PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS51714

General information about the entry

Entry name [info]

G_BMS1

Accession [info]

PS51714

Entry type [info]

MATRIX

Date [info]

01-APR-2014 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 05-JUL-2017 INFO UPDATE.

PROSITE Doc. [info]

PDOC51714

Associated ProRule [info]

PRU01051

Name and characterization of the entry

Description [info]

Bms1-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=171;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=166;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7239447; R2=0.0133201; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12350.1943359; R2=9.0902777; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=434; H_SCORE=16295; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=284; H_SCORE=14932; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-22; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 47,-33,-24,-30,-20,-46,-14,-33,-36,-13,-36,-26,-33, 27,-23,-30,  9, -8,-18,-56,-46,-20;
/M: SY='P'; M=  0,-39,-54,-30,-20,-58,-44,-39,-48,-19,-48,-38,-39,104,-29,-30,-15,-26,-36,-68,-58,-20;
/M: SY='K'; M=-20,-30,-36,-35,-19,-24,-44, -5,-42,  9,-36,-28,-21,-13, -9,  4,-20,-23,-36,-47,-23,-17;
/M: SY='V'; M=-24,-56,-30,-58,-42,  1,-61,-39, 19,-35, 17, 12,-49,-46,-26,-36,-33,-18, 22,-38,-17,-37;
/M: SY='V'; M=-19,-60,-20,-64,-49,-16,-64,-54, 53,-44, 14, 14,-54,-44,-44,-44,-34, -9, 57,-50,-30,-49;
/M: SY='T'; M= -7,-33,  1,-40,-36,-32,-44,-42, -6,-26,-12, -5,-23,-39,-24,-32, -1, 39,  9,-49,-32,-34;
/M: SY='I'; M=-10,-57,-20,-61,-49,-16,-57,-51, 40,-40, 16, 13,-53,-41,-41,-43,-28,-14, 35,-49,-30,-47;
/M: SY='V'; M=-16,-61,-21,-63,-46,-15,-63,-52, 42,-42, 19, 15,-53,-43,-42,-42,-33, -8, 56,-49,-29,-45;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='P'; M= -6,-39,-24,-34,-27,-54,-47,-43,-44,-25,-46,-37,-36, 74,-31,-34, -9,-22,-36,-66,-55,-27;
/M: SY='L'; M=-24,-40,-38,-48,-46,-19,-33,-37, -7,-30, 16, 15,-25,-47,-29,-34,-26,-22,-11,-46,-31,-39;
/M: SY='T'; M=-11,-26,-14,-34,-28,-34,-27,  1,-30,-24,-35,-24,-13,-41,-18,-26, -7, 10,-16,-48,-20,-28;
/M: SY='N'; M=-12,  4,-49, -7, -1,-51, -8,-13,-46,  4,-48,-33, 18,-33, -4,-13,  4, -7,-32,-62,-42, -4;
/M: SY='K'; M=-19,  6,-58,  1,  2,-54,-15, -7,-56, 26,-51,-35, 15,-31, 15, 12, -8,-13,-46,-60,-43,  6;
/M: SY='V'; M= -7,-50,-20,-54,-43,-20,-52,-47, 28,-35,  8,  9,-44,-39,-36,-38,-20,  3, 34,-49,-30,-41;
/M: SY='D'; M=-16, 21,-53, 33,  5,-52,-29,-18,-53,  5,-52,-40,  9,-27, -3, -3,  4,  2,-41,-66,-46,  2;
/M: SY='P'; M=-12,-34,-47,-30,-13,-40,-47,-33,-30,-19,-19,-19,-32, 26,-20,-28, -9,-20,-24,-58,-42,-14;
/M: SY='M'; M=-24,-53,-34,-58,-44,-14,-55,-43,  3,-36,  3, 24,-46,-26,-27,-36,-31,-13, -3,-10,-23,-38;
/M: SY='E'; M=-20,  4,-51,  3,  8,-46,-34,-12,-44, -3,-36,-28,  5,-31,  0, -3, -1,-12,-35,-59,-40,  5;
/M: SY='V'; M=  7,-44,-21,-47,-38,-10,-39,-38,  3,-29, -1, -1,-39,-34,-32,-37, -5, -9,  8,-44,-23,-36;
/M: SY='L'; M=-27,-57,-32,-59,-43, -9,-63,-40, 15,-30, 35, 30,-48,-45,-16,-32,-34,-23,  5,-40,-24,-32;
/M: SY='K'; M=-15,-20,-46,-24,  3,-34,-41,-11,-30, 14,-31,-19,-14,-31, 10, -6,-11,  2,-15,-43,-18,  4;
/M: SY='K'; M=-27,-25,-45,-35,-27,-15,-44,-19,-18,  3,-15,-12,-13,-40,-14, -1,-21,-19,-20,-46,-23,-24;
/M: SY='L'; M=-27,-53,-40,-56,-41,-16,-59,-36, -2,-10, 28, 11,-43,-42,-23, -9,-32,-25, -6,-45,-26,-33;
/M: SY='M'; M=-12,-46,-35,-49,-30,-19,-49,-33, -5, -9, 17, 19,-37,-37, -8,-20,-23,-18, -6,-43,-28,-22;
/M: SY='T'; M=-12,  8,-43,  2, -6,-49,-25,-13,-44,  8,-44,-30, 17,-29, -1,  5, 12, 18,-32,-60,-38, -6;
/M: SY='C'; M=-11,-37, 27,-47,-38,-38,-46,-42,-17,-17,-26,-22,-29,-42,-25,-19, -7,-12,-18,-53,-41,-37;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-43, 26, -8,-46,-27,-23,-36,-19,-44,-34, 10,-31,-16,-29,  4, -8,-31,-67,-45,-12;
/M: SY='T'; M= -8, 14,-40, 21,  5,-48,-28,-22,-42,-11,-47,-31,  6,-27, -5,-22, 15, 30,-27,-61,-41,  0;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G'; M= -8, -3,-46,  2,  0,-44,  8,-21,-46,-13,-46,-34, -9, -1,-13,-22, -9,-19,-37,-48,-42, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M=-11,-11,-37,-10, 10,-32,-16,-16,-28, -8,-23,-16,-13,-24, -2,-17, -8, -5,-19,-39,-31,  5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V'; M=  5,-31,-13,-33,-25,-20,-30,-31, 12,-21, -5,  0,-26,-24,-22,-25, -7, 11, 23,-36,-23,-25; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='M'; M= -9,-29,-26,-34,-25,-17,-37,-12, -5,-20, -2,  6,-19,-31,-15,-22, -3,  3,  2,-39,-16,-22; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='L'; M=-21,-25,-32,-30,-19,-22,-44,-26,  0,-21,  2,  0,-18,-35,-18,-26,-20,-14,  2,-44,-27,-19; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N'; M=-21,  7,-40, -6,-11,-44,-26, -8,-33, -7,-37,-23, 26, -7,  0,-14, -5, -9,-29,-53,-35, -9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-46, -4, 25,-43,-26, -5,-43, 30,-39,-26, -1,-18, 23,  6,  3, -6,-32,-48,-34, 23; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M:         M=-23,-36,-37,-41,-39, -9,-50,-31,-11,-29, -3, -4,-24,-21,-30,-33,-21,-10, -6,-45,-22,-36;
/M: SY='N'; M=-15, 29,-49, 28, -6,-55, -5,-14,-56,-12,-58,-42, 35,-34,-11,-22, 12,  3,-45,-68,-46, -9;
/M: SY='N'; M=-10, 19,-49, 11, -7,-54, -1,-13,-57,  3,-55,-41, 30,-32, -7,-13, 15, -4,-47,-66,-44, -8;
/M:         M=-21, -7,-43,-10,-20,-41,-41,-30,-15,-12,-30,-20, -5,-19,-19,-24,-13, -4,-16,-62,-41,-22;
/M: SY='Q'; M=-10, -5,-42, -2,  2,-44,-33,-14,-37, -3,-37,-23, -3,-29, 16, -3,  8, -3,-24,-55,-36,  7;
/M: SY='N'; M=-23,-15,-39,-30,-36,-28,-22,-20,-15,-26,-29,-19,  1,-46,-26,-32,-12, -5,-17,-45,-17,-35;
/M: SY='F'; M=-23,-47,-34,-50,-46, 23,-53,-34,  0,-39, -9, -6,-45,-23,-40,-42,-19,-23, -9,-34, -6,-46;
/M: SY='N'; M=-26, -5,-40,-14,-26,-25,-38,-14,-19,-22,-26,-10,  6,-42,-17,-28,-10,  1,-18,-43,-13,-24;
/M: SY='T'; M=-11,-37,-25,-42,-37,-10,-45,-35, -4,-27,  2,  1,-28,-39,-27,-32, -2, 16,  4,-43,-19,-34;
/M: SY='V'; M= -7,-40,-32,-43,-32,-27,-47,-23, -2,-26,-10, -6,-33,-14,-27,-31,-16, -2,  5,-50,-27,-31;
/M: SY='V'; M=-11,-36, -7,-44,-36,-31,-46,-39,  3,-25,-15, -8,-28,-39,-26,-19, -5,  6,  7,-52,-34,-34;
/M:         M=-16,-41,-39,-43,-34,-14,-49,-35,-11,-19,-10,-10,-37, -2,-29,-29,-14,-20,-14,-49,-27,-32;
/M: SY='K'; M=-15, -2,-55, -4, -6,-52,-14,-17,-52, 20,-48,-35, -1,-30, -2, 16, -8, -3,-40,-59,-45, -5;
/M: SY='K'; M=-20,-30,-43,-35,-19, -6,-42,-14,-30,  2,-18,-12,-22,-37, -1,  1,-10,-17,-27,-38,-15,-13;
/M: SY='K'; M=-21,-20,-58,-28, -6,-21,-38, 10,-45, 37,-35,-27,-10,-31,  5, 21,-18,-20,-38,-46,-16, -5;
/M:         M=-13,-25,-42,-32,-18,-17,-37, -2,-28,  0,-27,-20,-15,-33,-10,  0, -1,-10,-18,-45,-15,-16;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-50,-21, -5,-50,-30, -2,-48, 19,-41,-26,  1,-28, 17, 46, -9,-13,-37,-51,-38,  4;
/M: SY='M'; M=-30,-46,-36,-52,-46,  3,-53,-33, -4,-36,  8, 14,-32,-50,-30,-36,-31,-22, -5,-13,-11,-40;
/M: SY='M'; M=-14,-39,-31,-45,-33, -7,-46,-33, -3,-17,  2, 12,-30,-38,-21,-26,-11,  2,  3,-41,-21,-30;
/M: SY='F'; M=-30,-56,-31,-59,-54, 33,-60,-36,  8,-41, 18, 11,-51,-51,-41,-42,-31,-16,  0,-27,  1,-51;
/M: SY='L'; M=-25,-55,-34,-56,-49,  1,-60,-42,  6,-36, 17,  8,-49,-24,-38,-39,-29,-16,  0,-40,-19,-45;
/M: SY='E'; M=-14,-23,-43,-22,  1,-39,-45,-28,-22,-15,-23,-16,-25, -9,-10,-25, -6, -6,-16,-56,-39, -3;
/M: SY='C'; M= -3,-53, 17,-54,-45,-35,-52,-51,-13,-38,-14,-15,-47, -6,-38,-43,-20,-19, -5,-53,-43,-44;
/M: SY='P'; M=-18, -5,-61,  5, -4,-57,-21,-22,-58, -9,-55,-40,-11, 15, -2,-10,-14,-23,-48,-64,-53, -2;
/M: SY='K'; M=  0,-23,-42,-29,-12,-42,-32,-22,-33, 18,-29,-12,-16, -6, -3,  7, -6,  2,-23,-53,-40,-10;
/M: SY='D'; M=-16, -2,-53,  2,-16,-46, -2,-27,-46,-15,-44,-22, -5,-37,-15,-12,-11, -9,-38,-58,-48,-16;
/M: SY='D'; M=-12, 33,-52, 34, 12,-57,-19, -7,-58, -6,-58,-42, 34,-29, -1,-19,  3, -9,-45,-68,-47,  6;
/M: SY='F'; M=-31,-51,-41,-51,-35, 24,-60,-21, -6,-35,  6, -1,-48,-49,-31,-38,-33,-28, -6,-21, 13,-34;
/M: SY='H'; M=-32, -4,-53,  0,-21,-22,-44,  2,-36,-24,-22,-25, -2,-43,-17,-27,-20,-23,-33,-44, -6,-19;
/M: SY='S'; M=  1,-19,-32,-27,-20,-39,-17,-25,-20,-16,-29,-16, -8,-33, -7,-25,  3, -5,-11,-54,-36,-17;
/M: SY='V'; M= -5,-56,-22,-58,-43,-15,-52,-47, 27,-35, 17, 22,-48,-38,-34,-38,-25, -9, 35,-45,-30,-40;
/M: SY='I'; M=-30,-65,-25,-70,-60, -5,-70,-55, 44,-45, 41, 25,-60,-50,-45,-45,-40,-25, 24,-45,-25,-55;
/M: SY='D'; M=-28, 52,-70, 87, 30,-60,-32,-17,-68,-15,-68,-57, 15,-28, -4,-27,-10,-20,-57,-77,-58, 18;
/M: SY='F'; M= -1,-49, -8,-54,-46,  4,-43,-30, -4,-36, -8,  1,-45,-42,-33,-42,-18,-18, -6,-27, -3,-43;
/M: SY='C'; M= 17,-49, 32,-54,-47,-30,-38,-50, -7,-36,-11,-11,-45,-37,-36,-44, -9,-13, -4,-49,-39,-46;
/M: SY='K'; M=-12,-11,-60,-21,  8,-50,-31, -9,-50, 74,-40,-30, -1,-21, 19, 37,-11,-11,-40,-59,-40,  9;
/M: SY='V'; M= -7,-58,-20,-60,-44,-18,-56,-49, 33,-38, 15, 11,-51,-40,-39,-40,-27, -8, 46,-48,-30,-42;
/M: SY='A'; M= 36,-21,  6,-27,-23,-40,-13,-32,-33,-17,-34,-26,-15,-22,-20,-30, 36,  6,-20,-54,-37,-23;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='V'; M=-22,-46,-29,-52,-45,  4,-55,-29,  7,-35,  2,  1,-39,-46,-33,-37,-21,  4,  9,-29,  3,-42;
/M: SY='V'; M=-17,-54,-21,-58,-45,-18,-60,-50, 37,-38, 13, 12,-47,-43,-38,-40,-27,  3, 44,-49,-29,-44;
/M: SY='L'; M=-25,-66, -8,-69,-59, -9,-68,-54, 26,-44, 37, 19,-58,-50,-43,-44,-36,-23, 19,-44,-26,-53;
/M: SY='F'; M=-37,-63,-37,-63,-60, 70,-63,-29, -1,-47, 18,  9,-60,-57,-47,-47,-40,-37,-11,-12, 22,-57;
/M: SY='L'; M=-20,-61,-30,-62,-51,-14,-47,-49, 15,-39, 28, 14,-51,-47,-40,-40,-33,-20, 21,-46,-28,-45;
/M: SY='I'; M=-28,-59,-28,-64,-54, -9,-63,-49, 22,-41, 22, 14,-52,-49,-39,-41,-33,-13, 11,-21,-19,-49;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-47, 35,  1,-51,-27,-24,-52,-16,-53,-42,  7, -9,-12,-26, 16,  5,-40,-69,-47, -4;
/M: SY='A'; M= 30,-31,-33,-34,-28,-43, 13,-35,-38,-19,-37,-18,-27, -8,-26,-33,  1,-13,-25,-53,-47,-27;
/M: SY='N'; M= -3,-15,-29,-26,-27,-35,-31,-24,-14,-19,-18,-13,  3,-34,-21,-27,  1, -1,  1,-56,-33,-25;
/M: SY='Q'; M=-15,-25,-45,-24,  3, -5,-41, -5,-37, -6,-29,-12,-23,-35, 27,-15,-16,-19,-30,-32,-12, 10;
/M: SY='G'; M=  3, -9,-56,-10, 12,-57, 22,-22,-59,-10,-59,-41,-13,-31, -8,-26, -5,-21,-44,-58,-53,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-30,-65,-33,-65,-54, 25,-63,-40,  8,-46, 15,  7,-58,-53,-43,-44,-40,-27, 11, -5,  2,-50;
/M: SY='D'; M=-23, 44,-61, 62, 21,-58,-26,-12,-63,-11,-63,-50, 26,-29, -2,-22,  3,-12,-52,-73,-52, 12;
/M: SY='E'; M=-10, -7,-48, -9, 22,-43,-33,-12,-40,  1,-37,-16, -9,-25,  9, -1,  9, -7,-29,-54,-40, 17;
/M: SY='W'; M=-29,-28,-53,-25,  7,-15,-47,-18,-44,-21,-41,-27,-33,-41, -7,-29,-25,-19,-34, 10,-11,  1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M=  8,-11,-47,-13,-27,-54, 43,-34,-56,-22,-57,-40, -8,-38,-29,-34,  0, -7,-43,-59,-52,-28;
/M: SY='E'; M=-21,  4,-61, 13, 46,-49,-40, -7,-47,  2,-44,-18, -9,-26, 28,-13,-13,-17,-35,-55,-45, 38;
/M: SY='Q'; M=-27,-25,-53,-28,  0,-32,-47, -2,-37,  4,-24,-17,-20,-36, 19, 17,-21,-21,-30,-37,-17,  8;
/M: SY='I'; M=-29,-61, -5,-68,-61,  4,-67,-54, 40,-50, 15, 12,-59,-53,-49,-50,-37,-24, 20,-41,-21,-60;
/M: SY='L'; M=-30,-64,-30,-65,-57, 27,-65,-42, 20,-44, 28, 16,-58,-51,-44,-44,-38,-27, 14,-30, -4,-53;
/M: SY='N'; M=-15,  7,-41, -9,-13,-49,-24, -8,-43,  5,-43,-27, 26,-32, -1, 15, 12, 19,-31,-57,-36,-10;
/M: SY='I'; M= -9,-47, -1,-55,-47,-21,-50,-50, 24,-37,  1, 14,-42,-42,-34,-41,-19,  0, 15,-47,-34,-45;
/M: SY='M'; M= -5,-48,-22,-52,-41,-17,-48,-43, 15,-30, 14, 20,-41,-37,-29,-35,-18,  2, 19,-45,-29,-37;
/M: SY='Q'; M=-14,-12,-50,-15, 13,-31,-35, -5,-45, 22,-37,-21, -7,-28, 30,  1, -2,-11,-36,-46,-26, 17;
/M: SY='A'; M= 31,-30,-30,-33,-25,-35,  0,-11,-35,-17,-29,-22,-24,-26,-21,-28,  1,-13,-22,-49,-30,-24;
/M: SY='Q'; M=-23, -3,-53, -8, 21,-47,-36, 27,-53, 13,-44,-18, 12,-33, 67,  6, -9,-12,-43,-44,-22, 35;
/M: SY='G'; M=  3,-17,-54,-27,-35,-57, 74,-37,-65,-27,-65,-47, -7,-45,-35,-37,  3,-22,-55,-60,-55,-35;
/M: SY='I'; M=-25,-61,-24,-67,-54, -8,-65,-53, 45,-43, 30, 32,-55,-47,-40,-43,-37,-18, 33,-44,-28,-50;
/M: SY='P'; M=  5,-32,-47,-27,-18,-54,-37,-35,-46,-17,-46,-36,-31, 81,-25,-28,  0,-18,-35,-66,-53,-18;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='T'; M=  6, -6,-17,-14,-14,-34,-20,-22,-23, -8,-28,-14,  3,-22, -8,-17, 31, 50, -9,-45,-25,-14; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='V'; M=-18,-45,-30,-47,-36, -7,-50,-22,  6,-32, -7, -8,-39,-16,-31,-34,-25,-14, 14,-25,  5,-33; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='V'; M=-16,-46,-19,-50,-40,-13,-51,-43, 31,-33, 15, 12,-40,-37,-33,-34,-24, -1, 32,-41,-24,-39; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='S'; M= -3,-19,-31,-21, -8,-31,-16,-24,-21,-16,-21,-16,-15,-27,-14,-23,  7, -5,-11,-47,-31,-10; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='V'; M=  4,-44,-25,-49,-33,-25,-40,-37,  8,-21, -4, 10,-38,-32,-23,-17,-16, -8, 16,-47,-34,-30;
/M: SY='V'; M=-19,-61,-21,-64,-49,-14,-64,-53, 46,-43, 20, 16,-54,-44,-43,-43,-34,-10, 52,-49,-29,-47;
/M: SY='Q'; M=-17,-28,-45,-31,-10,-30,-44,  2,-29,-10,-17,  0,-17,-17, 15,-14,-11,-15,-25,-45,-22, -1;
/M: SY='N'; M=-18, 25,-60, 25,-13,-60, 24,-19,-67,-18,-67,-50, 28,-41,-19,-28, -4,-18,-57,-69,-54,-16;
/M: SY='L'; M=-27,-67,-27,-68,-57, -4,-68,-51, 29,-41, 47, 26,-58,-48,-41,-41,-38,-24, 23,-43,-23,-50;
/M: SY='S'; M= 11,  4,-39,  7,  3,-49, -4,-21,-50,-11,-50,-37,  0,-24, -9,-24, 28, -1,-37,-62,-43, -1;
/M: SY='S'; M=  7, -8,-37,-12,  5,-47, -9,-17,-44, -4,-44,-27, -4,-26,  8,-17, 20,  9,-30,-54,-38,  5;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='V'; M= -9,-42,-28,-44,-28,-23,-50,-40,  8,-27,  6,  4,-39,-37,-26,-33,-18, -1, 14,-48,-31,-28;
/M: SY='D'; M=-22, 20,-61, 26, -1,-59,-30,-17,-59, -2,-58,-45, 19, 12, -9,-17, -8,-16,-49,-72,-52, -4;
/M:         M=-18,-35,-41,-37,-21,-27,-50,-19,-12,-24, -7, -9,-31,-15,-21,-28,-13,-19,-12,-52,-27,-21;
/M: SY='K'; M=-18,-28,-52,-34,-12,-19,-41,-18,-32, 40,-17,-15,-19,-31, -1,  6,-20,-18,-29,-47,-24,-11;
/M: SY='K'; M=-17,-18,-58,-26, -2,-31,-35,-10,-45, 56,-35,-26, -9,-26, 10, 29,-15,-15,-38,-51,-30,  0;
/M: SY='R'; M=-12,-12,-45,-19,  1,-47,-33, -7,-43, 21,-38,-22, -2,-27, 25, 28,  4,  6,-32,-50,-34,  9;
/M: SY='Q'; M=-24,-18,-49,-23, -7,-43,-44,-17,-29, -5,-27,-17, -9,-13,  3, -2,-17,-18,-25,-55,-39, -4;
/M: SY='D'; M= -6, 28,-50, 37, 14,-54,-21,-13,-56, -9,-56,-43, 18,-25, -3,-22, 10, -8,-43,-68,-47,  7;
/M: SY='T'; M=  0,-32,-28,-33,-15,-32,-41,-33, -7,-19,-11, -5,-28,-31,-17,-28, -7, 14, 10,-50,-33,-16;
/M: SY='K'; M=-18,-30,-49,-37,-14,-37,-44,-20,-24, 29,-16,-14,-20,-30, -2, 22,-20,-14,-14,-53,-35,-10;
/M: SY='K'; M=-16,-12,-57,-19, 12,-50,-34, -3,-50, 56,-40,-25, -2,-24, 38, 34,-12,-12,-40,-53,-37, 19;
/M: SY='A'; M= 24,-14,-33,-21,-11,-45, -1,-22,-43, 14,-40,-29, -7,-20, -8,-11, 22, -1,-30,-57,-39,-11;
/M: SY='I'; M=  1,-39,-21,-45,-38,-22,-40,-40,  7,-29,  3,  1,-33,-34,-30,-35,  4, -7,  3,-51,-29,-36;
/M: SY='Q'; M=-15,-14,-49,-14, 19,-43,-40, -9,-40, 13,-28,-16,-11,-28, 31, -4, -5,-12,-30,-50,-35, 22;
/M: SY='K'; M= -7,-13,-45,-20, -1,-29,-29,-11,-42, 29,-35,-23, -4,-26, 15,  3,  9, -5,-35,-50,-26,  3;
/M: SY='V'; M= -4,-39,-29,-44,-31,-22,-42,-26, -1,-22,-14,-10,-31,-35,-25,-17, -7, -6, 10,-42,-15,-29;
/M: SY='F'; M=-32,-62,-31,-64,-57, 40,-64,-39, 22,-47, 16, 11,-59,-53,-47,-47,-39,-28, 12,-26,  3,-56;
/M: SY='K'; M= -8,-11,-47,-19,  4,-35,-31,  5,-39, 14,-33,-13, -4,-27,  7, -3,  6, -7,-31,-52,-26,  3;
/M: SY='H'; M=-24, -8,-58,-20, -7,-19,-34, 28,-48, 21,-40,-30,  8,-35,  3,  2,-14,-19,-41,-46, -8, -7;
/M: SY='F'; M=-35,-44,-50,-49,-36, 12,-53,  2,-30,-21,-15,-14,-36,-48,-21, -1,-33,-32,-30, -8,  6,-31;
/M: SY='F'; M=-31,-54,-36,-56,-54, 69,-56,-24, -9,-44,  4,  1,-52,-54,-44,-45,-27,-31,-17,-13, 23,-53;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P'; M=-20,-40,-35,-38,-30, -1,-39,-26,-21,-27,-17, -5,-37,  9,-24,-28,-25,-24,-21,  1, -9,-27; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='P'; M=-11,  5,-49,  8, -2,-54,-29,-16,-53, -8,-51,-36,  9, 12,  2,-18, 10, -8,-43,-65,-45,  0;
/M: SY='E'; M=-19,  4,-63,  2, 32,-53,-16, 12,-60,  2,-57,-37,  6,-31, 23,-10, -9,-19,-46,-55,-37, 27;
/M: SY='E'; M=  5, -3,-52,  8, 29,-55,-29,-17,-51, -4,-51,-37,-17,  4,  2,-21, -3,-16,-34,-61,-50, 19;
/M: SY='K'; M=-15,-14,-60,-24, -2,-51,-19,-11,-52, 53,-44,-32, -4,-26, 10, 39,-13,-15,-42,-57,-42,  1;
/M: SY='V'; M=-19,-63,-23,-64,-49,-13,-64,-51, 39,-41, 26, 17,-54,-44,-41,-41,-34,-11, 49,-47,-27,-46;
/M: SY='F'; M=-32,-59,-36,-63,-53, 37,-60,-28,  4,-41, 23, 29,-52,-52,-34,-41,-36,-28, -5,-16, 13,-47;
/M: SY='P'; M= -8,-28,-44,-31,-21,-32,-39,-15,-36,-16,-28,-22,-19,  7, -8,-24,-12,-18,-28,-43,-18,-15;
/M: SY='L'; M=  0,-55,-24,-57,-45,-11,-47,-43,  6,-30, 30, 26,-48,-37,-29,-36,-21,-18,  4,-41,-27,-38;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='D'; M=-24, 45,-59, 75, 24,-51,-27,-14,-58,-13,-58,-48, 13,-24, -4,-23, -8,-17,-48,-65,-49, 15; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='T'; M= -1,-16,-22,-22,-15,-32,-28,-25,-13, -2,-21,-10, -7,-25,-10,-14, 11, 36,  3,-45,-27,-15; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='N'; M=  1,  1,-28, -9, -8,-38,-17,-10,-30, -5,-32,-19, 17,-25,  2,-14, 13,  2,-18,-48,-30, -6; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Q'; M= -5,  6,-34,  8,  7,-40,-23, -9,-39, -1,-38,-22,  6,-23, 21,-10, 17,  9,-30,-47,-30, 11; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-21, 29,-59, 49, 43,-51,-30, -8,-55, -4,-55,-42,  4,-21,  9,-17, -8,-17,-42,-59,-46, 30; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='A'; M= 37,-21,  6,-28,-25,-42,-12,-30,-33,-17,-35,-26,-13,-23,-21,-31, 20,  0,-19,-54,-40,-25;
/M: SY='L'; M=-13,-45,-37,-49,-46,-23,-15,-42,-15,-32,  7, -2,-35,-45,-35,-37,-14,-22,-16,-49,-33,-41;
/M: SY='N'; M=-23,  3,-43,-11, -7,-43,-31, -6,-32, -4,-32, -7, 27,-37, 18,-12, -7, -4,-21,-53,-34,  0;
/M: SY='V'; M=-18,-62,-22,-64,-48,-14,-64,-52, 40,-42, 24, 16,-54,-44,-42,-42,-34,-10, 51,-48,-28,-46;
/M: SY='M'; M=-27,-45,-33,-53,-46, -9,-54,-38,  8,-31, 32, 38,-31,-45,-24,-32,-29,-19,  1,-41,-26,-38;
/M: SY='R'; M=-25,-20,-60,-30,-15,-52,-20, -6,-53, 21,-45,-33,-10,-33,  2, 70,-18,-22,-43,-52,-43, -6;
/M: SY='R'; M=-10,-29,-39,-36,-20,-28,-39,-10,-26, -4,-27,-17,-22,-34, -1,  9,-11, -5,-19,-36,-12,-13;
/M: SY='L'; M=-32,-64,-30,-68,-58,  3,-68,-41, 28,-43, 35, 18,-57,-52,-42,-43,-38,-27, 13,-32, -3,-52;
/M: SY='C'; M= -2,-23,  1,-28,-20,-52,-19,-35,-45,-25,-47,-36,-17,-15,-23,-35, -8,-18,-35,-59,-51,-23;
/M: SY='N'; M=-18, 19,-52, 15,  4,-55, -9,-10,-55, -6,-56,-36, 26,-35,  6,-17,  1,  2,-42,-62,-44,  3;
/M: SY='Q'; M=-15,-19,-39,-26, -8,-41,-39,-14,-25,  3,-29,-14,-11,-32, 17, 14, -1,  1,-21,-49,-33,  0;
/M: SY='H'; M=-21,-14,-61,-20,  9,-36,-40, 29,-46, 25,-34,-27, -6,-30, 11,  5,-17,-21,-37,-51,-16,  7;
/M: SY='P'; M=-14,-35,-46,-36,-15,-42,-48,-30,-17,  4,-26,-16,-29, 11, -6,-14,-21,-16,-10,-57,-41,-13;
/M: SY='R'; M=-26,-14,-52,-24,-10,-44,-39, -6,-41, 19,-28,-20,  1,-34, 12, 36,-16,-16,-34,-52,-36, -2;
/M:         M=-15, -9,-50,-16, -8,-45,-16, -6,-39,-16,-45,-31, -1,-19,-13,-23, -4,-16,-33,-59,-36,-11;
/M: SY='I'; M=-30,-65,-25,-70,-60, -5,-70,-55, 43,-45, 42, 25,-60,-50,-45,-45,-40,-25, 24,-45,-25,-55;
/M: SY='H'; M= -6,-12,-38,-23,-17,-31,-30, 19,-27,-15,-33,-23,  2,-34,-10,-19,  4,  0,-21,-51,-14,-17;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='W'; M=-21,-17,-28,-23,-20,-17,-26,-11,-22,-10,-15,-12, -7,-28,-10,  0,-16,-15,-21,  3,-10,-16; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='K'; M=  5, -9,-26,-12,  4,-28,-14, -6,-26, 26,-22,-14, -4,-11, 14,  6, -1, -4,-19,-31,-22,  6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='W'; M=-24,-46,-38,-50,-45, 11,-45,-27,-23,-39,-22,-15,-35,-51,-34,-40,-30,-26,-17, 22,  4,-42;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='P'; M=-21,  5,-65, 25, -1,-55,-41,-13,-59,-19,-58,-48, -9, 39,-17,-26,-16,-26,-49,-71,-49, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51705; PS51706; PS51709; PS51710; PS51711; PS51712; PS51713; PS51715; PS51716; PS51717; PS51718; PS51719; PS51720; PS51721; PS51722

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_07 which contains 555'100 sequence entries.

Total number of hits

13 in 13 different sequences

Number of true positive hits

13 in 13 different sequences

Number of 'unknown' hits

Number of false positive hits

Number of false negative sequences

Number of 'partial' sequences

Precision (true positives / (true positives + false positives))

100.00 %

Recall (true positives / (true positives + false negatives))

100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]

protein_domain

Scaling database [info]

reversed

Author [info]

CJA_Sigrist

Taxonomic range [info]

Eukaryotes

Maximum number of repetitions [info]

Feature key [info]

DOMAIN

Feature description [info]

Bms1-type G

Version [info]

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

13 sequences

BMS1_HUMAN  (Q14692    ), BMS1_SCHPO  (O94653    ), BMS1_YEAST  (Q08965    ),

TSR1_CAEBR  (Q61WR2    ), TSR1_CAEEL  (Q19329    ), TSR1_DICDI  (Q54YA7    ), 
TSR1_DROME  (Q9VP47    ), TSR1_HUMAN  (Q2NL82    ), TSR1_MOUSE  (Q5SWD9    ), 
TSR1_PONAB  (Q5R434    ), TSR1_SCHPO  (O13956    ), TSR1_XENLA  (Q5XGY1    ), 
TSR1_YEAST  (Q07381    )

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

5IW7

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top