ID   DNAJ_2; MATRIX.
AC   PS50076;
DT   01-NOV-1997 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   dnaJ domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.3380001; R2=0.0152141; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3768.5698242; R2=3.4767442; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=647; H_SCORE=6018; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=516; H_SCORE=5563; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-3;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-14,27,14,-28,-13,-3,-29,0,-24,-21,13,-12,1,-5,5,1,-22,-36,-18,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-20,-21,-16,16,-24,4,-3,-16,5,1,-15,-19,-15,-14,-16,-10,-7,-4,25,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-21,-19,21,-27,15,-3,-10,-2,0,-19,-28,-10,-8,-20,-11,-11,27,58,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,13,-26,18,22,-30,-11,-3,-29,11,-24,-18,7,-9,9,3,1,-7,-24,-29,-17,15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-21,-28,-22,-1,-31,-25,26,-23,17,11,-21,-21,-20,-21,-15,-4,23,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,14,-30,-20,20,-29,44,19,-29,-30,-21,-20,-28,-9,12,-19,1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-26,-1,-6,-29,42,-14,-35,-12,-29,-20,4,-15,-10,-13,3,-14,-28,-25,-26,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-17,-31,-25,3,-31,-25,27,-23,23,16,-26,-27,-22,-21,-18,-5,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-23,2,7,-26,-11,-7,-23,-2,-24,-16,-1,12,1,-6,6,2,-20,-31,-19,2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-26,0,7,-23,-17,-9,-21,10,-20,-12,-3,1,2,8,-2,-4,-16,-26,-15,3;
MA   /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='B'; M=-7,8,-23,7,0,-20,-9,-5,-19,-5,-18,-13,7,-14,-2,-7,4,3,-16,-22,-11,-1;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-8,-16,-12,-17,-3,-17,-10,-13,-8,-8,-9,-16,-11,-17,4,0,-2,-24,-17,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-18,18,3,-23,-8,-8,-22,-4,-23,-17,14,-11,-3,-8,15,14,-15,-35,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-25,1,4,-21,-14,-11,-15,-4,-11,-8,-6,0,0,-8,-3,-4,-14,-26,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-25,12,13,-27,-12,-5,-24,8,-22,-13,4,-8,7,2,2,-4,-19,-29,-16,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-26,13,26,-25,-17,-4,-24,6,-17,-14,1,-8,10,2,0,-4,-21,-28,-15,18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-36,-27,2,-35,-26,39,-27,24,20,-23,-23,-20,-26,-20,-9,27,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-29,-2,7,-27,-19,-7,-27,37,-26,-10,1,-12,9,31,-7,-8,-19,-22,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-26,-3,6,-23,-18,-7,-23,25,-22,-10,0,-12,7,23,-4,-5,-16,-23,-11,5;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-11,-14,-6,-19,-6,-14,-12,-5,-13,-10,-5,-13,-6,-10,7,1,-4,-24,-16,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-28,-22,-20,33,-29,17,-1,-14,2,2,-19,-29,-13,-11,-20,-11,-8,20,64,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-28,-13,-4,-11,-22,1,-18,16,-10,-2,-6,-20,5,36,-13,-10,-14,-16,0,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-27,3,8,-28,-17,-6,-27,30,-25,-11,5,-12,10,25,-5,-6,-20,-24,-12,8;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-19,-25,-15,-1,-25,-17,9,-16,26,11,-22,-24,-12,-11,-20,-8,5,-19,-3,-14;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-2,-21,-14,-13,-11,-18,-4,-14,-5,-2,-13,-18,-11,-18,3,0,4,-25,-15,-12;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-23,-17,-8,-9,-22,-13,-3,3,4,6,-13,-18,-5,4,-13,-8,-2,-21,-7,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-26,-4,9,-23,-21,-5,-18,21,-16,-5,-4,-14,12,16,-7,-8,-14,-23,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-26,-17,-15,13,-25,16,-6,-13,-2,-2,-12,-26,-10,-10,-16,-9,-11,10,37,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-29,-1,-1,-17,-20,91,-28,-10,-19,-1,10,-20,8,-1,-9,-18,-29,-28,20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-19,88,-10,-20,-9,-9,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,45,-30,64,20,-38,-11,3,-38,0,-28,-28,18,-10,1,-10,-1,-10,-29,-38,-17,10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-26,-6,2,-23,-19,-8,-20,29,-21,-5,-1,-14,6,24,-7,-6,-13,-22,-10,3;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,6,-18,-2,-7,-13,0,-1,-16,-8,-17,-11,16,-17,-7,-6,1,-5,-17,-27,-13,-7; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-24,-6,-3,-22,-2,-13,-18,1,-21,-12,-3,7,-4,-4,1,-3,-15,-25,-18,-5; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,9,-21,10,4,-23,2,-5,-22,-3,-20,-14,8,-10,-3,-7,4,-4,-18,-27,-17,0; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,7,-17,9,5,-20,-5,-5,-17,-1,-17,-12,5,-2,2,-4,4,-1,-14,-23,-14,3; D=-2;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-21,-2,9,-18,-13,-7,-13,3,-13,-6,-4,7,5,-2,-2,-4,-14,-20,-13,6; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-19,1,6,-17,-9,-5,-13,-2,-10,-7,-1,-11,2,-5,0,-3,-11,-21,-10,3; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-12,-12,-7,-14,-3,-14,-8,-7,-8,-7,-6,-12,-7,-12,4,-2,-3,-16,-13,-7; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-21,6,19,-20,-12,-6,-19,3,-15,-12,1,-8,5,-3,2,0,-16,-25,-14,12; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,4,19,-22,-16,0,-19,5,-15,-9,-1,-10,11,1,-3,-7,-17,-24,-11,14; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-27,-8,0,-18,-20,-8,-14,16,-13,-3,-5,-16,4,13,-9,-7,-11,-17,-5,1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-34,-26,56,-26,-17,0,-25,6,1,-16,-27,-31,-18,-15,-7,-1,5,23,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-25,-4,7,-25,-18,-4,-19,19,-19,-5,-2,-12,13,16,-2,-4,-15,-24,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-22,1,19,-23,-20,-7,-19,8,-12,-9,-5,-11,11,5,-4,-5,-16,-26,-14,15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-35,-26,4,-34,-26,34,-27,25,19,-24,-24,-21,-24,-20,-8,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='N'; M=1,9,-17,1,-2,-20,-6,-4,-16,-2,-20,-13,18,-16,2,-3,9,3,-16,-31,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-25,2,19,-23,-18,-4,-16,4,-15,-9,-1,-10,11,-1,-1,-5,-15,-26,-13,14;
MA   /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,-11,-20,-11,-18,-2,-20,-7,-12,-6,-8,-10,-12,-11,-20,7,-1,1,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-30,-18,-17,21,-27,15,-6,-8,-5,-3,-16,-27,-10,-8,-19,-11,-13,28,57,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-27,20,31,-31,-15,1,-28,7,-23,-17,6,-7,17,0,4,-6,-26,-30,-17,24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-18,-23,-17,-6,-28,-21,16,-13,5,6,-17,-20,-14,-14,-7,3,19,-25,-7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21,12,-30,-20,20,-28,43,19,-28,-29,-20,-19,-28,-10,11,-19,1,-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-13,-2,3,-22,-4,-10,-23,2,-24,-16,5,-13,0,1,15,6,-15,-32,-18,1;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-27,38,13,-30,-12,2,-29,2,-24,-20,15,-13,5,-3,0,-8,-25,-32,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-29,3,11,-28,-14,-10,-20,-1,-23,-15,-4,23,4,-8,0,-6,-22,-29,-21,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-25,11,13,-22,-15,-5,-21,5,-16,-12,5,-13,5,2,-1,-3,-17,-28,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-27,-1,4,-24,-17,-7,-23,25,-21,-8,0,-13,7,21,-7,-8,-16,-22,-10,5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-12; IM=0; E1=0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-28,-9,1,-20,-20,-4,-24,28,-18,-8,-2,-18,7,52,-9,-9,-16,-20,-9,0; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=6,-4,-21,-6,4,-22,-12,-9,-18,8,-17,-10,-2,-8,5,8,3,-2,-13,-23,-15,3; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-26,-11,1,-13,-20,-7,-4,-4,-4,-1,-7,-15,0,-5,-9,-9,-6,-19,-7,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-18,27,-28,18,-1,-11,0,1,-16,-29,-9,-10,-18,-10,-10,21,66,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-17,43,-29,58,19,-37,-10,-1,-36,-1,-28,-27,19,-8,1,-9,1,-9,-29,-39,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-26,-2,10,-24,-19,-2,-19,12,-17,-7,-1,-14,18,19,-2,-4,-17,-22,-9,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-23,-24,-21,29,-25,-1,1,-18,3,1,-14,-26,-19,-14,-14,-5,-3,5,33,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-27,-7,-11,-24,37,-16,-30,-14,-20,-15,-3,-18,-13,-13,-2,-13,-23,-20,-23,-12;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=J;
CC   /VERSION=6;
PR   PRU00286; PRU50000;
DO   PDOC00553;
//