Entry: PS51535

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PESTIVIRUS_NS3PRO
Accession [info] PS51535
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2011 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2011 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51535
Associated ProRule [info] PRU00868

Name and characterization of the entry

Description [info] Pestivirus NS3 protease (NS3pro) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=174;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=169;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3668725; R2=0.0102380; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-70420.86423; R2=54.75809; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=697; N_SCORE=9.5; H_SCORE=50633; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=404; N_SCORE=6.5; H_SCORE=23873; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-23; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M= -2,-23,-58,-33,-41,-56, 79,-41,-64,-31,-61,-45,-13,-50,-40,-40,-12,-30,-55,-59,-57,-41;
/M: SY='P'; M=-11,-42,-58,-33,-23,-56,-51,-41,-45,-21,-43,-35,-41,109,-31,-31,-21,-30,-37,-68,-57,-22;
/M: SY='A'; M= 67,-28,-11,-29,-19,-40, -1,-29,-31,-10,-31,-21,-27,-11,-19,-29, 23,  1,-11,-51,-39,-19;
/M: SY='V'; M=-11,-61,-21,-61,-41,-19,-61,-50, 39,-40, 13, 11,-51,-41,-40,-40,-31, -2, 66,-49,-29,-41;
/M: SY='C'; M=-10,-60,120,-69,-68,-39,-60,-69,-16,-59,-27,-27,-50,-59,-49,-59,-21,-19,-14,-50,-49,-68;
/M: SY='K'; M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30,  0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='K'; M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30,  0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='I'; M=-26,-60,-20,-68,-56,-12,-68,-58, 63,-48, 18, 18,-58,-48,-48,-48,-38,-16, 47,-50,-30,-56;
/M: SY='T'; M= -7,-23,-20,-33,-30,-33,-40,-37,  2,-20,-17, -3,-15,-35,-20,-27,  5, 54, 12,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M=-20, 13,-63, 13, 36,-51,-27, 20,-60, -1,-58,-41, 10,-29, 13,-12, -3,-17,-45,-59,-33, 25;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='K'; M=-12,-11,-60,-21,  8,-50,-31, -9,-50, 74,-40,-30, -1,-21, 19, 37,-11,-11,-40,-59,-40,  9;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='H'; M=-20,-13,-58,-22, -6,-30,-36, 67,-51, -2,-44,-33,  2,-35,  5, 13,-12,-11,-39,-44,  4, -4;
/M: SY='V'; M= -9,-42,-28,-44,-32,-33,-50,-43,  8,-29,-12, -5,-35, -7,-30,-33,-15, 15, 27,-54,-36,-32;
/M: SY='S'; M=  3, 14,-32, -2,-12,-48, -3,-12,-48, -8,-48,-34, 33,-28, -9,-18, 45, 11,-38,-63,-35,-12;
/M: SY='I'; M=-29,-59,-21,-69,-59, -9,-69,-59, 66,-49, 21, 25,-59,-49,-47,-49,-39,-19, 38,-49,-30,-58;
/M: SY='M'; M=-15,-53,-34,-55,-41,-16,-54,-44,  6,-31, 17, 32,-46, -9,-27,-34,-28,-19,  2,-44,-34,-35;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='K'; M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30,  0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='T'; M= -3,-18,-22,-28,-24,-32,-33,-32,-12,-14,-18,  9, -8,-32,-10,-22, 10, 61,  2,-46,-30,-22;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60, 99,-60,-20,-10,-50,  1,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 39,-60;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60, 97,-60,-21, -9,-50,  2,  1,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-19, -1, 38,-60;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='I'; M=-22,-59,-21,-65,-52,-15,-63,-56, 56,-46, 14, 15,-55,-46,-46,-46,-35,-12, 50,-50,-31,-52;
/M: SY='M'; M=-20,-50,-30,-60,-40,  0,-50,-40, 21,-30, 30, 88,-40,-40,-11,-30,-30,-10, 11,-30,-30,-31;
/M: SY='P'; M= -8,-40,-59,-30,-20,-60,-49,-40,-50,-20,-50,-40,-40,117,-30,-30,-19,-29,-39,-70,-60,-20;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='T'; M= -2,-20,-20,-28,-24,-36,-36,-34, -8,-16,-22, -6,-10,-32,-16,-24, 10, 64, 14,-50,-30,-24;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -7,-39,-58,-30,-20,-59,-48,-39,-49,-20,-49,-39,-39,114,-29,-30,-17,-28,-39,-69,-59,-20;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='A'; M= 68,-30,-11,-30,-20,-41, -1,-30,-31,-10,-31,-21,-30, -7,-20,-30, 19, -1,-11,-51,-41,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-40,-60,-30,-20,-60,-50,-40,-50,-20,-50,-40,-40,120,-30,-30,-20,-30,-40,-70,-60,-20;
/M: SY='V'; M=-10,-50,-20,-53,-38,-23,-55,-47, 31,-35,  3,  7,-41,-39,-35,-37,-21, 14, 53,-50,-30,-38;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 40,-60;
/M: SY='P'; M=-10,-40,-60,-30,-20,-60,-50,-40,-50,-20,-50,-40,-40,120,-30,-30,-20,-30,-40,-70,-60,-20;
/M: SY='T'; M= -3,-19,-21,-27,-24,-36,-35,-33, -9,-16,-22, -6, -8,-32,-16,-24,  9, 61, 12,-50,-30,-24;
/M: SY='S'; M= 40,-12,-16,-18,-14,-40, -6,-24,-36,-10,-36,-26, -6,-16,-14,-24, 50, 12,-22,-56,-34,-14;
/M: SY='L'; M=-29,-68,-30,-68,-59,  0,-68,-49, 18,-39, 56, 28,-58,-49,-39,-40,-37,-29,  9,-40,-20,-49;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 22,-40, 58, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 11,-40,-20,-50;
/M: SY='K'; M=-11,-11,-60,-21,  9,-50,-31, -9,-50, 77,-40,-30, -1,-21, 19, 34,-11,-11,-40,-59,-40,  9;
/M: SY='I'; M=-21,-60,-20,-66,-51,-14,-66,-56, 57,-46, 16, 16,-56,-46,-46,-46,-36,-11, 53,-50,-30,-51;
/M: SY='R'; M=-29,-20,-60,-30,-10,-50,-37, -1,-50, 31,-41,-30,-10,-30,  9, 85,-19,-20,-40,-51,-40,  0;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='G'; M= -2,-17,-61,-25,-29,-60, 78,-36,-69,-26,-69,-49,-10,-47,-33,-37,-10,-29,-58,-60,-59,-31;
/M: SY='L'; M=-33,-68,-33,-68,-60, 20,-68,-44, 12,-43, 45, 22,-60,-53,-42,-42,-41,-33,  2,-26, -7,-52;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='G'; M=  1,-20,-60,-30,-40,-60, 89,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='W'; M=-46,-78,-44,-78,-60, -1,-62,-42,-39,-57,-25,-21,-68,-67,-40,-49,-56,-47,-40,127, 21,-50;
/M: SY='A'; M= 62,-29,-16,-30,-22,-42, 10,-31,-34,-12,-34,-23,-28,-14,-22,-31, 17, -3,-16,-51,-42,-22;
/M: SY='Y'; M=-38,-53,-47,-61,-51, 33,-61, 18,-22,-40,-10,-22,-43,-58,-32,-40,-31,-29,-22, 19, 90,-41;
/M: SY='T'; M=  1,-10,-20,-20,-20,-40,-29,-30,-21,-10,-30,-11,  0,-30,-10,-20, 22, 78, -1,-50,-30,-20;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='Q'; M=-18,-16,-52,-14, 20,-52,-42,  0,-50, 12,-42,-16, -8, -1, 66,  2,-12,-14,-40,-46,-36, 36;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='I'; M=-26,-60,-20,-68,-56,-12,-68,-58, 64,-48, 18, 18,-58,-48,-48,-48,-38,-16, 46,-50,-30,-56;
/M: SY='S'; M= 20,  0,-20,-10,-10,-40,-10,-20,-40,-10,-40,-30, 10,-20,-10,-20, 70, 20,-30,-60,-30,-10;
/M: SY='S'; M= 20,  0,-20,-10,-10,-40,-10,-20,-40,-10,-40,-30, 10,-20,-10,-20, 70, 20,-30,-60,-30,-10;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='D'; M=-28, 38,-62, 69,  8,-48,-34,-24,-52,-22,-50,-31,  8,-32,-10,-30,-14,-18,-46,-70,-54,  2;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 21, 79,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 46,-34, 15,-37,-30,-41,-12,-38,-28,-20,-31,-22,-31,-23,-26,-35, 11,  3,-12,-50,-42,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='K'; M= -4, -8,-52,-18,  6,-48,-26,-12,-48, 61,-40,-30,  2,-20, 14, 21,  5, -4,-38,-60,-38,  6;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='L'; M=-30,-63,-31,-66,-55, -7,-67,-47, 23,-35, 43, 22,-55,-48,-37,-30,-38,-27, 11,-43,-24,-47;
/M: SY='L'; M=-32,-66,-34,-68,-58,  8,-68,-34, 10,-40, 44, 18,-56,-52,-38,-40,-38,-30,  2,-26,  5,-48;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='C'; M=-14,-38, 95,-52,-58,-44,-50,-54,-28,-48,-36,-32,-23,-56,-40,-50,-14,-16,-26,-54,-48,-58;
/M: SY='D'; M=-30, 59,-70, 99, 19,-60,-29,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='S'; M= 16, -2,-20,-12,-12,-40,-14,-22,-36,-10,-38,-26,  8,-22,-10,-20, 61, 31,-24,-58,-30,-12;
/M: SY='M'; M=-22,-52,-28,-62,-44, -2,-54,-44, 30,-34, 28, 76,-44,-42,-18,-34,-32,-12, 16,-34,-30,-36;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-26,-18,-60,-28, -6,-50,-38, -2,-50, 40,-40,-30, -8,-28, 12, 78,-18,-18,-40,-52,-40,  2;
/M: SY='V'; M=-14,-60,-20,-62,-44,-18,-62,-52, 46,-42, 12, 12,-52,-42,-42,-42,-32, -4, 64,-50,-30,-44;
/M: SY='V'; M=-12,-50,-26,-50,-26,-26,-56,-38, 22,-28,  0,  6,-40,-38,-15,-30,-26, -2, 48,-48,-30,-22;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='Q'; M=-21,-10,-53,-11, 26,-46,-40, 24,-51, 16,-41,-14,  1,-31, 80,  9,-11,-13,-41,-40,-22, 44;
/M: SY='S'; M=  9, 13,-31, 12, -4,-44,-14,-19,-46,-12,-46,-36, 14,-22,-10,-22, 53, 12,-36,-64,-36, -6;
/M: SY='N'; M=-26, 38,-52, 12, -6,-58,-14,  6,-58, 16,-56,-38, 72,-36,  4, -2,  6, -2,-48,-68,-40, -6;
/M: SY='N'; M=-30, 50,-50, 20,-10,-60,-10, 10,-60,  0,-60,-40, 90,-40,  0,-10, 10,  0,-50,-70,-40,-10;
/M: SY='K'; M=-10,-11,-52,-21,  2,-48,-31,-13,-44, 58,-38,-26, -1,-23, 13, 25, -5,  7,-32,-57,-38,  3;
/M: SY='M'; M=-19,-48,-28,-55,-42, -8,-52,-41, 12,-29, 27, 52,-38,-41,-19,-31,-23,  2,  8,-37,-27,-34;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='T'; M=  3,-18, 10,-28,-28,-40,-32,-36,-24,-20,-32,-18, -8,-34,-18,-28, 22, 47,-10,-52,-34,-28;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='V'; M=-14,-60,-20,-62,-44,-18,-62,-52, 46,-42, 12, 12,-52,-42,-42,-42,-32, -4, 64,-50,-30,-44;
/M: SY='K'; M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30,  0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='S'; M= 20,  0,-20,-10,-10,-40,-10,-20,-40,-10,-40,-30, 10,-20,-10,-20, 70, 20,-30,-60,-30,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='P'; M= -4,-32,-52,-26,-18,-56,-42,-36,-48,-18,-48,-38,-30, 91,-26,-27, -2,-20,-38,-68,-54,-18;
/M: SY='D'; M=-25, 36,-70, 62, 48,-60,-35,-11,-65, -6,-65,-51,  6,-25,  9,-21,-10,-20,-51,-71,-55, 34;
/M: SY='G'; M=  0,-19,-60,-29,-37,-60, 87,-39,-70,-29,-70,-50,-10,-49,-38,-39,-10,-30,-60,-60,-60,-38;
/M: SY='A'; M= 67,-30,-11,-30,-19,-40, -2,-29,-29,-10,-30,-19,-30,-11,-18,-29, 18,  0, -9,-50,-40,-19;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='L'; M=-33,-65,-31,-67,-60, 27,-67,-43, 20,-45, 33, 18,-60,-53,-45,-45,-40,-31,  6,-27, -4,-55;
/M: SY='N'; M=-30, 50,-50, 20,-10,-60,-10, 10,-60,  0,-60,-40, 90,-40,  0,-10, 10,  0,-50,-70,-40,-10;
/M: SY='P'; M=-11,-39,-60,-30,-20,-60,-50,-38,-50,-18,-50,-40,-39,113,-28,-24,-20,-30,-40,-69,-59,-19;
/M: SY='E'; M=-19,  9,-70, 18, 74,-60,-34, -2,-60,  8,-60,-40,-10,-21, 27,-11,-10,-20,-41,-60,-50, 55;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='V'; M=-11,-48,-23,-50,-34,-24,-54,-43, 20,-31,  3,  6,-39,-34,-28,-34,-20, 11, 42,-49,-30,-32;
/M: SY='N'; M=-30, 46,-50, 18,-11,-56,-12, 10,-59, -2,-59,-40, 85,-41, -1,-11,  8, -1,-49,-66,-35,-11;
/M: SY='I'; M=-28,-60,-20,-69,-58,-11,-69,-59, 68,-49, 19, 19,-59,-49,-49,-49,-39,-18, 42,-50,-30,-58;
/M: SY='S'; M= 33, -8,-17,-15,-13,-40, -7,-23,-37,-10,-37,-27, -1,-17,-13,-23, 57, 15,-25,-57,-33,-13;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='T'; M=  6, -8,-20,-18,-18,-39,-25,-28,-24,-11,-32,-15,  2,-27,-11,-21, 34, 60, -8,-53,-30,-18;
/M: SY='K'; M=-11,-11,-60,-21,  9,-50,-31, -9,-50, 77,-40,-30, -1,-21, 19, 34,-11,-11,-40,-59,-40,  9;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='M'; M=-17,-53,-27,-60,-40, -6,-53,-43, 26,-33, 24, 66,-43,-40,-19,-33,-30, -7, 28,-36,-30,-33;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='Q'; M=-23,-13,-53,-15, 19,-50,-40,  7,-50, 23,-40,-15, -3,-30, 69, 31,-13,-13,-40,-43,-33, 37;
/M: SY='K'; M=-11, -8,-60,-19,  9,-50,-29, -9,-50, 78,-41,-30,  3,-21, 19, 29, -9,-10,-40,-60,-40,  9;
/M: SY='T'; M= 14,-14,-20,-22,-21,-41,-19,-30,-24,-11,-32,-14, -6,-27,-13,-23, 19, 59, -5,-50,-33,-21;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='G'; M=  0,-19,-58,-29,-38,-59, 81,-38,-68,-27,-68,-48, -9,-48,-37,-35, -6,-27,-58,-60,-58,-37;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 40,-60;
/M: SY='T'; M= -5,  2,-26,-12,-18,-44,-26,-22,-28, -8,-36,-16, 17,-32, -8,-18, 18, 64,-10,-54,-32,-18;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='V'; M=-10,-60,-20,-60,-40,-20,-60,-50, 40,-40, 10, 10,-50,-40,-40,-40,-30,  0, 70,-50,-30,-40;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='S'; M= 12, -2,-26,-10, -2,-42,-16,-14,-42, -4,-40,-26,  8,-22, 10,-14, 54, 14,-32,-56,-30,  2;
/M: SY='G'; M= -1,-20,-60,-30,-39,-60, 84,-38,-69,-27,-69,-49,-10,-49,-38,-34,-10,-30,-59,-60,-59,-38;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-20,-10,-30,-10,  0,-30,-10,-20, 20, 80,  0,-50,-30,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-40,-60,-30,-20,-60,-50,-40,-50,-20,-50,-40,-40,120,-30,-30,-20,-30,-40,-70,-60,-20;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 40,-60;
/M: SY='F'; M=-40,-58,-42,-60,-58, 88,-60,-10,-14,-48, -4, -6,-56,-60,-46,-48,-38,-38,-22,  6, 54,-56;
/M: SY='D'; M=-30, 58,-66, 84, 14,-60,-26,-14,-68,-16,-68,-56, 34,-32, -8,-26, -6,-16,-58,-78,-56,  6;
/M: SY='L'; M=-25,-63,-29,-64,-55, -4,-64,-47, 14,-37, 51, 24,-53,-47,-37,-38,-30,-25,  6,-42,-21,-46;
/M: SY='K'; M=-11,-10,-60,-20,  9,-50,-30,-10,-50, 79,-40,-30,  0,-20, 20, 32,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='N'; M=-30, 50,-50, 20,-10,-60,-10, 10,-60,  0,-60,-40, 90,-40,  0,-10, 10,  0,-50,-70,-40,-10;
/M: SY='L'; M=-30,-69,-31,-69,-59, -1,-69,-49, 19,-38, 58, 29,-59,-49,-39,-39,-39,-30,  9,-40,-20,-49;
/M: SY='K'; M=-11,-10,-60,-20,  9,-50,-30,-10,-50, 77,-40,-30,  0,-20, 19, 32,-10,-10,-40,-60,-40,  9;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='W'; M=-45,-74,-51,-75,-58, -6,-46,-40,-52,-57,-43,-32,-64,-68,-40,-49,-55,-48,-51,139, 22,-49;
/M: SY='S'; M= 20,  0,-20,-10,-10,-40,-10,-20,-40,-10,-40,-30, 10,-20,-10,-20, 70, 20,-30,-60,-30,-10;
/M: SY='G'; M= -3,-13,-59,-25,-37,-60, 81,-35,-69,-27,-69,-49, -1,-49,-36,-37, -8,-27,-59,-61,-58,-37;
/M: SY='L'; M=-28,-67,-33,-66,-56, -6,-68,-49, 13,-38, 50, 23,-58,-34,-39,-39,-38,-30,  5,-43,-24,-47;
/M: SY='P'; M=-10,-40,-60,-30,-20,-60,-50,-40,-50,-20,-50,-40,-40,120,-30,-30,-20,-30,-40,-70,-60,-20;
/M: SY='I'; M=-30,-59,-20,-69,-59,-10,-70,-59, 69,-48, 19, 19,-59,-50,-49,-49,-40,-20, 39,-50,-30,-59;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 41,-60;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='S'; M= 30, -6,-18,-14,-12,-40, -8,-22,-38,-10,-38,-28,  2,-18,-12,-22, 60, 16,-26,-58,-32,-12;
/M: SY='S'; M= 16, -2,-20,-12,-12,-40,-13,-22,-36,-10,-38,-26,  8,-22,-10,-20, 60, 31,-24,-58,-30,-12;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 5 in 5 different sequences
Number of true positive hits 5 in 5 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase S31
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
5 sequences

POLG_BVDVC  (Q96662), POLG_BVDVN  (P19711), POLG_BVDVS  (Q01499), 
POLG_CSFVA  (P19712), POLG_CSFVB  (P21530)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission