ID   KH_TYPE_1; MATRIX.
AC   PS50084;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 03-MAY-2023 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Type-1 KH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6368001; R2=0.0209632; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2311.8957520; R2=4.5809312; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=314; H_SCORE=3750; N_SCORE=8.2; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=232; H_SCORE=3375; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-25,-1,4,-19,-15,-7,-17,2,-15,-9,-2,-4,4,0,-2,-5,-16,-24,-12,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-19,-16,-10,-5,-21,-10,0,-9,-4,-1,-10,-18,-10,-7,-5,-1,4,-22,-4,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-16,-9,-4,-12,-19,-12,-9,-5,-11,-7,-4,-12,-4,-4,6,13,-4,-27,-9,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-14,-19,-16,-8,-6,-24,-14,4,-11,3,3,-14,-19,-9,-12,-9,-3,5,-20,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-25,4,14,-23,-18,-3,-22,10,-18,-12,1,-12,9,12,0,-2,-18,-26,-11,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-33,-26,10,-31,-22,27,-24,22,19,-24,-26,-22,-21,-19,-7,24,-19,1,-25;
MA   /M: M=-5,-9,-22,-11,-5,-12,-21,-13,-2,-7,-2,-2,-8,-14,-6,-7,-6,-2,-2,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-14,-33,-28,1,-32,-28,31,-24,13,12,-25,-25,-25,-23,-14,-4,34,-25,-6,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-32,2,4,-27,-16,-9,-22,-5,-26,-18,-7,43,-4,-11,-4,-7,-25,-30,-21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-23,-1,5,-21,-13,-5,-18,1,-19,-12,1,-3,3,-1,4,-1,-15,-27,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,13,9,-24,-9,-3,-24,5,-23,-15,10,-13,4,2,5,-2,-20,-28,-13,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-22,-15,-7,0,-22,0,-6,-6,-1,2,-10,-21,-2,-4,-10,-8,-7,-15,6,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-17,-23,-18,-6,-25,0,11,-17,4,8,-15,-22,-13,-15,-11,-7,12,-24,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-27,-8,-10,-26,29,-15,-30,-6,-26,-16,0,-10,-9,-4,2,-11,-23,-23,-23,-11;
MA   /M: M=-3,-9,-14,-11,-8,-9,-13,-5,-13,-6,-8,-6,-5,-20,-6,-2,-3,-5,-9,-24,-7,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-20,-33,-26,2,-31,-27,32,-25,21,15,-24,-24,-22,-24,-17,-6,28,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-28,1,-37,-27,43,-28,20,19,-21,-22,-20,-27,-20,-9,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-20,-29,67,-20,-38,-20,-29,-19,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-5,4,-24,-18,-8,-25,27,-24,-10,-2,-3,6,26,-7,-7,-18,-23,-12,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-26,-1,-4,-27,21,-8,-31,1,-27,-15,7,-16,-4,1,1,-11,-25,-25,-20,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-19,-29,65,-19,-39,-19,-29,-19,1,-20,-19,-18,0,-19,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-20,-1,8,-24,-11,-7,-19,5,-20,-12,2,-11,8,1,8,0,-14,-28,-16,7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-20,-3,-6,-13,-14,-4,-9,-3,-13,-7,15,-17,-4,-2,3,7,-10,-29,-10,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-24,-34,-26,-1,-34,-26,36,-23,18,16,-22,-23,-20,-22,-18,-7,28,-22,-3,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-26,0,7,-25,-16,-2,-25,23,-24,-11,7,-14,11,26,-2,-5,-20,-24,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-25,0,12,-22,-16,-3,-20,9,-15,-9,0,-12,10,8,-2,-5,-18,-23,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-24,-35,-25,4,-32,-25,33,-27,24,18,-22,-23,-20,-25,-20,-8,21,-19,-1,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-24,-5,9,-22,-18,-4,-18,10,-16,-5,-2,-13,14,18,-1,-4,-15,-24,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-26,12,20,-27,-15,-1,-25,10,-21,-14,7,-10,14,7,2,-5,-22,-29,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-26,3,12,-20,-19,-7,-16,6,-12,-8,-2,-13,6,2,-5,-6,-14,-23,-11,8;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-12,-13,-11,-2,-17,-11,-9,-13,-9,-8,-2,-15,-11,-12,12,23,-4,-24,-3,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-27,-1,-8,-28,35,-12,-33,-7,-27,-18,7,-16,-9,-7,1,-13,-26,-25,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,1,-22,-18,-11,-15,-23,-3,-15,-7,-6,-16,-21,-18,-18,-1,2,8,-17,-13,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,0,-23,-2,3,-20,-15,-4,-19,10,-19,-9,3,-14,5,12,2,-2,-14,-25,-11,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-36,-29,1,-36,-28,40,-27,20,18,-23,-24,-22,-26,-18,-8,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='B'; M=-11,8,-25,8,6,-22,-15,-2,-19,6,-19,-11,8,-15,7,7,-1,-4,-17,-27,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-27,11,-32,-26,30,-26,17,14,-23,-25,-25,-24,-17,-7,27,-19,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-27,-2,2,-20,-15,-10,-15,-5,-17,-11,-6,13,-3,-9,-2,-5,-16,-26,-15,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,9,13,-27,-12,-7,-25,8,-23,-16,3,1,6,5,0,-4,-22,-28,-17,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-21,8,7,-21,-11,-2,-19,2,-17,-12,5,-5,3,0,1,-3,-16,-25,-12,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-18,5,5,-18,-2,-3,-18,-2,-17,-11,3,-4,1,-3,2,-4,-16,-22,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-16,11,11,-16,-8,-2,-14,1,-12,-10,4,-4,3,-2,2,-2,-13,-19,-9,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: M=-1,-7,-8,-8,-6,-4,-10,-8,-1,-8,0,-1,-6,-10,-7,-8,-4,-3,0,-13,-4,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-3,-18,-2,1,-16,-8,-8,-12,-4,-13,-9,-3,7,-3,-7,0,-3,-11,-20,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-1,-19,-1,0,-19,5,-8,-17,-5,-14,-10,0,-7,-3,-8,1,-4,-13,-21,-14,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-16,3,4,-19,-9,-8,-16,-4,-15,-11,2,-8,-1,-7,5,2,-12,-27,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-7,8,-24,10,8,-26,-6,-6,-25,3,-22,-15,5,-5,2,-1,3,-1,-20,-29,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-23,14,15,-23,-14,-3,-21,1,-19,-14,5,-9,4,-3,3,-2,-18,-31,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-21,1,4,-21,-13,-5,-21,8,-18,-11,2,-15,3,15,-2,-5,-15,-26,-13,2;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-13,-21,-16,-10,-10,-24,-16,5,-8,0,2,-11,-13,-10,-9,-8,0,6,-25,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-13,-32,-27,4,-32,-27,27,-23,15,11,-24,-26,-24,-21,-15,-5,29,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-19,-7,-1,-15,-20,-6,-11,-1,-11,-5,-3,-14,1,0,3,9,-6,-26,-8,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-33,-25,0,-33,-26,34,-25,18,15,-21,-23,-20,-24,-17,-7,26,-22,-3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-18,-8,-2,-13,-17,-10,-11,-3,-13,-8,-3,-12,-2,-2,7,10,-6,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-9,-17,-28,52,-18,-34,-18,-26,-17,0,-18,-17,-18,1,-16,-25,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-23,5,7,-22,-13,-8,-20,0,-19,-15,2,-1,0,-3,5,4,-16,-29,-15,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-28,-4,6,-22,-18,-8,-18,5,-18,-10,-6,9,3,2,-6,-7,-18,-25,-14,3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-25,12,16,-23,-14,-4,-21,1,-17,-14,3,-10,5,-4,0,-5,-18,-26,-13,10;
MA   /M: SY='A'; M=8,0,-18,-4,-2,-23,-2,-10,-17,-4,-17,-9,3,-13,1,-7,4,-4,-13,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-15,-26,-21,-3,-26,-23,20,-19,8,7,-20,-23,-20,-19,-10,-3,24,-24,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-24,4,16,-24,-15,-1,-21,6,-19,-11,2,-11,11,3,-1,-7,-20,-24,-12,13;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-24,-5,5,-20,-16,-2,-16,8,-14,-7,-2,-12,5,6,-3,-5,-13,-24,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=33,-13,-9,-21,-12,-16,-7,-21,-4,-13,-6,-7,-13,-13,-13,-20,4,-1,4,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-25,-8,4,-17,-21,-7,-12,9,-8,-2,-7,-14,6,8,-8,-7,-11,-21,-7,4;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-22,-2,5,-18,-13,-5,-17,2,-14,-9,-1,-14,2,1,-1,-4,-13,-23,-9,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-24,-16,-5,-4,-22,-8,1,-9,7,7,-14,-19,-5,-6,-13,-9,-2,-19,-1,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-24,2,-33,-24,32,-26,25,17,-24,-24,-20,-23,-20,-8,24,-22,-3,-24;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS50823;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=KH;
CC   /VERSION=7;
PR   PRU00117;
DO   PDOC50084;
//