ID   TPR; MATRIX.
AC   PS50005;
DT   01-JAN-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   TPR repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34; TOPOLOGY=LINEAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3014; R2=0.0295; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=194; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=5.0; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B0=-100; B1=-200; E0=-100; E1=-200; MI=-105; MD=-50; IM=-105; DM=-50;
MA   /I: B1=0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-12,-19,-15,-8,-14,-13,-14,-6,-12,-11,-8,-10,-1,-9,-15,2,0,-4,-20,-12,-10; D=-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-24,1,7,-17,-16,-7,-16,1,-14,-11,0,-13,2,-1,-2,-5,-14,-20,-9,4; D=-4;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-15,-20,-13,-9,-14,-19,1,-14,-1,-1,-12,-16,-12,-16,-1,2,5,-22,-11,-13; D=-4;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-22,-27,-23,-17,8,-24,-1,-4,-15,3,0,-20,-25,-11,-12,-22,-14,-10,25,24,-14; D=-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-14,-16,-12,4,-21,-8,-5,-10,-3,-3,-8,-22,-10,-7,-8,-3,-5,-14,8,-12; D=-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-1,-21,-4,-2,-15,-9,-2,-15,-3,-11,-7,5,-18,-1,0,-4,-6,-15,-23,-8,-2; D=-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-23,-23,-14,-1,-26,-14,9,-13,18,11,-18,-23,-9,-4,-18,-8,5,-18,-2,-13; D=-4;
MA   /M: SY='G'; M=13,-9,-23,-12,-16,-25,44,-19,-29,-16,-24,-16,-2,-17,-16,-19,4,-12,-20,-21,-26,-16; D=-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-21,-8,-2,-15,-18,0,-8,-4,-6,-1,-2,-17,1,-2,-5,-4,-9,-24,-6,-1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-6,-21,-14,-5,-21,-17,2,-15,4,2,-16,-21,-13,-15,-7,-3,5,-23,-7,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-23,-18,-14,14,-23,9,-6,-12,-1,-1,-14,-25,-9,-10,-14,-10,-10,5,35,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-15,-20,-17,-10,3,-21,-9,-2,-10,2,2,-12,-20,-10,-7,-9,-4,-2,-16,2,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-23,-2,5,-21,-15,-6,-17,7,-15,-8,-1,-13,6,4,-1,-4,-14,-23,-10,5;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-19,-12,-3,-12,-20,-7,-4,-4,1,4,-8,-18,1,-3,-7,-3,-5,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-27,3,1,-28,19,-7,-31,-1,-26,-16,7,-15,-2,-3,1,-11,-25,-25,-20,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-27,21,15,-28,-14,2,-26,10,-23,-15,14,-12,11,6,-1,-8,-25,-29,-14,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-25,-21,-16,16,-25,2,-1,-14,2,2,-15,-21,-13,-11,-15,-8,-5,1,26,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-25,17,17,-29,-13,-3,-25,5,-23,-16,6,-6,8,-1,3,-4,-21,-31,-17,12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-26,3,15,-23,-17,-6,-19,11,-15,-9,0,-11,10,5,-4,-7,-18,-24,-12,12;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-9,-18,-10,-19,0,-19,-11,-11,-12,-11,-8,-11,-10,-19,12,2,-1,-22,-19,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-24,-22,-11,-3,-27,-17,13,-14,12,8,-17,-20,-11,-12,-15,-7,8,-19,-1,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-26,10,17,-25,-16,-3,-23,10,-19,-12,4,-9,11,4,0,-5,-20,-27,-13,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-9,-9,-9,-4,-18,-2,-11,-13,-7,-6,-7,-21,-8,-13,-6,-6,-9,-16,6,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-25,-20,-30,-24,42,-28,-7,2,-23,11,3,-21,-29,-24,-17,-20,-9,-2,9,36,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-24,3,11,-22,-16,1,-21,7,-17,-9,4,-13,12,8,1,-2,-19,-26,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-26,-1,12,-25,-18,-3,-24,21,-21,-10,0,-11,13,20,-3,-5,-19,-22,-11,11;
MA   /M: SY='A'; M=25,-15,-5,-21,-15,-14,-9,-21,-2,-15,-3,-4,-13,-17,-14,-20,4,0,6,-25,-16,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-20,-28,-20,1,-29,-17,19,-22,23,14,-22,-25,-16,-17,-19,-7,14,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-23,6,13,-24,-14,-5,-22,8,-19,-12,3,-11,8,6,3,-2,-17,-27,-14,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-19,-24,-15,-1,-25,-16,11,-17,19,10,-19,-24,-12,-12,-17,-7,7,-19,-3,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-23,16,7,-21,-13,-1,-21,0,-18,-15,12,-14,1,-4,0,-5,-19,-29,-12,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-34,-6,5,-27,-18,-14,-20,-3,-26,-16,-12,50,-3,-9,-5,-7,-24,-29,-23,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,10,-23,9,5,-19,-11,1,-22,2,-21,-14,11,-14,2,0,2,-2,-20,-25,-8,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,9,-22,6,0,-14,-12,3,-18,-4,-16,-11,12,-13,-3,-3,-1,-4,-18,-26,-9,-2;
MA   /I: E1=0;
PP   /COMPETES_SEQ_WITH: PS51375;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=TPR;
CC   /VERSION=4;
PR   PRU00339;
DO   PDOC50005;
//