ID   IQ; MATRIX.
AC   PS50096;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   IQ motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX'; LENGTH=30; TOPOLOGY=LINEAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=23;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6543000; R2=0.0183000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1022.9739990; R2=1.1948051; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=265; H_SCORE=1340; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; H_SCORE=1275; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; I=-20; D=-20;
MA   /I: B1=0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,5,-4,-9,-24,6,2,-18,5,-9,-2,-1,3,-15,-16,-8,-9,-23,-6,-11,-7,2,-8;
MA   /I: B1=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,2,-3,-18,4,7,-18,1,-17,-16,3,-9,-20,-13,0,-1,-27,-11,-14,-1,4,-8;
MA   /I: B1=-20;
MA   /M: SY='K'; M=-4,6,1,2,-26,0,0,-11,2,-20,-19,7,-10,-21,-10,-4,-9,-22,-7,-16,1,-2,-8;
MA   /I: B1=-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,-7,-11,-14,-7,-4,-6,-16,-9,-7,-7,-8,-18,-11,5,0,-23,-16,-3,-6,-5,-2;
MA   /I: B1=-40;
MA   /M: SY='A'; M=23,-22,-13,-26,-10,-14,-17,-16,-23,8,0,-17,0,-12,-15,0,0,-22,-13,11,-16,-17,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-19,-15,-24,-16,-18,-20,-27,-25,18,7,-19,5,-3,-18,-2,15,-26,-6,20,-17,-20,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,19,-1,-8,-18,0,-2,-20,-9,-18,-19,21,-8,-19,-16,-5,-2,-21,-7,-11,-4,-2,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-22,-37,-26,-21,-28,-37,-27,41,24,-29,18,5,-22,-21,-9,-18,1,25,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,10,0,0,-30,60,20,-20,10,-20,-20,10,0,-40,-10,0,-10,-20,-10,-30,0,40,-10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-4,-2,-11,-13,-3,-3,-3,-14,-16,-18,0,-12,-21,-10,13,3,-25,-18,-6,-5,-3,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-4,-10,-17,-19,-5,-10,-19,-8,-5,0,-10,-2,2,-20,-2,1,-13,6,-4,-14,-8,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-22,-32,-2,-26,-26,-26,-22,1,2,-24,-2,21,-28,-16,-9,8,8,2,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,70,0,-10,-30,10,0,-20,0,-30,-20,30,-10,-20,-20,-10,-10,-20,-10,-20,-10,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-19,-2,-12,-27,-17,-19,57,-18,-32,-24,-18,-11,-26,-19,-1,-17,-20,-26,-24,-10,-18,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-7,-5,-12,-29,-4,-12,-23,43,-14,-10,-11,-2,6,-25,-15,-15,9,38,-18,-11,-11,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-8,-18,-21,-22,-5,-11,-27,-16,9,18,-9,12,-5,-22,-17,-6,-21,-4,5,-19,-9,-9;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-11,-18,-13,-2,-9,-12,-16,-2,-6,-9,-1,-17,-13,4,4,-22,-14,5,-11,-6,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-19,68,0,-9,-30,10,0,-20,0,-30,-20,30,-10,-20,-19,-10,-10,-20,-10,-20,-9,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,21,3,1,-18,10,8,-18,-4,-25,-22,21,-9,-25,-14,-4,-6,-25,-13,-20,2,8,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,9,1,2,-24,3,8,-15,0,-22,-17,11,-11,-20,-13,-1,-4,-22,-7,-17,2,4,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-14,-19,-25,-23,-15,-21,-26,0,5,5,-15,5,25,-26,-16,-8,9,42,0,-21,-20,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,26,4,-2,-27,14,6,-17,1,-24,-23,27,-6,-26,-13,-4,-6,-23,-9,-20,0,9,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,7,1,1,-25,2,0,-13,-4,-21,-20,9,-9,-18,-11,0,-3,-24,-9,-15,0,0,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,8,-9,-10,-24,0,-3,-16,-7,-6,2,-2,8,-12,-18,-10,-6,-23,-8,-7,-10,-3,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,10,-12,-15,-24,-1,-3,-22,-9,-3,6,2,9,-9,-18,-15,-9,-20,-6,-4,-14,-4,-9;
MA   /I: E1=-50;
MA   /M: SY='R'; M=-2,12,2,-5,-20,6,2,-14,-1,-19,-16,8,-9,-21,-10,-1,-3,-24,-12,-16,-1,3,-7;
MA   /I: E1=-40;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-4,-1,-17,1,6,-7,-1,-12,-8,-1,-5,-7,-9,-3,-6,-10,0,-12,-2,3,-5;
MA   /I: E1=-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,4,-4,-2,-19,-2,0,-16,-1,-7,-1,0,-2,-4,-13,-9,-7,-13,0,-7,-4,-2,-7;
MA   /I: E1=-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,14,6,7,-17,7,7,-9,-1,-18,-16,13,-9,-18,-8,-1,-4,-17,-9,-15,6,6,-6;
MA   /I: E1=-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,1,4,-14,0,3,-2,-6,-15,-16,1,-11,-16,2,5,0,-18,-12,-11,2,0,-3;
MA   /I: E1=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=IQ;
CC   /VERSION=6;
PR   PRU00116;
DO   PDOC50096;
//