PROSITE entry PS51493
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AV_NSP4_PRO |
| Accession [info] | PS51493 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2010 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51493 |
| Associated ProRule [info] | PRU00826 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Arterivirus nsp4 proteinase domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=202; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=197; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5510452; R2=0.0069948; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11591.2197266; R2=29.2987804; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1137; H_SCORE=44904; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=851; H_SCORE=36524; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='L'; M= -5,-10,-35,-10,-13, 0,-10,-12, 12,-12, 25, 15,-12, -5,-10,-17, -5, 0, 12,-32,-15,-10; /M: SY='F'; M=-25,-35,-51,-39,-39, 67,-39,-20, 25,-34, 52, 26,-30,-29,-29,-35,-25,-19, 16, -2, 46,-34; /M: SY='R'; M=-10, 0,-40, 0, 0,-40,-20, 20,-20, 40,-30, 0, 10, 0, 10, 50, 0, 0,-20, 30,-40, 10; /M: SY='A'; M= 10, 8,-23, 10, 8,-35, 10, -2, -8, 3,-18, -8, 8, 7, 5, 0, 7, 7, -5,-51,-33, 8; /M: SY='R'; M= -3, 7,-40, 7, 7,-43, -8, 15,-18, 24,-23, -5, 8, 12, 12, 27, 2, 2,-15,-25,-42, 10; /M: SY='K'; M= 1, 7,-36, 7, 7,-45, 9, -1,-15, 16,-20, -5, 7, 3, 5, 13, 5, 5,-12,-46,-40, 5; /M: SY='C'; M= -4, -9, 26,-11,-11,-38,-11, -5,-13, -5,-34,-18, -5, 8,-11, 0, 5, -1,-13,-41,-26,-11; /M: SY='B'; M= 5, 8,-20, 8, 5,-32, 3, -1, -7, 4,-22, -8, 5, 8, 2, 6, 8, 8, -7,-32,-32, 2; /M: SY='B'; M= 2, 12,-32, 12, 10,-42, 9, 7,-17, 11,-22,-10, 10, 3, 9, 8, 5, 5,-13,-44,-40, 7; /M: SY='B'; M= 0, 20,-30, 20, 20,-30, 10, 10,-10, 10,-30,-10, 10, 0, 10, 10, 10, 0,-10,-40,-30, 10; /M: SY='V'; M= 5, -2,-15, -7, -5,-15, 0,-12, 13,-10, 8, 7, -2, 0, -5,-10, 0, 5, 18,-50,-25, -5; /M: SY='V'; M= 2, -5,-22,-13, -5,-12, 2,-18, 18,-18, 16, 11, -5, -8, -8,-20, -5, 2, 28,-62,-27, -8; /M: SY='F'; M= -2, 1,-16, -2, -7, 3, -4, -2, -3, -9,-11, -5, 1, -4, -7, -7, 1, -2, -8,-21, 0, -9; /M: SY='V'; M= 0,-10,-20,-20,-10, 0,-10,-20, 30,-20, 30, 20,-10,-10,-10,-20,-10, 0, 40,-60,-20,-10; /M: SY='Y'; M=-14,-19,-17,-27,-24, 50,-27,-12, 12,-31, 10, 2,-18,-24,-24,-28,-16,-14, 4,-19, 51,-27; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='A'; M= 7, 5, -5, 2, -3,-22, 5, -5, 1, -5, -7, -2, 5, 5, -3, -5, 5, 7, 3,-38,-27, -3; /M: SY='A'; M= 10, 7,-11, 7, 3,-30, 10, -5, -5, -3,-17, -7, 5, 10, 0, -3, 10, 10, -5,-44,-30, 0; /M: SY='C'; M=-14,-22, 35,-27,-30, 11,-24,-13, -1,-27, -6,-10,-19,-19,-27,-27, -9,-12, -6,-32, 