PROSITE entry PS51716
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | G_IRG |
| Accession [info] | PS51716 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51716 |
| Associated ProRule [info] | PRU01053 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | IRG-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=183; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=178; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4812465; R2=0.0070647; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=36671.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1419; H_SCORE=36671; N_SCORE=12.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=569; H_SCORE=36671; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-30; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='T'; M= 33,-69,-66,-65, 33, 29, 15,-23,-61,-17,-57,-12,-26, -7, -6,-14, 43, 4,-73,-57; /M: SY='P'; M=-24,-78,-64,-35, 8,-41,-60,-64, 25, -5,-58,-61, 65, 36, 49,-58, 13,-26,-70, 1; /M: SY='L'; M=-64,-70,-79,-74, 22,-82,-66, 24,-73, 65,-36,-75,-79,-23,-73,-33, 7, 14,-64, 37; /M: SY='H'; M=-64,-74, 64, -9,-74,-60, 84,-80,-10,-78,-68, 83,-69,-49,-55, -4,-54,-79,-92, -4; /M: SY='I'; M=-62,-72,-84,-79, 35,-86,-79, 74,-74, 11, -6,-76,-77,-75,-31,-70,-21, 53,-71,-51; /M: SY='A'; M= 92,-63,-67,-61,-76, 17,-69,-67,-63,-69,-63,-60,-66,-60,-68,-15,-22,-55,-76,-72; /M: SY='V'; M=-55,-69,-84,-79,-52,-86,-85, 55,-76,-13,-40,-78,-78,-77,-78,-68,-53, 89,-83,-60; /M: SY='T'; M= 41, 56,-70,-68,-62,-68,-73, 16,-66,-13, 14,-61,-69,-66,-71,-23, 64, 31,-83,-65; /M: SY='G'; M=-49,-76,-64,-76,-83,102,-71,-90,-69,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-23,-67,-84,-74,-78; /M: SY='E'; M= -7, 11, 29, 75,-76, -8,-60,-25,-22,-68,-17,-55, -5, 7,-58,-54, 23, 2,-82,-70; /M: SY='S'; M= 41,-65,-61,-59,-72,-56,-65,-64,-58,-45,-63,-52, 24,-56,-14, 68, 54,-24,-81,-68; /M: SY='G'; M=-29,-76, -7,-69,-82, 96,-68,-88,-16,-85,-74,-49,-68,-63,-16,-16,-65,-82,-75,-76; /M: SY='S'; M= 35, 35,-60,-16,-71,-57,-65,-59,-60,-66,-63,-18,-66,-56,-65, 74, 31, 21,-83,-68; /M: SY='G'; M=-49,-75,-61,-20,-82, 95,-68,-88,-22,-84,-74,-50,-67,-62,-71, 21,-63,-81,-75,-76; /I: I=-42; MD=-106; /M: SY='K'; M=-19,-78,-60,-48,-79,-72,-62,-46, 98,-75, -9, -5,-67,-46,-32,-59,-23,-23,-77,-69; D=-42; /I: I=-42; MI=-106; MD=-106; IM=-106; DM=-106; /M: SY='S'; M=-46,-67,-61,-61,-75,-55,-63,-70,-61,-74, 7,-49,-67,-54,-65, 98, 13,-24,-86,-69; D=-42; /I: I=-42; DM=-106; /M: SY='S'; M=-31,-64,-58,-59,-69,-56,-61,-65,-57,-10,-62,-47,-64,-53,-14, 89, 59,-59,-82,-65; /M: SY='F'; M=-69,-71,-86,-80, 89,-85,-71, 21,-78, 53,-39,-79,-83,-79,-76,-75,-63, 6,-55,-35; /M: SY='I'; M=-28,-73,-84,-80,-50,-86,-82, 86,-77, 2, 15,-77,-76,-74,-79,-70,-56, 54,-77,-58; /M: SY='N'; M=-61,-68, 20,-54,-77,-51,-44,-77,-49,-83,-71,119,-72,-50,-57, 3,-46,-78,-96,-72; /M: SY='A'; M= 84,-62,-66,-61,-73,-23,-69,-60,-62,-65,-60,-59,-66,-59,-67, 18, 26, 0,-78,-70; /M: SY='L'; M=-66,-71,-85,-79, 21,-86,-72, 59,-77, 65, 41,-79,-80,-72,-76,-75,-61, 0,-69,-50; /M: SY='R'; M=-66,-79,-66,-55,-66,-78,-56,-37,-11, 21,-54,-60,-76,-13,103,-62,-12,-64,-75,-61; /M: SY='G'; M=-51,-77, 15,-15,-83, 96,-67,-90,-66,-86,-76, -4,-68,-64,-74,-50,-66,-84,-76,-77; /M: SY='L'; M=-65,-70,-81,-74,-16,-84,-66, 5,-74, 77, 15,-79,-81, -1,-72,-73,-31, 6,-67, 21; /M: SY='G'; M=-38, 13, 22,-54,-79, 50, 44,-81, 33,-78,-68,-19, 10, 3, 27, 7, 1,-76,-80,-66; /M: SY='P'; M= 1,-77, 66,-47,-81,-22, 31,-77,-26,-80,-71, 49, 70,-12,-63, -1,-15,-75,-88,-70; /M: SY='G'; M=-57,-76, 45, 45,-79, 46, 11,-80,-13,-78,-71,-17,-13,-50, 24,-18, 35,-74,-83,-69; /M: SY='D'; M= 10,-79, 98, 27,-85,-10, 11,-82,-55,-80,-76,-42, 14,-11,-62,-54,-58,-77,-92,-70; /M: SY='P'; M= -2,-79, 55, 41,-80,-66,-60,-74, 10,-41,-69,-22, 74,-15,-18,-14,-10,-50,-83,-72; /M: SY='G'; M=-31,-76, 14,-37,-78, 89,-65,-85,-20,-82,-73, 3,-68,-22,-25,-50,-14,-80,-74,-10; /M: SY='A'; M= 90,-62,-66,-60,-74,-50,-68,-67,-62,-69,-63,-59,-66,-57,-66, 38,-49,-55, 27,-68; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='A'; M= 88,-64,-70,-64,-74,-19,-72,-14,-65,-65,-60,-63,-69,-62,-70,-13,-13, -2,-78,-71; D=-18; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='P'; M= 23,-81,-60, 28,-36,-27, -2,-46, -3,-50,-66,-64, 86, 17,-29, -6,-59,-70,-76,-13; D=-18; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='T'; M= 21,-65,-66,-66,-66,-69,-73, 4,-64,-39,-56,-57,-14,-66,-70, -1, 86, 30,-86,-67; D=-18; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='G'; M=-28,-77,-65,-73,-84, 90,-71,-88,-69,-86,-76,-10,-71, -4,-75, 5, -3,-82,-79,-78; D=-18; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='V'; M=-32,-73,-19, 28,-67, -3, -9,-18,-65,-16, 27, -6, -5,-62,-70, -3, 22, 51,-86,-67; D=-18; /I: I=-18; MD=-45; /M: SY='V'; M= 7, -6,-22,-36,-67,-31,-78, 30,-71,-23,-55,-67, -9,-12,-76,-10, 42, 44,-87,-69; D=-18; /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; /M: SY='E'; M=-16,-82,-17, 86,-83,-78, 24,-79, 2,-76,-19,-60,-23,-45, -4,-60, 2,-27,-86,-73; D=-18; /I: I=-18; DM=-45; /M: SY='T'; M=-32, 6,-65,-19,-72,-27,-71,-29,-24,-64, 46,-56,-67,-65,-36,-47, 94,-56,-89,-70; D=-18; /I: I=-18; DM=-45; /M: SY='T'; M= -5,-65,-30,-60,-69,-66,-66, 1,-59,-63,-10, 6, 36,-61,-67, 0, 96,-52,-85,-67; /M: SY='T'; M= 2,-17, -8, 5,-66,-68,-61,-30, 1, -5, 47,-12,-21, 23, 7, 2, 53, 6,-80,-63; /M: SY='E'; M= -6,-77, 29, 71,-78, 0,-57,-78, 26,-74,-19,-12,-62, 12, 10,-53, 14,-72, 21,-68; /M: SY='P'; M=-22,-81,-65,-17,-75,-71,-66,-19,-12,-41,-61,-65, 96, -1, 40,-59, 8, 9,-79,-72; /M: SY='T'; M= 17,-69,-11,-54,-72,-27, 7,-44, 19,-66, 21, -4,-65, 22, 30, -9, 73,-59,-81,-64; /M: SY='P'; M= 22, 12,-64, -7,-33, 2,-64,-66, 16,-67, 46,-61, 77, -4, 1, 6,-57,-27,-77,-69; /M: SY='Y'; M=-26,-79,-18,-73, 57,-77,-44,-56,-67,-52,-52,-71,-82,-65,-65,-66,-66,-61, 47,120; /M: SY='P'; M= 1,-83,-59, 23,-80,-68,-63,-72, -1,-33,-65,-63, 97, 34, 20,-57, -9,-72,-78,-73; /M: SY='H'; M= 11,-76, 36,-52,-63,-66,123,-76,-58,-43,-57,-46,-69,-11,-57, -6,-12,-74,-83, 33; /M: SY='P'; M=-64,-86,-65,-55,-80,-68, 38,-72,-28,-39,-66,-66,117,-63,-70, -5, -9,-75,-81,-75; /M: SY='H'; M= -9,-76, 34, 41,-36,-66, 54,-45, 52,-74,-66, 30, -4,-15, 4,-30, -6,-72,-82,-63; /M: SY='H'; M=-44, 19,-12,-65, 36,-26, 62,-32,-61, 29,-11,-64, 25,-61, 20,-18,-63,-59,-60, 61; /M: SY='P'; M=-37,-85,-65,-30,-78,-70,-67, 2,-20,-39,-64,-13,111,-61, 21,-61,-15,-67,-79,-75; /M: SY='N'; M=-59,-73, 55,-48,-79, -9, 28,-79, -2,-80,-70, 84,-11, 15,-17, 28,-25,-77,-90,-67; /M: SY='V'; M=-56, 15,-78,-74, -7,-26,-74,-11,-70,-16, 42,-15, 12,-72,-28,-65,-54, 82,-79, -3; /M: SY='T'; M=-59,-71,-68,-24, 10,-76,-65, 34, -4,-17, 20,-61,-71,-18, 43, -6, 48, 29,-74,-10; /M: SY='F'; M=-66,-71,-84,-79, 63,-84,-72, 39,-76, 52, 31,-78,-80,-75,-75,-72,-13, 16, 32,-43; /M: SY='W'; M=-73, 15,-97,-80, -5,-32,-92,-68,-73,-11,-67,-90,-80,-72,-76,-79,-82,-79,169, 7; /M: SY='D'; M=-21,-78, 99, -7,-68,-21,-53,-72,-56,-74,-71, -1,-69,-55,-30,-21,-57, -6,-79, 45; /I: I=-11; MD=-28; /M: SY='L'; M=-64,-72, 39,-66,-51,-26,-66,-39,-72, 66, 52,-68,-79,-67,-73,-25,-60, 18,-79,-58; D=-11; /I: I=-11; MD=-28; /M: SY='P'; M=-65, 13,-71,-61,-18,-72,-73, 1,-67,-41,-64,-73,114,-69,-77,-17,-59,-11,-79,-75; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='G'; M=-31,-76,-15,-30,-80, 87,-71,-75,-67,-78,-71,-53, -7,-65,-32, -8,-18, 5,-78,-76; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='I'; M= 37, 5,-31, 3,-61,-70,-72, 52,-67, 2, 18,-66, -8,-64,-72, 7, -1, 12,-79,-64; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='G'; M= -4,-76,-20, 3,-33, 80,-68,-42,-64,-39,-70, -5, -1,-62,-31,-23, 0,-73,-77,-73; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='T'; M=-39, 1,-24,-20,-71, 9,-67,-63,-58,-44,-63,-51,-21,-20,-18, 23, 90,-18,-86,-68; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='P'; M=-11, -6,-68,-62,-33,-40,-68,-57,-61, 7, 13,-63, 73,-22, -2, 8, 52, -4,-80,-67; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='N'; M= 2, -8, 15,-15,-76, -6,-57,-75, 21,-40,-67, 45, -7, 28, 19, 36, -3,-71,-81,-26; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='F'; M=-67, 41,-77,-73, 89,-77, 31,-50,-72, -1,-52, -9, 8,-10,-72, -3,-61, 19,-60,-37; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='P'; M= -9,-78,-14, -4,-81, -6,-61,-75, -1,-49,-67,-11, 68, 53, 5, 34, 4,-72,-80,-71; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='P'; M= 44,-73, 21,-59,-70,-31,-67, -4,-30, 6, -8,-61, 59,-61,-17, 27,-55,-34,-80,-69; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='W'; M= -6,-78, 39, 42,-74,-40, 36,-21, 32,-71,-66, 5,-66, 21,-22,-55, 11,-14, 59,-62; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='Q'; M=-14,-75, 39, 28,-76,-24,-58,-73, 23,-72, 11,-26, -1, 48, -7, -8, 45,-69,-80,-17; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='Y'; M=-69,-10,-31,-37, -9,-12, 21,-61,-66,-37,-54,-68, -9,-61,-65,-17,-65,-65,-37,120; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='F'; M= 0,-74,-80,-73, 61,-27, 10, -8,-35, 46, 12,-74, 10,-23,-72,-69,-64,-13,-63, 6; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='Q'; M=-30,-84,-56, 51,-82,-76, -1,-21, 32,-23,-67,-10, 9, 53, -9,-18,-19,-73,-84,-72; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='D'; M=-74,-91, 44, 16,-89,-82,-13,-84, 34,-34, -8,-61,-79, 44, 15,-21,-71,-46,-93,-76; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='V'; M=-20,-82,-80,-73,-72,-33,-76, 0,-73,-18, 42, 9,-85, 51,-75,-70,-66, 52,-91,-72; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='G'; M=-69,-87,-65,-14,-80, 47, -5,-88, 41,-48,-76, 37,-79, -3,-61,-63,-34,-86,-82, 17; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='F'; M=-77,-79,-38,-84, 71,-91,-75,-47,-82, 55, 8,-86,-29,-83,-38,-82,-72,-19,-67,-47; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='Y'; M= -6,-74, 38, 11,-13,-33, 35,-70, 4,-49,-64, 9, 5, -4,-28, 28, 12,-40,-71, 46; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='H'; M=-30, 11,-34, 9,-66,-74, 63, 14, 10, 0, 18, -3,-24, 20, 44,-32,-60, 4,-81,-59; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='Y'; M=-72, 28,-76,-75, 82,-79, 13,-57,-27,-50,-52,-71,-84,-69,-66,-37,-66,-61,-38,104; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='D'; M=-67,-80,110, -4,-30,-65, 8,-85,-16,-82,-80, 1,-68,-53,-61,-22,-57,-82,-98,-67; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='F'; M= 16, 35,-82,-77, 82,-76, 12,-50,-76, 4, -2,-73,-83,-77,-75, -6,-62, 18,-62, -9; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='F'; M=-69,-71,-84,-78, 91,-83,-66, 3,-76, 40,-42,-78,-83,-27,-74,-73,-63, 15,-51, 37; /M: SY='I'; M=-64,-74,-86,-82, 22,-88,-79, 86,-78, 32, 5,-78,-77,-75,-79,-74,-59, 22,-70,-52; /M: SY='I'; M=-61,-74,-81,-28,-51,-87,-81, 82,-72, 9,-38,-76,-29,-72,-18,-70,-57, 57,-78,-59; /M: SY='V'; M=-37,-70,-83,-78, 5,-84,-76, 52,-75, 27, 23,-78,-30,-74,-76,-70,-56, 68,-73, 1; /M: SY='S'; M= -4,-20,-18,-62, 8,-13,-65, 8,-62,-10,-57, -5,-26, 0,-66, 58, 48, -1,-78,-60; /M: SY='S'; M= 20, 20, 42,-54,-76, 19,-62,-73,-60,-28,-68,-49, 26,-16,-66, 70,-48,-67,-82,-70; /M: SY='E'; M= 4,-73, 16, 59,-77, 34, -1,-39,-35,-73,-67, 16,-31,-20,-30, -6, 30,-25,-82,-70; /M: SY='R'; M=-14, 43,-66,-56,-12,-41,-58,-75,-35,-72,-64,-23, 14,-12, 97,-26,-63,-32, 40,-61; /M: SY='F'; M=-69, 13,-82,-75, 99,-46,-68, -4,-74, 9, 11,-73, 20, -3,-73,-27,-63,-16,-52,-32; /M: SY='T'; M=-56,-71,-60,-55,-72, 6,-59,-68, -8,-67, 27,-51,-66, 40, 62, 3, 74,-62,-79,-64; /M: SY='E'; M= 11, -9, 17, 68,-12,-66, 8,-72, -4,-28,-64,-54,-63, 23,-32, 26, -3,-68, 11,-12; /M: SY='N'; M=-11, 31, 19,-15,-68,-38, 30, 24, 0,-26,-59, 69,-69,-56,-60,-11, 40,-38,-87,-65; /M: SY='H'; M=-30,-79, 89, 12,-80,-38, 90,-84,-54,-78,-70, 30,-22, 0,-58,-54,-59,-81,-97,-59; /M: SY='W'; M= 37,-70,-34,-71,-54,-38,-75, 46,-71, 21, 1,-71,-28,-69,-74,-60, -2, 37, 68,-22; /M: SY='D'; M= 31,-74, 42, 40, 10,-67, 15,-65, 10, -7, -5,-21,-67, 30, 3,-55,-32,-23,-77,-60; /M: SY='L'; M=-65,-72,-80,-71,-46,-84,-69, 47,-72, 72,-33,-77,-79, 38,-71,-72,-61, 3,-73,-55; /M: SY='A'; M= 75,-65,-72,-66,-65,-24,-73, 19,-67, -2,-51,-67, -8,-65,-71,-50,-21, 31,-77,-67; /M: SY='R'; M=-25, 22,-21,-50,-72,-70,-55,-70, 48,-16, 25, 27,-71, 32, 74,-32,-29,-68,-77,-63; /M: SY='E'; M= 37, 9,-48, 61,-73,-62,-58,-47, 24,-23,-63, 25,-64, 0,-53, 19, -9,-64,-78,-26; /M: SY='I'; M= 35, 57,-81,-77,-54,-76,-79, 81,-75, 16,-41,-73,-75,-72,-78,-64,-58, -4,-76,-61; /M: SY='Q'; M= -5,-74,-10,-18,-70,-19, 27,-56, 20, -4,-55, -6,-69, 77, 3,-18,-13, 29,-79,-62; /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115; /M: SY='K'; M=-11,-77, -6, 44,-74,-14,-59, -7, 54,-19,-61,-30, -6, 29, 27,-12,-58,-24,-76,-66; /I: I=-45; MD=-115; /M: SY='M'; M=-12,-76,-70,-39, 34,-73, 33,-55,-28, 0, 86,-64, 20, 41, 33,-17,-62,-58,-69, -4; D=-45; /I: I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115; /M: SY='G'; M=-57,-77, 37,-51,-79, 57, 5,-80, 34,-36,-68, 18,-68, 39, 16, 3,-59,-77,-79,-68; /M: SY='K'; M=-11,-76,-59,-12,-71,-72,-62, 36, 89,-63,-57,-54,-66, 25,-15,-58,-57,-16,-73,-64; /M: SY='P'; M= -5,-77,-24,-28, 4,-20, 32,-67, 44,-17, 11, -8, 75,-55, -6, -4,-57,-39,-75,-62; /M: SY='F'; M=-30, 53,-83,-79, 90,-81,-68,-12,-75, 14,-47,-75,-83,-79,-75,-68,-18, 27,-53, 33; /M: SY='Y'; M=-67, -5,-72,-73, 34,-78, 17,-27,-68, 1,-48,-70,-81,-64,-66,-20,-13, 3,-40,112; /M: SY='F'; M=-70, 44,-86,-82,102,-84,-70, 33,-78,-18,-47,-76,-84,-84,-77,-72,-64, 6,-50, 13; /M: SY='V'; M=-38, -3,-82,-75,-54,-83,-83, 39,-73,-40,-42,-76,-78, -6,-75,-66,-52, 93,-85,-61; /M: SY='R'; M=-65, -1,-63,-50,-74,-75, 10,-80,-13,-45,-62,-56,-74, 40,105,-30,-64,-75, 16,-60; /M: SY='S'; M=-47, -4,-56,-57,-73,-18,-61,-69,-27,-73,-66, 4, -6, -1,-61, 80, 68,-62,-84,-67; /M: SY='K'; M=-63,-77, 16, 9,-78,-70,-56,-38, 91,-76,-66, -9,-64, 5, 30,-56,-13,-72,-76,-66; /M: SY='V'; M= 27, 41,-30,-70,-12,-25,-75, 36,-21,-29, 38,-68,-74,-68,-71,-19,-26, 59,-79,-61; /M: SY='D'; M=-67,-80,109, 12,-77,-66,-53,-78,-11,-19,-74,-11,-67,-53,-60,-57,-58,-77,-91, -2; /M: SY='Q'; M=-35, 17,-20, 19,-11, 0,-59,-32,-29, -9, 6, 32,-69, 50,-11, 20, 8, 17,-79,-63; /M: SY='D'; M=-13,-77, 91, 1,-76,-66, 60,-74,-10,-13,-67,-43,-68,-51, 9, 3,-57,-36,-92,-62; /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='L'; M=-36, 13,-22,-14,-52,-79,-70, 32,-30, 57, 4,-72, -9,-65, 0, -3,-60, -1, 17,-59; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='E'; M= 3,-77, -4, 44,-72,-18, -5,-73, 1,-16,-63, 9,-11, 40, 41, 4,-21,-70,-76, 2; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='N'; M= 21,-73,-49, 41,-72,-62,-57,-22,-26,-48,-66, 74, 3,-11,-25,-12, 8,-67, 35, -9; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='E'; M=-45,-91,-66, 52,-86,-89, -2,-28,-21,-23, 32,-34,-81,-63, -5, -6, 10,-77,-97,-81; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='R'; M= -8,-91,-74,-25,-89,-84,-72,-89, 31,-53,-78,-26,-84, 9, 59,-24, 4,-84,-91,-34; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='R'; M= 7,-87, 26,-65,-84,-82, 8,-72, 13,-76, 22, -7,-84,-64, 47,-70,-71, 13,-96,-76; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='Q'; M= -9,-84, 23, 32,-83, 6,-65,-81,-31,-46,-12,-61,-15, 36, 24, 17,-65,-44,-85,-23; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='K'; M=-34,-83,-57, 36,-80, 9,-62,-83, 53,-41,-72, 26,-73,-50, 40,-24,-65,-80,-80,-10; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='P'; M= 7,-86, 11,-27,-83,-26,-70, 1, 8,-77,-69,-65, 90, -3,-13,-37,-20,-70,-83,-78; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='S'; M= -4,-74,-12,-12,-76,-12,-58,-45, 5,-31,-11,-11,-22, 48, 48, 50, -3,-68,-79,-66; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='D'; M=-23,-74, 40, 21,-68, 31,-59,-21,-12,-23,-63, 19,-16,-54, 6, 0, 28,-24,-77, 15; /M: SY='F'; M=-26, 51,-18, 3, 74,-26,-60,-55, 1, -3,-54,-65,-77, 2,-63, -6,-61,-10,-55, 53; /M: SY='N'; M=-55, 9, 45, 3,-77, -7,-55,-74,-18,-52, -5, 57,-14, 26,-34, 52, 5,-71,-86,-68; /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58; /M: SY='E'; M=-24,-78, 5, 74,-76,-36,-57,-70, 31,-29,-64,-56,-13,-16, 45,-57,-14, -8,-79,-68; /M: SY='E'; M= -6,-76, 51, 65,-81, 29,-58,-79,-19,-77,-71,-20,-27,-21, -2,-27, 29,-72,-83,-71; /M: SY='E'; M= -2,-76, 17, 47,-34,-33,-56, 1, 28,-69,-16, 41, -6, 30, 22,-16,-27,-65,-79,-66; /M: SY='V'; M= 14,-68,-32, -7, 26,-70,-70, 30,-66, -5,-50, 10,-71,-65,-70, 5, 35, 42, 24,-55; /M: SY='L'; M=-40,-71, 7,-70,-48,-23,-68, -7,-74, 73, 27,-74, 11,-69,-74,-71,-61, 12,-75,-57; /M: SY='E'; M= 5,-76, 13, 52,-74,-24, 14,-23, 36,-11,-16,-54, -6, 41,-14, -4,-15,-65,-78,-65; /M: SY='E'; M=-12,-78, 45, 67,-81,-22,-55,-76, 12,-74,-68,-28,-63, 47, 22,-23,-13,-25,-81,-69; /M: SY='I'; M= -3,-72,-79,-75,-53, -2,-74, 68,-22, 27, 45,-70,-74,-69,-73,-65, -3, 24,-75,-59; /M: SY='R'; M=-63, 8,-59, 2,-76,-39, -7,-79, 17,-49,-64,-55,-18, 16, 96,-10, -9,-73,-77,-64; /M: SY='E'; M= 8,-74, 31, 50,-75,-65,-56,-38, 32,-10, -9, 30,-11, 27,-28, 14,-55,-66,-80,-67; /M: SY='D'; M= 5, -8, 59,-11,-66, -2, 31,-70, -7,-48,-65, -3,-17, 2,-60, 18, 22,-28,-75, 39; /M: SY='C'; M= -1,117,-74,-73, -8,-73,-72, 24,-16,-57,-57,-15,-80,-71,-72, -2,-14, 20,-79, 14; /M: SY='R'; M= 10,-72,-67, -3, 9, -9, 3, 26, 7, 5, -8,-35,-72, -4, 33,-32,-23, 28,-74,-57; /M: SY='E'; M= 1,-75,-16, 57,-76,-24, -4,-38, 42,-29,-63, 6, -5, 24, 0, -3, 2,-42,-79,-67; /M: SY='N'; M=-59, 29, -7, 30,-12, 10,-55,-68, 3,-40,-63, 56,-70, 30, 27, 1,-28, -6,-76, 0; /M: SY='L'; M= -8, 31,-78,-15, 19,-80,-69,-38,-73, 75,-36,-77, -9,-69,-73,-69,-20,-11,-71,-53; /M: SY='Q'; M= -2,-77, -9, 26,-77,-20,-55,-75, 46,-28,-63,-52,-66, 61, 57, 1,-32,-71,-76,-65; /M: SY='E'; M= 14, 2, 17, 57,-72, 4,-58,-18, 11,-32, 12,-55,-66, 0, 31, -1,-58,-45,-77,-18; /M: SY='A'; M= 53,-70,-57, 29,-70, 6, 9,-34,-25,-24, 4, 19,-67, 17, -8,-21, -9,-13, 12,-31; /M: SY='G'; M=-55,-76,-60,-31,-73, 68,-61,-39, 25,-73,-24, 14,-69, 19, 35,-15,-24,-11,-74, -7; /M: SY='V'; M= 8,-10,-75,-37, -6, 0,-73, 24,-31, 28, 19,-23,-75,-23,-71,-33,-57, 53, 31,-57; /I: I=-10; MD=-26; /M: SY='K'; M= 24,-74, 2, 15,-76, 1, 13,-39, 39,-34,-65, 18, 17,-16, 9, 14, -9,-68,-80,-68; D=-10; /I: I=-10; MD=-26; /M: SY='E'; M=-18,-76, 12, 59,-23, 13,-13,-20,-32,-48,-67, 18, -1, 19,-61, 7, 22,-69,-82,-69; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='P'; M=-60,-80,-64,-56,-75, -4, 25,-40, 0,-33,-64,-61, 95, 18,-64, 18, 18,-35, 36,-68; /M: SY='R'; M=-38,-81,-59, -6,-37,-70, 26,-74, 26,-74,-64,-16, 65, 42, 67,-14,-28,-30,-77,-64; /M: SY='V'; M= -3,-69,-20,-31,-52,-80,-76, 32,-72, 23,-41,-75,-28,-71,-74,-66,-55, 76,-78, 1; /M: SY='F'; M= -3,-71,-81,-78,107,-77,-65,-29,-74, -6,-50,-22,-82,-79,-73,-25,-63,-21,-46, 30; /M: SY='L'; M= -5,-71,-81,-73, 28,-79,-68, 18,-72, 68, 29,-77, 20,-69,-26,-41,-61,-26,-69,-51; /M: SY='V'; M=-27,-69,-78,-24,-51,-82,-76, 45,-71, 43,-38,-75,-77,-70,-28,-39,-11, 63,-79,-59; /M: SY='S'; M=-48,-17,-13,-13,-34,-56,-58,-25,-15,-33,-64, 14,-66, -4, 4, 89,-43,-22,-81,-64; /M: SY='S'; M= 4, -8,-54,-57,-75,-11, 12,-45,-35,-74, -3, 57, 45, -1,-30, 63, -4,-67,-83,-68; /M: SY='W'; M=-63,-22,-67, 6, 49, 16, 25,-57,-64, 35,-52, 7,-76,-62,-12, 7,-63,-61, 85, 13; /I: I=-28; MD=-70; /M: SY='D'; M=-34,-76, 63, 45,-74,-24, 34,-73, -3, -6,-65, -3,-66,-13,-22, 21, 8,-70,-85,-25; D=-28; /I: I=-28; MD=-70; /M: SY='P'; M=-17,-84,-14, 3,-26,-82,-74,-63,-24, 32,-60,-75, 60,-69,-14,-36, 7,-38,-83,-22; D=-28; /I: I=-28; MI=0; MD=-70; IM=0; DM=-70; /M: SY='N'; M=-68,-82, 4, 3,-30, -9, 14,-78,-16, -3,-71, 34,-79, 4,-34, 26, 18,-76,-92,-73; D=-28; /I: I=-28; DM=-70; /M: SY='R'; M=-12, 18, -7,-16,-12,-77,-12,-71, 36, 13,-63, -2,-79, 5, 43,-39,-67,-71, 42,-20; D=-28; /I: I=-28; DM=-70; /M: SY='Y'; M= -8,-79,-75,-73, 67,-78, 49,-61, -2,-28,-55,-69,-82,-67,-65,-22,-67,-64,-46, 93; D=-28; /I: I=-28; DM=-70; /M: SY='D'; M= 9,-81, 96, 12,-13,-68,-60,-80,-20,-80,-78,-10, -6,-58,-65,-58,-61,-37,-93,-71; D=-28; /I: I=-28; DM=-70; /M: SY='F'; M=-71,-72,-83,-78, 98,-31,-66, 7,-75, 36,-44,-76,-83, -5,-73,-72,-65,-48,-49, 24; /M: SY='P'; M=-61,-82,-19, 16,-75,-70, 14,-12,-55,-69,-62,-63, 93, 27, 5, -2,-14, 13,-79,-32; /M: SY='L'; M=-39, 33, 9, 8,-25,-26,-60,-55, 19, 40, 30, -4,-72, 21, 6, 14,-33,-34,-77,-61; /M: SY='L'; M=-66,-71,-74,-68, 28,-79,-62,-41,-22, 73, -2, 4,-80, 20,-12,-30,-61,-47,-66, 4; /M: SY='Q'; M=-35,-76,-61, 22,-68, 18, 17,-15,-21,-16, 34,-58,-69, 51, 43,-19,-22, 19, 29,-60; /M: SY='E'; M= 20,-71, 29, 47,-11,-63,-58,-67, 15,-44, 15,-23,-64, 15, -9, 37, 4,-26,-79,-64; /M: SY='T'; M= -3,-68,-63,-31,-59,-67,-63,-56,-20,-12, -1,-19,-67,-18, -3, 24, 75, 1, 64, 23; /M: SY='L'; M=-65,-72,-19,-70,-14,-80,-68, -9,-69, 66, 54,-75, 18,-67,-13,-37,-15, -2, 55,-53; /M: SY='E'; M=-23, 10,-54, 53,-21,-40,-60, -7, -1, -5,-56, 25,-69, 35, 30,-58,-59, 22, 19,-62; /M: SY='R'; M=-41, -7, 23, 31,-74,-46, 20,-71, 25,-19, 7, 15, 17, 17, 33, 16, 9,-69,-81,-65; /M: SY='D'; M= -1, -8, 69, 58,-79,-25, -4,-71, 14,-72, 5,-49,-11, 15,-55,-21,-57, -8,-85,-68; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51705; PS51706; PS51709; PS51710; PS51711; PS51712; PS51713; PS51714; PS51715; PS51717; PS51718; PS51719; PS51720; PS51721; PS51722 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 15 in 15 different sequences |
| Number of true positive hits | 15 in 15 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | IRG-type G |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
15 sequences
IIGP1_MOUSE (Q9QZ85), IIGP5_BOVIN (Q32KW9), IIGP5_HUMAN (Q6NXR0), IIGP5_MOUSE (Q8C262), IIGP5_RAT (Q6AYF9), IRB10_MOUSE (Q0GUM3), IRGM1_MOUSE (Q60766), IRGM2_MOUSE (A0A140LIF8), IRGM3_MOUSE (Q9DCE9), IRGM_HUMAN (A1A4Y4), IRGM_RAT(Q6AYC2), IRGQ_HUMAN (Q8WZA9), IRGQ_MOUSE (Q8VIM9), TGTP1_MOUSE (Q62293), TGTP2_MOUSE (Q3T9E4)» more
|
| PDB [Detailed view] |
13 PDB
1TPZ; 1TQ2; 1TQ4; 1TQ6; 1TQD; 4LV5; 4LV8; 5FPH; 7C3K; 7VES; 7VEX; 8H4M; 8H4O » more |