Entry: PS51493

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] AV_NSP4_PRO
Accession [info] PS51493
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2010 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51493
Associated ProRule [info] PRU00826

Name and characterization of the entry

Description [info] Arterivirus nsp4 proteinase domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=202;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=197;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5510452; R2=0.0069948; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2671.18252; R2=53.75613; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1137; N_SCORE=8.5; H_SCORE=63738; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=851; N_SCORE=6.5; H_SCORE=48364; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='L'; M= -5,-10,-35,-10,-13,  0,-10,-12, 12,-12, 25, 15,-12, -5,-10,-17, -5,  0, 12,-32,-15,-10;
/M: SY='F'; M=-25,-35,-51,-39,-39, 67,-39,-20, 25,-34, 52, 26,-30,-29,-29,-35,-25,-19, 16, -2, 46,-34;
/M: SY='R'; M=-10,  0,-40,  0,  0,-40,-20, 20,-20, 40,-30,  0, 10,  0, 10, 50,  0,  0,-20, 30,-40, 10;
/M: SY='A'; M= 10,  8,-23, 10,  8,-35, 10, -2, -8,  3,-18, -8,  8,  7,  5,  0,  7,  7, -5,-51,-33,  8;
/M: SY='R'; M= -3,  7,-40,  7,  7,-43, -8, 15,-18, 24,-23, -5,  8, 12, 12, 27,  2,  2,-15,-25,-42, 10;
/M: SY='K'; M=  1,  7,-36,  7,  7,-45,  9, -1,-15, 16,-20, -5,  7,  3,  5, 13,  5,  5,-12,-46,-40,  5;
/M: SY='C'; M= -4, -9, 26,-11,-11,-38,-11, -5,-13, -5,-34,-18, -5,  8,-11,  0,  5, -1,-13,-41,-26,-11;
/M: SY='B'; M=  5,  8,-20,  8,  5,-32,  3, -1, -7,  4,-22, -8,  5,  8,  2,  6,  8,  8, -7,-32,-32,  2;
/M: SY='B'; M=  2, 12,-32, 12, 10,-42,  9,  7,-17, 11,-22,-10, 10,  3,  9,  8,  5,  5,-13,-44,-40,  7;
/M: SY='B'; M=  0, 20,-30, 20, 20,-30, 10, 10,-10, 10,-30,-10, 10,  0, 10, 10, 10,  0,-10,-40,-30, 10;
/M: SY='V'; M=  5, -2,-15, -7, -5,-15,  0,-12, 13,-10,  8,  7, -2,  0, -5,-10,  0,  5, 18,-50,-25, -5;
/M: SY='V'; M=  2, -5,-22,-13, -5,-12,  2,-18, 18,-18, 16, 11, -5, -8, -8,-20, -5,  2, 28,-62,-27, -8;
/M: SY='F'; M= -2,  1,-16, -2, -7,  3, -4, -2, -3, -9,-11, -5,  1, -4, -7, -7,  1, -2, -8,-21,  0, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-10,-20,-20,-10,  0,-10,-20, 30,-20, 30, 20,-10,-10,-10,-20,-10,  0, 40,-60,-20,-10;
/M: SY='Y'; M=-14,-19,-17,-27,-24, 50,-27,-12, 12,-31, 10,  2,-18,-24,-24,-28,-16,-14,  4,-19, 51,-27;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='A'; M=  7,  5, -5,  2, -3,-22,  5, -5,  1, -5, -7, -2,  5,  5, -3, -5,  5,  7,  3,-38,-27, -3;
/M: SY='A'; M= 10,  7,-11,  7,  3,-30, 10, -5, -5, -3,-17, -7,  5, 10,  0, -3, 10, 10, -5,-44,-30,  0;
/M: SY='C'; M=-14,-22, 35,-27,-30, 11,-24,-13, -1,-27, -6,-10,-19,-19,-27,-27, -9,-12, -6,-32, 25,-27;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='A'; M= 10,  8, -5,  8,  0,-30, 10, -2, -8,  0,-18, -8,  8, 10,  0,  0, 10, 10, -8,-35,-30,  0;
/M: SY='G'; M= 10, 12,-34, 14, 14,-50, 33, -6,-20, -6,-30,-20, 12,  0,  4,-16, 10,  8,-12,-70,-48,  4;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-23, 10,  8,-45, 33, -8,-18, -8,-28,-18, 10,  2,  0,-15, 10, 10,-10,-61,-45,  0;
/M: SY='L'; M= -3, -9,-37,-12, -6, -3,-11,-13, 19,-13, 27, 16, -9,-10, -6,-18,-10, -3, 26,-51,-19, -4;
/M: SY='F'; M=-37,-42,-49,-55,-55, 89,-55,-20,  4,-45, 18, -2,-32,-45,-42,-24,-30,-35,-14, 76, 79,-52;
/M: SY='A'; M= 10,  3,-15,  3,  0,-30, 10, -7, -3,  0,-13, -3,  3, 10,  0,  0, 10, 10, -3,-45,-30,  0;
/M: SY='I'; M=  0, -5,-33, -2, -2,-13,-12, -3, 10,  2,  0,  5,  3, -5, -2,  2, -2,  0,  5,-37,-20, -2;
/M: SY='D'; M=  5, 17,-34, 20, 20,-40, 18,  5,-15,  5,-30,-15, 12,  0, 10,  0, 10,  3,-12,-55,-38, 10;
/M: SY='G'; M=  5, 15,-30, 15, 15,-40, 25,  0,-15,  0,-30,-15, 10,  0,  5, -5, 10,  5,-10,-55,-40,  5;
/M: SY='D'; M=  0, 18,-39, 20, 20,-39,  6, 10,-15, 17,-28,-10, 12,  0, 12, 14,  5,  0,-12,-45,-35, 15;
/M: SY='I'; M=  5, -7,-20, -9, -7,-14, -4,-12, 13, -9,  6,  6, -5, 12, -7, -9,  1,  5, 13,-55,-26, -7;
/M: SY='V'; M= -2, -6,-27,-13, -6,-11,-10,-13, 19, -7, 19, 16, -6, -8, -6, -7, -8,  0, 27,-53,-24, -6;
/M: SY='C'; M= -3,-16, 31,-24,-19,-17,-11,-20, 10,-24, -3, -3,-13, -8,-19,-21, -3, -3, 15,-63,-14,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-20,-40,-25,-20, 15,-20,-20, 30,-20, 50, 30,-20,-15,-15,-25,-15, -5, 35,-40,-10,-15;
/M: SY='A'; M= 10,  0,-20,  0,  0,-30, 10,-10,  0,  0,-10,  0,  0, 10,  0,  0, 10, 10,  0,-50,-30,  0;
/M: SY='I'; M=  8,  3,-20,  3,  3,-19,  3,-12,  9,-12, -9, -3, -2,  6, -4,-12,  6,  8,  7,-58,-23, -4;
/M: SY='A'; M= 10,  7,-10,  7,  2,-30, 10, -5, -5, -2,-17, -7,  5, 10,  0, -2, 10, 10, -5,-42,-30,  0;
/M: SY='H'; M=-10, 10,-30, 10, 10,-20,-10, 50,-20, 10,-20,-10, 10,  0, 30, 20,  0,-10,-20,-20,  0, 20;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-31,-23,-15,  8,-15,-20, 30,-20, 41, 25,-15,-13,-13,-23,-13, -3, 37,-49,-15,-13;
/M: SY='C'; M=-11,-17, 18,-22,-20, -9,-16,-16,  8,-21,  3,  0,-16,-13,-19,-21, -6, -8, 10,-50, -9,-19;
/M: SY='G'; M= 10,  8,-20,  8,  5,-40, 25, -7,-13, -5,-23,-13,  8,  5,  0,-10, 10, 10, -8,-55,-40,  0;
/M: SY='D'; M=  3, 13,-38, 16, 16,-42, 10,  8,-17, 13,-30,-13, 13,  0, 10, 10,  8,  2,-15,-38,-40, 10;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='B'; M=  0, 15,-34, 15, 15,-40, 14,  5,-15, 11,-28,-10, 10,  0,  7,  9,  8,  3,-12,-46,-38,  7;
/M: SY='K'; M= -6,  3,-39,  3,  1,-31, -8,  3, -8, 22, -6,  9,  5,  0,  3, 22,  0,  2, -8,-32,-31,  3;
/M: SY='V'; M=  8,  6,-20,  3,  6,-23,  6,-12,  7,-12, -9, -3, -2,  6, -2,-12,  6,  8,  9,-60,-28, -2;
/M: SY='R'; M= -3, -3,-30, -5, -3,-27,-10,  2, -2, 14, -9,  5,  2,  0,  2, 19,  0,  2,  1,-13,-32,  2;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-29,-22,-15,  7,-15,-20, 30,-20, 39, 25,-15,-12,-12,-22,-12, -2, 38,-51,-15,-12;
/M: SY='D'; M=  5, 13,-25, 15, 10,-40,  5,  5,-15, 12,-23,-10, 13,  5,  8,  9,  8,  5,-15,-41,-35,  8;
/M: SY='C'; M=-11,-21, 38,-27,-27, 10,-17,-15, -1,-31,-16,-16,-16,-21,-29,-31, -8,-11, -6,-46, 27,-29;
/M: SY='V'; M=  2,  3,-30, -2,  3,-23,  4, -4,  5,-10,  2,  3,  0, -5,  3,-12, -3,  2, 15,-60,-32,  0;
/M: SY='G'; M= 10, 12,-35, 15, 15,-50, 33, -5,-20, -5,-30,-20, 12,  0,  5,-15, 10,  8,-12,-70,-48,  5;
/M: SY='F'; M= -1, -6,-21, -9,-11,  8, -6,-10,  3,-16, -4, -2, -6, -4,-11,-13, -1, -1, -2,-29,  5,-14;
/M: SY='R'; M= -2,  3,-29,  3,  0,-23, -5,  5, -6, 13,-11,  7,  5,  0,  3, 16,  3,  3, -6,-18,-28,  3;
/M: SY='Y'; M=-13, -5,-36, -8, -8, 14,-21, 10, -3,-11,  7,  2,-10,-18, -1,-13,-13,-10, -3,-27, 15, -6;
/M: SY='C'; M=  0,-10, 24,-10,-10,-27, -8,-12, -2,-15,-20,-15, -5, -5,-13,-15,  0, -3, -1,-64,-15,-10;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-40,-17,-17, 12,-17,-17, 24,-17, 37, 22,-17,-10,-15,-22,-10, -2, 22,-37, -8,-15;
/M: SY='E'; M=  7,  7,-35,  9, 12,-32,  5, -3, -2,  0, -9, -5,  7,  0,  7, -5,  5,  2,  1,-63,-32,  7;
/M: SY='F'; M=-30,-40,-40,-50,-50,110,-50,-20, 20,-50, 30, 10,-30,-40,-40,-40,-30,-30,  0, 20,100,-50;
/M: SY='K'; M=  0, 10,-42, 12, 12,-45,  0,  5,-15, 23,-20, -4, 10,  3, 10, 20,  5,  3,-15,-44,-37, 10;
/M: SY='C'; M= -5,-11, 25,-16,-13,-31,-10,-13, -3, -9,-17, -9, -8, -5,-13, -6,  0, -3, -1,-56,-19,-13;
/M: SY='K'; M= -2, 12,-37, 12, 12,-40,  0,  5,-12, 19,-22, -5,  7,  3,  7, 19,  5,  3,-12,-41,-35,  7;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20,  0, 20,  0, 10,  0,-20,-70,-40, 20;
/M: SY='Y'; M=-30,-35,-13,-45,-45,105,-50, -9,  9,-45, 14, -1,-30,-45,-40,-40,-30,-30,-11, 15,116,-45;
/M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10,  0,-10,-20,-10,  0, 10,  0,-10, 10, 10,  0,-60,-30,  0;
/M: SY='F'; M= -3, -8,-27, -8,-11, 15,-13, -8,  7,-16,  2,  0, -3,-10,-11,-15, -8, -5,  2,-30, 10,-11;
/M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10,  0,-10,-20,-10,  0, 10,  0,-10, 10, 10,  0,-60,-30,  0;
/M: SY='V'; M=  0, -1,-32, -3,  2,-22, -8, -2,  5,  3,  0,  6,  2, -5,  2,  4, -3,  0, 10,-38,-30,  2;
/M: SY='C'; M= -2,-14, 23,-22,-17,-16,-10,-20, 12,-22,  0,  0,-12, -8,-17,-20, -3, -2, 17,-62,-16,-17;
/M: SY='P'; M= 10,  3,-20,  3,  3,-35,  5, -5, -5, -3,-18, -8,  0, 30,  0, -3, 10, 10, -5,-58,-40,  0;
/M: SY='B'; M=  0,  9,-32,  9,  9,-19,  0,  7,  1,  2,-11, -2,  5, -3,  7,  2,  2,  0,  1,-45,-24,  4;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='W'; M=-34,-32,-54,-42,-42, 17,-42,-15,-18,-20,  7,-10,-27,-34,-29,  8,-20,-27,-23,124,  5,-34; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='P'; M=  2,  7,-35,  7,  7,-43, -3,  9,-15, 13,-20, -7,  5, 25,  9, 13,  5,  5,-13,-50,-45,  7;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='E'; M=  5, 11,-31, 11, 13,-29,  6, -2, -1, -2,-14, -6,  6,  0,  6, -5,  6,  3,  1,-58,-30,  6;
/M: SY='W'; M=-17,-18,-39,-25,-25, 19,-25,-15, -6,-25, -7,-12,-17,-20,-23, -9,-10,-15,-14, 37, 14,-28;
/M: SY='P'; M= 10,  0,-20,  0,  0,-40,  0,  0,-10,  0,-20,-10,  0, 50,  0,  0, 10, 10,-10,-60,-50,  0;
/M: SY='K'; M= -2, 10,-42, 10, 10,-45, -5, 12,-17, 22,-20, -5,  7, 13, 12, 22,  3,  3,-15,-43,-43, 10;
/M: SY='L'; M= -5,-10,-40,-10,-10,  0,-10,-15, 15,-15, 25, 15,-15, -5,-10,-20, -5,  0, 15,-40,-15,-10;
/M: SY='H'; M= -2, 15,-45, 18, 18,-41, -2, 24,-20, 18,-23,-10, 13,  0, 22, 18,  0, -2,-15,-43,-31, 20;
/M: SY='F'; M=-27,-37,-45,-45,-45, 88,-45,-20, 23,-42, 41, 18,-30,-35,-35,-37,-27,-25,  8,  9, 73,-42;
/M: SY='C'; M=  3, -1, 28, -3, -6,-32,  1,-12, -7,-16,-29,-19, -4,  3,-11,-14,  8,  3, -7,-56,-21,-11;
/M: SY='H'; M=  2, 12,-36, 14, 14,-37,  0, 23,-17,  7,-22,-12, 10, 13, 20,  8,  3,  0,-13,-49,-32, 17;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='Q'; M=  5, 10,-29, 12, 12,-31,  2, 10,-12,  5,-17,-10,  7, 12, 13,  3,  5,  2,-10,-43,-31, 10; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='W'; M=-22,-19,-31,-26,-26, 14,-32, -1,-17, -7,-15,-12,-14,-25,-19, 10,-12,-17,-24, 57, 19,-21;
/M: SY='R'; M=  5,  0,-25,  0,  0,-33,  2, -2, -5, 11,-15,  0,  3,  7,  3, 14,  7,  7, -5,-28,-33,  3;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='R'; M= -5,  0,-35,  0,  0,-40,-15, 15,-18, 31,-28, -2,  8, 12,  8, 38,  2,  2,-18,  9,-42,  8;
/M: SY='A'; M= 10, 10,-20, 10, 10,-30, 10,-10,  0,-10,-20,-10,  0, 10,  0,-10, 10, 10,  0,-60,-30,  0;
/M: SY='Y'; M=-21,-21,  8,-28,-31, 70,-36,  0, -2,-31, -5,-10,-21,-36,-31,-31,-21,-21,-18,  1, 92,-31;
/M: SY='W'; M=-49,-47,-12,-65,-65,  4,-59,-23,-42,-35,-31,-43,-37,-49,-50, 11,-22,-42,-49,167, 10,-57;
/M: SY='C'; M=-15,-21, 29,-27,-29, 16,-25,-12, -1,-27, -4, -8,-19,-20,-27,-27,-10,-12, -6,-29, 29,-27;
/M: SY='P'; M= 10,  3,-20,  3,  3,-33,  7, -7, -3, -3,-15, -5,  0, 21,  0, -3, 10, 10, -3,-55,-35,  0;
/M: SY='M'; M= -1,  2,-29,  2,  0,-14, -1, -5,  3, -5,  2,  4, -3, -1, -3, -8,  2,  2,  3,-37,-22, -3;
/M: SY='V'; M=  7,  0,-16, -3, -3,-22,  5,-10,  6, -5, -1,  3,  0,  5, -3, -5,  5,  7,  9,-48,-27, -3;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='L'; M= -3, -8,-38,-11, -6, -4,-11,-13, 18,-13, 27, 16, -8,-10, -6,-18, -8, -3, 23,-51,-19, -6;
/M: SY='D'; M= 10, 17,-36, 25, 22,-45, 10,  7,-17,  7,-27,-17, 17,  3, 15,  0,  3,  3,-10,-59,-37, 22;
/M: SY='P'; M=  2, -3,-38, -1, -1,-21, -3, -6,  1, -3,  5,  4, -3,  8, -1, -8, -1,  2,  4,-49,-29,  2;
/M: SY='G'; M= 10, 13,-35, 15, 15,-50, 32, -5,-20, -5,-30,-20, 13,  0,  5,-15, 10,  7,-13,-70,-47,  5;
/M: SY='L'; M=-18,-28,-46,-33,-31, 45,-31,-20, 27,-28, 50, 27,-26,-23,-23,-30,-20,-13, 24,-18, 22,-26;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-40,-25,-22, 20,-22,-20, 32,-20, 50, 30,-20,-15,-17,-25,-15, -5, 33,-37, -5,-17;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-23, 10,  8,-45, 33, -8,-18, -8,-28,-18, 10,  2,  0,-15, 10, 10,-10,-61,-45,  0;
/M: SY='G'; M=  2, 10,-33, 10, 10,-40, 12,  0,-12, 11,-22, -7,  7,  3,  5,  8,  7,  5,-10,-47,-37,  5;
/M: SY='G'; M=  7, 12,-32, 15, 15,-39, 17,  0,-12,  3,-25,-12, 10,  3,  7, -2,  8,  5, -7,-56,-37, 10;
/M: SY='V'; M= -1, -6,-22,-10,-11,  3,  0,-12,  3,-19,  0, -1, -4, -9,-11,-19, -4, -1,  4,-37, -4,-14;
/M: SY='C'; M= -5,-15, 76,-20,-20,-35,-10,-20,-10,-30,-40,-30,-15, -5,-25,-25,  5, -5,-10,-70,-10,-25;
/M: SY='F'; M=-25,-35,-50,-40,-40, 70,-40,-20, 25,-35, 50, 25,-30,-30,-30,-35,-25,-20, 15,  0, 50,-35;
/M: SY='C'; M= -8,-20, 74,-28,-25,-27,-15,-23, -2,-33,-26,-22,-18,-10,-27,-28,  0, -8,  1,-70, -7,-27;
/M: SY='F'; M=-37,-42,-49,-55,-55, 89,-55,-20,  4,-45, 18, -2,-32,-45,-42,-24,-30,-35,-14, 76, 79,-52;
/M: SY='A'; M= 10,  3,-15,  3,  0,-30, 10, -7, -3,  0,-13, -3,  3, 10,  0,  0, 10, 10, -3,-45,-30,  0;
/M: SY='G'; M=  5,  8,-31,  8,  8,-41, 13, -5,-11,  6,-20, -8,  5,  5,  3,  3,  7,  7, -8,-52,-38,  3;
/M: SY='C'; M= -5,-17, 79,-22,-25,-38,-13,-15,-15,-25,-40,-30,-13,  6,-25,-20,  5, -5,-15,-63,-16,-25;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20,  0, 20,  0, 10,  0,-20,-70,-40, 20;
/M: SY='A'; M= 10, 10,  0, 10,  0,-30, 10,  0,-10,  0,-20,-10, 10, 10,  0,  0, 10, 10,-10,-30,-30,  0;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='A'; M= 10, 10,  0, 10,  0,-30, 10,  0,-10,  0,-20,-10, 10, 10,  0,  0, 10, 10,-10,-30,-30,  0;
/M: SY='P'; M= 10,  2,-20,  2,  2,-38,  2, -2, -8, -2,-20,-10,  0, 41,  0, -2, 10, 10, -8,-60,-45,  0;
/M: SY='V'; M=  0,-13,-20,-20,-13,  5,-13,-20, 33,-20, 30, 20,-10,-10,-13,-20,-10,  0, 37,-57,-15,-13;
/M: SY='I'; M=  0,-15,-20,-20,-15, 10,-15,-20, 35,-20, 30, 20,-10,-10,-15,-20,-10,  0, 35,-55,-10,-15;
/M: SY='D'; M=  8, 10,-35, 13, 13,-38,  8,  5,-10,  5,-18, -8,  8,  5, 12,  2,  8,  5, -8,-55,-35, 10;
/M: SY='D'; M= 10, 12,-37, 17, 17,-47, 14,  3,-17,  3,-27,-17, 12, 13, 10, -5,  5,  5,-10,-67,-45, 15;
/M: SY='D'; M= 10, 18,-43, 26, 26,-46, 10,  6,-16,  6,-28,-18, 16,  2, 16, -2, 10,  2,-16,-68,-38, 16;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-28, 10, 10,-45, 33,-10,-15,-10,-28,-18,  8,  2,  0,-18, 10, 10, -8,-68,-45,  0;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='D'; M= -3,  2,-36,  4,  4,-11, -3,  0,  1,  0,  4,  4, -1, -5,  2, -5, -3, -3,  3,-32,-17,  4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-40,-25,-23, 20,-23,-20, 33,-20, 50, 30,-20,-15,-18,-25,-15, -5, 32,-37, -5,-18;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-31,-23,-15,  8,-15,-20, 30,-20, 41, 25,-15,-13,-13,-23,-13, -3, 37,-49,-15,-13;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='V'; M=  0,-13,-20,-20,-13,  5,-13,-20, 33,-20, 30, 20,-10,-10,-13,-20,-10,  0, 37,-57,-15,-13;
/M: SY='H'; M=-10, 10,-30, 10, 10,-20,-10, 50,-20, 10,-20,-10, 10,  0, 30, 20,  0,-10,-20,-20,  0, 20;
/M: SY='A'; M= 10,  0,-20,  0,  0,-30, 10,-10,  0,  0,-10,  0,  0, 10,  0,  0, 10, 10,  0,-50,-30,  0;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='A'; M= 10, 10,  0, 10,  0,-30, 10,  0,-10,  0,-20,-10, 10, 10,  0,  0, 10, 10,-10,-30,-30,  0;
/M: SY='D'; M=  3, 20,-35, 23, 23,-35, 10, 10,-13, 10,-30,-13, 13,  0, 13,  7, 10,  0,-13,-48,-33, 13;
/M: SY='K'; M=  0,  8,-29,  8,  5,-40,  0,  3,-13, 20,-18, -3,  8,  5,  5, 20,  5,  5,-13,-35,-35,  5;
/M: SY='R'; M= -3, 10,-36, 10,  7,-40, -6, 15,-18, 24,-23, -5, 10,  2, 12, 27,  2,  2,-15,-18,-38, 10;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='G'; M=  8,  5,-11,  3,  0,-27, 12, -7, -3, -7,-11, -5,  5,  3, -2, -9,  5,  8,  2,-46,-32, -2;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-28, 10, 10,-45, 33,-10,-15,-10,-28,-18,  8,  2,  0,-18, 10, 10, -8,-68,-45,  0;
/M: SY='F'; M= -7,-14,-21,-17,-17, 23,-19,-10, 14,-17, 12, 13,-12,-14,-17,-17, -9, -4,  7,-36, 20,-17;
/M: SY='F'; M= -8,-15,-12,-25,-18, 27,-21,-15, 22,-25, 22, 12,-15,-21,-18,-25,-15, -8, 24,-41, 20,-18;
/M: SY='A'; M= 10,  0,-20,  0,  0,-30, 10,-10,  0,  0,-10,  0,  0, 10,  0,  0, 10, 10,  0,-50,-30,  0;
/M: SY='R'; M=  6,  0,-24,  0,  0,-32,  3, -3, -4,  9,-14,  0,  2,  8,  2, 11,  8,  8, -4,-32,-32,  2;
/M: SY='P'; M=  5,  3,-23,  3,  3,-35, -3, 14,-13,  3,-20,-10,  3, 36,  8,  5,  7,  5,-13,-49,-36,  5;
/M: SY='G'; M=  7, 13,-16, 13,  8,-35, 18,  0,-13,  0,-25,-13, 10,  5,  3, -3, 10,  7,-10,-44,-35,  3;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='K'; M=-10,  1,-53,  1,  1,-26,-13,  6, -7, 17,  4,  9, -1, -5,  6, 14, -5, -3, -4,-32,-29,  4;
/M: SY='L'; M= -6,-16,-34,-18,-18, 15,-13,-15, 12,-16, 18, 12,-14, -8,-14,-16, -6, -4,  7,-27,  6,-16;
/M: SY='L'; M=-15,-27,  2,-32,-29,  6,-25,-22, 19,-27, 30, 14,-25,-17,-24,-30,-13,-10, 22,-44, -3,-24;
/M: SY='G'; M=  8, 12,-22, 12, 10,-40, 25, -3,-15, -3,-27,-15, 10,  3,  2, -8, 10,  8,-10,-53,-40,  2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='M'; M=  0, -5,-23, -8, -5, -4, -5,-10, 12, -7, 13, 16, -5, -3, -5, -7, -3,  2, 14,-38,-14, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D'; M=  6, 12,-36, 15, 15,-45, 14, -1,-15,  6,-25,-13, 10,  3,  7,  1,  8,  5,-12,-58,-40,  7;
/M: SY='P'; M=  7,  5,-23,  5,  5,-35,  5,  0, -8,  3,-20, -8,  3, 27,  3,  3, 10,  7, -8,-52,-40,  3;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-31,-23,-18, 13,-18,-20, 32,-20, 41, 25,-15,-13,-15,-23,-13, -3, 35,-47,-10,-15;
/M: SY='K'; M=  0,  8,-29,  8,  5,-40,  0,  3,-13, 20,-18, -3,  8,  5,  5, 20,  5,  5,-13,-35,-35,  5;
/M: SY='L'; M=-20,-30,-60,-30,-30, 30,-30,-20, 30,-20, 70, 40,-30,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=  5, 10,-13, 10,  3,-35,  5,  3,-13, 11,-20, -7, 10,  7,  3, 11,  7,  7,-13,-30,-33,  3;
/M: SY='D'; M= 10, 18,-38, 25, 23,-45, 10,  8,-18,  8,-28,-18, 18,  2, 15,  0,  2,  2,-10,-61,-38, 23;
/M: SY='L'; M=-15,-25,-55,-25,-25, 19,-25,-15, 25, -9, 54, 45,-19,-15,-15,-14,-15, -5, 25,-31, -5,-15;
/M: SY='C'; M=  2, -4, 38, -6,-11,-38,  7,-11,-15,-16,-34,-24, -1, -1,-14,-16,  7,  2,-13,-54,-25,-14;
/M: SY='P'; M=  5, 10,-34, 12, 12,-42,  3,  2,-12,  9,-22,-10,  7, 16,  7,  7,  5,  5,-10,-55,-40,  9;
/M: SY='H'; M=-14, -1,-32, -3, -3,  9,-19, 34,-11, -3, -9, -6,  1, -9, 14,  7, -7,-14,-16,-11, 22,  4;
/M: SY='Y'; M=-30,-35,-13,-45,-45,105,-50, -9,  9,-45, 14, -1,-30,-45,-40,-40,-30,-30,-11, 15,116,-45;
/M: SY='D'; M= 10, 10,-23, 13, 10,-35, 10, -2, -8,  0,-20,-10,  8,  7,  5, -2,  7,  7, -5,-52,-33,  8;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-30, 10, 10,-50, 40,-10,-20,-10,-30,-20, 10,  0,  0,-20, 10, 10,-10,-70,-50,  0;
/M: SY='P'; M= 10,  0,-20,  0,  0,-40,  0,  0,-10,  0,-20,-10,  0, 50,  0,  0, 10, 10,-10,-60,-50,  0;
/M: SY='L'; M= -4, -7,-39, -7, -7,-12, -4,-11,  8, -4, 12,  9, -5, -7, -8, -9, -5,  0,  8,-44,-23, -8;
/M: SY='V'; M=  2, -8,-20,-15, -8, -7, -5,-18, 23,-15, 21, 15, -8, -5, -8,-15, -5,  2, 31,-58,-22, -8;
/M: SY='P'; M= 10,  8,-23, 10,  8,-40,  5,  3,-13,  3,-23,-13,  8, 27,  5,  0, 10,  7,-13,-56,-43,  5;
/M: SY='L'; M= -4,-17,-29,-22,-17, 11,-17,-20, 32,-20, 39, 24,-14,-12,-15,-22,-12, -2, 35,-49,-11,-15;
/M: SY='P'; M= 10,  5,-17,  5,  2,-40, 12, -2,-12, -2,-22,-12,  5, 28,  0, -4, 10, 10,-10,-54,-45,  0;
/M: SY='K'; M=  5,  7,-34,  9,  9,-39,  5, -1, -9, 12,-17, -4,  7,  5,  7,  9,  8,  5, -9,-50,-35,  7;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='K'; M= -5, 10,-47, 12, 12,-47, -8, 13,-20, 33,-25, -5, 12,  0, 12, 33,  2,  0,-20,-23,-40, 12;
/M: SY='L'; M=-11,-25,-42,-25,-25, 25,-25,-20, 35,-20, 52, 31,-21,-15,-20,-25,-15, -5, 30,-34,  0,-20;
/M: SY='P'; M= 10,  2,-22,  2,  2,-42,  9, -2,-12, -2,-22,-12,  2, 39,  0, -4, 10, 10,-10,-62,-50,  0;
/M: SY='K'; M= -1, 10,-36, 12, 10,-43, -4, 10,-18, 24,-25, -7, 12,  2, 10, 24,  5,  2,-18,-23,-38, 10;
/M: SY='H'; M= -5, 15,-30, 15, 15,-25,  0, 30,-15, 10,-25,-10, 10,  0, 20, 15,  5, -5,-15,-30,-15, 15;
/M: SY='L'; M= -5,-20,-31,-23,-20, 17,-20,-20, 35,-20, 41, 25,-15,-13,-17,-23,-13, -3, 33,-45, -5,-17;
/M: SY='I'; M= -3, -9,-23,-12, -9,  4,-15, -1, 21,-12, 17, 12, -5, -7, -4, -9, -7, -3, 19,-45, -5, -6;
/M: SY='B'; M=  0,  7,-29,  5,  7,-26,  0, -3,  1,  4, -9,  0,  2,  0,  2,  4,  2,  2,  4,-48,-30,  2;
/M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20,  0, 20,  0, 10,  0,-20,-70,-40, 20;
/M: SY='V'; M=  5, -5,-20,-10, -5,-15,  0,-15, 15,-10, 10, 10, -5,  0, -5,-10,  0,  5, 20,-55,-25, -5;
/M: SY='D'; M= -2,  4, -1,  7,  7,-48, -4,  1,-20,  5,-34,-21,  6, -4,  2,  2,  2, -4,-17,-61,-29,  4;
/M: SY='D'; M= 10, 10,-21, 12,  9,-34, 10, -3, -7,  0,-20,-10,  7,  8,  4, -2,  8,  8, -5,-51,-32,  7;
/M: SY='V'; M=  0,-10,-20,-20,-10,  0,-10,-20, 30,-20, 30, 20,-10,-10,-10,-20,-10,  0, 40,-60,-20,-10;
/M: SY='P'; M= 10,  3,-15,  3,  0,-37,  3,  0,-10,  0,-20,-10,  3, 39,  0,  0, 10, 10,-10,-52,-45,  0;
/M: SY='R'; M=  3, 10,-23, 10,  5,-35,  0, 13,-15, 12,-22, -8, 10,  5, 10, 14,  5,  5,-12,-21,-35,  8;
/M: SY='D'; M= 10, 12,-30, 17, 15,-43,  7,  5,-15,  5,-25,-15, 12, 16, 10,  0, 10,  5,-15,-58,-40, 10;
/M: SY='L'; M=-20,-30,-60,-30,-30, 30,-30,-20, 30,-20, 70, 40,-30,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-20;
/M: SY='C'; M=  1, -7, 23,-12, -9,-24, -4,-17,  4,-22,-15,-11, -9, -2,-14,-19,  2,  1,  6,-64,-18,-14;
/M: SY='R'; M=  0,  0,-32,  0,  0,-23, -5, -2, -1,  6, -9,  7,  0,  3,  0,  9,  3,  5, -1,-31,-28,  0;
/M: SY='L'; M=-15,-25,-49,-27,-25, 22,-25,-20, 30,-20, 59, 35,-25,-17,-17,-27,-17, -7, 33,-31, -5,-17;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-40,-25,-22, 19,-22,-20, 32,-20, 50, 30,-20,-15,-17,-25,-15, -5, 33,-38, -5,-17;
/M: SY='D'; M= 10, 18,-43, 26, 26,-46, 10,  6,-16,  6,-28,-18, 16,  2, 16, -2,  5,  2,-10,-68,-38, 21;
/M: SY='G'; M= 10, 10,-12, 10,  5,-35, 17, -5,-10, -5,-22,-12,  8,  8,  0, -7, 10, 10, -8,-46,-35,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-10,-42,-10,-13, -4,-15, -8,  8, -1, 26, 18,-10, -7, -8, -6, -7, -2,  8,-25,-17, -8;
/M: SY='P'; M=  7, -3,-15, -3, -5,-21, -3, -5,  3, -5, -7, -2,  0, 24, -5, -5,  5,  7,  1,-50,-32, -5;
/M: SY='D'; M=  5, 17,-32, 20, 20,-34, 10,  5,-10,  5,-27,-12, 10,  3, 10,  2,  8,  3, -7,-52,-32, 12;
/M: SY='L'; M=-18,-23,-55,-23,-23, 14,-28,-11, 18, -6, 47, 31,-21,-15,-13,-11,-15, -8, 18, -8, -9,-13;
/M: SY='D'; M= 10, 20,-50, 30, 30,-50, 10, 10,-20, 10,-30,-20, 20,  0, 20,  0,  0,  0,-10,-70,-40, 30;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 9 in 9 different sequences
Number of true positive hits 9 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase S32
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
9 sequences

RPOA_EAVBU  (P19811), RPOA_LDVC   (Q06502), RPOA_LDVP   (Q83017), 
RPOA_PRRS1  (Q9YN02), RPOA_PRRSB  (Q8B912), RPOA_PRRSL  (Q04561), 
RPOA_PRRSR  (Q9WJB2), RPOA_PRRSS  (A0MD28), RPOA_SHFV   (Q68772)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission