Entry: PS51495

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] GLUE
Accession [info] PS51495
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUL-2011 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51495
Associated ProRule [info] PRU00828

Name and characterization of the entry

Description [info] GLUE domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=198;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=193;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6033959; R2=0.0142529; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14176.95652; R2=21.47826; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=449; N_SCORE=9.0; H_SCORE=23069; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; N_SCORE=6.5; H_SCORE=20041; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V'; M= -1,-25,-39,-28,-21,-12,-22,-28, 24,-21, 22, 25,-18,-17,-20,-25,-13, -3, 27,-61,-30,-18;
/M: SY='D'; M=  4, 25,-56, 31, 30,-61,  0, -1,-25,  2,-39,-27, 19, -9, 17,-13,  3, -1,-20,-73,-45, 24;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-46,-22,-21,-19,-23,-16,  6,-11,  8,  8,-14,-14,-12, -9,-11,  0,  5,-35,-31,-15;
/M: SY='T'; M= -2,-11,-34,-14,-21,-10,-15,-17,  1,-14,-11, -7, -7,-14,-19,-19,  4, 18, -4,-45, -7,-20;
/M: SY='T'; M=  7, -3,-35, -5, -3,-43, -2,-15, -9, -6,-22,-11, -1,  8, -5,-10,  7, 11, -4,-61,-41, -5;
/M: SY='S'; M=  0, -4,-19,-14,-15,-31, -6,-14,-24,-12,-33,-25, -2, -1,-18, -9,  9,  4,-19,-10,-24,-18;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-38,-12,-11,-32, 14,-23, -9,-20,-17,-14, -7,-14,-19,-31,  0,  2, -4,-60,-35,-15;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-48, -9, -6,-44,-29, 13,-17, 20,-25, -6,  1, -5, 13, 32, -8, -7,-22,-15,-42,  5;
/M: SY='P'; M= 10, -8,-40,-14, -7,-55, -3,-11,-24,-18,-28,-26, -7, 48, -1, -6,  7,  0,-16,-70,-55, -7;
/M: SY='V'; M= -8,-24,-39,-28,-23, -6,-24,-22, 14,-27, 14,  9,-18,-22,-23,-27,-15, -6, 15,-46,-20,-21;
/M: SY='L'; M=-22,-34,-57,-42,-35, 25,-47,-20,  8,-38, 41, 20,-30,-34,-23,-39,-34,-21,  6,-22,  4,-29;
/M: SY='Q'; M= -8, -2,-46, -5, -2,-30,-22, -1,-14, -5,-13, -9, -1,-12,  3, -5,-10, -7,-13,-35,-29,  1;
/M: SY='P'; M=  2,  5,-47,  3,  7,-52, -9, -3,-20, -5,-29,-20,  4, 20,  7, -4,  4,  0,-16,-64,-46,  5;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D'; M=  3, 25,-47, 29, 24,-56, 10, -3,-25, -1,-43,-30, 20,-11,  9,-17,  6,  2,-21,-66,-41, 15; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-27;
/M: SY='E'; M=  0, 30,-70, 40, 50,-70,  0,  0,-30,  0,-40,-30, 20,-10, 30,-20,  0,-10,-20,-90,-50, 40;
/M: SY='V'; M= -4, -7,-40, -7, -4,-37,-16,-10,  4, -6, -8,  1, -3,-13, -4,-10, -4,  2,  8,-60,-34, -2;
/M: SY='L'; M= -9, -4,-58, -4, -1,-20,-22,-14,  3,-17,  4,  0, -6,-22, -3,-25,-15, -8,  1,-55,-28, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-32,-28,-37,-31, -6,-32,-29, 24,-33, 26, 17,-27,-24,-28,-31,-19, -7, 26,-52,-22,-28;
/M: SY='F'; M=-22,-32,-33,-41,-39, 25,-37,-16,  2,-36,  4, -3,-23,-35,-33,-31,-22,-19, -8,-23, 18,-36;
/M: SY='V'; M= -8,-21,-40,-22,-14,-19,-26,-15, 19,-15, 14, 17,-14,-17, -9,-15,-15, -5, 20,-55,-32,-10;
/M: SY='Q'; M= -9,  3,-63,  7, 12,-46,-21,  5,-15,  5,-13, -4,  3,-11, 21,  0,-11, -7,-17,-53,-43, 16;
/M: SY='D'; M= -1, 20,-51, 23, 22,-59, -4,  5,-26,  2,-40,-28, 17, -5, 17, -5,  2, -1,-24,-62,-45, 19;
/M: SY='N'; M=  0, 12,-44, 11,  8,-51,  8,  3,-24,  5,-41,-24, 13, -7,  4, -2,  5,  0,-22,-51,-41,  5;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-22,-30,-22,-15,-22,-30, 43,-28, 20, 20,-20,-22,-30,-28,-12,  0, 48,-77,-28,-22;
/M: SY='G'; M=  2,  8,-47,  9,  8,-62, 26,-14,-28, -2,-48,-33,  8,-11, -4,-15,  4, -2,-24,-64,-56,  2;
/M: SY='L'; M=-15,-36,-54,-43,-35, 12,-41,-30, 31,-34, 52, 33,-33,-28,-24,-34,-31,-13, 29,-38,-22,-28;
/M: SY='Y'; M=-31,-24,-16,-30,-29, 36,-47,  1,-22,-36,-25,-29,-10,-47,-31,-38,-23,-25,-28,-24, 70,-30;
/M: SY='E'; M=-11,  7,-55,  9, 10,-25,-19,  7,-21,-14,-26,-23,  7,-21,  8,-18, -9,-11,-24,-54,-15, 10;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='G'; M=  8,  6,-42,  7,  7,-58, 41,-20,-28,-14,-46,-35,  5, -8, -9,-31,  8,  1,-20,-75,-54, -2;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='K'; M= -2,  9,-46,  9,  9,-54,  0, -6,-22, 11,-36,-17,  9, -2,  6,  2,  4,  0,-21,-52,-44,  6; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-36, -2,  0,-24,-16,  1,-12, -8,-18,-13,  2, -9,  1, -9, -4, -4,-11,-41,-17,  0; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='K'; M=-14,  3,-56,  3,  3,-58,-15, -2,-20, 37,-35, -2,  8,-12, 11, 28, -2, -3,-25,-34,-45,  5; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='I'; M= -4,-15,-28,-18,-16,  2,-17,-14, 10,-17,  9,  5,-12,-13,-14,-17,-10, -4,  6,-28,-11,-14; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='T'; M= -2, -5,-34, -9, -9,-25,-14, -7, -5,-12,-12,-10, -3,  0, -6,-10, -2,  3, -5,-43,-26, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='K'; M= -1, 10,-45, 10,  7,-44, -7,  7,-18, 13,-31,-12, 13, -4,  8,  9,  3,  0,-18,-43,-32,  7; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='F'; M=-24,-25,-42,-32,-31, 24,-40,  5, -3,-25,  1, -3,-14,-30,-17,-13,-23,-21,-15,-14, 19,-22; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='Q'; M= -5, 11,-53, 17, 20,-51,-11,  8,-19,  9,-25,-12, 11, -7, 22,  3, -3, -4,-19,-55,-41, 21; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='B'; M=  3, 13,-37, 13,  9,-40, -2,  2,-14,  5,-29,-15, 13, -5,  4, -2,  7,  6,-12,-47,-29,  5; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='G'; M=  7, -1,-36, -1,  0,-51, 45,-24,-23,-17,-39,-31, -1, -9,-15,-32,  7,  0,-14,-70,-51, -7; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='R'; M= -8, -7,-38, -9, -9,-29,-19, -1, -8,  2,-14, -6, -3, -9,  0,  5, -5,  0, -9,-30,-26, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-9;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-29,-29,-24, -5,-23,-24, 17,-30, 17,  9,-21,-18,-23,-28,-14, -6, 18,-48,-18,-21; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='Y'; M=-20,-27,-25,-33,-31, 23,-36, -9,  3,-27,  1, -3,-16,-33,-27,-26,-19,-13, -4,-26, 27,-29; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='L'; M=-14,-34,-57,-42,-33,  8,-40,-27, 19,-35, 53, 31,-33,-21,-19,-34,-30,-15, 21,-31,-22,-26; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='T'; M= 10,  1,-26,  0, -8,-38,  1,-18, -2, -1,-21,-11,  1,  1, -9,-10, 18, 34, -1,-54,-29, -9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='T'; M=  5,  5,-26,  2, -2,-35, -1,-10, -8,  3,-25, -8,  7, -2, -6, -6, 12, 17, -5,-45,-28, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='H'; M=-14,  6,-47,  3,  4,-37,-23, 43,-25,  8,-28,-16, 13, -8, 25, 21, -7,-12,-27,-35,-22, 17; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='R'; M=-19, -8,-38,-18,-18,-45,-37, 22,-19, 35,-37,-10,  1, -1, 10, 63, -9,-10,-28, 16,-44,  1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-9;
/M: SY='I'; M=-13,-34,-45,-38,-33, 12,-37,-30, 43,-28, 40, 28,-28,-29,-26,-28,-27, -8, 33,-45,-21,-29;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='I'; M=-16,-36,-12,-40,-39,  6,-35,-29, 30,-35, 11,  7,-28,-32,-36,-29,-19,-11, 21,-52, -8,-37; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='W'; M=-50,-48,-47,-62,-66, 34,-65,-16,-33,-43,-12,-32,-34,-60,-51,-16,-29,-42,-48, 75, 42,-56; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-27,-26,-21,-13,-19,-22, 25,-20,  8, 10,-16,-18,-23,-18,-11, -2, 25,-53,-26,-19; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='D'; M=  0, 30,-52, 35, 27,-59, -3,  4,-26,  2,-43,-32, 24, -9, 15,-10,  2,  0,-26,-65,-43, 20; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='E'; M=  2, 12,-38, 12, 13,-50, -3,  0,-22,  5,-32,-18, 11,  4, 11, -2,  5,  3,-18,-50,-39, 10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='N'; M= -1, -1,-40, -1, -1,-31, -3,-11, -9, -3,-18, -9,  1,-11, -4,-11,  0,  1, -9,-47,-28, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='D'; M= -3,  9,-43, 10,  8,-32, -9, -3,-15, -2,-27,-17,  9,-13,  2, -8,  0,  0,-17,-45,-24,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-1;
/M: SY='P'; M=  6, -4,-29, -9, -6,-37, -3, -5,-16,-13,-21,-19, -3, 30, -2, -4,  6,  1,-11,-50,-37, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-1; IM=0; DM=-1;
/M: SY='D'; M=  3,  8,-42,  9,  8,-48, -7,  0,-17,  5,-31,-18,  9, -3,  7,  3,  4,  4,-15,-49,-38,  9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M= -5,  5,-41,  2,  4,-53, -4, -3,-21, 18,-37,-14,  7, -4,  6, 13,  4,  2,-20,-37,-43,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M:         M= -6, -4,-21, -7, -8,-24,-17,  0,-11,-14,-22,-16, -1,-14, -9,-12, -3, -6,-10,-45,-12, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  1, -9, -7,-17,-16,-26, -6,-15,-17,-21,-28,-21, -7,  3,-19,-19,  5,  2,-12,-42,-18,-20; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-22,-28,-24,-12,-22,-23, 14,-23,  5,  6,-18,-20,-24,-22,-12, -6, 15,-51,-20,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M= 13,  1,-16, -2, -3,-38,  9,-16,-13, -9,-27,-18,  1,  3,-10,-13, 10,  9, -7,-49,-32, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M=-12,-32,-41,-35,-31,  9,-34,-28, 40,-27, 36, 26,-26,-27,-25,-27,-25, -7, 32,-45,-20,-27; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M= -1,  6,-46,  3,  7,-48,-10,  2,-23, -7,-26,-21,  4, 15,  9, -5,  1, -4,-18,-58,-41,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-19,-35,-59,-44,-36, 19,-46,-22, 17,-36, 55, 30,-33,-29,-19,-34,-35,-18, 15,-21,-12,-27; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M=  2, 11,-29,  7,  5,-46, -2, -1,-20,  9,-36,-17, 12, -2,  2,  2,  8,  7,-17,-39,-34,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='D'; M= -2, 13,-48, 16, 13,-43,-10, -3,-18, -5,-26,-20, 10,-13,  8,-13, -4, -1,-17,-55,-34, 11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-28,-29,-23, -7,-24,-28, 40,-25, 22, 19,-20,-22,-26,-25,-14,  0, 39,-62,-24,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M=  1,  0,-41,  3,  4,-34,-11,-10,  4, -6,-14, -8,  2,-11,  0,-11, -4,  2,  1,-61,-35,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='H'; M= -8, -1,-37, -5, -4,-27,-18,  9,-18,  0,-29,-18,  4,-10,  1,  6, -4, -7,-20,-29,-19,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='V'; M= -3,-24,-24,-27,-22, -3,-21,-22, 20,-26,  8,  8,-16,-20,-26,-26,-11, -3, 21,-55,-11,-21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M= -4, 13,-49, 15, 18,-43, -8,  2,-22,  1,-32,-20, 11,-10, 12, -8, -1, -5,-20,-55,-30, 15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='Y'; M=-15,-13,-38,-18,-15, -3,-26, -1,-11,-18,-14,-11, -6,-19,-12,-16,-11,-12,-15,-35,  4,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='H'; M=-10, -5,-27, -8, -6,-16,-20,  5,-13,-11,-22,-16,  1,-16, -5,-12, -5, -4,-12,-40,  0, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M=  9,  3,-34,  2,  3,-42,  1, -8,-13, -7,-23,-14,  4,  3,  0,-11,  5,  5, -7,-58,-37,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='G'; M=  1, -2,-41, -4, -3,-46,  5,-12,-17,  5,-28,-13,  1, -5, -4, -2,  3,  3,-15,-45,-43, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='F'; M=-15,-26,-36,-32,-32, 19,-20,-16, -5,-32,-12,-12,-16,-26,-32,-29,-13,-14,-15,-30, 14,-31; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-12,-28,-45,-34,-30, 10,-28,-25, 16,-25, 23, 21,-22,-25,-23,-27,-19,-10, 12,-36,-13,-26; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='R'; M=-11,-12,-40,-17,-17,-23,-13, -7,-13,  0,-27,-13, -4,-13,-12,  3, -5, -6,-19,-29,-22,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='R'; M= -4,  1,-29, -5, -5,-44,-12,  4,-19, 18,-35,-12,  7,  0,  2, 22,  4,  3,-19,-21,-36, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  9,  7,-10,  0, -1,-41, 12,-12,-18,  0,-37,-19,  8,  6,-10,-11, 17, 17,-10,-37,-33, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M= 12, -2,-32, -8, -5,-48,  1,-11,-21,-13,-28,-24, -2, 36, -4, -7, 11,  7,-13,-60,-45, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M=-17, -2,-53, -6, -6,-59,-23,  0,-19, 47,-38,  2,  6,-11,  8, 44, -2, -2,-27,-19,-46, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-37,-31,-27,  5,-29,-25, 33,-24, 30, 21,-22,-23,-22,-24,-20, -4, 26,-41,-20,-24; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -3,-13,-28,-16,-16,-24,-17,-14, 15, -1, -7,  3, -7,-10,-12,  2, -3,  6, 10,-41,-30,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-15,-32,-46,-39,-33, 16,-37,-24, 20,-31, 37, 24,-27,-27,-23,-31,-25,-12, 17,-31, -8,-27; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='H'; M=-13,-10,-37,-14,-13,-13,-25,  5, -6, -6,-15, -7, -3,-17, -5,  0, -9, -7,-11,-31,-10, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-51,-38,-30,  7,-35,-24, 16,-30, 40, 24,-28,-17,-18,-28,-25,-12, 15,-32,-20,-24; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M= -5,  5,-45,  4,  5,-44, -8,  2,-17,  4,-26,-14,  7, -7,  6,  0, -2, -4,-16,-48,-36,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  0, -3,-36, -7, -4,-40,-11, -4,-12, -2,-20,-10,  0, 16,  0,  3,  3,  1, -9,-49,-37, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  2, -6,-28,-10, -7,-26, -4, -7, -9,-15,-14,-13, -4,  6, -8,-13,  1, -1, -5,-47,-23, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M=  1,  5,-35,  5,  7,-43, -1, -4,-17,  6,-25,-12,  5,  3,  7, -1,  5,  5,-14,-45,-35,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  4,  3,-26,  0,  0,-38,  0, -6,-15,  4,-27,-13,  4,  5, -1,  2,  7,  6,-12,-35,-32, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M= -2,  3,-31,  0,  1,-33, -3,  0,-15,  2,-22,-13,  4, -1,  2,  2,  1, -1,-13,-31,-29,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M=  0, 10,-33, 10, 11,-41, -3,  0,-17,  7,-26,-13,  9,  1,  9,  0,  4,  2,-15,-40,-31,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M:         M= -1,  0,-36, -1,  0,-26, -5, -7, -7, -7,-10, -7,  0, -4, -1,-10, -2, -2, -5,-39,-27, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  3,  0,-16, -3, -1,-25, -3, -4, -7,  1,-15, -7,  1,  5, -1,  1,  4,  5, -5,-24,-22, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-18, -4, -5,-21,  0, -9, -9, -7,-16,-13, -1, -1, -7, -7,  3,  2, -8,-20,-20, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  1, -1,-21, -2, -2,-22, -6, -4, -6,  0,-10, -4,  0,  0,  1, -2,  3,  9, -5,-26,-21, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='W'; M=-36,-32,-48,-43,-48,  4,-42,-17,-28,-23, -9,-25,-26,-37,-33,  6,-16,-30,-40, 84, -2,-38; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -1, -8,-21, -8,-10,-15, -9,-13,  7, -9, -3, -2, -5,-10,-11,-10, -1,  5,  6,-29,-17, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-11,-19, 45,-23,-27,-34,-16,-18,-16,-31,-35,-29,-19,-16,-29,-20,  2,-12,-10,-48, -6,-28; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  0, -2,-25, -4, -4,-30, -9, -1,-10,  5,-17, -8,  0, 10,  3, 10,  3,  5,-10,-25,-27, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -9,-20,-23,-22,-21,  3,-21,-18, 24,-15, 12,  9,-15,-19,-19,-11,-13, -5, 16,-20,-12,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-14,-22, 55,-27,-33,-33,-19,-19,-17,-33,-38,-31,-22,-19,-34,-20,  1,-14,-11,-48, -3,-34; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  0, -2,-20, -5, -5,-21,  2, -9, -7,  1,-13,  0,  0, -4, -5, -5,  3,  3, -4,-27,-22, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='F'; M=-11,-24,-22,-27,-26, 26,-23,-12,  6,-29,  5, -1,-15,-23,-25,-24,-14,-12,  0,-19, 20,-23; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  1, -3,-14, -5, -5,-21,  2, -6, -3, -4,-14, -8,  0, -3, -7, -6,  3,  5, -1,-29,-20, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M=  1, 14,-26, 13,  9,-25,  0,  9,-12,  4,-23,-12, 14,  0,  4,  0,  6,  1,-11,-30,-15,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-31,  5,  8,-27, -8,  0, -9, -4,-12,-10,  3, -3,  6, -6, -2, -3, -6,-37,-23,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-22, -6, -3,-24, -3, -6,  0, -4, -9, -3, -3, -5, -3, -5, -1,  2,  2,-35,-25, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  0,  5,-27,  5,  7,-34, -4,  0,-15,  3,-21,-11,  5,  8,  7,  1,  3,  1,-13,-33,-27,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='G'; M=  2, -3,-20, -5, -4,-23, 16,-14,-10, -8,-15, -9, -2, -5, -9,-17,  2,  1, -6,-33,-25, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M= -1,  6,-26,  6,  7,-25, -1, -4,-10, -1,-13, -8,  4, -6,  2, -8,  0, -1, -7,-30,-21,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-15,-24, 55,-29,-34,-31,-21,-18,-15,-32,-35,-29,-24,-19,-33,-16,  0,-15,-11,-42, -2,-33; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='V'; M=  0, -7,-15, -9, -7,-16,  0,-11,  2, -8, -6, -2, -5, -6,-10,-10, -2,  0,  5,-28,-20, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='M'; M= -2, -1,-28, -3, -3,-12, -9, -4, -2, -2,  0,  4,  0, -7, -2, -6, -4, -2, -1,-24,-14, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-15,-23, 54,-28,-32,-31,-20,-18,-16,-33,-34,-29,-23,-19,-31,-19,  0,-15,-11,-46, -2,-32; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='G'; M=  5,  0,-21,  0,  0,-31, 31,-16,-16,-10,-26,-21,  0, -5,-10,-21,  5,  0,-10,-42,-31, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -2,-14,-12,-14,-12, -5,-11,-15, 22,-12,  8,  9, -9,-11,-15,-13, -6,  1, 21,-35,-14,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M=  6,  2,-21,  2,  3,-28, -2, -5, -8, -5,-15,-10,  2,  4,  1, -5,  2,  2, -4,-35,-25,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='D'; M= -1,  9,-30, 10,  9,-35, -3, -1,-14,  8,-22,-11,  9, -2,  7,  1,  2,  1,-14,-34,-27,  7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='D'; M=  3,  9,-27, 11,  9,-32, -1, -2,-11,  2,-19,-12,  7, -3,  6, -5,  3,  5,-10,-37,-25,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M= -2,  1,-26,  1,  1,-24, -7, -2,-10,  3,-16, -8,  2, -1,  3,  1,  0,  0,-11,-26,-20,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M=  8,  4,-15,  3,  3,-25,  6, -8, -8, -4,-17,-11,  3,  2, -3, -9,  7,  8, -4,-32,-20,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='S'; M=  3,  3,-15,  1,  0,-24,  4, -5, -8, -1,-18,-10,  4, -1, -4, -5,  5,  5, -5,-27,-20, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='V'; M= -3, -4,-22, -6, -5,-10, -3, -3,  0,-11, -5, -4, -2,-10, -7,-12, -3, -4,  1,-29,-11, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M=  4, -3,-21, -4, -3,-19, -5, -6, -3, -2, -7, -3, -2, -1, -2, -2, -1,  1, -2,-26,-20, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21,  0,-16,-11,-48,  0,-37; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  5, -5,-21,-10, -5,-31, -5, -6,-14,-10,-15,-15, -5, 33, -1, -1,  6,  2,-10,-37,-30, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='A'; M=  9,  0,-19, -1,  0,-23, -2, -4, -7, -3,-13, -9,  1,  4,  0,  0,  2,  2, -5,-27,-23,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21,  0,-16,-11,-48,  0,-37; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  5,  0,-16,  0, -5,-21,  0,-11,  0,  0,-11, -5,  0,  0, -5, -5, 11, 21,  0,-32,-16, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='F'; M=-21,-32,-32,-37,-37, 53,-32,-11,  5,-37, 11,  0,-21,-32,-32,-26,-21,-21,-11,  0, 37,-32; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M= -5,-12,-30,-14,-11, -3,-18,-11,  7,-14, 18, 10,-12,-12, -6,-15,-13, -6,  7,-23,-15, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M=  0, 16,-26, 16, 11,-21,  0, 11,-11,  5,-21,-11, 16, -5,  5,  0,  5,  0,-11,-26,-11,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='H'; M= -9,  3,-16, -3, -3, -8,-14, 31,-15, -7,-16,-15,  8, -6,  8,  5, -4, -8,-14,-15,  3,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  6, -4,-17, -8, -4,-27, -3, -7,-10,-10,-13,-12, -4, 25, -3, -4,  5,  2, -5,-35,-27, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M= -1,  3,-17,  0,  1,-19, -5,  1, -9, -3,-11, -6,  3, -1,  3, -5,  1,  2, -7,-20,-16,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M= -9,-19,-32,-23,-18,  5,-23,-16, 13,-12, 28, 25,-16,-15,-10,-15,-16, -7, 13,-20,-13,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='R'; M= -6, -5,-23, -8, -7,-18,-12,  1, -4,  6, -9,  1, -1, -6, -1, 10, -5, -4, -5,-12,-20, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M=  4, 10,-21, 10,  6,-21,  2,  3, -8,  1,-18,-10, 10, -2,  1, -3,  6,  4, -7,-28,-14,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21,  0,-16,-11,-48,  0,-37; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M=  0, 16,-37, 21, 26,-37,  0,  0,-16,  0,-21,-16, 11, -5, 16,-11,  0, -5,-11,-48,-26, 21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -8,-17,-25,-20,-17,  5,-20,-16, 22, -8, 19, 21,-13,-16,-12,-11,-13, -4, 16,-26,-12,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21,  0,-16,-11,-48,  0,-37; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='G'; M=  6,  4,-20,  4,  3,-29, 19,-10,-13, -7,-23,-17,  4, -3, -5,-15,  5,  2, -9,-37,-26, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  2, -1,-19, -2, -6,-14, -1, -5, -4, -6,-11, -8,  0, -4, -6, -8,  4,  9, -4,-28,-11, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  0, -4,-23, -9, -5,-30,-10,  1,-15, -1,-17,-12, -3, 24,  4, 10,  2, -2,-12,-25,-30, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-11,-21,-37,-26,-21, 11,-26,-16, 11,-21, 37, 21,-21,-16,-11,-21,-21,-11, 11,-11,-11,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M= -2, -5,-26, -7, -5,-23,-11, -2, -7, -1, -9, -5, -3, 11,  2,  3, -2, -2, -7,-26,-24, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M=  0,  7,-19,  6,  3,-24, -4,  4,-11,  6,-21,-10,  8, -1,  3,  6,  3,  1,-10,-18,-18,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='M'; M= -1, -5,-24, -7, -6,-15, -9, -4, -2, -4, -2,  2, -3, -2, -2, -4, -2, -1,  0,-27,-16, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M=  1,  6,-15,  6,  4,-31, -2, -5,-13, -3,-23,-16,  5,  0,  0, -6,  3,  1,-11,-35,-23,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-25, -9, -6,-24, -5,-10, -7,-11, -7, -8, -5, 12, -4,-10,  0,  1, -4,-36,-27, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='G'; M=  5, -1,-25, -2, -2,-33,  8,-12,-11, -6,-21,-15,  0,  7, -5,-10,  5,  4, -8,-43,-31, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-30,-15,-12,-25,-10,-13,-14,-15,-12,-15, -9,  3,-11, -8, -1, -5,-11,-17,-27,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M:         M= -6,-11,-38,-14, -8,-13,-14,-13, -5,-21, -3, -6, -9, -9,-10,-22, -8, -8, -3,-43,-17, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M= -5,  1,-35,  1, -1,-30, -5, -4,-16,  2,-27,-14,  4,-11, -2, -5,  0,  1,-18,-38,-22, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  2,  6,-22,  1, -1,-34, -1,  6,-17, -4,-28,-20,  7,  5,  1, -4,  9, 10,-13,-40,-25, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='B'; M=  3,  8,-28,  5,  7,-43,  2, -3,-19,  2,-32,-18,  8,  3,  3, -4,  8,  6,-13,-43,-33,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M= -2,  6,-43,  5,  3,-50, -5,  0,-19, 13,-35,-16,  9, -6,  5, 11,  3,  1,-20,-42,-41,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-39, -1, -1,-25,-14, -3,-12, -9,-19,-14,  2,-13, -2,-11, -3, -3,-12,-38,-19, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='E'; M= -1,  6,-37,  8, 10,-51, -6, -4,-17, -5,-30,-21,  5, -1,  7, -9,  2,  1,-14,-62,-41,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='Y'; M=-15,-19,-32,-24,-23,  9,-28, -3, -2,-27, -5, -7,-10,-25,-19,-23,-13, -9, -6,-35, 11,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='I'; M= -9,-31,-30,-32,-28,  5,-28,-28, 44,-27, 24, 20,-22,-27,-29,-26,-18, -4, 36,-57,-18,-27; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M=-12,  1,-53,  1,  1,-56,-18,  1,-18, 33,-32, -2,  7, -8, 13, 28,  0,  3,-23,-34,-44,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='L'; M=-18,-37,-58,-45,-37, 20,-44,-28, 25,-36, 55, 32,-34,-30,-23,-35,-34,-16, 21,-26,-15,-30; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='T'; M=  6,  1, -8, -6, -5,-36,  4,-12, -9, -4,-28,-13,  3,  3,-12,-10, 12, 13, -1,-37,-31,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='F'; M=-34,-52,-45,-61,-62, 75,-49,-21,  7,-62, 11, -4,-36,-52,-54,-45,-33,-34,-17,-11, 53,-54; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-42,-15,-15,-49,-33, 17,-20, 34,-37, -9,  2,  1, 10, 56, -7, -8,-28,  3,-45,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-1;
/M: SY='K'; M= -5,  6,-55,  6,  7,-57,  4, -8,-22, 15,-37,-13,  9,-13,  4,  1,  1, -3,-21,-59,-47,  5;
/M: SY='G'; M=  7,  2,-33, -1, -1,-51, 29,-14,-25,-10,-42,-29,  4, -1,-10,-20, 10,  5,-17,-62,-46, -6;
/M: SY='G'; M=  6,  7,-47,  9,  7,-58, 34,-22,-26,-12,-42,-32,  5,-13, -9,-30,  5,  0,-20,-74,-54, -1;
/M: SY='E'; M= -3,  6,-47,  7,  8,-40,  0, -4,-18,-13,-30,-24,  6,-10,  1,-20, -2, -5,-16,-63,-34,  5;
/M: SY='K'; M= -5,  3,-45,  4,  4,-48,-12, -9, -7,  9,-25, -7,  6, -9,  3,  0,  0,  4, -9,-57,-41,  2;
/M: SY='E'; M=  1,  5,-52,  6, 10,-45, -7,-13,-12,-10,-18,-14,  2, -4,  3,-18, -3, -3, -7,-67,-43,  6;
/M: SY='F'; M=-33,-53,-55,-62,-62, 83,-54,-20,  7,-63, 17, -1,-36,-53,-53,-47,-35,-34,-17, -7, 58,-53;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='Y'; M=-26,-29,-35,-39,-37, 25,-43, -5,-10,-32,  1, -7,-18,-36,-27,-26,-23,-20,-16, -8, 29,-32;
/M: SY='E'; M= -1, 14,-49, 16, 17,-58, -6,  0,-23, 10,-37,-19, 13, -2, 14,  2,  4,  2,-21,-56,-45, 14;
/M: SY='K'; M= -1, -3,-44, -7, -7,-46,-11, -5,-15, 14,-27, -8,  2, -5,  0, 14,  1,  2,-16,-38,-41, -2;
/M: SY='L'; M=-15,-34,-53,-42,-34, 12,-41,-27, 21,-34, 47, 28,-31,-27,-22,-35,-29,-12, 20,-31,-16,-28;
/M: SY='K'; M= -9,  2,-42,  1,  2,-50,-15, -5,-20,  8,-31,-13,  4,-12,  3,  3,  0, -3,-19,-42,-38,  1;
/M: SY='E'; M=  3, 13,-40, 13, 15,-54,  4, -3,-24,  3,-39,-23, 12, -3,  7, -7,  7,  2,-17,-57,-41, 10;
/M:         M= -1, -9,-20,-10, -8,-33,-11,-13, -6,-22,-20,-16, -7,-13,-13,-22, -1, -2, -1,-66,-24, -9;
/M: SY='L'; M=-17,-34,-54,-41,-35,  6,-40,-29, 26,-23, 41, 35,-29,-29,-22,-25,-26,-11, 22,-33,-23,-28;
/M: SY='D'; M= -2,  9,-52, 13, 12,-54, -2, -4,-17,  7,-33,-17,  9, -9,  9, -2,  2,  3,-17,-61,-45, 11;
/M: SY='Z'; M= -2,  9,-52, 12, 13,-55, -6,  3,-20,  6,-31,-18,  9, -7, 14,  1, -1, -1,-19,-57,-47, 15;
/M: SY='R'; M=-14, -8,-52,-13,-12,-47,-25, -6,-13, 24,-27, -3, -1,-10,  0, 26, -5, -5,-20,-22,-43, -6;
/M: SY='K'; M=  0, -5,-49, -6, -2,-45,-12,-12, -9,  3,-16, -4, -2, -5,  0, -1, -2,  0, -7,-54,-43,  0;
/M: SY='W'; M=-42,-38,-70,-52,-58,-15,-53,-20,-42,-27,-20,-35,-31,-41,-37, 11,-17,-35,-53, 92,-19,-45;
/M: SY='E'; M=  1, 14,-58, 19, 24,-53, -4, -4,-20, -6,-24,-18,  9, -8, 16,-17, -2, -3,-15,-70,-44, 20;
/M:         M= -9, -8,-54,-10, -9,-27,-22, -6, -7, -4, -7, -3, -5,-15, -1, -4,-11, -6,-10,-37,-33, -4;
/M: SY='Q'; M= -7, -1,-45, -4,  0,-34,-16, -4,-14, -2,-16, -6,  1, -9,  2, -9, -4, -3,-11,-47,-28,  0;
/M: SY='S'; M= -3,  0,-42, -3, -1,-38, -3,-13,-18, -4,-29,-17,  1, -7, -6,-13,  2,  2,-17,-53,-30, -5;
/M: SY='R'; M= -5, -4,-31, -9, -9,-33,-16,  4,-11,  2,-26,-12,  2, -8, -4,  8, -1, -1,-10,-34,-26, -5;
/M: SY='S'; M=  0, -4,-31, -9, -7,-37, -2,-12,-15, -1,-28,-11,  0,  2, -8, -5,  5,  4,-13,-43,-35,-10;
/M: SY='N'; M= -1,  1,-43, -1,  1,-28,-12, -2,-19,-14,-24,-19,  3,  0, -1,-15, -1, -4,-17,-51,-22, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 11 in 11 different sequences
Number of true positive hits 11 in 11 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] GLUE N-terminal
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] GLUE C-terminal
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
11 sequences

VPS36_ARATH (Q9FF81), VPS36_BOVIN (A5PK00), VPS36_DANRE (Q7ZVK4), 
VPS36_DICDI (Q54T18), VPS36_DROME (Q9VU87), VPS36_HUMAN (Q86VN1), 
VPS36_MOUSE (Q91XD6), VPS36_RAT   (P0C0A2), VPS36_SCHPO (O43038), 
VPS36_XENLA (Q6DDF4), VPS36_YEAST (Q06696)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

2CAY; 2DX5; 2HTH

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission