ID   DS_RBD; MATRIX.
AC   PS50137;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5994000; R2=0.0242763; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2441.8774414; R2=4.2387094; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=285; H_SCORE=3650; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; H_SCORE=3298; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,24,-22,20,4,-20,-9,7,-24,-2,-24,-18,27,-15,0,-3,7,2,-23,-34,-13,2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-26,-17,-10,-14,-17,-14,-11,-12,-17,-11,-18,31,-12,-18,-8,-8,-15,-15,-7,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-20,-20,-13,-12,-27,-20,7,3,-2,6,-15,-16,-10,-4,-13,-5,10,-24,-8,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-19,1,2,-23,-4,-10,-21,0,-20,-12,3,-14,0,0,6,1,-15,-29,-17,0;
MA   /M: M=-1,-13,-22,-14,-3,-10,-15,-13,-9,-1,-4,-2,-11,-14,-3,0,-7,-6,-6,-20,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-22,8,-30,-21,23,-28,42,21,-29,-29,-20,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-23,-2,-1,-14,-15,9,-10,-4,-10,-1,13,-19,8,-3,-3,-6,-17,-23,-2,2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-26,9,28,-26,-16,-4,-23,7,-18,-13,-1,-7,14,0,2,-6,-21,-26,-14,20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-16,-30,-23,23,-28,-14,4,-22,13,3,-23,-29,-21,-18,-21,-10,0,8,22,-22;
MA   /M: SY='A'; M=6,-13,-2,-19,-12,-10,-12,-16,-8,-11,-5,-2,-9,-19,-11,-12,-3,-4,-4,-25,-13,-11;
MA   /I: MD=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-25,-1,13,-27,-12,2,-21,8,-17,-6,1,-11,26,11,-1,-5,-22,-21,-11,18; D=-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-25,-7,2,-16,-15,-4,-16,14,-15,-3,-2,-15,4,12,-5,-6,-13,-20,-5,2; D=-4;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-1,-15,-16,1,-13,2,-8,-4,-3,-17,1,5,-7,-5,-12,-22,-4,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-27,-4,-3,-19,-3,-9,-21,4,-14,-10,-2,-18,-1,6,-7,-10,-18,-14,-10,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-17,-24,-20,-11,-1,-21,-14,-1,-9,-3,1,-12,-7,-8,-5,-13,-9,-4,-19,-6,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-23,-4,0,-19,-11,-4,-15,-5,-12,-8,0,-11,0,-4,1,2,-13,-27,-12,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-14,-20,-15,-13,-22,-19,-1,-17,-2,-2,-21,10,-17,-19,-14,-8,-1,-24,-15,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-22,4,9,-19,-17,-1,-15,0,-16,-10,8,-12,5,-2,4,4,-14,-29,-12,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-25,-21,42,-29,5,-1,-16,3,-1,-20,-29,-19,-13,-19,-10,-8,23,58,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-27,4,13,-22,-15,-7,-22,13,-15,-11,-1,-13,4,11,-5,-6,-17,-24,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-22,-15,-11,-2,-27,-16,8,-17,13,5,-17,-22,-12,-16,-14,-3,6,-18,-1,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-15,-12,-18,-13,-8,-26,-19,7,-12,3,1,-13,-21,-13,-11,-7,0,10,-26,-7,-14;
MA   /I: MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-24,3,10,-24,-15,-6,-17,1,-18,-12,-1,0,6,-4,3,-3,-15,-28,-15,7; D=-4;
MA   /I: MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-20,6,15,-20,-12,-3,-16,6,-13,-9,1,-7,10,2,-1,-3,-15,-20,-11,12; D=-4;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-15,-6,0,-14,-11,-11,-9,-6,-11,-8,-3,-1,-3,-6,7,8,-5,-24,-13,-2; D=-4;
MA   /I: DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-22,-5,-11,-22,38,-13,-28,-13,-23,-16,5,-15,-12,-12,4,-8,-21,-21,-22,-12; D=-4;
MA   /I: DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-8,-26,-5,1,-21,-11,-12,-14,-7,-16,-11,-7,24,-4,-11,-3,-4,-16,-26,-19,-3; D=-4;
MA   /I: DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=5,-3,-22,-1,1,-23,-4,-12,-17,-6,-20,-14,-3,1,-5,-12,5,-3,-11,-29,-20,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-13,2,-27,-1,-4,-20,-3,41,-25,-6,-18,-5,10,-19,2,-1,-5,-13,-25,-28,0,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-18,1,3,-24,-13,-6,-22,1,-19,-12,0,-3,3,2,2,-1,-18,-29,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-26,-6,5,-24,-20,-2,-18,6,-20,-8,-5,10,8,5,-7,-9,-19,-25,-13,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-6,2,-19,-11,-6,-17,6,-16,-8,-1,-13,3,12,-1,-3,-13,-24,-11,1;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-14,-35,-27,59,-29,-16,-2,-27,5,-2,-19,-29,-33,-19,-17,-8,-1,8,26,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-19,-20,-13,-6,-26,-16,8,-12,7,6,-14,-19,-10,-12,-5,9,9,-24,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,7,-28,-22,5,-24,-18,4,-19,1,5,-19,-25,-20,-19,-10,-4,9,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-10,-4,10,-21,-20,-4,-18,1,-17,-10,-2,-13,7,-1,2,0,-15,-27,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,13,-29,-25,-4,-28,-25,12,-22,11,7,-25,-30,-24,-20,-14,-5,21,-30,-12,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-23,-11,-3,-8,-22,-13,-6,-1,-8,-4,-8,-16,-5,1,-4,-1,-3,-19,-6,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-18,-29,-25,1,-27,-25,25,-22,14,12,-21,-24,-22,-21,-11,-1,27,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-8,10,-24,12,2,-26,13,-7,-30,-6,-27,-20,10,-9,-4,-10,2,-9,-26,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-26,0,-2,-27,14,-12,-24,-8,-22,-14,0,-7,-3,-11,2,-8,-19,-26,-21,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-9,-24,-12,-2,-12,-21,-8,-7,0,-9,-4,-5,-13,2,2,-4,-2,-7,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-22,-6,5,-16,-17,-13,-12,-2,-14,-9,-4,-6,-1,-6,2,6,-9,-23,-13,1;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-19,-18,-15,22,-23,-4,2,-13,5,1,-15,-19,-16,-11,-14,-7,0,0,23,-16; D=-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-6,-9,-8,-18,6,-16,-19,-11,-18,-14,-6,-1,-11,-14,3,-3,-13,-23,-19,-10; D=-3;
MA   /I: DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-22,-7,4,-16,-19,-3,-13,1,-13,-6,-5,-11,0,3,1,3,-7,-26,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-24,-12,-14,-24,41,-19,-28,-16,-22,-16,-4,-17,-17,-19,2,-12,-18,-21,-25,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-14,-4,-2,-15,-16,-8,-11,-6,-15,-9,1,-16,-4,-8,5,4,-7,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-25,-9,-15,-27,49,-18,-33,-16,-27,-19,1,-18,-15,-16,6,-12,-24,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-18,-8,-5,-16,-13,-10,-17,-2,-20,-12,0,-1,-4,1,8,9,-12,-28,-13,-6;
MA   /M: SY='S'; M=1,12,-15,4,-2,-19,-2,-5,-19,-5,-27,-18,23,-13,-1,-5,24,15,-15,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-26,-5,4,-24,-21,-8,-23,34,-22,-7,-3,-13,7,24,-10,-9,-16,-20,-7,5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,0,12,-30,-18,-7,-29,39,-27,-10,0,-11,15,29,-8,-10,-22,-21,-11,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-23,7,11,-21,-19,-8,-12,-2,-11,-10,-2,-13,1,-6,-1,-3,-8,-29,-14,5;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-11,-18,-9,-20,1,-19,-12,-10,-13,-11,-8,-9,-9,-19,12,1,-2,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-29,0,14,-29,-14,-4,-28,29,-25,-11,0,-10,14,21,-5,-10,-22,-22,-12,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-24,-5,2,-24,-12,3,-15,3,-16,-6,6,-15,16,5,1,-5,-17,-25,-11,8;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-22,1,-1,-17,-15,-1,-13,-2,-10,-7,6,-17,-1,1,-2,-3,-12,-27,-9,-2;
MA   /M: SY='A'; M=41,-12,4,-22,-13,-19,-5,-22,-10,-13,-10,-10,-12,-14,-13,-21,7,-1,1,-24,-21,-13;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-7,-20,-11,-20,-1,-20,-11,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,0,0,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-7,5,-17,-20,-7,-12,8,-9,-2,-8,-15,3,6,-7,-5,-8,-21,-9,3;
MA   /M: SY='B'; M=-7,7,-24,7,6,-21,-15,-6,-18,5,-14,-10,5,-15,3,4,-2,-5,-16,-28,-13,4;
MA   /M: SY='A'; M=24,-18,-15,-26,-17,-3,-13,-19,4,-16,3,2,-16,-17,-15,-20,-3,-3,7,-17,-8,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-13,-30,-23,9,-30,-19,17,-25,30,15,-28,-30,-21,-19,-24,-8,15,-15,4,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,5,-28,7,15,-28,-18,-1,-23,14,-19,-9,4,-12,19,16,-4,-7,-21,-25,-13,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-7,-26,-7,1,-14,-23,-5,-6,3,-8,-3,-8,-16,4,-2,-9,-9,-7,-16,3,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-20,9,-29,-19,18,-25,38,21,-27,-28,-18,-18,-26,-9,10,-16,1,-19;
MA   /M: M=-7,-7,-24,-7,-6,-8,-11,-7,-10,-6,-6,-4,-7,-19,-7,-7,-8,-9,-7,-20,-4,-7;
MA   /M: M=-8,-5,-22,-7,-3,-17,-12,-1,-14,-2,-10,-4,-3,-14,-1,0,-5,-4,-13,-23,-7,-3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=DRBM;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00266;
DO   PDOC50137;
//