ID AV_ZBD; MATRIX. AC PS51652; DT 01-AUG-2012 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE. DE Arteriviridae zinc-binding (AV ZBD) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=67; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2115955; R2=0.0074997; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8898.2285156; R2=4.7628765; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=972; H_SCORE=13528; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=572; H_SCORE=11623; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='G'; M=-56,-80,-67,-68,-87,71,-72,-90,43,-89,-80,-55,-73,-62,-64,68,-60,-83,-84,-79; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='K'; M=-90,-104,-82,-68,-106,-97,-85,-106,93,-105,-93,-75,-90,-67,-51,-84,-84,-102,-99,-93; D=-28; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='K'; M=-89,-105,-73,48,-107,-99,-84,-108,76,-105,-95,-78,-87,-65,-58,-84,-85,-102,-102,-95; D=-28; MA /I: I=-28; MI=-71; IM=-71; DM=-71; MA /M: SY='C'; M=58,85,-85,-80,64,-75,-82,-57,-79,-61,-63,-77,-85,-81,-82,-64,-65,40,-77,-59; MA /I: I=-30; MD=-77; MA /M: SY='R'; M=-91,-111,-87,-72,-107,-101,-78,-107,-55,-101,-89,-81,-99,67,83,-84,-92,-104,-102,-89; D=-30; MA /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77; MA /M: SY='H'; M=-8,-21,-21,-19,-12,-30,53,13,-19,-1,0,-13,-25,-18,-20,-9,20,41,-44,-7; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='T'; M=19,-17,-13,-15,-26,31,-19,-21,-13,-24,-18,-2,-16,-12,-20,25,36,-13,-33,-22; MA /M: SY='I'; M=-13,-26,-29,-27,-6,-36,44,45,-25,8,7,-20,-27,-21,-25,-20,-9,38,-36,-6; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='C'; M=-8,64,33,-13,-34,55,-20,-39,-19,-34,-28,-1,-24,-19,-27,-6,-16,-32,-37,-29; MA /M: SY='A'; M=53,-14,-17,-12,-28,-1,-19,-19,-14,-21,-15,-10,-18,-9,-18,25,0,-7,-29,-23; MA /M: SY='P'; M=28,-22,-14,-6,-29,-13,-19,-21,22,-24,-16,-9,40,-8,-5,1,22,-13,-30,-23; MA /M: SY='P'; M=35,-23,-17,-10,-31,-7,-20,-22,-14,-27,-18,-14,61,-12,-21,19,-3,-15,-31,-27; MA /M: SY='D'; M=-11,-24,32,-6,-20,-26,-17,2,-4,-11,-10,-6,-23,-11,24,-8,20,26,-41,-17; MA /M: SY='Y'; M=27,-19,-21,-18,1,-17,-11,-6,-17,12,-2,-16,-24,-15,-19,-2,20,-3,-11,39; MA /M: SY='K'; M=19,-20,-15,-7,-22,-18,-20,-6,32,-15,-10,-8,-18,-6,1,-1,22,14,-31,-18; MA /M: SY='S'; M=7,-16,-8,-9,-27,-2,-11,-26,-9,-30,-23,3,-16,-1,-14,61,12,-19,-35,-19; MA /M: SY='A'; M=43,-16,-20,-15,-18,-7,-19,-10,-17,10,-6,-14,-21,-11,-20,20,-3,-4,-28,-18; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='G'; M=-1,-29,-17,-28,-35,77,-23,-43,-22,-39,-28,-3,-21,-20,-30,-2,-21,-37,-26,-30; MA /M: SY='M'; M=-11,-24,-28,-28,-6,38,-18,1,-25,32,39,-19,-27,-19,-26,-16,-17,-4,-25,-12; MA /M: SY='W'; M=11,-31,33,-8,-14,-13,-18,-27,-13,-28,-25,26,-25,-12,-19,-9,-14,-28,110,-2; MA /M: SY='F'; M=-22,-22,-38,-31,53,-37,-21,10,-31,45,13,-34,-37,-29,-28,-29,-17,3,-10,10; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='D'; M=-12,-29,49,-5,-22,40,-15,-19,-17,9,-13,-1,-23,-15,-23,-10,-15,-21,-35,-20; MA /M: SY='F'; M=-22,-24,-11,-23,59,-20,-3,-11,-15,-7,-9,42,-33,-18,-18,-12,-11,-15,-2,42; MA /M: SY='C'; M=-17,105,-19,-19,-22,-27,75,-34,-20,-21,-14,-7,-33,-17,-19,-14,-16,-26,-55,-9; MA /M: SY='V'; M=21,-19,-21,-20,-20,24,-24,2,-19,-12,-10,-12,-23,-16,-23,22,-2,27,-33,-20; MA /I: I=-28; MD=-71; MA /M: SY='P'; M=-45,-65,-38,-32,-56,-46,45,-55,-38,-55,-41,-37,58,-36,-43,-39,-39,-58,-64,-37; D=-28; MA /I: I=-28; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; MA /M: SY='Y'; M=-47,-60,-45,-41,-9,-55,-19,-42,-22,-37,-31,-43,-57,-29,18,-41,-43,-44,-16,48; D=-28; MA /I: I=-28; DM=-71; MA /M: SY='H'; M=-22,-33,-6,-6,-20,-23,109,-39,-10,-21,-6,5,-22,0,-4,-11,-20,-38,-56,11; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='G'; M=-11,-29,-23,-30,38,54,-13,-22,-23,-16,-15,-12,-27,-23,-26,-10,-20,-23,-4,38; MA /M: SY='H'; M=-22,-33,-6,-6,-20,-23,109,-39,-10,-21,-6,5,-22,0,-4,-11,-20,-38,-56,11; MA /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; MA /M: SY='P'; M=-29,-56,-33,-22,-58,17,-32,-51,-26,-51,-38,-27,35,28,-30,-24,-35,-52,-46,-44; D=-28; MA /I: I=-28; DM=-71; MA /M: SY='C'; M=-17,105,-19,-19,-22,-27,75,-34,-20,-21,-14,-7,-33,-17,-19,-14,-16,-26,-55,-9; MA /M: SY='C'; M=-18,94,-16,-16,-22,-26,86,-35,-18,-21,-12,-4,-31,-12,-15,-13,-17,-28,-55,-3; MA /M: SY='P'; M=-10,-26,-18,-13,-23,-23,-24,-4,-15,-16,-12,-15,68,-19,-24,-4,35,14,-37,-24; MA /M: SY='V'; M=-7,-17,-25,-23,-7,-30,-27,15,-21,19,4,-17,-24,-22,-24,-6,35,37,-37,-14; MA /M: SY='S'; M=2,-16,-13,-13,-20,-11,-17,-6,-12,-16,-14,-2,-17,-8,-17,44,32,14,-37,-18; MA /M: SY='L'; M=-13,-20,-29,-24,2,-28,-19,10,-25,49,13,-25,-32,-17,-24,10,-8,4,-26,-8; MA /I: I=-26; MD=-65; MA /M: SY='F'; M=-38,-40,-46,-39,63,-43,-33,-18,-39,-12,-19,-40,34,-47,-40,-36,-30,-24,-12,7; D=-26; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='N'; M=-27,-40,-17,-31,-50,-24,-23,-50,-26,-56,-45,41,-44,-24,-33,14,-16,-48,-65,-44; D=-26; MA /I: I=-26; DM=-65; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='G'; M=-4,-29,-15,-19,-34,68,-20,-41,16,-37,-26,-2,-19,-12,-12,-3,-18,-34,-26,-27; MA /M: SY='H'; M=-22,-33,-6,-6,-20,-23,109,-39,-10,-21,-6,5,-22,0,-4,-11,-20,-38,-56,11; MA /M: SY='H'; M=12,-26,46,0,-24,-18,55,-11,-13,-17,-13,0,-22,-9,-16,-7,-9,10,-46,-11; MA /M: SY='I'; M=18,-23,-33,-28,-7,-28,-34,49,-26,8,6,-25,-25,-24,-30,-14,-8,32,-29,-13; MA /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; MA /M: SY='G'; M=-7,-31,-16,-18,-33,60,-16,-40,0,-34,-23,-5,-23,-8,40,-6,-20,-34,-27,-24; MA /M: SY='S'; M=7,-16,-8,-9,-27,-2,-11,-26,-9,-30,-23,3,-16,-1,-14,61,12,-19,-35,-19; MA /M: SY='T'; M=-8,-21,-5,-9,-27,23,-12,-24,24,-27,-18,32,-17,-6,-3,3,35,-19,-35,-21; MA /M: SY='Y'; M=-12,-26,-9,23,4,-29,-5,-3,-10,-9,-7,-15,-21,-7,-15,-8,20,13,-7,52; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='T'; M=-6,-21,30,-1,-27,-15,-13,-23,20,-25,-20,4,-15,-4,-4,26,37,-16,-38,-19; MA /M: SY='M'; M=-10,-26,-23,-13,-15,20,-7,-2,-11,4,67,-12,-21,34,-11,-12,-14,-7,-26,-9; MA /M: SY='C'; M=-14,128,-33,-34,-24,-29,-33,-31,-29,-21,-22,-20,-44,-37,-36,-16,-14,-18,-54,-35; MA /M: SY='E'; M=-4,-27,3,40,-33,-14,-6,-30,1,-28,-20,-2,-13,40,-4,34,-1,-25,-31,-20; MA /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='S'; M=3,-19,-13,-14,-20,-8,-16,13,-13,-16,-13,-1,-18,-5,-17,53,8,-4,-33,-16; MA /M: SY='P'; M=-19,-44,-19,-8,-38,-21,-22,-26,-15,-37,-23,-26,101,-19,-28,-16,-11,-31,-32,-36; MA /M: SY='V'; M=-10,-24,-24,-14,-12,-32,-26,29,30,0,0,-17,-24,-12,-3,-16,-7,37,-31,-14; MA /M: SY='Q'; M=-11,-28,-19,-8,-18,27,-10,-8,-9,14,35,-11,-23,45,-10,-10,-16,-12,-25,-12; MA /M: SY='M'; M=20,-20,-19,-11,-18,-13,-11,-7,18,-4,50,-10,-19,-4,-5,16,-4,-7,-28,-13; MA /M: SY='V'; M=-9,-24,26,-15,-14,26,-23,6,-22,13,-3,-12,-27,-20,-26,-13,-10,27,-35,-17; MA /M: SY='P'; M=-18,-35,-10,-6,-32,-20,-8,-31,9,-32,-20,25,60,-2,49,-11,-11,-30,-33,-23; MA /M: SY='T'; M=-5,-19,-8,-4,-25,-16,-14,-21,34,-24,-17,1,-14,-2,3,26,40,-14,-33,-18; MA /M: SY='P'; M=-11,-29,-11,21,-23,-28,-20,1,19,-13,-10,-17,47,-7,-7,-14,-8,25,-33,-22; MA /M: SY='P'; M=-21,-29,-30,-21,34,-31,-21,1,-25,31,4,-31,60,-25,-28,-24,-15,-6,-17,-3; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_01,570830; NR /TOTAL=9(9); /POSITIVE=9(9); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=AV ZBD; CC /VERSION=4; DR P19811 , RPOA_EAVBU , T; Q06502 , RPOA_LDVC , T; DR Q83017 , RPOA_LDVP , T; Q9YN02 , RPOA_PRRS1 , T; DR Q8B912 , RPOA_PRRSB , T; Q04561 , RPOA_PRRSL , T; DR Q9WJB2 , RPOA_PRRSR , T; A0MD28 , RPOA_PRRSS , T; DR Q68772 , RPOA_SHFV , T; 3D 4N0N; 4N0O; PR PRU00985; DO PDOC51652; //