PROSITE entry PS51459
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | FIDO |
Accession [info] | PS51459 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JUL-2009 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51459 |
Associated ProRule [info] | PRU00791 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Fido domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=138; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=133; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0208886; R2=0.0137402; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8310.4492188; R2=3.6167665; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=487; H_SCORE=10072; N_SCORE=8.7; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=326; H_SCORE=9490; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -6,-13,-13,-18,-16, 16,-17,-15, 17,-14, 21, 6,-12,-26,-17,-16,-11, -1, 13,-18, 14,-16; /M: SY='T'; M= 5, 9,-20, 12, -3,-20, -8,-15,-12, -2, -9,-11, 6, -6, -5,-14, 13, 14, -8,-35,-14, -5; /M: SY='L'; M= 0, -9,-16, -8, 1, -8,-15, -8, -1, -2, 2, -1,-11, -4, -4, -9, -5, -2, -2,-21, -2, -1; /M: SY='E'; M= 4, 4,-17, 9, 13,-25,-10, -9,-16, 6,-11, -7, 0, -2, 8, -4, 2, -4,-15,-25,-15, 10; /M: SY='L'; M= -4, -4,-20, -1, -3, -5,-16, -3, -6, -5, 4, -1, -6,-14, -5, -8, -5, -3, -4,-21, 3, -4; /M: SY='I'; M= -2,-16,-14,-23,-19, 11,-18,-17, 31,-16, 22, 11,-11,-29,-19,-19,-12, 1, 24,-23, 9,-19; /M: SY='M'; M= -4,-10, -9,-13, -3, -3,-16,-14, -1, 0, 1, 6, -8,-14, 0, 3, -8, -7, -2,-18, -2, -3; /M: SY='E'; M= 3, 0,-18, 5, 11,-20,-11,-10,-16, 5, -9, -4, -4, -6, 10, 1, 0, -5,-13,-18,-10, 10; /M: SY='I'; M= -4,-16,-13,-23,-18, 10,-16,-16, 27,-15, 21, 11,-12,-29,-17,-18,-13, -1, 19,-16, 9,-18; /M: SY='H'; M=-14,-11,-40,-14, -1,-23,-23, 91,-15,-14, -9, 13, 0, 1, 3, -8, -8,-13,-24,-43, -3, 0; /M: SY='R'; M= 2, -1,-24, 4, 4,-18, -8,-10,-17, 7,-13, -2, -4, -6, 11, 13, -1, -9,-13,-18,-11, 4; /M: SY='L'; M= -1, -9,-20,-10, -5, -7,-15, -6, 2, -5, 3, 3, -8,-15, 0, -2, -6, -3, 1,-19, -1, -4; /M: SY='I'; M= -2,-13,-13,-19,-15, 9,-17,-14, 23,-14, 21, 11,-11,-28,-14,-16,-12, 1, 16,-22, 9,-15; /M: SY='F'; M= -5,-16,-18,-24,-19, 20,-19,-15, 12, -9, 16, 4,-10,-27,-16,-13, -9, -2, 12,-15, 11,-19; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='Q'; M= 3, -1,-19, 1, 8,-21, -3,-10,-16, 5,-13, -7, -4, -1, 9, 3, 0, -7,-16,-17,-14, 7; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= -2, 8,-24, 14, 2,-20, 0, -9,-17, 1,-10, -9, 3, -8, -1, -1, -1, -9,-16,-20,-11, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='L'; M= -2, -8,-16, -9, -9, -2,-14, -9, 6, -8, 8, 1, -8,-15, -9,-11, -5, 2, 6,-21, 4, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='Y'; M= -6, -8,-26, -6, -8, -5, -1,-11, -7, -4, -2, -9,-11, -4, -6, -5, -4, -5, -7, -5, 4, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= 1, 2,-21, 7, 4,-22, 3,-10,-14, 1,-10,-11, -5, 3, -1, -7, 0, -5,-16,-17,-12, 1; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='W'; M= -5, -6,-14, -3, 1, -6, -5,-13,-10, -1, -6, -7,-10, -7, -3, -5, -4, -8, -9, 10, 0, -1; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='A'; M= 9, -5,-22, -5, -1,-15, -3,-12, -5, -1, -8, -4, -6, 5, 0, -8, 0, 1, -5,-26,-16, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= 1, -3,-33, -8,-12,-22, 42,-19, -7, -6,-13,-13, -4, -6,-13,-15, 0,-11,-19, -5,-21,-13; /M: SY='E'; M= 2, -2,-21, -2, 5,-21, 4,-10,-13, 2,-12, -6, -4, -6, 5, -1, -1, -9,-16,-15,-14, 4; /M: SY='F'; M=-13,-20,-27,-25,-23, 30,-19,-18, 12,-13, 18, -4,-16,-27,-19,-13,-11, -7, 14, 2, 25,-23; /M: SY='R'; M= -7,-16,-21, -8, -6,-10,-18,-11,-26, 11,-18, 1,-15, -7, 24, 61, -7,-23,-11, -6, -3, 1; /M: SY='D'; M= 3, 10,-21, 16, 3,-24, -9,-13,-16, 3,-11, -8, 5, -4, 2, -5, 4, 3,-12,-31,-13, 2; /M: SY='A'; M= 2, -5,-20, -4, 1,-16, -9, -8, -4, -1, -6, -3, -6, -7, 0, -4, 0, -2, -4,-23, -9, -1; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='D'; M= 1, 5,-17, 7, 3,-20, -3, -7,-12, 1,-11,-10, 4, 3, 4, -4, 0, -1,-14,-23,-13, 2; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='I'; M= 2, -2,-13, -6, -8, -4, -7,-11, 9, -4, 0, 0, 3,-13, -9, -8, -4, 1, 7,-22, -7, -9; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='Y'; M= -3, -7,-13, -7, -6, 0, -5, -8, -2, -3, -1, -3, -7, -6, -3, -2, -2, -1, 0, -1, 3, -6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='A'; M= 1, -3,-13, -5, -4, -8, -4, -5, 1, -2, -2, -1, -1, -4, -1, -3, -1, 0, 0,-15, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 2, -2,-15, -4, -2, -9, -4,-10, -3, 0, -5, -3, -1, -6, -2, -5, 2, 2, -3,-17, -8, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 3, -2,-18, -4, -5,-11, 3,-12, -1, 0, -6, -1, 0, -7, -4, -6, 0, 0, -3,-16,-10, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= 3, -6,-20, -9, -9, -5, 1,-13, 4, -5, -1, -3, -5,-10, -7, -8, -1, -1, 3,-14, -6,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -1, -4,-16, -4, -5, -9, -2, -4, -4, -4, -4, -3, -3, -8, -5, -5, -2, -3, -5,-16, -6, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='H'; M= -8,-11,-25,-12,-10, 6,-15, 10, -4, -6, 2, -2, -6, -7, -7, -8, -4, -3, -3,-13, 8,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= 1, -7,-16, -8, -4, -8, -9,-10, 2, -3, -1, -2, -6, -7, -3, -6, -2, 0, 1,-16, -5, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -4,-12,-21,-11, -5, -3,-10, -4, -8, -1, -5,-11,-12, 15, -4, -6, -4, -2, -8,-14, -3, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -1, -9,-14, -8, 1,-16,-10, -5, -9, 0, -9,-11,-11, 22, 0, -6, -3, 1,-10,-21,-11, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= 1, -2,-20, 0, 2,-18, -5, -4,-10, 1,-10,-10, -4, 12, 0, -6, 1, -1,-12,-23,-12, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -2,-11,-21, -8, 1,-14, -8, -3,-12, 2,-11,-13,-13, 23, -1, -5, -3, -3,-13,-15, -9, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= 2, 2,-22, 4, 3,-21, 4,-10,-13, 1,-10, -8, 0, -4, -2,-10, 1, -5,-15,-21,-16, 0; /M: SY='E'; M= -1, -3,-16, 0, 3,-12,-11, -7, -9, 0, -1, 0, -6, -9, 1, -2, -4, -5, -8,-21, -4, 2; /M: SY='I'; M= 1,-14,-14,-18,-18, 7,-18,-16, 26,-15, 18, 9,-12,-26,-17,-17,-10, 4, 22,-26, 7,-17; /M: SY='P'; M= 0, -1,-17, 5, 16,-28,-11, -4,-20, 8,-14,-13, -7, 20, 7, -4, -1, -6,-21,-24,-16, 11; /M: SY='A'; M= 6, -1,-21, 0, 3,-16, -5,-11, -9, 1, -9, -6, -2, -5, 1, -7, 4, 1, -9,-25,-14, 0; /M: SY='L'; M= 3, -7,-12, -8, -2, -5,-12,-12, 3, -5, 6, 5, -7,-17, -4,-10, -4, -1, 2,-24, -5, -3; /M: SY='L'; M= 0,-15,-12,-20,-14, 4,-19, -8, 19, -8, 21, 20,-10,-30,-14,-12,-14, 0, 13,-24, 6,-14; /M: SY='E'; M= 6, 4,-19, 9, 11,-24, -8, -9,-16, 4,-11, -6, 1, -4, 9, -3, 2, -3,-14,-26,-16, 10; /M: SY='Q'; M= 0, -1,-20, 3, 4,-19, -9, -8,-17, 4,-12, -5, -2, -8, 12, 12, -2, -8,-14,-18,-10, 5; /M: SY='L'; M= -7,-16,-17,-19,-13, 12,-16,-14, 10,-10, 13, 1,-16,-13,-14,-14,-12, -4, 6, -9, 11,-14; /M: SY='L'; M= -3,-10, -4,-13, -4, 2,-18,-17, 2, -5, 5, -1, -7,-19, -6, -8, -7, -6, 2,-19, -5, -5; /M: SY='D'; M= 5, 6,-20, 9, 7,-22, -9, -8,-14, 3,-11, -5, 6, -7, 9, -2, 1, -2,-14,-29,-17, 6; /M: SY='W'; M=-10,-14,-20,-13, -7, 5,-12,-18, -8, -5, -1, -6,-15,-18, -5, -4, -7, -9, -6, 16, 10, -7; /M: SY='Y'; M= -8,-15,-21,-17,-16, 15,-18,-12, 10,-11, 15, 2,-13,-23,-13,-11,-10, -3, 10,-10, 16,-16; /M: SY='N'; M= 0, 0,-22, -5, -3, -7, -8, -6, -8, 0, -7, -2, 7,-11, 1, -4, -2, -2,-10,-26,-10, -3; /M: M= -3, -3,-25, -1, -4, -8, -2,-12, -9, -2, -4, -7, -4,-12, -2, -5, 0, -4, -8,-12, -1, -5; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='E'; M= 4, 0,-16, 1, 6,-19, -8,-10, -9, 2, -7, -3, -2, -5, 3, -6, 0, -2,-10,-24,-14, 4; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='D'; M= 0, 5,-18, 11, 7,-19,-10, -8,-14, 2, -7, -6, 0, -5, 2, -5, -1, -3,-12,-23, -9, 4; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='A'; M= 1, -1,-18, 1, -1,-11,-10, -8, -5, -2, -1, 0, -3, -6, -3, -8, -3, 0, -5,-24, -4, -2; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='Y'; M= -4, -4,-19, -2, -1, -7, -9, -5, -7, -1, 0, -2, -5, -7, -1, -4, -3, -2, -6,-12, 3, -2; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='P'; M= 0, -2,-13, -1, 1,-13, -5, -7, -7, 2, -6, -4, -4, 5, -1, -3, -1, -1, -8,-17, -8, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='D'; M= 0, 8,-23, 16, 6,-28,-11, 4,-18, 0,-12,-12, 3, 5, -1,-10, 3, 1,-16,-35,-14, 2; /M: SY='P'; M= -2,-13,-24,-16,-10, -2,-13,-11, 2, -4, -2, -9,-12, 12,-10,-12, -6, 1, -1,-25, -5,-13; /M: SY='I'; M= -3,-14,-15,-18,-14, 12,-18,-15, 15,-12, 14, 2,-12,-23,-15,-15, -9, -1, 13,-17, 8,-15; /M: SY='E'; M= 3, -2,-15, 2, 7,-16,-14,-13, -1, 0, -1, -3, -6,-12, -1, -9, -3, -5, 0,-24, -8, 4; /M: SY='R'; M= 1, -7,-22, -6, 0, -8,-13,-12, -7, 7, -5, 7, -7, -9, 6, 10, -5, -7, -5,-20, -5, 0; /M: SY='A'; M= 20, -6,-23,-10, -8,-10, -4,-17, 11, -6, 1, 7, -4,-16, -3,-14, 3, 7, 12,-37,-21, -9; /M: SY='A'; M= 23, -5,-23, -8, -7,-12, -1,-20, 5, -4, -4, 5, -3,-14, -1,-13, 5, 7, 8,-37,-26, -7; /M: SY='I'; M= 2, -9,-19,-10, -7, -6,-15, -8, 5, -6, 4, 4, -6,-17, -5, -8, -4, -1, 5,-22, -4, -7; /M: SY='L'; M= -2,-15,-21,-18,-17, 16,-17,-15, 14,-12, 17, 5,-13,-25,-14,-14, -8, 1, 15,-17, 12,-17; /M: SY='H'; M=-10,-17,-32,-19, -8, -5,-21, 47, -3,-12, 4, 12,-11,-11, -6,-10, -9, -9, -7,-25, 7, -8; /M: SY='Y'; M=-10,-16,-29,-16,-14, 13,-16, -1, -1,-11, 9, -3,-14,-19,-10, -8, -9, -7, 3, -6, 17,-14; /M: SY='Q'; M= -3, -5,-22, -3, 3,-11, -8, -8,-14, 1, -7, -5, -7,-10, 6, 2, -3, -9,-13, -8, -3, 3; /M: SY='F'; M=-10,-19,-16,-30,-25, 41,-21,-20, 19,-15, 25, 2,-12,-34,-23,-16,-13, -6, 16,-11, 19,-25; /M: SY='I'; M= 7, -4,-11, -8, -1,-12,-13,-15, 8, -5, 0, 1, 0,-18, -7,-14, -2, 2, 7,-30,-13, -3; /M: SY='Y'; M= -5,-12,-21,-11, -5, -1,-15,-13, -8, 0, -3, -1,-10,-13, -1, 2, -3, -3, -3, -5, 5, -6; /M: SY='I'; M= 1, -8,-17,-21,-19, -2, -8,-17, 30,-13, 9, 5, 5,-26,-15,-21, -7, 1, 18,-31,-10,-19; /M: SY='H'; M=-17,-19,-46,-19, 1,-28,-29,122,-20,-17,-10, 17,-10, 8, 7, -5,-10,-18,-29,-44, 0, 3; /M: SY='P'; M= -8,-19,-25,-12, 6,-32,-11, 4,-23, 6,-24,-33,-26, 86, -2,-11, -9, -1,-31,-27,-18, -3; /M: SY='F'; M=-20,-29,-30,-46,-37, 91,-29,-28, 0,-10, 21,-17,-12,-39,-28,-10,-11,-19, 9, 12, 32,-37; /M: SY='R'; M= -1, -8,-21, -6, -5, -9,-12, -9, -5, -2, -4, -2, -7,-10, 1, 4, -4, -5, -3,-18, -3, -4; /M: SY='D'; M= 0, 40,-23, 68, 14,-44, -9,-17,-34, 2,-11,-24, 12, -9, -6,-10, 0, -9,-20,-37,-14, 5; /M: SY='G'; M= 2, 0,-37, -9,-18,-29, 70,-28, -9, -9,-19,-17, 0,-10,-17,-19, 0,-17,-26, 4,-30,-18; /M: SY='N'; M= 0, 39,-10, 10,-10,-10, 0,-10, 0, 0,-20, 0, 78,-29,-10,-20, 1, 10,-20,-69,-39,-10; /M: SY='G'; M= 0, 0,-34, -6, -6,-23, 45,-25,-13, 5,-19, -7, 0, -4,-12,-10, 1,-15,-25, -2,-22, -9; /M: SY='R'; M= -9,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-28, 9,-19, 0,-19, -9, 28, 75,-10,-28,-10, -2, -1, 0; /M: SY='T'; M= 7, -8,-18,-16,-19, -8,-19,-15, 15,-11, 8, 6, 0,-16,-10,-22, 5, 25, 17,-39, -5,-15; /M: SY='G'; M= 17, -2,-28, -6, -6,-20, 18,-16, -4, -5,-12, -4, -1,-10, 0,-12, 8, 2, -7,-26,-28, -6; /M: SY='R'; M= -8,-18,-20,-13,-11, -1,-18,-12,-16, 3, -8, 1,-16,-15, 16, 46, -9,-19, -4, -4, 4, -5; /M: SY='L'; M= 1,-12,-15,-17,-13, 12,-17,-13, 15,-12, 18, 10,-11,-26,-13,-15, -9, 1, 13,-23, 7,-13; /M: SY='L'; M= -2,-14,-12,-20,-16, 16,-17,-16, 17,-13, 20, 9,-13,-28,-16,-16,-11, -1, 14,-17, 10,-16; /M: SY='I'; M= 4,-11,-15,-19,-13, 2,-14,-11, 10, -6, 10, 10, -3,-24,-10,-14, -4, 5, 8,-26, -5,-13; /M: SY='N'; M= -1, 5,-18, 3, -3,-11,-12, -4, -4, -5, -2, -2, 9,-15, -5,-11, -2, 1, -6,-32, -8, -5; /M: SY='Y'; M= -5,-12,-19,-13, -9, 5,-15,-11, 4, -8, 10, 4,-13,-20, -7, -9, -9, -3, 3, -8, 12, -9; /M: SY='F'; M= -7,-17,-19,-22,-16, 23,-21,-14, 12,-11, 19, 3,-14,-25,-14,-13,-11, -4, 11,-11, 17,-16; /M: SY='L'; M= -3,-10, -2,-12, -9, 10,-17,-12, 15,-15, 28, 16,-15,-27,-15,-17,-15, 0, 9,-23, 14,-10; /M: SY='M'; M= 0,-10,-17,-11, -3, -8,-15, -3, 0, -2, 2, 7, -9,-15, 0, -2, -5, -4, 0,-20, -3, -3; /M: SY='Q'; M= 1, -6,-20, -4, 3,-13,-14, -7,-11, 5, -7, 3, -6, -9, 12, 12, -4, -7, -9,-19, -6, 5; /M: SY='N'; M= 3, 6,-19, 0, -2,-11, -6, -6, -7, 0,-10, -1, 15,-15, -1, -7, 0, -1,-10,-33,-17, -3; /M: SY='G'; M= -1, 4,-31, -2,-12,-24, 45,-20,-10, -6,-14,-14, 4,-12,-13,-14, -1,-14,-23, -6,-22,-13; /M: SY='Y'; M=-13,-16,-29,-13,-12, 11,-17, -7, 2, -9, 12, -2,-17,-18, -9, -8,-11, -7, 5, 1, 24,-13; /M: SY='P'; M= -2, -7,-19, -4, -1,-14,-11, -8, -7, -1, -4, -6,-10, 3, -1, -6, -4, -2, -8,-20, -5, -2; /M: SY='P'; M= -5,-14,-20,-15, -8, -1,-14, -9, 3, -6, 4, -6,-15, 6,-10,-12, -9, -2, -1,-19, 2,-11; /M: SY='A'; M= 1, -3,-19, -2, -6, -8,-12,-14, -2, -4, -1, -5, -4,-10, -5, -8, -2, 0, 0,-25, -6, -7; /M: M= -2, -9,-20, -9, -7, -7, -6,-17, -3, -4, -4, -7, -9, -7, -8, -8, -4, -4, -4, -9, -5,-10; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='I'; M= -5,-11,-20,-14,-12, 2,-13,-14, 9, -9, 7, -3, -9,-17,-11,-13, -5, -1, 7,-10, 6,-13; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: M= -2, -9,-20, -9, -4, -6, -9,-11, -3, -2, -4, -6, -9, -1, -5, -6, -2, -2, -5,-14, -3, -6; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='S'; M= 0, -5,-20, -5, -6, -3,-11,-11, -2, -3, -1, -5, -5, -9, -8, -9, 1, 1, -1,-20, -2, -9; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='A'; M= 2, -3,-13, -2, 1,-11, -9, -9, 0, -2, 0, -2, -5, -5, -3,-10, -1, 0, -1,-19, -6, -1; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='S'; M= 1, -1, -9, -1, 1, -7, -4, -5, -4, 0, -4, -4, -2, -4, -1, -2, 4, 1, -4,-12, -5, 0; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='D'; M= 1, 8,-19, 11, 5,-21,-11, -3,-15, 2,-11, -6, 8, -7, 4, -4, 2, -2,-15,-31,-14, 4; /M: SY='R'; M= 0, -9,-22, -7, -1,-10,-13,-11,-11, 8, -9, 4, -9, -8, 8, 20, -4,-10, -7,-16, -6, 0; /M: SY='D'; M= 5, 5,-19, 10, 10,-22, -9,-12,-13, 4, -8, -5, 0, -6, 4, -6, 1, -3,-11,-26,-14, 7; /M: SY='D'; M= 4, 4,-19, 11, 10,-20,-13,-11,-16, 5, -8, -6, -3, -6, 7, 0, 0, -5,-11,-23,-11, 7; /M: SY='Y'; M=-26,-25,-40,-16,-19, 25,-25, -8, -1,-11, 24, -4,-29,-24,-13, -5,-17, -8, 9, 28, 57,-19; /M: SY='Y'; M= -9,-15,-28,-14,-15, 9,-19,-10, 7, -7, 13, 3,-14,-22,-10, -5,-11, -3, 10, -6, 22,-15; /M: SY='E'; M= 4, 0,-18, 4, 6,-17,-12, -9,-10, 3, -7, -2, -2, -9, 5, 1, 1, -3, -8,-25,-11, 4; /M: SY='A'; M= 11, -6,-19, -8, -5, -9, -7,-13, 1, -3, -1, 5, -5,-16, -2, -8, 0, 1, 3,-29,-14, -6; /M: SY='L'; M= -3,-12,-13,-16,-14, 11,-18,-11, 17,-12, 22, 12,-12,-26,-15,-15,-12, 1, 13,-22, 12,-14; /M: SY='A'; M= 7, -1,-19, 1, 5,-16,-10, -9, -7, 2, -6, 1, -3,-10, 4, -2, 0, -3, -6,-27,-13, 4; /M: SY='A'; M= 6, -1,-20, 0, 3,-16, -7,-10,-10, 2, -7, -1, -1,-10, 5, -1, 1, -2, -9,-24,-12, 3; /M: SY='A'; M= 6, -7,-23, -9, -9, -5, -4,-16, 0, -5, -2, -5, -7,-14, -7,-10, 3, 2, 2,-21, -8,-10; /M: SY='D'; M= 1, 3,-24, 10, 1,-18,-12, -8,-13, -1, -6, -8, -2, -8, 4, -2, 0, -1, -9,-24, -5, 0; /M: SY='A'; M= 4, -3,-19, -3, 0,-14,-11, -9, -5, 0, -6, -1, -1, -9, 2, -3, 1, 0, -4,-26,-11, -1; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= 2, 4,-23, 5, 0,-22, 6, -9,-13, 0,-12, -9, 3, -2, -3, -9, 3, -2,-16,-24,-17, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -2, 2,-17, 4, 0,-15, -2,-11,-11, -1, -7, -6, 1, -8, -1, -3, -2, -5,-12,-15, -9, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -1, 5,-15, 8, 0,-12, -5, -6, -9, 0, -5, -5, 2, -6, -2, -4, -1, -2, -8,-17, -6, -1; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='L'; M= -5,-11,-17,-11, -6, -3,-13,-13, 2, -5, 5, 1,-12,-14, -7, -9, -7, -4, 1, -7, 5, -7; /M: SY='E'; M= 3, -1,-17, 2, 8,-19,-11,-10,-14, 4, -8, -3, -4, -6, 8, 1, 1, -3,-11,-21,-11, 7; /M: SY='P'; M= 0, 0,-21, 5, 8,-25, -7, -7,-15, 3,-11,-11, -6, 13, 2, -7, -2, -4,-16,-23,-13, 4; /M: SY='F'; M=-11,-20,-17,-25,-19, 21,-16,-20, 12,-13, 16, 2,-18,-30,-17,-12,-14, -8, 9, 10, 19,-19; /M: SY='I'; M= 5, -8,-13,-12, -7, -7,-13,-17, 11, -5, 4, 4, -3,-18, -8,-14, -1, 4, 10,-29, -9, -8; /M: SY='D'; M= 1, 4,-18, 8, 6,-17,-10, -9,-13, 4, -7, -3, 1, -8, 1, -2, -1, -5,-11,-25,-10, 3; /M: SY='F'; M=-20,-26,-27,-29,-20, 38,-18,-21, -2,-11, 11,-10,-24,-28,-16, -8,-13,-16, 2, 34, 31,-21; /M: SY='I'; M= -3,-16,-15,-24,-20, 18,-19,-16, 21,-12, 19, 8, -9,-30,-18,-16,-11, -2, 17,-19, 8,-20; /M: SY='M'; M= 0, -7,-17, -5, -2, -6,-13,-12, -3, -2, 2, 3, -9,-15, -1, -1, -5, -4, -2,-18, 0, -2; /M: SY='E'; M= 0, 3,-20, 8, 9,-21,-11, -5,-18, 5,-11, -6, -1, -4, 6, 1, 1, -6,-15,-22,-11, 7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 42 in 41 different sequences |
Number of true positive hits | 42 in 41 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 2 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Fido |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
41 sequences
ANKX_LEGPH (Q5ZXN6), BEPA_BARHE (Q6G2A9), DOC_BPP1(Q06259), DOC_MYCS2 (A0QRY0), FICD_AEDAE (Q17A75), FICD_CAEBR (A8X181), FICD_CAEEL (Q23544), FICD_CRIGR (A0A061I403), FICD_CULQU (B0W429), FICD_DANRE (Q6ZM51), FICD_DROAN (B3MK83), FICD_DROER (B3N5J3), FICD_DROGR (B4JBN5), FICD_DROME (Q8SWV6), FICD_DROMO (B4KFW6), FICD_DROPE (B4GJC1), FICD_DROPS (Q29JP8), FICD_DROSE (B4I1V5), FICD_DROSI (B4Q4M7), FICD_DROVI (B4LQT7), FICD_DROWI (B4MUQ2), FICD_DROYA (B4P0E1), FICD_HUMAN (Q9BVA6), FICD_MOUSE (Q8BIX9), FICD_NEMVE (A7SVT1), FICD_RAT(Q6AY47), FICD_XENTR (B4F6I5), FIC_ECOLI (P20605), FIC_SALTY (P20751), IBPA_HISS2 (Q06277), NMFIC_NEIMB (Q7DDR9), RIR2_OSHVF (Q6R7K3), SOFIC_SHEON (Q8E9K5), VBHT_BARSR (E6Z0R3), VOPS_VIBPA (Q87P32), XOPAC_XANC8 (Q4UWF4), Y459_NEIMB (Q9K0V1), Y4LH_SINFN (P55548), Y5363_DICDI (Q54RJ6), Y977_HAEIN (P44088), YZ38_AQUAE (O66426)» more
|
PDB [Detailed view] |
49 PDB
2G03; 2JK8; 2VY3; 2VZA; 3DD7; 3DD9; 3EQX; 3K33; 3KH2; 3LET; 3N3U; 3S6A; 3SE5; 3SHG; 3SN9; 3ZC7; 3ZCB; 3ZCN; 3ZEC; 3ZLM; 4BEP; 4BER; 4BES; 4BET; 4ITR; 4U04; 4U07; 4U0S; 4U0U; 4U0Z; 5CGL; 5CKL; 5CMT; 5JFF; 5JFZ; 5JJ6; 5JJ7; 5NH2; 6I7G; 6I7H; 6I7I; 6I7J; 6I7K; 6I7L; 6SIU; 6SKU; 6ZMD; 7B7Z; 7B80 » more |