Entry: PS51494

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SPOIVB
Accession [info] PS51494
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2010 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2010 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51494
Associated ProRule [info] PRU00827

Name and characterization of the entry

Description [info] SpoIVB peptidase domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=240;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=235;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2715583; R2=0.0117389; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10530.23607; R2=53.78673; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=446; N_SCORE=8.5; H_SCORE=34465; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=276; N_SCORE=6.5; H_SCORE=25322; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -9, -2,-26, -5,  4,-21,-15,  5,-13,  0,-15, -6,  3,-14,  6,  0, -2, -4,-14,-26, -8,  3;
/M: SY='E'; M=-10, -5,-26, -7,  1,-10,-18, -7, -7,  1, -7, -5, -2,-16, -3, -4, -8, -4,-10,-18,  1, -2;
/M: SY='F'; M=-12, -6,-24,-11, -8,  3,-18, -8, -3, -8,  1,  3, -3,-21,-10, -8,-12, -8, -6,-18,  2, -9;
/M: SY='B'; M= -8,  9,-23,  8,  8,-22,-15, -3,-21,  9,-21,-10,  8,-12,  8,  3,  4,  3,-18,-27,-10,  8;
/M: SY='T'; M= -4,-11,-20,-14, -8, -8,-12,-16,-10, -4, -2, -4, -9,-18,-10, -1, -4,  5, -4,-22, -9, -9;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-27,  5, 11,-27,-11,  0,-28, 18,-25,-13,  5,-12,  8, 15, -1, -4,-22,-26,-12,  9;
/M: SY='I'; M= -6,-21,-22,-24,-17, -9,-24,-14, 18,-18,  5,  8,-17,-22,-11,-17,-12, -8, 18,-25, -6,-16;
/M:         M= -9, -3,-23, -4, -6,-14,-22, -5, -3, -6,-10, -4, -2,-17, -1, -5, -2,  0, -3,-23, -1, -6;
/M: SY='P'; M= -8,-14,-31, -9,  3,-21,-21,-17,-14,-10,-15,-13,-16, 47, -8,-16, -7, -1,-20,-29,-22, -5;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-18,-25,-19, -6,-26,-21, 16,-15,  9,  7,-19,-23,-13,-10,-10, -1, 20,-24, -8,-17;
/M: SY='Y'; M=-11,-11,-26,-11, -2, -2,-23, -4,-13,  9, -9, -5,-10,-19, -3, 10,-10, -5, -9, -9, 13, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='C'; M= -4, -9, 23,-12,-12, -9,-14,-13, -6,-14, -3, -2, -9,-18,-12,-13, -2, -2,  0,-25,-12,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q'; M= -5,  1,-25,  1,  3,-22,-16,  1,-17,  6,-16, -5,  0, -9, 11,  1, -3, -5,-17,-22, -6,  6;
/M: SY='E'; M= -7, 12,-24, 12, 25,-23,-16, -3,-20,  3,-18,-16, 10,-10,  6,  0,  2, -2,-18,-32,-18, 15;
/M: SY='B'; M= -6, 13,-21, 11,  9,-22,-15,  0,-19, -3,-16,-13, 10,-12,  5, -6,  6,  9,-17,-31,-13,  7;
/M: SY='G'; M= -8,  2,-28,  0,  2,-28, 16, -7,-31,  7,-27,-16,  9,-16,  2,  8, -1,-12,-27,-24,-20,  1;
/M: SY='R'; M= -5, -3,-24, -3,  8,-23,-17,  6,-20, 10,-18, -8,  0,-14, 10, 14, -2, -7,-14,-26,-10,  8;
/M: SY='Y'; M=-18,-19,-32,-19,-12, 17,-28,  9, -4,-12, -4, -4,-18,-19, -9,-12,-19,-12,-13, 23, 47,-13;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-28, -6,  2,-19,-15,  6,-25, 18,-18, -8, -1,-17,  5, 27, -7,-10,-19,-20, -3,  1;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-23,-29,-19,  0,-32,-23, 28,-24, 23, 17,-21,-22,-16,-22,-18, -5, 19,-22, -3,-20;
/M: SY='G'; M= -2,-11,-30,-13,-19,-27, 52,-20,-30,-16,-25,-15, -2,-19,-18,-18, -3,-18,-23,-20,-25,-19;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-19,-28,-21,  2,-28,-21, 22,-25, 27, 15,-22,-25,-18,-20,-16, -3, 17,-24, -4,-20;
/M: SY='W'; M=-17,-28,-33,-30,-24, 28,-24,-11, -8,-19, -5, -8,-26,-29,-19,-16,-24,-15,-14, 62, 40,-21;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-16,-32,-28,  7,-32,-28, 30,-24, 18, 13,-28,-28,-27,-22,-16, -4, 37,-24, -4,-28;
/M: SY='R'; M=-15, -3,-28, -5,  3,-23,-19, -3,-28, 30,-23,-10,  4,-16, 11, 46, -6, -6,-20,-22,-11,  5;
/M: SY='D'; M=-18, 47,-29, 61, 20,-37, -9,  1,-37,  1,-29,-28, 24,-11,  1, -8,  1, -9,-30,-39,-20, 11;
/M: SY='E'; M=  1,  7,-22,  9, 10,-24, -7, -3,-23,  1,-20,-15,  5,-11,  1, -5,  7, -2,-18,-31,-16,  5;
/M: SY='T'; M=  5,-12,-15,-20,-15, -7,-21,-22,  6,-17,  3,  0,-10,-15,-13,-17,  5, 20,  8,-26, -9,-15;
/M: SY='A'; M= 21, -2,-14, -5, -3,-21, -6,-13,-13, -9,-14,-11, -3,-12, -2,-14, 12,  3, -5,-28,-17, -2;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-34,-30,  5,-34,-29, 35,-25, 15, 14,-26,-26,-26,-24,-15, -5, 38,-23, -3,-30;
/M: SY='G'; M=  3,-10,-29,-11,-19,-29, 66,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-21,  7,-29,-18, 23,-26, 40, 25,-28,-28,-18,-19,-26, -9, 15,-21, -1,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,  0,-10,-10,-10, 21, 49,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26, 62,-30, -6,  0,-23,  6,  0,-20,-30,-29,-16,-20,-10, -4, 17, 48,-26;
/M: SY='Y'; M=-14,-23,-26,-24,-22, 16,-31,  0, 13,-12,  4,  5,-21,-27,-15,-13,-17, -8,  8,  7, 44,-22;
/M: SY='D'; M=-12, 27,-19, 32, 11,-27,-12,  7,-29, -3,-24,-21, 18,-14, -1, -8,  2, -4,-24,-34,-12,  4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P'; M= -9,-16,-32,-10, -1,-20,-18,-16,-16, -9,-23,-15,-16, 64, -7,-16, -7, -6,-23,-24,-21, -8; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M=  0, 10,-23, 13, 15,-27,-13, -7,-23,  6,-21,-15,  4, -9,  7, -2,  4, -1,-16,-29,-16, 11;
/M: SY='T'; M= -5,  9,-17,  5, -2,-18,-14, -9,-17, -3,-17,-10,  9,-12, -1, -3, 13, 21,-11,-32,-13, -2;
/M: SY='K'; M= -6, -5,-26, -5,  0,-24,  6, -5,-25, 10,-22, -6, -1,-14,  0,  6, -2, -9,-19,-24,-15,  0;
/M: SY='R'; M= -8, -2,-23, -4,  1,-18,-16,-11,-13,  7,-13, -8,  0,-16, -2,  8, -3,  1, -8,-27,-12, -2;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 56,-30, -1,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -5, 20, 54,-25;
/M: SY='G'; M=  4, -9,-28,-10,-17,-29, 57,-19,-36,-14,-28,-18, -1,-18,-17,-17,  0,-17,-26,-20,-28,-17;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-29, 45, 19,-29,-29,-21,-21,-28, -9, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A'; M= 10,-15,-19,-17,-14,-18,  3,-19, -8,-14,-10, -6,-12,-12,-10,-16,  1, -3,  1,-25,-18,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-27,-38,-29,  0,-37,-28, 45,-27, 19, 21,-21,-21,-20,-27,-19, -9, 32,-21, -1,-29;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-15, -4, -6,-17, -9,-15,-12, -7,-18,-12,  4,-13, -7, -9, 18, 19, -3,-33,-15, -7;
/M: SY='D'; M=-16, 36,-27, 51, 12,-33,-10, -5,-31, -4,-22,-23, 12,-13, -4,-12, -1, -7,-21,-37,-18,  4;
/M: SY='S'; M=  1, -8,-21,-12,-14,-15,  0,-16, -6,-15,-15, -8,  0,-14,-12,-16,  5, -2, -4,-21,-15,-13;
/M: SY='D'; M=-14, 34,-26, 44, 13,-33, -8, -4,-33,  1,-26,-24, 16,-11, -1, -7,  3, -1,-25,-36,-18,  6;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T'; M=  5, -6,-12,-13,-11,-10,-14,-19, -7,-14, -3, -7, -5,-14,-11,-13, 12, 29, -1,-28,-11,-11;
/M: SY='G'; M= -1,  2,-26,  0, -3,-29, 18, -8,-29, -1,-26,-15,  7,-15,  4, -2,  2,-10,-25,-24,-20,  0;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-25,  0, 11,-24,-17, -1,-19,  9,-19,-10,  4, -6, 11,  5,  0, -2,-19,-27,-13, 10;
/M: SY='P'; M=  2,-19,-24,-19, -8,-13,-21,-19,  2,-11,  1,  1,-18,  6,-11,-15,-11, -7,  0,-24,-13,-11;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-26,-25,-14, -2,-27,-17, 15,-20, 14, 15,-20, -4,-12,-19,-17, -8,  5,-22, -6,-15;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-26,  4,  7,-20,-21, -8,-10, -3,-10, -7, -6, -5,  4, -8, -5, -7,-11,-25, -9,  4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I'; M= -4,-24,-16,-29,-23, 14,-26,-22, 22,-22, 13,  9,-20,-21,-22,-19,-14, -5, 21,-14,  2,-23; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K'; M= -4, -1,-26, -2, 10,-26, -9, -5,-24, 16,-20,-10,  1,-13, 12, 15, -2, -8,-21,-23,-14, 10;
/M: SY='N'; M= -4, 15,-23, 13, 10,-26, -7, -2,-24,  2,-23,-16, 16,-12,  8,  2,  6,  0,-22,-31,-17,  8;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q'; M= -8,  4,-24,  4,  8,-23,-11,  0,-22,  8,-22,-10,  7,-13, 13,  8,  5, -3,-20,-25, -9, 10;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-26,-38,-29,  1,-38,-29, 44,-29, 22, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 31,-21, -1,-29;
/M: SY='Y'; M=-10,-24,-19,-27,-23, 21,-27, -8, 12,-17,  7, 10,-22,-27,-20,-15,-13, -5, 14, -5, 24,-22;
/M: SY='E'; M= -4,  4,-23,  5, 13,-23,-15,  3,-20,  1,-15,-11,  3,-12,  8,  0,  3, -2,-18,-29,-12, 10;
/M: SY='A'; M= 23, -7,-13,-13, -7,-18, -6,-17,-11,-10,-14, -9, -4, -4, -7,-15, 16, 13, -4,-27,-18, -8;
/M: SY='K'; M= -2, -1,-21, -3,  6,-18,-15, -7,-19,  9,-18,-10,  2,-12,  3,  9,  6,  7,-13,-24, -9,  3;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-25,-32,-24, -3,-35,-19, 34,-24, 14, 15,-19,-22,-15,-23,-16, -8, 25,-23, -2,-23;
/M: SY='T'; M= -7,-13,-21,-16, -7,-10,-25,-12,  3,-12,  6,  4,-12,-18,  3,-10, -5,  8,  1,-22, -3, -3;
/M: SY='S'; M=  1,  9,-20,  7,  5,-26, -1, -6,-24,  2,-26,-16, 12,-12,  5, -3, 13,  3,-19,-31,-18,  5;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30;
/M: SY='R'; M=-12,  0,-27,  1, 10,-20,-20,  0,-18, 13,-17, -9,  2,-15,  7, 17, -6, -8,-14,-24, -8,  6;
/M: SY='K'; M= -7, -3,-30, -2,  9,-30,-19,-10,-27, 36,-28,-10, -3,  3, 11, 19, -8,-10,-21,-21,-13,  9;
/M: SY='G'; M=  8, -5,-22, -8,-13,-26, 41,-16,-30,-15,-27,-19,  4,-16,-13,-17, 11, -7,-21,-26,-26,-13;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-24, -7, -3,-15,-20, -7,-12, 12,-14, -1, -4,-15,  3,  9, -3,  0, -9,-19, -1, -1;
/M: SY='R'; M= -4,  1,-25, -1,  1,-23,-14, -8,-24, 17,-23,-13,  5, -4,  2, 19, -1, -1,-18,-25,-15,  0;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-28, -7,-10,-30, 52,-16,-36,-15,-29,-19,  1,-17,-11,-16,  3,-15,-28,-22,-27,-11;
/M: SY='Q'; M= -5,  6,-25,  4, 16,-30,-14,  6,-23, 10,-23,-10,  9,-11, 25,  8,  5, -5,-24,-27,-13, 20;
/M: SY='P'; M= -7,-21,-34,-13, -5,-24,-21,-21,-10,-12,-23,-14,-19, 63,-12,-20, -7, -7,-16,-30,-25,-13;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-11,  6,-20, 10, 35,-23,-20, -1,-26, 11,-20,-17,  0, -8, 11,  2, -3, -9,-25,-25, -9, 23;
/M: SY='K'; M=-10,-12,-27,-14, -4,-16,-26,-16, -4, 18, -5,  2,-10,-16, -2,  8,-15,-10, -3,-20, -6, -4;
/M: SY='M'; M= -9,-16,-25,-21,-14, -9,-22,-16, 10, -4,  5, 13,-11,-19, -8, -6,-14, -9,  5,-22, -6,-13;
/M: SY='G'; M= 11, -9,-24,-11,-14,-27, 42,-18,-30,-15,-25,-17, -2,-13,-13,-18,  5,-12,-22,-22,-26,-13;
/M: SY='R'; M= -8, -5,-21, -5, -7,-16,-19,-10, -9,  2,-14, -7, -4,-19, -7,  4, -1,  0,  1,-23,-10, -8;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-23,-36,-27, 37,-32,-22, 17,-26, 17, 10,-21,-26,-28,-18,-20,-10, 11, -7, 13,-27;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M:         M= -5, -6,-20, -8, -4,-10,-18, -7, -2, -8, -2, -3, -3,-17, -6, -6, -3, -1, -2,-24, -6, -7; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-26,  2,  9,-18, -9,  1,-22,  2,-20,-13,  0,  4,  0, -2, -3, -8,-21,-21, -9,  3; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='H'; M= -9,  5,-20,  5,  2,-16, -5,  9,-15, -3,-10, -5,  7,-14,  1, -2, -4, -8,-15,-22, -8,  1; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='S'; M= -3,  1,-21, -1,  5,-20, -8, -7,-17,  0,-16,-11,  5,-14,  4,  1,  7,  2,-15,-29,-15,  4;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-21,  6,  9,-24, -9, -6,-20,  1,-18,-13,  8,-14,  4,  0,  0, -7,-19,-29,-17,  6;
/M: SY='M'; M= -9,-16,-23,-19,-10,  3,-25, -9,  2,-10,  2,  4,-12,-16,-11, -5,-12, -6,  1,-18,  0,-12;
/M: SY='I'; M= -3,-24,-21,-30,-21,  1,-28,-21, 24,-23, 19, 16,-20,-22,-15,-21,-14, -6, 17,-22, -3,-19;
/M: SY='G'; M=  2,-11,-27,-13,-19,-24, 52,-18,-32,-17,-24,-13, -3,-19,-17,-18, -1,-15,-23,-20,-25,-18;
/M: SY='S'; M= -1,  8,-15,  3,  0,-18, -8, -8,-17, -6,-22,-16, 15,-10, -2, -6, 21, 18,-13,-36,-17, -2;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-24,-36,-26, 10,-33,-25, 32,-27, 21, 16,-22,-23,-22,-25,-19, -9, 21,-17,  2,-26;
/M: SY='B'; M= -5,  2,-22,  2,  2,-15,-16, -9,-11, -6, -9, -7, -1,-15, -2, -7,  1,  2, -9,-22, -9,  0;
/M: SY='K'; M= -7, -7,-19,-10, -1,-17,-21,-10,-11,  9,-10, -5, -4,-16, -2,  7, -7, -4, -7,-25,-10, -3;
/M: SY='N'; M=-11, 24,-21, 10, -2,-18, -7,  8,-18,  1,-23,-15, 40,-20,  0,  8,  5,  0,-23,-35,-15, -2;
/M: SY='T'; M=  2, -4,-14,-12, -9,-10,-16,-16, -7,-11, -9, -7, -1,-13, -7,-10, 15, 27, -2,-29,-10, -8;
/M: SY='P'; M= -1, -6,-26, -4,  0,-22,-15,-10,-13, -5,-17,-11, -7, 10, -3, -9, -3, -5,-11,-26,-16, -3;
/M: SY='F'; M=-14,-21,-22,-25,-19, 31,-26, -7, -1,-17,  7,  1,-16,-26,-19, -9,-14, -6, -2, -3, 22,-18;
/M: SY='G'; M=  5,-11,-26,-12,-18,-26, 50,-20,-30,-18,-24,-16, -3,-17,-19,-20,  0,-16,-21,-21,-27,-19;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-37,-27,  2,-35,-27, 38,-28, 22, 18,-22,-23,-21,-27,-20, -9, 25,-21, -1,-27;
/M: SY='F'; M=-11,-23,-22,-28,-21, 38,-24,-10, -2,-18,  4,  0,-17,-26,-22,-11,-14, -7, -3,  6, 26,-21;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-26,-11,-18,-23, 50,-19,-31,-18,-24,-16, -2,-19,-18,-19,  2,-15,-22,-20,-25,-18;
/M: SY='R'; M= -4, -2,-23, -6,  2,-18,-16, -7,-19, 12,-18, -8,  1,-10,  7, 13,  0,  1,-15,-23,-11,  4;
/M: SY='L'; M= -4,-22,-22,-27,-20,  2,-24,-17, 15,-21, 16, 14,-18,-22,-14,-19,-15, -5,  8,-10,  1,-18;
/M: SY='N'; M=  0,  5,-20,  1,  1,-18, -8, -7,-14, -4,-16,-12,  8,-15, -4, -6,  4,  2,-10,-29,-13, -2;
/M: SY='N'; M= -1,  2,-22, -1,  3,-16, -7, -4,-18, -4,-17,-12,  5,-15,  1, -6,  3, -1,-16,-21, -8,  2;
/M: SY='N'; M= -3,  4,-21,  2,  0, -8, -9,-10,-16, -8,-15,-13,  5,-13, -9,-10,  2, -2,-13,-26,-11, -4;
/I:         I=-5; MD=-9;
/M: SY='F'; M= -3,-10, -8,-11, -8,  4, -9, -3, -2, -8, -1, -1, -8,-12, -8, -7, -5, -4,  0, -4,  4, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='A'; M=  4, -7, -9,-12, -8,-13,-10, -9, -3,-10, -7, -2, -3, -8, -4,-12,  1, -1, -3,-22,-11, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='T'; M=  0,-11,-18,-14, -9, -7,-14,-12, -4, -7, -1, -2, -8,-15, -8, -2, -4,  1, -1,-20, -7, -9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='N'; M= -2,  3,-21,  0, -4,-13,-10, -1,-14, -7,-13,-10,  5, -6, -5, -9,  0, -2,-14,-23, -7, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P'; M= -2, -8,-28, -7, -3,-22,-11,-14,-14, -8,-19,-13, -5, 20, -4,-12, -1, -5,-18,-24,-19, -6;
/M: SY='S'; M=  0, -7,-22, -9, -6, -7,-16,-11,-10, -6,-12, -9, -6, -7, -7,-10,  1,  0, -8,-19, -2, -8;
/M:         M= -6,-13,-25,-13, -5, -7, -8,-11,-12, -7, -9, -4,-10, -8, -6, -9, -5, -6,-12,-17, -4, -6;
/M: SY='D'; M= -3,  5,-25,  7,  0,-22,-13, -8,-17, -3,-17,-14,  4,  2, -3, -5,  0, -5,-17,-28,-15, -3;
/M: SY='E'; M=  2, -2,-19, -2,  9,-26, -8, -6,-22,  7,-21,-11, -2,-12,  7,  0,  2, -5,-15,-26,-15,  7;
/M: SY='P'; M=  3,-11,-23,-11, -1,-20,-13,-13,-15, -1,-15, -8,-10, 12, -3, -7, -4, -6,-15,-23,-15, -4;
/M: SY='I'; M= -9,-18,-25,-22,-17, -4,-26,-15, 15,-15,  4, 11,-16,-12,-11,-17,-12, -3, 10,-18,  2,-17;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-31,  3, 14,-29,-15,-12,-24,  0,-26,-18, -7, 35,  1, -9, -1, -5,-25,-30,-23,  6;
/M: SY='I'; M= -5,-25,-21,-30,-25,  6,-31,-22, 25,-22,  9,  8,-21,-21,-21,-22,-12, -1, 23,-16,  6,-25;
/M: SY='A'; M= 15,-17,-10,-24,-18, -5, -6,-19, -3,-17, -2, -1,-14,-16,-17,-20, -4, -5,  0,-18,-10,-17;
/M: SY='P'; M= -6,-16,-25,-15,-10,-10,-11,-15,-12,-12,-10, -8,-12,  7,-11, -8, -3, -2,-12,-19,-11,-12;
/M: SY='I'; M=  0,-18,-22,-20,-11,-10,-22,-18,  5, -9,  4,  3,-16,-11, -9,-10, -9, -5,  5,-24,-10,-11;
/M: SY='D'; M= -5, 15,-23, 19, 15,-28, -6, -2,-27,  1,-26,-19, 11,-10,  8, -4, 10, -2,-23,-32,-16, 11;
/M: SY='E'; M=-11, 13,-28, 21, 32,-32,-17,  4,-27,  5,-20,-15,  4, -7, 21, -1,  1, -7,-27,-30,-15, 26;
/M: SY='V'; M= -1,-27,-18,-31,-26, -1,-31,-28, 31,-23, 14, 11,-23,-24,-23,-23,-12, -1, 33,-25, -6,-26;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-28, -1,  7,-25,-19, 15,-28, 28,-25, -8,  2,-13,  9, 20, -7,-10,-21,-22, -2,  6;
/M: SY='P'; M= -6, -9,-28, -6,  3,-21,-21,-15,-13, -2,-14,-11,-11, 19, -5, -6, -6, -2,-13,-27,-17, -3;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-30, -9,-18,-30, 65,-19,-39,-19,-30,-19,  0,-19,-17,-19,  1,-19,-30,-20,-29,-18;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -5, -3,-27,  0,  6,-26,-16,-12,-23, 10,-25,-15, -3, 16,  2,  4,  1,  0,-20,-28,-18,  2;
/M: SY='A'; M= 28,-11,-13,-17,-15,-23, 24,-21,-20,-15,-17,-13, -7,-15,-15,-20,  5, -8,-10,-21,-24,-15;
/M: SY='Y'; M= -9,-11,-24,-12, -2, -8,-25, -8, -4,  0, -8, -3,-11,-17,  1, -4, -6,  0, -2,-11,  7, -1;
/M: SY='I'; M=  0,-18,-24,-25,-22, -6, -6,-22, 11,-22,  3,  4,-11,-20,-18,-22, -9, -8,  7,-21,-10,-22;
/M: SY='L'; M=-13,-24,-26,-26,-18,  6,-29,-12, 10,-14, 20, 10,-22,-26,-13, -7,-24,-11,  2, -2, 13,-17;
/M: SY='T'; M=  1, -2, -9,-12,-11, -4,-18,-18,-10,-12, -9, -9,  0,-14,-12,-12, 14, 34, -2,-28, -9,-11;
/M: SY='V'; M= -3,-18,-15,-18,-15, -7,-21,-20, 12,-14,  0,  2,-17,-24,-17,-15, -6,  0, 25,-28,-10,-16;
/M: SY='F'; M= -9,-18,-20,-21,-20, 13,-26,-20, 13,-22, 12,  6,-16,-24,-22,-19,-13, -6, 12,-19,  0,-21;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-25, 13, 14,-28,-13,  7,-26,  8,-24,-14, 11,-12, 13,  7,  3, -5,-23,-30,-13, 13;
/M: SY='G'; M= -3, -3,-28, -5,-17,-24, 55,-16,-36,-18,-28,-19,  6,-20,-18,-17,  0,-17,-29,-22,-26,-17;
/M: SY='B'; M= -6, 11,-22,  9,  8,-23,-12, -6,-22,  4,-21,-14,  9,-11,  5,  0,  7, 10,-18,-28,-13,  6;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K'; M= -7,  4,-22,  3,  7,-21,-12, -7,-23, 18,-21,-12,  5,-10,  4, 14,  1,  2,-16,-23,-12,  5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-22,-31,-23, -3,-33,-27, 26,-25,  9,  8,-22, -1,-20,-26,-17, -9, 16,-24, -8,-25;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-28, 12, 42,-29,-20,  2,-27, 11,-20,-16,  1, -4, 20,  3,  1, -5,-26,-28,-16, 31;
/M: SY='K'; M= -5, -1,-26,  1, 10,-25,-13, -9,-25, 13,-24,-15,  0,  4,  3, 10,  1, -2,-20,-27,-17,  6;
/M: SY='F'; M=-18,-26,-17,-33,-27, 55,-30, -9,  1,-23,  7,  2,-21,-30,-29,-17,-20,-10, -1, 10, 39,-26;
/M: SY='D'; M=-10, 17,-26, 22, 15,-30, -8, -3,-28,  2,-25,-19, 10, -5,  8, -3,  5, -1,-25,-32,-18, 11;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-19,-33,-28,  2,-30,-28, 33,-24, 14, 13,-24,-25,-25,-23,-14, -4, 35,-24, -5,-28;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-28, 15, 39,-27,-19, -2,-26, 12,-20,-17,  1, -6, 14,  4, -1, -7,-24,-27,-15, 26;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='L'; M= -7,-12,-23,-13,  4,-10,-26,-15,  4,-11,  8,  2,-13,-15, -4,-12, -9, -1,  0,-25, -9, -1;
/M: SY='G'; M= -8,  5,-27,  7, -1,-28, 13, -2,-33,  4,-27,-17,  8,-16, -2,  7,  1,-10,-25,-27,-18, -2;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-18,-30,-26,  0,-32,-27, 29,-22, 17, 12,-24,-25,-23,-20,-14, -1, 33,-25, -6,-26;
/M: SY='L'; M= -2,-11,-18,-14,-11, -5,-20,-14,  3,-12,  8,  5,-10,-21,-12,-11, -9, -3,  4,-25, -8,-11;
/M: SY='K'; M=-15,  3,-31,  7,  3,-20,-17,  2,-26, 11,-24,-14,  1,  3,  0,  9, -8,-10,-23,-21, -4, -1;
/M: SY='N'; M=-12, 16,-27, 15,  6,-24, -9,  8,-24,  3,-22,-12, 17,-16, 12,  0, -1, -8,-26,-27, -9,  9;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='K'; M= -3, -4,-24, -6, -3,-14, -8, -6,-15,  1,-15, -6, -2,-13,  0, -1, -4, -8,-14,-15, -5, -2; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='A'; M=  1, -7,-17,-10, -6,-13, -2, -7, -9, -5, -8, -5, -3,-12, -5, -3,  1,  0, -6,-18, -9, -7; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S'; M= -1,  3,-23,  4,  0,-22,  1, -8,-23, -6,-21,-17,  4, -9, -4, -8,  6, -2,-19,-22,-16, -2;
/M: SY='G'; M= -3, -8,-26, -7, -6,-21,  9,-14,-23,-11,-23,-16, -2,  8, -9,-13,  6,  0,-20,-26,-18, -9;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-28, -1,  2,-27, -6, -7,-29, 27,-27,-12,  3,-11,  3, 20, -6, -9,-20,-23,-13,  2;
/M: SY='G'; M= -3,  4,-24,  4, -3,-24, 12, -6,-25, -6,-21,-13,  7,-16, -3, -7,  3, -8,-21,-27,-17, -3;
/M: SY='M'; M=-12, -7,-23, -8,-11, -3,-21, -8,  3,-14,  8, 16,-11,-16, -7,-14,-13, -8, -2,-22, -3, -9;
/M: SY='V'; M= -5,-21,-20,-23,-15, -5,-28,-21, 18,-14, 11, 10,-20,-22,-15,-14,-13, -4, 21,-25, -7,-17;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-37,-28,  8,-36,-27, 37,-29, 24, 17,-23,-24,-23,-26,-21, -9, 26,-19,  1,-28;
/M: SY='R'; M= -8,-13,-25,-15, -4,-13,-23,-13, -6, 10, -1,  2,-11,-18, -2, 13,-13, -7, -4,-21, -7, -5;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-29,-23, -5,-30,-26, 25,-16,  8,  9,-22,-24,-21,-17,-12, -5, 30,-26, -8,-24;
/M: SY='T'; M=  0, -7,-17,-12, -8,-13,-17,-16,-12,  3,-12, -7, -5,-14, -5,  5,  5, 18, -2,-25,-10, -7;
/M: SY='D'; M=-13, 22,-21, 32,  6,-26,-12, -7,-24, -5,-15,-16,  6,-15, -5,-10, -1, -5,-16,-35,-16,  1;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-27,  7,  8,-28, -6,-10,-25,  3,-24,-15, -1,  5,  2, -4,  1, -3,-21,-28,-19,  4;
/M: SY='R'; M=-12,  3,-29,  7,  9,-27, -3, -3,-31, 11,-25,-17,  4, -7,  3, 17, -2,-10,-25,-26,-17,  4;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-23,-20,-14, -4,-19,-19,  5,-21, 22,  7,-22,-12,-16,-18,-20, -9,  1,-23, -9,-16;
/M: SY='L'; M= -8,-20,-24,-21,-11, -5,-27,-17,  9,-12, 20, 10,-19,-18,-10, -8,-20, -9,  3,-22, -5,-12;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-24,  1, 10,-21,-15, -9,-13, -1,-10, -8, -1,-10,  4, -6, -3, -5,-12,-27,-15,  7;
/M: SY='K'; M=  0, -5,-24, -4,  6,-19,-18, -8,-15,  7, -8, -5, -7,-14,  6,  3, -7, -8,-12,-20, -8,  6;
/M: SY='T'; M=  3, -6,-14,-11, -9,-12,-14,-12,-10, -9,-12, -9, -3,-14, -8, -7, 13, 24, -1,-27, -9, -9;
/M: SY='G'; M=  1, -6,-23, -9,-15,-23, 36,-16,-25,-16,-23,-14,  3,-18,-14,-16,  6, -5,-18,-25,-23,-15;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-29, -9,-19,-29, 64,-19,-38,-18,-29,-19,  1,-20,-18,-17,  0,-19,-29,-21,-29,-19;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-26,-37,-28,  1,-36,-29, 42,-27, 16, 16,-20,-20,-20,-28,-16, -7, 28,-20, -1,-28;
/M: SY='V'; M=  4,-28,-16,-31,-27, -2,-26,-28, 22,-20,  6,  7,-26,-25,-24,-21,-11, -4, 32,-12, -7,-26;
/M: SY='Q'; M=  3, -2,-25, -4, 11,-33,-15,  7,-19,  6,-19, -3, -1,-11, 38,  5,  3, -7,-22,-21,-11, 24;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  3,-20, -1, 18,-11, 19, 55,-19,-20, -2,-10,-19, -8,  9,-19,  1,-11;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M= 11,  0,-10, -1, -1,-20, -1,-11,-19,-10,-28,-19,  9,-10, -1,-10, 38, 20, -9,-39,-20, -1;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-29,  1,-36,-29, 41,-27, 21, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 33,-23, -3,-29;
/M: SY='Y'; M=-13,-26,-27,-30,-25, 13,-34, -8, 25,-20, 11, 10,-21,-26,-17,-20,-19, -9, 15,  0, 33,-25;
/M: SY='Q'; M= -5,-11,-20,-14,  0,-22,-24, -7, -2, -3, -7,  3,-10,-16, 23, -4, -6, -8, -6,-22, -9, 11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-13, 39,-26, 42, 12,-31, -5,  5,-31, -1,-28,-24, 32,-14,  0, -6,  4, -7,-29,-38,-19,  6;
/M: SY='G'; M= -3,  2,-27, -1,-15,-27, 48,-13,-33,-15,-29,-19, 12,-20,-15,-15,  2,-15,-27,-25,-27,-15;
/M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2,  7,-28,-17, -8,-30, 42,-28,-10,  0,-12, 10, 35, -9,-10,-21,-20,-11,  8;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-31,-22, 10,-31,-21, 25,-28, 37, 19,-23,-27,-20,-21,-25,-10, 13,-19,  1,-22;
/M: SY='V'; M=  4,-26,-18,-32,-26, -3,-29,-27, 30,-22, 12, 12,-23,-23,-22,-23,-11, -4, 32,-24, -7,-26;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-26,-11,-20,-30, 67,-20,-40,-20,-30,-20, -1,-21,-20,-20,  0,-20,-29,-21,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 46,-11, -4,-21,-11,-19, -2,-21,-10,-11,-10,-10,-11,-12,-11,-20,  9,  0,  1,-22,-20,-11;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-32,-29,  4,-32,-27, 31,-23, 16, 13,-27,-28,-27,-22,-15, -4, 38,-24, -3,-29;
/M: SY='T'; M= 10, -2,-11, -9, -8,-15, -5,-18,-15,-11,-16,-13,  1,-11, -8,-12, 22, 30, -5,-30,-15, -8;
/M: SY='H'; M=-17, -9,-28,-10, -8, -1,-23, 60,-18,-10,-10,  1, -2,-23,  0, -3,-13,-15,-20,-11, 33, -8;
/M: SY='V'; M=  2,-20,-17,-21,-22,-13,  1,-23,  1,-15, -6, -2,-17,-24,-20,-14, -4, -5, 16,-26,-16,-21;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-26,-36,-26, 40,-29,-22,  7,-27, 10,  2,-23,-27,-27,-21,-21,-12,  1, 19, 18,-25;
/M: SY='V'; M=  0,-17,-20,-17,-12,-13, -8,-18,  0,-12, -3, -2,-14,-18,-11,-10, -4, -5,  8,-26,-14,-12;
/M: SY='N'; M=-11, 10,-22,  5, -2, -6,-10, -1,-17, -5,-17,-11, 16,-18,  0, -2,  2, -3,-19,-25, -7, -1;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='D'; M=-10, 19,-24, 23,  3,-15, -4, -1,-26, -7,-21,-19, 13,-15, -6,-10,  2, -5,-21,-27, -9, -2; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P'; M= -5, -3,-29,  3,  7,-27,-12, -7,-22, -7,-25,-18, -4, 33, -3,-13,  2, -5,-24,-32,-22,  0;
/M: SY='A'; M=  6, -4,-20, -6,  1,-21,-12,-15,-15, -1,-17,-12, -3, -1, -4, -6,  6,  6,-10,-27,-17, -2;
/M: SY='V'; M=-10,-18,-20,-22,-15, -8,-24,-14,  5, -2, -2,  5,-13,-21,-10,  3,-12, -8,  7,-22, -5,-15;
/M: SY='G'; M=  6,-11,-16,-13,-18,-27, 46,-20,-34,-17,-26,-18, -4,-17,-18,-18,  0,-16,-24,-22,-28,-18;
/M: SY='Y'; M=-13,-18,-28,-19,-20, 12, -3,  4, -9,-15, -3, -2,-15,-27,-14,-14,-15,-11,-13,  9, 39,-20;
/M: SY='G'; M=  3,-18,-19,-20,-23,-15, 23,-23,-10,-21,-11, -7,-11,-22,-22,-21, -5,-12, -1,-22,-19,-23;
/M: SY='T'; M= -3,-14,-13,-21,-19, -7,-23,-23, 10,-17,  1,  1,-10,-19,-17,-16,  1, 17, 14,-28, -9,-19;
/M: SY='F'; M=-14,-25,-24,-24,-16, 17,-26,-16, -7,-20, -4, -7,-22, 17,-22,-19,-18,-11,-13, -6,  6,-20;
/M: SY='I'; M= -1,-25,-25,-34,-25, -2,-32,-25, 34,-25, 16, 15,-18,-19,-17,-26,-15, -6, 21,-19, -1,-25;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-29, 21, 32,-30,-17,  2,-29, 10,-23,-17,  4, -3, 14,  1, -1, -9,-27,-28,-14, 22;
/M: SY='W'; M= -9, -4,-32, -4,  4,-14,-16, -9,-20, -4,-18,-15, -5,-17,  1, -4,-10,-13,-23, 22, -1,  3;
/M: SY='M'; M= -8,-20,-20,-30,-20,  0,-20, -2, 19,-11, 21, 55,-20,-20, -2,-11,-20,-10, 10,-20, -1,-11;
/M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-23,-18,  6,-29,-18, 17,-24, 35, 17,-24,-27,-17,-18,-25,-10,  9,-20,  1,-18;
/M: SY='K'; M=-12,  5,-29,  8, 12,-25,-15,  0,-25, 17,-21,-11,  3,-13, 10, 13, -6,-10,-21,-23, -9, 10;
/M: SY='L'; M=-10, -9,-26, -8,  3,-11,-25,-12,  1,-10,  4,  1,-11,-10, -6,-12,-12, -6, -3,-24, -7, -2;
/M:         M= -6, -6,-17, -7, -6,-11,-16,-11,-10, -9, -5, -3, -5,-16, -7, -5, -5, -3, -8,-21, -9, -7;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-24,  2,  4,-17, -4, -8,-21, -1,-18,-13,  2,-11, -1, -4, -1, -5,-17,-23,-12,  1;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-24,  0, -1,-16,-19, -3, -9,  0, -7, -1,  0,-17,  1, -1, -6, -4, -9,-25, -6, -1;
/M: SY='E'; M= -3, -9,-24, -7,  3,-17,-16,-16, -8, -9, -6, -7,-10,  2, -6,-13, -2,  1, -8,-27,-15, -3;
/M: SY='P'; M= -7,  0,-27,  0, -1,-20,-16,-10,-17,  0,-16,-12,  1, 12, -5, -4, -5, -3,-18,-27,-14, -5;
/M: SY='Q'; M=  1, -3,-22, -6,  0,-19,-10, -7,-15,  0,-14, -7,  1, -5,  2, -1,  1, -2,-15,-25,-13,  0;
/M: SY='R'; M= -7,  0,-24, -2,  5,-16,-11, -5,-22,  8,-20,-12,  4,-15,  6, 12,  1, -5,-18,-23,-11,  5;
/M: SY='A'; M=  6, -5,-23, -9, -3,-19, -9,-14,-16, -2,-15,-11, -2,  0, -4, -8,  0,  0,-14,-18,-15, -4;
/M: SY='V'; M=  3,-17,-20,-18,-13,-13,-13,-19,  0,-14, -5, -3,-13, -7,-11,-13, -1,  0,  5,-27,-15,-14;
/M: SY='A'; M= 10, -5,-17, -7, -4,-15,-10,-15,-13, -6,-12,-10, -5,-11, -6, -9,  5,  4, -5,-25,-14, -5;
/M:         M= -6, -9,-24, -9, -7, -7,-16,-14, -9, -9, -9, -6, -9, -7,-10,-11, -7, -6, -7,-14, -8, -8;
/M: SY='A'; M=  6, -4,-21, -4, -2,-21, -4,-14,-18, -6,-16,-11, -4,  0, -6,-10,  6,  2,-13,-28,-18, -5;
/M: SY='R'; M= -3, -4,-22, -8, -1,-13,-15, -5,-17,  2,-17,-10,  1,-12,  1,  6,  2,  2,-13,-19, -9,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 1
Number of true positive hits 1
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase S55
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
1 sequence

SP4B_BACSU  (P17896)

			
		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission