PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS51424

General information about the entry
Entry name	ROC
Accession number	PS51424
Entry type	MATRIX
Date	DEC-2008 (CREATED); DEC-2008 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation	PDOC51417
Associated ProRule	PRU00758
Name and characterization of the entry
Description	Roc domain profile.
Matrix / Profile	/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=190; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=185; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5125285; R2=0.0102946; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; N_SCORE=18.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=485; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -4, 3,-27, 5, 12,-29, 3, -8,-28, 5,-23,-14, 1,-11, 6, -1, 1, -7,-23,-25,-18, 9; /M: SY='A'; M= 8, -6,-14, -8, -1,-20,-10,-15,-13, -6,-16,-11, -4, -5, -5,-10, 8, 4, -6,-29,-18, -4; /M: SY='E'; M= -3, -4,-20, -3, 3,-16,-18,-12,-11, 1,-12, -8, -4,-15, -2, 1, 1, 1, -3,-28,-13, 0; /M: SY='P'; M= -7,-13,-25,-11, -2,-16,-22,-13, -7, -6,-12, -7,-12, 12, -7, -8, -5, 0, -5,-26,-13, -6; /M: M= -9,-14, -4,-16,-15, -4,-21,-13, -5,-16, -2, -4,-12,-17,-14,-14, -8, -1, -3,-19, -3,-15; /M: SY='H'; M= -5, -2,-19, -6, -5,-13,-15, 3,-15, -5,-17,-10, 3, -3, -3, -6, -2, -4,-16,-22, -2, -6; /M: SY='R'; M=-14, -1,-22, 1, 14,-23,-19, 4,-28, 15,-19,-13, 1,-15, 9, 29, -5, -9,-22,-27,-12, 9; /M: SY='L'; M= 4,-19,-17,-25,-18, -4,-19,-17, 9,-16, 12, 12,-18,-21,-13,-13, -9, -1, 11,-22, -8,-16; /M: SY='K'; M=-11, 0,-30, -1, 9,-29,-20, -8,-30, 47,-29,-10, 1,-11, 10, 34,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='L'; M= -7,-27,-13,-30,-23, 4,-27,-22, 20,-25, 28, 17,-26,-27,-21,-20,-20, -6, 18,-23, -4,-23; /M: SY='M'; M= -6,-25,-18,-30,-23, 0,-27,-15, 24,-20, 20, 28,-23,-22,-15,-18,-18, -7, 21,-23, -3,-20; /M: SY='I'; M= -8,-29,-19,-33,-26, 11,-31,-23, 27,-26, 27, 18,-27,-27,-23,-21,-21, -7, 24,-20, 0,-25; /M: SY='V'; M= -6,-30,-16,-31,-26, 7,-31,-25, 26,-25, 28, 16,-29,-29,-25,-21,-20, -6, 29,-24, -4,-25; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M= -8, 8,-26, 11, 17,-25,-16, -2,-20, 1,-17,-13, 4, -6, 11, -3, 1, -4,-20,-29,-14, 14; /M: SY='E'; M= -4, -5,-24, -4, 1,-20, 0,-11,-22, -1,-19,-13, -3, -7, -3, -5, 1, -2,-17,-23,-12, -2; /M: SY='G'; M= -5, -4,-24, -6, -4,-19, 14, -9,-24, -6,-17, -8, 0,-17, -7, -4, -3,-11,-19,-23,-17, -5; /M: SY='A'; M= 23,-14, -9,-20,-14,-14,-10,-21, -1,-13, -7, -5,-12,-16,-13,-17, 7, 5, 10,-25,-15,-14; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 31,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12, 2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8; /M: SY='S'; M= 4, -2, 1, -6, -6,-17, -9,-13,-16,-11,-21,-15, 4,-15, -4,-11, 24, 19, -7,-37,-18, -5; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21, 10,-30,-20, 21,-29, 45, 20,-29,-29,-20,-20,-28, -9, 13,-20, 0,-21; /M: SY='V'; M= -1,-24, -3,-27,-21, -4,-26,-23, 11,-17, 12, 6,-22,-26,-19,-15,-14, -6, 16,-24, -9,-21; /M: SY='R'; M=-10, 4,-27, 2, 4,-23,-14, 9,-24, 14,-21, -9, 7,-16, 10, 15, -5, -9,-21,-22, -6, 6; /M: SY='A'; M= 7,-10, 0,-15, -8,-18,-14,-15,-15, -4,-14, -9, -7,-17, -3, -2, 3, 2, -8,-24,-15, -6; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-21, 9,-30,-19, 22,-28, 42, 23,-27,-28,-18,-20,-27,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-10,-10,-21,-14, -6,-15,-22, -9, -7, 6, -5, 5, -7,-17, 3, 9, -8, -2, -5,-23, -8, -3; /M: SY='R'; M= -9, 0,-27, 0, -1,-23, 4, -6,-25, 4,-19,-11, 4,-17, -1, 5, -3, -8,-21,-23,-13, -2; /M: SY='G'; M= -3, 2,-26, 3, 5,-25, 12,-10,-26, -5,-20,-15, 4,-11, -3, -9, 2, -9,-22,-27,-20, 1; /M: SY='K'; M= -8, -1,-27, 0, 7,-25,-15, -6,-21, 13,-21,-11, 0, -3, 6, 10, -3, -5,-17,-26,-14, 5; /M: SY='S'; M= 0,-11,-19,-14,-11, -3, -9,-12,-12, -9,-15,-10, -6,-11,-12,-11, 3, 0, -7,-16, -4,-11; /M: SY='E'; M= -8, 2,-21, 2, 4,-20,-17, -2,-18, 3,-18,-11, 2,-10, 3, 2, 0, -2,-13,-29,-12, 3; /M: SY='L'; M= -5,-11,-22,-10, -4,-11,-16,-14, -6, -8, 2, -2,-10,-12, -7, -8, -7, -3, -5,-25,-11, -6; /M: SY='T'; M= -3, 2,-18, -1, 0,-15,-13, -9,-15, -3,-14,-11, 2,-12, -4, -4, 4, 7,-10,-28,-12, -3; /I: I=-1; MD=-6; /M: SY='K'; M= -3, 1,-17, 2, 4,-17, -9, -6,-15, 5,-15, -9, 0, -1, 2, 2, 2, 0,-11,-19,-10, 2; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='E'; M= -5, -4,-18, -2, 5,-12,-11, -6, -7, -3, -7, -4, -5, -4, 0, -6, -4, -6, -7,-18, -8, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-6; /M: SY='E'; M= -6, 6,-24, 7, 20,-23,-16, -4,-20, 2,-16,-12, 3, -7, 7, -1, 2, -1,-18,-30,-16, 13; /M: SY='D'; M= -4, 4,-24, 7, 6,-24,-14, -7,-16, -2,-19,-12, 1, -1, 1, -8, 3, -2,-13,-31,-16, 3; /M: SY='R'; M= -4, -8,-23,-10, -2,-19,-14,-10,-16, 6,-17, -9, -2,-11, 2, 16, 4, 2,-10,-26,-13, -2; /M: SY='T'; M= 0, 0,-11, -9, -9,-10,-19,-18,-10,-10,-11,-10, 0,-11, -9,-10, 20, 45, 0,-30,-10, -9; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='H'; M=-12, 3,-27, 5, 6,-21,-18, 25,-17, -2,-16, -6, 3,-14, 5, -2, -5,-11,-16,-26, -1, 3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= -2,-13,-11,-14,-21,-23, 41,-21,-30,-20,-24,-17, -6,-20,-21,-21, -3,-16,-20,-20,-25,-21; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='I'; M= -5,-29,-21,-34,-28, 1,-34,-27, 37,-25, 19, 17,-24,-24,-22,-24,-16, -5, 33,-24, -4,-28; /M: SY='D'; M=-11, 22,-27, 29, 27,-29,-13, 0,-28, 5,-23,-20, 12, -9, 9, -1, 1, -7,-26,-31,-17, 17; /M: SY='I'; M= -6,-27,-22,-32,-26, -2,-34,-26, 34,-23, 15, 14,-21,-23,-19,-22,-14, -3, 29,-23, -4,-25; /M: SY='T'; M= -2, 0,-21, -2, -3,-20,-11, -6,-14, -1,-16, -9, 1,-14, -2, -3, 3, 5, -9,-27,-11, -4; /M: SY='E'; M= -7, 4,-24, 6, 9,-24,-17, -7,-18, 0,-17,-12, 1, -2, 7, -3, 4, 5,-16,-30,-15, 7; /M: SY='W'; M=-16,-32,-39,-34,-26, 12,-23,-21, -7,-19, -8, -9,-31,-28,-18,-18,-29,-19,-15, 87, 27,-19; /M: SY='K'; M= -6, 2,-21, 0, 3,-22,-17, -2,-18, 6,-18,-10, 3,-12, 3, 3, 0, 1,-14,-26,-10, 2; /M: SY='F'; M= -5,-16,-12,-18,-14, 4,-22,-18, -1,-17, 1, -2,-15,-12,-18,-16,-10, -5, 1,-21, -5,-16; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='E'; M= -8, 8,-25, 13, 14,-26,-13, -4,-23, 2,-22,-15, 4, 2, 7, -3, 2, -2,-21,-29,-16, 9; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: M= -1, -8,-17,-10, -6,-13,-15,-11, -3, -3, -4, -1, -7,-10, -4, -4, -5, -2, -1,-20, -9, -6; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='P'; M= -5, -1,-21, 1, 2,-18, -3, -8,-16, -1,-17,-11, -1, 10, -3, -3, -1, -5,-15,-20,-15, -2; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='D'; M= -6, 6,-17, 8, 2,-13,-10, -4,-13, 1,-13,-10, 4, -7, -1, 0, -1, -2,-11,-18, -8, 0; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='G'; M= -4, 0,-14, 1, 2,-16, 3, -6,-17, 1,-14, -9, 1, -6, 1, 0, 1, -3,-13,-16,-11, 1; D=0; /I: I=0; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='D'; M= -9, 8,-24, 10, 8,-25, -6, 1,-25, 8,-22,-13, 6, -7, 6, 6, 0, -5,-20,-25,-13, 6; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='D'; M= -9, 15,-23, 16, 10,-24, -9, 0,-24, 3,-23,-17, 14, -6, 2, 0, 4, -1,-21,-31,-16, 5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-32,-25, 7,-32,-24, 26,-24, 15, 11,-23,-19,-23,-22,-16, -6, 23,-19, 0,-26; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='R'; M= -7, -2,-22, -4, 3,-18,-18,-10,-14, 6,-13, -6, -1,-14, 2, 9, 1, 7, -9,-26,-12, 1; /M: SY='F'; M=-13,-29,-20,-33,-26, 34,-31,-18, 14,-26, 21, 10,-24,-29,-27,-20,-21, -8, 12, -6, 16,-26; /M: SY='N'; M= -7, 6,-22, 3, 7,-19,-12, 4,-17, 0,-18,-11, 13,-15, 5, 4, 6, -1,-18,-31,-12, 5; /M: SY='V'; M= -3,-24,-17,-29,-24, 2,-27,-25, 22,-22, 13, 11,-21,-23,-21,-20,-10, 2, 25,-23, -5,-24; /M: SY='W'; M=-20,-31,-40,-32,-26, 16,-23,-12,-13,-17,-13,-13,-31,-30,-17,-17,-32,-22,-22,100, 43,-20; /M: SY='D'; M=-20, 49,-30, 69, 21,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 19,-10, 1,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 11; /M: SY='F'; M=-18,-29,-15,-38,-29, 66,-30,-20, 2,-29, 10, 2,-20,-29,-37,-20,-19, -8, 2, 3, 23,-29; /M: SY='G'; M= 11, -9,-24,-11,-14,-27, 45,-18,-31,-15,-25,-18, -2,-17,-15,-17, 5,-12,-22,-22,-26,-14; /M: SY='G'; M= 0, -9,-30,-10,-20,-29, 67,-19,-38,-19,-29,-18, 1,-20,-19,-19, 0,-19,-29,-20,-29,-19; /M: SY='Q'; M=-12, 2,-30, 2, 11,-32,-17, 30,-23, 2,-20, -2, 4,-10, 34, 5, -3,-12,-28,-24, -4, 21; /M: SY='E'; M= -7, 9,-27, 15, 27,-31,-15, -1,-27, 7,-22,-16, 3, -3, 17, 2, 2, -6,-25,-29,-17, 21; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='I'; M= -4,-17,-20,-20,-12, -6,-26,-18, 17,-17, 5, 6,-15,-19,-13,-18, -6, 0, 17,-25, -6,-15; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-21,-20, 29,-28, 15, 1,-11, 3, 4,-19,-28,-11,-10,-19, -9, -7, 23, 67,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='H'; M=-16, -7,-28, -8, -7, 0,-22, 42,-17, -7,-10, -2, -2,-23, 0, 1,-12,-12,-19, -9, 29, -7; /M: SY='A'; M= 5,-11,-20,-13,-12,-10, -8,-11, -6,-15, -4, -4, -9,-11,-11,-16, -2, -2, -4,-22, -8,-12; /M: SY='T'; M= 2, -6, -9,-14,-12, -9,-19,-20, -5,-12, -9, -7, -4,-13,-11,-13, 14, 34, 3,-26, -9,-12; /M: SY='H'; M=-18, 0,-29, -1, -1,-18,-19, 82,-27, -9,-19, -1, 9,-20, 9, -1, -8,-17,-27,-27, 18, 0; /M: SY='Q'; M=-11, -3,-30, -2, 14,-34,-20, 10,-22, 9,-21, -4, -1, -1, 41, 12, -2, -9,-28,-22,-11, 26; /M: SY='F'; M=-16,-27,-10,-34,-27, 47,-29,-15, 2,-26, 10, 3,-21,-30,-31,-19,-19, -9, 3, 0, 21,-26; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 76,-30,-20, 1,-30, 12, 2,-20,-30,-39,-20,-20,-10, 1, 8, 28,-29; /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-31,-22, 22,-29,-19, 16,-27, 34, 17,-26,-26,-22,-20,-25,-10, 8,-14, 5,-22; /M: SY='T'; M= 5, -1,-11, -6, -6,-15,-12,-16,-14, -9,-18,-14, 3,-11, -6, -9, 26, 33, -3,-33,-14, -6; /M: SY='K'; M= -6, 0,-28, 2, 9,-26,-15, -4,-24, 10,-25,-14, 1, 9, 6, 5, 0, -5,-22,-27,-15, 6; /M: SY='R'; M=-12, 0,-27, 1, 1,-24, -8, 0,-27, 12,-22,-12, 5,-15, 7, 27, -3, -8,-22,-24,-13, 2; /M: SY='A'; M= 23, -6, -9,-12, -8,-20, 2,-16,-15,-11,-18,-14, -1,-12, -8,-14, 18, 8, -6,-28,-20, -8; /M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-31,-23, 10,-30,-22, 22,-27, 37, 17,-28,-29,-22,-21,-24, -8, 18,-20, -1,-23; /M: SY='Y'; M=-17,-14,-28,-16,-17, 19,-26, 21, -2,-11, -3, 0,-11,-27, -8, -9,-15,-10, -9, 12, 55,-16; /M: SY='L'; M= -7,-27,-21,-31,-22, 5,-31,-23, 25,-27, 34, 17,-25,-26,-20,-21,-22, -5, 17,-21, -2,-22; /M: SY='L'; M= -6,-29,-18,-30,-22, 6,-29,-22, 22,-27, 37, 17,-29,-29,-22,-20,-23, -7, 20,-22, -3,-22; /M: SY='V'; M= -2,-21, -8,-25,-24, -3,-27,-24, 19,-20, 9, 7,-18,-25,-22,-19, -8, 4, 27,-29, -9,-23; /M: SY='W'; M= -8,-29,-23,-32,-27, 15,-26,-21, 7,-20, 4, 2,-28,-28,-23,-19,-20,-10, 10, 25, 14,-24; /M: SY='B'; M=-13, 36,-24, 34, 9,-28, -7, 3,-28, 5,-29,-22, 35,-15, 1, 1, 5, -3,-28,-37,-19, 5; /M: SY='L'; M= -5,-23,-17,-25,-18, -1,-20,-20, 11,-24, 23, 10,-21,-19,-17,-19,-16, -5, 6,-23, -7,-19; /M: SY='R'; M= -3, -4,-21, -5, 4,-19,-15, -5,-20, 5,-18,-12, 0, -7, 3, 11, 4, 1,-16,-25,-11, 1; /M: SY='E'; M= -7, 3,-23, 3, 5,-22,-11, -7,-21, 5,-16,-11, 1,-13, 3, 4, 1, 2,-16,-27,-13, 4; /M: SY='Y'; M=-12, -7,-28, -5, -5, -1, -5, 0,-18, -7,-14,-11, -7,-15, -8, -9, -8,-10,-18, -4, 18, -8; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='D'; M=-10, 8,-23, 10, 10,-23,-13, 0,-22, 4,-19,-13, 7,-10, 3, 4, -1, -6,-19,-29,-13, 6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M= -3, 9,-23, 12, 17,-26,-13, -5,-25, 5,-23,-17, 6, -5, 8, -1, 7, 0,-21,-30,-17, 12; /M: SY='E'; M= -3, 10,-21, 13, 16,-26, -4, 3,-27, -3,-24,-18, 7,-11, 4, -7, 8, -4,-23,-31,-15, 9; /M: SY='F'; M= -5,-14,-19,-18,-11, 6,-20,-14, -8, -5, -4, -4,-10,-19,-12, 1, -7, -3, -4,-16, -1,-11; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='E'; M= -1, -5,-16, -6, 1, -3, -7, -5,-13, -7,-11, -8, -4, -7, -3, -8, 1, -3,-11,-13, -3, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='Y'; M= -4, 0,-13, 0, 1, -6, -9, 0, -7, -3, -8, -5, 0, -5, 1, -4, 0, 0, -8, -8, 2, 0; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='N'; M= -1, 3,-15, 2, 2,-15, -9, 0,-16, 2,-14,-10, 4, -9, 1, 3, 1, -1,-13,-19, -7, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='V'; M= -4,-27,-10,-29,-24, 2,-28,-24, 25,-22, 21, 13,-26,-26,-23,-20,-16, -4, 29,-24, -6,-24; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='G'; M= -8, 0,-29, 3, 4,-23, 11, -7,-28, -2,-21,-15, 1,-12, -2, -4, -4,-11,-24,-21,-13, 0; /M: SY='Y'; M=-13,-13,-23,-14,-11, 11,-22, 2, -9, -9, -9, -6,-10,-18, -9, -8, -8, -3,-10, -1, 25,-11; /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-39,-30, 12,-21,-28,-18,-20,-17,-18,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-28,140, 31,-20; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 9,-30,-20, 22,-28, 40, 19,-28,-28,-20,-20,-26, -8, 14,-19, 1,-21; /M: SY='D'; M=-10, 8,-24, 9, 6,-21,-15, 6,-20, 0,-16,-11, 6,-15, 2, 0, -1, -2,-16,-29,-10, 3; /M: SY='N'; M= -2, 0,-13, -7, -8,-13,-11, -6, -8,-11,-11, -7, 8,-18, -5,-10, 8, 7, -7,-31,-12, -7; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-35,-28, 2,-35,-27, 39,-27, 22, 19,-24,-24,-22,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28; /M: SY='Q'; M= -5, 4,-24, 0, 8,-22,-14, 0,-19, 7,-19,-10, 7,-13, 9, 7, 2, -1,-17,-26,-11, 7; /M: SY='A'; M= 23, -6, -9,-13, -8,-16, -6,-13,-11, -9,-12, -9, -3,-14, -7,-14, 12, 5, -4,-26,-15, -8; /M: SY='R'; M=-17,-10,-28,-11, -4, -7,-22, 12,-21, 13,-13, -5, -3,-20, 2, 30,-12,-10,-17,-16, 5, -4; /M: SY='A'; M= 11,-14,-12,-17,-15,-14, -4,-21, -2,-15, -8, -5,-12,-19,-16,-18, 3, 1, 10,-27,-17,-16; /M: SY='P'; M= -7,-11,-32, -7, -3,-23, -3,-16,-22, -7,-23,-16,-10, 31, -8,-11, -6,-10,-23,-25,-22, -8; /M: SY='N'; M=-10, 17,-25, 14, 0,-25, 4, 1,-26, 1,-26,-17, 21,-17, -1, 0, 2, -7,-24,-30,-16, -1; /M: SY='A'; M= 20, -6,-15, -9, -3,-22, -5,-10,-17, -8,-21,-14, -3, 1, -3,-12, 15, 4,-11,-29,-19, -4; /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='P'; M= -1,-15,-21,-14, -9,-20,-20,-19, -7,-11,-16,-10,-14, 28,-12,-17, -4, -2, -6,-30,-20,-13; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='V'; M= -2,-29,-16,-32,-29, 0,-32,-29, 33,-23, 15, 13,-27,-27,-26,-23,-13, -3, 40,-26, -7,-29; /M: SY='I'; M= -9,-24,-13,-30,-22, 3,-31,-20, 20,-24, 17, 11,-19,-24,-18,-20,-16, -5, 13,-21, 0,-22; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-32,-25, 1,-33,-26, 31,-26, 22, 15,-24,-19,-21,-24,-18, -7, 25,-23, -4,-25; /M: SY='V'; M= -1,-30,-14,-32,-30, 1,-31,-30, 33,-22, 12, 11,-27,-28,-28,-22,-12, -2, 44,-27, -8,-30; /M: SY='G'; M= 2,-11,-21,-13,-17,-24, 39,-18,-26,-17,-19,-11, -4,-20,-16,-17, -2,-14,-19,-22,-24,-17; /M: SY='T'; M= -1, 6,-12, -5, -7,-13,-16,-13,-13, -7,-15,-12, 9,-12, -7, -8, 19, 38, -6,-32,-12, -7; /M: SY='H'; M=-16, -1,-30, -1, 5,-20,-20, 54,-27, 7,-21, -4, 6,-17, 9, 9,-10,-16,-25,-25, 9, 4; /M: SY='I'; M= -2,-18,-16,-22,-14, -6,-23,-19, 7,-11, 6, 5,-15,-20,-13,-12,-10, -4, 7,-23, -7,-15; /M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 62, 19,-39, -9, 2,-38, 0,-29,-27, 19,-10, 3, -9, 0,-10,-30,-38,-19, 11; /M: SY='E'; M= -7, -5,-25, -4, 7,-17,-19, -6,-13, 2, -5, -2, -7,-12, 4, 4, -7, -6,-12,-24,-10, 5; /M: SY='C'; M= -8,-19, 10,-25,-21, 1,-22,-19, -2,-19, 0, -1,-14,-27,-19,-14,-11, -7, 3,-25, -8,-20; /M: SY='P'; M= -6, 2,-25, 4, 4,-23,-11, -6,-22, 0,-23,-15, 3, 6, 1, -4, 5, 1,-20,-30,-16, 2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='E'; M= -1, 1,-20, 3, 11,-20,-11, -7,-17, 1,-17,-12, -1, 6, 3, -3, 4, -1,-15,-23,-14, 6; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='E'; M= -3, 5,-16, 6, 10,-15, -7, -1,-15, 4,-13, -9, 4, -7, 4, 1, 1, -3,-13,-17, -8, 6; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='E'; M= -4, 5,-17, 7, 11,-15,-10, -2,-15, 2,-12, -7, 1, -7, 5, -1, 2, -3,-13,-19, -8, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='V'; M= -3,-13,-12,-15, -9, -4,-18,-14, 7, -7, 2, 2,-11,-13, -9, -6, -7, -3, 9,-16, -5,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -3, 1,-17, 2, 11,-16,-10, -3,-13, 4,-11, -6, 0, -6, 6, 2, 0, -3,-12,-18,-10, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= 2, -3,-16, -4, 5,-15, -8, -7,-13, 3,-11, -7, -3, -6, 3, 1, 1, -2, -9,-15,-10, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='R'; M= -8, -6,-18, -7, -1,-13,-14, -4,-11, 10,-10, -2, -4,-10, 2, 12, -7, -6, -8,-15, -4, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: M= -5, -6, 0, -8, -6,-12,-17,-11, -6, -6, -6, -4, -6,-14, -4, -7, -3, 0, -3,-22, -9, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -5, -4,-16, -4, 3,-15,-18, -9,-14, 0, -9, -8, -4,-14, -3, 1, -5, -5,-11,-26,-11, -1; /M: SY='D'; M=-14, 23,-27, 31, 20,-30,-14, 2,-28, 4,-23,-18, 12,-10, 8, -2, 0, -7,-24,-33,-15, 14; /M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-35,-26, 2,-35,-25, 36,-27, 22, 18,-22,-21,-19,-25,-20, -9, 25,-21, -1,-25; /M: SY='Q'; M= -9, 5,-22, 5, 4,-21,-16, -1,-17, 0,-13, -8, 4,-12, 6, 2, -3, -6,-17,-29,-12, 4; /M: SY='E'; M= -7, 0,-22, 1, 11,-22,-18, -3,-21, 7,-15, -9, -1,-13, 9, 7, -3, -6,-17,-24,-11, 9; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-26, -3, 7,-23,-15, 1,-20, 9,-17, -6, 0,-10, 13, 12, -2, -6,-19,-22, -9, 8; /M: SY='I'; M= -5,-16,-22,-19,-10, -4,-24,-17, 9,-14, 8, 4,-14,-19,-10,-14,-10, -5, 7,-22, -5,-11; /M: SY='L'; M= -4,-13,-22,-15, -4, -8,-21,-11, 1,-10, 6, 4,-11,-17, -2,-10, -8, -4, -2,-22, -6, -4; /M: SY='K'; M= -7, -1,-26, -2, 7,-24,-14, -6,-21, 15,-18, -9, 0,-14, 10, 15, -4, -7,-17,-22,-12, 7; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-26, -6, 4,-17,-17, -7,-11, 2,-10, -3, -6,-13, 7, 0, -6, -7,-13,-18, -6, 5; /M: SY='K'; M= -8, -2,-22, -2, 11,-22,-19, -2,-21, 14,-19, -9, -2,-12, 12, 12, -3, -7,-17,-24, -9, 10; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='E'; M= -5, -1,-17, -1, 3, -7,-13, -2,-13, 2,-10, -7, -1,-11, 1, 3, -2, -3,-10,-14, -2, 2; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='N'; M= -3, 0,-16, -1, 0,-14, -6, -4,-10, -2, -9, -5, 2, -9, -1, -2, 1, -1, -9,-19, -9, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='R'; M= -7, -7,-19, -7, -3, -6,-13, -4, -8, -1, -4, -2, -6,-10, -1, 2, -9, -7, -9, -3, -1, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: M= -4, -3,-14, -4, -2, -6,-11, -2, -3, -4, -3, -2, -2,-11, -3, -4, -4, -4, -3,-15, -3, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-15, -2, 3,-12, -9, -5, -8, 2, -7, -3, -2, -5, 4, 3, -2, -2, -7,-13, -7, 3; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='K'; M= -2, -5,-12, -6, -1, -8,-11, -7, -4, 4, -1, 0, -5, -9, 0, 2, -5, -3, -3,-12, -5, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='Q'; M= -3, -1,-13, -1, 2,-12,-12, -6, -6, 1, -7, -3, -2, -7, 3, -2, 0, 2, -4,-15, -6, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='G'; M= -5, -1,-17, -1, -3,-15, 2, -2,-15, -1,-13, -7, 2,-12, -1, 1, 1, -4,-12,-18, -9, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='F'; M=-12,-23,-23,-28,-20, 29,-26,-12, 2,-18, 12, 3,-19,-26,-19,-11,-18, -8, -1, 0, 21,-19; /M: SY='P'; M= -8, -9,-31, -4, 6,-26,-16, -9,-20, -5,-23,-14, -8, 35, 4,-10, -2, -5,-24,-28,-20, 3; /M: SY='R'; M= -7, 3,-22, 0, 1,-18,-14, -4,-18, 7,-19,-11, 7,-15, 2, 8, 0, -3,-14,-26,-10, 1; /M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-33,-25, 4,-34,-25, 33,-27, 25, 16,-23,-24,-20,-24,-19, -7, 24,-21, -1,-25; /M: SY='K'; M= -9, -5,-25, -6, -1,-16,-17, -5,-12, 4,-11, -4, -4,-14, 1, 3, -7, -6, -9,-22, -6, -1; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='D'; M= -6, 8,-21, 10, 6,-20, -5, -4,-18, -4,-15,-12, 5, -7, 1, -6, 1, -4,-16,-26,-14, 3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: M= -2, -9,-17,-10, -6, -8,-11, -4, -4, -6, -4, 0, -8, -8, -3, -6, -5, -5, -3,-14, -4, -5; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='V'; M= -5,-20,-18,-24,-19, 6,-26,-17, 14,-18, 4, 5,-17,-21,-17,-18,-10, -5, 15,-19, 1,-19; /M: SY='I'; M= -8,-17,-19,-19,-12, -3,-25,-13, 4,-15, 2, 1,-14, -9,-12,-14,-11, -5, 3,-23, -5,-13; /M: M= -6,-10,-18, -9, -5,-11,-17,-14, -8, -8, -9, -7, -9, -8, -9, -6, -4, -3, -2,-27,-12, -8; /M: SY='V'; M= -1,-15,-15,-18,-17, -6,-20,-17, 9,-16, -2, 0,-11,-20,-16,-16, 1, 4, 16,-28, -8,-17; /M: SY='S'; M= 6, 1,-11, -1, -2,-17, -5,-10,-17, -9,-22,-16, 8,-13, -3,-10, 24, 11,-10,-35,-17, -3; /M: SY='C'; M= 6, -8, 19,-12,-11,-18,-10,-18,-18,-14,-17,-14, -5,-20,-12,-16, 9, 4, -8,-35,-20,-12; /M: SY='K'; M= -6, 1,-23, 1, 5,-19,-15, -9,-19, 9,-18,-11, -1,-11, 0, 3, 0, 0,-13,-24, -9, 2; /M: SY='T'; M= -5, 11,-20, 12, 4,-23, -8, -8,-23, -3,-22,-17, 9, -8, -2, -6, 11, 13,-16,-32,-16, 1; /M: SY='G'; M= -6, -7,-21,-10,-12,-10, 5,-13,-15,-14, -6, -6, -2,-18,-13,-12, -6, -8,-14,-23,-13,-13; /M: SY='E'; M= -8, 4,-26, 7, 13,-26,-15, 0,-24, 9,-21,-13, 3,-10, 12, 10, 2, -4,-20,-27,-12, 11; /M: SY='G'; M= -2, -1,-27, -1,-11,-27, 43,-12,-35,-12,-28,-19, 7,-18,-13,-11, 2,-14,-27,-24,-25,-12; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26, 5,-34,-25, 34,-26, 22, 18,-23,-24,-19,-24,-20, -9, 25,-19, 0,-25; /M: SY='E'; M= -6, 11,-27, 17, 20,-30,-13, -2,-28, 8,-23,-17, 4, -4, 8, 3, 0, -6,-24,-29,-17, 13; /M: SY='E'; M= -5, 1,-25, 3, 11,-21,-14, -4,-18, 3,-14,-10, -1,-12, 4, -1, -1, -4,-15,-26,-11, 6; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 11,-30,-21, 21,-28, 40, 17,-27,-28,-20,-20,-26, -9, 12,-19, 1,-21; /M: SY='R'; M=-10, -7,-19, -9, -1,-21,-20, -7,-22, 21,-18, -7, -4,-17, 6, 28, -7, -5,-14,-22,-10, 1; /M: SY='D'; M= -9, 15,-27, 18, 16,-30,-13, 2,-27, 10,-23,-15, 10,-11, 14, 6, 0, -6,-25,-29,-15, 15; /M: M= -3, -6,-18, -7, 0,-14,-21, -7,-10, -2, -7, -5, -6,-15, -2, -5, -4, 0, -7,-24, -6, -2; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26, 3,-34,-24, 36,-27, 29, 22,-24,-24,-20,-24,-22, -9, 24,-21, -1,-25; /M: SY='L'; M= -3,-16,-20,-19,-10, -3,-22,-14, 1, -8, 2, 1,-14,-18,-10, -7, -9, -4, 1,-17, 0,-11; /M: SY='E'; M= -9, 10,-26, 13, 14,-26,-15, 9,-26, 8,-22,-14, 7,-12, 11, 7, 2, -5,-23,-28, -9, 11; /M: SY='V'; M= -5,-17,-14,-20,-13, -3,-25,-13, 7,-14, 6, 7,-16,-21,-12,-14, -8, 2, 9,-22, 0,-13; /M: SY='A'; M= 16,-17,-15,-24,-17, -5,-16,-21, 7,-16, 2, 0,-14,-18,-16,-19, -1, 2, 11,-20, -8,-17; /M: M= -5, -5,-16, -6, -2,-15,-16,-10,-12, -4, -9, -5, -5,-17, -1, -5, -3, -3,-10,-19,-10, -1; /M: SY='N'; M= -8, 18,-22, 14, 5,-23,-10, 4,-21, 3,-23,-15, 21,-14, 4, 0, 7, 1,-20,-33,-14, 4; /M: SY='L'; M= -9,-13,-24,-14, -4, -7,-21,-10, -3, -7, 3, 2,-10,-14, -1, -4,-10, -6, -7,-20, -4, -3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
Post-processing
COMPETES_HIT_WITH: PS51417; PS51418; PS51419; PS51420; PS51421; PS51422; PS51423;
Numerical results
UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052. Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 17 hits in 17 different sequences Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 17 hits in 17 different sequences Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences Number of known missed hits: 1 Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0 Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 % Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 94.44 %
Comments
MATRIX_TYPE: protein_domain Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed Matrix author: N_Hulo, L_Cerutti Taxonomic range: Eukaryotes Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1 VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot	True positive hits: GBPC_DICDI (Q8MVR1), LRK1_CAEEL (Q9TZM3), LRRK1_HUMAN (Q38SD2), LRRK1_MOUSE (Q3UHC2), LRRK2_HUMAN (Q5S007), LRRK2_MOUSE (Q5S006), MFHA1_HUMAN (Q9Y4C4), MFHA1_MOUSE (Q3V1N1), MFHA1_XENTR (A4IIK1), PATS1_DICDI (Q55E58), QKGA_DICDI (Q8SSS9), ROC10_DICDI (Q6XHA6), ROC11_DICDI (Q6XHA5), ROCO4_DICDI (Q6XHB2), ROCO5_DICDI (Q1ZXD6), ROCO6_DICDI (Q54WS5), ROCO8_DICDI (Q54M77) False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): TRN1_ARATH (Q9FJ57) Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
PDB [Detailed view]	2ZEJ; 3D6T;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top