ID   UBIQUITIN_2; MATRIX.
AC   PS50053;
DT   01-NOV-1997 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1843000; R2=0.0217754; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3386.7353516; R2=3.7062781; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; H_SCORE=4803; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; H_SCORE=4465; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-24,-21,-28,-20,0,-25,-18,18,-18,15,22,-23,-23,-14,-17,-17,-6,16,-11,-2,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-23,5,6,-23,-16,10,-21,1,-21,-10,4,-13,11,2,6,2,-18,-27,-5,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,34,-27,27,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-3,-18,-12,-10,4,-20,-12,-8,-8,-3,-5,3,-19,-10,-6,-1,12,-7,-21,-3,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-31,-26,7,-31,-26,26,-25,25,14,-29,-29,-26,-21,-18,-5,32,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-28,-4,4,-25,-19,0,-25,31,-24,-6,-1,-9,7,25,-7,-7,-18,-22,-8,5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-16,-12,-12,-10,-18,-9,0,-10,-6,0,1,-17,-9,-10,4,11,3,-29,-10,-11;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-16,-24,-17,-8,-6,-23,-14,2,-10,7,5,-13,-11,-6,-7,-12,-6,-2,-23,-7,-8;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,7,-23,6,3,-26,-3,-3,-23,4,-20,-10,7,-13,10,5,2,-2,-20,-25,-14,6; D=-3;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,1,-26,2,3,-30,14,-1,-28,-3,-23,-12,2,-13,9,-6,1,-11,-24,-22,-17,6; D=-3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,7,-25,8,10,-22,-14,7,-25,9,-21,-11,7,-13,12,12,-1,-5,-22,-25,-9,10; D=-3;
MA   /I: DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-19,-1,2,-18,-13,-13,-12,-5,-13,-10,-2,-13,-3,-8,9,11,-6,-30,-14,-1;
MA   /I: DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-15,-21,-22,-18,5,-23,-11,7,-18,1,1,-7,-21,-15,-14,-6,-3,5,-16,0,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-21,-5,10,-14,-21,-12,-11,-2,-11,-9,-5,-7,2,-6,3,8,-8,-26,-11,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-20,-28,-22,12,-29,-15,17,-21,13,9,-21,-25,-19,-18,-15,-4,17,-16,7,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-24,11,15,-15,-17,-2,-21,-3,-17,-15,5,-11,3,-4,4,2,-18,-28,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-19,-30,-25,12,-20,-23,15,-23,13,11,-22,-25,-24,-20,-14,-6,18,-18,-1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-25,3,9,-22,-9,-9,-26,9,-23,-15,1,-7,4,6,3,-1,-19,-26,-15,6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-26,-11,-4,-16,-15,-16,-5,-13,-6,-6,-11,8,-10,-13,-6,-6,-7,-28,-17,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-21,3,10,-26,-10,-8,-23,6,-24,-14,3,-9,10,1,13,8,-17,-29,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-27,12,13,-24,-14,-3,-21,3,-18,-7,2,-7,8,-2,-2,-7,-20,-22,-14,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-13,-9,-8,-13,-18,-17,-10,-10,-12,-10,0,-7,-7,-10,17,35,-2,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-14,-29,-27,-1,-30,-27,28,-20,9,11,-24,-25,-24,-20,-8,5,38,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-6,-22,-6,0,-15,-11,-5,-16,-3,-12,-8,-4,-10,3,-6,1,-4,-14,-23,-8,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-24,1,12,-20,-20,4,-12,-5,-7,-5,-2,-14,8,-6,-3,-6,-12,-28,-9,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-28,-19,7,-30,-20,16,-19,27,13,-22,-25,-17,-12,-22,-7,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-29,-3,7,-28,-20,-11,-25,42,-26,-9,-1,-11,8,27,-10,-10,-17,-20,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-1,-23,0,11,-22,-17,-6,-15,2,-9,-7,-3,-13,11,0,-3,-5,-14,-25,-13,10;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-9,-26,-11,-2,-19,-22,13,-11,8,-8,6,-6,-17,10,6,-11,-11,-11,-22,-2,3;
MA   /I: MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-24,-26,-18,-4,-27,-23,25,-22,14,10,-17,-22,-17,-21,-15,-8,19,-24,-7,-20;
MA   /I: MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=8,-1,-20,-3,12,-22,-12,-3,-17,0,-16,-11,0,-9,8,-1,6,-1,-14,-25,-15,9; D=-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,11,13,-29,-1,-3,-28,4,-24,-15,3,-11,12,1,2,-8,-25,-25,-14,12;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-24,-7,4,-19,-18,-10,-14,8,-13,-8,-4,-10,1,13,-3,-5,-10,-25,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-26,-2,8,-18,-19,-7,-6,-4,-7,-2,-4,-13,6,-7,-6,-5,-9,-23,-7,6;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-24,-7,-9,-26,33,-15,-30,-9,-26,-17,3,-16,-10,-10,7,-7,-22,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-15,-27,-22,-1,-28,-22,17,-15,3,9,-18,-19,-18,-14,-10,-4,19,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-33,-2,7,-27,-19,1,-21,-5,-23,-14,-9,40,2,-9,-7,-10,-26,-29,-18,1;
MA   /M: SY='P'; M=0,-13,-23,-12,-4,-17,-18,-15,-2,-10,-9,0,-13,9,-6,-14,-2,-2,-1,-28,-16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,13,-22,15,9,-21,2,-7,-26,-6,-23,-20,11,-12,-3,-10,8,-4,-21,-30,-18,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-26,4,9,-19,-10,-4,-23,4,-20,-11,3,-13,13,3,1,-6,-21,-24,-11,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-9,-28,-11,6,-21,-24,0,-5,-2,-6,5,-7,-15,34,0,-7,-10,-16,-18,-5,20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-28,-12,-3,-19,-20,-9,-22,25,-19,-9,-7,-18,3,38,-11,-10,-13,-8,-8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-23,19,-30,-21,18,-29,40,16,-29,-30,-24,-20,-26,-9,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-24,-30,-21,0,-30,-19,25,-23,21,15,-19,-22,-13,-21,-16,-6,14,-18,1,-19;
MA   /I: MD=-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-23,-26,-20,34,-26,-2,-1,-16,5,1,-17,-27,-20,-13,-16,-8,-3,5,34,-20;
MA   /I: I=-8; MI=-15; IM=-15; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=4,9,-23,13,14,-29,-6,-7,-26,5,-23,-17,4,-9,8,-4,7,-4,-20,-29,-18,11;
MA   /I: DM=-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-6,-17,-30,62,-19,-39,-19,-29,-20,1,-19,-19,-19,1,-17,-29,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-27,-10,0,-21,-21,-9,-14,21,-15,-2,-5,-15,7,20,-8,-8,-10,-21,-9,2;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-24,-20,-10,-6,-25,-16,2,-10,-1,0,-16,-6,-8,-4,-10,-6,3,-22,-8,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,7,-31,-21,25,-29,42,21,-28,-28,-20,-21,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,9,19,-29,-16,3,-25,13,-21,-11,5,-10,18,9,-1,-8,-23,-27,-13,18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,40,-27,55,18,-37,-9,-2,-36,-1,-28,-27,16,-10,0,-11,3,-8,-26,-38,-20,9;
MA   /I: MD=-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-25,16,8,-26,-1,1,-27,1,-24,-15,15,-13,3,-2,5,-4,-23,-32,-17,5;
MA   /I: I=-8; MI=-15; IM=-15; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-23,-9,2,-19,-20,-3,-10,6,-7,1,-5,-16,11,4,-6,-4,-10,-23,-8,6;
MA   /I: DM=-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-11,-12,-9,-11,-19,-19,-12,-10,-13,-11,-5,2,-11,-12,11,26,-6,-29,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-21,-26,-18,0,-27,-20,15,-23,26,13,-26,-11,-18,-19,-20,-7,11,-24,-7,-19;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-21,-1,3,-26,5,-10,-25,0,-23,-15,2,-12,3,-1,10,0,-18,-27,-19,2;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-26,24,24,-24,-14,-2,-27,0,-21,-19,5,-8,7,-7,3,-6,-23,-28,-13,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-21,6,-24,-20,7,-27,-5,-2,-19,8,0,-21,-30,-14,-17,-17,-9,-4,-7,23,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-7,8,-28,6,-7,-28,30,0,-34,-6,-29,-18,15,-18,-8,-7,0,-14,-29,-27,-20,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-34,-25,7,-31,-21,30,-25,26,25,-24,-25,-19,-21,-21,-8,22,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-24,6,15,-27,-9,-6,-23,5,-21,-13,3,-10,11,-1,4,-1,-19,-27,-16,13;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-28,25,17,-31,-12,-7,-29,1,-27,-22,6,12,1,-8,3,-6,-25,-34,-21,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-27,-2,1,-25,15,-10,-26,-4,-18,-12,1,-16,0,-4,-2,-11,-22,-24,-19,0;
MA   /M: SY='B'; M=-2,12,-5,9,-1,-23,-11,-4,-21,-8,-21,-15,10,-15,-2,-10,11,8,-15,-35,-16,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-17,-13,-6,-7,-20,-15,-7,-6,-9,-6,-5,-14,-4,-5,7,16,-1,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-18,-32,-27,1,-33,-28,32,-24,19,14,-25,-26,-24,-23,-15,-2,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-8,-25,-8,0,-8,-24,18,-4,-11,-3,4,-7,-18,-3,-10,-10,-9,-4,-23,4,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-17,-27,-19,4,-24,-19,14,-19,23,15,-23,-25,-18,-16,-16,-4,15,-21,-4,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-15,-18,-20,-17,-7,-21,-1,10,-13,1,13,-11,-22,-9,-13,-8,-6,13,-24,-2,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-20,-18,-16,-7,-14,-18,5,-14,10,7,-18,-25,-14,-10,-14,-8,10,-24,-10,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-26,-1,7,-22,-19,-1,-22,16,-20,-10,1,-13,8,23,0,0,-16,-25,-10,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-26,-7,6,-21,-16,-4,-12,7,-5,5,-6,-15,14,3,-10,-10,-15,-22,-9,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-15,-12,-7,-18,-20,-13,-16,1,-14,-10,-5,1,-5,11,-4,0,-13,-28,-15,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-26,-2,-9,-27,33,-14,-33,-4,-29,-18,5,-16,-9,-8,6,-8,-24,-25,-23,-9;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-28,-8,-8,-28,39,-18,-32,-15,-28,-19,-3,-1,-13,-18,2,-13,-26,-24,-28,-12;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Ubiquitin-like;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00214;
DO   PDOC00271;
//