ID   ZF_PHD_2; MATRIX.
AC   PS50016;
DT   01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger PHD-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4800000; R2=0.0089000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3510.1113281; R2=3.0049100; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=789; H_SCORE=5881; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=565; H_SCORE=5208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-11,-4,-7,-14,-8,-8,-17,-6,-16,-11,1,-19,-6,-4,0,-2,-12,-25,-8,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-7,-24,-10,-8,-14,-15,-8,-7,-2,-9,-4,-4,-14,-6,-4,-6,-4,-6,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-20,-23,-16,17,-21,-12,2,-16,3,3,-16,-23,-16,-13,-11,-4,2,-9,12,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-8,-11,-8,-5,-2,-13,-4,-9,-8,-6,-3,-7,-10,-6,-7,-5,-5,-9,-14,2,-6; D=-6;
MA   /I: DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-21,-24,-17,6,-27,-21,12,-13,7,5,-17,-21,-17,-14,-12,-4,13,-18,0,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-19,-1,-5,-17,6,-8,-24,-6,-19,-14,6,-18,-6,-5,1,-8,-19,-26,-16,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-24,4,8,-23,-9,-6,-23,5,-19,-11,2,-12,6,6,3,-1,-18,-27,-14,6;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-12,-4,1,-19,-8,-11,-16,-5,-17,-11,0,-5,-3,-8,7,4,-11,-29,-17,-2; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,1,-22,3,0,-13,-6,-3,-13,-6,-10,-9,0,-15,-5,-5,-3,-6,-12,-18,-3,-4; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-17,6,6,-18,-8,-5,-17,2,-15,-11,4,-7,2,0,-1,-6,-15,-22,-13,4; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: M=-3,-1,-16,0,-2,-10,-1,-8,-12,-4,-12,-8,-1,-3,-4,-7,-1,-3,-10,-10,-8,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,6,-25,12,7,-23,-6,-2,-25,-5,-21,-17,2,-2,-2,-9,4,-1,-20,-30,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,7,-25,8,4,-26,12,-7,-27,-5,-22,-17,8,-14,-4,-8,2,-9,-21,-28,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-23,1,4,-18,-16,-11,-18,-1,-15,-12,-3,0,-2,-5,-4,-6,-16,-24,-14,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-14,-30,-22,10,-27,-18,14,-21,18,17,-21,-25,-17,-17,-18,-7,9,-14,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-21,-30,-22,3,-30,-19,24,-22,21,19,-25,-25,-18,-19,-20,-9,20,-15,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-9,-14,-11,-1,-8,-19,-7,-11,-8,-8,-5,-7,-18,4,-7,-1,-1,-11,-20,-1,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-24,28,11,-32,-4,-2,-30,0,-25,-20,13,-12,4,-5,1,-8,-25,-32,-18,7;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
MA   /M: SY='B'; M=-7,0,-21,0,-4,-16,-4,-8,-18,-3,-13,-9,-1,-17,-7,-5,-4,-5,-13,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-120,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,6,-20,9,3,-24,-2,-6,-26,1,-22,-15,4,-10,1,-1,-2,-9,-22,-25,-14,1; D=-6;
MA   /I: I=-8; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,2,-25,3,6,-21,-17,1,-22,11,-18,-11,3,-15,7,21,-2,-4,-17,-25,-9,5; D=-6;
MA   /I: DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-17,-30,-18,-14,-11,-5,-17,-18,-9,-20,-14,-14,-11,-11,-13,-8,-10,-17,29,-3,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-21,-29,-23,30,-24,-9,2,-19,3,2,-20,-28,-21,-16,-17,-10,2,7,25,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-11,-24,-12,-3,-17,-16,-10,-7,-4,-8,-1,-8,-7,4,-2,-3,-3,-8,-24,-11,-1;
MA   /M: M=-7,-2,-24,-3,-1,-11,-15,-6,-13,0,-13,-8,-1,-16,-4,-4,-3,-3,-10,-21,-3,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-16,-24,-16,3,-25,-14,10,-19,15,8,-20,-24,-16,-17,-13,-3,10,-18,3,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-25,-4,-3,-23,2,-10,-17,-6,-15,-7,0,-11,2,-7,-1,-6,-16,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-11,-28,-10,-7,-6,-23,-9,-7,-9,-6,-5,-10,3,-11,-9,-12,-8,-9,-19,-7,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-25,-6,-1,-18,-10,-12,-17,-5,-21,-14,-3,8,-5,-9,3,0,-16,-20,-14,-4;
MA   /M: M=-5,-8,-25,-7,-2,-13,-14,-10,-11,-3,-8,-5,-8,-7,-4,-6,-8,-8,-10,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-25,-3,4,-15,-20,-11,-11,1,-10,-8,-3,-7,-3,1,-4,-3,-9,-26,-12,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-11,0,1,-10,-5,-6,-8,-3,-9,-6,-1,1,-2,-5,3,1,-7,-16,-8,-1; D=-1;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: M=-2,-5,-16,-6,-3,-10,-7,-9,-6,-4,-5,-4,-4,-6,-2,-5,-4,-4,-7,-10,-7,-3; D=-1;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=1,-4,-19,-5,0,-15,-10,-10,-10,-3,-7,-5,-5,-8,-3,-5,-3,-4,-8,-18,-11,-2; D=-1;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: M=-2,-2,-22,-2,-2,-18,-13,-12,-6,-6,-11,-7,-2,0,-7,-11,-3,-5,-6,-25,-15,-6; D=-1;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-29,-7,1,-20,-12,-10,-17,-1,-18,-11,-7,9,-2,-5,-5,-8,-18,-16,-13,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-27,9,9,-22,-11,-8,-23,3,-20,-15,3,-1,1,0,0,-4,-21,-28,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-24,-3,0,-17,1,-10,-17,-6,-15,-10,-1,-16,-5,-5,0,-6,-12,-25,-14,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-6,-2,-25,-2,-3,-21,-4,-8,-16,-3,-15,-8,-2,-11,-5,-5,-4,-7,-12,-24,-14,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-33,-39,-35,-26,25,-24,-20,-10,-19,-8,-10,-30,-29,-21,-17,-31,-21,-18,86,32,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-16,-21,-14,-1,-25,-12,2,-10,3,2,-14,-22,-9,-6,-9,-4,2,-16,3,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-29,-7,-1,-22,-13,-12,-16,-1,-19,-12,-6,13,-4,-3,-4,-4,-15,-24,-17,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-21,-8,-2,-12,-11,-5,-15,1,-10,-7,-2,-19,-4,5,-7,-8,-12,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,115,-29,-29,-20,-30,-26,-30,-29,-20,-19,-19,-39,-29,-29,-10,-10,-11,-49,-28,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-22,0,1,-19,-15,-9,-14,2,-11,-5,-1,-15,2,1,-1,1,-10,-27,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-14,-6,0,-15,-18,-9,-15,1,-17,-10,1,-6,-3,0,-2,-4,-14,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-4,-9,-1,-19,-17,-6,-20,2,-18,-9,-6,-12,-2,2,-2,-5,-13,-29,-13,-3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS51805;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20_shuffled;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=PHD-type;
CC   /VERSION=6;
PR   PRU00146;
DO   PDOC50016;
//