3, 17,-20, -8,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-19,-21,-23,-15, 18,-25, 21,-14,-16,-16,-12, -8,-27,-14,-16,-11,-16,-15,  6, 47,-15;
/M: SY='I'; M=-11,-32,-10,-32,-28, -4,-36,-29, 25,-26, 24, 12,-32,-26,-22,-24,-22, -3, 21,-23,-11,-26;
/M: SY='V'; M= -1,-27,-11,-28,-26, -9,-29,-19, 22,-20,  7,  6,-26,-21,-17,-25,-18, -4, 27,-27, -8,-19;
/M: SY='V'; M= -1,-30, -1,-30,-28,-10,-29,-29, 19,-21, 10,  6,-29,-21,-19,-26,-17,  1, 25,-27,-12,-22;
/M: SY='Y'; M=-19,-33,-18,-38,-27, 27,-30, -9, -3,-26, -6, -6,-30,-34,-23,-27,-23,-19, -7, 30, 31,-26;
/M: SY='N'; M=-16, 18,-31, 11,  3,-30,-14, -2,-24,  6,-32,-19, 25,-18,  1,  2,  1, -5,-22,-39,-21,  2;
/M: SY='L'; M=-15,-33, -6,-35,-28,  2,-36,-27, 16,-27, 24, 13,-32,-29,-21,-23,-22, -5,  9,-18, -8,-28;
/M: SY='S'; M=  9, -3, -5, -7, -6,-22, -7,-12,-17, -6,-25,-16,  7,-13, -6,-10, 21, 12,-14,-31,-20, -6;
/M: SY='K'; M=-14,  1,-25,  2, -1,-24,-22,-15,-14,  4,-14,-11, -4,-18, -3, -6, -6, -4,-12,-34,-20, -3;
/M: SY='P'; M= -9, -8,-28, -5, -5,-17, -2,-10,-26,-13,-28,-23,-12,  3,-11,-18, -6,-14,-21,-25, -9, -8;
/M: SY='E'; M=-12,  9,-32, 13, 18,-28,-12, -6,-25, -2,-25,-17,  6,-15,  7, -7,  0, -4,-23,-33,-22, 13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -3, -1,-19,  1, 10,-14,-11, -2,-16,  5,-18,-13, -2,-10,  3,  2,  1, -5,-15,-17, -6,  7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M=  0, -1,-22,  1, 16,-19,-13,  7,-18, -1,-21,-14, -2,-11,  7, -4,  2, -6,-16,-24,-10, 13; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='I'; M= -9,-16,-15,-22,-20,  3,-24,-16,  5,-18, -3, -1,-10,-24,-17,-21, -6, -2,  4,-20, -4,-18;
/M: SY='Q'; M=  6, -4,-21, -2,  5,-27, -4, -9,-24, -2,-27,-16, -4, -5,  9, -3,  9, -5,-18,-30,-22,  5;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Q'; M= -1, -4,-22, -8,  4,-23,-14, -2,-21,  9,-19, -9,  1,-11, 17, 14,  1, -2,-15,-24,-17,  7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='I'; M= -8,-32,-11,-32,-29, -4,-35,-29, 29,-25, 20, 16,-32,-26,-21,-27,-22, -6, 28,-24,-10,-25;
/M: SY='E'; M=-11, -1,-28,  1,  9,-25,-16,-10,-18, -2,-18,-13, -3,-11,  3, -8, -4, -5,-16,-30,-20,  6;
/M: SY='Y'; M=-13,-23,-18,-26,-19, 23,-23, -2,-10,-19,-11,-10,-17,-20,-19,-21, -7, -9,-12, -1, 26,-19;
/M: SY='W'; M=-28,-38,-20,-47,-29, 16,-30,-16,-18,-29,-18,-18,-37,-39,-21,-29,-28,-28,-27, 86, 25,-29;
/M: SY='L'; M=-16,-37,-11,-37,-29, -2,-37,-29, 21,-27, 33, 22,-36,-28,-18,-22,-27, -8, 15,-22,-10,-27;
/M: SY='H'; M=-13, -4,-26,-10,  0,-13,-20, 20,-19, -5,-19,-11,  3,-19,  7, -1, -4,-10,-18,-23, -3,  1;
/M: SY='N'; M= -8, -5, -9,-13,-11, -9,-10, -7,-20, -9,-23,-15,  5,-22, -6, -9,  4, -6,-21,-22,-11,-10;
/M: SY='I'; M=-10,-32,-10,-32,-30, -2,-38,-30, 35,-28, 22, 12,-32,-28,-26,-28,-22, -8, 28,-22,-10,-28;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30, -7,  7,-26,-14, -1,-27, 20,-26,-14,  4,-15,  6,  9, -1, -7,-21,-29,-17,  6;
/M: SY='S'; M= 15, -6,-12, -9, -5,-23,  2,-13,-19, -2,-27,-17,  0,-12, -5, -8, 18,  3,-13,-31,-21, -5;
/M: SY='R'; M=-12,-10,-29,-19, -5,-16,-23, -4,-20, 11,-15,-13, -2,-20,  0, 22, -8, -6,-19,-23, -8, -5;
/M: SY='A'; M= 17,-14, -9,-12,-12,-20, -6,-20, -4,-12,-16, -9,-15,-14,-11,-17,  5,  0,  3,-32,-19,-10;
/M: SY='P'; M= -5,-10,-26,-11, -2,-32,-12,-16,-27,  1,-29,-24, -9, 32, -4,-10,  2, -2,-19,-35,-25, -3;
/M: SY='N'; M=-12, 10,-27,  1, -3,-27, -8,  2,-24, -2,-32,-20, 22, -9, -3, -7,  4, -5,-21,-36,-18, -3;
/M: SY='A'; M= 21,-12, -9,-12, -3,-13, -5,-14,-14, -7,-22,-13,-10,-13, -6,-11, 15,  0,-10,-26,-15, -4;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -7,-20,-24,-20,-13,-32,-21,-21,-18,-11,-21,-21,-18, 50,-11,-20, -8,  2, -8,-37,-25,-11;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24;
/M: SY='I'; M=-10,-31, -4,-33,-30,  4,-36,-24, 24,-28, 14,  6,-30,-29,-26,-29,-21,-10, 19,-16, -1,-28;
/M: SY='L'; M=-15,-35,-10,-35,-30, -1,-39,-30, 29,-29, 30, 15,-35,-29,-24,-25,-25, -9, 20,-21,-10,-29;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-10,-30,-30, -8,-32,-30, 32,-22, 12, 10,-30,-22,-22,-30,-20, -2, 38,-28,-10,-22;
/M: SY='G'; M=  7,-12,-25,-12,-18,-28, 49,-20,-35,-18,-36,-26,-12,-18,-18,-18,  2,-16,-25,-30,-28,-18;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 10, 50,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='H'; M=-20,  2,-30, -8,  0,-12,-19, 74,-30, -9,-31,-20, 14,-20,  9,  0, -8,-18,-30,-22, 17,  0;
/M: SY='L'; M=  0,-30, -7,-30,-22, -7,-26,-26, 12,-22, 15,  7,-29,-23,-17,-18,-12, -6,  8,-24,-14,-22;
/M: SY='D'; M=-18, 35,-37, 53, 17,-38,-11,-11,-28,-10,-37,-28,  9,-19, -1,-19,  1, -4,-27,-48,-29,  8;
/M:         M= -5, -8,-19, -3, -4,-19,-21,-17, -3,-12, -7, -5,-12,-18, -4,-16, -4, -1, -1,-30,-18, -4;
/M: SY='I'; M= -6,-25,  3,-29,-25,  3,-27,-19,  7,-22,  1,  2,-22,-27,-19,-26, -9, -7,  5,-16, -2,-23;
/M: SY='N'; M= -7,  1,-23, -1,  0,-24,-10,-10,-19, -8,-20,-14,  6,-12, -4,-10,  2, -1,-17,-33,-21, -2;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S'; M=  1, -9,-18, -9,  1,-13,-13, -9,-13, -3,-17,-10, -8, -6,  2, -6,  3, -4,-10,-22,-12,  2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -7,  1,-22,-17, -4,-22,  5,-23,-17,  5,  4, -1,  1, -1,  0,-17,-26,-12,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-25,  5, 16,-15,-14,  3,-20,  8,-20,-13, -1,-11, 10,  0, -2, -9,-18,-19, -9, 14; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Y'; M=-12,-11,-20,-17,-10,  1,-21, -3, -8, -8, -8, -5, -4,-22, -5, -3, -7, -9,-11,-13,  2, -9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M:         M= -5,-15,-19,-14, -9,-16, -4,-18, -5, -9, -7, -6,-16,-17, -9,-14,-10, -8, -1,-24,-15, -8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='S'; M= -3, -3,-19, -1,  1,-17,-13, -7,-12, -6,-19,-13, -2, -6, -3,-12,  2, -3, -9,-24, -9,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -6, -1,-16,  0,  0,-25, -9,-12,-20,  3,-23,-18, -4, -6, -3, -5,  0, -7,-16,-29,-20, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V'; M=-10,-18, -9,-18,-16,-12,-29,-18,  5,-13,  0, -1,-20,-22,-10,-18,-13, -5,  6,-23, -9,-14;
/M:         M= -8, -4,-19, -6,-11,-12,-20,-14, -3,-16,-10, -7, -2,-23,-12,-16, -4, -6, -6,-28,-14,-13;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-30, 15, 19,-30,-16, -7,-25,  6,-27,-17,  1,-12, 12, -3,  2,  0,-20,-34,-22, 15;
/M: SY='I'; M= -2,-24, -3,-24,-19, -9,-28,-24, 16,-21,  5,  4,-23,-24,-18,-23,-10, -6, 12,-23,-14,-19;
/M: SY='M'; M= -9,-18,-18,-18,-12,-12,-26,-11, -3,-15,  5, 10,-16,-22, -3, -9,-12, -2, -3,-25,-13,-13;
/M: SY='E'; M= -7, -7,-26, -6, 13,-23,-21, -8,-18,  6,-14, -9, -8,-15, 12,  3, -2, -8,-17,-27,-18, 11;
/M: SY='Q'; M=-11,  0,-25, -3,  4,-17,-18,  0,-21,  4,-22,-12,  5,-17,  8, -3,  2, -7,-19,-23, -6,  4;
/M: SY='I'; M= -9,-20,-18,-21,-12,-13,-30,-21,  8, -6,  3,  0,-19,-21,-11,-10,-13, -3,  8,-26,-14,-12;
/M: SY='V'; M= -4,-27,-12,-28,-21, -3,-27,-13,  9,-20,  7,  6,-24,-23,-16,-19,-15, -4, 10,-18,  1,-20;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25,-12,  1,-25,-16, -6,-23, 15,-21,-15,  2,-15,  8, 18,  4, -5,-20,-29,-19,  2;
/M: SY='Q'; M= -8, -7,-25,-12,  2,-23,-21, -8,-18,  9,-14, -8, -3,-16, 10, 10, -4, -3,-15,-28,-18,  3;
/M: SY='R'; M=-11,-12,-21,-18, -5,-12,-22, -3,-19,  1,-15,-14, -4,-22, -3, 12, -7, -9,-20,-20, -5, -6;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='F'; M=-12,-15,-17,-20,-11, 18,-19, -1, -8, -7, -7, -4,-13,-20, -7, -6,-10,-12,-10,  0, 15,-10; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M:         M= -5, -8,-16, -8, -3,-12, -8, -4, -9, -4, -9, -3, -6,-12, -2, -7, -3, -3, -6,-19, -9, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='H'; M= -8, -1,-24, -7, -3,-19,  3,  9,-25,  3,-25,-18,  5,-14,  0,  6, -2,-11,-22,-22,-10, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-20,-29,-24, 37,-30, -9, -1,-27,  1, -1,-26,-35,-24,-26,-20,-17, -9,  1, 24,-25;
/M: SY='P'; M=-10, -8,-27, -6,  2,-30,-19,-12,-23, -5,-21,-17, -9, 20,  4, -8, -3, -4,-18,-33,-24,  1;
/M: SY='N'; M=-12, -3,-26, -8, -6,-18,-20,  2,-16, -2,-18, -8,  7,-20, -2,  2, -4,  1,-13,-27, -8, -6;
/M: SY='I'; M=-11,-23,-14,-22,-23, -3,-33,-26, 22,-25, 12,  5,-25,-27,-22,-26,-17, -4, 17,-23,-10,-23;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-25,-12, -4,-22,-13, -1,-20,  6,-19,-13,  1,-16,  3,  6, -1, -4,-15,-28,-15, -2;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='B'; M=-14,  2,-23,  0, -1, -9,-17, -6,-12, -7,-12, -9,  2,-19, -4, -4, -6, -7,-15,-22, -9, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='K'; M= -7, -4,-13, -9, -3,-11,-13, -1, -7,  6, -8, -5, -1,-10, -1,  0, -5, -5, -5,-16, -6, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='H'; M= -3,-14,-14,-16,-11, -3,-11,  3, -8,-13,-12, -9,-11, -9,-10,-12, -6, -5, -7,-14,  2,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-11,-30,-26, -2,-31,-20, 21,-23, 12,  7,-28,-25,-20,-24,-18, -7, 21,-22, -6,-23;
/M: SY='I'; M=-13,-23,-15,-26,-21, -3,-31,-15, 11,-19, 10,  4,-19,-26,-16,-18,-15, -8,  6,-21, -7,-20;
/M:         M= -9, -7,-23, -4, -7,-17,-14,-17,-11,-14,-14,-13,-12, -8,-10,-19, -4, -8,-11,-30,-17, -9;
/M: SY='V'; M=  3,-22,-10,-24,-22,-12,-24,-24, 15,-18,  2,  3,-19,-19,-17,-22,-10,  2, 20,-29,-14,-18;
/M: SY='S'; M=  4, -7, -5, -9, -9,-20, -3,-14,-17, -9,-21,-16,  1,-15, -8,-13, 18,  6,-15,-29,-20, -9;
/M: SY='C'; M=  3,-14, 36,-22,-20,-22,-19,-19,-15,-12,-19,-18, -9,-21,-15,-21,  4,  0,-13,-26,-20,-20;
/M: SY='T'; M=  2, -7,-18, -8,  0,-25,-13,-13,-20,  4,-22,-17, -1, -2, -1, -1, 12, 13,-14,-31,-21, -1;
/M: SY='S'; M= -2,  5,-20,  8,  2,-26, -4,-12,-22, -6,-27,-20,  8,-13, -3,-11, 16, 14,-18,-34,-23,  0;
/M: SY='G'; M=  1,-16,-10,-18,-17,-23,  8,-19,-21,-14,-19,-17,-14,-12,-14,-13,  1, -9,-17,-28,-23,-17;
/M: SY='K'; M=-13,  1,-30, -1,  3,-23,-21, -7,-18, 11,-22,-16,  0,-18,  0,  6, -5, -9,-15,-29,-13,  2;
/M: SY='G'; M= -6,  8,-30,  9, -5,-30, 22, -5,-33,-13,-38,-26,  6,-19, -9,-15,  1,-13,-28,-36,-24, -7;
/M: SY='I'; M=-11,-30,-14,-30,-25,  0,-35,-24, 22,-24, 18, 20,-28,-28,-15,-24,-20, -9, 19,-20, -8,-23;
/M: SY='K'; M= -8,  7,-31,  6, 10,-31,-16, -8,-27, 18,-29,-21,  4,-14,  5, 11,  0, -5,-22,-35,-22,  7;
/M: SY='K'; M= -4, -7,-22,-12, -1,-23,-14,-13,-17, 10,-18,-13, -4,-15, -1,  2,  0, -1,-11,-30,-19, -1;
/M: SY='L'; M=-20,-39,-11,-40,-30,  4,-39,-29, 19,-30, 37, 19,-39,-31,-21,-21,-29,-11,  9,-18, -7,-30;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-32,-19, -1,-26,-23, -6,-23, 20,-14,-13, -6,-18,  9, 35,-10,-10,-21,-28,-19,  0;
/M: SY='N'; M=-15, 12,-32,  7,  8,-28,-16,  0,-26,  8,-27,-11, 18,-17, 12,  5,  0, -7,-23,-34,-20,  8;
/M: SY='E'; M=-13, -5,-26, -5,  4,-20,-23,  1,-17,  0,-13,-11, -6,-17,  2,  0, -7, -2,-16,-28,-13,  2;
/M: SY='I'; M=-15,-35,-10,-35,-30,  0,-40,-30, 30,-30, 30, 15,-35,-30,-25,-25,-25,-10, 20,-20,-10,-30;
/M:         M= -7,-17,-19,-18, -6, -7,-26,-13,  0, -6, -5, -3,-18,-21, -5,-11,-10,-10,  0,-19, -6, -6;
/M: SY='Q'; M= -8,  4,-29,  0, 11,-26,-16,  9,-28, 12,-28,-17,  6,-14, 16,  8,  2, -9,-24,-29,-15, 11;
/M: SY='V'; M= -6,-20, -6,-20,-13,-13,-29,-22,  6,-17,  3,  3,-19,-21,-12,-20,-10,  5,  7,-25,-15,-13;
/M: SY='A'; M=  5,-20,-15,-22,-15,-16,-15,-19, -1,-10, -6, -6,-16,-19,-11, -4, -4, -1,  2,-28,-17,-14;
/M:         M= -5,-15,-12,-16, -3,-17,-22,-16,-12, -4,-11, -9,-14,-18, -2,-10, -3, -2,-10,-17,-15, -3;
/M: SY='N'; M= -9,  9,-27,  2,  9,-27,-14,  6,-27,  9,-30,-17, 20,-14, 10,  2,  6, -1,-23,-31,-17,  9;
/M: SY='Q'; M=-10,-13,-22,-15, -6,-11,-25,-10, -3, -9, -5,  2, -8,-21,  4, -7, -7, -7, -3,-23,-12, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51417; PS51418; PS51419; PS51420; PS51421; PS51422; PS51423

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 20 in 20 different sequences
Number of true positive hits 20 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 86.96 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
20 sequences

DAPK1_HUMAN (P53355), DAPK1_MOUSE (Q80YE7), DAPK_CAEEL  (O44997), 
GBPC_DICDI  (Q8MVR1), LRK1_CAEEL  (Q9TZM3), LRRK1_HUMAN (Q38SD2), 
LRRK1_MOUSE (Q3UHC2), LRRK2_HUMAN (Q5S007), LRRK2_MOUSE (Q5S006), 
MFHA1_HUMAN (Q9Y4C4), MFHA1_MOUSE (Q3V1N1), MFHA1_XENTR (A4IIK1), 
PATS1_DICDI (Q55E58), QKGA_DICDI  (Q8SSS9), ROC10_DICDI (Q6XHA6), 
ROC11_DICDI (Q6XHA5), ROCO4_DICDI (Q6XHB2), ROCO5_DICDI (Q1ZXD6), 
ROCO6_DICDI (Q54WS5), ROCO8_DICDI (Q54M77)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

EHD1_ARATH  (Q94CF0), EHD2_ARATH  (B3LF48), TRN1_ARATH  (Q9FJ57)

		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

2ZEJ; 3D6T

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission