ID RNASE_3_2; MATRIX. AC PS50142; DT 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE Ribonuclease III family domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2496000; R2=0.0182516; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6947.5546875; R2=6.2195892; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=453; H_SCORE=9765; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=343; H_SCORE=9081; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='L'; M=-6,-24,-19,-27,-20,8,-26,-21,17,-25,21,9,-20,-24,-19,-20,-12,-3,13,-22,-2,-20; MA /M: SY='N'; M=1,9,-20,7,8,-24,-10,-7,-23,11,-25,-16,12,-11,3,3,10,4,-17,-30,-16,5; MA /M: SY='R'; M=-2,-1,-23,-6,-1,-18,-15,8,-20,9,-18,-8,4,-15,6,10,-1,-2,-17,-20,-1,1; MA /M: SY='L'; M=-13,-30,-22,-35,-25,29,-32,-22,20,-30,32,14,-25,-28,-26,-22,-25,-10,11,-11,9,-25; MA /M: SY='E'; M=-13,-5,-25,-3,9,0,-23,-8,-11,-4,0,-1,-9,-16,-1,-6,-12,-10,-12,-19,-3,5; MA /M: SY='E'; M=-10,3,-28,7,30,-27,-18,-3,-29,20,-23,-16,1,-7,14,20,0,-7,-24,-27,-16,21; MA /M: SY='K'; M=-12,8,-27,7,8,-28,-17,-2,-26,23,-25,-11,8,-13,15,21,-2,-3,-22,-25,-12,11; MA /M: SY='I'; M=-11,-28,-25,-32,-25,9,-34,-17,28,-25,25,15,-24,-26,-19,-22,-22,-9,17,-11,15,-25; MA /M: SY='G'; M=-7,0,-28,-1,-13,-18,37,-4,-33,-16,-25,-17,7,-20,-15,-15,-2,-16,-27,-22,-18,-14; MA /M: SY='Y'; M=-13,-23,-25,-26,-21,10,-30,2,16,-19,15,15,-20,-26,-13,-16,-20,-10,8,-6,27,-20; MA /M: SY='R'; M=-10,-9,-23,-12,-7,-3,-10,-1,-20,-1,-16,-8,-2,-18,-3,6,-1,0,-15,-19,-3,-5; MA /M: SY='F'; M=-14,-22,-25,-27,-23,26,-30,-22,13,-24,6,3,-18,-13,-27,-22,-16,-9,9,-12,6,-25; MA /M: SY='N'; M=-6,20,-21,10,3,-23,-6,0,-23,12,-30,-17,33,-15,3,6,11,1,-23,-34,-17,3; MA /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; MA /M: SY='D'; M=-7,22,-26,24,15,-28,-10,6,-27,-1,-25,-20,19,0,2,-7,2,-7,-27,-34,-18,8; MA /M: SY='W'; M=-15,-18,-16,-20,-10,-10,-24,-10,-14,0,-11,-6,-15,-23,2,6,-17,-14,-16,13,5,-5; MA /M: SY='E'; M=-1,2,-25,2,22,-25,-16,-4,-18,5,-12,-9,0,-10,16,-1,-2,-8,-20,-25,-15,19; MA /M: SY='L'; M=-13,-28,-24,-31,-23,19,-32,-15,20,-26,31,14,-25,-28,-20,-20,-25,-10,9,-8,18,-23; MA /M: SY='L'; M=-13,-27,-22,-28,-22,22,-30,-9,13,-23,28,11,-26,-30,-20,-17,-24,-9,6,-3,26,-22; MA /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,0,6,-22,-21,-1,-17,7,-14,-7,-5,-4,3,1,-6,-3,-13,-27,-10,3; MA /M: SY='Q'; M=-4,-3,-25,-5,11,-22,-19,-5,-10,1,-7,-3,-2,-13,17,-2,-5,-8,-15,-24,-11,14; MA /M: SY='A'; M=40,-11,-12,-19,-9,-19,-4,-18,-8,-10,-5,-6,-11,-12,-5,-18,6,-2,-1,-20,-17,-7; MA /M: SY='F'; M=-11,-25,-18,-29,-21,29,-27,-19,8,-27,26,8,-21,-27,-24,-18,-17,-3,5,-13,7,-21; MA /M: SY='T'; M=-1,-5,-14,-14,-14,-9,-21,-20,1,-13,-7,-5,-1,-14,-12,-13,12,30,7,-30,-10,-14; MA /M: SY='H'; M=-12,2,-26,1,-2,-21,-8,55,-27,-10,-24,-8,12,-10,4,-5,1,-11,-27,-32,2,-2; MA /M: SY='N'; M=8,6,-9,-4,-6,-20,-7,-9,-18,-4,-21,-15,14,-9,-5,-4,9,4,-15,-31,-19,-6; MA /M: SY='S'; M=8,-2,-14,0,10,-20,-8,-11,-16,-7,-22,-16,2,-10,1,-10,23,9,-7,-35,-19,5; MA /M: SY='Y'; M=1,-15,-22,-17,-11,-3,-17,-2,-4,-10,-4,4,-13,-8,-4,-12,-5,-4,-7,-9,13,-9; MA /M: SY='A'; M=5,-9,-20,-13,-11,-15,-13,-16,1,-14,-3,1,-7,-15,-6,-16,1,1,0,-25,-12,-9; MA /M: SY='N'; M=-3,18,-20,9,-3,-20,1,-3,-19,-7,-22,-17,27,-11,-5,-8,8,1,-21,-34,-19,-4; MA /M: SY='E'; M=-6,7,-26,6,18,-25,-16,-3,-16,8,-17,-6,6,-10,12,1,-2,-8,-18,-27,-14,14; MA /M: SY='H'; M=-15,-3,-27,-5,-2,-10,-19,41,-22,-2,-17,-4,5,-20,9,8,-5,-11,-22,-19,13,1; MA /M: SY='N'; M=-9,14,-22,7,0,-17,-7,-4,-13,-4,-11,-10,20,-20,-5,-5,-3,-6,-16,-32,-15,-3; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-15; MD=-15; MA /M: SY='Y'; M=-12,-5,-18,-3,-8,11,-16,10,-4,-5,-3,-3,-8,-16,-5,-6,-10,-6,-8,11,38,-9; D=-4; MA /I: DM=-22; MA /M: SY='E'; M=-12,16,-29,21,34,-34,-16,5,-27,7,-23,-15,9,-7,29,2,1,-9,-30,-29,-17,31; MA /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,3,-23,-20,12,-29,23,-20,-8,1,-19,17,55,-9,-11,-22,-21,-7,5; MA /I: I=-10; MI=-10; IM=-10; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,15,-29,-19,18,-29,45,21,-28,-29,-20,-19,-28,-10,9,-17,3,-20; MA /M: SY='E'; M=-10,13,-29,20,54,-29,-18,1,-29,9,-21,-20,6,-2,18,0,1,-9,-30,-31,-20,36; MA /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-37,-28,64,-30,-21,4,-28,9,1,-18,-27,-35,-20,-17,-5,3,3,23,-28; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-21,9,-30,-16,22,-26,38,22,-27,-28,-18,-19,-26,-9,13,-17,5,-20; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='D'; M=-19,45,-30,63,19,-39,-11,-1,-39,5,-30,-28,18,-10,1,-6,-1,-10,-29,-38,-19,10; MA /M: SY='A'; M=23,-2,-1,-9,-7,-20,-2,-14,-17,-10,-21,-16,4,-13,-7,-15,20,7,-8,-32,-21,-7; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-36,-28,20,-33,-26,28,-27,20,13,-24,-27,-27,-23,-19,-7,25,-16,4,-28; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,14,-31,-21,21,-29,42,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,13,-18,2,-22; MA /M: SY='B'; M=-5,17,-24,16,6,-28,-4,-3,-27,7,-27,-18,17,-13,5,4,7,-3,-23,-31,-18,5; MA /M: SY='Y'; M=-14,-22,-23,-25,-19,29,-26,-5,2,-15,10,7,-18,-26,-17,-12,-17,-8,-2,1,30,-18; MA /M: SY='V'; M=0,-17,-21,-21,-15,-2,-16,-5,4,-16,-1,4,-14,-20,-14,-16,-8,-5,7,-18,1,-15; MA /M: SY='I'; M=0,-21,-18,-28,-23,-4,-27,-24,24,-20,7,11,-17,-20,-17,-21,-5,5,24,-25,-7,-22; MA /M: SY='T'; M=17,-5,-10,-12,-9,-15,-10,-18,-9,-11,-13,-11,-3,-11,-9,-14,19,25,1,-29,-15,-9; MA /M: SY='K'; M=-11,-1,-27,0,7,-21,-20,-7,-16,12,-11,-7,0,-15,6,12,-7,-8,-14,-25,-11,5; MA /M: SY='Y'; M=-4,-15,-22,-18,-12,6,-23,-7,1,-9,-4,-2,-12,-20,-11,-12,-5,-1,0,-7,18,-13; MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-23,7,-33,-23,28,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,18,-21,-1,-23; MA /M: SY='F'; M=-18,-25,-25,-31,-25,47,-30,-4,6,-21,8,6,-20,-28,-24,-16,-20,-10,0,13,45,-25; MA /M: SY='H'; M=-11,-2,-26,-3,8,-14,-19,15,-17,0,-10,-4,1,-16,10,0,-5,-9,-19,-24,-3,9; MA /M: SY='K'; M=-11,0,-26,1,4,-23,-19,6,-24,19,-19,-8,1,-14,7,17,-4,-4,-18,-25,-6,4; MA /M: SY='F'; M=-17,-23,-24,-27,-21,41,-27,-3,-2,-17,5,0,-18,-28,-21,-10,-16,-8,-5,10,41,-21; MA /M: SY='P'; M=-9,-19,-35,-11,-2,-25,-19,-18,-17,-9,-22,-16,-17,64,-9,-13,-8,-8,-24,-29,-25,-9; MA /M: SY='D'; M=-15,16,-29,21,13,-33,-16,2,-30,16,-25,-14,10,-13,19,18,-3,-9,-26,-28,-14,15; MA /M: SY='Y'; M=-2,-15,-14,-19,-13,-2,-22,-7,-1,-9,4,4,-15,-21,-6,-10,-9,0,-1,-12,10,-10; MA /M: SY='N'; M=-7,10,-24,9,2,-25,-4,4,-25,-4,-26,-17,15,-4,3,-2,9,1,-23,-33,-16,1; MA /M: SY='E'; M=-7,4,-26,10,39,-25,-19,-6,-23,3,-19,-17,-3,3,10,-4,4,-1,-21,-31,-19,24; MA /M: SY='G'; M=-2,-13,-28,-13,-21,-22,52,-18,-30,-19,-24,-15,-5,-22,-20,-19,-3,-17,-20,-17,-20,-21; MA /M: SY='E'; M=-8,2,-24,7,19,-24,-20,-7,-15,3,-12,-9,-4,-12,10,-3,-2,-6,-11,-29,-14,14; MA /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-18,22,-28,45,25,-28,-28,-18,-20,-28,-10,11,-20,0,-20; MA /M: SY='S'; M=2,4,-13,-2,-4,-16,-9,-3,-17,-9,-22,-15,12,-12,-3,-8,26,26,-10,-36,-13,-4; MA /M: SY='R'; M=-6,0,-23,-3,-4,-7,-16,-8,-21,6,-16,-12,2,-17,-5,16,-3,-3,-14,-20,-7,-5; MA /M: SY='L'; M=1,-16,-18,-22,-16,0,-20,-12,8,-18,20,14,-15,-22,-12,-15,-13,-3,3,-19,0,-14; MA /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-11,-2,-19,-21,-5,-24,28,-18,-8,-3,-20,6,55,-10,-9,-13,-21,-10,-2; MA /M: SY='A'; M=15,-3,-15,-9,-6,-18,-6,-12,-9,-6,-16,-7,4,-13,-4,-10,15,5,-5,-30,-16,-5; MA /M: SY='K'; M=4,-2,-20,-7,1,-15,-14,-12,-15,8,-18,-10,2,-12,-2,0,5,3,-10,-24,-11,-1; MA /M: SY='L'; M=-12,-22,-24,-25,-15,11,-30,-12,15,-20,19,12,-20,-23,-14,-17,-18,-5,6,-11,14,-16; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30; MA /M: SY='S'; M=-4,1,-10,-3,-3,-21,-4,-7,-25,4,-27,-17,11,-17,0,12,14,3,-17,-33,-18,-3; MA /M: SY='N'; M=-9,22,-25,17,15,-26,7,1,-28,-1,-27,-21,28,-13,2,-4,5,-7,-30,-33,-22,9; MA /M: SY='E'; M=-3,0,-2,0,6,-25,-5,-12,-28,-2,-22,-18,-1,-10,-4,-6,0,-6,-20,-31,-22,0; MA /M: SY='T'; M=-3,3,-17,-5,-5,-15,-16,-10,-4,-8,-13,-8,9,-16,-3,-9,9,12,-2,-32,-14,-4; MA /M: SY='L'; M=-6,-29,-21,-32,-22,11,-29,-22,21,-29,38,16,-26,-27,-21,-22,-25,-9,12,-18,1,-22; MA /M: SY='A'; M=17,-4,-19,-9,-8,-13,-10,-9,-9,-5,-12,-9,-3,-15,-7,-12,3,-2,-6,-16,-2,-9; MA /M: SY='R'; M=-11,-4,-28,-3,8,-22,-14,9,-22,11,-19,-8,-1,-14,13,14,-4,-10,-21,-20,-3,9; MA /M: SY='L'; M=-11,-31,-26,-35,-26,11,-31,-24,21,-26,23,14,-27,-27,-21,-22,-26,-12,12,7,6,-24; MA /M: SY='A'; M=24,-10,-16,-15,-13,-22,20,-19,-18,-14,-18,-13,-5,-15,-13,-18,10,-3,-7,-24,-22,-13; MA /M: SY='R'; M=-12,-13,-26,-16,-6,-8,-25,-12,-4,9,-7,2,-9,-17,-3,15,-11,-5,-2,-20,-5,-6; MA /M: SY='K'; M=-12,-6,-26,-4,4,-13,-23,-5,-11,8,-5,0,-9,-17,3,6,-12,-9,-9,-18,0,3; MA /M: SY='Y'; M=-15,-27,-14,-31,-24,24,-28,-11,3,-23,15,7,-25,-30,-21,-18,-25,-12,-3,14,25,-22; MA /M: SY='G'; M=-6,8,-28,6,8,-28,22,-7,-32,-2,-27,-19,14,-14,-2,-6,2,-12,-29,-27,-23,3; MA /M: SY='L'; M=-13,-31,-25,-36,-26,24,-32,-23,21,-29,27,12,-26,-27,-25,-23,-26,-11,10,0,9,-25; MA /M: SY='H'; M=-6,4,-30,7,0,-29,4,10,-28,-8,-26,-15,5,5,0,-11,-2,-12,-27,-29,-16,-2; MA /M: SY='E'; M=-12,7,-31,14,23,-32,-18,-4,-30,22,-26,-15,1,0,14,14,-5,-10,-26,-26,-16,18; MA /M: SY='Y'; M=-16,-18,-15,-22,-18,24,-27,3,-6,-13,1,-1,-15,-26,-16,-10,-15,-6,-7,0,31,-18; MA /M: SY='L'; M=-4,-28,-20,-32,-23,10,-29,-22,22,-26,30,17,-25,-26,-21,-21,-21,-8,16,-18,0,-22; MA /M: SY='Q'; M=-9,-16,-26,-17,-7,-13,-24,-13,-3,1,-2,1,-13,-19,3,2,-12,-9,-4,-8,-4,-2; MA /M: SY='L'; M=-2,-19,-19,-22,-15,-2,-23,-8,8,-22,21,8,-16,-22,-13,-17,-11,-1,4,-24,-3,-15; MA /M: SY='G'; M=-1,0,-20,-4,-4,-20,15,-11,-22,-10,-21,-11,6,-14,-6,-11,11,5,-17,-29,-19,-5; MA /M: SY='P'; M=-8,-11,-11,-12,-10,-6,-19,-12,-14,-8,-18,-12,-6,6,-12,-12,-2,-3,-12,-24,-7,-12; MA /M: SY='G'; M=6,-6,-24,-4,-10,-24,23,-17,-25,-15,-18,-15,-4,-7,-13,-18,2,-9,-19,-25,-23,-12; MA /M: SY='E'; M=10,-5,-21,-4,16,-20,-7,-12,-15,-5,-8,-10,-9,-11,-1,-12,-1,-7,-10,-25,-18,7; MA /M: SY='L'; M=-10,-15,-26,-16,1,-9,-27,-12,7,-8,13,11,-15,-17,0,-9,-16,-10,-1,-22,-6,-1; MA /M: SY='K'; M=-8,-4,-13,-3,-1,-18,-20,-9,-21,16,-15,-9,-6,-18,-2,11,-10,-9,-14,-20,-4,-2; MA /M: SY='D'; M=-10,17,-22,21,10,-25,-13,15,-27,-4,-23,-17,13,-12,2,-6,9,5,-21,-35,-10,5; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='G'; M=-2,-5,-25,-9,-7,-19,6,-9,-19,1,-18,-6,-1,-15,0,-3,-6,-11,-18,-2,-10,-3; D=-1; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='G'; M=-4,-11,-7,-15,-17,-14,8,-17,-8,-19,-8,-6,-3,-20,-15,-18,-3,-8,-7,-25,-16,-17; D=-1; MA /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; MA /M: SY='Y'; M=-11,-8,-22,-14,-10,4,-20,-7,-1,2,-6,-1,-2,-17,-7,3,-10,-7,-4,-10,7,-10; D=-1; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='R'; M=-10,-1,-26,3,8,-21,-1,-7,-25,7,-14,-12,-1,-13,1,12,-6,-11,-20,-22,-15,4; D=-1; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='R'; M=-5,-6,-19,-6,-1,-18,-13,-8,-18,14,-20,-10,0,-14,2,22,6,1,-8,-25,-12,-1; D=-1; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='E'; M=-9,-7,-26,-5,9,-19,-21,-10,-10,-3,-10,-7,-7,4,2,-3,-7,-7,-10,-28,-16,4; MA /M: SY='K'; M=-5,3,-23,1,5,-25,-12,-7,-26,25,-29,-14,9,-12,6,18,7,0,-18,-28,-14,5; MA /M: SY='I'; M=-4,-23,-21,-29,-21,5,-28,-22,17,-19,14,8,-18,-22,-18,-13,-13,-2,14,-19,-2,-21; MA /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-32,-24,6,-31,-16,28,-23,26,24,-24,-25,-16,-20,-22,-9,18,-16,7,-22; MA /M: SY='A'; M=36,-9,-14,-16,-11,-22,14,-19,-17,-12,-16,-13,-6,-12,-11,-19,11,-2,-7,-22,-22,-11; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='V'; M=2,-16,-6,-23,-19,-7,-23,-22,11,-17,1,6,-13,-19,-15,-18,1,11,16,-28,-10,-18; MA /M: SY='F'; M=-12,-29,-19,-33,-26,36,-30,-19,13,-26,20,8,-25,-30,-29,-19,-20,-8,14,-6,17,-26; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-15,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-14,-12,-5,-10,-8,-17,17,8,-2,-25,-19,-8; MA /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-26,-20,7,-27,-10,17,-19,18,18,-20,-25,-13,-17,-15,-6,11,-13,13,-18; MA /M: SY='I'; M=-2,-28,-23,-34,-26,0,-32,-27,35,-26,21,15,-23,-23,-21,-25,-17,-7,27,-22,-4,-26; MA /M: SY='G'; M=4,-11,-14,-13,-20,-28,54,-21,-36,-20,-27,-19,-3,-21,-20,-21,0,-17,-25,-23,-29,-20; MA /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,12,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12; MA /M: SY='I'; M=-9,-28,-9,-34,-26,2,-33,-24,27,-28,27,18,-25,-27,-20,-24,-22,-9,18,-24,-4,-25; MA /M: SY='Y'; M=-15,-22,-25,-26,-21,27,-28,0,8,-17,9,9,-19,-27,-15,-15,-17,-8,0,7,41,-20; MA /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-20,-4,1,-29,-17,12,-22,33,12,-23,-23,-12,-17,-23,-10,3,-22,-4,-8; MA /M: SY='D'; M=-18,46,-28,64,18,-38,-9,-1,-38,-1,-30,-29,19,-10,0,-10,3,-8,-28,-40,-20,9; MA /M: SY='S'; M=3,-4,-17,-4,-6,-18,-3,-11,-11,-11,-12,-4,-2,-16,-3,-12,10,2,-6,-30,-16,-5; MA /M: SY='G'; M=-3,-6,-31,-3,-11,-32,46,-16,-36,-15,-29,-19,-1,-7,-10,-16,-1,-17,-30,-22,-27,-11; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=K_Hofmann; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=RNase III; CC /VERSION=5; PR PRU00177; DO PDOC00448; //