Entry: PS51461

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NC1_FIB
Accession [info] PS51461
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUL-2009 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51461
Associated ProRule [info] PRU00793

Name and characterization of the entry

Description [info] Fibrillar collagen C-terminal non-collagenous (NC1) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=227;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=227;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5615940; R2=0.0238547; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6080.52898; R2=47.95273; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=312; N_SCORE=10.0; H_SCORE=22049; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13993; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-22,  5,  5,-23,-12, -7,-21, -4,-21,-15, 10,-10, -1, -9,  9,  7,-16,-29,-17,  3;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-31,  8, 29,-27,-13, -6,-24,  7,-24,-16, -2,-11, 10, -3,  4, -7,-15,-30,-20, 23;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-13,-23,-17,  1,-26,-18,  8,-17,  3,  2,-19,-23,-13,-20, -8, -1,  8,-18, -1,-16;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='F'; M= -6,-12,-18, -9, -5,  2,-20, -9, -5,-13, -5,  0,-15,-20, -8,-15, -8,-10, -5,-16, -4, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='G'; M= 15,-15,-13,-15,-15,-21, 19,-19,-19,-14,-17,-15,-10,-15,-14,-14,  3, -5,-11,-22,-22,-15; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M= -3, -1,-19,  1,  6,-19,-12, -6,-20,  0,-19,-11,  2,-12,  5, -3, 13,  7,-16,-23,-12,  5; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L'; M=-10,-36,-11,-36,-29,  5,-38,-28, 24,-24, 29, 15,-30,-30,-24,-24,-20,-10, 16,-21, -6,-29;
/M: SY='N'; M= -4,  0,-21, -4, -5,-24, -2,-13,-18,  1,-20,-14,  6,-15, -7, -7,  4,  0,-13,-29,-21, -6;
/M: SY='E'; M= -2,  5,-24,  7, 16,-26,-10, -6,-26,  8,-24,-14,  5,-11,  7,  2, 16, -1,-22,-31,-21, 12;
/M: SY='L'; M= -9,-37,-11,-37,-28,  3,-38,-28, 21,-21, 31, 16,-30,-29,-21,-23,-20, -9, 15,-20, -7,-28;
/M: SY='N'; M=-11,  6,-26,  4,  2,-21, -9,  3,-27,  3,-26,-17,  9,-16,  1,  4,  3, -8,-26,-27,-11,  0;
/M: SY='N'; M= -9, -2,-23, -4,  1,-16,-14, -8,-17,  0,-13, -3,  5,-17,  5, -6,  4, -6,-16,-24,-14,  2;
/M: SY='Q'; M= -1,  2,-23,  4, 16,-26,-13, -7,-25,  7,-22,-10,  2,-10, 17, -1, 13,  1,-18,-27,-18, 16;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-10,-25,-24, -4,-24,-25, 24,-23, 12,  6,-23,-24,-23,-24,-15, -8, 20,-24,-10,-24; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-36,  9, 36,-30,-20,  0,-30, 12,-26,-14,  0,-12, 24, 10, -2,-10,-22,-28,-18, 31;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-19, -1,  0,-16,-13,  4,-20, -6,-19, -9,  5,-15,  3, -7,  5, -1,-16,-23, -6,  0;
/M: SY='M'; M=-11,-32,-12,-32,-26, 11,-34,-23, 17,-20, 20, 24,-27,-28,-17,-21,-17,-11, 12,-13, -2,-22;
/M: SY='K'; M= -4,-14,-22,-18, -5,-18,-21,-13,-17, 11,-10, -5,-11,-10,  0,  8, -6, -9,-14,-26,-15, -4;
/M: SY='N'; M= -5, -1,-23, -4, -2,-24, -1, -8,-25, -3,-24,-16, 10, -8, -3, -3,  9,  2,-22,-29,-20, -3;
/M: SY='P'; M= -4,-20,-26,-11,-10,-37,-17,-20,-27,-10,-27,-19,-20, 60,-10,-19, -7, -9,-17,-39,-29,-10;
/M: SY='T'; M= -8, -6,-21, -4,  2,-19,-22,-14, -7, -7, -8, -4, -4,-16, -1,-11, -4,  5, -1,-27,-17,  1;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-30,-11,-17,-30, 50,-17,-39,-15,-37,-27,  0,-20,-16,-11, -1,-19,-30,-21,-29,-17;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T'; M=  3, -3,-14, -2,  2,-21,-12,-13,-17, -3,-17,-11,  4,-10, -2, -9, 21, 25,-11,-26,-20,  1;
/M: SY='R'; M=-11, -2,-31, -7, 13,-29,-20,  2,-30, 21,-22, -9,  1,-14, 20, 25, -4,-11,-24,-27,-15, 14;
/M:         M=-11, -2,-21,  0, -4,-13,-21,-14,-10, -2,-10, -5, -5,-18, -5,-10, -5, -7,-10,-27,-15, -5;
/M: SY='N'; M= -2,  7,-21, -3,  0,-26, -5,  3,-25,  1,-23,-14, 23,-16,  3,  4, 10, -2,-22,-33,-17,  0;
/M: SY='P'; M= -9,-19,-30,-10,-11,-39,-10,-20,-31,-11,-31,-21,-17, 59,-11,-20, -9,-11,-21,-37,-30,-11;
/M: SY='A'; M= 19,-12,-11,-15,-13,-22, 11,-17,-16,-13,-17,-14, -6,-15,-13,-13,  5, -5, -8,-29,-22,-13;
/M: SY='R'; M=-10, -8,-30,-18,  2,-30,-20, -2,-30, 25,-20,-10,  0,-18, 10, 45, -8,-10,-28,-30,-20,  2;
/M: SY='T'; M=  3, -5,-11, -6, -6,-20,-12,-15,-14, -6,-14,-10,  5,-10, -6,-10, 21, 34, -8,-24,-20, -6;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='C'; M=  5,-29, 79,-29,-36,-20,-26,-29,-10,-27,-10,-10,-29,-27,-27,-27, -7, -9, -9,-21,-20,-27;
/M: SY='K'; M=-12, -7,-28, -9,  6,-19,-23,  0,-21, 14,-14, -8, -5,-17,  7,  9, -7,-12,-18,-23, -7,  5;
/M: SY='D'; M=-20, 40,-30, 60, 20,-30,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-10,  0,-20,  0,-10,-30,-40,-30, 10;
/M: SY='L'; M= -9,-36,-10,-36,-29, -1,-39,-30, 27,-23, 30, 16,-30,-29,-23,-24,-20, -9, 20,-24,-10,-29;
/M: SY='F'; M=-13,-10,-24,-10, -7,  8,-22, -7,-16, -1,-14, -8,-12,-23, -5, -8, -9,-14,-16,-11,  6, -7;
/M: SY='L'; M= -4,-32,-11,-32,-22, -3,-31,-24,  9,-11, 23, 20,-24,-24,-12,-14,-12, -9,  6,-19,-11,-20;
/M: SY='C'; M= -4,-13, 18,-16,-14,-18,-21,  2,-13,-15,-16,-11, -8,-21,-12,-16, -4, -8,-11,-25,-10,-11;
/M: SY='H'; M=-11,  2,-25,  1, -2,-12, -4, 27,-27,-11,-28,-19,  6,-18, -5,-10,  3,-12,-26,-23, -2, -4;
/M: SY='P'; M= -2, -8,-21, -6, -2,-26,-12, -9,-24, -4,-23,-13, -2, 15,  3,-10,  9, -3,-19,-29,-16, -1;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='N'; M= -4,  9,-27,  9, 11,-28,  1, -6,-28, -2,-29,-20, 12,-14,  1, -4,  5, -7,-23,-32,-23,  7;
/M: SY='F'; M= -4,-26,-14,-26,-20,  4,-22,-19, -6,-16,  0, -1,-23,-19,-16,-18, -9, -6, -7, -2, -3,-20;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-28,  2, 13,-30,-15, -7,-27, 10,-25,-15,  6,  2,  7, -1,  5, -1,-20,-32,-21, 11;
/M: SY='D'; M=-11, 22,-23, 30,  9,-25, -8, -8,-24, -6,-29,-17, 14,-12,  0,-14, 11, -3,-24,-35,-24,  4;
/M: SY='G'; M=  2,-10,-25,-10,-13,-28, 34,-17,-32,-14,-31,-22, -2,-17, -9,-14,  2, -8,-22,-21,-25,-12;
/M: SY='E'; M=-10,-11,-24, -6,  4,-14,-23, -8,-16, -7,-14, -9, -9, -5, -1,-11, -4,  3,-10,-19, -4,  2;
/M: SY='Y'; M=-18,-28,-19,-28,-20, 30,-29, 13, -9,-20, -9, -9,-20,-30,-13,-20,-18,-15, -9, 16, 58,-20;
/M: SY='W'; M=-17,-33,-18,-33,-25,  5,-15,-15,-19,-25,-15, -9,-31,-32,-18,-26,-22,-16,-16, 58, 17,-25;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-10,-29,-25, -4,-34,-28, 30,-24, 17, 10,-27,-26,-24,-27,-15, -6, 26,-29,-11,-25;
/M: SY='D'; M=-19, 35,-30, 52, 20,-30,-11, -9,-30, -7,-37,-26,  9,-10,  6,-16,  0,-10,-29,-37,-27, 13;
/M: SY='P'; M= -6,-16,-26, -8, -8,-36,-16,-18,-28, -8,-28,-18,-14, 54, -8,-18,  0, -6,-20,-38,-28, -8;
/M: SY='N'; M=-19, 26,-30,  9,  3,-30, -3,  9,-30,  1,-29,-17, 52,-19,  6,  1,  9, -1,-29,-37,-19,  4;
/M: SY='Q'; M= -7,-10,-27, -9,  0,-24,  0,-12,-23, -5,-15, -7, -6,-17, 13, -6, -4,-13,-17,-21,-17,  4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-27,-10,-19,-29, 50,-20,-36,-19,-36,-27,  0,-19,-19,-19,  1,-11,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='C'; M=  3,-13, 34,-14,-20,-20,-17,-20,-13,-17,-13,-11,-10,-21,-16,-20,  4, -4,-13,-26,-20,-16;
/M: SY='A'; M=  1, -9,-17, -9, -7,-21,-16,-10,-10, -8,-14,-10, -8, -5, -9,-10,  0, -1, -7,-31,-17, -8;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-26,-13,  0,-24,-13, -8,-21,  6,-13, -4, -2,-18,  9, 11, -6,-10,-17,-26,-17,  1;
/M: SY='D'; M=-17, 34,-27, 51, 16,-29,-11,-11,-27,-10,-36,-27,  9,-10, -1,-19,  1, -2,-26,-37,-29,  7;
/M: SY='A'; M= 27,-17, -5,-18, -8,-17, -4,-14,-13, -7,-12,-10,-14,-12, -7, -6, 11, -1, -6,-26,-13, -8;
/M: SY='I'; M= -9,-31,-12,-31,-27, 12,-34,-25, 24,-25, 15, 10,-30,-29,-25,-28,-20, -9, 20,-18,  0,-26;
/M: SY='K'; M= -7,-10,-23,-14,  1,-21,-22,-11,-17, 18, -7,  0, -5,-16,  6, 10,  0, -7,-14,-26,-17,  2;
/M: SY='V'; M=  7,-25, -8,-25,-16,-13,-22,-26, 18,-16,  3,  4,-23,-17,-16,-24, -8,  1, 26,-30,-13,-16;
/M: SY='F'; M=-18,-15,-22,-14,-16, 25,-25,  8,-11,-21,-12, -9,-14,-29,-16,-21,-13,-12,-15, -2, 23,-17;
/M: SY='C'; M= -1,-30, 77,-30,-39,-17,-31,-30, -4,-30, -6, -7,-30,-30,-30,-30,-11,-10, -5,-21,-19,-30;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='N'; M=-14, 23,-28, 13,  4,-29,  2,  2,-30, -2,-30,-20, 40,-17,  0, -5, 11, -2,-28,-36,-22,  2;
/M: SY='M'; M=-13,-20,-20,-18, -6,  9,-28,-12, -2,-11,  1, 16,-18,-23, -2,-13,-11,-13, -3,-10, -1, -4;
/M: SY='T'; M= -2,  0,-22,  3, 15,-24,-16,-10,-20,  0,-20,-13,  2,-10,  6, -5, 12, 17,-12,-26,-19, 12;
/M: SY='G'; M=  5, -6,-18, -9,-12,-25, 17,-16,-24,-12,-24,-19,  4,-15,-12,-13,  8,  7,-16,-25,-24,-12;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G'; M=  1, -6,-19, -6,-12,-19, 36,-13,-25,-12,-25,-19,  1,-13,-12,-13,  3,-11,-19,-14,-19,-12; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -3,-11,-27,-11,-12,-27, 26,-13,-28,-14,-29,-19, -5,-12, -8,-16, -4,-15,-19,-23,-22,-11;
/M: SY='E'; M=-11,-10,-27, -6, 13,-12,-19, -4,-26, -5,-22,-13,-13,-19,  8, -9, -7,-12,-20, 10,  2, 10;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 10, 50,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='C'; M=  0,-25, 50,-25,-33,-21, -9,-28,-12,-26,-14,-12,-23,-26,-26,-28, -9,-11, -8,-21,-21,-26;
/M: SY='I'; M= -6,-31,-10,-31,-26, -4,-36,-30, 34,-25, 18, 11,-30,-26,-25,-29,-20, -6, 32,-29,-10,-26;
/M: SY='S'; M=  4,-12,-12,-14, -8, -9,-12, -2,-14, -8,-13, -7, -5,-16, -6, -9, 10,  5,-11,-19, -3, -8;
/M: SY='P'; M= 10,-21,-17,-15,-11,-30,-13,-21,-18,-11,-19,-14,-21, 33,-11,-17, -3, -5, -8,-35,-25,-11;
/M: SY='N'; M=-10,  2,-24,  3,  0,-27,-16,-10,-22,  0,-20,-14,  5, -4,  0, -1,  2,  4,-19,-31,-22, -1;
/M: SY='P'; M= -8, -6,-24, -3,  3,-26,-21,-15,-18,  2,-18, -9, -7,  6,  0, -8, -2,  4,-10,-29,-21,  2;
/M: SY='Q'; M= -1,  3,-22,  5,  7,-27, -7, -9,-24,  2,-22,-13,  2, -9,  9, -5,  6, -6,-19,-30,-20,  7;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-13, -1,  4,-15, -7, -4,-11,  0,-12, -5,  5, -8,  6, -4,  7,  0, -8,-19,-11,  5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-10,-27,-22, -7,-24,-26, 22,-20, 11,  7,-25,-22,-20,-25,-16, -5, 24,-26,-11,-22; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-22, -9, -9,-24,-17,-16,-19, -9,-20,-14,-16, 28, -9,-12, -7, -9,-13,-31,-21, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='L'; M= -9,-19,-17,-22,-15, -4,-25,-15, -2, -7,  4,  2,-13,-16,-10, -8,-11, -9, -5,-20, -8,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K'; M=  9, -8,-16,-12, -1,-23, -6,-12,-20, 14,-16,-10, -5,-11,  0,  5,  7, -2,-13,-27,-19, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='H'; M= -1, -3,-17, -8, -4,-17,-11, 13,-18, -5,-18,-12,  7,-14, -3, -2,  6,  2,-14,-25, -8, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='W'; M=-25,-31,-20,-32,-23,  8,-19, -2,-26,-24,-19,-10,-29,-33,-15,-23,-24,-18,-26, 76, 23,-23; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='Y'; M=-12,-15,-17,-17,-13,  0,-17, -1,-11,-13,-12, -8, -7,-13, -9,-16, -8, -8, -9,  4, 14,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K'; M= -2,-12,-19,-13, -3,-21,-12,-13,-11,  1,-13, -7, -8,-10, -4, -1, -2, -3, -5,-27,-17, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='S'; M= -4, -1,-19,  3,  3,-18,  3,-11,-18, -6,-16,-12, -1,-12, -3,-11,  4, -7,-15,-21,-18,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K'; M= -2,  4,-21,  4,  4,-22,  3, -9,-23,  7,-22,-15,  3,-10, -1, -3,  5, -7,-18,-24,-19,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='S'; M=  1, -3,-16, -5, -7,-22,  3,-10,-18, -7,-20,-13,  6, -1, -7,-11,  9, -2,-14,-27,-19, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M=  2,  1,-12,  4,  1,-15,  6, -8,-15, -6,-16,-12, -1, -7, -4, -8,  2, -2,-10,-16,-14, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D'; M=-10, 16,-17, 20,  9,-17, -7, -5,-17,  4,-19,-13,  6, -6,  2, -4,  0, -5,-15,-21,-15,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M= -7,  0,-25, -6, -5,-24, 15, -2,-29,  4,-26,-18,  8,-14, -5, -1,  0,-11,-23,-22,-17, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='H'; M=-11,-11,-22,-14, -8, -4,-11, 24,-21, -9,-21,-14, -2,-15, -4, -6, -4,-13,-20,-10, 17, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M:         M= -5,-14,-18,-15, -5,-10,-22,-13, -2, -6, -6, -3,-12,-18, -6, -4, -6, -2,  0,-23,-11, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='W'; M=-23,-25,-20,-28,-22, 14,-19, -7,-21,-22,-15, -9,-20,-33,-16,-22,-20,-16,-22, 55, 22,-22; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='F'; M=-14,-26,-15,-26,-23, 35,-26, -8,  3,-22,  2,  1,-24,-29,-21,-23,-17,-14, -1,  3, 24,-23; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='S'; M=  6, -4,-14, -6, -5,-20,  9,-10,-22, -2,-20,-12,  3,-12, -3, -3, 18, -1,-19,-23,-19, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D'; M=-12, 14,-25, 24, 16,-23,-16,-10,-19, -6,-21,-17,  1,-11,  1,-12, -1,  0,-16,-29,-22,  9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='M'; M=-10,-19,-15,-21,-12, -3,-26, -9, -1, -8,  4, 15,-13,-19,  0, -5, -9, -5, -1,-14, -6, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='T'; M=-10, -2,-19, -2,  0,-17,-20,-12, -8, -3, -9, -5,  1,-15, -4, -8, -2,  4, -6,-26,-17, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M=  6, -4,-20, -4, -7,-25, 17,-13,-26, -8,-26,-19, -1,-15, -8, -5,  2,-10,-20,-26,-23, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M=  4,-13,-22,-13,-18,-24, 40,-19,-28,-17,-27,-21, -5,-18,-17,-17,  0,-15,-21,-20,-25,-18; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='F'; M=-12, -7,-20, -6, -8,  4,-19,  1,-15, -9,-14,-10, -6,-21, -9,-14, -1, -6,-16,-15,  3, -9;
/M: SY='Q'; M= -3, -7,-23, -9,  8,-23,-20, -8,-19, 10,-11, -5, -6,-13, 13,  2, -1, -5,-12,-25,-15,  9;
/M: SY='F'; M=-15,-32,-16,-32,-29, 33,-34,-19, 14,-28, 11,  6,-30,-35,-28,-28,-20,-15,  5, -6, 12,-29;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-19,  5,  2,-24, -3, -8,-23, -5,-25,-17,  3, -5, -3,-12, 16,  5,-19,-29,-21,  0;
/M: SY='Y'; M=-19,-31,-19,-31,-21, 28,-31, 17, -8,-20, -7, -8,-21,-30,-11,-20,-20,-19, -9, 18, 66,-21;
/M: SY='D'; M= -7,  1,-25,  5, -2,-23,  4,-15,-18,-12,-22,-16, -2,-17, -7,-17, -1,-10,-13,-29,-22, -5;
/M:         M= -7, -6,-19, -1, -5,-16,-14,-18, -4,-13, -7, -2,-10,-18, -9,-18, -7, -9, -3,-28,-19, -7;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-21, -3,  3,-26, -7, -7,-23, -2,-23,-14, -2,  0,  0, -6, 10, -3,-17,-31,-20,  2;
/M: SY='D'; M=-10,  9,-31, 14, 14,-30, -1, -7,-31, -1,-32,-21,  7, -8,  4, -5,  2, -9,-25,-31,-24, 10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='T'; M= -7, -8,-17,-10, -8,-15,-21, -1, -1,-13,-10, -6, -4,-17,-10,-16, -5,  4,  4,-28, -9, -9;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 19,-29,-20,  3,-30,  9,-20, -1,  0,-10, 48, 10,  0,-10,-20,-20, -9, 29;
/M: SY='L'; M=-10,-36,-10,-36,-27,  0,-37,-27, 20,-18, 31, 28,-27,-27,-15,-18,-17,-10, 13,-18,-10,-24;
/M: SY='T'; M=  0, -6,-14, -6, -4,-23,-16,-15,-16, -4,-15,-11,  0,-11, -2, -2,  8, 28, -9,-24,-20, -4;
/M: SY='F'; M= -2,-28,-14,-28,-24, 33,-22,-14, -2,-24,  0, -2,-27,-31,-24,-24,-11,-14, -6, -4, 13,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-39,-10,-39,-30,  0,-40,-30, 21,-20, 38, 21,-30,-30,-20,-20,-20,-10, 11,-20,-10,-29;
/M: SY='R'; M=-10,-18,-23,-24, -8,-19,-26,-10,-14,  8, -1,  5, -9,-21,  4, 23,-11,-10,-15,-25,-16, -6;
/M: SY='L'; M= 11,-31, -6,-31,-21, -9,-23,-26,  7,-16, 19,  7,-26,-21,-16,-16, -7, -6,  6,-24,-14,-21;
/M: SY='L'; M= -5,-27,-14,-27,-15, -9,-30,-21,  4,-11, 19, 13,-20,-23, -2,-12, -9, -8,  1,-21,-11,-13;
/M: SY='S'; M= 11, -1,-10, -1, -1,-20, -1,-11,-19, -1,-19,-10,  8,-10, -1,-10, 37, 11,-18,-30,-20, -1;
/M: SY='T'; M=  3, -9,-13,-11, -8,-14,-13,-14,-12, -4,-12, -8, -1,-15, -7, -7, 12, 14, -8,-24,-15, -8;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-29,  4, 20,-21,-16, 14,-27,  6,-26,-16,  4,-13,  9,  0,  6, -8,-22,-26, -8, 16;
/M: SY='A'; M= 35,-19, -4,-19,-11,-21,  8,-20,-14,-11,-14,-13,-17,-11,-11,-11,  9, -3, -4,-29,-21,-11;
/M: SY='T'; M= -4,-10,-17,-13, -7,-13,-18,  4,-13, -7,-14, -9, -2,-16, -6, -5,  4, 10, -9,-23, -8, -7;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-30,-20,  0,-30, 10,-20,  0,  0,-10, 50, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 30;
/M: SY='N'; M=-12,  8,-23,  1, -1,-22,-12, -4,-17, -3,-17, -3, 22,-16,  4, -5,  5,  1,-15,-30,-17,  1;
/M: SY='I'; M= -6,-31,-11,-31,-25,  2,-34,-28, 29,-25, 14,  9,-30,-26,-25,-29,-20, -6, 29,-25, -5,-25;
/M: SY='T'; M=  5, -9, -9, -9, -8,-20,-15,-18,-12, -8,-12,-10,  0,-10, -8,-10, 15, 39, -3,-22,-20, -8;
/M: SY='Y'; M=-17,-32,-17,-32,-22, 19,-30,  3, -3,-21, -2, -3,-24,-30,-14,-22,-21,-16, -2, 16, 44,-22;
/M: SY='H'; M=-13,  0,-26, -4,  0,-17,-17, 27,-24, -4,-24,-15,  6,-11,  2, -4, -5,-13,-21,-25,  1,  0;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='K'; M= -9, -4,-26,-10,  6,-24,-20, -4,-23, 25,-17, -7, -2,-14, 12, 12,  0, -9,-17,-26,-12,  8;
/M: SY='N'; M=-13, 17,-30, 10, -2,-30, 15, -3,-33, -6,-33,-23, 30,-18, -2, -8,  5, -8,-29,-32,-23, -2;
/M: SY='S'; M= 12,-13, -8,-13, -9,-16,-10,-18, -2, -9, -8, -4, -8,-14, -9,-16, 16,  4,  1,-30,-17, -9;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='V'; M=  3,-26, -7,-26,-20, -7,-26,-25, 21,-19, 11, 10,-25,-20,-18,-21,-12, -5, 22,-25,-11,-19; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='A'; M= 14,-13,-10,-17,-10,-18, -6,-15, -8, -7, -9, -3, -7,-14, -7, -6,  1, -3, -1,-27,-17, -9; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='Y'; M=-15,-24,-15,-24,-18, 22,-22,  4, -5,-18, -6, -5,-19,-25,-12,-18,-16,-14, -6, 18, 39,-18; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='Y'; M= -9,-16,-13,-16, -7,  1,-20,  1, -3, -8,  3,  7,-11,-16, -1, -8, -9, -9, -3, -6,  8, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D'; M=-12, 17,-21, 19,  6,-19, -7, -1,-21, -3,-24,-17, 15,-12,  0, -5,  4, -4,-21,-26,-13,  2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -4,  6,-19, 11, 11,-20,-12, -8,-16,  0,-18,-12,  1, -8,  5, -6,  4,  2,-12,-23,-16,  8; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S'; M=  5,  1,-13, -1,  4,-19, -4, -5,-17,  0,-16, -8,  7, -9,  7, -3, 14,  1,-13,-23,-14,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='N'; M= -1,  5,-14,  3,  0,-19, -7, -6,-16, -3,-16,-10, 11,-10,  2, -5, 10, 10,-12,-23,-15,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G'; M=  0, -3,-21, -5, -7,-22, 19,-10,-25, -4,-24,-17,  2,-14, -7, -3,  0,-10,-20,-21,-20, -8; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='N'; M= -3,  6,-16,  2,  3,-18, -4, -3,-17,  0,-15, -9, 17,-12,  1, -5, 16,  2,-16,-25,-15,  2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='Y'; M= -9,-25,-11,-25,-18,  6,-25, -8,  4,-14, 11,  7,-17,-20,-10,-14,-12, -6,  2, -4, 13,-17; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='D'; M=  1,  8,-20, 10,  8,-24, -8, -9,-22,  7,-23,-15,  4,-10,  2, -4,  9, -3,-18,-31,-21,  5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -7, -9,-22,-12, -5, -8, -6, -4,-22,  6,-18,-11, -5,-17,  0, -4,  1,-10,-17,-13,  1, -4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A'; M= 25,-16, -8,-16, -9,-25, -4,-18,-16, -9,-16,-13,-14,  6, -9,-11,  6, -2, -6,-33,-22, -9;
/M: SY='L'; M=  4,-30,-10,-29,-21, -2,-25,-24,  7,-18, 11,  5,-27,-17,-18,-20,-11, -7,  7,-22, -9,-21;
/M: SY='I'; M=-10,-24,-17,-27,-19,-11,-32,-20, 13,-10,  8,  6,-19,-25,-14, -2,-16,-10,  8,-28,-13,-18;
/M: SY='F'; M=-18,-34,-16,-34,-28, 28,-32,-14,  3,-25,  9,  4,-30,-35,-22,-25,-21,-16, -5, 13, 21,-28;
/M: SY='K'; M= -9,-11,-23,-15,  1,-21,-23,-10,-17, 12, -8,  3, -6,-16,  9, 12, -4, -2,-12,-23,-16,  3;
/M: SY='G'; M=  6, -9,-19, -9,-13,-25, 26,-18,-27,-13,-27,-20,  0,-15,-13,-15, 11,  2,-19,-23,-25,-13;
/M: SY='S'; M=  2,-10,-13,-12, -7,-12,-12, -8,-13, -7,-10, -6,  0,-16, -2,-10, 12,  3,-12,-21, -6, -6;
/M: SY='N'; M=-13, 25,-25, 18,  4,-28, -2,  1,-28, -2,-30,-20, 38,-16,  0, -6, 15,  0,-28,-38,-22,  2;
/M: SY='D'; M=-12, 18,-32, 27, 14,-30,  9, -9,-33, -8,-37,-27,  8,-14, -1,-14,  1,-12,-28,-32,-27,  7;
/M: SY='I'; M=-11,-10,-20, -6, -7, -4,-24,-18,  1,-13, -5, -4,-16,-22,-13,-20,-12,-10,  1,-24,-10,-10;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-31, 10, 31,-27,-18, -5,-24,  5,-22,-13, -4,-11, 18, -2,  0, -9,-16,-28,-18, 26;
/M: SY='W'; M=-17,-37,-14,-37,-29,  5,-32,-25,  5,-25, 12,  9,-33,-33,-21,-25,-23,-14, -1, 26,  2,-28;
/M: SY='T'; M=  2,-10,-14,-12, -7,-20,-15,-15,-10, -2, -9, -6, -1,-14, -6, -5,  9, 14, -5,-27,-18, -7;
/M: SY='A'; M=  4,-18,-15,-16,-11,-10,-16, -3,-11,-14,-14,-11,-17, -4,-10,-16, -6, -9, -5,-20,  4,-11;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M=-12, 19,-33, 28, 31,-29,-14, -3,-29,  3,-31,-21,  8,-11, 13, -6,  4, -7,-24,-33,-22, 24;
/M: SY='S'; M=  3,  0,-23, -3,  3,-27,  5,-10,-26,  1,-24,-17,  6,-14, -2, -5,  7, -2,-18,-29,-22,  1;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='N'; M= -6,  4,-21,  0, -2,-26, -8, -5,-22, -1,-22,-14, 14,  1, -2, -1,  5,  1,-19,-31,-20, -3; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='S'; M= -5, -9,-22, -9, -9,-19, -2,-11,-21, -6,-21,-14, -1,  2, -8, -7,  4, -6,-19,-26,-18, -9; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='R'; M= -9,-14,-15,-17, -8, -4,-20, -6, -4,  2, -2, -2,-10,-17, -5,  3, -9, -9, -5,-12,  1, -8; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='F'; M=-10,-13,-12,-12, -9, 21,-15, -1, -4,-12, -4, -3,-12,-18,-10,-12, -9,-10, -6,  4, 17, -9; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
/M: SY='R'; M= -5, -2,-13, -5,  0,-14, -9, -2,-13,  4,-10, -5,  4, -8,  5, 11,  0,  5,-11,-14,-10,  1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='Y'; M=-14,-27,-18,-26,-19, 11,-28,  2, -2,-18, -5, -5,-21,-14,-12,-20,-17,-14, -2,  0, 34,-19; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='T'; M= -7, -1,-22, -5,  4,-23,-16, -7,-18,  7,-17,-11,  7,-13,  1,  6,  3, 10,-14,-26,-18,  2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='V'; M=  0,-26,-12,-26,-15,-11,-28,-26, 20,-17,  9,  6,-25,-20,-16,-24,-15, -1, 26,-28,-12,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-32,-12,-31,-27,  0,-36,-27, 17,-22, 21, 10,-26,-22,-22,-22,-16, -4, 11,-22, -9,-27;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q'; M= -8,-10,-24,-10,  5,-15,-22,  0,-13, -1,-12, -5, -8,-17,  8, -3, -5, -8, -7,-21, -2,  5;
/M: SY='D'; M=-20, 40,-30, 60, 20,-30,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-10,  0,-20,  0,-10,-30,-40,-30, 10;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -7,-14,-30, 48,-17,-37,-17,-37,-28,  4,-19,-16,-17,  1,-15,-28,-22,-28,-15;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='Q'; M= -5, -6,-21, -9,  2,-17,-17,  2,-22,  7,-18, -9, -1,-13,  9,  0,  5,  1,-16,-19, -3,  4;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-17, -5,  1,-22,-14, -9,-16,  3,-16, -9, -3,-11,  3, -5,  7,  7, -9,-27,-16,  1;
/M: SY='N'; M=-11,  7,-28, -5,  2,-27,-11, 10,-29, 11,-24,-14, 21,-17,  7, 15,  1, -7,-26,-32,-15,  3;
/M: SY='D'; M= -6,  7,-21, 10,  5,-26,-13,-11,-23,  0,-24,-14,  6, -5,  5, -7, 10,  8,-18,-30,-22,  4;
/M: SY='G'; M= 11, -8,-18, -9,-11,-25, 27,-16,-27,-11,-27,-19,  1,-15,-11,-14, 14, -6,-20,-26,-25,-11;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='S'; M=  0, -3,-17, -3,  6,-19,-12, -9,-12,  3,-13, -7,  0,-10,  4, -5,  7,  2, -6,-24,-14,  5; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='W'; M=-11,-23,-17,-24,-15, -7,-23,-15, -8,-10, -7, -4,-19,-15,-11,-13,-13, -1, -4,  7,  0,-15; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M:         M= -4, -8,-20, -7, -7,-20,  0,-14,-13, -8,-17,-11, -5,-16, -7, -7, -1, -5,-10,-25,-19, -7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='K'; M=  0, -4,-22,-10,  4,-25,-13, -2,-25, 21,-19,-10,  0,-12,  7, 10,  7, -6,-19,-28,-16,  5;
/M: SY='T'; M=  4, -7,-12, -8, -5,-21,-14,-16,-15,  0,-14,-10,  1,-10, -5, -6, 16, 29, -7,-24,-20, -5;
/M: SY='V'; M= -2,-26,-13,-26,-20, -8,-21,-26, 17,-20,  3,  3,-23,-21,-20,-27,-14,  3, 24,-25,-10,-20;
/M: SY='I'; M= -9,-31,-12,-31,-26,  7,-34,-24, 25,-25, 14,  8,-29,-28,-24,-28,-20, -9, 23,-20,  1,-26;
/M: SY='E'; M=  2,  2,-27,  7, 27,-26,-13, -6,-25,  8,-24,-16, -1,-10, 10, -2, 10, -4,-17,-30,-20, 21;
/M: SY='Y'; M=-13,-29,-17,-30,-21, 13,-32, -8,  6,-16,  6,  2,-24,-28,-16,-20,-18,-13,  4, -6, 22,-21;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-22, -7,  3,-13,-18, -7,-16,  7,-11, -7, -3,-16,  1,  6, -3, -8,-15,-22,-12,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='T'; M= -1, -7,-14, -6, -2,-21,-19,-17,-13, -7,-13,-11,  0,-10, -6, -9, 10, 41, -3,-22,-20, -3;
/M: SY='G'; M= -6, -8,-28, -9, -7,-31,  9,-13,-32,  1,-28,-18, -1, -2, -3, -2, -1, -7,-23,-27,-24, -6;
/M: SY='K'; M= -8, -7,-25,-11,  1,-28,-20,-11,-22, 18,-18, -9, -2, -3,  5,  9, -2,  0,-14,-29,-20,  2;
/M: SY='T'; M=  5,-18,-13,-17,-13,-21,-18,-21, -4,-13, -7, -6,-13,  1,-13,-16, -3,  7,  2,-30,-19,-13;
/M: SY='D'; M=  1,  3,-21,  9,  9,-25, -7,-12,-21, -4,-23,-17, -1,-11, -1, -8,  7,  3,-15,-30,-22,  5;
/M: SY='R'; M= -8, -3,-27, -8,  6,-29,-17, -2,-29, 13,-21, -9,  2,-16, 18, 29, -1, -7,-26,-28,-18,  8;
/M: SY='L'; M=-10,-38,-11,-38,-29,  5,-38,-28, 19,-21, 34, 17,-30,-30,-21,-22,-20,-10, 11,-18, -6,-29;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-20,-20, 70,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-10,-30,-28,  0,-38,-29, 36,-28, 17, 10,-30,-28,-28,-30,-20, -8, 30,-28, -8,-28;
/M: SY='V'; M=  1,-27,-11,-29,-19,-11,-27,-25, 17,-15,  8,  6,-25,-21,-16,-15,-15, -4, 21,-29,-13,-19;
/M: SY='D'; M=-20, 40,-30, 60, 20,-30,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-10,  0,-20,  0,-10,-30,-40,-30, 10;
/M: SY='F'; M= -8,-31,-13,-31,-27, 19,-31,-22, 16,-25, 12,  6,-29,-31,-25,-27,-18,-11, 11,-13,  4,-27;
/M: SY='A'; M= 21,-20, -7,-21,-10,-13, -8,-12,-11, -8, -9, -5,-16,-14, -7, -6,  5, -4, -5,-22, -8,-10;
/M: SY='P'; M=-10,-25,-22,-19,-17,-16,-25,-21,-12,-15, -8, -7,-22, 24,-15,-21,-10,-10,-10,-28,-17,-17;
/M: SY='S'; M= -3,-11,-17,-13, -8,-12, -9, -7,-15, -2,-12, -6, -1,-17, -4, -7, 10, -3,-14,-20, -5, -8;
/M: SY='D'; M=-19, 38,-31, 57, 22,-30,-11, -9,-30, -9,-39,-29,  9,-10,  1,-19,  0,-10,-29,-39,-29, 12;
/M: SY='I'; M=-12,-32,-13,-32,-28, 12,-34,-24, 18,-26, 14, 10,-30,-31,-24,-27,-20,-11, 13, -6,  1,-27;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-26,-10,-18,-29, 51,-19,-36,-18,-36,-27, -1,-19,-18,-19,  4,-16,-27,-21,-29,-18;
/M: SY='G'; M=  1, -7,-25, -7,-13,-27, 34,-17,-30,-15,-29,-23,  1,-19,-14,-16,  1,-14,-23,-24,-26,-14;
/M: SY='P'; M=  0,-12,-23, -7,  1,-30,-16,-15,-21, -5,-21,-12,-12, 21,  1,-12,  0, -3,-11,-32,-22,  1;
/M: SY='N'; M=-14, 15,-26, 15,  4,-26,-12, -1,-21, -7,-26,-18, 16, -8, -3,-12,  1, -2,-18,-35,-20,  1;
/M: SY='Q'; M= -9,  0,-30,  2, 21,-29,-20, -3,-27,  8,-21, -7,  0,-11, 32,  8,  0, -2,-18,-23,-14, 25;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-29,  4, 17,-21,-19, -1,-24,  8,-23,-15, -1,-13,  6,  2, -1, -3,-18,-26,-15, 13;
/M: SY='F'; M=-14,-27,-20,-26,-26, 26,-23,-17,  1,-26, -3, -3,-26,-21,-26,-28,-17,-16, -3, -8,  8,-26;
/M: SY='G'; M= -3,-13,-28,-13,-20,-19, 45,-14,-35,-20,-35,-26, -4,-22,-19,-20, -3,-20,-27,-14,-15,-20;
/M: SY='I'; M= -9,-33,-12,-33,-26,  9,-34,-25, 19,-21, 19, 16,-29,-28,-20,-25,-19, -9, 17,-17, -2,-24;
/M: SY='E'; M=-14,  1,-28,  5, 11, -9,-21,  1,-19, -7,-19,-14, -1,-19,  0,-11, -5, -7,-17,-20, -4,  6;
/M: SY='I'; M=-12,-24,-15,-26,-23,  8,-30,-19, 13,-20, 11, 11,-17,-28,-19,-22,-15, -9,  9,-18, -2,-22;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-23, -8,-15,-26, 35,-18,-31,-15,-31,-23,  2,-16,-15,-16,  9, -3,-23,-22,-26,-15;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-25, -7,-10,-26,-21,-19,-19,-13,-22,-15,-17, 37,-12,-21, -7, -9,-14,-35,-23,-11;
/M: SY='V'; M=  8,-25,-10,-25,-18,-15,-12,-27, 13,-18, -1,  1,-24,-18,-18,-25,-11, -3, 23,-29,-15,-18;
/M: SY='C'; M= -6,-28, 52,-28,-33,-13,-24,-25,-16,-26,-14,-10,-27,-30,-24,-27, -8,-10,-16,  8,-11,-26;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-17,-26,-26, 32,-15,-14, -4,-26, -5, -5,-25,-32,-26,-26,-13,-16, -8, -3, 12,-26;
/M: SY='M'; M= -4,-20,-15,-21,-11,-11,-23,-15,  0, -6,  2,  8,-14,-19, -3, -9, -3, -4,  2,-21, -7, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 49 in 49 different sequences
Number of true positive hits 49 in 49 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Fibrillar collagen NC1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
49 sequences

CAF1_EPHMU  (P18856), CO1A1_BOVIN (P02453), CO1A1_CANFA (Q9XSJ7), 
CO1A1_CHICK (P02457), CO1A1_CYNPY (Q9YIB4), CO1A1_HUMAN (P02452), 
CO1A1_MOUSE (P11087), CO1A1_RAT   (P02454), CO1A2_BOVIN (P02465), 
CO1A2_CANFA (O46392), CO1A2_CHICK (P02467), CO1A2_HUMAN (P08123), 
CO1A2_LITCT (O42350), CO1A2_MOUSE (Q01149), CO1A2_ONCMY (O93484), 
CO1A2_RABIT (Q28668), CO1A2_RAT   (P02466), CO2A1_BOVIN (P02459), 
CO2A1_CHICK (P02460), CO2A1_HUMAN (P02458), CO2A1_MOUSE (P28481), 
CO2A1_RAT   (P05539), CO2A1_XENLA (Q91717), CO2A1_XENTR (Q6P4Z2), 
CO3A1_CHICK (P12105), CO3A1_HUMAN (P02461), CO3A1_MOUSE (P08121), 
CO3A1_RAT   (P13941), CO5A1_CRILO (Q60467), CO5A1_HUMAN (P20908), 
CO5A1_MOUSE (O88207), CO5A1_RAT   (Q9JI03), CO5A2_HUMAN (P05997), 
CO5A2_MOUSE (Q3U962), CO5A3_HUMAN (P25940), COA_ACRMI   (B8V7R6), 
COBA1_HUMAN (P12107), COBA1_MOUSE (Q61245), COBA1_RAT   (P20909), 
COBA2_BOVIN (Q32S24), COBA2_HUMAN (P13942), COBA2_MOUSE (Q64739), 
COOA1_HUMAN (Q17RW2), COOA1_MOUSE (Q30D77), CORA1_HUMAN (Q8IZC6), 
CORA1_MOUSE (Q5QNQ9), CORA1_RAT   (Q80ZF0), CRA1A_DANRE (C7DZK3), 
CRA1B_DANRE (A0MSJ1)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

4AE2; 4AEJ; 4AK3

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission