ID   DEUBAD; MATRIX.
AC   PS51916;
DT   22-APR-2020 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   DEUBAD (DEUBiquitinase ADaptor) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=112;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7036135; R2=0.0060760; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15208.1884766; R2=8.6523972; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1366; H_SCORE=27027; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=790; H_SCORE=22044; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='P'; M=1,-43,-13,-12,-30,-3,7,-24,-21,-29,-18,-25,80,11,-2,5,-7,-21,-41,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-38,22,4,-16,0,2,-18,4,-19,-12,8,8,38,4,1,0,-22,-39,-2;
MA   /M: SY='S'; M=14,-34,19,18,-35,17,-7,-35,-1,-39,-32,7,-11,6,-5,41,-11,-26,-44,-31;
MA   /M: SY='P'; M=4,-38,-24,-16,-15,-5,-30,8,-8,18,0,-23,44,12,2,-13,-10,6,-39,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-1,28,-1,-5,4,-11,-20,3,-10,21,-7,-15,-9,-3,0,-4,-3,-5,-34,10;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='P'; M=4,24,25,5,-26,-26,-6,-19,-9,-25,-25,1,41,23,-15,2,-3,11,-46,-31;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-20,14,-6,-19,8,11,-18,-1,-8,-17,28,17,3,-14,16,-5,-16,-40,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-18,-15,-12,-3,-23,-24,30,-27,2,-7,-23,24,-17,-34,-4,7,35,-41,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-37,61,6,-39,-2,-11,-10,-15,-26,-31,38,-24,-10,-17,17,-3,-17,-53,-32;
MA   /M: SY='L'; M=-28,-33,-48,-40,29,-48,-31,11,-40,64,21,-45,-46,-29,-38,-39,-26,-2,-30,-11;
MA   /M: SY='S'; M=12,-33,-16,-7,-21,3,-12,-31,22,-27,-27,21,-17,4,15,29,15,-14,-13,-28;
MA   /M: SY='D'; M=7,-38,60,37,-44,-8,-7,-41,0,-37,-35,5,-23,3,-11,10,-4,-31,-50,-33;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-44,-39,4,-30,-41,44,-37,19,4,-37,-31,-36,-39,-16,-12,47,-40,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-29,-34,-48,-42,22,-49,-36,37,-41,54,18,-43,-44,-36,-40,-38,-21,18,-33,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,2,-19,-37,-20,-6,-26,6,-37,-29,50,-18,-11,-6,39,37,-28,-50,-31;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='P'; M=3,-39,-30,-10,11,-18,-27,-8,-1,-1,5,-17,62,-5,-9,-1,-7,-9,-34,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-40,45,55,-36,-30,14,-38,-4,-39,-34,-4,-4,18,-6,13,-4,-37,-47,-31;
MA   /M: SY='T'; M=19,-29,-13,-9,-25,-18,-11,-6,-12,-16,-21,30,-30,-8,-19,9,44,14,-47,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-39,-51,-41,38,-43,-42,16,-38,28,9,-45,-43,-37,-39,-36,-19,21,105,-3;
MA   /M: SY='N'; M=5,-35,7,6,-27,-10,0,-3,-5,-19,6,30,-31,28,6,17,0,-10,10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,10,16,-38,-17,-5,-24,-2,-21,3,6,54,1,-6,22,-2,-23,-45,-32;
MA   /M: SY='L'; M=-20,32,-42,-32,1,-44,8,24,-36,46,9,-36,-42,-18,-36,-20,-7,19,-37,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-34,-39,-19,7,-35,-31,7,-30,50,15,-29,23,-24,-35,-12,-14,7,-36,-19;
MA   /I: I=-22; MD=-55;
MA   /M: SY='T'; M=4,-38,3,-8,-28,-16,-18,-37,-7,-31,-34,19,-28,-8,5,21,29,-23,-52,-35; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-30,26,32,-49,-24,-19,-41,8,-39,-39,-13,56,-8,-13,-15,-23,-43,-50,-33; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-55;
MA   /M: SY='E'; M=0,-39,40,46,-35,-13,10,-36,6,-29,-32,10,-7,16,-11,10,-8,-35,-46,-31;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,4,30,2,-37,17,5,-19,6,1,5,-34,12,-20,-20,-16,16,-35,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-13,-24,5,-36,-31,-13,-16,20,-12,4,-20,-17,55,46,-12,-23,0,-39,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-39,13,33,-18,-26,11,-33,14,-17,-18,0,-23,42,13,2,-11,-25,-38,0;
MA   /M: SY='R'; M=4,-40,-8,17,-18,-24,33,-32,20,-30,-18,-4,-31,43,44,-1,-13,-33,-39,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-26,-33,-47,-40,-5,-49,-33,19,-41,68,10,-38,-46,-34,-39,-39,-25,5,-35,-17;
MA   /M: SY='M'; M=11,-17,-34,-16,13,-31,-28,14,-10,25,41,-22,-36,10,-21,-2,1,5,-35,-14;
MA   /M: SY='P'; M=4,-14,-8,5,-43,-28,-23,-34,22,-31,-13,-3,64,34,0,2,-4,-27,-41,-34;
MA   /M: SY='H'; M=-25,-37,-27,-31,47,-40,70,-15,-21,28,3,-17,-41,-20,-23,-25,-15,-20,-22,43;
MA   /M: SY='L'; M=-27,-32,-48,-40,4,-49,-32,9,-41,69,15,-46,-47,-34,-38,-40,-26,-1,-34,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-25,-55,-30,-19,-49,-31,-33,-37,-26,-43,-33,-36,111,-30,-39,-27,-22,-41,-42,-46;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-40,30,36,-44,-24,-6,-38,-2,-36,-32,7,48,21,-14,13,7,-31,-46,-34;
MA   /M: SY='G'; M=-8,9,6,12,16,25,-18,2,-25,-4,14,-2,-26,-5,-17,-10,-4,6,-37,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-5,-29,50,20,-38,-9,14,-21,-17,-16,-28,-7,37,4,-27,0,2,-17,-48,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,5,23,-39,-13,4,-26,0,-28,-21,-3,33,30,22,6,6,-19,1,-30;
MA   /I: I=-20; MD=-51;
MA   /M: SY='N'; M=-17,-34,1,-10,-40,-50,-20,-8,-32,-7,-34,5,-7,-19,-46,-27,-14,-9,-63,-45; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-55,6,19,-53,-19,-15,-45,-18,-37,-32,-16,14,-11,-24,-15,-28,-34,-58,-23; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='N'; M=-11,-48,11,12,-52,-13,-3,-49,4,-45,-41,18,9,5,-9,-1,3,-45,-56,-42; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-19,1,-16,5,-31,-30,-23,11,-10,-19,-13,3,12,-20,10,28,-14,-15,-14; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='P'; M=8,-19,-12,21,-26,-25,-25,-14,-7,-7,-15,0,46,23,-6,6,-2,-6,-41,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-25,27,46,-40,-17,-2,-35,8,-20,-21,-3,-11,28,11,-4,2,-22,-44,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-20,18,31,-34,-19,-14,-14,-14,-10,-1,10,-8,12,-13,14,29,-5,-46,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-25,-33,-43,-38,-2,-37,-34,30,-36,48,21,-31,-20,-32,-25,-10,-8,26,-38,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-13,-4,16,-36,-24,5,-19,26,-14,2,4,-9,29,40,4,-6,-24,-41,-27;
MA   /M: SY='E'; M=9,-9,12,40,-39,-18,-6,-36,1,-28,-5,-4,-15,24,3,24,12,-30,-43,-24;
MA   /M: SY='T'; M=3,-17,-33,-31,-2,-36,2,6,-30,33,26,-7,-35,-22,-32,-6,37,12,-41,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-22,-33,-47,-41,50,-47,-24,24,-38,43,7,-41,-45,-38,-23,-35,-21,27,-27,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-36,5,6,-38,-11,20,-24,2,-29,-18,31,-31,28,34,24,12,-28,-45,-27;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,6,-19,-38,-8,-18,-36,-18,-36,-32,51,-22,-14,-24,61,13,-31,-50,-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-45,-18,17,16,-31,-7,-16,-23,-27,-18,-10,84,-7,-31,-5,-21,-27,-36,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-17,-23,-14,2,17,-31,31,-26,5,-29,-14,13,2,78,-3,-13,-20,-34,-33,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-38,-35,-50,-46,97,-46,-30,-9,-41,3,-13,-40,-49,-50,-39,-37,-31,-17,23,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-40,-18,-8,-39,19,-2,-25,20,-26,-25,-1,-14,49,36,-7,1,-24,-14,-20;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-39,7,17,-44,-26,20,-39,-2,-37,-26,27,-29,71,7,21,-3,-33,-43,-27;
MA   /M: SY='P'; M=46,-21,-4,-19,-42,-5,-27,-33,-22,-36,-28,9,50,8,-29,15,4,-23,-43,-36;
MA   /M: SY='L'; M=-1,35,-46,-39,5,-44,-36,22,-39,46,19,-41,-43,-35,-38,-32,-19,29,-37,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-20,14,11,-37,-7,4,-33,6,-15,-12,16,-30,29,17,25,-2,-22,-44,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-20,-6,3,-21,-25,-14,-7,4,-10,26,-17,-30,19,6,33,19,-9,-16,1;
MA   /M: SY='F'; M=-30,-37,-51,-44,82,-45,-33,-7,-40,25,-10,-43,-48,-44,-38,-38,-31,-13,78,22;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-12,7,-9,-1,12,9,-36,-5,-31,-20,-4,-31,40,4,38,13,-32,4,-5;
MA   /M: SY='H'; M=6,-36,9,25,-34,-21,38,-31,5,-23,-6,16,-29,26,4,17,6,-23,-42,1;
MA   /M: SY='A'; M=53,-30,-10,-16,-33,-14,-7,-25,-4,-1,-8,-3,-32,1,19,-6,-14,-12,-40,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-30,-33,-48,-41,14,-49,-33,17,-41,67,11,-46,-47,-35,-39,-40,-26,2,-33,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=8,10,-19,9,-41,-17,12,-38,18,-30,-20,4,-31,56,33,17,-19,-30,-41,-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,-31,23,20,-39,4,-23,-35,-18,-36,-12,8,-26,-5,-25,47,35,-28,-47,-31;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-40,-22,-37,-46,85,-33,-53,-32,-49,-38,-10,-22,-23,-39,-9,-30,-46,-37,-41;
MA   /I: I=-42; MD=-106;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-42,1,22,-18,-26,25,-15,-6,-3,-8,9,-34,57,-5,-14,-16,-14,-42,-17; D=-42;
MA   /I: I=-42; MD=-106;
MA   /M: SY='F'; M=-17,17,-47,-42,47,-24,-7,-7,-41,43,14,-41,-48,-38,-39,-27,-25,-14,-25,21; D=-42;
MA   /I: I=-42; MI=-106; IM=-106; DM=-106;
MA   /M: SY='G'; M=8,-37,28,-5,-42,42,14,-40,-18,-36,-31,17,-17,11,4,3,9,-29,-45,-32;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-45,-16,-14,-39,-10,-20,-19,-21,-15,-3,-3,91,-14,-23,-10,-9,-24,-43,-38;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-36,35,24,-26,-31,-26,0,-12,19,-6,-18,-23,-4,-13,9,-14,20,-45,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-20,-43,-38,14,-41,-34,31,-35,28,45,-13,-40,-24,-36,-12,-10,28,52,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-20,-20,-2,-32,-20,-9,-15,-1,0,-7,-5,-20,37,10,27,3,1,-41,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-23,-19,16,-40,4,10,-29,7,-10,-22,-7,-22,69,12,9,-17,-23,-39,-26;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-34,-32,-29,61,-40,-15,-4,-23,28,27,-34,-42,-6,-22,-18,-17,-5,12,24;
MA   /M: SY='G'; M=1,-39,0,-1,-42,53,-5,-44,14,-38,-32,13,-23,-8,28,-7,-21,-35,-9,-33;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-10,-33,-1,-2,-41,-16,12,-9,41,22,-16,-29,17,-6,-25,-19,8,-36,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,29,23,-31,19,-7,-30,-11,-10,-28,13,36,1,-23,3,-17,-25,-45,-33;
MA   /M: SY='P'; M=11,17,15,18,-25,-28,-2,-5,-14,-5,4,-14,39,-7,-7,1,-7,-4,-43,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-8,27,36,-19,-2,-20,-35,4,-24,8,4,-13,-7,20,15,-9,-29,-41,-11;
MA   /M: SY='A'; M=32,-4,-25,4,-6,-11,-26,-14,31,-19,-3,-2,-32,-12,12,-10,-8,3,-36,-8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-22,-3,-2,4,9,-17,0,-12,-11,-13,-12,-18,-13,-1,9,1,17,-37,-6;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-40,-2,16,-29,-18,-25,-32,11,-5,-7,0,-34,30,9,3,4,-25,-44,-23; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='A'; M=31,-42,-24,-12,-21,-25,-32,-39,9,-22,-32,-23,-18,-6,18,-7,-15,-33,-43,-3; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='A'; M=29,-27,-21,-30,-52,-25,-25,-42,11,-42,-29,-15,-24,-14,26,-26,-14,-39,-54,-44; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-54,-13,-2,-30,-24,-26,-37,-17,-13,-27,18,-51,3,-4,-26,-29,-35,-54,-11; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-21,-60,-39,-27,-43,-47,16,-52,-6,-39,-44,-28,-43,-10,-14,-12,-10,-40,-52,21; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-44,-12,-31,-6,50,24,-43,-31,-35,-25,-2,-41,-32,-39,9,-30,-27,-42,1; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-38,42,3,-13,16,2,-36,14,-24,-22,20,-31,7,7,17,-10,-24,-16,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-13,-20,-39,-19,12,-36,-20,24,-31,31,29,-34,-39,7,-22,-9,-10,34,-36,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-25,38,42,-37,-25,-12,-18,13,-10,-25,4,-29,24,13,-13,-14,-12,-44,-23;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,5,10,-24,-8,-16,-34,4,-22,-27,-3,25,12,13,14,-3,-26,-11,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-27,-39,-44,-39,77,-41,1,-11,-25,-5,-12,-36,-45,-37,-16,-20,-21,-16,76,52;
MA   /M: SY='H'; M=9,-11,-33,-22,-3,-32,33,-2,21,28,-5,-27,-37,-8,-12,-19,-12,11,6,9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-10,5,25,-22,-30,12,-28,27,-25,-26,12,-22,17,27,8,5,-18,-40,-8;
MA   /M: SY='A'; M=43,-17,-4,7,-40,-9,1,-35,21,-31,-18,-5,-21,12,9,16,-13,-24,-41,-31;
MA   /M: SY='M'; M=-22,-22,-39,-14,7,-44,11,32,-16,40,45,-18,-30,-28,-32,-33,-20,5,23,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-37,-17,27,26,-28,-24,0,-8,1,-8,-25,-32,42,-17,-10,3,9,-7,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-40,14,52,-42,-21,-4,-27,31,-34,-30,7,-18,19,13,-4,-4,-30,-43,-31;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-21,11,28,-37,-11,0,-33,2,-20,-3,7,0,37,-4,20,0,-24,1,-20;
MA   /M: SY='V'; M=11,-34,-6,11,16,-20,-18,9,-15,11,-11,-19,-27,-15,-29,7,-6,20,-11,8;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-39,3,1,-18,-8,-9,-11,18,-8,-10,7,-14,3,-2,6,6,-12,76,4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-38,15,13,-38,27,-8,-17,17,-17,-26,10,-17,21,-1,12,-5,-17,-42,-31;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-16,-5,20,-33,-7,-7,-8,15,-6,2,7,-8,28,-5,16,0,-17,7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-22,2,11,-32,-7,1,-40,41,-37,-15,-9,-22,21,42,7,-4,-35,-16,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-39,26,27,-29,0,-4,-24,12,-11,-26,7,-10,32,0,10,-2,-24,-13,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,12,22,-31,-2,-12,-33,20,-23,-21,7,6,11,20,11,6,-14,-43,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=27(27); /POSITIVE=27(27); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=DEUBAD;
CC   /VERSION=2;
DR   Q6GN67    , ADM1A_XENLA, T; Q7ZXD6    , ADM1B_XENLA, T;
DR   A1L5A6    , ADRM1_BOVIN, T; Q09289    , ADRM1_CAEEL, T;
DR   Q98SH3    , ADRM1_CHICK, T; Q6NZ09    , ADRM1_DANRE, T;
DR   Q556N5    , ADRM1_DICDI, T; Q7K2G1    , ADRM1_DROME, T;
DR   Q16186    , ADRM1_HUMAN, T; Q9JKV1    , ADRM1_MOUSE, T;
DR   Q9JMB5    , ADRM1_RAT  , T; Q6P877    , ADRM1_XENTR, T;
DR   Q8IXJ9    , ASXL1_HUMAN, T; P59598    , ASXL1_MOUSE, T;
DR   Q5ZM88    , ASXL2_CHICK, T; Q76L83    , ASXL2_HUMAN, T;
DR   Q8BZ32    , ASXL2_MOUSE, T; Q9C0F0    , ASXL3_HUMAN, T;
DR   Q8C4A5    , ASXL3_MOUSE, T; Q9V727    , ASX_DROME  , T;
DR   Q8W4H1    , GAT26_ARATH, T; Q5PP38    , GAT27_ARATH, T;
DR   Q6P4R8    , NFRKB_HUMAN, T; Q6PIJ4    , NFRKB_MOUSE, T;
DR   Q6P4L9    , NFRKB_XENTR, T; Q9Y7Y6    , RP13A_SCHPO, T;
DR   O48726    , RPN13_ARATH, T;
3D   2KQZ; 2KR0; 2L5V; 2MKZ; 4UEL; 4UEM; 4UF5; 4UF6; 4WLP; 4WLQ; 4WLR; 6CGA;
3D   6HGC; 8H1T; 8SVF;
PR   PRU01264;
DO   PDOC51916;
//