ID   HTH_ARAC_FAMILY_1; PATTERN.
AC   PS00041;
DT   01-APR-1990 CREATED; 01-APR-2006 DATA UPDATE; 13-SEP-2023 INFO UPDATE.
DE   Bacterial regulatory proteins, araC family signature.
PA   [KRQ]-[LIVMA]-x(2)-[GSTALIV]-{FYWPGDN}-x(2)-[LIVMSA]-x(4,9)-[LIVMF]-x-
PA   {PLH}-[LIVMSTA]-[GSTACIL]-{GPK}-{F}-x-[GANQRF]-[LIVMFY]-x(4,5)-[LFY]-
PA   x(3)-[FYIVA]-{FYWHCM}-{PGVI}-x(2)-[GSADENQKR]-x-[NSTAPKL]-[PARL].
NR   /RELEASE=2023_04,570157;
NR   /TOTAL=326(324); /POSITIVE=217(215); /UNKNOWN=1(1); /FALSE_POS=108(108);
NR   /FALSE_NEG=47; /PARTIAL=0;
CC   /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=2;
CC   /VERSION=2;
DR   P43463    , AARP_PROST , T; P19219    , ADAA_BACSU , T;
DR   P06134    , ADA_ECOLI  , T; P26189    , ADA_SALTY  , T;
DR   P33234    , ADIY_ECOLI , T; P43464    , AGGR_ECOLX , T;
DR   P9WJW2    , ALKA_MYCTO , T; P9WJW3    , ALKA_MYCTU , T;
DR   O31249    , ALKR_ACIAD , T; Q84BZ4    , ANDR_BURCE , T;
DR   P05052    , APPY_ECOLI , T; Q03320    , ARACL_STRAT, T;
DR   P35319    , ARACL_STRLI, T; P11765    , ARAC_CITFR , T;
DR   P07642    , ARAC_DICCH , T; P0A9E1    , ARAC_ECO57 , T;
DR   P0A9E0    , ARAC_ECOLI , T; P03022    , ARAC_SALTY , T;
DR   G3XCU2    , ARGR_PSEAE , T; P40408    , BTR_BACSU  , T;
DR   P26950    , CAF1R_YERPE, T; Q9HTH5    , CDHR_PSEAE , T;
DR   P25393    , CFAD_ECOLX , T; P17410    , CHBR_ECOLI , T;
DR   P43460    , CSVR_ECOLX , T; P10805    , ENVY_ECOLI , T;
DR   P36547    , EUTR_ECOLI , T; Q9ZFU7    , EUTR_SALTY , T;
DR   P26993    , EXSA_PSEAE , T; P23774    , FAPR_ECOLX , T;
DR   P63202    , GADW_ECO57 , T; Q8FCI7    , GADW_ECOL6 , T;
DR   P63201    , GADW_ECOLI , T; P63203    , GADW_SHIFL , T;
DR   Q9EYV5    , GADX_ECO27 , T; P58230    , GADX_ECO57 , T;
DR   Q8FCI6    , GADX_ECOL6 , T; P37639    , GADX_ECOLI , T;
DR   Q83PR0    , GADX_SHIFL , T; A0A0H2ZIC3, GBDR_PSEAB , T;
DR   Q9HTI4    , GBDR_PSEAE , T; O87389    , GLXA_RHIME , T;
DR   E1WAC0    , HILD_SALTS , T; P0CL08    , HILD_SALTY , T;
DR   P31778    , HRPB_RALN1 , T; P69342    , INVF_SALTI , T;
DR   P69343    , INVF_SALTY , T; O33813    , LACR_STAXY , T;
DR   P28808    , LCRF_YERPE , T; Q51872    , LUMQ_PHOLE , T;
DR   P0ACH6    , MARA_ECO57 , T; P0ACH5    , MARA_ECOLI , T;
DR   P0A2S6    , MARA_SALEN , T; P0A2S5    , MARA_SALTI , T;
DR   P0A2S4    , MARA_SALTY , T; P0ACH7    , MARA_SHIFL , T;
DR   P0ACH9    , MELR_ECOL6 , T; P0ACH8    , MELR_ECOLI , T;
DR   P28809    , MMSR_PSEAE , T; Q00753    , MSMR_STRMU , T;
DR   P0A2S7    , MXIE_SHIFL , T; P0A2S8    , MXIE_SHISO , T;
DR   P76241    , NIMR_ECOLI , T; B1Q2A8    , NPHR_RHOSO , T;
DR   P40883    , PCHR_PSEAE , T; P43459    , PERA_ECO27 , T;
DR   T2KMF4    , PLH4_FORAG , T; Q05587    , POCR_SALTY , T;
DR   Q52620    , PQRA_PROVU , T; P43465    , RAFR_PEDPE , T;
DR   Q48413    , RAMA_KLEPN , T; A7ML57    , RHAR_CROS8 , T;
DR   A7ZUB8    , RHAR_ECO24 , T; Q8X7B3    , RHAR_ECO57 , T;
DR   C5A074    , RHAR_ECOBW , T; A8A710    , RHAR_ECOHS , T;
DR   A1AI83    , RHAR_ECOK1 , T; Q0TAF7    , RHAR_ECOL5 , T;
DR   Q8FBD7    , RHAR_ECOL6 , T; P09378    , RHAR_ECOLI , T;
DR   Q1R413    , RHAR_ECOUT , T; A4WG90    , RHAR_ENT38 , T;
DR   A6TGB0    , RHAR_KLEP7 , T; Q65Q30    , RHAR_MANSM , T;
DR   B5F0N0    , RHAR_SALA4 , T; A9MI63    , RHAR_SALAR , T;
DR   Q57HG7    , RHAR_SALCH , T; B5FPP6    , RHAR_SALDC , T;
DR   B5QWY5    , RHAR_SALEP , T; B4TBY4    , RHAR_SALHS , T;
DR   B4SZZ4    , RHAR_SALNS , T; Q5PKG1    , RHAR_SALPA , T;
DR   A9MZC9    , RHAR_SALPB , T; B5BJG9    , RHAR_SALPK , T;
DR   B4TPR0    , RHAR_SALSV , T; Q8Z2V5    , RHAR_SALTI , T;
DR   P40865    , RHAR_SALTY , T; Q31U83    , RHAR_SHIBS , T;
DR   Q32A71    , RHAR_SHIDS , T; Q0SZ96    , RHAR_SHIF8 , T;
DR   Q83PD9    , RHAR_SHIFL , T; A7FN79    , RHAR_YERP3 , T;
DR   Q1C0W2    , RHAR_YERPA , T; B2K1W6    , RHAR_YERPB , T;
DR   Q8ZIZ9    , RHAR_YERPE , T; A9QYR6    , RHAR_YERPG , T;
DR   Q1CEB6    , RHAR_YERPN , T; A4TRS7    , RHAR_YERPP , T;
DR   Q66FF1    , RHAR_YERPS , T; B1JNC4    , RHAR_YERPY , T;
DR   A8AL27    , RHAS_CITK8 , T; A7ZUB7    , RHAS_ECO24 , T;
DR   B7UNM6    , RHAS_ECO27 , T; B7MI37    , RHAS_ECO45 , T;
DR   B7L9G1    , RHAS_ECO55 , T; Q8X897    , RHAS_ECO57 , T;
DR   B5YZ43    , RHAS_ECO5E , T; B7NUA1    , RHAS_ECO7I , T;
DR   B7N2P7    , RHAS_ECO81 , T; B7M6V7    , RHAS_ECO8A , T;
DR   C5A073    , RHAS_ECOBW , T; B1XB72    , RHAS_ECODH , T;
DR   A8A709    , RHAS_ECOHS , T; A1AI82    , RHAS_ECOK1 , T;
DR   Q0TAF8    , RHAS_ECOL5 , T; Q8CXW5    , RHAS_ECOL6 , T;
DR   B1IVH3    , RHAS_ECOLC , T; P09377    , RHAS_ECOLI , T;
DR   B7NFK3    , RHAS_ECOLU , T; B6I4P8    , RHAS_ECOSE , T;
DR   B1LMU6    , RHAS_ECOSM , T; Q1R414    , RHAS_ECOUT , T;
DR   A4WG91    , RHAS_ENT38 , T; B5XZ49    , RHAS_KLEP3 , T;
DR   A6TGA9    , RHAS_KLEP7 , T; Q6DA22    , RHAS_PECAS , T;
DR   C6DJR4    , RHAS_PECCP , T; B5F0M9    , RHAS_SALA4 , T;
DR   A9MI64    , RHAS_SALAR , T; Q57HG8    , RHAS_SALCH , T;
DR   B5FPP5    , RHAS_SALDC , T; B5QWY4    , RHAS_SALEP , T;
DR   B5RFC3    , RHAS_SALG2 , T; B4TBY3    , RHAS_SALHS , T;
DR   B4SZZ3    , RHAS_SALNS , T; Q5PKG2    , RHAS_SALPA , T;
DR   A9MZC8    , RHAS_SALPB , T; C0Q3L4    , RHAS_SALPC , T;
DR   B5BJG8    , RHAS_SALPK , T; B4TPQ9    , RHAS_SALSV , T;
DR   P0A2T0    , RHAS_SALTI , T; P0A2S9    , RHAS_SALTY , T;
DR   Q31U84    , RHAS_SHIBS , T; Q32A70    , RHAS_SHIDS , T;
DR   Q0SZ95    , RHAS_SHIF8 , T; Q83PE0    , RHAS_SHIFL , T;
DR   Q3YV71    , RHAS_SHISS , T; A7FN80    , RHAS_YERP3 , T;
DR   B2K1W5    , RHAS_YERPB , T; A9QYR8    , RHAS_YERPG , T;
DR   A4TRS8    , RHAS_YERPP , T; Q66FF2    , RHAS_YERPS , T;
DR   B1JNC5    , RHAS_YERPY , T; Q6NI56    , RIPA_CORDI , T;
DR   Q8FQS2    , RIPA_COREF , T; Q8NRR3    , RIPA_CORGL , T;
DR   P16114    , RNS_ECOLX  , T; P0ACI1    , ROB_ECO57  , T;
DR   P0ACI0    , ROB_ECOLI  , T; P0ACI2    , ROB_SHIFL  , T;
DR   Q8Z4A6    , SIRC_SALTI , T; E1WAB2    , SIRC_SALTS , T;
DR   P0CL09    , SIRC_SALTY , T; P0A9E4    , SOXS_ECO57 , T;
DR   P0A9E3    , SOXS_ECOL6 , T; P0A9E2    , SOXS_ECOLI , T;
DR   Q56143    , SOXS_SALTY , T; A5F384    , TCPN_VIBC3 , T;
DR   P0C6D6    , TCPN_VIBCH , T; P28816    , TETD_ECOLX , T;
DR   P43462    , THCR_RHOER , T; P32326    , URER_ECOLX , T;
DR   Q02458    , URER_PROMH , T; P0A2T2    , VIRF_SHIDY , T;
DR   P0A2T1    , VIRF_SHIFL , T; P0A2T3    , VIRF_SHISO , T;
DR   A1JU91    , VIRF_YERE8 , T; P0C2V5    , VIRF_YEREN , T;
DR   P0ACI5    , XYLR_ECO57 , T; P0ACI4    , XYLR_ECOL6 , T;
DR   P0ACI3    , XYLR_ECOLI , T; P45043    , XYLR_HAEIN , T;
DR   Q04710    , XYLS1_PSEPU, T; Q05092    , XYLS2_PSEPU, T;
DR   Q05335    , XYLS3_PSEPU, T; Q04713    , XYLS4_PSEPU, T;
DR   P07859    , XYLS_PSEPU , T; P45008    , Y1052_HAEIN, T;
DR   P55449    , Y4FK_SINFN , T; P43461    , YCGK_PSEVC , T;
DR   P76103    , YDCO_ECOLI , T; P96660    , YDEC_BACSU , T;
DR   P96662    , YDEE_BACSU , T; Q8X4Z9    , YDEO_ECO57 , T;
DR   Q8FHG0    , YDEO_ECOL6 , T; P76135    , YDEO_ECOLI , T;
DR   Q83RF4    , YDEO_SHIFL , T; O31522    , YESS_BACSU , T;
DR   P54722    , YFIF_BACSU , T; P31449    , YIDL_ECOLI , T;
DR   P32677    , YIJO_ECOLI , T; P40331    , YISR_BACSU , T;
DR   P43458    , YMCR_STRLA , T; O34901    , YOBQ_BACSU , T;
DR   P77396    , YPDC_ECOLI , T;
DR   Q47129    , FEAR_ECOLI , N; Q2FK47    , HPTR_STAA3 , N;
DR   Q2G1E1    , HPTR_STAA8 , N; Q2YV56    , HPTR_STAAB , N;
DR   Q5HJF7    , HPTR_STAAC , N; Q99X00    , HPTR_STAAM , N;
DR   Q7A7X9    , HPTR_STAAN , N; Q6GK93    , HPTR_STAAR , N;
DR   Q6GCQ3    , HPTR_STAAS , N; Q8NYJ9    , HPTR_STAAW , N;
DR   Q9WW32    , MTRA_NEIGO , N; P72171    , ORUR_PSEAE , N;
DR   P55922    , RAMA_ENTCL , N; P77379    , RCLR_ECOLI , N;
DR   Q6DA21    , RHAR_PECAS , N; C6DJR5    , RHAR_PECCP , N;
DR   B7LVD8    , RHAS_ESCF3 , N; Q65Q31    , RHAS_MANSM , N;
DR   B2TVP7    , RHAS_SHIB3 , N; Q1C0W1    , RHAS_YERPA , N;
DR   Q8ZJ00    , RHAS_YERPE , N; Q1CEB5    , RHAS_YERPN , N;
DR   Q9Z3Q6    , RHRA_RHIME , N; P9WMJ2    , VIRS_MYCTO , N;
DR   P9WMJ3    , VIRS_MYCTU , N; Q9I1P2    , VQSM_PSEAE , N;
DR   Q8NYT6    , Y077_STAAW , N; Q6GD21    , Y078_STAAS , N;
DR   Q5HJR8    , Y084_STAAC , N; Q7A882    , Y097_STAAN , N;
DR   Q99XB1    , Y101_STAAM , N; Q6GKK1    , Y107_STAAR , N;
DR   P9WMJ0    , Y1395_MYCTO, N; P9WMJ1    , Y1395_MYCTU, N;
DR   P68912    , Y1430_MYCBO, N; Q8CQE3    , Y165_STAES , N;
DR   P95283    , Y1931_MYCTU, N; Q5HKE0    , Y2406_STAEQ, N;
DR   P77634    , YBCM_ECOLI , N; O31449    , YBFI_BACSU , N;
DR   O31456    , YBFP_BACSU , N; P77402    , YDIP_ECOLI , N;
DR   Q936F1    , YHTH1_STAAU, N; P77601    , YKGA_ECOLI , N;
DR   P76138    , YNEL_ECOLI , N; Q46855    , YQHC_ECOLI , N;
DR   O32071    , YTDP_BACSU , N;
DR   Q9U2G5    , MRP7_CAEEL , ?;
DR   K9NBS6    , AAM_RHOER  , F; P77744    , ABGR_ECOLI , F;
DR   Q7LXU6    , AIPS_SACS2 , F; Q8H1D8    , APY4_ARATH , F;
DR   Q7VMS5    , ARGD_HAEDU , F; Q5N3D4    , AROB_SYNP6 , F;
DR   P74985    , ARSB_YEREN , F; P0CH01    , AT21A_ARATH, F;
DR   F4IK01    , AUG1_ARATH , F; Q47C02    , BIOC_DECAR , F;
DR   Q9Z0S1    , BPNT1_MOUSE, F; A2XW69    , BRE1A_ORYSI, F;
DR   Q7XU27    , BRE1A_ORYSJ, F; Q31DE8    , CBID_PROM9 , F;
DR   Q54468    , CHB_SERMA  , F; Q8ZAG5    , CORA_YERPE , F;
DR   Q66FY7    , CORA_YERPS , F; Q924C3    , ENPP1_RAT  , F;
DR   O04036    , ERD6_ARATH , F; P43712    , FABD_HAEIN , F;
DR   Q04952    , FKS3_YEAST , F; Q6FFC1    , FTSW_ACIAD , F;
DR   Q2J6U8    , GATB_FRACC , F; Q47SC0    , GATB_THEFY , F;
DR   O15303    , GRM6_HUMAN , F; Q5NCH9    , GRM6_MOUSE , F;
DR   Q863I4    , GRM6_RABIT , F; P35349    , GRM6_RAT   , F;
DR   Q31IC2    , HLDE_HYDCU , F; P57683    , KDPA_PSEAE , F;
DR   Q88FD7    , KDPA_PSEPK , F; Q883V6    , KDPA_PSESM , F;
DR   A5V2F7    , KUP1_RHIWR , F; P15911    , L2_FOWPN   , F;
DR   P75826    , LYSO_ECOLI , F; Q6TQR6    , L_CCHFI    , F;
DR   Q1KXX8    , MATK_HELAN , F; A0RK76    , MEND_BACAH , F;
DR   Q81K94    , MEND_BACAN , F; A7GU91    , MEND_BACCN , F;
DR   Q816H7    , MEND_BACCR , F; Q632I2    , MEND_BACCZ , F;
DR   Q6HC26    , MEND_BACHK , F; A9VM77    , MEND_BACMK , F;
DR   A8FGK9    , MEND_BACP2 , F; P23970    , MEND_BACSU , F;
DR   A7Z812    , MEND_BACVZ , F; Q5KVX6    , MEND_GEOKA , F;
DR   A4IS14    , MEND_GEOTN , F; Q92AY5    , MEND_LISIN , F;
DR   Q71YZ2    , MEND_LISMF , F; Q8Y6K9    , MEND_LISMO , F;
DR   A0AJC9    , MEND_LISW6 , F; Q2RYY4    , METK_SALRD , F;
DR   Q823C4    , METN_CHLCV , F; Q5JL08    , MON1_ORYSJ , F;
DR   Q6DC77    , MPRGB_DANRE, F; P65458    , MURA1_STRP1, F;
DR   P0DC44    , MURA1_STRP3, F; Q5XCX7    , MURA1_STRP6, F;
DR   P65459    , MURA1_STRP8, F; Q48UD0    , MURA1_STRPM, F;
DR   P0DC45    , MURA1_STRPQ, F; Q5NYP9    , MUTS_AROAE , F;
DR   A5DSI2    , NAR1_LODEL , F; Q3E7D0    , NAT12_ARATH, F;
DR   A5CTB2    , NHAA2_CLAM3, F; O42101    , NR5A2_CHICK, F;
DR   Q4WVN4    , NRPS8_ASPFU, F; Q8QVU9    , POL2_CNSV  , F;
DR   Q11188    , POPL1_CAEEL, F; F4J264    , PRFB3_ARATH, F;
DR   A1CHL3    , PRP28_ASPCL, F; Q4WPE9    , PRP28_ASPFU, F;
DR   A2QIL2    , PRP28_ASPNC, F; Q2UH00    , PRP28_ASPOR, F;
DR   Q0CLX0    , PRP28_ASPTN, F; A6RJA2    , PRP28_BOTFB, F;
DR   Q1DMX8    , PRP28_COCIM, F; Q5BCU6    , PRP28_EMENI, F;
DR   Q4I7F9    , PRP28_GIBZE, F; A1CX72    , PRP28_NEOFI, F;
DR   Q7SEL0    , PRP28_NEUCR, F; Q0UWC8    , PRP28_PHANO, F;
DR   A7EGG4    , PRP28_SCLS1, F; Q6FCS7    , PURA_ACIAD , F;
DR   Q7FGZ2    , RH1_ARATH  , F; O08429    , RP54_VIBAN , F;
DR   Q8NG04    , S2610_HUMAN, F; Q32LP4    , S4A10_BOVIN, F;
DR   Q6U841    , S4A10_HUMAN, F; Q5DTL9    , S4A10_MOUSE, F;
DR   Q80ZA5    , S4A10_RAT  , F; Q99PY0    , SCTL_SHIFL , F;
DR   Q7VKC2    , SELA_HAEDU , F; Q9H3S1    , SEM4A_HUMAN, F;
DR   Q62179    , SEM4B_MOUSE, F; Q8PJE5    , SYFB_XANAC , F;
DR   Q73Y21    , SYG_MYCPA  , F; Q5YZT7    , SYG_NOCFA  , F;
DR   O75005    , SYV_SCHPO  , F; Q2T4P1    , THAQ_BURTA , F;
DR   Q5I2M5    , TLR9_BOVIN , F; Q5I2M4    , TLR9_SHEEP , F;
DR   A6NFC5    , TM235_HUMAN, F; A7S2N8    , UFL1_NEMVE , F;
DR   Q8W487    , YB95_ARATH , F; O34572    , YKOC_BACSU , F;
3D   1BL0; 1D5Y; 1U8B; 1WPK; 1XS9; 1ZGW; 2K9S; 3GBG; 3MKL; 4FE4; 4FE7; 5SUW;
3D   6XIU; 6XIV; 7BEF; 7BEG; 7VWY; 7VWZ; 7W5W; 7W5X; 7W5Y;
DO   PDOC00040;
//