Entry: PS51437

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CG_1
Accession [info] PS51437
Entry type [info] MATRIX
Date [info] FEB-2009 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); FEB-2009 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51437
Associated ProRule [info] PRU00767

Name and characterization of the entry

Description [info] CG-1 DNA-binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0244696; R2=0.0096673; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4590.47661; R2=32.78793; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=929; N_SCORE=11.0; H_SCORE=35018; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=463; N_SCORE=6.5; H_SCORE=19771; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-23; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='R'; M=  8,-51,-48, -2, 26,-54,-44, 33,-10,-21,  3,-45, -9,-37, 41,-39,-11, 31,-48,  0;
/M: SY='C'; M= 10, 62, 21,  9,-50,-26, 24,-40,-28,-18,-38, 22, -9, 34,-23, 10,-33, 12,-63,-44;
/M: SY='Q'; M=-37,-57,  8, 44,-58,-47, 38,-51, -8,-51,-42,-31, 48, 62, -6,  1, 14,-25,-59,-43;
/M: SY='L'; M=-25,-49,-43, 31,-30,-15,-11, 22,-44, 52, 32,-46,-50,-37,-46,  5,-36, -6,-53,-36;
/M: SY='F'; M=-42,-50,  2,-11, 53, -6, 29,-13,-48, 42,-22,-45,-56,-45,-48,-10,-39, 12,-42,  9;
/M: SY='P'; M=-20,-59,-14, 34,-50,-46,-37,-28, 21,-25,-41,-38, 77, 36,-33,  3,-35,-48,-50, 13;
/M: SY='E'; M=-39, 39,-24, 69,-54,-51,-36,-51, 10,-21,-43, -7, 35,-22, 28,-23, -2,-30,-58,-49;
/M: SY='A'; M= 51,-46,  7, 24, 11,-22, 28,-41,-36,-24,-38,  2,-45, -1,-41,  5,  0, -7,-54,-38;
/M: SY='Q'; M=-21, 30,-40,-28,-14,-13, 14, -5, 38,-46,-38,-33, 12, 55, 53,-35,-40,-45,-50,-11;
/M: SY='H'; M=-17,-50, 12,-34,-45,  4, 57,-22,-20,  4,-35, 19,-48,  1, 22, 33,  1, -5,-61,-38;
/M: SY='R'; M=  3,-55,-43,-32,-48,-51,-35,-43, 31,-13, 20,-36,-51,-23, 86,-38,-39, -6,-53,-40;
/M: SY='W'; M=-27,-73,-67,-50,-24,-51, 24,-53,-38,-49,-48,-60,-56,-42, 28,-53,-59,-62,161,-10;
/M: SY='N'; M=-20, 25,-36,  2, -7,-47,-36,-29,-36, 44, 17, 59,-53,-36,  3,-20,  3,-32,-56,-38;
/M: SY='R'; M=-35,-50, -2,-30,-51,-47,-36,-47, 26,-48,-41,-27,-44,  2, 64, 18, 59,-26,-59,-42;
/M: SY='P'; M=-42,-58,-31,  6,-57,-43,-36,-52, 25,-40,-45, 53, 85,-31, 12,-33, -1,-53,-59,-52;
/M: SY='E'; M= 21,-50,-24, 57,-55,-41,-36,-48, -9,-39,-44, 36, 36,-26,-36, 10, 21,-27,-60,-49;
/M: SY='E'; M=-37,-56,-16, 90,-48,-55,-33,-43,  1,-45,-43,-37,-38,-17,-31,-36,-37, 17,-53, 14;
/M: SY='I'; M=-38,-51,-55, -2,-30,-65,-59, 77,-51,  0,-17,-52,-51,-49,-55,-46,-10, 49,-56,-37;
/M: SY='C'; M= 38, 74,-47,-44,-38, -4, 34,-37,-11, 16,-32,-39,-51,-41,-44, -4,  6,-15,-53, 16;
/M: SY='A'; M= 42,-48, -5, 32,  6,-22,-18,-46,  4,-19,-40, 16,  5,  1,-36, 18,-32,-41,-50, -3;
/M: SY='I'; M=-42, 19,-52,  9, -7,-63,-47, 74,-49, -9, 31,-51,-52,-45,-51,-47,-37, 16,-43, 43;
/M: SY='L'; M=-17,-47,-62,-54, 16,-61,-47, 15,-55, 74, 17,-59,-60,-49,-53,-52,-40,-17,-47,-29;
/M: SY='Q'; M=  4, 39,-47,-36,-41,-49,-44, 42,-14, 10,-27,-41, 14, 58, -9,  4,-36,-25, 29,-39;
/M: SY='N'; M=  0, -2, -3,-36,-52, 10,-31,-49,-29,-51, 11, 80,-47,-31,  7, 20, 28,-46,-65,-47;
/M: SY='H'; M= -4,-53, -6,-42, 60,-52, 64,-32,-39,-31,-30,-40,-55, -5, 10,-41,-40, 16,-32, 64;
/M: SY='E'; M= 14,-54, 41, 44,-55,-12,  4,  5, -3,-48,-42, 29,-43, 35, -6,-30,-16,-42,-60,-45;
/M: SY='K'; M=  9,-50,-40,-33,  2,  7,-40, -9, 55, -5,-37,-16,-46,-28, 27, 26,-33,-39,-50,-39;
/I:         I=-8; MD=-19;
/M: SY='H'; M=-68,-83, 30, -3,-69,-21, 83,-85,-59,-75,-65,-47,-71,-52,-60,-60,-67,-84,-86,  6; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='D'; M=-56,-77, 23,-36,-83, 16,-61,-84, -6,-83,-75,-48,-69,-21,  1, 21,-56,-79,-83,-71; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='F'; M= -8,-57,-37, 44, 65,-15, 39,-47,-41,-20,-41, 14,-53,-13,-45,-42,-45,-47,-45,-25; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='W'; M=-46, 38,-45, 14,-44,-53,  6,-23, -7,-40,-47,  0,-10, 31,-13,-21,  9,-53,115,-33; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q'; M=-46,-57,-60,-49, 12,-65,-51, 42,-50, 39,-21,-55,-10, 45,-51,-50,-43, 14,-53,-36; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='T'; M=  1,-48,-37, -5,-55,-41,  5,-52,-35,-54,-48, 12,-46,-34,  5, 53, 56,-44,-67,-48; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='C'; M=-21, 57,-46,-39,-55,-14,  5,-42, 32,-49,-43, -4, 34, 23,-37,-22,  5, 19,-65,-50; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='E'; M= 21,-57,  6, 66,-63,-49,-40,-57,  9,-55,-49,-36,-43, 34,-33,-23,  1,-36,-62,-52; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -3,-60,-49,-41,-59,-47,-50,-44,-41,-54,-47,-47, 88,-43,  2, 24,-10,  9,-63,-56; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -6,-61,-46,-36,-61,-12,-48,-49, 40,-57,-48,-43, 78,-38, -6,  3,-38, -5,-60,-55; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='T'; M=-42,-55,-10,-36,-55,-49, 45,-45,-14,-35,-42, 29, 35, 37,-41,-30, 54, -6,-68,-45; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='R'; M=-47,-62,-45,-35,-51, -7,-37,-58, 37,-25,-44,-38,-55,-27, 81,-41,-14,-54,-53,  7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='P'; M=-49,-73,-50,-39, -7,-52,-52,-55,-46,-63,-52,-56,113,-50,-58,-47,-42,-60,-59,-59; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q'; M=-19, 38,-45,-34,-55,-35,-44,-30, 23, -8,-40,-40, 37, 60,-35,-21, 23,-22,-60,-49; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='S'; M=-19,-47,-32,-40,-57, 17,-37,-57,-37,-61,-52, 51,-47,-32,-43, 77,-22,-51,-65,-50; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='G'; M=-29,-57,-45,-55,-63, 90,-51,-70,-50,-67,-56,-31,-49,-47,-57,  7,-46,-64,-55,-58; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='S'; M=  8,-43,-36,-36,-53,-31,-40,-50,-18,-53,-47,-25,-42,-30,-40, 85, 31,-42,-61,-46; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='W'; M=-43,-52,-62,-51,-26,-62,-49, 33,-51, 52, 50,-56,-57, 17,-50,-51,-41, 14, 66,-31; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='F'; M=-47,-51,-66,-61, 83,-64,-53, 42,-57, 20,-21,-57,-61,-60,-56,-53,-41, 20,-34,-13; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='L'; M=-45,-47,-63,-55,-19,-64,-47, 16,-56, 79, 11,-61,-61,-49,-53,-55,-41,-15,-49,-31;
/M: SY='Y'; M=-51,-55,-56,-56, 83,-58,-27, -9,-49,-24,-27,-52,-62,-50,-47,-48,-44,-34,-12, 98;
/M: SY='N'; M=-39,-50, 66,-24,-58,-33,-27,-57,-30,-61,-52, 86, 18,-30,-38, 19,-27,-56,-73,-49;
/M: SY='R'; M=-44,-60,-40,-28,-54,-54,-31,-60, 32,-53,-42,-33,-52,-18,102,-38,-42,-54,-53,-41;
/M: SY='K'; M=-42,-56,-37,-23,-52,-50,-35,-52, 84,-12,-39,-30,-45,-19, 58,-37,-38,-49,-51,-41;
/M: SY='V'; M=-25,-48, 10,-35,-41,-53,-46,-11, 55,-29, 32,-38,-48,-35,-27,-38, -8, 62,-59,-40;
/M: SY='V'; M=-38,-45,-53,-52, 13,-57,-49, -7,-50, 48,-16, 24,-59,-49,-51,-45,-33, 61,-55,-33;
/M: SY='R'; M= -4,-57,-39,-27,-54,-50,-33,-58, 51,-53,-42,-32,-49,-19, 91,-36,-27,-51,-53,-42;
/I:         I=-30; MD=-77;
/M: SY='Y'; M=-66,-73,-60,-67, 41,-66,-44,-55,-59,-52,-51, 35,-76,-59,-60,-58,-58,-60, 63, 73; D=-30;
/I:         I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
/M: SY='F'; M=-52,-53,-58,-57, 93,-59,-30,-30,-51,-23,-28,-53,-63,-53,-48,-49,-44,-35,-12, 89;
/M: SY='R'; M=-42,-59,-40,-29,-54,-52,-31,-60, 20,-53,-42,-33,-51,-18,101, -1,-40,-53,-54,-41;
/M: SY='K'; M=-41,-54,-30,-23,-56,-45,-32,-57, 85,-56,-44, 42,-44,-19, 39,-33,-34,-53,-54,-44;
/M: SY='D'; M=-46,-59,110, -9,-66,-42,-31,-64,-33,-62,-62,-13,-45,-32,-41,-33,-35,-61,-81,-48;
/M: SY='G'; M=-27,-55,-42,-54,-61, 96,-49,-69,-48,-64,-53,-28,-46,-45,-55,-27,-46,-62,-52,-56;
/M: SY='H'; M=-48,-59,-39,-40,-15,-52,111,-47,-39,-38,-30,-32,-54,-31,-35,-40,-45,-50,-29, 95;
/M: SY='C'; M=-18, 78,-30,  8,-46,-41,-35,  2,-35,  4,-36, 70,-52,  2,-26, 16,-30,-38,-64,-46;
/M: SY='W'; M=-53,-79,-81,-58,-18,-52,-81,-51,-50,-49,-52,-74,-57,-50,-54,-60,-66,-66,172, -5;
/M: SY='K'; M=-42,-58,-36,-23,-56,-50,-33,-58, 77,-54,-43,-29,-46,  8, 74,-36,-39,-53,-51,-42;
/M: SY='K'; M=-41,-55,-33,-20,-57,-48,-35,-57, 97,-56,-44,-26,-41,-17, 24,-35,-36,-53,-50,-43;
/M: SY='K'; M=-42,-57,-36,-23,-56,-50,-33,-58, 80,-55,-43,-29,-45,-18, 73,-36,-38,-53,-51,-42;
/M: SY='K'; M=-40,-54,-33,-21,-56,-47,-36,-55, 93,-55,-43, -6,-41,-19, 19,-33,  9,-50,-52,-43;
/M: SY='D'; M=-45,-56,103,-12,-64,-40,-29,-62,-32,-62,-59, 45,-46,-31,-40,-31,-33,-60,-80,-49;
/M: SY='G'; M=-28,-55,-42,-52,-60, 93,-47,-68,-43,-63,-52,-28,-46,-43,  0,-28,-46,-61,-52,-55;
/M: SY='K'; M=-42,-56,-35,-21,-56,-49,-34,-58, 88,-55,-43,-28,-44,-17, 58,-36,-37,-53,-51,-42;
/M: SY='T'; M=-11,-40,-35,-36,-47,-45,-44,-38,-34,-42,-37,-25,-38, 19,-41,-14, 99,-30,-64,-43;
/M: SY='T'; M=-33,-44,-46,-48,-36,-54,-52, 40,-44,-24,-25, 14,-48,-47,-50,-31, 60, 58,-63,-40;
/M: SY='R'; M= 11,-56,-39,-28,-56, 14,-35,-58, 44,-53,-42,-32,-48, 24, 77,-33,-40,-51,-52,-43;
/M: SY='E'; M=-38,-59, -9,102,-61,-54,-31,-63,-19,-54,-51,-35,-33,-12,-29,-35,-38,-55,-58,-51;
/M: SY='D'; M= 66,-46, 73,-24,-58,-33,-40,-50,-37,-51,-47,-27,-44,-35,-43,-24, -8,-40,-63,-49;
/M: SY='H'; M=-47,-59,-31,-31,-46,-49,139,-64,-36,-46,-32,-20,-48,-25,-30,-37,-46,-63,-81,-15;
/M: SY='M'; M=-39,-54,-23, 80,-44,-54,-32,-35,-28, -2, 87,-40,-39,-20,-34,-40,-38,-37,-55,-40;
/M: SY='K'; M=-42,-56,-33,-24,-55,-48, 36,-58, 74,-54,-42, 18,-46,-19, 66,-35,-38,-54,-54,-40;
/M: SY='L'; M=-45,-47,-62,-54,-18,-64,-46,-10,-56, 83, -6,-62,-62,-49,-53,-55,-41,-17,-49,-31;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='K'; M=-40,-55,-33,-19,-57,-48,-36,-57,100,-56,-44,-26,-41,-17, -1,-35,-35,-53,-50,-43;
/M: SY='V'; M=  4,-45,-59,-53,-33,-57,-61, 38,-51,-18,-21,-53,-54,-52,-54,-17,-29, 80,-62,-40;
/M: SY='Q'; M=-31,-56, 15,-30,-62, 69, -8,-62,-34,-57,-46,-26,-45, 73,-37,  8,-40,-58,-54,-47;
/M: SY='N'; M=-29,-47,-29,-42,-55, 60,-36,-56,-36,-58,-49, 66,-45,-35,-44, 33, 25,-52,-61,-50;
/M: SY='V'; M=-14,-48,-18, 21,-37,-55, 33, 24,-42,-23, 48,-42,-48,-39,-45,-37, 22, 57,-62,-37;
/M: SY='E'; M=-40,-60, 62, 84,-63,-50,-32,-62,-24,-57,-53,-28, 20,-18,-34,-35,-37,-56,-64,-51;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='C'; M= 19, 48,-42,-42,-44,-11, 34,-29,-33,-20, -9, 28,-51,-37, 31,-32, 14, 37,-63,-41;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='L'; M=-41,-51,-57,-51,-27,-59,-15, 49,-52, 54,-15,-53, 30,-47,-53, -3,-36, 11,-53,-36;
/M: SY='H'; M=-41,-52, 27,-32,-39,-40, 92,-49,-34, -7,-36, 65,-50,-29,-36, 15,-33,-51,-60, 31;
/M: SY='C'; M= -1,112,-54,-52,-45,  4,-55, 15,-46,-38,-37,-45, 12,-51,  1,-39,-37, 22,-65,-51;
/M: SY='Y'; M=-42, 53,-50,-49,-10,-15,-27,-28,  2,-32,-30,-47,-59,-41,-40,-42,-39, 26,-20,102;
/M: SY='Y'; M=-48,-57,-50,-51, -1,-57,-19,-30,-42, 20,-23,-51,-61,-39, -3,-46,-43,-35,-12,114;
/M: SY='A'; M= 66,-42,-50,-44,-45,  0,-52,  9,-45,-33,-32,-43,-48,-43,-49,-27, -7, 43,-57,-45;
/M: SY='H'; M=-46,-58,-34,-33,  9,-13,130,-60,-34,-45,-33,-23,-49,-27, 12,-37,-46,-60,-69,-16;
/M: SY='G'; M=  5,-51,-38, -6,-45, 66,-38,-56,-39,-54,-46,-30,-45, 17,-44, 39,-34,-51,-45, 34;
/M: SY='E'; M= 14,-53, 20, 71,-53, -3,-35,-49,-28,  0,-41,-33,-40, 31,-35, -2,-36,-45,-57,-47;
/M: SY='D'; M=-31,-54, 51, 17,-52,-32,-33, 29, 10,-43,-39, 49,-45, 46,-32,-31, -1,-36,-62,-44;
/M: SY='N'; M=-37,-47, 37,  5,-45,-40,-32,-21,-34,-15,-37, 78,-50,-33,-40, -3,-12, 33,-67,-24;
/M: SY='P'; M=-19,-62,-37, 27,-60,-45,-43,-32,-33,-57,-46,-43,101,-34,  4,  6,-12,-51,-57,-55;
/M: SY='T'; M= -8, 25,-29,  4,-45,-40,-35,-45,-10,-48,-42, 56,  5,-33,-38, 14, 65,-40,-58, 13;
/M: SY='F'; M=-51,-52,-61,-55,103,-58,-46,-29,-53, -5,-30,-54, 47,-61,-54,-50,-43,-34,-24, -4;
/M: SY='Q'; M=-39,-57,  7,  3, 10, -4, 69,-45,-27,-43,-36,-29,-46, 83, -2,-31, -4, -4,-54,-31;
/M: SY='R'; M=-45,-61, 24,-27,-55,-53,-31,-61, -5,-54,-44,-32,  3,-20,100,-38,-42,-55,-56,-42;
/M: SY='R'; M=-14, 24,-41,-33,-52,-51,-34,-50,-10,-50,-41,  9, 10,-24, 93,-37,-40, -7,-57,-43;
/M: SY='C'; M=-35,110,-50,-47,-44,-11,-51, 15, -3,-43,-41,-38,-55,-43,  2, 31, -6,-36, 57,-44;
/M: SY='Y'; M= -8,-55,-50,-49, 33,-53,-21,-32, -7, -9, 25,-48,-58,-39,-39,-43,-42,-36,-13,108;
/M: SY='W'; M= -9,-65,-63,-54,-27, 28,-65,-50,-48,-21,-47,-54,-53,-46,-52,  1,-52,-57,153,-16;
/M: SY='M'; M=-12, 26,-59,-51,-28,-57,-43,-12,-45, 44, 85,-52,-55,-43,  2,-47,-37, 34,-55,-34;
/M: SY='L'; M=-41,-49,-55,-49,-27, -7,-47,  8, -5, 65,-15,-51, 16,-44,-47,-10,-38, -1,-51,-36;
/M: SY='D'; M= -8,-57, 71, 34,-57,-43,-34,-57,  4,-56,-50,  1,  7, 40,-33, -4,-21,-54, 57,-43;
/M: SY='P'; M=-38,-56,-34, 23,-50, -3,-39, 17, 27,-18,  6, 27, 63, -9,-35,  4,-34,-38,-56,-47;
/M: SY='D'; M= 21,-53, 52, 19, -1,-33,-14,-46,-33,-48,-45,-31, 31,-15,  6,  8, -5, -7, 45,-40;
/I:         I=-26; MD=-65;
/M: SY='Y'; M=-14,-65,-61, -4,  0,-69,-47, -3,-55, 30,-33,-63,-68,-20,-22,-57,-54,-40,-45, 56; D=-26;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='E'; M=-10, 23, 16, 61,-61,-59,-47,-57,-41,-18, 28,-45,-52,-34,-48, -9,-29,-54,-71,-57; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='H'; M= -6, 39, 24,-34,-43,-19, 99,-50,-35,  1,-35,  2,-51,-32, 10, -5,-40,-49, 52,-28;
/M: SY='I'; M=-19,-54,-55,-54,-32,-11, 32, 84,-47,-18,-19,-45,-50,-46, -8,-43,  5, -6,-54,-35;
/M: SY='V'; M= -2,-44,  0,-47,-35,-53,-55, -5,-48,  0,-24,-47,-54,-48,-51, 11,-28, 79,-64,-40;
/M: SY='L'; M=-41,-46,-54,-48, 37,-55,-44,-19, -6, 64,-15,-48,-56,-44,-45, 14,  6,-24,-45,-27;
/M: SY='V'; M=-32,-45, -4,-47,  4,-57,-55, -5, -5,  0,-23,-48,-55,-48,-47, -3,-29, 79,-60,-36;
/M: SY='H'; M= -8,-56,-31,  3,-48,-47,126,-59,-32,-47,-34,-23,-46,  2,  3,-33,  3,-56,-73,-21;
/M: SY='Y'; M=-46,-60,-47,-44, -6,-52,-20,-39,-35,-36,-31,-45,-57, 17, 19, -3,-42,-43, 58,110;
/M: SY='R'; M= -7,-52,-44, -3,-38,-53,-38,-34,-22, 39,-27,-41,  3,-30, 68,-37, 24,-34,-54,-39;
/M: SY='N'; M=-40,-55, 39, 51,-55, -3, 22,-58,  4,-56,-48, 59,-43, 26,-31,-30,-10,-56, 46,-43;
/M: SY='V'; M= -3,-44,-48, -4,-36,-55,-54, 19,-45, -5,-24,-45,-49,-46,-49,-34, 46, 67,-62,-41;
/M: SY='K'; M= -1,-55,-35,  5,-57,  9, -3,-48, 54,-51,-42,-32, 45, 42,-23,  2,-20, -9,-54,-46;
/M: SY='E'; M= -1,-51,-30, 56,-41, 16,-39,-43,-11,  8,-37,-36,-42,-29,-38, -4, 32,-41, 47, 12;
/M: SY='N'; M= 10,-50,  9, 18,-49, 22,-40,  5,-20,-32,-39, 34,  8,-33, -9, 16,-15, 11,-59,-47;
/M: SY='N'; M=-19,-52,  7, 23,-35,-28, -1,-45, -4,-21,-41, 42, 27, -5, 33, 26,-31, -6,-58,-21;
/M: SY='Q'; M=  6,-52, 24, 14,-49, -7, -3,  5, 11,-10,-23,-21, 15, 34,-20,  6, 14,-23,-57,-43;
/M: SY='S'; M=-20, 10,-39, -4, -7,-14,-39,  3,-34,  3, 31,  7, 12,-33, 15, 52,  0,-34,-55,-39;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 10 in 10 different sequences
Number of true positive hits 10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] CG-1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

CMTA1_ARATH (Q9FY74), CMTA1_HUMAN (Q9Y6Y1), CMTA1_MOUSE (A2A891), 
CMTA2_ARATH (Q6NPP4), CMTA2_HUMAN (O94983), CMTA2_MOUSE (Q80Y50), 
CMTA3_ARATH (Q8GSA7), CMTA4_ARATH (Q9FYG2), CMTA5_ARATH (O23463), 
CMTA6_ARATH (Q9LSP8)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission