Entry: PS51550

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] EPH_LBD
Accession [info] PS51550
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2011 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2011 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51550
Associated ProRule [info] PRU00883

Name and characterization of the entry

Description [info] Eph receptor ligand-binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=182;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=177;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4008522; R2=0.0164643; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-292.22104; R2=39.40200; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=523; N_SCORE=11.0; H_SCORE=22679; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=249; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16690; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -7, -7,-26, -6, 15,-17,-24,-11, -4, -3, -3, -2, -9, -9,  4, -8, -6, -3, -7,-25,-11,  8;
/M: SY='V'; M= -5,-15,-22,-14, -2,-10,-22,-11,  2, -8,  3,  1,-16,-20, -5, -8,-10, -7,  6,-23, -6, -4;
/M: SY='V'; M= -7,-15,-16,-17,-11, -3,-23,-18,  5,-17,  5,  1,-15,-16,-14,-16, -6,  3,  7,-24, -5,-13;
/M: SY='L'; M=-10,-25,-20,-25,-16,  3,-21,-19,  9,-23, 28, 10,-23,-23,-17,-14,-22,-11,  3,-20, -5,-17;
/M: SY='L'; M=-11,-16,-22,-17,-12,  6,-24, -9,  6,-15, 15, 10,-15,-23,-12,-12,-16, -7,  1,-16,  7,-13;
/M: SY='D'; M=-12, 22,-24, 28, 11,-19,-14, -4,-25, -4,-19,-19, 10,-12, -1, -9,  2,  0,-20,-30,-11,  5;
/M: SY='T'; M= -4,  1,-16, -4, -4,-11,-15,-10,-13, -6,-13, -8,  4,-14, -1, -3, 12, 19, -9,-28,-10, -3;
/M: SY='S'; M= -4,  3,-22,  2,  0,-19, -7,  1,-23,  6,-23,-14,  6,-14,  0,  5,  7,  1,-17,-24, -6, -1;
/M: SY='S'; M=  1, -3,-21, -6, -3,-17,-11, -9,-14,  1,-14, -7, -1,-12, -1, -1,  2,  2,-11,-23, -9, -2;
/M: SY='E'; M=  4, -6,-22, -7,  6,-17,-17, -8,-11,  1,-12, -7, -6,-13,  4, -2,  0, -3, -8,-20, -6,  3;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-19,-11, -5,-16,-14,-14, -9, -5, -9, -6, -5,-10, -3, -5,  3, 10, -5,-27,-13, -5;
/M: SY='S'; M=  6, -5,-17, -7, -7,-18, -1,-14,-16,-10,-19,-14, -2, -7, -7,-11, 15, 11, -8,-28,-15, -8;
/M: SY='E'; M= -9, 10,-27, 15, 18,-24,-15, -2,-23, -1,-17,-16,  4, -8,  4, -4, -2, -8,-22,-23,-14, 11;
/M: SY='L'; M= -5,-20,-21,-22,-15,  2,-22,-12, 10,-22, 25,  9,-17,-25,-14,-17,-18, -8,  3,-19,  1,-15;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-27, -2, -4,-28, 21,-10,-28, -1,-25,-14,  4,-16,  1, -3,  0,-11,-23,-24,-20, -2;
/M: SY='W'; M=-17,-33,-44,-34,-27,  6,-16,-27,-18,-19,-16,-17,-32,-28,-19,-19,-33,-24,-26,116, 22,-19;
/M: SY='T'; M= -5, -7,-20,-11, -9, -9,-16,-14, -6,-11, -3, -3, -5, -7, -8,-11,  0, 10, -7,-26,-10, -8;
/M: SY='T'; M= -4, -8,-22,-12,-11,-14, -6,-14, -9,-11, -9, -2, -4,-13, -7, -8,  0,  4, -7,-20,-12,-10;
/M: SY='Y'; M=-10,-10,-13,-14,-14,  1,-16, -9,-13,-14,-14,-11, -6,-22,-13,-14, -4, -1,-12,  5,  8,-13;
/M: SY='P'; M= -8,-12,-31,-10, -4,-22,-10,-11,-18, -5,-20,-11, -8, 21, -3, -8, -5, -7,-21,-19,-17, -5;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='T'; M= -2, -3,-15, -4, -2,-10,-13, -8, -5, -1, -6, -4, -1,-12, -4, -4,  0,  1, -4,-19, -6, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='C'; M= -5, -4,  2, -7, -8, -9,-11, -9, -9, -6, -9, -7, -3,-15, -6, -5, -4, -2, -6,-11, -5, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='H'; M= -3, -2,-12, -3, -1,-11, -3,  5,-11, -5,-12, -6,  2, -5,  0, -5,  4,  0, -9,-14, -5, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -5,  1,-16,  4,  3,-13, -8, -2,-12, -4,-12, -8,  0,  5, -1, -7,  1, -3,-13,-13, -9,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -3, -7,-23, -3, 10,-18,-12, -7,-16,  1,-16,-12, -7, 12,  1,  1, -2, -6,-15,-20,-13,  3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-25,  5,  6,-21,-16,-10,-12, -2,-15,-11,  3, -8, -2, -3,  0, -2,-10,-30,-15,  1;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-26, -5,-11,-22, 26,-13,-26,-13,-19,-13, -2,-18, -9,-11,  1, -8,-19,-22,-17,-10;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='W'; M=-16,-29,-42,-29,-24,  5,-16,-24,-18,-18,-16,-17,-30,-27,-17,-18,-29,-20,-24,102, 22,-17;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-24, 21, 17,-26, -9, -6,-24, -2,-21,-18,  8,-11,  2, -6,  6, -2,-18,-34,-18,  9;
/M: SY='E'; M= -9,  9,-27, 13, 30,-24,-18,  0,-21,  4,-17,-14,  4, -9, 13,  0,  0, -7,-22,-27,-13, 21;
/M: SY='V'; M= -1,-18,-19,-21,-15, -4,-21,-22,  6,-16,  0,  1,-17,-13,-16,-17, -4,  5, 11,-16, -8,-16;
/M: SY='S'; M=  3,  0,-19, -4,  0,-17, -3,-10,-20, -5,-23,-15,  5,-13,  0, -8, 15,  7,-15,-22,-14,  1;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-22,-11,-11, -5,  1,-10,-16, -8,-16, -8,  1,-19,-10, -9,  1, -3,-13,-15, -4,-10;
/M: SY='T'; M= -8, -5,-22, -8, -2,-10,-19,  1, -7, -8, -4, -1, -1,-15,  1, -6, -2,  3, -9,-23, -1, -2;
/M: SY='D'; M=-13, 19,-26, 29,  7,-27,-13, -4,-22, -4,-16,-15,  6,-10, -2, -9, -3, -8,-17,-33,-15,  2;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-30,  2,  9,-16, -6, -9,-24, -4,-19,-16, -1, -4, -1, -8, -6,-10,-25,-10,-12,  4;
/M: SY='D'; M= -6,  7,-25,  9,  2,-24, -2, -8,-21, -2,-15,-11,  5,-15,  1, -6, -2, -7,-18,-28,-16,  2;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M:         M= -7, -2,-21, -3, -5,-15, -1, -1,-14, -8, -8, -5, -1, -8, -3, -8, -5, -6,-15,-20, -8, -5; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='N'; M= -3, -1,-23, -6, -1,-19, -9,  2,-15, -5,-14, -7,  4,-12,  1, -2,  1, -1,-14,-27,-12, -2;
/M: SY='T'; M= -3, -5,-15, -6, -6,-17,-10,-10,-14,-13,-12,-11, -2, -1, -9,-14,  2,  3,-11,-31,-16, -9;
/M: SY='V'; M=-11,-15,-24,-16,-14, -7,-23, -4,  4,-11,  0,  3,-13,-22, -9, -4,-11, -7,  5,-16,  2,-14;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-29, -7, -2,-18,-14,  2,-24, 14,-18, -9,  3,-15,  8, 37, -8,-10,-21,-19, -5,  0;
/M: SY='T'; M=  1, -8,-18,-13, -7,-13,-15,-13, -8, -5,-10, -2, -7, -7, -5, -8,  5, 13, -2,-24, -9, -7;
/M: SY='Y'; M=-18,-23,-28,-25,-21, 31,-30,  4,  5,-17,  7,  3,-21,-24,-16,-14,-21,-10, -5, 15, 53,-22;
/M: SY='Q'; M= -6, -6,-24, -5,  6,-20,-12,  3,-15, -3,-16, -6, -4,-15, 16, -4,  2, -3,-14,-20, -2, 10;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-17,-27,-24, -5,-27,-25, 25,-20,  8, 11,-20,-22,-20,-21, -8, -1, 29,-26, -8,-23;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D'; M=-13, 22,-27, 23,  8,-26,-11,  9,-26,  1,-26,-18, 22, -5,  5, -2,  2, -6,-27,-31,-12,  5;
/M: SY='V'; M= -5,-17,-21,-17,-15, -5,-26,-14, 10,-13, -1,  2,-17,-17, -9,-15, -9, -6, 13,-18,  3,-14;
/M: SY='S'; M=  0, -1,-20, -3,  2,-17, -9, -4,-16, -3,-16, -8,  2,-14,  2, -3,  6,  3,-11,-27,-12,  1;
/M: SY='R'; M= -9, -1,-23, -1,  5,-12,-13,  4,-20,  2,-18, -9,  4,-15,  4,  6,  3, -4,-18,-24, -5,  4;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P'; M= -4, -1,-22,  1,  1,-21, -2,-10,-18, -4,-21,-14,  1, 11, -4, -7,  3, -1,-17,-25,-18, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='N'; M=-12, 16,-27, 15,  7,-24, -6,  9,-25,  0,-23,-16, 18,-10,  3, -2, -1, -9,-26,-23,-12,  5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='Q'; M= -7, -6,-27, -5,  9,-31,-20, -2,-14,  3,-18, -3, -5, -1, 32,  1,  1, -4,-18,-24,-13, 19;
/M: SY='N'; M=-12, 24,-25, 22,  4,-25,-10,  0,-21,  0,-24,-17, 25,-12,  3,  1,  5, -2,-22,-35,-17,  3;
/M: SY='N'; M= -4, 23,-19, 10, -1,-21, -1,  4,-20, -1,-27,-17, 37,-17,  1, -2, 12,  4,-23,-35,-18,  0;
/M: SY='W'; M=-19,-37,-47,-37,-28, 10,-17,-28,-20,-17,-20,-19,-36,-29,-19,-18,-36,-28,-28,130, 26,-19;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-30,-21, 11,-30,-21, 20,-29, 43, 18,-29,-29,-21,-20,-27, -9, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='R'; M=-14,-17,-29,-19, -9, -7,-25, -9, -5,  4, -3, -1,-10,-21, -1, 25,-14,-10, -6,-12, -1, -8;
/M: SY='T'; M=  4,  0,-11, -5, -5,-15,-10,-14,-16, -9,-20,-15,  5,-10, -4, -7, 29, 33, -6,-34,-15, -5;
/M: SY='P'; M=-11,  3,-31,  7,  4,-27,-15, -4,-22, -1,-26,-16,  3, 27, -1, -8, -3, -4,-25,-31,-19, -1;
/M: SY='W'; M=-17,-26,-29,-29,-23, 31,-26, -6, -5,-18, -1, -4,-22,-28,-20,-13,-21,-11, -9, 39, 37,-21;
/M: SY='I'; M=-11,-29,-22,-39,-29,  9,-37,-28, 39,-29, 18, 17,-21,-23,-22,-27,-19,-10, 25,-18,  2,-29;
/M: SY='N'; M= -8,  7,-28,  7,  4,-22, -9, -4,-23,  2,-25,-17,  8,  5,  0, -2, -2, -7,-24,-23,-12,  0;
/M: SY='R'; M= -4,-14,-21,-18,-11, -8,-19,-15, -7,  2, -5, -3,-10,-19, -9, 11, -6,  2,  1,-21, -8,-11;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='R'; M=-10, -5,-27, -5,  1,-20, -5, -9,-18,  2,-13, -8, -3,-14,  2,  4, -7,-10,-16,-23,-13,  0;
/M: SY='D'; M= -3,  2,-25,  5,  0,-26,  5,-12,-24, -8,-22,-17,  0,  0, -6,-10,  3, -4,-19,-29,-21, -4;
/M: SY='A'; M= 32, -8,-14,-16,-10,-18, -1,-12,-11,-10,-10, -8, -5,-14,-10,-15,  5, -2, -3,-22,-17,-10;
/M: SY='K'; M= -5,  3,-24,  1,  8,-26,-14,  2,-24, 15,-25,-11,  8, -9, 13, 12,  4, -2,-21,-27,-12, 10;
/M: SY='R'; M=-15, -4,-29, -4, 10,-23,-20, -3,-27, 26,-19,-10,  0,-15, 12, 43, -7, -8,-20,-22,-11,  8;
/M: SY='I'; M= -4,-29,-21,-34,-27,  0,-33,-27, 35,-25, 19, 16,-24,-24,-22,-24,-17, -6, 32,-23, -4,-27;
/M: SY='Y'; M=-13,-13,-24,-15,-13, 17,-24, 11, -6,-13, -3, -3,-12,-24,-11,-11,-10, -4, -8,  0, 34,-14;
/M: SY='V'; M= -1,-28,-15,-31,-27,  0,-31,-28, 30,-23, 16, 12,-26,-27,-25,-22,-13, -1, 38,-26, -7,-27;
/M: SY='E'; M=-11, 11,-27, 15, 32,-27,-18,  5,-28, 10,-21,-16,  6, -7, 14,  6,  0, -4,-25,-29,-14, 22;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-33,-25,  5,-32,-25, 31,-27, 27, 18,-25,-25,-21,-23,-20, -8, 24,-21, -2,-25;
/M: SY='R'; M=-11,  4,-26,  4, 10,-23,-17,  2,-22, 10,-19,-11,  6,-13, 10, 14,  0, -2,-19,-27,-11,  9;
/M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27, 65,-30, -8,  0,-24,  7,  0,-20,-30,-31,-17,-20,-10, -3, 16, 45,-27;
/M: SY='T'; M=  5, -4,-14,-11, -9,-12,-14,-17, -8,-12,-14,-11,  1,-12, -8,-13, 18, 27, -2,-25,-12, -9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='I'; M= -5,-17,-19,-24,-17, -2,-25,-17, 15,-13,  9, 14,-14,-20,-11,-13,-11, -2, 13,-22, -4,-15; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='R'; M=-14, -9,-26,-11, -5,-17,-19, -5,-18, 15,-15, -6,  0,-16,  2, 41, -7, -6,-11,-24,-12, -5;
/M: SY='D'; M=-11, 25,-27, 34, 14,-28, -3, -1,-33, -2,-26,-23, 13,-12, -1, -8,  2, -8,-26,-32,-17,  7;
/M: SY='C'; M=-11,-14,103,-22,-24,-22,-28,-26,-30,-26,-21,-20,-16,-37,-24,-27, -9,-10,-12,-48,-28,-24;
/M: SY='S'; M= -1,  7,-21,  7,  6,-23,-11, -8,-19,  1,-20,-14,  7, -8,  2, -3,  9,  1,-14,-32,-17,  4;
/M: SY='S'; M= -2,  3,-20,  3, -1,-15,-13, -8,-14, -9,-18,-13,  4, -8, -5,-11, 11,  5,-10,-31,-12, -4;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='L'; M=-11,-19,-23,-22,-19, 11,-18,-16,  7,-19, 13,  5,-14,-24,-18,-13,-17,-10,  2,-14,  3,-19; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-26, -6, -4,-21, -2,-11,-19,-10,-18,-13, -7, 22, -8,-11,  0, -4,-18,-26,-19, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M= -6,  3,-23,  1, -2,-21, 11, -8,-24, -1,-21,-14,  9,-15, -5,  0,  2, -6,-20,-22,-17, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M:         M= -1, -9,-18,-12,-12, -8, -6,-15,  0,-14, -5, -4, -5, -7,-13,-15, -4, -5,  0,-21,-12,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='A'; M=  4, -5,-15, -5, -4,-14, -3, -9,-10, -3,-12, -7, -4, -5, -2, -7,  3, -2, -5,-16, -8, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M=  3, -6,-15, -7, -7,-12,  5, -9,-13, -6,-12, -9, -2, -6, -6, -4,  4, -2, -9,-16,-10, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='C'; M=-10,-19,114,-29,-29,-19,-29,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29,-10,-10,-10,-48,-29,-29; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='K'; M=-10, -3,-27, -4,  7,-26,-19, -6,-23, 28,-23, -8, -1, -8, 14, 24, -5, -5,-18,-21,-10,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-27, 10, 37,-23,-19,  5,-24,  5,-18,-14, -1, -6, 18, -1,  1, -6,-25,-24, -8, 27;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='T'; M=  1, -2,-12,-10,-10, -6,-18,-18, -7,-12, -8, -8, -2,-12,-11,-12, 14, 33,  0,-27, -8,-10; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-19,-38,-29, 60,-30,-21,  8,-29, 16,  4,-22,-30,-36,-20,-20, -9,  7,  1, 21,-29;
/M: SY='N'; M= -8, 14,-21, 11,  2,-19, -9, -3,-19,  1,-20,-15, 18,-16, -2, -1,  6,  2,-17,-30,-11, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-26,-22,  8,-30,-22, 22,-25, 28, 15,-24,-27,-21,-21,-21, -8, 18,-21, -1,-22;
/M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-24,-17, 26,-29, -1,  1,-10,  6,  3,-18,-26,-13, -9,-19,-10, -5,  8, 39,-16;
/M: SY='Y'; M= -9,-17,-24,-18,-16, 12,-20,  1, -3, -8, -3, -2,-16,-24,-11, -9,-11, -5, -5,  5, 37,-16;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-26,-17,-14,  3,-18,  3, -3, -7,  0,  3,-11,-23, -6, -7,-14,-10, -8, -4, 23,-12;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-29,  6, 31,-30,-20,  6,-21,  7,-16, -8,  1, -8, 31,  3, -2,-10,-26,-25,-13, 31;
/M: SY='T'; M= 10,-11, -9,-17,-13, -2,-14,-18, -8,-13, -7, -8, -7,-17,-13,-12,  9, 12,  1,-24,-10,-13;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M=-12, 24,-25, 33, 19,-31,-11,  1,-28,  7,-24,-18, 12, -8, 12,  0,  1, -7,-24,-29,-15, 16; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='S'; M=  0, -1,-14, -1,  1,-13, -5, -8, -9, -6,-12, -9,  1, -5, -3, -8,  5, -1, -7,-16,-11, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='A'; M= 10, -1,-13, -4, -1,-14, -3, -4,-12, -4,-10, -8,  1, -4, -3, -5,  3, -2, -9,-18,-12, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='T'; M=  2, -3,-17, -4, -3,-15, -9, -6,-10, -8,-13, -9, -2, -1, -4,-10,  5,  6, -8,-21, -9, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='D'; M= -4,  5,-21, 10,  7,-23, -1, -7,-21, -2,-20,-14,  3, -3,  2, -5,  6, -3,-17,-25,-16,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-17,  3,  2,-15,-12, -2,-12, -1,-12, -9,  5, -8, -2, -3,  2,  2, -9,-24, -9, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='S'; M= -3, -5,-18, -6, -7, -8, -2,-10,-12,-10,-15,-10,  0, -6, -7,-11,  4,  1,-10,-15, -8, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -2,-12,-23,-12, -7, -8,-15,-14, -9, -9,-12,-10, -9, 20,-10,-13, -4, -3,-12,-15,-11,-10; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M:         M=  0, -6,-12,-10, -7,-12, -8, -7,-12,-10,-12, -8, -2,  0, -4,-11, -1, -2,-12,-22,-12, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='W'; M= -9,-16,-28,-18, -8,  1,-17,-17,-11,-10, -9,-10,-15,-18,-10,-11,-15, -9,-15, 38,  6, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R'; M=-11, -2,-25, -5, -2,-17,-16,  1,-16,  5,-16, -5,  5, -8,  4, 12, -2, -4,-16,-25, -8, -1;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-26,  5, 22,-23,-17, -6,-23,  3,-20,-15, -3,  5,  8, -1,  2, -2,-21,-27,-14, 14;
/M: SY='S'; M= -3, -2,-23, -3,  1,-18, -1, -5,-21, -4,-21,-14,  5, -9, -3, -2,  7, -1,-17,-28,-15, -2;
/M: SY='P'; M= -5, -7,-24, -9, -6,-12,-12, -7,-13,-12,-12, -9, -2,  5, -5,-12, -1, -1,-15,-26,-12, -7;
/M: SY='Y'; M=-15,-20,-32,-21,-18, 17,-25, -2, -5,-14, -6, -6,-19,-21,-12,-14,-18,-12,-12, 34, 40,-16;
/M:         M= -3, -6,-21, -8, -6,-16,-15,-12, -7, -2, -9, -5, -4,-17, -6, -1, -1,  0, -2,-26,-11, -8;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2,  4,-22,-20, -9,-23, 25,-21,-10, -1, -4,  5, 19, -8, -6,-19,-22,-11,  4;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-22,-28,-20, -4,-32,-25, 27,-17,  9, 10,-22,-19,-19,-16,-14, -6, 27,-25, -7,-21;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-25, 23,  3,-26, -6, -9,-25, -2,-15,-16,  3,-15, -5, -4, -4, -8,-16,-30,-17, -2;
/M: SY='T'; M=  2,  3,-14, -4, -6,-15,-15,-14,-15, -5,-14,-12,  5,-12, -6, -2, 15, 30, -6,-30,-13, -7;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-34,-27,  1,-34,-28, 34,-26, 19, 14,-24,-24,-22,-24,-17, -5, 29,-17, -2,-27;
/M: SY='A'; M= 25, -6,-16,-12, -2,-20, -5,-16,-14, -7,-11,-11, -6, -6, -7,-14,  6,  2, -7,-24,-18, -4;
/M: SY='A'; M= 22, -2,-18, -6, -4,-24, -5,-10,-16, -5,-17,-12, -3, -5, -4,-12,  5, -3, -9,-25,-18, -4;
/M: SY='D'; M=-12, 18,-27, 25, 13,-28, -9, -5,-24, -4,-18,-16,  8, -8,  3, -9, -1, -7,-22,-32,-17,  8;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-29,  4, 18,-21,-13,  4,-26,  7,-21,-14, -2, -3,  6,  2, -4, -9,-24,-21, -6, 11;
/M: SY='R'; M= -7, -6,-23, -8, -2,-15,-12, -5,-15, -2,-13, -8, -1,-12,  1,  4,  2, -1,-12,-27,-11, -2;
/M: SY='F'; M=-12,-20,-22,-26,-21, 28,-15,-16, -5,-20,  1, -3,-12,-24,-23,-13,-11, -4, -5, -1, 10,-21;
/M: SY='R'; M= -1, -8,-21,-11, -4,-15,-17,-11,-13,  3,-14, -8, -4, -8, -1,  5,  4,  5, -8,-25,-11, -4;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='N'; M= -5,  5,-21,  5,  2,-20,-11,  5,-17,  0,-17,-10,  7, -4,  5,  2,  1, -4,-17,-24,-11,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='N'; M= -2, -2,-12, -5, -3, -6, -9,  1, -8, -2, -9, -5,  2,-11, -3,  2,  2,  0, -4,-17, -5, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='A'; M=  1, -5,-14, -5, -1,-13,  1, -8,-12, -2,-10, -7, -3, -1, -1, -3,  1, -2,-10,-15,-11, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='D'; M= -2,  7,-16,  9,  5,-19,  2, -3,-19,  0,-16,-11,  5, -8,  3,  0,  3, -4,-15,-18,-12,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='N'; M= -3,  6,-16,  3, -4,-15, -2, -7,-16, -3,-16,-12,  9,-12, -4, -1,  5,  4,-12,-18,-12, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='S'; M=  0,  1,-11,  0, -3,-16,-11,-11,-12, -3,-14,-10,  1,-13, -6, -4,  6,  6, -3,-27,-14, -5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V'; M=  0, -9,-17, -8, -3,-13,-13,-11, -3, -7, -4, -2,-10,-16, -7, -8, -3, -3,  5,-24,-11, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -8,  5,-22,  6, 10,-21,-15, -5,-19,  9,-17,-11,  4,-12,  5, 10,  0, -3,-15,-26,-13,  7; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -3,-18,-17,-21,-15, -3,-22,-17, 10,-14,  8,  7,-15,-20,-11,-12, -5,  2, 11,-24, -6,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='N'; M= -7, 25,-20, 13, -1,-20, -3,  7,-19, -4,-22,-16, 36,-18,  0, -4,  8,  2,-23,-35,-16,  0;
/M: SY='V'; M= -3,-12,-19,-15,-13, -8,-14,-17,  0,-10, -5,  3,-12,-13,-12,-12, -4,  4,  6,-24,-10,-13;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-28,  9, 28,-29,-20, -3,-24, 17,-20,-10, -1, -8, 18,  9, -3, -7,-21,-26,-14, 23;
/M: SY='T'; M= -4,-11,-20,-16, -8,-10,-24,-12,  3,-11,  0,  3, -9,-15, -6,-10, -1, 11,  4,-25, -7, -8;
/M: SY='R'; M=-10,-15,-19,-17, -8, -6,-22,-12, -9,  4, -3, -1,-11,-21, -6, 17,-10, -4, -3,-21, -7, -8;
/M: SY='S'; M= -3,  3,-20,  1,  4,-21,-11, -6,-19,  0,-24,-14,  8, -2,  1, -1, 14,  9,-15,-33,-16,  1;
/M: SY='L'; M=-12,-22,-22,-28,-22, 19,-30,-20, 17,-26, 20,  9,-18,-25,-23,-21,-18, -5, 10,-14,  6,-23;
/M: SY='G'; M=  6,-11,-25,-11,-11,-25, 26,-19,-24,-13,-22,-15, -5, -4,-14,-17,  2, -9,-17,-23,-24,-13;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-27,-10, -7,-15,-18,-13, -9, -9,-13, -7, -8, 19,-10,-14, -6, -5,-11,-26,-15,-10;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='L'; M= -9,-19,-19,-20,-10,  4,-24,-15, 13,-17, 20,  9,-17,-14,-12,-13,-17, -8,  6,-15, -1,-12; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='T'; M= -1,  3,-12, -1, -3,-14,-10, -6,-14, -3,-16,-11,  6,-10, -1,  0, 15, 20, -8,-26,-10, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='R'; M=-10, -5,-19, -5,  3,-19,-15, -2,-19, 18,-15, -4, -3,-13,  7, 19, -6, -6,-14,-19, -8,  4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='N'; M= -1,  4,-22,  2, -1,-22, -6, -9,-19,  5,-20,-13,  6,-11, -3,  5,  0, -5,-12,-27,-17, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-26, -9,-16,-20, 39, -9,-29,-15,-23,-15,  1,-19,-14,-16,  1,-12,-23,-16,-13,-16; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='F'; M= -7,-24,-18,-31,-22, 31,-25,-18, 10,-22, 11, 11,-20,-24,-24,-18,-14, -7, 10,-10,  8,-21;
/M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-17, 21,-25, 16, -6, -6, -4, -2,-16,-28, -9,  0,-17,-10,-11, 16, 56,-17;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-30,-20,  9,-31,-22, 22,-27, 34, 15,-27,-23,-20,-21,-24, -9, 14,-20, -1,-21;
/M: SY='A'; M= 34,-12,-14,-20, -9,-12, -7,-20, -7,-12, -8, -9,-10,-12,-11,-19,  6,  0, -1,-15,-14,-10;
/M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-36,-26, 40,-31,-20, 14,-26, 15,  7,-20,-26,-28,-19,-19, -9,  9, -4, 16,-26;
/M: SY='Q'; M=-10, -1,-27,  1, 13,-28,-20,  7,-19, 10,-19, -5, -1,-13, 27,  9, -2, -8,-19,-23, -6, 19;
/M: SY='D'; M=-16, 29,-28, 39, 12,-27, -9, -1,-30, -3,-23,-22, 14,-10, -2, -9, -1, -7,-25,-30,-11,  5;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-23, -4,  2,-23,-17, -1,-16,  5,-18, -7,  5,-11, 13,  7,  4,  3,-15,-27,-11,  7;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-29,-10,-17,-29, 58,-18,-38,-13,-29,-19,  0,-19,-16,-12, -1,-18,-28,-20,-27,-17;
/M: SY='A'; M= 27, -5,-13,-13, -8,-19,  1,-17,-13, -9,-16,-12, -1,-12, -8,-15, 14,  6, -5,-26,-19, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-20,114,-29,-29,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-35,-29,-30,-10,-10,-11,-49,-30,-29;
/M: SY='M'; M= -4,-20,-18,-25,-20, -4,-19,-16, 16,-18, 10, 20,-17,-21,-12,-16, -7, -1, 15,-26, -7,-17;
/M: SY='A'; M= 19, -8,-10,-13, -5,-15, -8,-15,-10,-11,-15,-11, -4,-13, -4,-14, 15,  4, -3,-27,-16, -4;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-32,-24,  2,-33,-25, 30,-25, 27, 16,-25,-21,-20,-22,-22, -9, 21,-22, -3,-24;
/M: SY='L'; M= -3,-14,-20,-18, -9, -5,-20,-13,  5,-14,  7,  7,-11,-16, -6,-13, -7, -3,  2,-24, -8, -8;
/M: SY='S'; M=  3,  0,-18, -3, -4,-19, -1,  0,-21, -3,-23,-14,  9,-15, -2, -1, 14,  4,-14,-29,-12, -4;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-14,-29,-26,  2,-28,-24, 24,-21, 17, 13,-27,-28,-24,-19,-13, -1, 34,-25, -5,-25;
/M: SY='R'; M=-10, -8,-27, -8,  2,-23,-19, -2,-19, 18,-17, -5, -2,-16, 13, 28, -5, -7,-14,-22, -9,  5;
/M: SY='V'; M=  0,-27,-16,-30,-26, -3,-30,-27, 28,-21, 10, 10,-25,-22,-23,-21,-11, -3, 36,-27, -9,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-24,-27,-28,-20, 37,-28, -7, -1,-17,  2, -2,-20,-27,-20,-15,-19,-11, -6, 23, 39,-20;
/M: SY='Y'; M=-15,-14,-26,-17,-17, 20,-22, 14, -4,-11, -4, -2,-11,-27, -9,-10,-13, -8,-10, 11, 50,-16;
/M: SY='K'; M=-13, -5,-26, -8, -4, -6,-22, -6,-13, 10,-11, -5, -2,-18, -2, 10, -9, -4,-11,-15,  4, -4;
/M: SY='V'; M= -4,-16,-19,-20,-15,  0,-23,-15,  0, -2, -5,  1,-13,-21,-13,  1, -6,  0,  8,-18, -1,-14;
/M: SY='C'; M=-10,-20,115,-30,-30,-19,-30,-30,-28,-30,-18,-19,-20,-40,-30,-30,-11,-10, -9,-49,-29,-30;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-33, -3,  6,-29,-14, -9,-22, -5,-27,-17,-10, 47, -3,-13, -3, -8,-26,-29,-23, -1;
/M: SY='E'; M=  2, -3,-25, -1, 13,-25,-15, -9,-19,  5,-17,-11, -5,  5,  6, -2,  0, -5,-17,-26,-17,  8;
/M: SY='T'; M= -4,-15,-14,-20,-13, -3,-24,-16,  2, -8,  0,  5,-12,-19, -9, -6, -5,  6,  6,-22, -6,-12;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-20,-13, -9,-11,-15,-16, -2,-13, -4, -3, -6,-14, -8,-13, -1,  8, -1,-22,-11, -9;
/M:         M= -4,-10,-24,-13, -9,-13,-17, -6, -5, -5, -8, -2, -7,-19, -3, -1, -7, -8, -3,-14, -4, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 52 in 52 different sequences
Number of true positive hits 52 in 52 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Eph LBD
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
52 sequences

EPA4A_XENLA (Q91845), EPA4B_XENLA (Q91694), EPB1A_XENLA (Q91571), 
EPB1B_XENLA (Q91736), EPHA1_HUMAN (P21709), EPHA1_MOUSE (Q60750), 
EPHA2_HUMAN (P29317), EPHA2_MACFA (Q1KL86), EPHA2_MOUSE (Q03145), 
EPHA3_CHICK (P29318), EPHA3_DANRE (O13146), EPHA3_HUMAN (P29320), 
EPHA3_MOUSE (P29319), EPHA3_RAT   (O08680), EPHA4_CHICK (Q07496), 
EPHA4_HUMAN (P54764), EPHA4_MOUSE (Q03137), EPHA5_CHICK (P54755), 
EPHA5_HUMAN (P54756), EPHA5_MOUSE (Q60629), EPHA5_RAT   (P54757), 
EPHA6_HUMAN (Q9UF33), EPHA6_MOUSE (Q62413), EPHA6_RAT   (P54758), 
EPHA7_CHICK (O42422), EPHA7_HUMAN (Q15375), EPHA7_MOUSE (Q61772), 
EPHA7_RAT   (P54759), EPHA8_HUMAN (P29322), EPHA8_MOUSE (O09127), 
EPHAA_HUMAN (Q5JZY3), EPHAA_MOUSE (Q8BYG9), EPHB1_CHICK (Q07494), 
EPHB1_HUMAN (P54762), EPHB1_MOUSE (Q8CBF3), EPHB1_RAT   (P09759), 
EPHB2_CHICK (P28693), EPHB2_COTJA (Q90344), EPHB2_HUMAN (P29323), 
EPHB2_MOUSE (P54763), EPHB3_CHICK (Q07498), EPHB3_HUMAN (P54753), 
EPHB3_MOUSE (P54754), EPHB3_XENLA (Q91735), EPHB4_HUMAN (P54760), 
EPHB4_MOUSE (P54761), EPHB5_CHICK (Q07497), EPHB6_HUMAN (O15197), 
EPHB6_MOUSE (O08644), EPHB6_PANTR (P0C0K6), EPHB6_RAT   (P0C0K7), 
VAB1_CAEEL  (O61460)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission