PROSITE entry PS51550
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | EPH_LBD |
| Accession [info] | PS51550 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2011 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51550 |
| Associated ProRule [info] | PRU00883 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Eph receptor ligand-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=182; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=177; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4008522; R2=0.0164643; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12645.8867188; R2=10.8473721; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=523; H_SCORE=18319; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=249; H_SCORE=15347; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -7, -7,-26, -6, 15,-17,-24,-11, -4, -3, -3, -2, -9, -9, 4, -8, -6, -3, -7,-25,-11, 8; /M: SY='V'; M= -5,-15,-22,-14, -2,-10,-22,-11, 2, -8, 3, 1,-16,-20, -5, -8,-10, -7, 6,-23, -6, -4; /M: SY='V'; M= -7,-15,-16,-17,-11, -3,-23,-18, 5,-17, 5, 1,-15,-16,-14,-16, -6, 3, 7,-24, -5,-13; /M: SY='L'; M=-10,-25,-20,-25,-16, 3,-21,-19, 9,-23, 28, 10,-23,-23,-17,-14,-22,-11, 3,-20, -5,-17; /M: SY='L'; M=-11,-16,-22,-17,-12, 6,-24, -9, 6,-15, 15, 10,-15,-23,-12,-12,-16, -7, 1,-16, 7,-13; /M: SY='D'; M=-12, 22,-24, 28, 11,-19,-14, -4,-25, -4,-19,-19, 10,-12, -1, -9, 2, 0,-20,-30,-11, 5; /M: SY='T'; M= -4, 1,-16, -4, -4,-11,-15,-10,-13, -6,-13, -8, 4,-14, -1, -3, 12, 19, -9,-28,-10, -3; /M: SY='S'; M= -4, 3,-22, 2, 0,-19, -7, 1,-23, 6,-23,-14, 6,-14, 0, 5, 7, 1,-17,-24, -6, -1; /M: SY='S'; M= 1, -3,-21, -6, -3,-17,-11, -9,-14, 1,-14, -7, -1,-12, -1, -1, 2, 2,-11,-23, -9, -2; /M: SY='E'; M= 4, -6,-22, -7, 6,-17,-17, -8,-11, 1,-12, -7, -6,-13, 4, -2, 0, -3, -8,-20, -6, 3; /M: SY='T'; M= -2, -7,-19,-11, -5,-16,-14,-14, -9, -5, -9, -6, -5,-10, -3, -5, 3, 10, -5,-27,-13, -5; /M: SY='S'; M= 6, -5,-17, -7, -7,-18, -1,-14,-16,-10,-19,-14, -2, -7, -7,-11, 15, 11, -8,-28,-15, -8; /M: SY='E'; M= -9, 10,-27, 15, 18,-24,-15, -2,-23, -1,-17,-16, 4, -8, 4, -4, -2, -8,-22,-23,-14, 11; /M: SY='L'; M= -5,-20,-21,-22,-15, 2,-22,-12, 10,-22, 25, 9,-17,-25,-14,-17,-18, -8, 3,-19, 1,-15; /M: SY='G'; M= -3, -1,-27, -2, -4,-28, 21,-10,-28, -1,-25,-14, 4,-16, 1, -3, 0,-11,-23,-24,-20, -2; /M: SY='W'; M=-17,-33,-44,-34,-27, 6,-16,-27,-18,-19,-16,-17,-32,-28,-19,-19,-33,-24,-26,116, 22,-19; /M: SY='T'; M= -5, -7,-20,-11, -9, -9,-16,-14, -6,-11, -3, -3, -5, -7, -8,-11, 0, 10, -7,-26,-10, -8; /M: SY='T'; M= -4, -8,-22,-12,-11,-14, -6,-14, -9,-11, -9, -2, -4,-13, -7, -8, 0, 4, -7,-20,-12,-10; /M: SY='Y'; M=-10,-10,-13,-14,-14, 1,-16, -9,-13,-14,-14,-11, -6,-22,-13,-14, -4, -1,-12, 5, 8,-13; /M: SY='P'; M= -8,-12,-31,-10, -4,-22,-10,-11,-18, -5,-20,-11, -8, 21, -3, -8, -5, -7,-21,-19,-17, -5; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='T'; M= -2, -3,-15, -4, -2,-10,-13, -8, -5, -1, -6, -4, -1,-12, -4, -4, 0, 1, -4,-19, -6, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='C'; M= -5, -4, 2, -7, -8, -9,-11, -9, -9, -6, -9, -7, -3,-15, -6, -5, -4, -2, -6,-11, -5, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='H'; M= -3, -2,-12, -3, -1,-11, -3, 5,-11, -5,-12, -6, 2, -5, 0, -5, 4, 0, -9,-14, -5, -1; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='P'; M= -5, 1,-16, 4, 3,-13, -8, -2,-12, -4,-12, -8, 0, 5, -1, -7, 1, -3,-13,-13, -9, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='P'; M= -3, -7,-23, -3, 10,-18,-12, -7,-16, 1,-16,-12, -7, 12, 1, 1, -2, -6,-15,-20,-13, 3; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='E'; M= -7, 4,-25, 5, 6,-21,-16,-10,-12, -2,-15,-11, 3, -8, -2, -3, 0, -2,-10,-30,-15, 1; /M: SY='G'; M= -4, -6,-26, -5,-11,-22, 26,-13,-26,-13,-19,-13, -2,-18, -9,-11, 1, -8,-19,-22,-17,-10; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='W'; M=-16,-29,-42,-29,-24, 5,-16,-24,-18,-18,-16,-17,-30,-27,-17,-18,-29,-20,-24,102, 22,-17; /M: SY='D'; M= -8, 15,-24, 21, 17,-26, -9, -6,-24, -2,-21,-18, 8,-11, 2, -6, 6, -2,-18,-34,-18, 9; /M: SY='E'; M= -9, 9,-27, 13, 30,-24,-18, 0,-21, 4,-17,-14, 4, -9, 13, 0, 0, -7,-22,-27,-13, 21; /M: SY='V'; M= -1,-18,-19,-21,-15, -4,-21,-22, 6,-16, 0, 1,-17,-13,-16,-17, -4, 5, 11,-16, -8,-16; /M: SY='S'; M= 3, 0,-19, -4, 0,-17, -3,-10,-20, -5,-23,-15, 5,-13, 0, -8, 15, 7,-15,-22,-14, 1; /M: SY='G'; M= -4, -6,-22,-11,-11, -5, 1,-10,-16, -8,-16, -8, 1,-19,-10, -9, 1, -3,-13,-15, -4,-10; /M: SY='T'; M= -8, -5,-22, -8, -2,-10,-19, 1, -7, -8, -4, -1, -1,-15, 1, -6, -2, 3, -9,-23, -1, -2; /M: SY='D'; M=-13, 19,-26, 29, 7,-27,-13, -4,-22, -4,-16,-15, 6,-10, -2, -9, -3, -8,-17,-33,-15, 2; /M: SY='E'; M=-11, 0,-30, 2, 9,-16, -6, -9,-24, -4,-19,-16, -1, -4, -1, -8, -6,-10,-25,-10,-12, 4; /M: SY='D'; M= -6, 7,-25, 9, 2,-24, -2, -8,-21, -2,-15,-11, 5,-15, 1, -6, -2, -7,-18,-28,-16, 2; /I: I=-9; MD=-19; /M: M= -7, -2,-21, -3, -5,-15, -1, -1,-14, -8, -8, -5, -1, -8, -3, -8, -5, -6,-15,-20, -8, -5; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='N'; M= -3, -1,-23, -6, -1,-19, -9, 2,-15, -5,-14, -7, 4,-12, 1, -2, 1, -1,-14,-27,-12, -2; /M: SY='T'; M= -3, -5,-15, -6, -6,-17,-10,-10,-14,-13,-12,-11, -2, -1, -9,-14, 2, 3,-11,-31,-16, -9; /M: SY='V'; M=-11,-15,-24,-16,-14, -7,-23, -4, 4,-11, 0, 3,-13,-22, -9, -4,-11, -7, 5,-16, 2,-14; /M: SY='R'; M=-16, -6,-29, -7, -2,-18,-14, 2,-24, 14,-18, -9, 3,-15, 8, 37, -8,-10,-21,-19, -5, 0; /M: SY='T'; M= 1, -8,-18,-13, -7,-13,-15,-13, -8, -5,-10, -2, -7, -7, -5, -8, 5, 13, -2,-24, -9, -7; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-28,-25,-21, 31,-30, 4, 5,-17, 7, 3,-21,-24,-16,-14,-21,-10, -5, 15, 53,-22; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-24, -5, 6,-20,-12, 3,-15, -3,-16, -6, -4,-15, 16, -4, 2, -3,-14,-20, -2, 10; /M: SY='V'; M= 2,-22,-17,-27,-24, -5,-27,-25, 25,-20, 8, 11,-20,-22,-20,-21, -8, -1, 29,-26, -8,-23; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='D'; M=-13, 22,-27, 23, 8,-26,-11, 9,-26, 1,-26,-18, 22, -5, 5, -2, 2, -6,-27,-31,-12, 5; /M: SY='V'; M= -5,-17,-21,-17,-15, -5,-26,-14, 10,-13, -1, 2,-17,-17, -9,-15, -9, -6, 13,-18, 3,-14; /M: SY='S'; M= 0, -1,-20, -3, 2,-17, -9, -4,-16, -3,-16, -8, 2,-14, 2, -3, 6, 3,-11,-27,-12, 1; /M: SY='R'; M= -9, -1,-23, -1, 5,-12,-13, 4,-20, 2,-18, -9, 4,-15, 4, 6, 3, -4,-18,-24, -5, 4; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='P'; M= -4, -1,-22, 1, 1,-21, -2,-10,-18, -4,-21,-14, 1, 11, -4, -7, 3, -1,-17,-25,-18, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='N'; M=-12, 16,-27, 15, 7,-24, -6, 9,-25, 0,-23,-16, 18,-10, 3, -2, -1, -9,-26,-23,-12, 5; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='Q'; M= -7, -6,-27, -5, 9,-31,-20, -2,-14, 3,-18, -3, -5, -1, 32, 1, 1, -4,-18,-24,-13, 19; /M: SY='N'; M=-12, 24,-25, 22, 4,-25,-10, 0,-21, 0,-24,-17, 25,-12, 3, 1, 5, -2,-22,-35,-17, 3; /M: SY='N'; M= -4, 23,-19, 10, -1,-21, -1, 4,-20, -1,-27,-17, 37,-17, 1, -2, 12, 4,-23,-35,-18, 0; /M: SY='W'; M=-19,-37,-47,-37,-28, 10,-17,-28,-20,-17,-20,-19,-36,-29,-19,-18,-36,-28,-28,130, 26,-19; /M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-30,-21, 11,-30,-21, 20,-29, 43, 18,-29,-29,-21,-20,-27, -9, 13,-20, 0,-21; /M: SY='R'; M=-14,-17,-29,-19, -9, -7,-25, -9, -5, 4, -3, -1,-10,-21, -1, 25,-14,-10, -6,-12, -1, -8; /M: SY='T'; M= 4, 0,-11, -5, -5,-15,-10,-14,-16, -9,-20,-15, 5,-10, -4, -7, 29, 33, -6,-34,-15, -5; /M: SY='P'; M=-11, 3,-31, 7, 4,-27,-15, -4,-22, -1,-26,-16, 3, 27, -1, -8, -3, -4,-25,-31,-19, -1; /M: SY='W'; M=-17,-26,-29,-29,-23, 31,-26, -6, -5,-18, -1, -4,-22,-28,-20,-13,-21,-11, -9, 39, 37,-21; /M: SY='I'; M=-11,-29,-22,-39,-29, 9,-37,-28, 39,-29, 18, 17,-21,-23,-22,-27,-19,-10, 25,-18, 2,-29; /M: SY='N'; M= -8, 7,-28, 7, 4,-22, -9, -4,-23, 2,-25,-17, 8, 5, 0, -2, -2, -7,-24,-23,-12, 0; /M: SY='R'; M= -4,-14,-21,-18,-11, -8,-19,-15, -7, 2, -5, -3,-10,-19, -9, 11, -6, 2, 1,-21, -8,-11; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='R'; M=-10, -5,-27, -5, 1,-20, -5, -9,-18, 2,-13, -8, -3,-14, 2, 4, -7,-10,-16,-23,-13, 0; /M: SY='D'; M= -3, 2,-25, 5, 0,-26, 5,-12,-24, -8,-22,-17, 0, 0, -6,-10, 3, -4,-19,-29,-21, -4; /M: SY='A'; M= 32, -8,-14,-16,-10,-18, -1,-12,-11,-10,-10, -8, -5,-14,-10,-15, 5, -2, -3,-22,-17,-10; /M: SY='K'; M= -5, 3,-24, 1, 8,-26,-14, 2,-24, 15,-25,-11, 8, -9, 13, 12, 4, -2,-21,-27,-12, 10; /M: SY='R'; M=-15, -4,-29, -4, 10,-23,-20, -3,-27, 26,-19,-10, 0,-15, 12, 43, -7, -8,-20,-22,-11, 8; /M: SY='I'; M= -4,-29,-21,-34,-27, 0,-33,-27, 35,-25, 19, 16,-24,-24,-22,-24,-17, -6, 32,-23, -4,-27; /M: SY='Y'; M=-13,-13,-24,-15,-13, 17,-24, 11, -6,-13, -3, -3,-12,-24,-11,-11,-10, -4, -8, 0, 34,-14; /M: SY='V'; M= -1,-28,-15,-31,-27, 0,-31,-28, 30,-23, 16, 12,-26,-27,-25,-22,-13, -1, 38,-26, -7,-27; /M: SY='E'; M=-11, 11,-27, 15, 32,-27,-18, 5,-28, 10,-21,-16, 6, -7, 14, 6, 0, -4,-25,-29,-14, 22; /M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-33,-25, 5,-32,-25, 31,-27, 27, 18,-25,-25,-21,-23,-20, -8, 24,-21, -2,-25; /M: SY='R'; M=-11, 4,-26, 4, 10,-23,-17, 2,-22, 10,-19,-11, 6,-13, 10, 14, 0, -2,-19,-27,-11, 9; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27, 65,-30, -8, 0,-24, 7, 0,-20,-30,-31,-17,-20,-10, -3, 16, 45,-27; /M: SY='T'; M= 5, -4,-14,-11, -9,-12,-14,-17, -8,-12,-14,-11, 1,-12, -8,-13, 18, 27, -2,-25,-12, -9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='I'; M= -5,-17,-19,-24,-17, -2,-25,-17, 15,-13, 9, 14,-14,-20,-11,-13,-11, -2, 13,-22, -4,-15; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M=-14, -9,-26,-11, -5,-17,-19, -5,-18, 15,-15, -6, 0,-16, 2, 41, -7, -6,-11,-24,-12, -5; /M: SY='D'; M=-11, 25,-27, 34, 14,-28, -3, -1,-33, -2,-26,-23, 13,-12, -1, -8, 2, -8,-26,-32,-17, 7; /M: SY='C'; M=-11,-14,103,-22,-24,-22,-28,-26,-30,-26,-21,-20,-16,-37,-24,-27, -9,-10,-12,-48,-28,-24; /M: SY='S'; M= -1, 7,-21, 7, 6,-23,-11, -8,-19, 1,-20,-14, 7, -8, 2, -3, 9, 1,-14,-32,-17, 4; /M: SY='S'; M= -2, 3,-20, 3, -1,-15,-13, -8,-14, -9,-18,-13, 4, -8, -5,-11, 11, 5,-10,-31,-12, -4; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='L'; M=-11,-19,-23,-22,-19, 11,-18,-16, 7,-19, 13, 5,-14,-24,-18,-13,-17,-10, 2,-14, 3,-19; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='P'; M= -4,-10,-26, -6, -4,-21, -2,-11,-19,-10,-18,-13, -7, 22, -8,-11, 0, -4,-18,-26,-19, -8; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= -6, 3,-23, 1, -2,-21, 11, -8,-24, -1,-21,-14, 9,-15, -5, 0, 2, -6,-20,-22,-17, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: M= -1, -9,-18,-12,-12, -8, -6,-15, 0,-14, -5, -4, -5, -7,-13,-15, -4, -5, 0,-21,-12,-14; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='A'; M= 4, -5,-15, -5, -4,-14, -3, -9,-10, -3,-12, -7, -4, -5, -2, -7, 3, -2, -5,-16, -8, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= 3, -6,-15, -7, -7,-12, 5, -9,-13, -6,-12, -9, -2, -6, -6, -4, 4, -2, -9,-16,-10, -7; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='C'; M=-10,-19,114,-29,-29,-19,-29,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29,-10,-10,-10,-48,-29,-29; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='K'; M=-10, -3,-27, -4, 7,-26,-19, -6,-23, 28,-23, -8, -1, -8, 14, 24, -5, -5,-18,-21,-10, 9; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='E'; M= -8, 4,-27, 10, 37,-23,-19, 5,-24, 5,-18,-14, -1, -6, 18, -1, 1, -6,-25,-24, -8, 27; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='T'; M= 1, -2,-12,-10,-10, -6,-18,-18, -7,-12, -8, -8, -2,-12,-11,-12, 14, 33, 0,-27, -8,-10; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-16,-30,-19,-38,-29, 60,-30,-21, 8,-29, 16, 4,-22,-30,-36,-20,-20, -9, 7, 1, 21,-29; /M: SY='N'; M= -8, 14,-21, 11, 2,-19, -9, -3,-19, 1,-20,-15, 18,-16, -2, -1, 6, 2,-17,-30,-11, -1; /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-26,-22, 8,-30,-22, 22,-25, 28, 15,-24,-27,-21,-21,-21, -8, 18,-21, -1,-22; /M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-24,-17, 26,-29, -1, 1,-10, 6, 3,-18,-26,-13, -9,-19,-10, -5, 8, 39,-16; /M: SY='Y'; M= -9,-17,-24,-18,-16, 12,-20, 1, -3, -8, -3, -2,-16,-24,-11, -9,-11, -5, -5, 5, 37,-16; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-26,-17,-14, 3,-18, 3, -3, -7, 0, 3,-11,-23, -6, -7,-14,-10, -8, -4, 23,-12; /M: SY='E'; M=-10, 3,-29, 6, 31,-30,-20, 6,-21, 7,-16, -8, 1, -8, 31, 3, -2,-10,-26,-25,-13, 31; /M: SY='T'; M= 10,-11, -9,-17,-13, -2,-14,-18, -8,-13, -7, -8, -7,-17,-13,-12, 9, 12, 1,-24,-10,-13; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M=-12, 24,-25, 33, 19,-31,-11, 1,-28, 7,-24,-18, 12, -8, 12, 0, 1, -7,-24,-29,-15, 16; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='S'; M= 0, -1,-14, -1, 1,-13, -5, -8, -9, -6,-12, -9, 1, -5, -3, -8, 5, -1, -7,-16,-11, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='A'; M= 10, -1,-13, -4, -1,-14, -3, -4,-12, -4,-10, -8, 1, -4, -3, -5, 3, -2, -9,-18,-12, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='T'; M= 2, -3,-17, -4, -3,-15, -9, -6,-10, -8,-13, -9, -2, -1, -4,-10, 5, 6, -8,-21, -9, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='D'; M= -4, 5,-21, 10, 7,-23, -1, -7,-21, -2,-20,-14, 3, -3, 2, -5, 6, -3,-17,-25,-16, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='N'; M= -4, 4,-17, 3, 2,-15,-12, -2,-12, -1,-12, -9, 5, -8, -2, -3, 2, 2, -9,-24, -9, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='S'; M= -3, -5,-18, -6, -7, -8, -2,-10,-12,-10,-15,-10, 0, -6, -7,-11, 4, 1,-10,-15, -8, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='P'; M= -2,-12,-23,-12, -7, -8,-15,-14, -9, -9,-12,-10, -9, 20,-10,-13, -4, -3,-12,-15,-11,-10; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: M= 0, -6,-12,-10, -7,-12, -8, -7,-12,-10,-12, -8, -2, 0, -4,-11, -1, -2,-12,-22,-12, -6; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='W'; M= -9,-16,-28,-18, -8, 1,-17,-17,-11,-10, -9,-10,-15,-18,-10,-11,-15, -9,-15, 38, 6, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='R'; M=-11, -2,-25, -5, -2,-17,-16, 1,-16, 5,-16, -5, 5, -8, 4, 12, -2, -4,-16,-25, -8, -1; /M: SY='E'; M= -6, 1,-26, 5, 22,-23,-17, -6,-23, 3,-20,-15, -3, 5, 8, -1, 2, -2,-21,-27,-14, 14; /M: SY='S'; M= -3, -2,-23, -3, 1,-18, -1, -5,-21, -4,-21,-14, 5, -9, -3, -2, 7, -1,-17,-28,-15, -2; /M: SY='P'; M= -5, -7,-24, -9, -6,-12,-12, -7,-13,-12,-12, -9, -2, 5, -5,-12, -1, -1,-15,-26,-12, -7; /M: SY='Y'; M=-15,-20,-32,-21,-18, 17,-25, -2, -5,-14, -6, -6,-19,-21,-12,-14,-18,-12,-12, 34, 40,-16; /M: M= -3, -6,-21, -8, -6,-16,-15,-12, -7, -2, -9, -5, -4,-17, -6, -1, -1, 0, -2,-26,-11, -8; /M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2, 4,-22,-20, -9,-23, 25,-21,-10, -1, -4, 5, 19, -8, -6,-19,-22,-11, 4; /M: SY='I'; M= -6,-25,-22,-28,-20, -4,-32,-25, 27,-17, 9, 10,-22,-19,-19,-16,-14, -6, 27,-25, -7,-21; /M: SY='D'; M= -8, 15,-25, 23, 3,-26, -6, -9,-25, -2,-15,-16, 3,-15, -5, -4, -4, -8,-16,-30,-17, -2; /M: SY='T'; M= 2, 3,-14, -4, -6,-15,-15,-14,-15, -5,-14,-12, 5,-12, -6, -2, 15, 30, -6,-30,-13, -7; /M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-34,-27, 1,-34,-28, 34,-26, 19, 14,-24,-24,-22,-24,-17, -5, 29,-17, -2,-27; /M: SY='A'; M= 25, -6,-16,-12, -2,-20, -5,-16,-14, -7,-11,-11, -6, -6, -7,-14, 6, 2, -7,-24,-18, -4; /M: SY='A'; M= 22, -2,-18, -6, -4,-24, -5,-10,-16, -5,-17,-12, -3, -5, -4,-12, 5, -3, -9,-25,-18, -4; /M: SY='D'; M=-12, 18,-27, 25, 13,-28, -9, -5,-24, -4,-18,-16, 8, -8, 3, -9, -1, -7,-22,-32,-17, 8; /M: SY='E'; M=-11, 0,-29, 4, 18,-21,-13, 4,-26, 7,-21,-14, -2, -3, 6, 2, -4, -9,-24,-21, -6, 11; /M: SY='R'; M= -7, -6,-23, -8, -2,-15,-12, -5,-15, -2,-13, -8, -1,-12, 1, 4, 2, -1,-12,-27,-11, -2; /M: SY='F'; M=-12,-20,-22,-26,-21, 28,-15,-16, -5,-20, 1, -3,-12,-24,-23,-13,-11, -4, -5, -1, 10,-21; /M: SY='R'; M= -1, -8,-21,-11, -4,-15,-17,-11,-13, 3,-14, -8, -4, -8, -1, 5, 4, 5, -8,-25,-11, -4; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='N'; M= -5, 5,-21, 5, 2,-20,-11, 5,-17, 0,-17,-10, 7, -4, 5, 2, 1, -4,-17,-24,-11, 2; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='N'; M= -2, -2,-12, -5, -3, -6, -9, 1, -8, -2, -9, -5, 2,-11, -3, 2, 2, 0, -4,-17, -5, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='A'; M= 1, -5,-14, -5, -1,-13, 1, -8,-12, -2,-10, -7, -3, -1, -1, -3, 1, -2,-10,-15,-11, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='D'; M= -2, 7,-16, 9, 5,-19, 2, -3,-19, 0,-16,-11, 5, -8, 3, 0, 3, -4,-15,-18,-12, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='N'; M= -3, 6,-16, 3, -4,-15, -2, -7,-16, -3,-16,-12, 9,-12, -4, -1, 5, 4,-12,-18,-12, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='S'; M= 0, 1,-11, 0, -3,-16,-11,-11,-12, -3,-14,-10, 1,-13, -6, -4, 6, 6, -3,-27,-14, -5; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='V'; M= 0, -9,-17, -8, -3,-13,-13,-11, -3, -7, -4, -2,-10,-16, -7, -8, -3, -3, 5,-24,-11, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -8, 5,-22, 6, 10,-21,-15, -5,-19, 9,-17,-11, 4,-12, 5, 10, 0, -3,-15,-26,-13, 7; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='V'; M= -3,-18,-17,-21,-15, -3,-22,-17, 10,-14, 8, 7,-15,-20,-11,-12, -5, 2, 11,-24, -6,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='N'; M= -7, 25,-20, 13, -1,-20, -3, 7,-19, -4,-22,-16, 36,-18, 0, -4, 8, 2,-23,-35,-16, 0; /M: SY='V'; M= -3,-12,-19,-15,-13, -8,-14,-17, 0,-10, -5, 3,-12,-13,-12,-12, -4, 4, 6,-24,-10,-13; /M: SY='E'; M=-10, 5,-28, 9, 28,-29,-20, -3,-24, 17,-20,-10, -1, -8, 18, 9, -3, -7,-21,-26,-14, 23; /M: SY='T'; M= -4,-11,-20,-16, -8,-10,-24,-12, 3,-11, 0, 3, -9,-15, -6,-10, -1, 11, 4,-25, -7, -8; /M: SY='R'; M=-10,-15,-19,-17, -8, -6,-22,-12, -9, 4, -3, -1,-11,-21, -6, 17,-10, -4, -3,-21, -7, -8; /M: SY='S'; M= -3, 3,-20, 1, 4,-21,-11, -6,-19, 0,-24,-14, 8, -2, 1, -1, 14, 9,-15,-33,-16, 1; /M: SY='L'; M=-12,-22,-22,-28,-22, 19,-30,-20, 17,-26, 20, 9,-18,-25,-23,-21,-18, -5, 10,-14, 6,-23; /M: SY='G'; M= 6,-11,-25,-11,-11,-25, 26,-19,-24,-13,-22,-15, -5, -4,-14,-17, 2, -9,-17,-23,-24,-13; /M: SY='P'; M= -4,-10,-27,-10, -7,-15,-18,-13, -9, -9,-13, -7, -8, 19,-10,-14, -6, -5,-11,-26,-15,-10; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='L'; M= -9,-19,-19,-20,-10, 4,-24,-15, 13,-17, 20, 9,-17,-14,-12,-13,-17, -8, 6,-15, -1,-12; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='T'; M= -1, 3,-12, -1, -3,-14,-10, -6,-14, -3,-16,-11, 6,-10, -1, 0, 15, 20, -8,-26,-10, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M=-10, -5,-19, -5, 3,-19,-15, -2,-19, 18,-15, -4, -3,-13, 7, 19, -6, -6,-14,-19, -8, 4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='N'; M= -1, 4,-22, 2, -1,-22, -6, -9,-19, 5,-20,-13, 6,-11, -3, 5, 0, -5,-12,-27,-17, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= 0, -7,-26, -9,-16,-20, 39, -9,-29,-15,-23,-15, 1,-19,-14,-16, 1,-12,-23,-16,-13,-16; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M= -7,-24,-18,-31,-22, 31,-25,-18, 10,-22, 11, 11,-20,-24,-24,-18,-14, -7, 10,-10, 8,-21; /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-17, 21,-25, 16, -6, -6, -4, -2,-16,-28, -9, 0,-17,-10,-11, 16, 56,-17; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-30,-20, 9,-31,-22, 22,-27, 34, 15,-27,-23,-20,-21,-24, -9, 14,-20, -1,-21; /M: SY='A'; M= 34,-12,-14,-20, -9,-12, -7,-20, -7,-12, -8, -9,-10,-12,-11,-19, 6, 0, -1,-15,-14,-10; /M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-36,-26, 40,-31,-20, 14,-26, 15, 7,-20,-26,-28,-19,-19, -9, 9, -4, 16,-26; /M: SY='Q'; M=-10, -1,-27, 1, 13,-28,-20, 7,-19, 10,-19, -5, -1,-13, 27, 9, -2, -8,-19,-23, -6, 19; /M: SY='D'; M=-16, 29,-28, 39, 12,-27, -9, -1,-30, -3,-23,-22, 14,-10, -2, -9, -1, -7,-25,-30,-11, 5; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-23, -4, 2,-23,-17, -1,-16, 5,-18, -7, 5,-11, 13, 7, 4, 3,-15,-27,-11, 7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-17,-29, 58,-18,-38,-13,-29,-19, 0,-19,-16,-12, -1,-18,-28,-20,-27,-17; /M: SY='A'; M= 27, -5,-13,-13, -8,-19, 1,-17,-13, -9,-16,-12, -1,-12, -8,-15, 14, 6, -5,-26,-19, -8; /M: SY='C'; M=-10,-20,114,-29,-29,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-35,-29,-30,-10,-10,-11,-49,-30,-29; /M: SY='M'; M= -4,-20,-18,-25,-20, -4,-19,-16, 16,-18, 10, 20,-17,-21,-12,-16, -7, -1, 15,-26, -7,-17; /M: SY='A'; M= 19, -8,-10,-13, -5,-15, -8,-15,-10,-11,-15,-11, -4,-13, -4,-14, 15, 4, -3,-27,-16, -4; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-32,-24, 2,-33,-25, 30,-25, 27, 16,-25,-21,-20,-22,-22, -9, 21,-22, -3,-24; /M: SY='L'; M= -3,-14,-20,-18, -9, -5,-20,-13, 5,-14, 7, 7,-11,-16, -6,-13, -7, -3, 2,-24, -8, -8; /M: SY='S'; M= 3, 0,-18, -3, -4,-19, -1, 0,-21, -3,-23,-14, 9,-15, -2, -1, 14, 4,-14,-29,-12, -4; /M: SY='V'; M= -2,-27,-14,-29,-26, 2,-28,-24, 24,-21, 17, 13,-27,-28,-24,-19,-13, -1, 34,-25, -5,-25; /M: SY='R'; M=-10, -8,-27, -8, 2,-23,-19, -2,-19, 18,-17, -5, -2,-16, 13, 28, -5, -7,-14,-22, -9, 5; /M: SY='V'; M= 0,-27,-16,-30,-26, -3,-30,-27, 28,-21, 10, 10,-25,-22,-23,-21,-11, -3, 36,-27, -9,-26; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-27,-28,-20, 37,-28, -7, -1,-17, 2, -2,-20,-27,-20,-15,-19,-11, -6, 23, 39,-20; /M: SY='Y'; M=-15,-14,-26,-17,-17, 20,-22, 14, -4,-11, -4, -2,-11,-27, -9,-10,-13, -8,-10, 11, 50,-16; /M: SY='K'; M=-13, -5,-26, -8, -4, -6,-22, -6,-13, 10,-11, -5, -2,-18, -2, 10, -9, -4,-11,-15, 4, -4; /M: SY='V'; M= -4,-16,-19,-20,-15, 0,-23,-15, 0, -2, -5, 1,-13,-21,-13, 1, -6, 0, 8,-18, -1,-14; /M: SY='C'; M=-10,-20,115,-30,-30,-19,-30,-30,-28,-30,-18,-19,-20,-40,-30,-30,-11,-10, -9,-49,-29,-30; /M: SY='P'; M= -4,-10,-33, -3, 6,-29,-14, -9,-22, -5,-27,-17,-10, 47, -3,-13, -3, -8,-26,-29,-23, -1; /M: SY='E'; M= 2, -3,-25, -1, 13,-25,-15, -9,-19, 5,-17,-11, -5, 5, 6, -2, 0, -5,-17,-26,-17, 8; /M: SY='T'; M= -4,-15,-14,-20,-13, -3,-24,-16, 2, -8, 0, 5,-12,-19, -9, -6, -5, 6, 6,-22, -6,-12; /M: SY='T'; M= -4, -9,-20,-13, -9,-11,-15,-16, -2,-13, -4, -3, -6,-14, -8,-13, -1, 8, -1,-22,-11, -9; /M: M= -4,-10,-24,-13, -9,-13,-17, -6, -5, -5, -8, -2, -7,-19, -3, -1, -7, -8, -3,-14, -4, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 54 in 54 different sequences |
| Number of true positive hits | 54 in 54 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Eph LBD |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
54 sequences
EPA4A_XENLA (Q91845), EPA4B_XENLA (Q91694), EPB1A_XENLA (Q91571), EPB1B_XENLA (Q91736), EPB4A_DANRE (O73875), EPB4B_DANRE (O73878), EPHA1_HUMAN (P21709), EPHA1_MOUSE (Q60750), EPHA2_HUMAN (P29317), EPHA2_MACFA (Q1KL86), EPHA2_MOUSE (Q03145), EPHA3_CHICK (P29318), EPHA3_DANRE (O13146), EPHA3_HUMAN (P29320), EPHA3_MOUSE (P29319), EPHA3_RAT (O08680), EPHA4_CHICK (Q07496), EPHA4_HUMAN (P54764), EPHA4_MOUSE (Q03137), EPHA5_CHICK (P54755), EPHA5_HUMAN (P54756), EPHA5_MOUSE (Q60629), EPHA5_RAT (P54757), EPHA6_HUMAN (Q9UF33), EPHA6_MOUSE (Q62413), EPHA6_RAT (P54758), EPHA7_CHICK (O42422), EPHA7_HUMAN (Q15375), EPHA7_MOUSE (Q61772), EPHA7_RAT (P54759), EPHA8_HUMAN (P29322), EPHA8_MOUSE (O09127), EPHAA_HUMAN (Q5JZY3), EPHAA_MOUSE (Q8BYG9), EPHB1_CHICK (Q07494), EPHB1_HUMAN (P54762), EPHB1_MOUSE (Q8CBF3), EPHB1_RAT (P09759), EPHB2_CHICK (P28693), EPHB2_COTJA (Q90344), EPHB2_HUMAN (P29323), EPHB2_MOUSE (P54763), EPHB3_CHICK (Q07498), EPHB3_HUMAN (P54753), EPHB3_MOUSE (P54754), EPHB3_XENLA (Q91735), EPHB4_HUMAN (P54760), EPHB4_MOUSE (P54761), EPHB5_CHICK (Q07497), EPHB6_HUMAN (O15197), EPHB6_MOUSE (O08644), EPHB6_PANTR (P0C0K6), EPHB6_RAT (P0C0K7), VAB1_CAEEL (O61460)» more
|
| PDB [Detailed view] |
49 PDB
1KGY; 1NUK; 1SHW; 2BBA; 2HLE; 2LW8; 2QBX; 2WO1; 2WO2; 2WO3; 2X10; 2X11; 3C8X; 3CKH; 3CZU; 3ETP; 3FL7; 3GXU; 3HEI; 3HPN; 3MBW; 3MX0; 3NRU; 3P1I; 3SKJ; 4BK4; 4BK5; 4BKA; 4BKF; 4ET7; 4L0P; 4M4P; 4M4R; 4W4Z; 4W50; 5JR2; 6B9L; 6NJZ; 6NK0; 6NK1; 6NK2; 6NKP; 6RW2; 7B7N; 7CZE; 7CZF; 7K7J; 7OFV; 7S7K » more |