PROSITE entry PS51796
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MSS4 |
| Accession [info] | PS51796 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51796 |
| Associated ProRule [info] | PRU01132 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MSS4 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6293807; R2=0.0197207; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9228.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=425; H_SCORE=9228; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=197; H_SCORE=9228; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -8, 6,-33, 4, 19,-28,-15, 1,-28, 9,-28,-18, 11,-14, 15, 14, 6, -5,-27,-30,-20, 17; /M: SY='L'; M=-14,-32,-10,-32,-25, -3,-33,-27, 15,-25, 27, 12,-31,-27,-18,-19,-18, -7, 7,-22,-12,-25; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='V'; M= -1,-24, -9,-24,-22, -9,-24,-24, 17,-16, 7, 6,-22,-18,-15,-22,-10, 0, 22,-25,-11,-16; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M= -3, 13,-18, 10, 2,-23, -4, -3,-22, -1,-31,-19, 23,-13, 0, -7, 23, 4,-22,-32,-19, 1; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M= 7, -4,-21, -8, 3,-26,-11, -7,-21, 2,-24,-16, 3,-14, 1, 10, 4, 1,-17,-32,-20, 2; /M: SY='N'; M=-15, 22,-36, 20, 25,-31,-15, 3,-30, 4,-35,-21, 27,-15, 9, -2, 4, -6,-30,-36,-21, 20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -6, 3,-26, -3,-11,-26, 31, -8,-31,-11,-34,-23, 11,-17,-11,-11, 3,-11,-26,-28,-23,-11; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='R'; M= -7,-11,-24,-16, -7,-21, -6,-10,-19, 4,-13,-13, -6,-16, -2, 16, -6, -3,-16,-24,-17, -7; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='N'; M=-14, 19,-28, 3, 3,-29,-12, 2,-29, 14,-36,-20, 38,-16, 3, 5, 10, -2,-26,-36,-20, 3; /M: SY='R'; M=-11, -9,-30,-17, -4,-25,-22, -9,-18, 11,-17,-10, -2, -6, 1, 15, -8, -9,-15,-30,-19, -4; /M: SY='K'; M= -5,-15,-17,-19, -9,-15,-22, -9, -6, 2, -7, -6,-12,-18, -5, -5, -2, -7, -6,-26,-13, -9; /M: SY='A'; M= 6, -7,-18,-10, 0,-22,-13,-12,-14, 6,-21,-13, -3,-14, -2, 1, 6, -4,-11,-30,-19, -1; /M: SY='I'; M= -6,-34, -9,-34,-28, -5,-33,-29, 23,-25, 22, 13,-34,-25,-20,-24,-22, -5, 22,-25,-11,-25; /M: SY='L'; M=-10,-23,-18,-26,-17, -3,-26,-13, -2,-12, 2, -2,-18,-24,-11, -3,-10, -3, -4,-18, -2,-16; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-33, 2, 23,-31,-20, 1,-30, 12,-25,-12, -3, 2, 33, 4, -1,-10,-23,-27,-21, 25; /M: SY='R'; M= -6, -6,-31,-10, 7,-20,-12, 1,-26, 9,-25,-18, -4,-17, 4, 15, -4,-12,-24,-26,-13, 5; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='G'; M= -7, 4,-28, 1, -7,-29, 16, -3,-32,-10,-37,-26, 10,-10, -8,-13, 6,-10,-28,-34,-22, -8; /M: SY='C'; M= 5,-14, 31,-18,-18,-20,-15,-20,-15,-14,-19,-19, -8,-18,-14,-22, 16, 7,-13,-26,-20,-18; /M: SY='R'; M= -5,-19,-23,-24,-12,-19,-24,-15, -3, 2, -5, -6,-15,-20, -5, 14,-12, -7, -2,-28,-16,-10; /M: SY='I'; M= -7,-32,-11,-32,-29, -5,-35,-29, 29,-25, 19, 16,-31,-25,-21,-27,-22, -5, 29,-25,-10,-25; /M: SY='L'; M=-17,-36,-11,-37,-30, 5,-39,-28, 24,-30, 30, 15,-36,-31,-24,-24,-26,-11, 14,-17, -6,-30; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-30, -8, 3,-30,-11, -4,-29, 11,-26,-16, 2, -2, 16, 9, -1, -5,-21,-29,-22, 6; /M: SY='P'; M= -8,-11,-27,-13, -1,-22,-20, -8,-20, -1,-22,-18, -7, 9, -4, -4, -6, -9,-16,-27,-11, -2; /M: SY='N'; M= -8, 7,-28, -1, -1,-29, 8, -3,-32, 1,-34,-19, 18,-16, 6, -3, 8, -7,-26,-31,-23, 1; /M: SY='T'; M= -9, 0,-24, -3, 0,-23,-19, -1,-18, -1,-20,-15, 6,-15, -1, -1, 1, 12,-12,-31,-15, -1; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='A'; M= 16,-12,-10,-13, -8,-20, 8,-16,-17, -4,-21,-13,-11,-10, -8, -7, 5, 0, -8,-25,-19, -8; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='E'; M=-11,-12,-20, -8, 8,-13,-24,-13, -5, -8, 2, -1,-15,-16, 0, -8,-10, -4, -8,-21,-13, 4; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-17,-28,-17, 19,-25, -5, -4,-19, -5, -4,-22,-27,-11,-19,-16,-16, -9, 19, 20,-16; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='S'; M= -2, -6,-12, -9, -7,-13,-12, -2, -8, -7,-13, -8, 2,-13, -4,-10, 9, 5, -7,-24,-10, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='R'; M=-10, -2,-29, 0, 4,-27,-19, -9,-21, 0,-18,-15, -3, -9, 5, 7, -2, -1,-19,-32,-21, 2; /M: SY='R'; M= -5, -2,-28, -2, 7,-27,-18, -6,-19, 3,-20,-13, 0,-15, 8, 9, -2, -2,-15,-31,-20, 7; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-26, -4, 9,-21,-25, -7, -6, -4,-12, -4, -5,-16, 12, -8, -6, -7, -4,-26,-16, 10; /M: SY='L'; M=-13,-24,-19,-27,-17,-13,-30,-12, 2,-10, 5, 0,-22,-14,-10, -8,-18,-10, 2,-26,-11,-16; /M: SY='N'; M=-14, 5,-27, 3, 2, -7,-17, -6,-20, -5,-24,-16, 6,-21, -5,-11, 1, -4,-21,-25, -9, -1; /M: SY='L'; M= -9,-32,-11,-33,-24, -7,-31,-26, 11,-21, 22, 10,-30,-24,-16,-12,-20, -3, 7,-24,-13,-23; /M: SY='P'; M=-10,-17,-31,-16, -5,-39,-20,-18,-30, -8,-30,-29,-18, 72, -7,-18, -9,-10,-21,-39,-29, -6; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='E'; M=-10, 8,-19, 7, 9,-16,-11, -2,-13, -2,-14, -9, 9,-11, 2, -4, -1, -4,-14,-20,-12, 6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='S'; M= 4, -8,-10, -8, -4,-17, -8,-12,-12, -1,-15,-12, -3, 0, -3, -7, 12, 5,-10,-23,-16, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='M'; M=-10,-24,-15,-25,-16, -3,-25,-16, 6,-14, 17, 28,-19,-22, -4, -8,-17, -8, 4,-16, -9,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='R'; M= -5, -9,-18,-13, -4,-10,-14, -6,-13, 0,-10, -8, -4,-14, 3, 10, 1, -1,-13,-18,-10, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='K'; M= -4, -2,-22, -5, 10,-22,-14, -4,-21, 21,-20,-11, -2, -9, 15, 13, 0, -7,-15,-21,-15, 11; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='K'; M= -7, -3,-19, -9, 0,-17,-15, -9,-13, 17,-15, -6, 1,-12, 2, 3, 1, -5, -9,-22,-14, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='D'; M= 1, 8,-12, 13, 4,-16, -2, -6,-12, -3,-18,-12, 3, -8, -1, -8, 9, 0,-11,-21,-13, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='R'; M=-11,-18,-22,-21, -7,-15,-24,-12, -7, -3, 3, -3,-14,-20, -2, 13,-11, -7,-11,-23,-14, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='S'; M= 9,-10,-12,-11, -8,-21, -4,-17,-15, -2,-21,-14, -5,-12, -7, -9, 13, 11, -7,-30,-20, -7; /M: SY='A'; M= 4, -5,-17, 0, -5,-21,-16,-17, -6,-12,-14, -5,-11,-17, -4,-16, -2, -1, -1,-33,-20, -5; /M: SY='D'; M= -9, 2,-31, 8, -2,-30, 2,-16,-22,-10,-28,-21, -7, -8, -7,-14, -5,-11,-16,-37,-25, -4; /M: SY='D'; M= -7, 11,-27, 18, 4,-29, 0, -3,-28, -8,-35,-26, 5, -8, -2,-15, 11, -6,-26,-37,-22, 0; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='N'; M= -3, 7,-14, 0, -3,-19, -8, -3,-16, -3,-21,-12, 21,-11, -3, -4, 10, 11,-13,-26,-15, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -7,-22,-16,-23,-18,-12,-25,-22, -1,-17, -4, -6,-19, 4,-15,-20, -7, 3, 1,-27,-14,-17; /M: SY='D'; M=-13, 13,-35, 20, 8,-36, -1, -9,-32, -7,-35,-26, 3, 1, 2,-14, -1,-11,-27,-39,-27, 5; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='S'; M= 1, -9,-18,-10, -9,-19, 6,-14,-19, -8,-19, -9, -2,-15, -6, -7, 9, 4,-14,-26,-20, -9; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='D'; M=-13, 20,-33, 30, 22,-31,-14, -8,-26, 3,-30,-22, 5,-14, 5, -7, 1, -4,-23,-36,-23, 15; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='P'; M= -8,-18,-18,-19,-11,-21,-21,-18, -9, -6, -7,-10,-16, 19, -9,-12, -9, 0, -4,-27,-18,-10; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='L'; M=-14,-30,-10,-32,-25, 6,-31,-23, 17,-24, 24, 12,-30,-25,-19,-20,-22, -9, 11,-14, -4,-24; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='R'; M= -6, -6,-25, -9, 4,-22,-19, -6,-17, 7,-15,-10, -3,-14, 11, 14, -1, 0,-14,-25,-17, 5; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M=-11, 13,-35, 16, 17,-32, 5, -5,-33, -3,-36,-24, 10,-16, 2, -9, 2,-11,-30,-35,-24, 11; /M: SY='F'; M=-20,-22,-23,-32,-22, 42,-27, 13, -8,-25, -8, -5,-20,-35,-20,-22,-17,-20,-15, 2, 27,-22; /M: SY='W'; M=-23,-36,-18,-43,-29, 18,-31,-16, -6,-28, -7, -9,-35,-36,-22,-28,-26,-22,-13, 50, 21,-28; /M: SY='L'; M=-12,-22,-20,-24,-15,-13,-21,-10, -4,-14, 5, 1,-19,-22, -4, -5,-15, -6, -4,-24,-13,-13; /M: SY='V'; M= -5,-32,-10,-32,-30, -7,-33,-30, 29,-23, 16, 12,-32,-23,-21,-28,-22, -3, 34,-27,-10,-23; /M: SY='N'; M=-13, 8,-30, 3, 5,-31,-17, -7,-25, 9,-30,-20, 12, 0, 1, -3, -1, -6,-20,-37,-22, 4; /M: SY='D'; M=-16, 32,-36, 48, 15,-37, -3,-11,-30,-10,-39,-29, 8,-19, -2,-19, 4, -9,-29,-46,-29, 6; /M: SY='M'; M= -8,-27,-19,-27,-21,-12,-29,-23, 7,-19, 5, 21,-23, 0,-10,-23,-17, -8, 10,-27,-15,-19; /M: SY='F'; M=-20,-33,-19,-39,-27, 32,-31,-12, -2,-27, 2, 7,-30,-36,-21,-26,-23,-19, -9, 21, 23,-27; /M: SY='D'; M= 0, 1,-19, 8, -4,-24, -8,-18,-11,-13,-20,-15, -6,-17,-10,-17, 4, 2, -9,-35,-22, -7; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /M: SY='E'; M=-14, 21,-40, 34, 39,-34,-16, -4,-30, 3,-34,-24, 4,-14, 13, -7, 0,-10,-30,-37,-24, 29; /M: SY='N'; M=-20, 30,-30, 10, 0,-30,-10, 10,-30, 0,-40,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24; /M: SY='G'; M= 4,-10,-26,-10,-17,-28, 50,-19,-36,-17,-37,-27, -9,-18,-17,-18, 4,-16,-27,-30,-28,-17; /M: SY='F'; M=-15,-30,-17,-37,-30, 41,-30,-15, 8,-27, 3, 3,-30,-35,-27,-30,-20,-15, 4, -1, 19,-27; /M: SY='S'; M= 6, -4,-10, -4, -4,-20, -7,-14,-16, -4,-23,-16, 6,-10, -4,-10, 29, 24,-13,-30,-20, -4; /M: SY='R'; M=-11, -3,-35,-13, 4,-30,-19, -4,-30, 31,-26,-20, 5,-16, 9, 38, -4, -9,-26,-31,-20, 4; /M: SY='D'; M=-13, 18,-32, 27, 11,-35,-13,-10,-28, -7,-34,-26, 6, 2, -1,-15, 3, -3,-25,-42,-27, 5; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='V'; M= 3,-20, -8,-20,-18,-10,-19,-21, 12,-14, 1, 1,-18,-16,-13,-20, -3, 1, 16,-25,-12,-14; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='G'; M= 0, 1,-24, 2, 3,-26, 8,-10,-26, -7,-29,-20, 0, -6, -4,-10, 2, -9,-21,-30,-22, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='N'; M=-11, 0,-23, -8,-11,-19, 9, -7,-27,-11,-31,-21, 11,-21, -9,-12, 1,-10,-26, -7,-14,-11; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='V'; M= -8,-18,-17,-19,-11, -9,-26,-15, 7, -7, 1, -1,-18,-19,-10,-10,-13, -7, 8,-20, -5, -9; D=-2; /I: I=-2; DM=-4; /M: SY='K'; M=-10, -2,-32,-11, 9,-30,-20, -5,-30, 39,-27,-18, 0,-12, 16, 27, -2,-10,-22,-29,-20, 10; /M: SY='Y'; M=-20,-32,-18,-35,-25, 34,-32, 0, -1,-25, 3, -1,-27,-33,-23,-23,-22,-18, -6, 9, 41,-25; /M: SY='L'; M=-18,-38,-10,-38,-30, 0,-40,-30, 24,-30, 36, 18,-38,-30,-22,-22,-28,-10, 14,-20,-10,-30; /M: SY='V'; M= -3,-32, -9,-32,-28, -7,-31,-29, 25,-23, 17, 11,-32,-23,-20,-25,-21, -4, 27,-26,-11,-23; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='A'; M= 28,-17, -7,-17,-10,-23, 4,-19,-16,-10,-24,-15,-16, -3,-10,-12, 11, -2, -7,-31,-22,-10; /M: SY='D'; M=-10, 24,-35, 38, 25,-35,-12, -8,-28, -4,-35,-25, 3,-16, 5,-13, 1, -9,-26,-42,-26, 16; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='E'; M=-12, 17,-39, 29, 35,-33,-10, -5,-31, 2,-34,-24, 2,-14, 11, -7, 0,-11,-30,-36,-24, 26; /M: M= -8,-19, -3,-24,-15,-17,-29,-17, 0, -4, -5, -7,-17,-23, -7, -3,-11,-10, -1,-23,-16,-14; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10; /M: SY='I'; M=-13,-35,-10,-35,-30, -2,-38,-30, 28,-28, 28, 15,-35,-28,-23,-25,-25, -8, 22,-22,-10,-28; /M: SY='G'; M= 0,-11,-29,-11,-21,-29, 54,-21,-35,-20,-36,-27,-11,-20,-20,-21, -1,-19,-25,-30,-29,-20; /M: SY='F'; M=-21,-33,-19,-39,-27, 31,-31, -7, -4,-27, -5, -3,-29,-36,-23,-27,-23,-21,-11, 31, 31,-27; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='H'; M= -6,-10,-21,-15, -6,-11,-19, 22,-14, -3,-19,-13, -4,-18, -2, -6, -4,-11,-11,-21, 4, -5; /M: SY='D'; M= -8, 7, 7, 13, -6,-30, -8,-18,-23,-17,-29,-26, -6,-22,-12,-26, 0, -9,-22,-36,-26,-11; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M= -3,-10,-11,-11, -7,-12,-12,-11, -2, -3, -7, -7, -9, 8, -6, -9, -3, -3, 0,-17,-11, -6; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-12,-29,-16,-30,-24,-11,-25,-26, 8,-19, 13, 4,-29,-13,-17,-19,-20, -9, 7,-26,-15,-22; /M: SY='D'; M=-10, 16,-28, 17, 11,-30,-13, -5,-26, 2,-31,-20, 16,-15, 6, -6, 9, 4,-22,-36,-23, 8; /M: SY='D'; M=-12, 15,-33, 22, 15,-32, -7, -5,-29, -3,-31,-20, 7,-15, 11, -8, 2, -3,-24,-36,-24, 12; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='K'; M= -5, -5,-25, -9, 8,-24,-17, -8,-22, 25,-20, -8, -4,-12, 11, 12, -2, -8,-15,-26,-17, 8; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M=-13, 13,-25, 8, 9,-22,-13, 6,-21, -2,-24,-14, 21,-14, 3, -3, 2, -1,-20,-29,-14, 6; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='S'; M= 5, -7, 8,-10, -8,-15, -9,-12,-12, -3,-16,-13, -3,-11, -6,-10, 12, 6, -9,-20,-15, -8; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-17,-24,-15, 24,-24, 13, -9,-16, -8, -6,-16,-25,-12,-16,-15,-16, -9, 13, 47,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='V'; M= -8,-26,-10,-27,-22, -6,-28,-24, 17,-15, 16, 10,-26,-19,-14,-18,-19, -4, 18,-21, -9,-18; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='A'; M= 21,-12, -5,-13, -8,-17, -4,-15,-10, -8,-17,-10, -7,-12, -7, -9, 12, 1, -6,-27,-17, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='L'; M= -9,-23,-16,-24,-12,-12,-25,-19, -1,-13, 9, 1,-23,-11, -9, -6,-14, -7, -4,-23,-14,-13; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M=-10, 0,-20, 3, 15,-12,-20, -7,-18, -1,-20,-15, -8,-17, 1,-10, -5,-10,-18,-22,-11, 10; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='R'; M= -5, -6,-31,-11, 4,-25,-14, -2,-25, 14,-21,-18, 2,-16, 8, 37, 1, -5,-25,-27,-18, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='V'; M= -6,-28,-12,-29,-26, -9,-31,-23, 22,-17, 11, 8,-28,-22,-17,-23,-20, -4, 26,-27, -9,-20; /M: SY='S'; M= -6, -3,-23, -2, 3,-21,-18,-12,-11, 0,-16,-12, -2,-17, -2, -5, 4, -4,-11,-31,-18, 1; /M: SY='H'; M=-13,-12,-24,-17, -8, -7,-22, 29,-16, -8,-20,-15, -5,-11, -3, -9, -9,-13,-13,-17, 15, -7; /M: SY='D'; M=-15, 10,-32, 15, 13,-28,-14, -9,-22, -3,-23,-17, 3,-18, 1, -9, -4, -9,-22,-35,-22, 7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51797 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MSS4 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
DSS4_YEAST (P32601), MSS4_CAEEL (Q9U1X4), MSS4_DROME (Q9VLP3), MSS4_HUMAN (P47224), MSS4_MOUSE (Q91X96), MSS4_RAT(Q08326), MSS4_SCHPO (O43057)» more
|
| PDB [Detailed view] |
3 PDB
1FWQ; 1HXR; 2FU5 |