Entry: PS51459

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] FIDO
Accession [info] PS51459
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUL-2009 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51459
Associated ProRule [info] PRU00791

Name and characterization of the entry

Description [info] Fido domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=138;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=133;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0208886; R2=0.0137402; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6980.89819; R2=38.62802; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=487; N_SCORE=8.7; H_SCORE=22393; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=326; N_SCORE=6.5; H_SCORE=19574; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-13,-18,-16, 16,-17,-15, 17,-14, 21,  6,-12,-26,-17,-16,-11, -1, 13,-18, 14,-16;
/M: SY='T'; M=  5,  9,-20, 12, -3,-20, -8,-15,-12, -2, -9,-11,  6, -6, -5,-14, 13, 14, -8,-35,-14, -5;
/M: SY='L'; M=  0, -9,-16, -8,  1, -8,-15, -8, -1, -2,  2, -1,-11, -4, -4, -9, -5, -2, -2,-21, -2, -1;
/M: SY='E'; M=  4,  4,-17,  9, 13,-25,-10, -9,-16,  6,-11, -7,  0, -2,  8, -4,  2, -4,-15,-25,-15, 10;
/M: SY='L'; M= -4, -4,-20, -1, -3, -5,-16, -3, -6, -5,  4, -1, -6,-14, -5, -8, -5, -3, -4,-21,  3, -4;
/M: SY='I'; M= -2,-16,-14,-23,-19, 11,-18,-17, 31,-16, 22, 11,-11,-29,-19,-19,-12,  1, 24,-23,  9,-19;
/M: SY='M'; M= -4,-10, -9,-13, -3, -3,-16,-14, -1,  0,  1,  6, -8,-14,  0,  3, -8, -7, -2,-18, -2, -3;
/M: SY='E'; M=  3,  0,-18,  5, 11,-20,-11,-10,-16,  5, -9, -4, -4, -6, 10,  1,  0, -5,-13,-18,-10, 10;
/M: SY='I'; M= -4,-16,-13,-23,-18, 10,-16,-16, 27,-15, 21, 11,-12,-29,-17,-18,-13, -1, 19,-16,  9,-18;
/M: SY='H'; M=-14,-11,-40,-14, -1,-23,-23, 91,-15,-14, -9, 13,  0,  1,  3, -8, -8,-13,-24,-43, -3,  0;
/M: SY='R'; M=  2, -1,-24,  4,  4,-18, -8,-10,-17,  7,-13, -2, -4, -6, 11, 13, -1, -9,-13,-18,-11,  4;
/M: SY='L'; M= -1, -9,-20,-10, -5, -7,-15, -6,  2, -5,  3,  3, -8,-15,  0, -2, -6, -3,  1,-19, -1, -4;
/M: SY='I'; M= -2,-13,-13,-19,-15,  9,-17,-14, 23,-14, 21, 11,-11,-28,-14,-16,-12,  1, 16,-22,  9,-15;
/M: SY='F'; M= -5,-16,-18,-24,-19, 20,-19,-15, 12, -9, 16,  4,-10,-27,-16,-13, -9, -2, 12,-15, 11,-19;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='Q'; M=  3, -1,-19,  1,  8,-21, -3,-10,-16,  5,-13, -7, -4, -1,  9,  3,  0, -7,-16,-17,-14,  7; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='D'; M= -2,  8,-24, 14,  2,-20,  0, -9,-17,  1,-10, -9,  3, -8, -1, -1, -1, -9,-16,-20,-11, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L'; M= -2, -8,-16, -9, -9, -2,-14, -9,  6, -8,  8,  1, -8,-15, -9,-11, -5,  2,  6,-21,  4, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='Y'; M= -6, -8,-26, -6, -8, -5, -1,-11, -7, -4, -2, -9,-11, -4, -6, -5, -4, -5, -7, -5,  4, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='D'; M=  1,  2,-21,  7,  4,-22,  3,-10,-14,  1,-10,-11, -5,  3, -1, -7,  0, -5,-16,-17,-12,  1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='W'; M= -5, -6,-14, -3,  1, -6, -5,-13,-10, -1, -6, -7,-10, -7, -3, -5, -4, -8, -9, 10,  0, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='A'; M=  9, -5,-22, -5, -1,-15, -3,-12, -5, -1, -8, -4, -6,  5,  0, -8,  0,  1, -5,-26,-16, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G'; M=  1, -3,-33, -8,-12,-22, 42,-19, -7, -6,-13,-13, -4, -6,-13,-15,  0,-11,-19, -5,-21,-13;
/M: SY='E'; M=  2, -2,-21, -2,  5,-21,  4,-10,-13,  2,-12, -6, -4, -6,  5, -1, -1, -9,-16,-15,-14,  4;
/M: SY='F'; M=-13,-20,-27,-25,-23, 30,-19,-18, 12,-13, 18, -4,-16,-27,-19,-13,-11, -7, 14,  2, 25,-23;
/M: SY='R'; M= -7,-16,-21, -8, -6,-10,-18,-11,-26, 11,-18,  1,-15, -7, 24, 61, -7,-23,-11, -6, -3,  1;
/M: SY='D'; M=  3, 10,-21, 16,  3,-24, -9,-13,-16,  3,-11, -8,  5, -4,  2, -5,  4,  3,-12,-31,-13,  2;
/M: SY='A'; M=  2, -5,-20, -4,  1,-16, -9, -8, -4, -1, -6, -3, -6, -7,  0, -4,  0, -2, -4,-23, -9, -1;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='D'; M=  1,  5,-17,  7,  3,-20, -3, -7,-12,  1,-11,-10,  4,  3,  4, -4,  0, -1,-14,-23,-13,  2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='I'; M=  2, -2,-13, -6, -8, -4, -7,-11,  9, -4,  0,  0,  3,-13, -9, -8, -4,  1,  7,-22, -7, -9; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='Y'; M= -3, -7,-13, -7, -6,  0, -5, -8, -2, -3, -1, -3, -7, -6, -3, -2, -2, -1,  0, -1,  3, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='A'; M=  1, -3,-13, -5, -4, -8, -4, -5,  1, -2, -2, -1, -1, -4, -1, -3, -1,  0,  0,-15, -6, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A'; M=  2, -2,-15, -4, -2, -9, -4,-10, -3,  0, -5, -3, -1, -6, -2, -5,  2,  2, -3,-17, -8, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A'; M=  3, -2,-18, -4, -5,-11,  3,-12, -1,  0, -6, -1,  0, -7, -4, -6,  0,  0, -3,-16,-10, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='I'; M=  3, -6,-20, -9, -9, -5,  1,-13,  4, -5, -1, -3, -5,-10, -7, -8, -1, -1,  3,-14, -6,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M= -1, -4,-16, -4, -5, -9, -2, -4, -4, -4, -4, -3, -3, -8, -5, -5, -2, -3, -5,-16, -6, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='H'; M= -8,-11,-25,-12,-10,  6,-15, 10, -4, -6,  2, -2, -6, -7, -7, -8, -4, -3, -3,-13,  8,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='I'; M=  1, -7,-16, -8, -4, -8, -9,-10,  2, -3, -1, -2, -6, -7, -3, -6, -2,  0,  1,-16, -5, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M= -4,-12,-21,-11, -5, -3,-10, -4, -8, -1, -5,-11,-12, 15, -4, -6, -4, -2, -8,-14, -3, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M= -1, -9,-14, -8,  1,-16,-10, -5, -9,  0, -9,-11,-11, 22,  0, -6, -3,  1,-10,-21,-11, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M=  1, -2,-20,  0,  2,-18, -5, -4,-10,  1,-10,-10, -4, 12,  0, -6,  1, -1,-12,-23,-12, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M= -2,-11,-21, -8,  1,-14, -8, -3,-12,  2,-11,-13,-13, 23, -1, -5, -3, -3,-13,-15, -9, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D'; M=  2,  2,-22,  4,  3,-21,  4,-10,-13,  1,-10, -8,  0, -4, -2,-10,  1, -5,-15,-21,-16,  0;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-16,  0,  3,-12,-11, -7, -9,  0, -1,  0, -6, -9,  1, -2, -4, -5, -8,-21, -4,  2;
/M: SY='I'; M=  1,-14,-14,-18,-18,  7,-18,-16, 26,-15, 18,  9,-12,-26,-17,-17,-10,  4, 22,-26,  7,-17;
/M: SY='P'; M=  0, -1,-17,  5, 16,-28,-11, -4,-20,  8,-14,-13, -7, 20,  7, -4, -1, -6,-21,-24,-16, 11;
/M: SY='A'; M=  6, -1,-21,  0,  3,-16, -5,-11, -9,  1, -9, -6, -2, -5,  1, -7,  4,  1, -9,-25,-14,  0;
/M: SY='L'; M=  3, -7,-12, -8, -2, -5,-12,-12,  3, -5,  6,  5, -7,-17, -4,-10, -4, -1,  2,-24, -5, -3;
/M: SY='L'; M=  0,-15,-12,-20,-14,  4,-19, -8, 19, -8, 21, 20,-10,-30,-14,-12,-14,  0, 13,-24,  6,-14;
/M: SY='E'; M=  6,  4,-19,  9, 11,-24, -8, -9,-16,  4,-11, -6,  1, -4,  9, -3,  2, -3,-14,-26,-16, 10;
/M: SY='Q'; M=  0, -1,-20,  3,  4,-19, -9, -8,-17,  4,-12, -5, -2, -8, 12, 12, -2, -8,-14,-18,-10,  5;
/M: SY='L'; M= -7,-16,-17,-19,-13, 12,-16,-14, 10,-10, 13,  1,-16,-13,-14,-14,-12, -4,  6, -9, 11,-14;
/M: SY='L'; M= -3,-10, -4,-13, -4,  2,-18,-17,  2, -5,  5, -1, -7,-19, -6, -8, -7, -6,  2,-19, -5, -5;
/M: SY='D'; M=  5,  6,-20,  9,  7,-22, -9, -8,-14,  3,-11, -5,  6, -7,  9, -2,  1, -2,-14,-29,-17,  6;
/M: SY='W'; M=-10,-14,-20,-13, -7,  5,-12,-18, -8, -5, -1, -6,-15,-18, -5, -4, -7, -9, -6, 16, 10, -7;
/M: SY='Y'; M= -8,-15,-21,-17,-16, 15,-18,-12, 10,-11, 15,  2,-13,-23,-13,-11,-10, -3, 10,-10, 16,-16;
/M: SY='N'; M=  0,  0,-22, -5, -3, -7, -8, -6, -8,  0, -7, -2,  7,-11,  1, -4, -2, -2,-10,-26,-10, -3;
/M:         M= -3, -3,-25, -1, -4, -8, -2,-12, -9, -2, -4, -7, -4,-12, -2, -5,  0, -4, -8,-12, -1, -5;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='E'; M=  4,  0,-16,  1,  6,-19, -8,-10, -9,  2, -7, -3, -2, -5,  3, -6,  0, -2,-10,-24,-14,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='D'; M=  0,  5,-18, 11,  7,-19,-10, -8,-14,  2, -7, -6,  0, -5,  2, -5, -1, -3,-12,-23, -9,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='A'; M=  1, -1,-18,  1, -1,-11,-10, -8, -5, -2, -1,  0, -3, -6, -3, -8, -3,  0, -5,-24, -4, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='Y'; M= -4, -4,-19, -2, -1, -7, -9, -5, -7, -1,  0, -2, -5, -7, -1, -4, -3, -2, -6,-12,  3, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='P'; M=  0, -2,-13, -1,  1,-13, -5, -7, -7,  2, -6, -4, -4,  5, -1, -3, -1, -1, -8,-17, -8, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='D'; M=  0,  8,-23, 16,  6,-28,-11,  4,-18,  0,-12,-12,  3,  5, -1,-10,  3,  1,-16,-35,-14,  2;
/M: SY='P'; M= -2,-13,-24,-16,-10, -2,-13,-11,  2, -4, -2, -9,-12, 12,-10,-12, -6,  1, -1,-25, -5,-13;
/M: SY='I'; M= -3,-14,-15,-18,-14, 12,-18,-15, 15,-12, 14,  2,-12,-23,-15,-15, -9, -1, 13,-17,  8,-15;
/M: SY='E'; M=  3, -2,-15,  2,  7,-16,-14,-13, -1,  0, -1, -3, -6,-12, -1, -9, -3, -5,  0,-24, -8,  4;
/M: SY='R'; M=  1, -7,-22, -6,  0, -8,-13,-12, -7,  7, -5,  7, -7, -9,  6, 10, -5, -7, -5,-20, -5,  0;
/M: SY='A'; M= 20, -6,-23,-10, -8,-10, -4,-17, 11, -6,  1,  7, -4,-16, -3,-14,  3,  7, 12,-37,-21, -9;
/M: SY='A'; M= 23, -5,-23, -8, -7,-12, -1,-20,  5, -4, -4,  5, -3,-14, -1,-13,  5,  7,  8,-37,-26, -7;
/M: SY='I'; M=  2, -9,-19,-10, -7, -6,-15, -8,  5, -6,  4,  4, -6,-17, -5, -8, -4, -1,  5,-22, -4, -7;
/M: SY='L'; M= -2,-15,-21,-18,-17, 16,-17,-15, 14,-12, 17,  5,-13,-25,-14,-14, -8,  1, 15,-17, 12,-17;
/M: SY='H'; M=-10,-17,-32,-19, -8, -5,-21, 47, -3,-12,  4, 12,-11,-11, -6,-10, -9, -9, -7,-25,  7, -8;
/M: SY='Y'; M=-10,-16,-29,-16,-14, 13,-16, -1, -1,-11,  9, -3,-14,-19,-10, -8, -9, -7,  3, -6, 17,-14;
/M: SY='Q'; M= -3, -5,-22, -3,  3,-11, -8, -8,-14,  1, -7, -5, -7,-10,  6,  2, -3, -9,-13, -8, -3,  3;
/M: SY='F'; M=-10,-19,-16,-30,-25, 41,-21,-20, 19,-15, 25,  2,-12,-34,-23,-16,-13, -6, 16,-11, 19,-25;
/M: SY='I'; M=  7, -4,-11, -8, -1,-12,-13,-15,  8, -5,  0,  1,  0,-18, -7,-14, -2,  2,  7,-30,-13, -3;
/M: SY='Y'; M= -5,-12,-21,-11, -5, -1,-15,-13, -8,  0, -3, -1,-10,-13, -1,  2, -3, -3, -3, -5,  5, -6;
/M: SY='I'; M=  1, -8,-17,-21,-19, -2, -8,-17, 30,-13,  9,  5,  5,-26,-15,-21, -7,  1, 18,-31,-10,-19;
/M: SY='H'; M=-17,-19,-46,-19,  1,-28,-29,122,-20,-17,-10, 17,-10,  8,  7, -5,-10,-18,-29,-44,  0,  3;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-25,-12,  6,-32,-11,  4,-23,  6,-24,-33,-26, 86, -2,-11, -9, -1,-31,-27,-18, -3;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-30,-46,-37, 91,-29,-28,  0,-10, 21,-17,-12,-39,-28,-10,-11,-19,  9, 12, 32,-37;
/M: SY='R'; M= -1, -8,-21, -6, -5, -9,-12, -9, -5, -2, -4, -2, -7,-10,  1,  4, -4, -5, -3,-18, -3, -4;
/M: SY='D'; M=  0, 40,-23, 68, 14,-44, -9,-17,-34,  2,-11,-24, 12, -9, -6,-10,  0, -9,-20,-37,-14,  5;
/M: SY='G'; M=  2,  0,-37, -9,-18,-29, 70,-28, -9, -9,-19,-17,  0,-10,-17,-19,  0,-17,-26,  4,-30,-18;
/M: SY='N'; M=  0, 39,-10, 10,-10,-10,  0,-10,  0,  0,-20,  0, 78,-29,-10,-20,  1, 10,-20,-69,-39,-10;
/M: SY='G'; M=  0,  0,-34, -6, -6,-23, 45,-25,-13,  5,-19, -7,  0, -4,-12,-10,  1,-15,-25, -2,-22, -9;
/M: SY='R'; M= -9,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-28,  9,-19,  0,-19, -9, 28, 75,-10,-28,-10, -2, -1,  0;
/M: SY='T'; M=  7, -8,-18,-16,-19, -8,-19,-15, 15,-11,  8,  6,  0,-16,-10,-22,  5, 25, 17,-39, -5,-15;
/M: SY='G'; M= 17, -2,-28, -6, -6,-20, 18,-16, -4, -5,-12, -4, -1,-10,  0,-12,  8,  2, -7,-26,-28, -6;
/M: SY='R'; M= -8,-18,-20,-13,-11, -1,-18,-12,-16,  3, -8,  1,-16,-15, 16, 46, -9,-19, -4, -4,  4, -5;
/M: SY='L'; M=  1,-12,-15,-17,-13, 12,-17,-13, 15,-12, 18, 10,-11,-26,-13,-15, -9,  1, 13,-23,  7,-13;
/M: SY='L'; M= -2,-14,-12,-20,-16, 16,-17,-16, 17,-13, 20,  9,-13,-28,-16,-16,-11, -1, 14,-17, 10,-16;
/M: SY='I'; M=  4,-11,-15,-19,-13,  2,-14,-11, 10, -6, 10, 10, -3,-24,-10,-14, -4,  5,  8,-26, -5,-13;
/M: SY='N'; M= -1,  5,-18,  3, -3,-11,-12, -4, -4, -5, -2, -2,  9,-15, -5,-11, -2,  1, -6,-32, -8, -5;
/M: SY='Y'; M= -5,-12,-19,-13, -9,  5,-15,-11,  4, -8, 10,  4,-13,-20, -7, -9, -9, -3,  3, -8, 12, -9;
/M: SY='F'; M= -7,-17,-19,-22,-16, 23,-21,-14, 12,-11, 19,  3,-14,-25,-14,-13,-11, -4, 11,-11, 17,-16;
/M: SY='L'; M= -3,-10, -2,-12, -9, 10,-17,-12, 15,-15, 28, 16,-15,-27,-15,-17,-15,  0,  9,-23, 14,-10;
/M: SY='M'; M=  0,-10,-17,-11, -3, -8,-15, -3,  0, -2,  2,  7, -9,-15,  0, -2, -5, -4,  0,-20, -3, -3;
/M: SY='Q'; M=  1, -6,-20, -4,  3,-13,-14, -7,-11,  5, -7,  3, -6, -9, 12, 12, -4, -7, -9,-19, -6,  5;
/M: SY='N'; M=  3,  6,-19,  0, -2,-11, -6, -6, -7,  0,-10, -1, 15,-15, -1, -7,  0, -1,-10,-33,-17, -3;
/M: SY='G'; M= -1,  4,-31, -2,-12,-24, 45,-20,-10, -6,-14,-14,  4,-12,-13,-14, -1,-14,-23, -6,-22,-13;
/M: SY='Y'; M=-13,-16,-29,-13,-12, 11,-17, -7,  2, -9, 12, -2,-17,-18, -9, -8,-11, -7,  5,  1, 24,-13;
/M: SY='P'; M= -2, -7,-19, -4, -1,-14,-11, -8, -7, -1, -4, -6,-10,  3, -1, -6, -4, -2, -8,-20, -5, -2;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-20,-15, -8, -1,-14, -9,  3, -6,  4, -6,-15,  6,-10,-12, -9, -2, -1,-19,  2,-11;
/M: SY='A'; M=  1, -3,-19, -2, -6, -8,-12,-14, -2, -4, -1, -5, -4,-10, -5, -8, -2,  0,  0,-25, -6, -7;
/M:         M= -2, -9,-20, -9, -7, -7, -6,-17, -3, -4, -4, -7, -9, -7, -8, -8, -4, -4, -4, -9, -5,-10;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='I'; M= -5,-11,-20,-14,-12,  2,-13,-14,  9, -9,  7, -3, -9,-17,-11,-13, -5, -1,  7,-10,  6,-13; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M:         M= -2, -9,-20, -9, -4, -6, -9,-11, -3, -2, -4, -6, -9, -1, -5, -6, -2, -2, -5,-14, -3, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S'; M=  0, -5,-20, -5, -6, -3,-11,-11, -2, -3, -1, -5, -5, -9, -8, -9,  1,  1, -1,-20, -2, -9; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A'; M=  2, -3,-13, -2,  1,-11, -9, -9,  0, -2,  0, -2, -5, -5, -3,-10, -1,  0, -1,-19, -6, -1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S'; M=  1, -1, -9, -1,  1, -7, -4, -5, -4,  0, -4, -4, -2, -4, -1, -2,  4,  1, -4,-12, -5,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='D'; M=  1,  8,-19, 11,  5,-21,-11, -3,-15,  2,-11, -6,  8, -7,  4, -4,  2, -2,-15,-31,-14,  4;
/M: SY='R'; M=  0, -9,-22, -7, -1,-10,-13,-11,-11,  8, -9,  4, -9, -8,  8, 20, -4,-10, -7,-16, -6,  0;
/M: SY='D'; M=  5,  5,-19, 10, 10,-22, -9,-12,-13,  4, -8, -5,  0, -6,  4, -6,  1, -3,-11,-26,-14,  7;
/M: SY='D'; M=  4,  4,-19, 11, 10,-20,-13,-11,-16,  5, -8, -6, -3, -6,  7,  0,  0, -5,-11,-23,-11,  7;
/M: SY='Y'; M=-26,-25,-40,-16,-19, 25,-25, -8, -1,-11, 24, -4,-29,-24,-13, -5,-17, -8,  9, 28, 57,-19;
/M: SY='Y'; M= -9,-15,-28,-14,-15,  9,-19,-10,  7, -7, 13,  3,-14,-22,-10, -5,-11, -3, 10, -6, 22,-15;
/M: SY='E'; M=  4,  0,-18,  4,  6,-17,-12, -9,-10,  3, -7, -2, -2, -9,  5,  1,  1, -3, -8,-25,-11,  4;
/M: SY='A'; M= 11, -6,-19, -8, -5, -9, -7,-13,  1, -3, -1,  5, -5,-16, -2, -8,  0,  1,  3,-29,-14, -6;
/M: SY='L'; M= -3,-12,-13,-16,-14, 11,-18,-11, 17,-12, 22, 12,-12,-26,-15,-15,-12,  1, 13,-22, 12,-14;
/M: SY='A'; M=  7, -1,-19,  1,  5,-16,-10, -9, -7,  2, -6,  1, -3,-10,  4, -2,  0, -3, -6,-27,-13,  4;
/M: SY='A'; M=  6, -1,-20,  0,  3,-16, -7,-10,-10,  2, -7, -1, -1,-10,  5, -1,  1, -2, -9,-24,-12,  3;
/M: SY='A'; M=  6, -7,-23, -9, -9, -5, -4,-16,  0, -5, -2, -5, -7,-14, -7,-10,  3,  2,  2,-21, -8,-10;
/M: SY='D'; M=  1,  3,-24, 10,  1,-18,-12, -8,-13, -1, -6, -8, -2, -8,  4, -2,  0, -1, -9,-24, -5,  0;
/M: SY='A'; M=  4, -3,-19, -3,  0,-14,-11, -9, -5,  0, -6, -1, -1, -9,  2, -3,  1,  0, -4,-26,-11, -1;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M=  2,  4,-23,  5,  0,-22,  6, -9,-13,  0,-12, -9,  3, -2, -3, -9,  3, -2,-16,-24,-17, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -2,  2,-17,  4,  0,-15, -2,-11,-11, -1, -7, -6,  1, -8, -1, -3, -2, -5,-12,-15, -9, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -1,  5,-15,  8,  0,-12, -5, -6, -9,  0, -5, -5,  2, -6, -2, -4, -1, -2, -8,-17, -6, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='L'; M= -5,-11,-17,-11, -6, -3,-13,-13,  2, -5,  5,  1,-12,-14, -7, -9, -7, -4,  1, -7,  5, -7;
/M: SY='E'; M=  3, -1,-17,  2,  8,-19,-11,-10,-14,  4, -8, -3, -4, -6,  8,  1,  1, -3,-11,-21,-11,  7;
/M: SY='P'; M=  0,  0,-21,  5,  8,-25, -7, -7,-15,  3,-11,-11, -6, 13,  2, -7, -2, -4,-16,-23,-13,  4;
/M: SY='F'; M=-11,-20,-17,-25,-19, 21,-16,-20, 12,-13, 16,  2,-18,-30,-17,-12,-14, -8,  9, 10, 19,-19;
/M: SY='I'; M=  5, -8,-13,-12, -7, -7,-13,-17, 11, -5,  4,  4, -3,-18, -8,-14, -1,  4, 10,-29, -9, -8;
/M: SY='D'; M=  1,  4,-18,  8,  6,-17,-10, -9,-13,  4, -7, -3,  1, -8,  1, -2, -1, -5,-11,-25,-10,  3;
/M: SY='F'; M=-20,-26,-27,-29,-20, 38,-18,-21, -2,-11, 11,-10,-24,-28,-16, -8,-13,-16,  2, 34, 31,-21;
/M: SY='I'; M= -3,-16,-15,-24,-20, 18,-19,-16, 21,-12, 19,  8, -9,-30,-18,-16,-11, -2, 17,-19,  8,-20;
/M: SY='M'; M=  0, -7,-17, -5, -2, -6,-13,-12, -3, -2,  2,  3, -9,-15, -1, -1, -5, -4, -2,-18,  0, -2;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-20,  8,  9,-21,-11, -5,-18,  5,-11, -6, -1, -4,  6,  1,  1, -6,-15,-22,-11,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 40 in 39 different sequences
Number of true positive hits 40 in 39 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Fido
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
39 sequences

ANKX_LEGPH  (Q5ZXN6), BEPA_BARHE  (Q6G2A9), DOC_BPP1    (Q06259), 
DOC_MYCS2   (A0QRY0), FICD_AEDAE  (Q17A75), FICD_CAEBR  (A8X181), 
FICD_CAEEL  (Q23544), FICD_CULQU  (B0W429), FICD_DANRE  (Q6ZM51), 
FICD_DROAN  (B3MK83), FICD_DROER  (B3N5J3), FICD_DROGR  (B4JBN5), 
FICD_DROME  (Q8SWV6), FICD_DROMO  (B4KFW6), FICD_DROPE  (B4GJC1), 
FICD_DROPS  (Q29JP8), FICD_DROSE  (B4I1V5), FICD_DROSI  (B4Q4M7), 
FICD_DROVI  (B4LQT7), FICD_DROWI  (B4MUQ2), FICD_DROYA  (B4P0E1), 
FICD_HUMAN  (Q9BVA6), FICD_MOUSE  (Q8BIX9), FICD_NEMVE  (A7SVT1), 
FICD_RAT    (Q6AY47), FICD_XENTR  (B4F6I5), FIC_ECOLI   (P20605), 
FIC_SALTY   (P20751), IBPA_HISS2  (Q06277), NMFIC_NEIMB (Q7DDR9), 
RIR2_OSHVF  (Q6R7K3), SOFIC_SHEON (Q8E9K5), VBHT_BARSR  (E6Z0R3), 
VOPS_VIBPA  (Q87P32), Y459_NEIMB  (Q9K0V1), Y4LH_RHISN  (P55548), 
Y5363_DICDI (Q54RJ6), Y977_HAEIN  (P44088), YZ38_AQUAE  (O66426)
» More

PDB
[Detailed view]
24 PDB

2G03; 2JK8; 2VY3; 2VZA; 3DD7; 3DD9; 3EQX; 3K33; 3KH2; 3LET; 3N3U; 3S6A; 3SE5; 3SHG; 3SN9; 3ZC7; 3ZCB; 3ZCN; 3ZEC; 3ZLM; 4BEP; 4BER; 4BES; 4ITR
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission