ID   CUB; MATRIX.
AC   PS01180;
DT   01-NOV-1997 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   CUB domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=113;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=110;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4270475; R2=0.0141260; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6357.4711914; R2=6.2621794; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=501; H_SCORE=9495; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=360; H_SCORE=8612; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-210; MD=-210; IM=0; DM=0;
MA   /I: B1=0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-19,112,-29,-29,-20,-28,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29,-9,-9,-9,-48,-29,-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-25,-7,-12,-27,46,-15,-34,-15,-30,-19,2,-17,-13,-15,9,-10,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-28,-4,-9,-23,37,-12,-34,-12,-25,-18,2,-18,-12,-9,0,-14,-26,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-20,-4,-3,-9,-19,-8,-9,-3,-11,-8,0,-17,-5,-2,0,4,-5,-24,-6,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-32,-24,19,-31,-22,21,-27,28,13,-26,-28,-24,-21,-22,-8,16,-15,6,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-24,-9,-3,-8,-19,-10,-16,5,-13,-8,-5,-10,-1,7,-2,4,-12,-19,-3,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-3,5,-22,5,3,-20,-11,-9,-16,-3,-15,-12,4,-11,-2,-7,3,3,-13,-28,-13,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-20,2,2,-17,-15,-8,-15,-7,-15,-11,0,-4,-1,-10,8,9,-12,-27,-9,0;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-1,-21,-4,-2,-13,-15,-6,-13,-5,-18,-11,4,-4,0,-7,9,8,-13,-25,-6,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-28,-7,-15,-28,52,-18,-36,-15,-28,-19,1,-18,-15,-15,2,-12,-27,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-23,-10,-3,-8,-21,-1,-9,-3,-10,-5,-5,-18,-4,2,-4,0,-6,-16,0,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-26,-37,-28,12,-36,-24,36,-27,20,17,-22,-24,-22,-25,-20,-9,23,-14,8,-28;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-15,-9,-5,-11,-13,-12,-11,-7,-15,-10,-1,-13,-2,-9,14,14,-6,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-12,-1,-2,-17,-5,-2,-18,-10,-25,-16,9,-12,-1,-9,30,20,-11,-35,-12,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-34,-13,-5,-18,-19,-14,-15,-11,-21,-15,-18,55,-10,-18,-9,-8,-22,-20,-11,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-26,11,6,-23,2,3,-26,3,-24,-16,21,-16,2,1,1,-8,-26,-29,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-22,-30,-24,-22,25,-13,2,-8,-16,-5,-5,-19,-28,-17,-14,-18,-13,-13,29,47,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-38,-12,-3,-27,-15,-20,-17,-12,-25,-17,-19,74,-11,-20,-10,-11,-26,-29,-28,-12;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,14,-24,13,7,-26,-6,1,-26,10,-25,-14,15,-13,6,8,2,-4,-23,-29,-15,6; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='R'; M=-1,1,-3,0,0,-2,-1,0,-3,3,-3,-1,2,-2,1,3,0,-1,-2,-3,-1,0; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-20,9,7,-21,-5,-5,-18,-1,-19,-14,5,7,0,-5,3,-4,-17,-24,-16,3; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-24,-17,-17,26,-24,15,0,-9,0,0,-16,-24,-9,-9,-16,-8,-8,24,63,-17; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-4,-26,2,5,-23,-14,-9,-19,0,-22,-14,-6,33,-2,-6,-2,-4,-20,-25,-18,-1; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='N'; M=-5,6,-22,6,5,-21,-3,-6,-21,0,-21,-15,8,7,-1,-2,2,-4,-20,-25,-18,1; D=-4;
MA   /I: MD=-40;
MA   /M: SY='N'; M=-4,19,-17,14,2,-19,2,2,-20,-3,-23,-16,24,-13,-1,-4,9,0,-20,-28,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-19,-13,-6,-12,-20,-12,-5,-1,-4,4,-7,-15,1,-3,0,8,-3,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-26,11,17,-22,-15,5,-22,4,-19,-14,11,-13,8,5,-1,-6,-22,-27,-9,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,112,-29,-29,-20,-30,-29,-29,-28,-19,-19,-19,-38,-29,-28,-9,-8,-9,-49,-29,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-10,-18,-10,-6,-9,-24,-16,5,-12,-3,-3,-11,-19,-12,-14,-2,4,13,-28,-8,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-34,-44,-34,-27,15,-23,-17,-14,-17,-14,-14,-34,-29,-17,-17,-33,-23,-24,113,42,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-20,-10,-4,-14,-21,-6,-8,-3,-5,-3,-6,-17,1,4,-1,7,-3,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-29,4,-38,-28,44,-30,24,19,-22,-22,-21,-28,-21,-10,27,-19,1,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-22,-4,8,-18,-20,-8,-13,1,-11,-7,-5,-14,9,4,2,2,-9,-26,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-13,-24,-19,-8,-14,-21,8,-16,5,6,-19,-20,-17,-18,-4,0,17,-24,-12,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-30,5,13,-27,-18,-13,-23,3,-25,-18,-6,30,-1,-7,-2,-1,-22,-30,-21,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-31,0,11,-24,-19,-11,-19,-1,-21,-16,-7,29,-1,-7,-4,-5,-22,-27,-17,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-29,-5,-9,-28,44,-7,-35,-12,-27,-15,3,-18,-10,-13,-1,-17,-28,-23,-23,-10;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-2,-2,-3,-2,6,-3,0,0,-2,1,0,-2,-3,-3,-2,-2,-1,0,2,5,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-2,0,1,-2,-1,1,-1,1,-1,0,0,-1,3,1,0,-1,-2,-1,-1,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-11,-24,-12,-4,6,-22,15,-11,-8,-8,-3,-7,-20,-1,-3,-6,-7,-12,-11,17,-4; D=-5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-9,-2,-20,-16,3,-18,11,-16,-4,-2,-16,4,19,-4,-3,-12,-24,-8,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-23,-10,1,-12,-16,-5,-8,-3,-9,-3,-5,-15,-2,-4,-2,-2,-7,-24,-8,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,11,-31,-22,24,-29,40,18,-28,-29,-22,-21,-26,-9,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-21,-3,2,-21,-15,-1,-15,3,-18,-8,4,-14,11,4,6,3,-13,-26,-9,6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-23,-38,-28,55,-32,-21,10,-27,12,4,-19,-27,-32,-17,-20,-10,6,1,20,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-26,-5,7,-20,-22,-5,-9,-6,-6,-3,-6,-2,10,-7,-4,-1,-13,-26,-11,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-26,13,7,-22,-9,4,-25,-5,-23,-16,4,-2,2,-9,4,-2,-22,-27,-8,3;
MA   /I: I=-6; MI=-63; MD=-63;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-4,-1,1,-2,-3,-2,0,-1,-1,-1,-2,2,0,-2,-1,-1,-1,-3,-2,0; D=-6;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-35,-25,51,-29,-14,6,-28,21,10,-22,-29,-30,-19,-22,-10,2,-2,19,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-27,30,25,-27,-11,4,-29,1,-23,-20,16,-10,7,-5,1,-9,-27,-33,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-22,-28,-22,3,-31,-22,26,-26,31,18,-24,-26,-19,-21,-22,-7,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-26,9,30,-20,-19,-1,-20,2,-14,-12,-1,-8,11,-4,0,-3,-20,-25,-9,20;
MA   /I: MD=-46;
MA   /M: SY='D'; M=-4,1,-14,3,1,-17,-6,-7,-18,-3,-16,-13,0,-7,-3,-2,2,-3,-14,-22,-10,-2; D=-4;
MA   /I: MD=-46;
MA   /M: SY='H'; M=-3,6,-18,7,8,-20,-7,16,-21,-2,-20,-12,7,-10,5,-4,8,-2,-17,-26,-8,5; D=-4;
MA   /I: MD=-46;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-21,10,8,-21,-13,-6,-17,0,-16,-12,1,0,3,0,2,0,-15,-24,-12,5; D=-4;
MA   /I: MD=-46;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-18,2,4,-15,-2,-7,-16,-4,-12,-10,3,-12,-1,-2,3,-2,-13,-23,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,114,-30,-30,-19,-30,-30,-28,-30,-17,-18,-20,-40,-30,-30,-11,-10,-9,-49,-29,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-22,-11,-8,-17,-3,-14,-19,-4,-16,-11,-5,-11,-7,0,-7,-9,-16,-13,-13,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-30,-11,-11,8,-24,8,-10,2,-9,-3,-13,-23,-3,-3,-15,-10,-14,17,43,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-29,56,26,-37,-11,0,-37,1,-28,-27,16,-8,4,-8,2,-8,-29,-38,-20,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-19,-16,19,-24,10,-4,-12,-2,-2,-16,-26,-8,-11,-12,-7,-10,17,51,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-31,-26,4,-31,-26,28,-25,28,15,-29,-29,-25,-21,-20,-5,31,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-28,8,35,-22,-17,-3,-24,8,-18,-13,-1,-6,13,0,-2,-9,-23,-25,-15,24;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-21,-35,-29,0,-34,-29,39,-26,17,15,-24,-24,-24,-25,-16,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-26,-16,-9,-3,-22,-5,-9,2,-7,-4,-6,-21,-2,15,-10,-7,-10,-7,8,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,26,-25,35,12,-30,-9,-5,-28,0,-22,-21,12,-12,-1,-8,2,-6,-21,-34,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-28,3,-7,-30,41,-13,-35,-12,-29,-20,7,-17,-9,-14,4,-13,-28,-26,-26,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-28,-2,3,-26,-12,-11,-23,9,-25,-14,-2,12,1,4,-2,-4,-20,-25,-18,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-12,-20,-15,-12,-6,-23,-12,7,-14,7,3,-8,-22,-10,-11,-8,-1,6,-26,-7,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-24,-24,-19,5,-18,-12,8,-21,13,7,-18,-25,-18,-15,-18,-11,5,-14,2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-28,-11,-15,-25,48,-16,-30,-16,-21,-10,-2,-19,-15,-15,-3,-17,-24,-21,-24,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-31,-7,4,-24,-21,-8,-25,28,-23,-10,-3,-2,6,36,-10,-9,-19,-22,-12,2;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-23,-32,-25,42,-30,-8,9,-22,10,7,-21,-28,-24,-18,-19,-9,3,7,36,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-23,-8,-14,-29,56,-19,-38,-18,-29,-20,0,-19,-17,-19,1,-17,-28,-23,-29,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-26,1,-1,-22,5,1,-26,1,-24,-14,6,-14,2,1,1,-7,-23,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-25,-7,1,-18,-8,-9,-12,-2,-12,-7,-3,-15,-2,-4,-3,-5,-11,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-22,-13,-9,-6,-10,-14,-9,-9,-2,-5,-8,-15,-10,-8,-3,0,-7,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-34,-16,-7,-16,-19,-19,-10,-14,-16,-10,-18,52,-13,-20,-10,-8,-18,-26,-20,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-1,-27,4,9,-23,-9,-9,-20,-6,-18,-15,-6,10,-4,-12,-2,-6,-17,-28,-17,1;
MA   /I: MD=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-4,-19,-2,-3,-15,-14,-13,-7,-8,-10,-8,-6,7,-8,-10,-2,-1,-5,-24,-14,-7; D=-5;
MA   /I: MD=-55;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-16,-17,-11,-6,-16,-14,10,-12,6,5,-12,-14,-7,-10,-7,-4,9,-17,-6,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-19,-26,-24,-20,6,-30,-15,18,-16,9,7,-14,-23,-16,-15,-17,-9,10,-13,10,-20;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-17,-7,0,-19,-12,-9,-14,-2,-17,-9,0,-13,4,3,15,10,-7,-30,-15,1;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-12,-5,-4,-14,-6,-13,-16,-10,-21,-15,6,-12,-5,-9,26,23,-8,-33,-15,-5;
MA   /I: I=-6; MI=-63; MD=-63;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-3,-11,-3,1,-12,-7,-1,-6,0,-10,-4,0,-2,7,-2,4,0,-7,-14,-6,3; D=-6;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-19,-2,-6,-20,13,-8,-24,-12,-24,-16,4,-14,-6,-12,16,9,-16,-28,-14,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-19,15,0,-21,-1,5,-22,-4,-29,-19,37,-13,-1,-5,15,4,-24,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-22,-8,-3,-18,-14,-10,-10,0,-14,-7,0,-15,2,4,2,0,-7,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-24,-19,-30,-21,2,-23,-12,20,-18,26,36,-23,-23,-11,-16,-20,-8,14,-21,-3,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-10,-11,-23,-11,-8,-1,-21,-14,-7,-12,0,-2,-12,-19,-9,-9,-7,1,-6,-5,-1,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-27,3,-33,-25,34,-26,25,19,-26,-26,-22,-23,-20,-7,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-24,-7,4,-17,-22,-12,-11,12,-10,-5,-4,-14,0,10,-6,-1,-8,-25,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-22,-34,-26,58,-29,-11,2,-24,12,3,-20,-29,-30,-15,-21,-10,-1,9,34,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-22,-13,-8,-11,-22,1,-6,0,-8,-1,-7,-19,-1,4,-5,-4,-2,-22,-2,-6;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-14,-4,-2,-18,-9,-10,-19,-2,-23,-16,7,-12,-1,5,25,21,-10,-34,-16,-2;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-26,52,17,-34,-10,-2,-34,0,-27,-26,16,-10,0,-7,4,-3,-25,-37,-18,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-21,-4,-2,-10,-4,-8,-17,-7,-16,-13,3,-7,-6,-6,5,-2,-15,-24,-11,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-55; MD=-55;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-15,-2,-1,-20,4,-5,-21,-9,-23,-16,6,-11,-3,-10,20,11,-14,-31,-17,-2; D=-5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-12,-23,-16,-14,-8,-15,3,-1,-14,-6,-1,-5,-21,-12,-12,-8,-8,1,-18,-3,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-24,0,7,-22,-16,-5,-18,0,-20,-12,1,3,8,-3,5,3,-18,-26,-11,6;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-24,-3,1,-23,1,-10,-25,8,-20,-13,0,-14,-2,6,0,-7,-17,-22,-15,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-23,-5,2,-20,-13,-5,-22,12,-17,-10,1,-15,3,19,2,0,-15,-26,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-28,-9,-15,-21,38,-15,-31,-15,-27,-18,-1,-9,-15,-14,2,-12,-25,-20,-20,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-21,-32,-26,63,-28,-13,-2,-25,6,-1,-18,-28,-32,-18,-17,-8,-2,9,34,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-23,-2,5,-17,-16,-5,-17,5,-16,-8,-1,-10,3,3,0,-1,-13,-25,-11,4;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,-14,-23,-14,-14,-13,-22,5,-15,-3,-3,-12,-14,-13,-21,4,2,10,-23,-14,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-22,-6,-5,-10,-18,-3,-11,-1,-13,-8,-1,-14,-4,-1,1,3,-8,-20,2,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-19,-21,-24,-22,35,-23,1,-3,-18,1,-2,-15,-28,-20,-15,-16,-10,-7,9,41,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-23,-14,-6,-1,-17,-8,-6,-7,-5,-1,-9,-17,-5,-2,-7,-6,-5,-16,2,-7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-16,-13,-8,-14,-9,-17,-10,-5,-11,-7,-8,-15,-8,-9,2,-2,-2,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-6,-12,-4,-6,-15,-26,-18,4,-13,-4,-4,-10,-19,-12,-15,-7,-4,9,-31,-13,-10;
MA   /I: E1=0; MI=*;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, P_Bucher;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CUB;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00059;
DO   PDOC00908;
//