Entry: PS51424

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ROC
Accession [info] PS51424
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2008 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51417
Associated ProRule [info] PRU00758

Name and characterization of the entry

Description [info] Roc domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=190;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=185;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5125285; R2=0.0102946; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=351.60674; R2=43.40449; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; N_SCORE=18.5; H_SCORE=67759; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=485; N_SCORE=6.5; H_SCORE=21359; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-27,  5, 12,-29,  3, -8,-28,  5,-23,-14,  1,-11,  6, -1,  1, -7,-23,-25,-18,  9;
/M: SY='A'; M=  8, -6,-14, -8, -1,-20,-10,-15,-13, -6,-16,-11, -4, -5, -5,-10,  8,  4, -6,-29,-18, -4;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-20, -3,  3,-16,-18,-12,-11,  1,-12, -8, -4,-15, -2,  1,  1,  1, -3,-28,-13,  0;
/M: SY='P'; M= -7,-13,-25,-11, -2,-16,-22,-13, -7, -6,-12, -7,-12, 12, -7, -8, -5,  0, -5,-26,-13, -6;
/M:         M= -9,-14, -4,-16,-15, -4,-21,-13, -5,-16, -2, -4,-12,-17,-14,-14, -8, -1, -3,-19, -3,-15;
/M: SY='H'; M= -5, -2,-19, -6, -5,-13,-15,  3,-15, -5,-17,-10,  3, -3, -3, -6, -2, -4,-16,-22, -2, -6;
/M: SY='R'; M=-14, -1,-22,  1, 14,-23,-19,  4,-28, 15,-19,-13,  1,-15,  9, 29, -5, -9,-22,-27,-12,  9;
/M: SY='L'; M=  4,-19,-17,-25,-18, -4,-19,-17,  9,-16, 12, 12,-18,-21,-13,-13, -9, -1, 11,-22, -8,-16;
/M: SY='K'; M=-11,  0,-30, -1,  9,-29,-20, -8,-30, 47,-29,-10,  1,-11, 10, 34,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-13,-30,-23,  4,-27,-22, 20,-25, 28, 17,-26,-27,-21,-20,-20, -6, 18,-23, -4,-23;
/M: SY='M'; M= -6,-25,-18,-30,-23,  0,-27,-15, 24,-20, 20, 28,-23,-22,-15,-18,-18, -7, 21,-23, -3,-20;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-19,-33,-26, 11,-31,-23, 27,-26, 27, 18,-27,-27,-23,-21,-21, -7, 24,-20,  0,-25;
/M: SY='V'; M= -6,-30,-16,-31,-26,  7,-31,-25, 26,-25, 28, 16,-29,-29,-25,-21,-20, -6, 29,-24, -4,-25;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M= -8,  8,-26, 11, 17,-25,-16, -2,-20,  1,-17,-13,  4, -6, 11, -3,  1, -4,-20,-29,-14, 14;
/M: SY='E'; M= -4, -5,-24, -4,  1,-20,  0,-11,-22, -1,-19,-13, -3, -7, -3, -5,  1, -2,-17,-23,-12, -2;
/M: SY='G'; M= -5, -4,-24, -6, -4,-19, 14, -9,-24, -6,-17, -8,  0,-17, -7, -4, -3,-11,-19,-23,-17, -5;
/M: SY='A'; M= 23,-14, -9,-20,-14,-14,-10,-21, -1,-13, -7, -5,-12,-16,-13,-17,  7,  5, 10,-25,-15,-14;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 31,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='T'; M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,  2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='S'; M=  4, -2,  1, -6, -6,-17, -9,-13,-16,-11,-21,-15,  4,-15, -4,-11, 24, 19, -7,-37,-18, -5;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21, 10,-30,-20, 21,-29, 45, 20,-29,-29,-20,-20,-28, -9, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='V'; M= -1,-24, -3,-27,-21, -4,-26,-23, 11,-17, 12,  6,-22,-26,-19,-15,-14, -6, 16,-24, -9,-21;
/M: SY='R'; M=-10,  4,-27,  2,  4,-23,-14,  9,-24, 14,-21, -9,  7,-16, 10, 15, -5, -9,-21,-22, -6,  6;
/M: SY='A'; M=  7,-10,  0,-15, -8,-18,-14,-15,-15, -4,-14, -9, -7,-17, -3, -2,  3,  2, -8,-24,-15, -6;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-21,  9,-30,-19, 22,-28, 42, 23,-27,-28,-18,-20,-27,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-10,-10,-21,-14, -6,-15,-22, -9, -7,  6, -5,  5, -7,-17,  3,  9, -8, -2, -5,-23, -8, -3;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-27,  0, -1,-23,  4, -6,-25,  4,-19,-11,  4,-17, -1,  5, -3, -8,-21,-23,-13, -2;
/M: SY='G'; M= -3,  2,-26,  3,  5,-25, 12,-10,-26, -5,-20,-15,  4,-11, -3, -9,  2, -9,-22,-27,-20,  1;
/M: SY='K'; M= -8, -1,-27,  0,  7,-25,-15, -6,-21, 13,-21,-11,  0, -3,  6, 10, -3, -5,-17,-26,-14,  5;
/M: SY='S'; M=  0,-11,-19,-14,-11, -3, -9,-12,-12, -9,-15,-10, -6,-11,-12,-11,  3,  0, -7,-16, -4,-11;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-21,  2,  4,-20,-17, -2,-18,  3,-18,-11,  2,-10,  3,  2,  0, -2,-13,-29,-12,  3;
/M: SY='L'; M= -5,-11,-22,-10, -4,-11,-16,-14, -6, -8,  2, -2,-10,-12, -7, -8, -7, -3, -5,-25,-11, -6;
/M: SY='T'; M= -3,  2,-18, -1,  0,-15,-13, -9,-15, -3,-14,-11,  2,-12, -4, -4,  4,  7,-10,-28,-12, -3;
/I:         I=-1; MD=-6;
/M: SY='K'; M= -3,  1,-17,  2,  4,-17, -9, -6,-15,  5,-15, -9,  0, -1,  2,  2,  2,  0,-11,-19,-10,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-18, -2,  5,-12,-11, -6, -7, -3, -7, -4, -5, -4,  0, -6, -4, -6, -7,-18, -8,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -6,  6,-24,  7, 20,-23,-16, -4,-20,  2,-16,-12,  3, -7,  7, -1,  2, -1,-18,-30,-16, 13;
/M: SY='D'; M= -4,  4,-24,  7,  6,-24,-14, -7,-16, -2,-19,-12,  1, -1,  1, -8,  3, -2,-13,-31,-16,  3;
/M: SY='R'; M= -4, -8,-23,-10, -2,-19,-14,-10,-16,  6,-17, -9, -2,-11,  2, 16,  4,  2,-10,-26,-13, -2;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-11, -9, -9,-10,-19,-18,-10,-10,-11,-10,  0,-11, -9,-10, 20, 45,  0,-30,-10, -9;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='H'; M=-12,  3,-27,  5,  6,-21,-18, 25,-17, -2,-16, -6,  3,-14,  5, -2, -5,-11,-16,-26, -1,  3; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G'; M= -2,-13,-11,-14,-21,-23, 41,-21,-30,-20,-24,-17, -6,-20,-21,-21, -3,-16,-20,-20,-25,-21; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-21,-34,-28,  1,-34,-27, 37,-25, 19, 17,-24,-24,-22,-24,-16, -5, 33,-24, -4,-28;
/M: SY='D'; M=-11, 22,-27, 29, 27,-29,-13,  0,-28,  5,-23,-20, 12, -9,  9, -1,  1, -7,-26,-31,-17, 17;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-22,-32,-26, -2,-34,-26, 34,-23, 15, 14,-21,-23,-19,-22,-14, -3, 29,-23, -4,-25;
/M: SY='T'; M= -2,  0,-21, -2, -3,-20,-11, -6,-14, -1,-16, -9,  1,-14, -2, -3,  3,  5, -9,-27,-11, -4;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-24,  6,  9,-24,-17, -7,-18,  0,-17,-12,  1, -2,  7, -3,  4,  5,-16,-30,-15,  7;
/M: SY='W'; M=-16,-32,-39,-34,-26, 12,-23,-21, -7,-19, -8, -9,-31,-28,-18,-18,-29,-19,-15, 87, 27,-19;
/M: SY='K'; M= -6,  2,-21,  0,  3,-22,-17, -2,-18,  6,-18,-10,  3,-12,  3,  3,  0,  1,-14,-26,-10,  2;
/M: SY='F'; M= -5,-16,-12,-18,-14,  4,-22,-18, -1,-17,  1, -2,-15,-12,-18,-16,-10, -5,  1,-21, -5,-16;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='E'; M= -8,  8,-25, 13, 14,-26,-13, -4,-23,  2,-22,-15,  4,  2,  7, -3,  2, -2,-21,-29,-16,  9; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M:         M= -1, -8,-17,-10, -6,-13,-15,-11, -3, -3, -4, -1, -7,-10, -4, -4, -5, -2, -1,-20, -9, -6; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='P'; M= -5, -1,-21,  1,  2,-18, -3, -8,-16, -1,-17,-11, -1, 10, -3, -3, -1, -5,-15,-20,-15, -2; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='D'; M= -6,  6,-17,  8,  2,-13,-10, -4,-13,  1,-13,-10,  4, -7, -1,  0, -1, -2,-11,-18, -8,  0; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='G'; M= -4,  0,-14,  1,  2,-16,  3, -6,-17,  1,-14, -9,  1, -6,  1,  0,  1, -3,-13,-16,-11,  1; D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='D'; M= -9,  8,-24, 10,  8,-25, -6,  1,-25,  8,-22,-13,  6, -7,  6,  6,  0, -5,-20,-25,-13,  6; D=0;
/I:         I=0; DM=-2;
/M: SY='D'; M= -9, 15,-23, 16, 10,-24, -9,  0,-24,  3,-23,-17, 14, -6,  2,  0,  4, -1,-21,-31,-16,  5; D=0;
/I:         I=0; DM=-2;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-32,-25,  7,-32,-24, 26,-24, 15, 11,-23,-19,-23,-22,-16, -6, 23,-19,  0,-26; D=0;
/I:         I=0; DM=-2;
/M: SY='R'; M= -7, -2,-22, -4,  3,-18,-18,-10,-14,  6,-13, -6, -1,-14,  2,  9,  1,  7, -9,-26,-12,  1;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-20,-33,-26, 34,-31,-18, 14,-26, 21, 10,-24,-29,-27,-20,-21, -8, 12, -6, 16,-26;
/M: SY='N'; M= -7,  6,-22,  3,  7,-19,-12,  4,-17,  0,-18,-11, 13,-15,  5,  4,  6, -1,-18,-31,-12,  5;
/M: SY='V'; M= -3,-24,-17,-29,-24,  2,-27,-25, 22,-22, 13, 11,-21,-23,-21,-20,-10,  2, 25,-23, -5,-24;
/M: SY='W'; M=-20,-31,-40,-32,-26, 16,-23,-12,-13,-17,-13,-13,-31,-30,-17,-17,-32,-22,-22,100, 43,-20;
/M: SY='D'; M=-20, 49,-30, 69, 21,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 19,-10,  1,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 11;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-15,-38,-29, 66,-30,-20,  2,-29, 10,  2,-20,-29,-37,-20,-19, -8,  2,  3, 23,-29;
/M: SY='G'; M= 11, -9,-24,-11,-14,-27, 45,-18,-31,-15,-25,-18, -2,-17,-15,-17,  5,-12,-22,-22,-26,-14;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-30,-10,-20,-29, 67,-19,-38,-19,-29,-18,  1,-20,-19,-19,  0,-19,-29,-20,-29,-19;
/M: SY='Q'; M=-12,  2,-30,  2, 11,-32,-17, 30,-23,  2,-20, -2,  4,-10, 34,  5, -3,-12,-28,-24, -4, 21;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-27, 15, 27,-31,-15, -1,-27,  7,-22,-16,  3, -3, 17,  2,  2, -6,-25,-29,-17, 21;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='I'; M= -4,-17,-20,-20,-12, -6,-26,-18, 17,-17,  5,  6,-15,-19,-13,-18, -6,  0, 17,-25, -6,-15; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-21,-20, 29,-28, 15,  1,-11,  3,  4,-19,-28,-11,-10,-19, -9, -7, 23, 67,-19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='H'; M=-16, -7,-28, -8, -7,  0,-22, 42,-17, -7,-10, -2, -2,-23,  0,  1,-12,-12,-19, -9, 29, -7;
/M: SY='A'; M=  5,-11,-20,-13,-12,-10, -8,-11, -6,-15, -4, -4, -9,-11,-11,-16, -2, -2, -4,-22, -8,-12;
/M: SY='T'; M=  2, -6, -9,-14,-12, -9,-19,-20, -5,-12, -9, -7, -4,-13,-11,-13, 14, 34,  3,-26, -9,-12;
/M: SY='H'; M=-18,  0,-29, -1, -1,-18,-19, 82,-27, -9,-19, -1,  9,-20,  9, -1, -8,-17,-27,-27, 18,  0;
/M: SY='Q'; M=-11, -3,-30, -2, 14,-34,-20, 10,-22,  9,-21, -4, -1, -1, 41, 12, -2, -9,-28,-22,-11, 26;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-10,-34,-27, 47,-29,-15,  2,-26, 10,  3,-21,-30,-31,-19,-19, -9,  3,  0, 21,-26;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 76,-30,-20,  1,-30, 12,  2,-20,-30,-39,-20,-20,-10,  1,  8, 28,-29;
/M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-31,-22, 22,-29,-19, 16,-27, 34, 17,-26,-26,-22,-20,-25,-10,  8,-14,  5,-22;
/M: SY='T'; M=  5, -1,-11, -6, -6,-15,-12,-16,-14, -9,-18,-14,  3,-11, -6, -9, 26, 33, -3,-33,-14, -6;
/M: SY='K'; M= -6,  0,-28,  2,  9,-26,-15, -4,-24, 10,-25,-14,  1,  9,  6,  5,  0, -5,-22,-27,-15,  6;
/M: SY='R'; M=-12,  0,-27,  1,  1,-24, -8,  0,-27, 12,-22,-12,  5,-15,  7, 27, -3, -8,-22,-24,-13,  2;
/M: SY='A'; M= 23, -6, -9,-12, -8,-20,  2,-16,-15,-11,-18,-14, -1,-12, -8,-14, 18,  8, -6,-28,-20, -8;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-31,-23, 10,-30,-22, 22,-27, 37, 17,-28,-29,-22,-21,-24, -8, 18,-20, -1,-23;
/M: SY='Y'; M=-17,-14,-28,-16,-17, 19,-26, 21, -2,-11, -3,  0,-11,-27, -8, -9,-15,-10, -9, 12, 55,-16;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-21,-31,-22,  5,-31,-23, 25,-27, 34, 17,-25,-26,-20,-21,-22, -5, 17,-21, -2,-22;
/M: SY='L'; M= -6,-29,-18,-30,-22,  6,-29,-22, 22,-27, 37, 17,-29,-29,-22,-20,-23, -7, 20,-22, -3,-22;
/M: SY='V'; M= -2,-21, -8,-25,-24, -3,-27,-24, 19,-20,  9,  7,-18,-25,-22,-19, -8,  4, 27,-29, -9,-23;
/M: SY='W'; M= -8,-29,-23,-32,-27, 15,-26,-21,  7,-20,  4,  2,-28,-28,-23,-19,-20,-10, 10, 25, 14,-24;
/M: SY='B'; M=-13, 36,-24, 34,  9,-28, -7,  3,-28,  5,-29,-22, 35,-15,  1,  1,  5, -3,-28,-37,-19,  5;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-17,-25,-18, -1,-20,-20, 11,-24, 23, 10,-21,-19,-17,-19,-16, -5,  6,-23, -7,-19;
/M: SY='R'; M= -3, -4,-21, -5,  4,-19,-15, -5,-20,  5,-18,-12,  0, -7,  3, 11,  4,  1,-16,-25,-11,  1;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-23,  3,  5,-22,-11, -7,-21,  5,-16,-11,  1,-13,  3,  4,  1,  2,-16,-27,-13,  4;
/M: SY='Y'; M=-12, -7,-28, -5, -5, -1, -5,  0,-18, -7,-14,-11, -7,-15, -8, -9, -8,-10,-18, -4, 18, -8;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='D'; M=-10,  8,-23, 10, 10,-23,-13,  0,-22,  4,-19,-13,  7,-10,  3,  4, -1, -6,-19,-29,-13,  6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E'; M= -3,  9,-23, 12, 17,-26,-13, -5,-25,  5,-23,-17,  6, -5,  8, -1,  7,  0,-21,-30,-17, 12;
/M: SY='E'; M= -3, 10,-21, 13, 16,-26, -4,  3,-27, -3,-24,-18,  7,-11,  4, -7,  8, -4,-23,-31,-15,  9;
/M: SY='F'; M= -5,-14,-19,-18,-11,  6,-20,-14, -8, -5, -4, -4,-10,-19,-12,  1, -7, -3, -4,-16, -1,-11;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -1, -5,-16, -6,  1, -3, -7, -5,-13, -7,-11, -8, -4, -7, -3, -8,  1, -3,-11,-13, -3, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='Y'; M= -4,  0,-13,  0,  1, -6, -9,  0, -7, -3, -8, -5,  0, -5,  1, -4,  0,  0, -8, -8,  2,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='N'; M= -1,  3,-15,  2,  2,-15, -9,  0,-16,  2,-14,-10,  4, -9,  1,  3,  1, -1,-13,-19, -7,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='V'; M= -4,-27,-10,-29,-24,  2,-28,-24, 25,-22, 21, 13,-26,-26,-23,-20,-16, -4, 29,-24, -6,-24; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='G'; M= -8,  0,-29,  3,  4,-23, 11, -7,-28, -2,-21,-15,  1,-12, -2, -4, -4,-11,-24,-21,-13,  0;
/M: SY='Y'; M=-13,-13,-23,-14,-11, 11,-22,  2, -9, -9, -9, -6,-10,-18, -9, -8, -8, -3,-10, -1, 25,-11;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-39,-30, 12,-21,-28,-18,-20,-17,-18,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-28,140, 31,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22,  9,-30,-20, 22,-28, 40, 19,-28,-28,-20,-20,-26, -8, 14,-19,  1,-21;
/M: SY='D'; M=-10,  8,-24,  9,  6,-21,-15,  6,-20,  0,-16,-11,  6,-15,  2,  0, -1, -2,-16,-29,-10,  3;
/M: SY='N'; M= -2,  0,-13, -7, -8,-13,-11, -6, -8,-11,-11, -7,  8,-18, -5,-10,  8,  7, -7,-31,-12, -7;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-35,-28,  2,-35,-27, 39,-27, 22, 19,-24,-24,-22,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28;
/M: SY='Q'; M= -5,  4,-24,  0,  8,-22,-14,  0,-19,  7,-19,-10,  7,-13,  9,  7,  2, -1,-17,-26,-11,  7;
/M: SY='A'; M= 23, -6, -9,-13, -8,-16, -6,-13,-11, -9,-12, -9, -3,-14, -7,-14, 12,  5, -4,-26,-15, -8;
/M: SY='R'; M=-17,-10,-28,-11, -4, -7,-22, 12,-21, 13,-13, -5, -3,-20,  2, 30,-12,-10,-17,-16,  5, -4;
/M: SY='A'; M= 11,-14,-12,-17,-15,-14, -4,-21, -2,-15, -8, -5,-12,-19,-16,-18,  3,  1, 10,-27,-17,-16;
/M: SY='P'; M= -7,-11,-32, -7, -3,-23, -3,-16,-22, -7,-23,-16,-10, 31, -8,-11, -6,-10,-23,-25,-22, -8;
/M: SY='N'; M=-10, 17,-25, 14,  0,-25,  4,  1,-26,  1,-26,-17, 21,-17, -1,  0,  2, -7,-24,-30,-16, -1;
/M: SY='A'; M= 20, -6,-15, -9, -3,-22, -5,-10,-17, -8,-21,-14, -3,  1, -3,-12, 15,  4,-11,-29,-19, -4;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='P'; M= -1,-15,-21,-14, -9,-20,-20,-19, -7,-11,-16,-10,-14, 28,-12,-17, -4, -2, -6,-30,-20,-13;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V'; M= -2,-29,-16,-32,-29,  0,-32,-29, 33,-23, 15, 13,-27,-27,-26,-23,-13, -3, 40,-26, -7,-29;
/M: SY='I'; M= -9,-24,-13,-30,-22,  3,-31,-20, 20,-24, 17, 11,-19,-24,-18,-20,-16, -5, 13,-21,  0,-22;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-32,-25,  1,-33,-26, 31,-26, 22, 15,-24,-19,-21,-24,-18, -7, 25,-23, -4,-25;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-14,-32,-30,  1,-31,-30, 33,-22, 12, 11,-27,-28,-28,-22,-12, -2, 44,-27, -8,-30;
/M: SY='G'; M=  2,-11,-21,-13,-17,-24, 39,-18,-26,-17,-19,-11, -4,-20,-16,-17, -2,-14,-19,-22,-24,-17;
/M: SY='T'; M= -1,  6,-12, -5, -7,-13,-16,-13,-13, -7,-15,-12,  9,-12, -7, -8, 19, 38, -6,-32,-12, -7;
/M: SY='H'; M=-16, -1,-30, -1,  5,-20,-20, 54,-27,  7,-21, -4,  6,-17,  9,  9,-10,-16,-25,-25,  9,  4;
/M: SY='I'; M= -2,-18,-16,-22,-14, -6,-23,-19,  7,-11,  6,  5,-15,-20,-13,-12,-10, -4,  7,-23, -7,-15;
/M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 62, 19,-39, -9,  2,-38,  0,-29,-27, 19,-10,  3, -9,  0,-10,-30,-38,-19, 11;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-25, -4,  7,-17,-19, -6,-13,  2, -5, -2, -7,-12,  4,  4, -7, -6,-12,-24,-10,  5;
/M: SY='C'; M= -8,-19, 10,-25,-21,  1,-22,-19, -2,-19,  0, -1,-14,-27,-19,-14,-11, -7,  3,-25, -8,-20;
/M: SY='P'; M= -6,  2,-25,  4,  4,-23,-11, -6,-22,  0,-23,-15,  3,  6,  1, -4,  5,  1,-20,-30,-16,  2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -1,  1,-20,  3, 11,-20,-11, -7,-17,  1,-17,-12, -1,  6,  3, -3,  4, -1,-15,-23,-14,  6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-16,  6, 10,-15, -7, -1,-15,  4,-13, -9,  4, -7,  4,  1,  1, -3,-13,-17, -8,  6; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-17,  7, 11,-15,-10, -2,-15,  2,-12, -7,  1, -7,  5, -1,  2, -3,-13,-19, -8,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='V'; M= -3,-13,-12,-15, -9, -4,-18,-14,  7, -7,  2,  2,-11,-13, -9, -6, -7, -3,  9,-16, -5,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-17,  2, 11,-16,-10, -3,-13,  4,-11, -6,  0, -6,  6,  2,  0, -3,-12,-18,-10,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M=  2, -3,-16, -4,  5,-15, -8, -7,-13,  3,-11, -7, -3, -6,  3,  1,  1, -2, -9,-15,-10,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-18, -7, -1,-13,-14, -4,-11, 10,-10, -2, -4,-10,  2, 12, -7, -6, -8,-15, -4, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M:         M= -5, -6,  0, -8, -6,-12,-17,-11, -6, -6, -6, -4, -6,-14, -4, -7, -3,  0, -3,-22, -9, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-16, -4,  3,-15,-18, -9,-14,  0, -9, -8, -4,-14, -3,  1, -5, -5,-11,-26,-11, -1;
/M: SY='D'; M=-14, 23,-27, 31, 20,-30,-14,  2,-28,  4,-23,-18, 12,-10,  8, -2,  0, -7,-24,-33,-15, 14;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-35,-26,  2,-35,-25, 36,-27, 22, 18,-22,-21,-19,-25,-20, -9, 25,-21, -1,-25;
/M: SY='Q'; M= -9,  5,-22,  5,  4,-21,-16, -1,-17,  0,-13, -8,  4,-12,  6,  2, -3, -6,-17,-29,-12,  4;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-22,  1, 11,-22,-18, -3,-21,  7,-15, -9, -1,-13,  9,  7, -3, -6,-17,-24,-11,  9;
/M: SY='Q'; M= -6, -2,-26, -3,  7,-23,-15,  1,-20,  9,-17, -6,  0,-10, 13, 12, -2, -6,-19,-22, -9,  8;
/M: SY='I'; M= -5,-16,-22,-19,-10, -4,-24,-17,  9,-14,  8,  4,-14,-19,-10,-14,-10, -5,  7,-22, -5,-11;
/M: SY='L'; M= -4,-13,-22,-15, -4, -8,-21,-11,  1,-10,  6,  4,-11,-17, -2,-10, -8, -4, -2,-22, -6, -4;
/M: SY='K'; M= -7, -1,-26, -2,  7,-24,-14, -6,-21, 15,-18, -9,  0,-14, 10, 15, -4, -7,-17,-22,-12,  7;
/M: SY='Q'; M= -6, -6,-26, -6,  4,-17,-17, -7,-11,  2,-10, -3, -6,-13,  7,  0, -6, -7,-13,-18, -6,  5;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-22, -2, 11,-22,-19, -2,-21, 14,-19, -9, -2,-12, 12, 12, -3, -7,-17,-24, -9, 10;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-17, -1,  3, -7,-13, -2,-13,  2,-10, -7, -1,-11,  1,  3, -2, -3,-10,-14, -2,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='N'; M= -3,  0,-16, -1,  0,-14, -6, -4,-10, -2, -9, -5,  2, -9, -1, -2,  1, -1, -9,-19, -9, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-19, -7, -3, -6,-13, -4, -8, -1, -4, -2, -6,-10, -1,  2, -9, -7, -9, -3, -1, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M:         M= -4, -3,-14, -4, -2, -6,-11, -2, -3, -4, -3, -2, -2,-11, -3, -4, -4, -4, -3,-15, -3, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='Q'; M= -5, -2,-15, -2,  3,-12, -9, -5, -8,  2, -7, -3, -2, -5,  4,  3, -2, -2, -7,-13, -7,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -2, -5,-12, -6, -1, -8,-11, -7, -4,  4, -1,  0, -5, -9,  0,  2, -5, -3, -3,-12, -5, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='Q'; M= -3, -1,-13, -1,  2,-12,-12, -6, -6,  1, -7, -3, -2, -7,  3, -2,  0,  2, -4,-15, -6,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-17, -1, -3,-15,  2, -2,-15, -1,-13, -7,  2,-12, -1,  1,  1, -4,-12,-18, -9, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='F'; M=-12,-23,-23,-28,-20, 29,-26,-12,  2,-18, 12,  3,-19,-26,-19,-11,-18, -8, -1,  0, 21,-19;
/M: SY='P'; M= -8, -9,-31, -4,  6,-26,-16, -9,-20, -5,-23,-14, -8, 35,  4,-10, -2, -5,-24,-28,-20,  3;
/M: SY='R'; M= -7,  3,-22,  0,  1,-18,-14, -4,-18,  7,-19,-11,  7,-15,  2,  8,  0, -3,-14,-26,-10,  1;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-33,-25,  4,-34,-25, 33,-27, 25, 16,-23,-24,-20,-24,-19, -7, 24,-21, -1,-25;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-25, -6, -1,-16,-17, -5,-12,  4,-11, -4, -4,-14,  1,  3, -7, -6, -9,-22, -6, -1;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-21, 10,  6,-20, -5, -4,-18, -4,-15,-12,  5, -7,  1, -6,  1, -4,-16,-26,-14,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M:         M= -2, -9,-17,-10, -6, -8,-11, -4, -4, -6, -4,  0, -8, -8, -3, -6, -5, -5, -3,-14, -4, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='V'; M= -5,-20,-18,-24,-19,  6,-26,-17, 14,-18,  4,  5,-17,-21,-17,-18,-10, -5, 15,-19,  1,-19;
/M: SY='I'; M= -8,-17,-19,-19,-12, -3,-25,-13,  4,-15,  2,  1,-14, -9,-12,-14,-11, -5,  3,-23, -5,-13;
/M:         M= -6,-10,-18, -9, -5,-11,-17,-14, -8, -8, -9, -7, -9, -8, -9, -6, -4, -3, -2,-27,-12, -8;
/M: SY='V'; M= -1,-15,-15,-18,-17, -6,-20,-17,  9,-16, -2,  0,-11,-20,-16,-16,  1,  4, 16,-28, -8,-17;
/M: SY='S'; M=  6,  1,-11, -1, -2,-17, -5,-10,-17, -9,-22,-16,  8,-13, -3,-10, 24, 11,-10,-35,-17, -3;
/M: SY='C'; M=  6, -8, 19,-12,-11,-18,-10,-18,-18,-14,-17,-14, -5,-20,-12,-16,  9,  4, -8,-35,-20,-12;
/M: SY='K'; M= -6,  1,-23,  1,  5,-19,-15, -9,-19,  9,-18,-11, -1,-11,  0,  3,  0,  0,-13,-24, -9,  2;
/M: SY='T'; M= -5, 11,-20, 12,  4,-23, -8, -8,-23, -3,-22,-17,  9, -8, -2, -6, 11, 13,-16,-32,-16,  1;
/M: SY='G'; M= -6, -7,-21,-10,-12,-10,  5,-13,-15,-14, -6, -6, -2,-18,-13,-12, -6, -8,-14,-23,-13,-13;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-26,  7, 13,-26,-15,  0,-24,  9,-21,-13,  3,-10, 12, 10,  2, -4,-20,-27,-12, 11;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-27, -1,-11,-27, 43,-12,-35,-12,-28,-19,  7,-18,-13,-11,  2,-14,-27,-24,-25,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26,  5,-34,-25, 34,-26, 22, 18,-23,-24,-19,-24,-20, -9, 25,-19,  0,-25;
/M: SY='E'; M= -6, 11,-27, 17, 20,-30,-13, -2,-28,  8,-23,-17,  4, -4,  8,  3,  0, -6,-24,-29,-17, 13;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-25,  3, 11,-21,-14, -4,-18,  3,-14,-10, -1,-12,  4, -1, -1, -4,-15,-26,-11,  6;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 11,-30,-21, 21,-28, 40, 17,-27,-28,-20,-20,-26, -9, 12,-19,  1,-21;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-19, -9, -1,-21,-20, -7,-22, 21,-18, -7, -4,-17,  6, 28, -7, -5,-14,-22,-10,  1;
/M: SY='D'; M= -9, 15,-27, 18, 16,-30,-13,  2,-27, 10,-23,-15, 10,-11, 14,  6,  0, -6,-25,-29,-15, 15;
/M:         M= -3, -6,-18, -7,  0,-14,-21, -7,-10, -2, -7, -5, -6,-15, -2, -5, -4,  0, -7,-24, -6, -2;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26,  3,-34,-24, 36,-27, 29, 22,-24,-24,-20,-24,-22, -9, 24,-21, -1,-25;
/M: SY='L'; M= -3,-16,-20,-19,-10, -3,-22,-14,  1, -8,  2,  1,-14,-18,-10, -7, -9, -4,  1,-17,  0,-11;
/M: SY='E'; M= -9, 10,-26, 13, 14,-26,-15,  9,-26,  8,-22,-14,  7,-12, 11,  7,  2, -5,-23,-28, -9, 11;
/M: SY='V'; M= -5,-17,-14,-20,-13, -3,-25,-13,  7,-14,  6,  7,-16,-21,-12,-14, -8,  2,  9,-22,  0,-13;
/M: SY='A'; M= 16,-17,-15,-24,-17, -5,-16,-21,  7,-16,  2,  0,-14,-18,-16,-19, -1,  2, 11,-20, -8,-17;
/M:         M= -5, -5,-16, -6, -2,-15,-16,-10,-12, -4, -9, -5, -5,-17, -1, -5, -3, -3,-10,-19,-10, -1;
/M: SY='N'; M= -8, 18,-22, 14,  5,-23,-10,  4,-21,  3,-23,-15, 21,-14,  4,  0,  7,  1,-20,-33,-14,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-13,-24,-14, -4, -7,-21,-10, -3, -7,  3,  2,-10,-14, -1, -4,-10, -6, -7,-20, -4, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51417; PS51418; PS51419; PS51420; PS51421; PS51422; PS51423

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 17 in 17 different sequences
Number of true positive hits 17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 94.44 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo, L_Cerutti
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
17 sequences

GBPC_DICDI  (Q8MVR1), LRK1_CAEEL  (Q9TZM3), LRRK1_HUMAN (Q38SD2), 
LRRK1_MOUSE (Q3UHC2), LRRK2_HUMAN (Q5S007), LRRK2_MOUSE (Q5S006), 
MFHA1_HUMAN (Q9Y4C4), MFHA1_MOUSE (Q3V1N1), MFHA1_XENTR (A4IIK1), 
PATS1_DICDI (Q55E58), QKGA_DICDI  (Q8SSS9), ROC10_DICDI (Q6XHA6), 
ROC11_DICDI (Q6XHA5), ROCO4_DICDI (Q6XHB2), ROCO5_DICDI (Q1ZXD6), 
ROCO6_DICDI (Q54WS5), ROCO8_DICDI (Q54M77)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

TRN1_ARATH  (Q9FJ57)

		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

2ZEJ; 3D6T

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission