Entry: PS51545

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PIK_HELICAL
Accession [info] PS51545
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2011 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51545
Associated ProRule [info] PRU00878

Name and characterization of the entry

Description [info] PIK helical domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=177;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=172;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9079437; R2=0.0117903; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13030.35252; R2=34.76709; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=475; N_SCORE=8.5; H_SCORE=26555; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=305; N_SCORE=6.5; H_SCORE=23634; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M= -5,  6,-24,  7, -1,-22, -4, -1,-23,  0,-16,-12,  6,-16, -3,  0,  0, -6,-18,-29,-13, -3;
/M: SY='R'; M=-13,-17,-24,-19,-13, -6,-24,  4,  0, -4,  1,  8,-11,-22, -4, 10,-12, -8,  0,-19,  4,-11;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-25, 23, 25,-24,-17, -6,-21, -2,-12,-15,  1,-10,  3, -8, -1, -7,-17,-33,-17, 14;
/M:         M= -6,-11,-12,-17,-17, -6, -2,-17, -9,-16, -7, -7, -3,-21,-16,-11, -2, -2, -7,-24,-12,-17;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M= 10, -3,-10, -8, -9,-12,  1,-11, -5, -9,-10, -7,  1,-13, -9,-11,  7,  1,  1,-21,-14, -9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -3,  6,-26, 10, 18,-28, -4,  1,-29,  6,-23,-17,  3,-10,  5,  3,  2, -8,-23,-28,-16, 10;
/M: SY='G'; M= -5,-18,-24,-19,-17, -4,  8,-18,-11,-20, -5, -2,-12,-11,-18,-18, -6, -9, -8,-21,-13,-18;
/M: SY='N'; M=-11, -4,-27, -7, -8,-12,-10, -5,-15, -4,-12,-10,  3, -1, -7,  2, -6, -4,-18,-21, -6, -9;
/M: SY='E'; M=  3,  0,-23,  0, 18,-21,-15, -7,-19,  6,-12,-11, -1,-10,  5,  4, -2, -7,-16,-25,-16, 11;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-25, -1, 20,-11,-19, -6,-17,  1, -9, -9, -2,-12,  5, -4, -5, -8,-18,-22,-10, 13;
/M: SY='Q'; M=-12,  1,-23,  1,  3, -3,-21, -8,-15, -8, -8, -7, -3,-15,  4, -7, -2,  4,-14,-20, -3,  4;
/M: SY='Q'; M= -8, -8,-23, -9,  1,-12,-17, -5,-17,  4,-14, -6, -3,-16, 12, 11,  2, -2,-15,-21, -7,  6;
/M: SY='D'; M=-12,  4,-29, 11,  9,-26,-16, -8,-25,  5,-21,-16,  0,  7,  1,  8, -2, -6,-22,-30,-18,  3;
/M: SY='Q'; M=  6,-13,-21,-16, -5,-21,-20,-12,  1, -2, -7,  1,-11,-16, 10, -6, -3, -5,  3,-22,-11,  2;
/M: SY='L'; M= -2,-28,-19,-30,-21,  4,-28,-23, 22,-27, 35, 16,-27,-27,-20,-21,-22, -8, 16,-21, -3,-21;
/M: SY='E'; M=-12, 11,-29, 14, 15,-28, -7,  8,-31, 14,-26,-16, 10,-12,  6,  9, -3,-11,-27,-28,-13, 10;
/M: SY='A'; M= 14, -5,-21, -7,  3,-19,-14,-15, -8, -4, -5, -7, -8,-12, -4,-12, -3, -6, -5,-23,-14, -1;
/M: SY='I'; M=  1,-24,-20,-32,-25, -4,-30,-28, 31,-23, 10, 10,-19,-20,-20,-24, -9,  1, 28,-24, -6,-25;
/M: SY='V'; M= -6,-27,-16,-30,-24, 11,-27,-22, 20,-23, 19, 14,-24,-27,-23,-19,-14, -4, 23,-22, -2,-23;
/M: SY='A'; M= 15,  1,-17, -1,  2,-25,  2,-12,-21, -7,-20,-15,  1,-10,  1,-12, 14,  4,-13,-28,-19,  1;
/M: SY='R'; M=-15, -3,-26, -7, -4, -5,-20, 11,-21, 11,-17, -8,  4,-19,  0, 19, -7, -6,-18,-16,  7, -4;
/M: SY='D'; M=-14, 11,-28, 21, 10,-26,-15, -6,-25,  1,-17,-17,  3, -3,  0,  5, -2, -7,-21,-31,-17,  4;
/M: SY='P'; M=  1,-13,-31, -7,  4,-28, -9,-17,-21, -9,-26,-19,-12, 50, -7,-17, -1, -7,-24,-29,-27, -4;
/M: SY='C'; M= -7,-16, 18,-21,-17, -8,-24,-20, -8,-18,  5, -3,-14,-25,-16,-10, -6,  6, -2,-31,-12,-17;
/M: SY='N'; M= -5,  2,-21, -2, -2,-16, -6, -3,-16, -2,-16,-10,  9,-17,  4, -3,  7,  0,-17,-25, -7,  1;
/M: SY='E'; M= -4, -4,-29, -2, 22,-24,-18, -5,-19,  1,-15, -6, -8, -1, 16, -5, -5,-11,-22, -9,-12, 19;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-17,-25,-19,  2,-25,-20, 21,-23, 24, 12,-20,-22,-17,-19,-14, -4, 16,-21, -3,-19; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='T'; M= -5,  6,  0, -3, -8, -8,-12, -6,-11, -7,-12,-10, 10,-14, -7, -7,  7, 16, -8,-22, -5, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M=  0, -5,-20, -2,  7, -9,-17, -7, -8, -8,  3, -4,-10,-14, -3,-11, -8, -7, -9,-16, -2,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -4,  2,-23,  2, 19,-21,-15,  6,-16,  0, -9, -6,  2,-10, 16, -2, -2, -8,-19,-23,-10, 17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-26, 21, 35,-29,-16,  0,-27, 12,-21,-16,  3, -4, 18,  4, -1, -9,-25,-26,-15, 26; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K'; M= -9,-10,-23,-12, -4,-16,-21, -9, -4, 14, -9,  4, -8,-15,  5, 12,-10, -7, -1,-19, -7, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M=-11, 19,-27, 29, 10,-28, -4, -7,-28, -2,-19,-18,  7,-13, -3, -8, -1, -8,-22,-32,-18,  4;
/M: SY='L'; M=-12,-20,-23,-19, -5,  3,-27,-14,  2,-11, 22,  7,-19,-23,-10, -4,-21,-10, -2,-19, -2, -8;
/M: SY='V'; M=  2,-15,-16,-19,-18, -5,-20,-19, 12,-18,  8,  4,-10,-23,-17,-17, -5, -1, 15,-28,-10,-18;
/M: SY='W'; M= -7,-28,-37,-30,-25,  5,  3,-25,-21,-20,-18,-16,-24,-25,-21,-20,-22,-22,-23, 72, 10,-20;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-28, -3,  8,-24,-18,  0,-26, 19,-24,-12, -1,  0,  6, 22, -2, -3,-20,-25,-12,  5;
/M: SY='H'; M=-15,-14,-25,-14, -3,  5,-25, 10,-11, -6,  4,  1,-10,-21, -6,  3,-16,-12,-11,-18,  5, -5;
/M: SY='R'; M= -9,-12,-30,-11, -1,-22,-18, -7,-25, 16,-21,-12, -6,  8,  3, 38, -8, -9,-20,-22,-16, -4;
/M: SY='Y'; M=-13, -3,-26, -2, -7, -7,-13, 15,-15,-10, -7, -5, -5,-21, -2, -9, -8, -5,-16,-12, 17, -6;
/M: SY='Y'; M=-12, -9,-25, -7, -1, -3,-24,  1, -2, -7,  1,  5,-13,-20,  1, -9,-13, -9, -5,-11, 15, -1;
/M: SY='C'; M= -6,-15, 34,-18,-10,-13,-23,-20,-12,-20, -4, -9,-15,-26,-15,-19, -4, -4, -4,-37,-18,-13;
/M: SY='V'; M= -3,-13,-16,-14,-11,-12,-19, -6, -2,-10, -6, -2, -9,-20, -6, -5,  5,  6,  8,-30, -9, -9;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-24,  2, 10,-27, -3, -7,-24,  0,-25,-16,  6,  0,  8, -4,  9,  1,-23,-30,-19,  8;
/M: SY='H'; M= -8, -8,-27, -8,  2,-21,-19,  6,-12, -5,-17, -7, -2,  0,  6, -1,  2, -5,-14,-28,-10,  1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -7, -4,-28,  2,  5,-25,-18,-15,-18, -8,-23,-17, -8, 33, -6,-14,  2,  2,-17,-32,-22, -3;
/M: SY='S'; M= -1,  0,-21,  1,  9,-25, -2, -9,-25,  5,-25,-15,  3,-10,  6, -1, 13,  5,-18,-29,-17,  8;
/M: SY='A'; M= 38,-10,-12,-18,-10,-18, -3,-19, -7,-12,-11, -9, -7,-11, -9,-19, 13,  3,  1,-24,-18,-10;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-18,-27,-19, 20,-26,-15, 13,-25, 35, 13,-24,-26,-20,-17,-24, -9,  6,-10, 10,-19; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='P'; M= -1, -3,-23,  1, -2,-23, -3,-14,-20, -9,-23,-17, -4, 24, -7,-14,  5,  1,-18,-27,-21, -6; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='K'; M=  1, -8,-19,-10, -2,-15,-15,-11,-12, 11, -6, -4, -7,-14, -1,  8, -5, -4, -8,-20, -9, -2; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F'; M=-10,-22,-15,-27,-20, 29,-25,-18,  8,-23, 19,  6,-19,-24,-24,-16,-15,  0,  8,-10,  8,-20; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L'; M= -3,-24,-19,-29,-20,  8,-26,-20, 20,-24, 27, 13,-21,-22,-18,-20,-19, -8, 12,-15,  0,-20; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='K'; M= -2, -2,-22, -1,  0,-19,-16,-12,-15,  8, -9, -7, -4,-15, -2,  1, -3, -4,-10,-26,-12, -1;
/M: SY='S'; M=  0,-12, -1,-15,-14,-12, -7,-18, -9,-19, -5, -7, -8,-20,-14,-16,  8,  8, -2,-32,-16,-14;
/M: SY='V'; M=  3,-22,-14,-26,-23, -5,-25,-26, 22,-19,  4,  5,-19,-22,-21,-20, -2,  4, 30,-28,-10,-23;
/M: SY='K'; M=-13,  1,-30,  0,  5,-25,-18, 19,-28, 23,-27,-10,  7, -6,  7, 19, -8,-11,-24,-25, -6,  4;
/M: SY='W'; M=-11,-32,-33,-34,-26,  4,-26,-27,  8,-23,  1, -2,-28,-26,-19,-22,-23,-15,  0, 50, 10,-22;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-22,  8,  0,-23,  0, -4,-24, -6,-28,-19, 17,-15,  4, -7, 13,  1,-23,-19,-15,  3;
/M: SY='S'; M= -1,  2,-19,  1,  6,-21,-10, -6,-18,  2,-20,-13,  8,-12,  6, -1, 14,  4,-15,-32,-15,  6;
/M:         M= -8,-13,-25,-13, -7,-15,-20, -7,-11, -2,-12, -6,-11, -7, -3, -1, -5, -1, -8,-11, -7, -6;
/M: SY='E'; M= -4,  2,-25,  4, 16,-17,-16, -7,-23, 10,-20,-13, -1,-10,  8,  3,  0, -6,-19,-23,-10, 13;
/M: SY='D'; M= -8, 12,-12, 18, 13,-27,-15, -9,-24,  0,-23,-19,  5,-12,  1, -7,  6, -3,-18,-35,-18,  7;
/M: SY='V'; M= 10,-18,-15,-21,-14,-10,-18,-19,  7,-15,  6,  3,-17,-21, -9,-15, -3, -1, 13,-25,-11,-11;
/M: SY='A'; M=  9, -6,-22, -9, -1,-23,-11,  0,-22,  9,-21,-11, -3, -3,  1,  7,  2, -5,-15,-24,-13, -2;
/M: SY='Q'; M= -5, -4,-25, -4,  4,-24,-18, -2,-14,  6, -8,  3, -5,-15, 20,  9, -7, -9,-15,-22,-10, 11;
/M: SY='M'; M= -1,-16,-19,-21,-16, -9,-12,-16,  2,-11,  2,  8,-12,-19,-11, -5, -5,  3,  5,-23,-10,-15;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='Y'; M=-10,-10,-21,-10, -2, -4,-20,  5, -3, -4,  2,  4,-10,-16, 14, -3,-10, -8,-11, -3, 16,  5; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='R'; M= -4, -7, -7, -8,  2,-14,-16, -6,-13,  6,-12, -6, -7,-14,  3,  7, -5, -6, -8,-16, -5,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='L'; M= -8,-19,-17,-19,-10,  1,-22,-11, 10,-18, 29, 13,-19,-21, -5,-11,-19, -8,  2,-15, -1, -7; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-12,-19,-14,  6,-19,-14, 14,-18, 29, 12,-19,-19,-14,-13,-18, -6, 10,-14, -1,-14; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='K'; M= -5, -5, -7, -5,  1,-15, -5, -8,-13,  2, -7, -5, -5,-11,  2, -1, -6, -7,-11,-16,-10,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Y'; M= -6, -3,-16, -3, -3, -8,-14, -4, -3,  0, -7, -2, -4,-11,  1, -3, -3, -3, -3,-11,  4, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='W'; M=-13,-25,-32,-25,-19,  6,-13,-19,-13,-13,-13,-13,-25,-19,-13,-13,-25,-19,-19, 96, 19,-13; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -3, -3,-25, -5, -1,-23,-13,-10,-21,  7,-24,-15,  3, 11, -1, 10,  2,  0,-19,-28,-18, -3;
/M: SY='P'; M= -5,-10,-30, -6,  5,-26,-16, -3,-23,  1,-26,-15, -8, 33, -1, -1, -2, -7,-23,-28,-19, -1;
/M: SY='M'; M= -6,-19,-21,-22,-17, -6,-13,-14,  6,-14,  9, 13,-15,-22,-11, -7,-10, -6,  6,-24, -8,-15;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-26, 21,  8,-30,-10, -7,-28,  7,-30,-21, 10,  5,  1, -2,  7, -2,-23,-34,-19,  3;
/M: SY='P'; M= -8,-15,-29,-10,  1,-23,-23, -6, -9, -8,-16, -8,-15, 26, -1,-12, -8, -8, -9,-29,-17, -2;
/M: SY='E'; M= -4, -7,-23, -5,  6,-20,  0, -9,-19, -7,-11,-10, -3,-15,  3, -3,  4, -4,-16,-27,-16,  4;
/M: SY='D'; M=-11,  1,-28,  6,  4,-15,-16, -5,-21,  0,-17,-14, -4,-16,  2, -5, -4, -7,-20,  0,  2,  3;
/M: SY='A'; M= 14,-12,-15,-16, -9,-12,-11,-15, -7,-10, -1, -5, -8,-16, -8, -6,  5,  5, -2,-25,-13, -9;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-20,-29,-20,  5,-28,-18, 20,-24, 34, 23,-24,-25,-16,-18,-21, -3, 11,-21, -1,-18;
/M: SY='E'; M=-13,  3,-29,  4, 18,-20,-11,  3,-25,  9,-20,-14,  5,-13, 11, 15, -4,-10,-25,-20, -6, 13;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 18,-30,-20, 18,-30, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25, 44,-30,-20, 10,-30, 31, 10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,  5, -6, 14,-25;
/M: SY='D'; M=-12, 19,-25, 24, 14,-26,-13,  8,-24, -3,-17,-15, 12,-13,  8, -6,  1, -6,-23,-33,-13, 11;
/M: SY='S'; M=  2,-15,  5,-18,-14, -3,-16,-19,-11,-18,-15,-12,-10, -9,-17,-18,  8,  3, -3,-29,-13,-15;
/M: SY='N'; M=-10, 18,-24, 17, 16,-25,-12,  9,-26,  6,-25,-17, 19,-11,  6,  1,  5, -1,-24,-33,-13, 11;
/M: SY='Y'; M=-15,-22,-26,-26,-21, 30,-24, -2, -2,-16, -1,  3,-19,-26,-16,-14,-15, -9, -7, 24, 39,-19;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='P'; M= -7, -2,-30,  3,  2,-29, -7,-12,-25,  0,-27,-17, -3, 22,  1, -7,  1, -2,-24,-28,-21,  0;
/M: SY='D'; M=-15, 38,-28, 47, 25,-33,-10,  2,-33,  2,-28,-25, 24,-10,  5, -5,  2, -8,-30,-38,-20, 15;
/M: SY='P'; M= -1,-11,-19, -7,  5,-29,-16,-13,-20, -6,-25,-15,-10, 33,  5,-13,  1, -5,-23,-30,-23,  3;
/M: SY='G'; M= -7, -5,-23, -9, -7, -4,  4, -1,-18,-12,-15, -7,  1,-18, -9,-11,  1, -2,-16,-19, -2, -8;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-31,-29,  1,-31,-29, 31,-22, 16, 12,-29,-29,-28,-21,-14, -2, 43,-28, -8,-29;
/M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-12, -5,-17,-16,  5,-16,  6, -9, -2, -6,-21,  6, 26,-10,-11,-11,-22, -7, -2;
/M: SY='E'; M=  5, -3,-22, -3, 10,-25, -5, -7,-23,  3,-21,-14,  0,-11,  9,  7,  8, -3,-18,-26,-18,  9;
/M: SY='Y'; M=-18,-22,-26,-27,-21, 33,-29,  1,  2,-12,  4,  6,-18,-27,-16, -5,-19,-10, -4, 10, 42,-20;
/M: SY='A'; M= 31,-14,-14,-21,-13,-14, -9,-20,  0,-15, -2, -4,-11,-13,-11,-20,  5,  0,  4,-22,-15,-13;
/M: SY='V'; M= -4,-27,-18,-30,-29,  6,-19,-27, 21,-23,  7,  7,-23,-27,-28,-22,-12, -6, 29,-22, -6,-29;
/M: SY='N'; M= -5,  6,-25,  1,  6,-20, -6,  2,-21,  5,-21,-12, 11,-15, 10,  4,  0, -7,-23,-20, -6,  7;
/M: SY='R'; M=-11,-14, -1,-16, -9,-15,-19,-13,-22,  3,-15,-11, -8,-23, -5, 17, -5, -6,-14,-14,-11, -8;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='R'; M=-15, -8,-29, -7,  9, -5,-14, -2,-24,  8,-15,-11, -5,-17,  1, 22, -9,-11,-20,-13,  0,  3;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-19, -1,  9,-25,-13, -7,-17,  5,-23,-11,  1,-11, 13,  0, 14,  4,-11,-31,-15, 11;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-19,-21,-11,  5,-20,-10,  2,-11, 14, 10,-15,-20, -5, -3,-14, -8, -2,-14,  0, -8; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='S'; M= -4,  9,-20, 13,  7,-24,-12,-11,-23, -6,-24,-20,  5,  4, -2,-11, 16, 15,-16,-35,-19,  1;
/M: SY='D'; M=-16, 28,-28, 40, 10,-31,-15,  9,-29,  2,-24,-19, 10,-14, -1, -5, -4,-10,-19,-35,-12,  4;
/M: SY='E'; M= -7, 25,-26, 28, 30,-29,-11,  1,-28,  3,-24,-21, 18, -8,  8, -4,  3, -7,-27,-34,-20, 19;
/M: SY='D'; M=-14, 22,-29, 34, 29,-30,-17, -3,-28,  4,-17,-19,  5, -9,  6, -4, -4,-10,-24,-32,-17, 18;
/M: SY='L'; M= -1,-26,-18,-30,-22,  2,-26,-21, 22,-23, 28, 19,-25,-25,-19,-20,-19, -7, 19,-22, -4,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-14,-21,-14,-14, 11,-23,-17,  5,-23, 15,  3,-13,-23,-18,-18,-11, -5,  1,-20,  0,-16;
/M: SY='F'; M=-16,-12,-24,-16,-10, 24,-24,  1, -9,-14, -2,  4, -9,-21, -4, -9,-13,-11,-11, -8, 12, -5;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 40, 18,-30,-30,-22,-20,-25, -8, 20,-22, -2,-22;
/M: SY='P'; M=-10,-24,-32,-19, -9,-14,-25,-21,  0,-19,  2, -3,-23, 39,-14,-21,-18,-10,-11,-26,-17,-15;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29,  1,-30,-29, 29,-21, 15, 11,-30,-30,-29,-20,-13, -1, 45,-29, -9,-29;
/M: SY='Q'; M=-10,  5,-29,  3, 17,-37,-17, 10,-20,  9,-21, -3,  8,-11, 52,  9,  1, -9,-30,-23,-11, 35;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V'; M= 10,-18,  4,-24,-19, -8,-16,-16,  6,-14,  2, 13,-18,-20,-14,-16, -6, -4, 14,-24,-11,-16; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-21, 12,-30,-15, 18,-27, 40, 17,-29,-30,-19,-19,-27, -9, 10,-14, 10,-21;
/M: SY='K'; M=-10, -6,-28, -8,  1,-23,-21,-10,-18, 28,-21, -7, -2,-14,  5, 27, -6, -7,-12,-22,-10,  1;
/M: SY='Y'; M=-19,-19,-28,-20,-18, 25,-29, 23, -2,-14,  3,  2,-17,-29,-11,-11,-20,-11,-10, 15, 59,-18;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-27, 11, 29,-24,-20, -4,-18,  8,-14, -6, -4, -8,  8, -1, -5, -9,-15,-29,-15, 19;
/M: SY='K'; M=-11,  5,-16,  6,  4,-28,-16, -7,-27, 11,-27,-16,  5,  2,  4,  7, -2, -7,-23,-31,-18,  3;
/M: SY='Y'; M=-14,-18,-22,-21,-12, 29,-27, -6, -2,-15,  0, -3,-16,-24,-18,-13,-11, -2, -1,  2, 30,-15;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-16,-17,-12,  0,-21, -6,  7,-11, 19,  9,-17,-20,-11, -8,-16, -7,  7,-17, -1,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-21, 29, 11,-25,  1, -5,-26, -3,-20,-18,  8, -8, -2, -8,  2, -2,-20,-26,-15,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='S'; M= -3,  6,  4,  5, -2,-24,  0, -8,-24, -9,-24,-17,  7,-16, -1,-10, 10, -1,-18,-32,-19, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='A'; M=  9, -3,-18, -3,  0,-13,-10, -8,-12, -8,-10,-10, -6, -3, -5,-13,  2, -3,-10,-18, -5, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-18,-28,-20,  6,-28,-20, 23,-25, 35, 16,-25,-25,-19,-19,-23, -8, 16,-19, -1,-20; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='S'; M= -1, -7, -2, -8, -1,-16,-17, -3,-12, -2,-13, -7, -6,-15, -5, -6,  1,  0, -3,-27,-11, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8,  0,-19,-18, -6,-23, 18,-19,-10, -3, -1,  4, 38, -6, -2,-17,-20,-11, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-27, 65,-30,-15,  2,-27, 13,  2,-21,-30,-34,-19,-21,-10,  0,  9, 33,-27;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-21,-25,-13,  3,-30,-20, 19,-24, 33, 14,-25,-25,-17,-19,-23, -9, 13,-23, -4,-15;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22,  6,-30,-20, 25,-26, 38, 23,-28,-28,-19,-20,-25, -9, 18,-21, -1,-21;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-28, 23, 15,-31,-15,  9,-32, 17,-28,-17,  8,-10,  7,  7, -1, -8,-24,-30,-11, 10;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-28, -4,  8,-22,-20, -4,-28, 27,-21,-11,  0,-15,  9, 45, -5, -3,-19,-22,-11,  6;
/M: SY='A'; M= 31,-14,  5,-22,-15,-17, -2,-21,-11,-16, -6, -8,-13,-17,-15,-21,  2, -4, -2,-24,-20,-15;
/M: SY='L'; M= -1,-17, -4,-19,-12,-10,-21,-17, -5, -7,  4, -1,-15,-23,-11, -2, -9, -5,  1,-26,-11,-12;
/M: SY='K'; M= -3, -6,-25, -9, -1,-24,-11,-11,-16, 13,-19, -7, -2,-13,  6,  8, -1, -3,-12,-23,-12,  2;
/M: SY='N'; M= -5, 28,-19, 23,  4,-24, -2,  1,-24, -4,-30,-22, 34,-14,  0, -6, 19,  5,-23,-40,-20,  2;
/M: SY='M'; M= -8,-13,-23,-14, -2,-14,-23,-10,  0, -1, -2,  5,-10,-17,  2,  4, -7, -6,  0,-25, -9, -2;
/M: SY='R'; M= -7,-11,-24,-13, -6,-10,-20,  5,-16,  6, -8, -4, -6,-19, -1, 18, -8, -3,-11,-16,  4, -6;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-36,-28, 22,-33,-25, 27,-28, 22, 13,-24,-27,-27,-23,-20, -8, 22,-15,  5,-28;
/M: SY='G'; M= 19, -7,-16,-11,-11,-22, 21,-17,-22,-13,-21,-16, -1,-13,-11,-17, 15,  3,-12,-26,-22,-11;
/M: SY='H'; M=-16, -3,-26, -5, -3,-15,-20, 53,-16,-12, -4,  3,  5,-22,  6, -4,-12,-15,-20,-28,  8, -1;
/M: SY='Y'; M=-15,-16,-26,-20, -8, 17,-25,  1, -5, -9, -2,  6,-13,-21,  8, -6,-13,-10,-12,  0, 22,  0;
/M: SY='L'; M= -5,-27, -1,-32,-23, 14,-28,-23, 10,-28, 24,  8,-24,-28,-24,-23,-20, -9,  7,-19, -1,-23;
/M: SY='F'; M= -5,-23,-21,-31,-23, 31,-25,-17,  8,-23,  4,  1,-15,-23,-24,-20,-10, -5,  5, -4, 16,-23;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='H'; M=-14, -5,-24,-10,-11,  3,-20, 21, -5,-16,  5,  2,  3,-25, -8, -9,-14,-10,-12,-19, 11,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-21, 10,-29,-14, 19,-24, 37, 21,-28,-29,-18,-18,-26, -9, 12,-16,  8,-20;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-29,-12, -3,-21,-11,-10,-16, 13,-12, -3, -6,-17,  5, 18,-11,-11,-13,-20,-10, -1;
/M: SY='A'; M= 21, -2,-12, -4, -5,-20, -4,-15,-13,-10,-18,-14, -1,-12, -7,-15, 20,  8, -2,-31,-19, -6;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-27,  7, 19,-16, -8,  3,-19,  0,-16, -9, 10,-13,  5, -4, -2, -9,-23,-22, -5, 12;
/M: SY='C'; M= -5,-22, 14,-27,-22, -5,-25,-21,  8,-22,  9, 10,-20,-27,-18,-20,-10, -4, 12,-31,-11,-21;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='H'; M=-13,  5,-28, 10, 16,-26,-20, 19,-23,  9,-20, -9,  1,-13, 10,  3, -6,-11,-18,-28, -6, 12;
/M: SY='D'; M=-13, 23,-25, 30,  3,-25,-14, -5,-16, -6,-16, -9, 10,-15, -4,-12, -1, -6,-12,-35,-15, -1;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A'; M=  9, -7,-23, -8, -2,-26,  0,-12,-22, -1,-24,-14, -3,  4,  2, -4,  8, -2,-17,-26,-20, -1;
/M: SY='S'; M=  5, -1,-20, -5, -6,-21, -6, -6,-13,-11,-14, -9, -1,-13, -3,-13,  6,  5, -9,-27,-13, -5;
/M: SY='V'; M= -7,-18,-19,-20,-13, -1,-26,-13,  7,-13,  4,  5,-18,-23, -3,-11, -8,  0, 11,-18,  2, -8;
/M: SY='E'; M= -2,  5,-22,  4, 17,-26,-11, -1,-23,  5,-23,-14,  9,-10, 16,  7, 11,  0,-21,-30,-17, 16;
/M: SY='Q'; M=-12,  4,-26,  4,  7,-23,-20, 10,-11, -4,-11, -4,  4,-16, 14, -4, -5, -9,-15,-28, -8,  9;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-28, -5,  6,-18,-19,  0,-23, 11,-20,-12, -3, -5, 10, 26, -2, -6,-21,-19, -4,  5;
/M: SY='F'; M=-11,-12,-25,-15,-14, 17,-23,  2, -7,-12, -4, -3, -8,-22,-15, -5,-12,-10, -7, -9, 14,-15;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-30, -8, -6,-31, 26,-13,-30, -4,-26,-14, -3, -4,  1, -8, -1,-14,-27,-21,-23, -3;
/M: SY='T'; M= -7,-14,-21,-15,-10, -8,-24,-16, -3, -2, -3, -2,-14, -6,-11, -6, -6,  7,  1,-21, -3,-11;
/M: SY='I'; M= -9,-18,-21,-25,-17,  5,-28,-19, 11,-13, 10, 11,-15,-19,-14,-12,-11,  4,  7,-19,  0,-16;
/M: SY='L'; M= -9,-24,-19,-25,-18,  3,-28, -8, 13,-24, 31, 13,-22,-27,-17,-17,-20, -3,  9,-23,  0,-18;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-28, 13, 29,-29,-17, -1,-28, 12,-20,-16,  1, -8, 17, 16, -2, -9,-25,-27,-16, 22;
/M: SY='A'; M= 10, -8, -3,-12, -1,-20,-13,-12,-17,  3,-15, -6, -7,-15, -2,  0,  1, -4, -9,-26,-17, -2;
/M: SY='Y'; M=-13,-26,-26,-28,-23, 15,-32, -6, 20,-20, 17, 10,-23,-28,-17,-18,-21, -9, 11,  0, 33,-23;
/M: SY='C'; M=-11,-16,  9,-18, -3,-11,-28,-17, -5,-14,  5, -2,-16,-23,-10, -9,-15,-10, -5,-30,-13, -8;
/M: SY='R'; M=-13, -4,-13, -6,  7,-16,-20, -4,-17,  4, -7, -3, -1,-18,  3, 16, -9, -9,-15,-27,-13,  3;
/M: SY='A'; M=  6,-14, -8,-18,-16,-18,  4,-19,-11,-13,-14, -9, -8,-20,-14,-10,  2, -5, -3,-26,-19,-16;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 62 in 62 different sequences
Number of true positive hits 62 in 62 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PIK helical
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
62 sequences

AGE1_CAEBR  (P0C5E7), AGE1_CAEEL  (Q94125), P3C2A_HUMAN (O00443), 
P3C2A_MOUSE (Q61194), P3C2A_PONAB (Q5RAY1), P3C2B_HUMAN (O00750), 
P3C2G_HUMAN (O75747), P3C2G_MOUSE (O70167), P3C2G_RAT   (O70173), 
P4KA1_ARATH (Q9SXA1), P4KB1_ARATH (Q9FMJ0), P4KB2_ARATH (Q0WPX9), 
PI3K1_DICDI (P54673), PI3K1_SOYBN (P42347), PI3K2_DICDI (P54674), 
PI3K2_SOYBN (P42348), PI3K3_DICDI (P54675), PI3K4_DICDI (P54676), 
PI3K_ARATH  (P42339), PI4KA_BOVIN (O02811), PI4KA_HUMAN (P42356), 
PI4KA_RAT   (O08662), PI4KB_BOVIN (O02810), PI4KB_CALJA (B0KWC1), 
PI4KB_CALMO (B1MTG7), PI4KB_DANRE (Q49GP3), PI4KB_HUMAN (Q9UBF8), 
PI4KB_MOUSE (Q8BKC8), PI4KB_OTOGA (B4UT09), PI4KB_PAPAN (A9X1A0), 
PI4KB_RAT   (O08561), PI4KB_RHIFE (B2KI64), PI4KB_SORAR (B3EX61), 
PI4KB_XENLA (Q6GN16), PI4KB_XENTR (A4IID4), PI4K_DICDI  (P54677), 
PIK1A_CANAL (Q9UW24), PIK1_CANAL  (Q9UW20), PIK1_SCHPO  (Q10366), 
PIK1_YEAST  (P39104), PK3C3_HUMAN (Q8NEB9), PK3C3_MOUSE (Q6PF93), 
PK3C3_PIG   (Q5D891), PK3C3_RAT   (O88763), PK3C3_XENLA (Q6AZN6), 
PK3CA_BOVIN (P32871), PK3CA_HUMAN (P42336), PK3CA_MOUSE (P42337), 
PK3CB_HUMAN (P42338), PK3CB_MOUSE (Q8BTI9), PK3CB_RAT   (Q9Z1L0), 
PK3CD_HUMAN (O00329), PK3CD_MOUSE (O35904), PK3CG_HUMAN (P48736), 
PK3CG_MOUSE (Q9JHG7), PK3CG_PIG   (O02697), STT4_ENCCU  (Q8SQY7), 
STT4_SCHPO  (Q9USR3), STT4_YEAST  (P37297), VPS34_CANAX (Q92213), 
VPS34_SCHPO (P50520), VPS34_YEAST (P22543)
» More

PDB
[Detailed view]
110 PDB

1E7U; 1E7V; 1E8W; 1E8X; 1E8Y; 1E8Z; 1E90; 1HE8; 2A4Z; 2A5U; 2CHW; 2CHX; 2CHZ; 2RD0; 2V4L; 2WXF; 2WXG; 2WXH; 2WXI; 2WXJ; 2WXK; 2WXL; 2WXM; 2WXN; 2WXO; 2WXP; 2WXQ; 2WXR; 2X38; 2Y3A; 3APC; 3APD; 3APF; 3CSF; 3CST; 3DBS; 3DPD; 3ENE; 3HHM; 3HIZ; 3IBE; 3IHY; 3L08; 3L13; 3L16; 3L17; 3L54; 3LJ3; 3LS8; 3MJW; 3ML8; 3ML9; 3NZS; 3NZU; 3OAW; 3P2B; 3PRE; 3PRZ; 3PS6; 3QAQ; 3QAR; 3QJZ; 3QK0; 3R7Q; 3R7R; 3S2A; 3SD5; 3T8M; 3TJP; 3TL5; 3ZIM; 3ZVV; 3ZW3; 4A55; 4AJW; 4ANU; 4ANV; 4ANW; 4ANX; 4AOF; 4BFR; 4D0L; 4D0M; 4DK5; 4EZJ; 4EZK; 4EZL; 4F1S; 4FA6; 4FAD; 4FHJ; 4FHK; 4FJY; 4FJZ; 4FLH; 4FUL; 4G11; 4GB9; 4HLE; 4HVB; 4J6I; 4JPS; 4KZ0; 4KZC; 4L1B; 4L23; 4L2Y; 4PS3; 4PS7; 4PS8
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission