PROSITE entry PS51424
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ROC |
| Accession [info] | PS51424 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2008 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51417 |
| Associated ProRule [info] | PRU00758 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Roc domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=194; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=189; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8712015; R2=0.0226480; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11459.7626953; R2=14.7298574; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=757; H_SCORE=22610; N_SCORE=20.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; H_SCORE=13831; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -7, -7,-25, -9, 1,-25, -5,-12,-24, 7,-20,-14, -6,-14, 5, -1, -1, -1,-16,-28,-21, 1; /M: SY='S'; M= 4, 0,-20, 1, 3,-27, -6, -9,-23, -4,-27,-16, 1, -5, 5, -8, 10, 1,-17,-32,-22, 3; /M: SY='E'; M= -4, -2,-27, -2, 12,-25,-19, -9,-17, 7,-21,-13, -1,-13, 4, 1, -1, -1,-12,-31,-18, 11; /M: SY='P'; M= -6,-16,-20,-16, -9,-26,-21,-18,-15, -6,-15,-14,-12, 19, -5,-13, -2, 8, -8,-32,-22, -8; /M: SY='C'; M=-10,-26, 19,-30,-21, -8,-28,-13, -9,-20, -5, -8,-23,-26, -8,-22,-12,-12,-10, -5, -1,-20; /M: SY='H'; M=-14,-11,-25,-16, -9,-13,-21, 4,-19, -5,-18,-12, -1, -5, -5, -4, -6,-10,-17,-21, 2, -9; /M: SY='R'; M=-12, -9,-35,-18, -1,-25,-21, 10,-27, 16,-19,-17, -1,-19, 8, 39,-10,-12,-26,-28,-13, -1; /M: SY='M'; M= -8,-28,-13,-28,-23, -5,-31,-25, 19,-22, 16, 21,-23,-25,-15,-23,-15, -2, 17,-23,-12,-22; /M: SY='K'; M=-10, -2,-32,-12, 8,-30,-20, -8,-30, 45,-28,-20, 0,-12, 10, 27, -2,-10,-22,-30,-20, 8; /M: SY='L'; M=-18,-38,-11,-38,-29, 0,-39,-29, 21,-29, 37, 22,-38,-30,-20,-21,-28,-10, 12,-20,-10,-29; /M: SY='M'; M=-10,-25,-19,-27,-17, -6,-30,-21, 9, -9, 11, 30,-20,-25, -6,-15,-17, -9, 9,-23,-12,-17; /M: SY='I'; M=-13,-34,-12,-35,-29, 3,-37,-27, 25,-28, 25, 17,-33,-29,-22,-25,-24, -9, 19,-19, -7,-28; /M: SY='L'; M=-11,-34,-12,-35,-29, 2,-34,-27, 21,-25, 23, 17,-33,-27,-19,-25,-24, -7, 20,-21, -6,-25; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='H'; M=-12, 7,-28, 6, 8,-25,-14, 21,-28, -2,-30,-17, 9, -9, 18, -4, 4, -9,-25,-29,-11, 9; /M: SY='E'; M= -6, 3,-29, 7, 18,-30,-15, -9,-27, 9,-29,-21, 0, 2, 6, -4, 7, -2,-23,-33,-22, 14; /M: SY='G'; M= -2, -1,-27, -6, -6,-28, 18, -9,-32, -2,-33,-21, 6,-17, -1, -3, 5,-10,-25,-31,-24, -5; /M: SY='T'; M= 5,-16,-11,-16,-14,-16,-17,-19, 3,-10, -8, -4,-11,-14, -7,-17, 5, 10, 10,-29,-16, -9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='K'; M=-10, -1,-31,-11, 9,-30,-20, -9,-30, 48,-29,-20, 0,-11, 10, 23, -1,-10,-21,-30,-20, 9; /M: SY='T'; M= 3, -7,-10, -7, -7,-20,-14,-17,-13, -7,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 20, 37, -6,-30,-20, -7; /M: SY='T'; M= -1, -7,-15,-10, -8,-19,-14,-13,-12, -5,-15,-11, 3,-14, -5, -5, 13, 17, -9,-30,-18, -7; /M: SY='L'; M=-17,-38,-10,-38,-30, -1,-39,-30, 24,-29, 35, 18,-38,-29,-21,-22,-28, -9, 15,-21,-10,-29; /M: SY='V'; M= -6,-31, -4,-33,-27, -8,-30,-26, 14,-21, 9, 4,-30,-25,-19,-20,-19, -7, 15,-16,-10,-23; /M: SY='Q'; M=-12, 5,-32, 4, 20,-29,-19, 5,-30, 21,-28,-14, 2,-12, 27, 9, -1,-11,-23,-28,-18, 21; /M: SY='C'; M= 9,-19, 27,-23,-19,-19,-18,-21, -9,-16,-13,-12,-17,-19,-12,-21, 3, 4, -5,-25,-19,-18; /M: SY='L'; M=-19,-39,-11,-39,-29, 0,-39,-29, 19,-29, 39, 23,-39,-30,-19,-20,-29,-10, 10,-20,-10,-29; /M: SY='K'; M= -9, -6,-16,-13, 0,-23,-22, -4,-22, 20,-21,-11, -3,-14, 6, 5, -2, -1,-15,-27,-15, 1; /M: SY='K'; M= -5, -6,-16, -9, 2,-26, -7,-13,-25, 13,-25,-16, -5,-15, 0, -2, 2, -6,-19,-28,-21, 1; /M: SY='E'; M= -4, -5,-24, -5, 6,-23, -4,-12,-22, 5,-22,-12, -4,-15, 1, -5, 6, -6,-19,-28,-20, 3; /M: SY='K'; M= -7,-11,-26,-17, 0,-25,-21,-11,-20, 19,-17,-13, -9, -7, 6, 14, -6, -9,-14,-29,-19, 0; /M: SY='K'; M= -4,-13,-20,-18, -8,-21,-15,-19,-10, 11,-13, -9,-13,-16, -6, -3, -6, -4, -3,-28,-18, -7; /M: SY='K'; M= -9, -9,-27,-13, 2,-22,-21,-11,-20, 11,-21,-16, -8, 3, 4, 3, -3, -9,-16,-28,-18, 2; /M: SY='S'; M= 4, -4,-18, -5, 2,-23, -5,-11,-20, 6,-26,-16, 1,-11, 3, -5, 17, 3,-15,-29,-20, 3; /M: M= -7,-18, -9,-24,-17, -4,-18,-16, -9,-12, -6, -7,-14,-24,-13,-10, -6, -5,-10,-20, -9,-17; /M: SY='S'; M= -4,-10,-22,-13, -5,-10,-11,-11,-18, -6,-21,-14, -7, -5, -4,-13, 1, -7,-15,-24,-12, -4; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='R'; M= -3, -8,-17,-11, -5,-18, -6,-10,-16, 1,-15,-13, -4, -4, -2, 4, 4, 0,-14,-23,-16, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='Q'; M= -3, -2,-18, -2, 0,-18, 0, -5,-17, -2,-16,-10, -1,-11, 7, 0, 4, -5,-15,-19,-15, 1; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='S'; M= 0, -5,-14, -7, -4,-13, -2, -1,-12, -1,-15,-11, 0,-10, -1, 3, 6, -2,-10,-18,-10, -3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='N'; M= -5, 0,-10, -4, -4,-13, -9, -6, -9, -4,-11, -8, 7, -1, -3, -5, 4, 7, -8,-18,-11, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-4; /M: SY='S'; M= 5, -6, -9, -7, -6, -7, 6, -9,-13, -6,-17,-11, -3,-10, -6, -9, 11, -2,-11,-15,-10, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-4; /M: M=-13,-14,-22,-11,-14,-17,-20,-15, -4,-19, -3, -3,-17,-10,-12,-20,-13, -8, -5,-30,-17,-15; /M: SY='N'; M=-13, 13,-29, 7, 8,-29,-14, 5,-28, 2,-32,-19, 21, -8, 6, -3, 5, -1,-25,-35,-18, 6; /M: SY='S'; M= -2,-12,-19,-12, -6,-19,-14,-16, -6, -5,-14,-10,-10, -9, -3,-13, 3, -4, -3,-28,-18, -5; /M: SY='S'; M= 8,-11,-14,-11, -6,-20, -7,-17, -9, -3,-19,-12, -8,-13, -6,-13, 10, 0, -3,-30,-18, -4; /M: SY='T'; M= 1, -9,-11, -9,-10,-21,-13,-19,-13,-10,-14,-12, 0,-11,-10,-11, 12, 42, -4,-30,-21,-10; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='D'; M= -6, 8,-23, 9, 6,-24, -5, -8,-20, 5,-26,-17, 6,-13, 0, -6, 6, -4,-17,-30,-19, 4; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='G'; M= 2,-13,-19,-13,-17,-21, 22,-18,-17,-16,-21,-16,-13, -8,-16,-17, -3,-11,-10,-25,-21,-16; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='I'; M=-10,-29,-13,-30,-27, -4,-37,-27, 31,-24, 17, 8,-28,-28,-24,-20,-20, -9, 23,-22,-11,-26; /M: SY='E'; M=-11, 13,-36, 17, 18,-33,-15, -5,-29, 8,-31,-23, 6,-16, 7, 10, -1, -9,-27,-37,-23, 13; /M: SY='I'; M= -8,-26,-12,-26,-24, -5,-35,-25, 28,-23, 13, 11,-25,-25,-18,-25,-16, -4, 24,-22,-11,-22; /M: SY='Q'; M= -5, 4,-24, 8, 6,-27,-15, -8,-19, -3,-21,-13, -1,-15, 12, -4, 4, 2,-15,-32,-22, 6; /M: SY='D'; M=-13, 19,-33, 23, 19,-32,-13, -1,-29, 4,-33,-19, 15,-15, 16, -4, 5, -7,-26,-36,-23, 16; /M: SY='W'; M=-18,-32,-17,-38,-24, 4,-28,-10, -7,-25,-10,-11,-30,-32,-18,-24,-22,-21,-14, 43, 13,-24; /M: SY='K'; M=-10, -5,-26, -7, 3,-16,-20, -3,-20, 12,-21,-14, -4,-16, 4, 2, -2, -5,-15,-21, -3, 3; /M: SY='F'; M= -9,-23, -6,-28,-23, 7,-26,-18, 0,-22, 1, -2,-20,-22,-19,-22,-10, -9, -5,-16, -4,-23; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='D'; M=-11, 7,-26, 11, 9,-28,-12, -5,-23, -3,-25,-17, 1, 11, 8, -8, -2, -7,-19,-29,-20, 7; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: M= -3, -6,-15, -5, -8,-13, -1,-12, -7, -8,-11, -4, -6,-14, -6, -8, 0, -5, -6,-20,-14, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='K'; M= -3, -5,-18, -7, 1,-19,-12, -9,-15, 8,-17,-13, -4, 6, 1, 1, 2, -3,-11,-22,-15, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='D'; M= -5, 2,-18, 6, -4, -8, 2, -9,-16,-11,-19,-14, -4,-16, -8,-14, 0, -8,-15,-19,-10, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='G'; M= -6, 7,-23, 11, 1,-23, 13, -9,-24, -4,-25,-18, 0,-12, -2, -9, 0,-10,-19,-25,-19, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= 0, -1,-17, -3, 3,-19, 0, -7,-20, 9,-23,-16, 2, -9, 2, 3, 12, -2,-17,-22,-16, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='N'; M= -6, 3, -8, -1, -2,-15,-11, -6, -9, 2,-14,-10, 6,-11, -3, -5, 2, -3, -9,-20,-12, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='K'; M= -9, 1,-20, -7, 1,-18,-14, -5,-17, 17,-16,-10, 6,-11, 3, 10, -2, -5,-14,-21,-13, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='K'; M= -1, -7,-23,-11, -3,-23, 3,-11,-22, 11,-23,-15, -6,-12, 1, 4, -1, -9,-15,-25,-19, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='N'; M= -8, 5,-27, 3, 4,-31,-14, -9,-26, 2,-30,-23, 8, 6, 0, -4, 7, 0,-23,-36,-24, 2; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='R'; M= -5, -6,-16, -9, -6, -9, -4, -6,-14, -3,-14,-11, -1, -7, -5, 2, 0, -1,-13,-16, -9, -6; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='V'; M= -5,-28,-14,-28,-28,-10,-16,-28, 17,-24, 7, 4,-28,-24,-22,-27,-18, -8, 20,-26,-14,-24; /M: SY='T'; M= -6, -1,-26, 2, 8,-26,-13,-12,-20, 1,-21,-16, -2,-13, 0, -3, 1, 10,-14,-32,-21, 5; /M: SY='F'; M=-18,-33,-16,-38,-29, 34,-34,-18, 10,-29, 15, 10,-32,-36,-25,-26,-23,-16, 1, -3, 12,-29; /M: SY='S'; M= -3, -1,-17, -5, -4,-16,-10, 6,-16, -6,-23,-11, 11,-16, -1, -9, 18, 0,-17,-28,-12, -4; /M: SY='V'; M= -1,-29, -9,-29,-27, -8,-30,-28, 26,-22, 11, 8,-28,-22,-21,-26,-16, 0, 29,-26,-12,-22; /M: SY='W'; M=-27,-38,-19,-45,-28, 12,-31,-14,-13,-28,-15,-16,-36,-38,-21,-28,-28,-27,-22, 77, 26,-28; /M: SY='D'; M=-17, 32,-40, 49, 28,-37,-13, -7,-30, -4,-37,-27, 7,-17, 6,-14, 0,-10,-30,-44,-27, 18; /M: SY='F'; M=-17,-31,-11,-39,-31, 42,-32,-16, 7,-30, 5, 2,-31,-37,-29,-30,-20,-17, -3, 2, 18,-31; /M: SY='A'; M= 16,-11,-18,-11, -6,-25, 16,-16,-24, -8,-28,-19,-11,-14, -8, -7, 7, -7,-17,-30,-23, -7; /M: SY='G'; M= -2, -9,-29,-10,-19,-28, 48,-18,-35,-19,-35,-22, -6,-21,-17,-19, -1,-18,-27,-30,-28,-19; /M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -4, 5,-24,-20, 2,-25, 0,-20, -6, 0, -3, 22, 0, -5,-10,-19,-24,-13, 8; /M: SY='E'; M= -6, 3,-32, 8, 25,-30,-16, -3,-28, 5,-28,-18, -2, -3, 18, 2, 2, -8,-25,-31,-22, 22; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='V'; M= -4,-16,-16,-15, -9,-15,-23,-19, 6,-12, -4, -3,-16, -7,-10,-18, -6, -3, 8,-26,-14, -7; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-18,-24,-19,-27,-18, 26,-26, 17, -8,-19, -8, -4,-17,-28,-16,-18,-17,-18,-10, 10, 47,-18; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-13,-17,-21,-20,-11, 13,-24, 11,-13,-15,-15,-11, -9,-25,-13,-15,-10, -9,-13, -2, 29,-12; /M: SY='S'; M= 1,-10, 4,-11,-12,-22,-16,-11,-14,-12,-19,-17, -7, -9,-10,-18, 6, 6,-10,-30,-18,-12; /M: SY='T'; M= -2,-17, -2,-18,-17,-11,-23,-18, 0,-15, -6, -8,-10,-18,-15,-18, 2, 19, 3,-22, -9,-16; /M: SY='H'; M=-14, 3,-27, -1, 2,-14,-16, 41,-27, -7,-29,-18, 10,-19, 8, -5, 0,-12,-26,-22, 8, 1; /M: SY='Q'; M=-13, 1,-31, 1, 12,-29,-19, 16,-30, 1,-25,-11, 0, 1, 34, 1, -3,-12,-23,-26,-15, 16; /M: SY='F'; M=-16,-28,-12,-35,-26, 30,-30, -3, 0,-25, 0, 2,-25,-33,-22,-25,-19,-16, -4, 0, 24,-25; /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 53,-30,-12, 3,-29, 1, 1,-30,-38,-29,-30,-20,-18, -5, 6, 26,-29; /M: SY='L'; M=-11,-26,-16,-27,-23, 1,-22,-23, 5,-25, 12, 8,-28,-28,-18,-21,-18,-12, 0,-19, -8,-23; /M: SY='S'; M= 6, -4,-11, -6, -6,-20, -9,-14,-13, -6,-21,-14, 6,-12, -6,-11, 20, 19, -8,-31,-19, -6; /M: SY='E'; M= -5, 4,-28, 6, 12,-31,-15, -8,-26, 2,-29,-20, 2, 3, 6, -6, 3, -2,-21,-34,-23, 9; /M: SY='R'; M=-12, 5,-35, 2, 3,-30,-10, 3,-30, 8,-29,-23, 8,-19, 4, 21, -2, -9,-29,-34,-19, 1; /M: SY='A'; M= 19,-16, 2,-17,-12,-20, -8,-19,-10,-11,-19,-14,-14, -5,-11,-16, 12, 0, -6,-29,-20,-12; /M: SY='L'; M=-12,-33,-11,-33,-28, 1,-35,-27, 21,-26, 23, 12,-32,-27,-22,-24,-22, -3, 17,-20, -8,-26; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-21,-23,-15, 18,-25, 21,-14,-16,-16,-12, -8,-27,-14,-16,-11,-16,-15, 6, 47,-15; /M: SY='I'; M=-11,-32,-10,-32,-28, -4,-36,-29, 25,-26, 24, 12,-32,-26,-22,-24,-22, -3, 21,-23,-11,-26; /M: SY='V'; M= -1,-27,-11,-28,-26, -9,-29,-19, 22,-20, 7, 6,-26,-21,-17,-25,-18, -4, 27,-27, -8,-19; /M: SY='V'; M= -1,-30, -1,-30,-28,-10,-29,-29, 19,-21, 10, 6,-29,-21,-19,-26,-17, 1, 25,-27,-12,-22; /M: SY='Y'; M=-19,-33,-18,-38,-27, 27,-30, -9, -3,-26, -6, -6,-30,-34,-23,-27,-23,-19, -7, 30, 31,-26; /M: SY='N'; M=-16, 18,-31, 11, 3,-30,-14, -2,-24, 6,-32,-19, 25,-18, 1, 2, 1, -5,-22,-39,-21, 2; /M: SY='L'; M=-15,-33, -6,-35,-28, 2,-36,-27, 16,-27, 24, 13,-32,-29,-21,-23,-22, -5, 9,-18, -8,-28; /M: SY='S'; M= 9, -3, -5, -7, -6,-22, -7,-12,-17, -6,-25,-16, 7,-13, -6,-10, 21, 12,-14,-31,-20, -6; /M: SY='K'; M=-14, 1,-25, 2, -1,-24,-22,-15,-14, 4,-14,-11, -4,-18, -3, -6, -6, -4,-12,-34,-20, -3; /M: SY='P'; M= -9, -8,-28, -5, -5,-17, -2,-10,-26,-13,-28,-23,-12, 3,-11,-18, -6,-14,-21,-25, -9, -8; /M: SY='E'; M=-12, 9,-32, 13, 18,-28,-12, -6,-25, -2,-25,-17, 6,-15, 7, -7, 0, -4,-23,-33,-22, 13; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M= -3, -1,-19, 1, 10,-14,-11, -2,-16, 5,-18,-13, -2,-10, 3, 2, 1, -5,-15,-17, -6, 7; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= 0, -1,-22, 1, 16,-19,-13, 7,-18, -1,-21,-14, -2,-11, 7, -4, 2, -6,-16,-24,-10, 13; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='I'; M= -9,-16,-15,-22,-20, 3,-24,-16, 5,-18, -3, -1,-10,-24,-17,-21, -6, -2, 4,-20, -4,-18; /M: SY='Q'; M= 6, -4,-21, -2, 5,-27, -4, -9,-24, -2,-27,-16, -4, -5, 9, -3, 9, -5,-18,-30,-22, 5; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -1, -4,-22, -8, 4,-23,-14, -2,-21, 9,-19, -9, 1,-11, 17, 14, 1, -2,-15,-24,-17, 7; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='I'; M= -8,-32,-11,-32,-29, -4,-35,-29, 29,-25, 20, 16,-32,-26,-21,-27,-22, -6, 28,-24,-10,-25; /M: SY='E'; M=-11, -1,-28, 1, 9,-25,-16,-10,-18, -2,-18,-13, -3,-11, 3, -8, -4, -5,-16,-30,-20, 6; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-18,-26,-19, 23,-23, -2,-10,-19,-11,-10,-17,-20,-19,-21, -7, -9,-12, -1, 26,-19; /M: SY='W'; M=-28,-38,-20,-47,-29, 16,-30,-16,-18,-29,-18,-18,-37,-39,-21,-29,-28,-28,-27, 86, 25,-29; /M: SY='L'; M=-16,-37,-11,-37,-29, -2,-37,-29, 21,-27, 33, 22,-36,-28,-18,-22,-27, -8, 15,-22,-10,-27; /M: SY='H'; M=-13, -4,-26,-10, 0,-13,-20, 20,-19, -5,-19,-11, 3,-19, 7, -1, -4,-10,-18,-23, -3, 1; /M: SY='N'; M= -8, -5, -9,-13,-11, -9,-10, -7,-20, -9,-23,-15, 5,-22, -6, -9, 4, -6,-21,-22,-11,-10; /M: SY='I'; M=-10,-32,-10,-32,-30, -2,-38,-30, 35,-28, 22, 12,-32,-28,-26,-28,-22, -8, 28,-22,-10,-28; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, -7, 7,-26,-14, -1,-27, 20,-26,-14, 4,-15, 6, 9, -1, -7,-21,-29,-17, 6; /M: SY='S'; M= 15, -6,-12, -9, -5,-23, 2,-13,-19, -2,-27,-17, 0,-12, -5, -8, 18, 3,-13,-31,-21, -5; /M: SY='R'; M=-12,-10,-29,-19, -5,-16,-23, -4,-20, 11,-15,-13, -2,-20, 0, 22, -8, -6,-19,-23, -8, -5; /M: SY='A'; M= 17,-14, -9,-12,-12,-20, -6,-20, -4,-12,-16, -9,-15,-14,-11,-17, 5, 0, 3,-32,-19,-10; /M: SY='P'; M= -5,-10,-26,-11, -2,-32,-12,-16,-27, 1,-29,-24, -9, 32, -4,-10, 2, -2,-19,-35,-25, -3; /M: SY='N'; M=-12, 10,-27, 1, -3,-27, -8, 2,-24, -2,-32,-20, 22, -9, -3, -7, 4, -5,-21,-36,-18, -3; /M: SY='A'; M= 21,-12, -9,-12, -3,-13, -5,-14,-14, -7,-22,-13,-10,-13, -6,-11, 15, 0,-10,-26,-15, -4; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M= -7,-20,-24,-20,-13,-32,-21,-21,-18,-11,-21,-21,-18, 50,-11,-20, -8, 2, -8,-37,-25,-11; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='V'; M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24; /M: SY='I'; M=-10,-31, -4,-33,-30, 4,-36,-24, 24,-28, 14, 6,-30,-29,-26,-29,-21,-10, 19,-16, -1,-28; /M: SY='L'; M=-15,-35,-10,-35,-30, -1,-39,-30, 29,-29, 30, 15,-35,-29,-24,-25,-25, -9, 20,-21,-10,-29; /M: SY='V'; M= -2,-30,-10,-30,-30, -8,-32,-30, 32,-22, 12, 10,-30,-22,-22,-30,-20, -2, 38,-28,-10,-22; /M: SY='G'; M= 7,-12,-25,-12,-18,-28, 49,-20,-35,-18,-36,-26,-12,-18,-18,-18, 2,-16,-25,-30,-28,-18; /M: SY='T'; M= 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 10, 50, 0,-30,-20,-10; /M: SY='H'; M=-20, 2,-30, -8, 0,-12,-19, 74,-30, -9,-31,-20, 14,-20, 9, 0, -8,-18,-30,-22, 17, 0; /M: SY='L'; M= 0,-30, -7,-30,-22, -7,-26,-26, 12,-22, 15, 7,-29,-23,-17,-18,-12, -6, 8,-24,-14,-22; /M: SY='D'; M=-18, 35,-37, 53, 17,-38,-11,-11,-28,-10,-37,-28, 9,-19, -1,-19, 1, -4,-27,-48,-29, 8; /M: M= -5, -8,-19, -3, -4,-19,-21,-17, -3,-12, -7, -5,-12,-18, -4,-16, -4, -1, -1,-30,-18, -4; /M: SY='I'; M= -6,-25, 3,-29,-25, 3,-27,-19, 7,-22, 1, 2,-22,-27,-19,-26, -9, -7, 5,-16, -2,-23; /M: SY='N'; M= -7, 1,-23, -1, 0,-24,-10,-10,-19, -8,-20,-14, 6,-12, -4,-10, 2, -1,-17,-33,-21, -2; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='S'; M= 1, -9,-18, -9, 1,-13,-13, -9,-13, -3,-17,-10, -8, -6, 2, -6, 3, -4,-10,-22,-12, 2; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -7, 1,-22,-17, -4,-22, 5,-23,-17, 5, 4, -1, 1, -1, 0,-17,-26,-12, 0; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -9, 4,-25, 5, 16,-15,-14, 3,-20, 8,-20,-13, -1,-11, 10, 0, -2, -9,-18,-19, -9, 14; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='Y'; M=-12,-11,-20,-17,-10, 1,-21, -3, -8, -8, -8, -5, -4,-22, -5, -3, -7, -9,-11,-13, 2, -9; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: M= -5,-15,-19,-14, -9,-16, -4,-18, -5, -9, -7, -6,-16,-17, -9,-14,-10, -8, -1,-24,-15, -8; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='S'; M= -3, -3,-19, -1, 1,-17,-13, -7,-12, -6,-19,-13, -2, -6, -3,-12, 2, -3, -9,-24, -9, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='K'; M= -6, -1,-16, 0, 0,-25, -9,-12,-20, 3,-23,-18, -4, -6, -3, -5, 0, -7,-16,-29,-20, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='V'; M=-10,-18, -9,-18,-16,-12,-29,-18, 5,-13, 0, -1,-20,-22,-10,-18,-13, -5, 6,-23, -9,-14; /M: M= -8, -4,-19, -6,-11,-12,-20,-14, -3,-16,-10, -7, -2,-23,-12,-16, -4, -6, -6,-28,-14,-13; /M: SY='E'; M= -7, 9,-30, 15, 19,-30,-16, -7,-25, 6,-27,-17, 1,-12, 12, -3, 2, 0,-20,-34,-22, 15; /M: SY='I'; M= -2,-24, -3,-24,-19, -9,-28,-24, 16,-21, 5, 4,-23,-24,-18,-23,-10, -6, 12,-23,-14,-19; /M: SY='M'; M= -9,-18,-18,-18,-12,-12,-26,-11, -3,-15, 5, 10,-16,-22, -3, -9,-12, -2, -3,-25,-13,-13; /M: SY='E'; M= -7, -7,-26, -6, 13,-23,-21, -8,-18, 6,-14, -9, -8,-15, 12, 3, -2, -8,-17,-27,-18, 11; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-25, -3, 4,-17,-18, 0,-21, 4,-22,-12, 5,-17, 8, -3, 2, -7,-19,-23, -6, 4; /M: SY='I'; M= -9,-20,-18,-21,-12,-13,-30,-21, 8, -6, 3, 0,-19,-21,-11,-10,-13, -3, 8,-26,-14,-12; /M: SY='V'; M= -4,-27,-12,-28,-21, -3,-27,-13, 9,-20, 7, 6,-24,-23,-16,-19,-15, -4, 10,-18, 1,-20; /M: SY='R'; M= -4, -5,-25,-12, 1,-25,-16, -6,-23, 15,-21,-15, 2,-15, 8, 18, 4, -5,-20,-29,-19, 2; /M: SY='Q'; M= -8, -7,-25,-12, 2,-23,-21, -8,-18, 9,-14, -8, -3,-16, 10, 10, -4, -3,-15,-28,-18, 3; /M: SY='R'; M=-11,-12,-21,-18, -5,-12,-22, -3,-19, 1,-15,-14, -4,-22, -3, 12, -7, -9,-20,-20, -5, -6; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='F'; M=-12,-15,-17,-20,-11, 18,-19, -1, -8, -7, -7, -4,-13,-20, -7, -6,-10,-12,-10, 0, 15,-10; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: M= -5, -8,-16, -8, -3,-12, -8, -4, -9, -4, -9, -3, -6,-12, -2, -7, -3, -3, -6,-19, -9, -3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='H'; M= -8, -1,-24, -7, -3,-19, 3, 9,-25, 3,-25,-18, 5,-14, 0, 6, -2,-11,-22,-22,-10, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M=-20,-25,-20,-29,-24, 37,-30, -9, -1,-27, 1, -1,-26,-35,-24,-26,-20,-17, -9, 1, 24,-25; /M: SY='P'; M=-10, -8,-27, -6, 2,-30,-19,-12,-23, -5,-21,-17, -9, 20, 4, -8, -3, -4,-18,-33,-24, 1; /M: SY='N'; M=-12, -3,-26, -8, -6,-18,-20, 2,-16, -2,-18, -8, 7,-20, -2, 2, -4, 1,-13,-27, -8, -6; /M: SY='I'; M=-11,-23,-14,-22,-23, -3,-33,-26, 22,-25, 12, 5,-25,-27,-22,-26,-17, -4, 17,-23,-10,-23; /M: SY='K'; M= -8, -6,-25,-12, -4,-22,-13, -1,-20, 6,-19,-13, 1,-16, 3, 6, -1, -4,-15,-28,-15, -2; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='B'; M=-14, 2,-23, 0, -1, -9,-17, -6,-12, -7,-12, -9, 2,-19, -4, -4, -6, -7,-15,-22, -9, -3; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='K'; M= -7, -4,-13, -9, -3,-11,-13, -1, -7, 6, -8, -5, -1,-10, -1, 0, -5, -5, -5,-16, -6, -2; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='H'; M= -3,-14,-14,-16,-11, -3,-11, 3, -8,-13,-12, -9,-11, -9,-10,-12, -6, -5, -7,-14, 2,-11; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='I'; M= -5,-29,-11,-30,-26, -2,-31,-20, 21,-23, 12, 7,-28,-25,-20,-24,-18, -7, 21,-22, -6,-23; /M: SY='I'; M=-13,-23,-15,-26,-21, -3,-31,-15, 11,-19, 10, 4,-19,-26,-16,-18,-15, -8, 6,-21, -7,-20; /M: M= -9, -7,-23, -4, -7,-17,-14,-17,-11,-14,-14,-13,-12, -8,-10,-19, -4, -8,-11,-30,-17, -9; /M: SY='V'; M= 3,-22,-10,-24,-22,-12,-24,-24, 15,-18, 2, 3,-19,-19,-17,-22,-10, 2, 20,-29,-14,-18; /M: SY='S'; M= 4, -7, -5, -9, -9,-20, -3,-14,-17, -9,-21,-16, 1,-15, -8,-13, 18, 6,-15,-29,-20, -9; /M: SY='C'; M= 3,-14, 36,-22,-20,-22,-19,-19,-15,-12,-19,-18, -9,-21,-15,-21, 4, 0,-13,-26,-20,-20; /M: SY='T'; M= 2, -7,-18, -8, 0,-25,-13,-13,-20, 4,-22,-17, -1, -2, -1, -1, 12, 13,-14,-31,-21, -1; /M: SY='S'; M= -2, 5,-20, 8, 2,-26, -4,-12,-22, -6,-27,-20, 8,-13, -3,-11, 16, 14,-18,-34,-23, 0; /M: SY='G'; M= 1,-16,-10,-18,-17,-23, 8,-19,-21,-14,-19,-17,-14,-12,-14,-13, 1, -9,-17,-28,-23,-17; /M: SY='K'; M=-13, 1,-30, -1, 3,-23,-21, -7,-18, 11,-22,-16, 0,-18, 0, 6, -5, -9,-15,-29,-13, 2; /M: SY='G'; M= -6, 8,-30, 9, -5,-30, 22, -5,-33,-13,-38,-26, 6,-19, -9,-15, 1,-13,-28,-36,-24, -7; /M: SY='I'; M=-11,-30,-14,-30,-25, 0,-35,-24, 22,-24, 18, 20,-28,-28,-15,-24,-20, -9, 19,-20, -8,-23; /M: SY='K'; M= -8, 7,-31, 6, 10,-31,-16, -8,-27, 18,-29,-21, 4,-14, 5, 11, 0, -5,-22,-35,-22, 7; /M: SY='K'; M= -4, -7,-22,-12, -1,-23,-14,-13,-17, 10,-18,-13, -4,-15, -1, 2, 0, -1,-11,-30,-19, -1; /M: SY='L'; M=-20,-39,-11,-40,-30, 4,-39,-29, 19,-30, 37, 19,-39,-31,-21,-21,-29,-11, 9,-18, -7,-30; /M: SY='R'; M=-11,-11,-32,-19, -1,-26,-23, -6,-23, 20,-14,-13, -6,-18, 9, 35,-10,-10,-21,-28,-19, 0; /M: SY='N'; M=-15, 12,-32, 7, 8,-28,-16, 0,-26, 8,-27,-11, 18,-17, 12, 5, 0, -7,-23,-34,-20, 8; /M: SY='E'; M=-13, -5,-26, -5, 4,-20,-23, 1,-17, 0,-13,-11, -6,-17, 2, 0, -7, -2,-16,-28,-13, 2; /M: SY='I'; M=-15,-35,-10,-35,-30, 0,-40,-30, 30,-30, 30, 15,-35,-30,-25,-25,-25,-10, 20,-20,-10,-30; /M: M= -7,-17,-19,-18, -6, -7,-26,-13, 0, -6, -5, -3,-18,-21, -5,-11,-10,-10, 0,-19, -6, -6; /M: SY='Q'; M= -8, 4,-29, 0, 11,-26,-16, 9,-28, 12,-28,-17, 6,-14, 16, 8, 2, -9,-24,-29,-15, 11; /M: SY='V'; M= -6,-20, -6,-20,-13,-13,-29,-22, 6,-17, 3, 3,-19,-21,-12,-20,-10, 5, 7,-25,-15,-13; /M: SY='A'; M= 5,-20,-15,-22,-15,-16,-15,-19, -1,-10, -6, -6,-16,-19,-11, -4, -4, -1, 2,-28,-17,-14; /M: M= -5,-15,-12,-16, -3,-17,-22,-16,-12, -4,-11, -9,-14,-18, -2,-10, -3, -2,-10,-17,-15, -3; /M: SY='N'; M= -9, 9,-27, 2, 9,-27,-14, 6,-27, 9,-30,-17, 20,-14, 10, 2, 6, -1,-23,-31,-17, 9; /M: SY='Q'; M=-10,-13,-22,-15, -6,-11,-25,-10, -3, -9, -5, 2, -8,-21, 4, -7, -7, -7, -3,-23,-12, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51417; PS51418; PS51419; PS51420; PS51421; PS51422; PS51423 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of true positive hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 86.96 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
20 sequences
DAPK1_HUMAN (P53355), DAPK1_MOUSE (Q80YE7), DAPK_CAEEL (O44997), GBPC_DICDI (Q8MVR1), LRK1_CAEEL (Q9TZM3), LRRK1_HUMAN (Q38SD2), LRRK1_MOUSE (Q3UHC2), LRRK2_HUMAN (Q5S007), LRRK2_MOUSE (Q5S006), MFHA1_HUMAN (Q9Y4C4), MFHA1_MOUSE (Q3V1N1), MFHA1_XENTR (A4IIK1), PATS1_DICDI (Q55E58), QKGA_DICDI (Q8SSS9), ROC10_DICDI (Q6XHA6), ROC11_DICDI (Q6XHA5), ROCO4_DICDI (Q6XHB2), ROCO5_DICDI (Q1ZXD6), ROCO6_DICDI (Q54WS5), ROCO8_DICDI (Q54M77)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
EHD1_ARATH (Q94CF0), EHD2_ARATH (B3LF48), TRN1_ARATH (Q9FJ57) |
| PDB [Detailed view] |
37 PDB
2ZEJ; 3D6T; 6OJE; 6OJF; 6VNO; 6VP6; 6VP7; 6XAF; 6XR4; 7LHT; 7LHW; 7LI3; 7LI4; 7THY; 7THZ; 8E04; 8E05; 8E06; 8FAC; 8FO2; 8FO7; 8FO8; 8FO9; 8SMC; 8TXZ; 8TYQ; 8TZB; 8TZC; 8TZE; 8TZF; 8TZG; 8TZH; 8U1B; 8U7H; 8U7L; 8U8A; 8U8B » more |