ID   WD_REPEATS_2; MATRIX.
AC   PS50082;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Trp-Asp (WD) repeats profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0511000; R2=0.0334182; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1113.7017822; R2=1.6596491; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=223; H_SCORE=1484; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=164; H_SCORE=1386; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-20,-21,-14,6,-23,-12,4,-18,10,4,-15,-20,-14,-14,-14,-6,1,-16,3,-15;
MA   /M: M=-5,-2,-21,-2,0,-17,-13,-6,-16,-1,-15,-9,0,-11,0,-1,0,-1,-13,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-22,-6,-7,-22,18,-12,-24,-10,-20,-13,-1,-14,-9,-12,2,-7,-17,-24,-19,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-27,0,0,-19,-16,57,-25,-7,-19,-5,6,-15,5,-2,-6,-13,-24,-27,8,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-21,0,3,-20,-11,-8,-18,0,-17,-11,2,-9,1,-1,4,3,-14,-28,-13,1;
MA   /M: SY='B'; M=-2,4,-21,4,1,-22,-1,-6,-22,-3,-20,-13,4,-13,-1,-6,3,-4,-17,-27,-15,-1;
MA   /M: M=-2,-7,-23,-7,-3,-16,-9,-11,-16,-6,-17,-12,-5,-5,-5,-7,-1,-3,-14,-17,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-12,-30,-26,-1,-29,-26,25,-21,11,9,-23,-25,-23,-21,-12,-3,30,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-17,-10,-9,-7,-16,-8,-11,-7,-10,-7,0,-19,-7,-4,-1,4,-9,-16,-4,-8;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,0,-4,-6,-19,-7,-12,-20,-10,-19,-14,-1,-17,-7,-11,8,2,-11,-31,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-10,-29,-23,2,-27,-23,18,-23,17,11,-23,-26,-21,-20,-14,-5,20,-24,-6,-23;
MA   /M: SY='A'; M=5,-1,-15,-3,-2,-20,-11,-10,-17,-2,-16,-11,-2,-14,-2,-4,4,-1,-10,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-24,-31,-24,25,-24,-19,0,-22,1,-2,-22,-25,-23,-18,-19,-11,-3,25,16,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-16,1,-3,-17,-9,3,-17,-8,-18,-12,8,-15,-3,-8,9,2,-14,-31,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-28,-3,1,-23,-12,-8,-20,-4,-22,-15,-5,24,-3,-8,-2,-6,-21,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-22,16,4,-21,-10,-2,-22,-3,-20,-16,10,-12,-2,-6,3,-1,-18,-30,-13,1;
MA   /I: I=-12; MI=-15; MD=-25; IM=-15; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-19,-1,-3,-19,13,-8,-20,-7,-18,-12,2,-8,-5,-8,2,-6,-16,-21,-15,-4; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-20,-1,0,-17,-9,-4,-17,0,-16,-10,4,-8,1,1,1,-2,-15,-22,-10,0; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-21,-18,-13,1,-23,-7,0,-10,3,2,-12,-22,-9,-6,-12,-5,-1,-11,6,-12; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-31,-23,13,-29,-21,19,-25,23,13,-23,-26,-22,-20,-19,-7,15,-16,2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,-13,-27,-21,0,-19,-21,10,-20,8,4,-19,-22,-19,-20,-8,-3,14,-19,-6,-20;
MA   /M: SY='T'; M=8,-6,-8,-10,-9,-13,-9,-15,-11,-12,-15,-11,-1,-13,-9,-13,20,21,-1,-32,-15,-9;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-9,-14,-16,-21,22,-20,-22,-16,-19,-14,-5,-18,-16,-18,6,-5,-11,-26,-23,-16;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-13,-5,-8,-19,11,-12,-23,-13,-23,-16,2,-15,-8,-14,16,3,-14,-29,-17,-8;
MA   /M: M=-4,-2,-21,-2,-1,-16,-10,-7,-17,-4,-14,-9,-2,-14,-3,-4,-1,-4,-14,-18,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-28,52,16,-35,-8,0,-35,0,-28,-26,19,-11,1,-8,2,-7,-27,-37,-19,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-22,-4,-6,-22,11,-5,-27,-1,-23,-13,6,-16,-4,1,1,-8,-22,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-17,-6,-4,-14,-16,-8,-11,-4,-12,-7,0,-15,-2,-4,6,11,-7,-27,-9,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-14,-32,-25,0,-30,-26,27,-24,17,12,-23,-24,-22,-23,-15,-5,26,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-23,-10,-3,-15,-19,-5,-16,13,-14,-5,-3,-17,2,18,-7,-6,-12,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-18,-31,-24,6,-30,-22,23,-24,19,13,-23,-26,-21,-20,-17,-6,22,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-35,-42,-36,-28,17,-22,-21,-13,-20,-12,-14,-34,-29,-20,-18,-33,-24,-22,109,32,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,32,12,-29,-9,-1,-29,2,-26,-21,16,-11,3,-3,4,-4,-24,-34,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-19,-24,-18,0,-23,-18,9,-18,10,6,-18,-18,-16,-16,-12,-3,8,-17,-3,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,1,-23,1,4,-20,-13,-5,-19,3,-17,-11,2,-9,3,5,1,-2,-15,-26,-13,2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-19,0,0,-18,-10,-8,-18,-2,-18,-12,5,-11,-1,-3,8,8,-13,-28,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-23,-5,-5,-19,4,-10,-20,-7,-17,-10,-1,-11,-6,-7,-1,-7,-17,-23,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-22,0,6,-21,-13,-6,-19,4,-18,-11,1,-10,4,3,1,-2,-16,-25,-12,4;
MA   /M: M=-6,-9,-10,-11,-5,-14,-18,-11,-11,-7,-9,-6,-8,-11,-6,-6,-6,-4,-9,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-20,-15,-9,-9,-21,-15,2,-11,1,1,-11,-14,-9,-10,-7,-2,3,-24,-9,-10;
MA   /M: M=-6,-8,-21,-9,-5,-13,-15,-3,-12,-3,-10,-4,-5,-15,-2,-1,-5,-5,-10,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-18,-8,-4,-13,-17,-11,-9,-5,-10,-6,-4,-13,-4,-5,2,5,-4,-26,-10,-5;
MA   /I: E1=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=WD;
CC   /VERSION=8;
PR   PRU00221;
DO   PDOC00574;
//