25,-27; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='A'; M= 10, 8, -5, 8, 0,-30, 10, -2, -8, 0,-18, -8, 8, 10, 0, 0, 10, 10, -8,-35,-30, 0; /M: SY='G'; M= 10, 12,-34, 14, 14,-50, 33, -6,-20, -6,-30,-20, 12, 0, 4,-16, 10, 8,-12,-70,-48, 4; /M: SY='G'; M= 10, 10,-23, 10, 8,-45, 33, -8,-18, -8,-28,-18, 10, 2, 0,-15, 10, 10,-10,-61,-45, 0; /M: SY='L'; M= -3, -9,-37,-12, -6, -3,-11,-13, 19,-13, 27, 16, -9,-10, -6,-18,-10, -3, 26,-51,-19, -4; /M: SY='F'; M=-37,-42,-49,-55,-55, 89,-55,-20, 4,-45, 18, -2,-32,-45,-42,-24,-30,-35,-14, 76, 79,-52; /M: SY='A'; M= 10, 3,-15, 3, 0,-30, 10, -7, -3, 0,-13, -3, 3, 10, 0, 0, 10, 10, -3,-45,-30, 0; /M: SY='I'; M= 0, -5,-33, -2, -2,-13,-12, -3, 10, 2, 0, 5, 3, -5, -2, 2, -2, 0, 5,-37,-20, -2; /M: SY='D'; M= 5, 17,-34, 20, 20,-40, 18, 5,-15, 5,-30,-15, 12, 0, 10, 0, 10, 3,-12,-55,-38, 10; /M: SY='G'; M= 5, 15,-30, 15, 15,-40, 25, 0,-15, 0,-30,-15, 10, 0, 5, -5, 10, 5,-10,-55,-40, 5; /M: SY='D'; M= 0, 18,-39, 20, 20,-39, 6, 10,-15, 17,-28,-10, 12, 0, 12, 14, 5, 0,-12,-45,-35, 15; /M: SY='I'; M= 5, -7,-20, -9, -7,-14, -4,-12, 13, -9, 6, 6, -5, 12, -7, -9, 1, 5, 13,-55,-26, -7; /M: SY='V'; M= -2, -6,-27,-13, -6,-11,-10,-13, 19, -7, 19, 16, -6, -8, -6, -7, -8, 0, 27,-53,-24, -6; /M: SY='C'; M= -3,-16, 31,-24,-19,-17,-11,-20, 10,-24, -3, -3,-13, -8,-19,-21, -3, -3, 15,-63,-14,-19; /M: SY='L'; M=-10,-20,-40,-25,-20, 15,-20,-20, 30,-20, 50, 30,-20,-15,-15,-25,-15, -5, 35,-40,-10,-15; /M: SY='A'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-30, 10,-10, 0, 0,-10, 0, 0, 10, 0, 0, 10, 10, 0,-50,-30, 0; /M: SY='I'; M= 8, 3,-20, 3, 3,-19, 3,-12, 9,-12, -9, -3, -2, 6, -4,-12, 6, 8, 7,-58,-23, -4; /M: SY='A'; M= 10, 7,-10, 7, 2,-30, 10, -5, -5, -2,-17, -7, 5, 10, 0, -2, 10, 10, -5,-42,-30, 0; /M: SY='H'; M=-10, 10,-30, 10, 10,-20,-10, 50,-20, 10,-20,-10, 10, 0, 30, 20, 0,-10,-20,-20, 0, 20; /M: SY='L'; M= -5,-15,-31,-23,-15, 8,-15,-20, 30,-20, 41, 25,-15,-13,-13,-23,-13, -3, 37,-49,-15,-13; /M: SY='C'; M=-11,-17, 18,-22,-20, -9,-16,-16, 8,-21, 3, 0,-16,-13,-19,-21, -6, -8, 10,-50, -9,-19; /M: SY='G'; M= 10, 8,-20, 8, 5,-40, 25, -7,-13, -5,-23,-13, 8, 5, 0,-10, 10, 10, -8,-55,-40, 0; /M: SY='D'; M= 3, 13,-38, 16, 16,-42, 10, 8,-17, 13,-30,-13, 13, 0, 10, 10, 8, 2,-15,-38,-40, 10; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='B'; M= 0, 15,-34, 15, 15,-40, 14, 5,-15, 11,-28,-10, 10, 0, 7, 9, 8, 3,-12,-46,-38, 7; /M: SY='K'; M= -6, 3,-39, 3, 1,-31, -8, 3, -8, 22, -6, 9, 5, 0, 3, 22, 0, 2, -8,-32,-31, 3; /M: SY='V'; M= 8, 6,-20, 3, 6,-23, 6,-12, 7,-12, -9, -3, -2, 6, -2,-12, 6, 8, 9,-60,-28, -2; /M: SY='R'; M= -3, -3,-30, -5, -3,-27,-10, 2, -2, 14, -9, 5, 2, 0, 2, 19, 0, 2, 1,-13,-32, 2; /M: SY='L'; M= -5,-15,-29,-22,-15, 7,-15,-20, 30,-20, 39, 25,-15,-12,-12,-22,-12, -2, 38,-51,-15,-12; /M: SY='D'; M= 5, 13,-25, 15, 10,-40, 5, 5,-15, 12,-23,-10, 13, 5, 8, 9, 8, 5,-15,-41,-35, 8; /M: SY='C'; M=-11,-21, 38,-27,-27, 10,-17,-15, -1,-31,-16,-16,-16,-21,-29,-31, -8,-11, -6,-46, 27,-29; /M: SY='V'; M= 2, 3,-30, -2, 3,-23, 4, -4, 5,-10, 2, 3, 0, -5, 3,-12, -3, 2, 15,-60,-32, 0; /M: SY='G'; M= 10, 12,-35, 15, 15,-50, 33, -5,-20, -5,-30,-20, 12, 0, 5,-15, 10, 8,-12,-70,-48, 5; /M: SY='F'; M= -1, -6,-21, -9,-11, 8, -6,-10, 3,-16, -4, -2, -6, -4,-11,-13, -1, -1, -2,-29, 5,-14; /M: SY='R'; M= -2, 3,-29, 3, 0,-23, -5, 5, -6, 13,-11, 7, 5, 0, 3, 16, 3, 3, -6,-18,-28, 3; /M: SY='Y'; M=-13, -5,-36, -8, -8, 14,-21, 10, -3,-11, 7, 2,-10,-18, -1,-13,-13,-10, -3,-27, 15, -6; /M: SY='C'; M= 0,-10, 24,-10,-10,-27, -8,-12, -2,-15,-20,-15, -5, -5,-13,-15, 0, -3, -1,-64,-15,-10; /M: SY='L'; M= -7,-17,-40,-17,-17, 12,-17,-17, 24,-17, 37, 22,-17,-10,-15,-22,-10, -2, 22,-37, -8,-15; /M: SY='E'; M= 7, 7,-35, 9, 12,-32, 5, -3, -2, 0, -9, -5, 7, 0, 7, -5, 5, 2, 1,-63,-32, 7; /M: SY='F'; M=-30,-40,-40,-50,-50,110,-50,-20, 20,-50, 30, 10,-30,-40,-40,-40,-30,-30, 0, 20,100,-50; /M: SY='K'; M= 0, 10,-42, 12, 12,-45, 0, 5,-15, 23,-20, -4, 10, 3, 10, 20, 5, 3,-15,-44,-37, 10; /M: SY='C'; M= -5,-11, 25,-16,-13,-31,-10,-13, -3, -9,-17, -9, -8, -5,-13, -6, 0, -3, -1,-56,-19,-13; /M: SY='K'; M= -2, 12,-37, 12, 12,-40, 0, 5,-12, 19,-22, -5, 7, 3, 7, 19, 5, 3,-12,-41,-35, 7; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20, 0, 20, 0, 10, 0,-20,-70,-40, 20; /M: SY='Y'; M=-30,-35,-13,-45,-45,105,-50, -9, 9,-45, 14, -1,-30,-45,-40,-40,-30,-30,-11, 15,116,-45; /M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10, 0,-10,-20,-10, 0, 10, 0,-10, 10, 10, 0,-60,-30, 0; /M: SY='F'; M= -3, -8,-27, -8,-11, 15,-13, -8, 7,-16, 2, 0, -3,-10,-11,-15, -8, -5, 2,-30, 10,-11; /M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10, 0,-10,-20,-10, 0, 10, 0,-10, 10, 10, 0,-60,-30, 0; /M: SY='V'; M= 0, -1,-32, -3, 2,-22, -8, -2, 5, 3, 0, 6, 2, -5, 2, 4, -3, 0, 10,-38,-30, 2; /M: SY='C'; M= -2,-14, 23,-22,-17,-16,-10,-20, 12,-22, 0, 0,-12, -8,-17,-20, -3, -2, 17,-62,-16,-17; /M: SY='P'; M= 10, 3,-20, 3, 3,-35, 5, -5, -5, -3,-18, -8, 0, 30, 0, -3, 10, 10, -5,-58,-40, 0; /M: SY='B'; M= 0, 9,-32, 9, 9,-19, 0, 7, 1, 2,-11, -2, 5, -3, 7, 2, 2, 0, 1,-45,-24, 4; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='W'; M=-34,-32,-54,-42,-42, 17,-42,-15,-18,-20, 7,-10,-27,-34,-29, 8,-20,-27,-23,124, 5,-34; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M= 2, 7,-35, 7, 7,-43, -3, 9,-15, 13,-20, -7, 5, 25, 9, 13, 5, 5,-13,-50,-45, 7; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='E'; M= 5, 11,-31, 11, 13,-29, 6, -2, -1, -2,-14, -6, 6, 0, 6, -5, 6, 3, 1,-58,-30, 6; /M: SY='W'; M=-17,-18,-39,-25,-25, 19,-25,-15, -6,-25, -7,-12,-17,-20,-23, -9,-10,-15,-14, 37, 14,-28; /M: SY='P'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-40, 0, 0,-10, 0,-20,-10, 0, 50, 0, 0, 10, 10,-10,-60,-50, 0; /M: SY='K'; M= -2, 10,-42, 10, 10,-45, -5, 12,-17, 22,-20, -5, 7, 13, 12, 22, 3, 3,-15,-43,-43, 10; /M: SY='L'; M= -5,-10,-40,-10,-10, 0,-10,-15, 15,-15, 25, 15,-15, -5,-10,-20, -5, 0, 15,-40,-15,-10; /M: SY='H'; M= -2, 15,-45, 18, 18,-41, -2, 24,-20, 18,-23,-10, 13, 0, 22, 18, 0, -2,-15,-43,-31, 20; /M: SY='F'; M=-27,-37,-45,-45,-45, 88,-45,-20, 23,-42, 41, 18,-30,-35,-35,-37,-27,-25, 8, 9, 73,-42; /M: SY='C'; M= 3, -1, 28, -3, -6,-32, 1,-12, -7,-16,-29,-19, -4, 3,-11,-14, 8, 3, -7,-56,-21,-11; /M: SY='H'; M= 2, 12,-36, 14, 14,-37, 0, 23,-17, 7,-22,-12, 10, 13, 20, 8, 3, 0,-13,-49,-32, 17; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='Q'; M= 5, 10,-29, 12, 12,-31, 2, 10,-12, 5,-17,-10, 7, 12, 13, 3, 5, 2,-10,-43,-31, 10; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='W'; M=-22,-19,-31,-26,-26, 14,-32, -1,-17, -7,-15,-12,-14,-25,-19, 10,-12,-17,-24, 57, 19,-21; /M: SY='R'; M= 5, 0,-25, 0, 0,-33, 2, -2, -5, 11,-15, 0, 3, 7, 3, 14, 7, 7, -5,-28,-33, 3; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='R'; M= -5, 0,-35, 0, 0,-40,-15, 15,-18, 31,-28, -2, 8, 12, 8, 38, 2, 2,-18, 9,-42, 8; /M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10, 0,-10,-20,-10, 0, 10, 0,-10, 10, 10, 0,-60,-30, 0; /M: SY='Y'; M=-21,-21, 8,-28,-31, 70,-36, 0, -2,-31, -5,-10,-21,-36,-31,-31,-21,-21,-18, 1, 92,-31; /M: SY='W'; M=-49,-47,-12,-65,-65, 4,-59,-23,-42,-35,-31,-43,-37,-49,-50, 11,-22,-42,-49,167, 10,-57; /M: SY='C'; M=-15,-21, 29,-27,-29, 16,-25,-12, -1,-27, -4, -8,-19,-20,-27,-27,-10,-12, -6,-29, 29,-27; /M: SY='P'; M= 10, 3,-20, 3, 3,-33, 7, -7, -3, -3,-15, -5, 0, 21, 0, -3, 10, 10, -3,-55,-35, 0; /M: SY='M'; M= -1, 2,-29, 2, 0,-14, -1, -5, 3, -5, 2, 4, -3, -1, -3, -8, 2, 2, 3,-37,-22, -3; /M: SY='V'; M= 7, 0,-16, -3, -3,-22, 5,-10, 6, -5, -1, 3, 0, 5, -3, -5, 5, 7, 9,-48,-27, -3; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='L'; M= -3, -8,-38,-11, -6, -4,-11,-13, 18,-13, 27, 16, -8,-10, -6,-18, -8, -3, 23,-51,-19, -6; /M: SY='D'; M= 10, 17,-36, 25, 22,-45, 10, 7,-17, 7,-27,-17, 17, 3, 15, 0, 3, 3,-10,-59,-37, 22; /M: SY='P'; M= 2, -3,-38, -1, -1,-21, -3, -6, 1, -3, 5, 4, -3, 8, -1, -8, -1, 2, 4,-49,-29, 2; /M: SY='G'; M= 10, 13,-35, 15, 15,-50, 32, -5,-20, -5,-30,-20, 13, 0, 5,-15, 10, 7,-13,-70,-47, 5; /M: SY='L'; M=-18,-28,-46,-33,-31, 45,-31,-20, 27,-28, 50, 27,-26,-23,-23,-30,-20,-13, 24,-18, 22,-26; /M: SY='L'; M=-10,-22,-40,-25,-22, 20,-22,-20, 32,-20, 50, 30,-20,-15,-17,-25,-15, -5, 33,-37, -5,-17; /M: SY='G'; M= 10, 10,-23, 10, 8,-45, 33, -8,-18, -8,-28,-18, 10, 2, 0,-15, 10, 10,-10,-61,-45, 0; /M: SY='G'; M= 2, 10,-33, 10, 10,-40, 12, 0,-12, 11,-22, -7, 7, 3, 5, 8, 7, 5,-10,-47,-37, 5; /M: SY='G'; M= 7, 12,-32, 15, 15,-39, 17, 0,-12, 3,-25,-12, 10, 3, 7, -2, 8, 5, -7,-56,-37, 10; /M: SY='V'; M= -1, -6,-22,-10,-11, 3, 0,-12, 3,-19, 0, -1, -4, -9,-11,-19, -4, -1, 4,-37, -4,-14; /M: SY='C'; M= -5,-15, 76,-20,-20,-35,-10,-20,-10,-30,-40,-30,-15, -5,-25,-25, 5, -5,-10,-70,-10,-25; /M: SY='F'; M=-25,-35,-50,-40,-40, 70,-40,-20, 25,-35, 50, 25,-30,-30,-30,-35,-25,-20, 15, 0, 50,-35; /M: SY='C'; M= -8,-20, 74,-28,-25,-27,-15,-23, -2,-33,-26,-22,-18,-10,-27,-28, 0, -8, 1,-70, -7,-27; /M: SY='F'; M=-37,-42,-49,-55,-55, 89,-55,-20, 4,-45, 18, -2,-32,-45,-42,-24,-30,-35,-14, 76, 79,-52; /M: SY='A'; M= 10, 3,-15, 3, 0,-30, 10, -7, -3, 0,-13, -3, 3, 10, 0, 0, 10, 10, -3,-45,-30, 0; /M: SY='G'; M= 5, 8,-31, 8, 8,-41, 13, -5,-11, 6,-20, -8, 5, 5, 3, 3, 7, 7, -8,-52,-38, 3; /M: SY='C'; M= -5,-17, 79,-22,-25,-38,-13,-15,-15,-25,-40,-30,-13, 6,-25,-20, 5, -5,-15,-63,-16,-25; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20, 0, 20, 0, 10, 0,-20,-70,-40, 20; /M: SY='A'; M= 10, 10, 0, 10, 0,-30, 10, 0,-10, 0,-20,-10, 10, 10, 0, 0, 10, 10,-10,-30,-30, 0; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='A'; M= 10, 10, 0, 10, 0,-30, 10, 0,-10, 0,-20,-10, 10, 10, 0, 0, 10, 10,-10,-30,-30, 0; /M: SY='P'; M= 10, 2,-20, 2, 2,-38, 2, -2, -8, -2,-20,-10, 0, 41, 0, -2, 10, 10, -8,-60,-45, 0; /M: SY='V'; M= 0,-13,-20,-20,-13, 5,-13,-20, 33,-20, 30, 20,-10,-10,-13,-20,-10, 0, 37,-57,-15,-13; /M: SY='I'; M= 0,-15,-20,-20,-15, 10,-15,-20, 35,-20, 30, 20,-10,-10,-15,-20,-10, 0, 35,-55,-10,-15; /M: SY='D'; M= 8, 10,-35, 13, 13,-38, 8, 5,-10, 5,-18, -8, 8, 5, 12, 2, 8, 5, -8,-55,-35, 10; /M: SY='D'; M= 10, 12,-37, 17, 17,-47, 14, 3,-17, 3,-27,-17, 12, 13, 10, -5, 5, 5,-10,-67,-45, 15; /M: SY='D'; M= 10, 18,-43, 26, 26,-46, 10, 6,-16, 6,-28,-18, 16, 2, 16, -2, 10, 2,-16,-68,-38, 16; /M: SY='G'; M= 10, 10,-28, 10, 10,-45, 33,-10,-15,-10,-28,-18, 8, 2, 0,-18, 10, 10, -8,-68,-45, 0; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='D'; M= -3, 2,-36, 4, 4,-11, -3, 0, 1, 0, 4, 4, -1, -5, 2, -5, -3, -3, 3,-32,-17, 4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-10,-23,-40,-25,-23, 20,-23,-20, 33,-20, 50, 30,-20,-15,-18,-25,-15, -5, 32,-37, -5,-18; /M: SY='L'; M= -5,-15,-31,-23,-15, 8,-15,-20, 30,-20, 41, 25,-15,-13,-13,-23,-13, -3, 37,-49,-15,-13; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='V'; M= 0,-13,-20,-20,-13, 5,-13,-20, 33,-20, 30, 20,-10,-10,-13,-20,-10, 0, 37,-57,-15,-13; /M: SY='H'; M=-10, 10,-30, 10, 10,-20,-10, 50,-20, 10,-20,-10, 10, 0, 30, 20, 0,-10,-20,-20, 0, 20; /M: SY='A'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-30, 10,-10, 0, 0,-10, 0, 0, 10, 0, 0, 10, 10, 0,-50,-30, 0; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='A'; M= 10, 10, 0, 10, 0,-30, 10, 0,-10, 0,-20,-10, 10, 10, 0, 0, 10, 10,-10,-30,-30, 0; /M: SY='D'; M= 3, 20,-35, 23, 23,-35, 10, 10,-13, 10,-30,-13, 13, 0, 13, 7, 10, 0,-13,-48,-33, 13; /M: SY='K'; M= 0, 8,-29, 8, 5,-40, 0, 3,-13, 20,-18, -3, 8, 5, 5, 20, 5, 5,-13,-35,-35, 5; /M: SY='R'; M= -3, 10,-36, 10, 7,-40, -6, 15,-18, 24,-23, -5, 10, 2, 12, 27, 2, 2,-15,-18,-38, 10; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='G'; M= 8, 5,-11, 3, 0,-27, 12, -7, -3, -7,-11, -5, 5, 3, -2, -9, 5, 8, 2,-46,-32, -2; /M: SY='G'; M= 10, 10,-28, 10, 10,-45, 33,-10,-15,-10,-28,-18, 8, 2, 0,-18, 10, 10, -8,-68,-45, 0; /M: SY='F'; M= -7,-14,-21,-17,-17, 23,-19,-10, 14,-17, 12, 13,-12,-14,-17,-17, -9, -4, 7,-36, 20,-17; /M: SY='F'; M= -8,-15,-12,-25,-18, 27,-21,-15, 22,-25, 22, 12,-15,-21,-18,-25,-15, -8, 24,-41, 20,-18; /M: SY='A'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-30, 10,-10, 0, 0,-10, 0, 0, 10, 0, 0, 10, 10, 0,-50,-30, 0; /M: SY='R'; M= 6, 0,-24, 0, 0,-32, 3, -3, -4, 9,-14, 0, 2, 8, 2, 11, 8, 8, -4,-32,-32, 2; /M: SY='P'; M= 5, 3,-23, 3, 3,-35, -3, 14,-13, 3,-20,-10, 3, 36, 8, 5, 7, 5,-13,-49,-36, 5; /M: SY='G'; M= 7, 13,-16, 13, 8,-35, 18, 0,-13, 0,-25,-13, 10, 5, 3, -3, 10, 7,-10,-44,-35, 3; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='K'; M=-10, 1,-53, 1, 1,-26,-13, 6, -7, 17, 4, 9, -1, -5, 6, 14, -5, -3, -4,-32,-29, 4; /M: SY='L'; M= -6,-16,-34,-18,-18, 15,-13,-15, 12,-16, 18, 12,-14, -8,-14,-16, -6, -4, 7,-27, 6,-16; /M: SY='L'; M=-15,-27, 2,-32,-29, 6,-25,-22, 19,-27, 30, 14,-25,-17,-24,-30,-13,-10, 22,-44, -3,-24; /M: SY='G'; M= 8, 12,-22, 12, 10,-40, 25, -3,-15, -3,-27,-15, 10, 3, 2, -8, 10, 8,-10,-53,-40, 2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='M'; M= 0, -5,-23, -8, -5, -4, -5,-10, 12, -7, 13, 16, -5, -3, -5, -7, -3, 2, 14,-38,-14, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= 6, 12,-36, 15, 15,-45, 14, -1,-15, 6,-25,-13, 10, 3, 7, 1, 8, 5,-12,-58,-40, 7; /M: SY='P'; M= 7, 5,-23, 5, 5,-35, 5, 0, -8, 3,-20, -8, 3, 27, 3, 3, 10, 7, -8,-52,-40, 3; /M: SY='L'; M= -5,-18,-31,-23,-18, 13,-18,-20, 32,-20, 41, 25,-15,-13,-15,-23,-13, -3, 35,-47,-10,-15; /M: SY='K'; M= 0, 8,-29, 8, 5,-40, 0, 3,-13, 20,-18, -3, 8, 5, 5, 20, 5, 5,-13,-35,-35, 5; /M: SY='L'; M=-20,-30,-60,-30,-30, 30,-30,-20, 30,-20, 70, 40,-30,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M= 5, 10,-13, 10, 3,-35, 5, 3,-13, 11,-20, -7, 10, 7, 3, 11, 7, 7,-13,-30,-33, 3; /M: SY='D'; M= 10, 18,-38, 25, 23,-45, 10, 8,-18, 8,-28,-18, 18, 2, 15, 0, 2, 2,-10,-61,-38, 23; /M: SY='L'; M=-15,-25,-55,-25,-25, 19,-25,-15, 25, -9, 54, 45,-19,-15,-15,-14,-15, -5, 25,-31, -5,-15; /M: SY='C'; M= 2, -4, 38, -6,-11,-38, 7,-11,-15,-16,-34,-24, -1, -1,-14,-16, 7, 2,-13,-54,-25,-14; /M: SY='P'; M= 5, 10,-34, 12, 12,-42, 3, 2,-12, 9,-22,-10, 7, 16, 7, 7, 5, 5,-10,-55,-40, 9; /M: SY='H'; M=-14, -1,-32, -3, -3, 9,-19, 34,-11, -3, -9, -6, 1, -9, 14, 7, -7,-14,-16,-11, 22, 4; /M: SY='Y'; M=-30,-35,-13,-45,-45,105,-50, -9, 9,-45, 14, -1,-30,-45,-40,-40,-30,-30,-11, 15,116,-45; /M: SY='D'; M= 10, 10,-23, 13, 10,-35, 10, -2, -8, 0,-20,-10, 8, 7, 5, -2, 7, 7, -5,-52,-33, 8; /M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10, 0, 0,-20, 10, 10,-10,-70,-50, 0; /M: SY='P'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-40, 0, 0,-10, 0,-20,-10, 0, 50, 0, 0, 10, 10,-10,-60,-50, 0; /M: SY='L'; M= -4, -7,-39, -7, -7,-12, -4,-11, 8, -4, 12, 9, -5, -7, -8, -9, -5, 0, 8,-44,-23, -8; /M: SY='V'; M= 2, -8,-20,-15, -8, -7, -5,-18, 23,-15, 21, 15, -8, -5, -8,-15, -5, 2, 31,-58,-22, -8; /M: SY='P'; M= 10, 8,-23, 10, 8,-40, 5, 3,-13, 3,-23,-13, 8, 27, 5, 0, 10, 7,-13,-56,-43, 5; /M: SY='L'; M= -4,-17,-29,-22,-17, 11,-17,-20, 32,-20, 39, 24,-14,-12,-15,-22,-12, -2, 35,-49,-11,-15; /M: SY='P'; M= 10, 5,-17, 5, 2,-40, 12, -2,-12, -2,-22,-12, 5, 28, 0, -4, 10, 10,-10,-54,-45, 0; /M: SY='K'; M= 5, 7,-34, 9, 9,-39, 5, -1, -9, 12,-17, -4, 7, 5, 7, 9, 8, 5, -9,-50,-35, 7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='K'; M= -5, 10,-47, 12, 12,-47, -8, 13,-20, 33,-25, -5, 12, 0, 12, 33, 2, 0,-20,-23,-40, 12; /M: SY='L'; M=-11,-25,-42,-25,-25, 25,-25,-20, 35,-20, 52, 31,-21,-15,-20,-25,-15, -5, 30,-34, 0,-20; /M: SY='P'; M= 10, 2,-22, 2, 2,-42, 9, -2,-12, -2,-22,-12, 2, 39, 0, -4, 10, 10,-10,-62,-50, 0; /M: SY='K'; M= -1, 10,-36, 12, 10,-43, -4, 10,-18, 24,-25, -7, 12, 2, 10, 24, 5, 2,-18,-23,-38, 10; /M: SY='H'; M= -5, 15,-30, 15, 15,-25, 0, 30,-15, 10,-25,-10, 10, 0, 20, 15, 5, -5,-15,-30,-15, 15; /M: SY='L'; M= -5,-20,-31,-23,-20, 17,-20,-20, 35,-20, 41, 25,-15,-13,-17,-23,-13, -3, 33,-45, -5,-17; /M: SY='I'; M= -3, -9,-23,-12, -9, 4,-15, -1, 21,-12, 17, 12, -5, -7, -4, -9, -7, -3, 19,-45, -5, -6; /M: SY='B'; M= 0, 7,-29, 5, 7,-26, 0, -3, 1, 4, -9, 0, 2, 0, 2, 4, 2, 2, 4,-48,-30, 2; /M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20, 0, 20, 0, 10, 0,-20,-70,-40, 20; /M: SY='V'; M= 5, -5,-20,-10, -5,-15, 0,-15, 15,-10, 10, 10, -5, 0, -5,-10, 0, 5, 20,-55,-25, -5; /M: SY='D'; M= -2, 4, -1, 7, 7,-48, -4, 1,-20, 5,-34,-21, 6, -4, 2, 2, 2, -4,-17,-61,-29, 4; /M: SY='D'; M= 10, 10,-21, 12, 9,-34, 10, -3, -7, 0,-20,-10, 7, 8, 4, -2, 8, 8, -5,-51,-32, 7; /M: SY='V'; M= 0,-10,-20,-20,-10, 0,-10,-20, 30,-20, 30, 20,-10,-10,-10,-20,-10, 0, 40,-60,-20,-10; /M: SY='P'; M= 10, 3,-15, 3, 0,-37, 3, 0,-10, 0,-20,-10, 3, 39, 0, 0, 10, 10,-10,-52,-45, 0; /M: SY='R'; M= 3, 10,-23, 10, 5,-35, 0, 13,-15, 12,-22, -8, 10, 5, 10, 14, 5, 5,-12,-21,-35, 8; /M: SY='D'; M= 10, 12,-30, 17, 15,-43, 7, 5,-15, 5,-25,-15, 12, 16, 10, 0, 10, 5,-15,-58,-40, 10; /M: SY='L'; M=-20,-30,-60,-30,-30, 30,-30,-20, 30,-20, 70, 40,-30,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-20; /M: SY='C'; M= 1, -7, 23,-12, -9,-24, -4,-17, 4,-22,-15,-11, -9, -2,-14,-19, 2, 1, 6,-64,-18,-14; /M: SY='R'; M= 0, 0,-32, 0, 0,-23, -5, -2, -1, 6, -9, 7, 0, 3, 0, 9, 3, 5, -1,-31,-28, 0; /M: SY='L'; M=-15,-25,-49,-27,-25, 22,-25,-20, 30,-20, 59, 35,-25,-17,-17,-27,-17, -7, 33,-31, -5,-17; /M: SY='L'; M=-10,-22,-40,-25,-22, 19,-22,-20, 32,-20, 50, 30,-20,-15,-17,-25,-15, -5, 33,-38, -5,-17; /M: SY='D'; M= 10, 18,-43, 26, 26,-46, 10, 6,-16, 6,-28,-18, 16, 2, 16, -2, 5, 2,-10,-68,-38, 21; /M: SY='G'; M= 10, 10,-12, 10, 5,-35, 17, -5,-10, -5,-22,-12, 8, 8, 0, -7, 10, 10, -8,-46,-35, 0; /M: SY='L'; M=-10,-10,-42,-10,-13, -4,-15, -8, 8, -1, 26, 18,-10, -7, -8, -6, -7, -2, 8,-25,-17, -8; /M: SY='P'; M= 7, -3,-15, -3, -5,-21, -3, -5, 3, -5, -7, -2, 0, 24, -5, -5, 5, 7, 1,-50,-32, -5; /M: SY='D'; M= 5, 17,-32, 20, 20,-34, 10, 5,-10, 5,-27,-12, 10, 3, 10, 2, 8, 3, -7,-52,-32, 12; /M: SY='L'; M=-18,-23,-55,-23,-23, 14,-28,-11, 18, -6, 47, 31,-21,-15,-13,-11,-15, -8, 18, -8, -9,-13; /M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20, 0, 20, 0, 0, 0,-10,-70,-40, 30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of true positive hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase S32 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
10 sequences
RPOA_EAVBU (P19811), RPOA_LDVC (Q06502), RPOA_LDVP (Q83017), RPOA_PRRS1 (Q9YN02), RPOA_PRRSB (Q8B912), RPOA_PRRSL (Q04561), RPOA_PRRSR (Q9WJB2), RPOA_PRRSS (A0MD28), RPOA_PRRSV (A6YQT5), RPOA_SHFV (Q68772)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
1MBM |