ID   PACIFASTIN; MATRIX.
AC   PS51446;
DT   01-APR-2009 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Pacifastin domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1693327; R2=0.0095010; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=562; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=414; N_SCORE=7.1; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-12; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-24,-3,-1,-26,5,-16,-21,-7,-26,-18,-8,-10,-6,-13,3,-5,-14,-32,-23,-2;
MA   /M: M=-4,-10,-18,-11,-7,-16,-15,-15,-8,-8,-11,-7,-9,-18,-6,-12,-2,-3,-5,-27,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-26,-5,8,-21,-13,-2,-19,-4,-21,-12,-5,-9,8,-8,-2,-9,-15,-26,-12,8;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-20,-5,3,-20,-14,-8,-18,-4,-19,-14,-2,-12,-3,-7,4,20,-11,-27,-14,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-31,-11,-5,-30,-6,-15,-30,-10,-31,-26,-11,36,-9,-17,-6,-12,-23,-34,-24,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-30,1,-12,-30,37,-14,-36,-15,-38,-27,3,-19,-14,-16,2,-12,-28,-34,-28,-13;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-21,0,10,-26,-6,-11,-23,-2,-28,-20,-2,0,1,-9,14,3,-20,-31,-22,7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-21,-6,-3,-24,-14,-10,-18,2,-21,-16,5,-14,-1,7,10,14,-14,-32,-20,-3;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-22,-30,-21,-38,-23,18,-29,-13,-12,-17,-13,-12,-29,-33,-18,-22,-21,-22,-17,42,20,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-29,-16,0,-20,-22,-7,-24,22,-20,-13,-5,-10,5,17,-6,-7,-18,-25,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-25,0,6,-18,-20,-7,-15,1,-18,-12,-5,-17,2,-7,-4,-9,-13,-26,-9,4;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-35,20,10,-30,6,-8,-32,-5,-35,-25,0,-18,0,-13,-1,-14,-27,-34,-21,5;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='N'; M=-19,28,-30,9,1,-30,-11,9,-30,4,-39,-20,56,-19,1,1,9,-1,-29,-39,-20,1;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-15,-20,-16,-12,-8,-22,-15,-14,-15,-15,-10,-14,-24,-8,-15,-7,0,-15,8,-6,-13;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-20,-16,-8,-10,-19,-11,-13,-2,-14,-10,-5,-17,-3,1,3,10,-10,-23,-11,-7;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-17,-9,-7,-21,-13,-15,-10,-5,-16,-11,-3,-15,-6,-9,5,6,-5,-31,-19,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,11,-26,5,4,-28,-12,-1,-26,5,-32,-20,18,-9,1,-3,7,-1,-22,-36,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,0,-27,-1,-10,-27,21,-11,-29,-15,-31,-22,1,-19,-12,-15,0,-8,-23,-33,-24,-12;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-18,-8,-13,-17,31,-13,-21,-13,-20,-16,-8,-13,-13,-13,-2,-12,-16,-18,-18,-13; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: M=-3,-18,-15,-21,-14,-10,-23,-13,0,-10,-4,-5,-14,-20,-11,-8,-3,0,0,-24,-11,-14;
MA   /M: SY='G'; M=9,-19,-18,-21,-15,-19,11,-16,-22,-14,-25,-17,-17,-12,-13,-12,-3,-12,-16,-16,-15,-15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-17,-11,-18,-13,-13,-13,-18,-3,-13,-9,-3,-13,-18,-8,-16,4,0,-2,-19,-15,-12;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-10,-9,-9,-20,-19,-19,-11,-9,-11,-11,1,-10,-9,-10,12,48,-1,-30,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-20,-24,-22,-9,-14,-27,-13,-6,-4,2,3,-15,-22,-3,7,-14,-3,-6,-24,-11,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-26,-15,1,-21,-23,-13,-15,22,-14,-3,-8,-16,4,8,-6,-10,-10,-27,-17,0;
MA   /M: SY='A'; M=5,-18,-18,-20,-12,-8,-4,-14,-15,-11,-15,-11,-17,-20,-11,-6,-3,-10,-12,-21,-9,-12;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-12,-25,-9,-10,-15,-24,-15,-10,-15,-12,-13,-16,3,-11,-17,-11,-7,-9,-27,-12,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-27,-8,-2,-29,-13,-11,-25,0,-26,-21,-5,14,-1,-6,-1,-3,-18,-32,-21,-2;
MA   /M: M=-9,-9,-23,-10,-10,-20,-9,-14,-14,-9,-15,-11,-7,-20,-5,-7,-4,-5,-11,-24,-18,-9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=19(10); /POSITIVE=19(10); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Pacifastin;
CC   /VERSION=2;
DR   Q8T0W2    , CVP4_PIMHY , T; P80060    , LCM_LOCMI  , T;
DR   B3A0N9    , MSPI2_MELSA, T; A0A6B9KZ89, PI10A_PLARH, T;
DR   A0A6B9KZ79, PI11A_PLARH, T; A0A6B9L3M7, PI12A_PLARH, T;
DR   A0A6B9KZ59, PI21_PLARH , T; A0A7M6UNN1, PISP_NASVI , T;
DR   O46162    , SGP1_SCHGR , T; O46163    , SGP3_SCHGR , T;
DR   B3A0N8    , MSPI1_MELSA, N;
3D   1GL0; 1GL1; 1KGM; 1KIO; 1KJ0; 1PMC; 2F91; 2XTT; 3TVJ; 4DJZ; 7SGQ; 7SLT;
PR   PRU00776;
DO   PDOC51446;
//