ID   PDZ; MATRIX.
AC   PS50106;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   PDZ domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=86;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=81;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1898000; R2=0.0201000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3249.1350098; R2=5.8276424; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; H_SCORE=5370; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=265; H_SCORE=4793; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-22,-6,1,-12,-17,-9,-7,-7,0,-2,-6,-15,-5,-7,-6,-1,-7,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-16,-31,-27,-1,-30,-27,29,-22,14,13,-24,-26,-23,-20,-14,-4,33,-25,-7,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-20,-1,6,-19,-17,-7,-16,1,-13,-10,-1,-11,2,-2,3,6,-11,-28,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-23,10,-30,-20,22,-26,30,17,-25,-26,-20,-20,-23,-9,16,-19,2,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-25,-4,6,-20,-17,-2,-13,-1,-14,-6,-4,-7,7,-2,-5,-7,-13,-25,-11,5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-24,-6,3,-24,-19,-9,-22,25,-20,-7,-4,-10,6,22,-8,-7,-14,-23,-12,3;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-23,3,1,-21,-3,-8,-18,-5,-20,-12,4,-10,-2,-7,5,-2,-14,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-23,4,5,-24,-8,-11,-22,3,-22,-15,1,-1,-1,-2,6,2,-16,-29,-18,1;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-24,0,5,-24,-5,-4,-23,7,-21,-12,4,-13,6,6,1,-5,-18,-26,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-27,-4,-5,-24,26,-11,-30,-6,-25,-16,3,-12,-7,-8,1,-11,-25,-23,-21,-6;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-20,-4,2,-12,-5,-7,-12,-4,-11,-8,-4,-3,-2,-6,-1,-5,-12,-17,-8,-1; D=-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-28,-20,15,-28,-15,12,-23,28,14,-24,-28,-18,-15,-24,-10,6,-7,9,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-20,-35,-26,31,-30,-23,18,-27,19,9,-22,-26,-28,-22,-18,-7,15,-10,9,-26;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-16,-4,0,-18,-10,-9,-15,-4,-18,-11,3,-13,0,-3,14,11,-9,-30,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-31,-24,4,-28,-25,27,-26,23,13,-24,-25,-22,-22,-18,-7,23,-22,-4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-16,-8,-4,-19,-11,-11,-11,-1,-15,-8,-2,-16,-2,-3,4,2,-4,-28,-14,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-26,-6,-6,-23,20,-15,-23,-10,-20,-13,-2,-11,-10,-12,1,-9,-18,-23,-20,-9;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-25,-3,-3,-21,16,-7,-23,-8,-19,-12,2,-16,-5,-7,0,-9,-19,-23,-15,-5; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-23,2,4,-19,-10,-7,-17,5,-17,-11,2,-10,0,3,0,-3,-13,-25,-12,1; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-24,16,5,-25,-1,-3,-24,-2,-22,-17,8,-9,-1,-6,1,-7,-20,-25,-16,2; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-19,0,1,-17,-8,-3,-18,4,-17,-10,4,-13,1,2,0,-4,-14,-22,-9,1; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: M=-4,-4,-19,-4,-2,-17,-3,-9,-13,-4,-12,-7,-3,-5,-3,-5,-2,-5,-11,-21,-13,-4; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-7,-17,-8,-3,-12,-8,3,-7,-4,-8,0,-4,-5,0,-4,-3,-5,-6,-18,-6,-3; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-18,0,2,-13,-7,-6,-11,-1,-10,-7,-2,2,-1,-2,-4,-5,-12,-16,-9,0; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=1,-2,-12,-2,-2,-12,-2,-5,-9,-1,-9,-5,-2,-3,-1,-3,0,-2,-6,-14,-9,-2; D=-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-17,-8,-12,-17,30,-11,-21,-14,-17,-11,-1,-13,-12,-13,2,-8,-16,-17,-17,-13; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-9,-29,-23,-3,-29,-22,22,-22,11,9,-20,-23,-18,-22,-12,-5,22,-24,-6,-23; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-21,-26,-19,23,-28,-12,7,-16,7,4,-18,-25,-18,-13,-13,-4,7,-6,19,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-35,-30,1,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-14,-5,-2,-19,-10,-9,-17,1,-20,-11,3,-13,-1,-2,11,8,-10,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-23,9,8,-23,-7,-3,-26,5,-23,-16,7,-12,3,4,6,-2,-20,-29,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-32,-27,1,-32,-27,31,-23,17,15,-26,-21,-24,-22,-16,-5,33,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-9,-21,-11,-7,-6,-22,-11,0,-9,1,3,-8,-19,-6,-8,-9,-5,0,-23,-4,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-5,-31,0,8,-27,-16,-6,-23,3,-24,-14,-6,27,2,-2,-4,-8,-23,-28,-19,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-28,6,-8,-27,35,-12,-34,-10,-27,-19,8,-16,-11,-11,1,-12,-27,-25,-23,-10;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-15,-7,-10,-23,24,-14,-26,-14,-25,-17,2,-15,-9,-14,14,1,-17,-29,-22,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=4,-15,-27,-13,-6,-19,-15,-17,-10,-9,-13,-7,-14,28,-9,-15,-6,-6,-12,-25,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-12,-20,-11,-18,-3,-20,-6,-12,-8,-8,-11,-11,-11,-19,8,0,2,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=13,3,-21,4,10,-25,-8,-5,-21,-3,-17,-14,-2,-6,1,-11,4,-5,-15,-26,-17,5;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-21,-4,4,-21,-17,-7,-15,9,-12,-5,-3,-14,7,8,-4,-5,-12,-23,-11,5; D=-4;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-11,12,4,-17,-9,-5,-15,-2,-14,-12,3,-8,-1,-4,4,0,-9,-23,-11,1; D=-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=10,-5,-19,-8,-8,-21,25,-13,-23,-8,-18,-13,-1,-11,-9,-12,2,-9,-16,-18,-19,-9; D=-4;
MA   /I: DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-22,-7,-8,-24,18,-12,-27,-1,-22,-13,0,-18,-6,3,-1,-10,-19,-23,-19,-8; D=-4;
MA   /I: DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,30,-29,37,20,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-26,-1,7,-25,-18,7,-23,16,-20,-7,2,-14,16,18,-4,-8,-20,-23,-7,10;
MA   /M: SY='A'; M=5,-15,-22,-15,-5,-17,-19,-18,-2,-7,-9,-5,-14,3,-9,-12,-4,-4,3,-27,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-8,-17,-27,56,-15,-36,-18,-27,-18,2,-20,-17,-18,-1,-18,-28,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-29,66,19,-39,-10,1,-39,0,-29,-29,19,-10,0,-10,1,-9,-29,-39,-19,9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-23,-13,0,-14,-24,-9,-5,2,-7,-1,-11,-17,3,9,-9,-7,-2,-21,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-29,25,18,-23,-23,-21,-27,-20,-9,27,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-16,-27,-20,2,-29,-19,18,-23,25,13,-22,-25,-18,-18,-17,-2,14,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,-2,-21,-3,7,-21,-4,-7,-21,1,-20,-12,0,-11,3,-2,7,-2,-16,-25,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-18,-33,-28,1,-32,-28,34,-23,15,13,-26,-26,-25,-23,-14,-4,37,-25,-6,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,36,-20,22,2,-23,0,7,-23,0,-29,-20,49,-19,0,0,8,-2,-29,-38,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-27,2,-9,-29,38,-11,-34,-12,-28,-19,8,-17,-9,-12,3,-12,-27,-26,-24,-9;
MA   /I: MD=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,-21,-8,-1,-17,-21,-11,-6,2,-10,-4,-6,-15,2,1,-1,3,0,-26,-11,0; D=-2;
MA   /I: MD=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-3,4,-20,7,1,-23,-8,-10,-20,-5,-22,-16,2,7,-4,-10,7,2,-15,-31,-18,-2; D=-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-16,-25,-20,5,-26,-20,18,-20,20,12,-20,-23,-19,-17,-14,0,18,-20,-3,-19; D=-2;
MA   /I: DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-23,-1,9,-20,-15,-6,-17,6,-16,-9,-1,-11,4,8,1,-2,-12,-26,-13,6; D=-2;
MA   /I: DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,8,-24,6,-3,-25,13,-5,-25,-7,-23,-15,12,-15,-5,-9,3,-7,-21,-29,-19,-4; D=-2;
MA   /I: DM=-12;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-20,-18,-24,-17,0,-21,-14,6,-14,8,10,-17,-22,-13,-13,-12,-5,7,-15,-3,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-15,-4,-4,-16,-11,-13,-15,-8,-17,-12,2,-6,-5,-9,14,18,-9,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-9,-26,-11,-5,-10,-22,27,-9,-10,-3,2,-4,-18,1,-4,-11,-11,-11,-22,7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-24,11,14,-23,-16,-2,-20,0,-15,-12,2,-11,6,-1,1,-3,-17,-29,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-27,15,23,-28,-16,-3,-25,6,-20,-15,3,-7,14,3,1,-6,-22,-28,-16,18;
MA   /M: SY='A'; M=25,-17,-8,-23,-16,-12,-12,-21,3,-15,0,-1,-15,-18,-14,-20,1,-1,11,-24,-15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-18,-18,-14,-10,-23,-17,8,-9,0,3,-15,-22,-9,-8,-6,-2,16,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-22,1,7,-23,-12,-7,-18,3,-15,-10,1,-13,5,1,0,-3,-15,-27,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-20,-24,-15,-2,-21,-18,7,-14,9,6,-17,-20,-12,-11,-10,-4,7,-19,-4,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-21,-32,-23,6,-31,-22,26,-27,33,19,-25,-25,-19,-22,-22,-7,17,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-27,-2,6,-24,-19,-6,-22,24,-19,-7,-2,-14,9,26,-6,-7,-15,-23,-11,6;
MA   /M: SY='N'; M=-2,5,-24,3,8,-24,-3,-4,-24,6,-22,-14,9,-11,3,5,3,-5,-21,-28,-17,5;
MA   /M: SY='T'; M=12,-8,-11,-13,-9,-14,-11,-17,-8,-10,-11,-9,-5,-12,-9,-13,12,13,-1,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-27,-6,-6,-23,13,-12,-24,-8,-21,-14,-3,1,-8,-11,0,-8,-20,-25,-19,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-27,5,4,-27,2,-8,-27,4,-27,-16,6,-2,2,0,3,-6,-23,-27,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-23,-3,5,-19,-16,-10,-12,2,-13,-7,-4,-11,-1,-2,-2,-2,-7,-27,-13,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-14,-25,-21,-3,-27,-25,20,-20,14,8,-23,-23,-21,-19,-12,-2,26,-27,-9,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-20,-10,-4,-14,-17,-3,-12,0,-12,-5,-4,-16,0,1,3,7,-6,-24,-5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-30,-21,7,-30,-20,22,-26,36,21,-26,-27,-18,-19,-24,-7,15,-21,-1,-20;
MA   /M: M=-7,-10,-23,-12,-4,-14,-17,-12,-3,-2,-4,0,-8,-18,-4,-5,-7,-3,-1,-24,-9,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-18,-29,-24,1,-30,-24,25,-23,19,12,-23,-24,-20,-21,-14,-2,25,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-18,-12,-4,-14,-17,-13,-5,-7,-3,-1,-7,-15,-2,-8,-2,1,-4,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-28,-8,-2,-17,-20,-1,-19,12,-16,-8,-3,-7,4,25,-7,-6,-16,-21,-6,-2;
MA   /M: M=-8,-3,-26,-1,-4,-17,-10,-11,-16,-4,-13,-9,-3,-3,-5,-2,-6,-8,-13,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-28,4,6,-26,-6,-2,-26,5,-23,-14,2,-2,5,4,-1,-7,-22,-26,-15,4;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS51865;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PDZ;
CC   /VERSION=7;
PR   PRU00143;
DO   PDOC50106;
//