ID   PLD; MATRIX.
AC   PS50035;
DT   01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Phospholipase D phosphodiesterase active site profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.4560000; R2=0.0316000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=975.8386230; R2=0.5719298; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=316; H_SCORE=1157; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=252; H_SCORE=1120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MM=1; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-8,-23,-8,-10,-4,-9,-9,-10,-9,-8,-6,-7,-17,-10,-9,-5,-3,-8,-16,2,-11;
MA   /M: M=-8,0,-24,-1,-5,-9,-9,-7,-14,-6,-9,-6,0,-16,-6,-4,-5,-5,-13,-22,-7,-6;
MA   /M: M=-8,-10,-28,-11,-12,-9,-2,-10,-16,-6,-13,-9,-6,-16,-10,-2,-9,-11,-14,-6,-2,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-21,-22,-15,-3,-22,-17,3,-7,1,1,-15,-20,-12,-3,-9,-2,6,-14,-2,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-23,-8,-7,-7,-19,9,-1,-11,1,6,5,-22,-2,-8,-10,-8,-8,-24,1,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-19,5,-29,3,0,-20,-17,89,-29,-9,-21,-3,16,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,15,0;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-19,-1,1,-18,-12,-3,-17,-4,-15,-10,3,-12,2,-2,6,5,-13,-28,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-21,-28,-22,10,-20,-18,13,-23,15,9,-18,-24,-20,-19,-14,-4,9,-15,4,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-20,-31,-24,15,-27,-15,17,-21,18,19,-24,-26,-19,-18,-19,-8,14,-8,9,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-21,-32,-27,-1,-29,-27,30,-24,15,13,-23,-24,-22,-23,-15,-5,29,-19,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-29,-24,7,-29,-25,23,-22,9,8,-20,-23,-23,-21,-8,1,27,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,64,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,1,-9,-29,-39,-20,13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-27,28,8,-31,3,-1,-31,-1,-27,-21,17,-14,2,-4,3,-8,-27,-33,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-23,1,11,-20,-16,-6,-20,8,-17,-11,-1,-11,3,5,0,-1,-14,-25,-12,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-14,-19,-18,-13,4,-22,-4,5,-13,3,2,-12,-19,-9,-11,-8,0,3,-7,11,-13; D=-4;
MA   /I: DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-12,-21,-17,-8,-12,-21,3,-16,-2,-2,-13,-18,-16,-18,4,4,12,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-23,-25,-19,21,-29,6,4,-20,7,4,-16,-26,-16,-15,-17,-10,-2,-2,27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-31,-26,2,-32,-25,31,-24,18,13,-23,-25,-22,-22,-15,-3,29,-22,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-24,-10,-16,-25,46,-18,-31,-17,-26,-16,0,-17,-15,-17,7,-6,-22,-24,-25,-16;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-17,-6,-9,-21,17,-15,-24,-12,-26,-17,5,-12,-9,-12,20,10,-14,-31,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-12,-12,-19,-13,-7,-11,-13,-5,-13,-5,-4,-8,-17,-12,-15,2,-1,0,-22,-10,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-11,40,-22,29,4,-24,-2,7,-24,0,-30,-22,50,-18,0,-2,9,-1,-29,-40,-20,2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-26,-34,-25,17,-27,-19,14,-25,21,13,-26,-27,-21,-20,-26,-13,5,12,12,-22;
MA   /M: SY='B'; M=-6,14,-9,14,-2,-20,-6,-8,-22,-9,-20,-16,10,-17,-7,-12,4,-1,-17,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-1,-29,2,-1,-16,-3,-9,-23,-5,-20,-13,-3,-2,-6,-10,-6,-9,-22,-13,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-23,-1,1,-22,-3,-10,-23,5,-20,-14,1,-13,-2,10,2,-1,-15,-26,-17,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-4,-22,-6,-7,-8,-12,13,-17,-5,-16,-10,2,-19,-2,1,3,-1,-15,-15,10,-7;
MA   /I: E1=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PLD phosphodiesterase;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00153;
DO   PDOC50035;
//