ID RECA_3; MATRIX. AC PS50163; DT 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE RecA family profile 2. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2684000; R2=0.0182430; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3572.6193848; R2=6.9172578; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=481; H_SCORE=6900; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=372; H_SCORE=6146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='G'; M=5,-8,-24,-9,-15,-27,50,-18,-34,-17,-28,-19,1,-17,-15,-18,9,-9,-24,-24,-27,-15; MA /M: SY='V'; M=8,-23,-14,-26,-24,-7,-11,-24,13,-17,3,8,-21,-24,-21,-19,-6,-4,26,-26,-13,-23; MA /M: SY='M'; M=-5,-20,-19,-26,-19,-2,-19,-9,13,-14,14,31,-19,-17,-8,-14,-13,-4,10,-21,-2,-14; MA /M: SY='F'; M=-19,-28,-22,-36,-28,67,-26,-14,-1,-26,7,-1,-19,-30,-34,-18,-19,-10,-2,12,35,-28; MA /M: SY='G'; M=5,-8,-25,-12,-16,-24,37,-15,-24,-16,-18,-11,0,-19,-13,-17,-1,-14,-19,-22,-22,-15; MA /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; MA /M: SY='N'; M=-9,23,-21,20,2,-16,-7,-2,-23,-5,-25,-20,25,-11,-4,-6,10,1,-22,-34,-15,-1; MA /M: SY='P'; M=-5,-13,-34,-7,0,-29,-10,-16,-22,-7,-29,-18,-10,56,-5,-15,-3,-7,-27,-29,-26,-6; MA /M: SY='E'; M=-11,4,-30,9,37,-28,-21,-4,-26,21,-21,-15,-1,-5,15,12,-5,-10,-24,-26,-15,25; MA /M: SY='T'; M=-3,-2,-16,-8,-5,-16,-21,-18,-13,8,-15,-9,-2,-11,-5,2,9,27,-3,-27,-10,-5; MA /M: SY='T'; M=-3,-9,-19,-12,-9,-15,-21,-21,-9,-11,-14,-11,-9,19,-12,-14,8,27,-5,-30,-16,-12; MA /M: SY='T'; M=-3,-14,-21,-20,-14,-10,-23,-20,6,-15,-4,2,-11,3,-12,-17,1,15,4,-27,-11,-15; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='N'; M=-12,9,-26,2,-2,-21,-5,15,-23,6,-23,-11,20,-18,2,12,-1,-8,-23,-29,-10,-2; MA /M: SY='A'; M=28,-15,-14,-24,-16,-13,-13,-23,6,-15,-2,-2,-13,-14,-14,-21,3,3,11,-22,-14,-16; MA /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-28,-20,5,-20,-18,15,-27,38,21,-26,-28,-18,-19,-26,-11,7,-20,-3,-19; MA /M: SY='K'; M=8,-5,-25,-8,2,-27,-14,-14,-23,25,-23,-11,-5,-1,2,11,-4,-7,-15,-21,-15,2; MA /M: SY='F'; M=-19,-20,-23,-27,-20,40,-26,19,-6,-22,2,6,-11,-26,-20,-13,-17,-13,-8,-6,23,-19; MA /M: SY='Y'; M=-2,-17,-23,-20,-17,20,-21,4,-4,-12,-4,-4,-15,-24,-12,-13,-8,-5,-7,11,44,-17; MA /M: SY='S'; M=25,-4,-6,-8,-5,-20,-1,-14,-16,-11,-22,-16,2,-11,-5,-14,27,12,-6,-33,-20,-5; MA /M: SY='S'; M=13,0,-10,-4,-4,-18,-6,-14,-16,-10,-21,-16,4,-10,-4,-12,29,24,-6,-34,-17,-4; MA /M: SY='V'; M=-4,-14,-15,-16,-19,-6,-26,-22,13,-16,3,4,-16,-21,-18,-16,-3,11,23,-29,-9,-19; MA /M: SY='R'; M=-18,-9,-28,-10,-1,-19,-20,-2,-28,26,-19,-10,0,-19,8,62,-7,-4,-18,-21,-10,-1; MA /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-32,-23,6,-30,-20,26,-26,36,24,-27,-27,-18,-20,-25,-9,17,-21,-1,-21; MA /M: SY='D'; M=-11,12,-26,20,14,-15,-13,-5,-22,-5,-13,-14,1,-13,-2,-10,-3,-8,-19,-25,-8,6; MA /M: SY='I'; M=-5,-29,-20,-33,-27,5,-32,-27,31,-26,23,15,-25,-26,-23,-23,-18,-7,28,-22,-3,-27; MA /M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-12,-2,-19,-22,-4,-22,27,-17,-7,-2,-19,7,55,-11,-10,-15,-20,-9,-2; MA /M: SY='R'; M=-11,-5,-28,-5,2,-26,-8,-8,-30,30,-27,-12,1,-15,6,35,-5,-9,-20,-22,-13,2; MA /M: SY='G'; M=2,-14,-23,-18,-17,-17,12,-21,-7,-13,-11,-5,-8,-18,-15,-16,-2,-8,-3,-23,-17,-17; MA /M: SY='R'; M=-9,-3,-29,-1,12,-26,1,-7,-30,12,-23,-15,0,-13,6,19,-3,-9,-24,-23,-17,8; MA /M: SY='G'; M=2,-2,-23,-5,-4,-25,8,-11,-22,-3,-20,-11,2,-12,3,-6,4,-1,-19,-24,-18,0; MA /M: SY='I'; M=-10,-16,-21,-17,-3,-9,-30,-19,13,-17,9,5,-16,-12,-10,-19,-14,-8,6,-25,-9,-9; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='K'; M=-6,-2,-19,-2,4,-17,-15,-8,-16,26,-15,-4,-2,-8,4,15,-6,-4,-10,-15,-6,4; D=-3; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='D'; M=-9,17,-19,24,15,-23,-8,-1,-22,5,-17,-14,8,-7,6,-1,0,-6,-18,-23,-12,10; D=-3; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='G'; M=-1,-3,-18,-4,-9,-18,25,-10,-21,-4,-19,-11,3,-13,-8,-6,1,-8,-15,-17,-16,-9; D=-3; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; MA /M: SY='N'; M=-5,9,-15,8,3,-14,-7,-4,-12,-2,-14,-11,10,-9,-1,-4,6,3,-11,-22,-9,1; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='D'; M=-9,18,-19,23,19,-20,-9,0,-21,4,-17,-15,10,-6,5,-1,1,-5,-19,-23,-12,12; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='V'; M=1,-9,-14,-10,-8,-6,-15,-12,4,-9,2,1,-10,-9,-8,-11,-4,-1,5,-15,-4,-9; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='I'; M=-5,-15,-12,-19,-14,-4,-21,-14,15,-12,4,6,-12,-15,-7,-12,-7,-3,13,-16,-2,-12; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='G'; M=0,-5,-20,-5,-12,-20,42,-13,-27,-12,-20,-14,0,-13,-12,-11,0,-13,-20,-14,-20,-12; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='N'; M=-7,6,-17,-1,-6,-5,-10,1,-5,-2,-10,-6,13,-14,-3,-3,-2,-3,-10,-11,2,-5; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='R'; M=-7,-4,-19,-4,5,-18,-13,-2,-15,16,-13,-5,-1,-10,12,21,-4,-6,-12,-15,-7,7; D=-3; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='T'; M=-3,-8,-18,-12,-4,-6,-23,-16,-2,-11,-4,-4,-8,-15,-5,-11,2,13,1,-24,-7,-5; MA /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-8,1,-21,-20,-6,-23,27,-20,-9,-1,-17,5,42,-7,-6,-13,-22,-11,0; MA /M: SY='V'; M=-4,-29,-17,-32,-27,1,-32,-28,32,-24,19,14,-26,-27,-25,-22,-15,-4,36,-26,-6,-27; MA /M: SY='K'; M=-5,-2,5,-8,-4,-23,-18,-7,-25,15,-23,-10,2,-19,-2,8,-6,-8,-16,-29,-15,-3; MA /M: SY='V'; M=-3,-19,-17,-20,-16,-10,-27,-23,9,2,-3,3,-18,-22,-16,-4,-8,0,24,-27,-10,-16; MA /M: SY='V'; M=-2,-23,-16,-24,-17,-5,-28,-24,22,-18,8,7,-22,-23,-18,-18,-9,-3,30,-27,-9,-18; MA /M: SY='K'; M=-11,-6,-28,-6,2,-17,-22,-7,-20,31,-21,-6,-6,-15,6,18,-11,-9,-13,-14,1,4; MA /M: SY='N'; M=-9,35,-21,29,5,-25,-3,3,-25,-2,-30,-23,40,-15,0,-5,13,1,-26,-40,-20,3; MA /M: SY='K'; M=-3,-1,-24,-2,6,-26,-14,-9,-27,30,-28,-13,2,-11,7,21,4,-1,-17,-25,-13,6; MA /M: SY='P'; M=-5,-22,-14,-21,-16,-11,-25,-24,5,-17,-4,-2,-21,10,-19,-19,-7,1,9,-30,-16,-19; MA /M: SY='A'; M=18,-7,13,-14,-11,-18,-11,-18,-12,-14,-12,-12,-6,-19,-13,-18,5,-1,-2,-32,-20,-12; MA /M: SY='P'; M=-5,-18,-28,-16,-6,-16,-20,-16,-7,-5,-5,0,-16,21,-7,-9,-12,-8,-11,-25,-15,-9; MA /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; MA /M: SY='P'; M=-7,-17,-38,-8,5,-30,-19,-18,-20,-8,-28,-20,-18,76,-7,-18,-8,-10,-29,-30,-29,-5; MA /M: SY='F'; M=-16,-13,-25,-15,4,28,-26,-9,-12,-7,-4,-7,-12,-18,-13,-8,-13,-10,-12,-5,13,-2; MA /M: SY='K'; M=0,-2,-23,-4,3,-25,-9,-8,-25,22,-26,-12,3,-13,6,19,4,-3,-17,-25,-14,3; MA /M: SY='E'; M=-8,0,-27,3,26,-26,-22,-6,-18,9,-17,-10,-4,-5,15,2,-1,-3,-17,-27,-15,20; MA /M: SY='A'; M=29,-15,3,-23,-15,-9,-10,-22,-9,-15,-9,-9,-14,-12,-17,-21,3,-1,0,-22,-16,-16; MA /M: SY='E'; M=-9,-8,-23,-7,11,-7,-24,-12,-5,-5,-5,-3,-10,-14,-2,-6,-4,-1,-3,-24,-9,4; MA /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-35,-27,45,-31,-19,12,-27,15,6,-21,-28,-30,-20,-19,-7,9,-2,21,-27; MA /M: SY='D'; M=0,14,-24,20,11,-27,-13,-7,-19,-3,-17,-15,2,-11,3,-10,1,-6,-14,-29,-15,7; MA /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-35,-28,0,-36,-27,42,-27,18,17,-18,-22,-21,-26,-18,-8,29,-22,-2,-28; MA /M: SY='M'; M=-8,-15,-23,-21,-16,-4,-17,-10,8,-10,6,16,-11,-20,-9,-11,-11,-4,3,-19,1,-14; MA /M: SY='F'; M=-12,-20,-24,-22,-12,32,-26,-6,-5,-16,-2,-4,-17,-16,-19,-14,-13,-8,-6,3,28,-15; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; MA /M: SY='G'; M=-3,4,-19,4,-7,-20,28,-5,-24,-9,-20,-14,8,-12,-8,-10,2,-10,-20,-18,-17,-8; D=-6; MA /I: DM=-29; MA /M: SY='E'; M=-8,9,-28,14,17,-30,2,-7,-32,9,-26,-19,4,-10,3,3,-1,-9,-25,-27,-19,10; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-30,10,-36,-28,38,-28,18,15,-23,-24,-25,-26,-18,-8,30,-19,1,-30; MA /M: SY='S'; M=-1,8,-16,9,-3,-23,4,-9,-24,-8,-25,-18,8,-14,-6,-11,14,4,-15,-32,-17,-5; MA /M: SY='D'; M=-16,14,-29,22,10,-30,-16,4,-31,13,-25,-16,7,-11,10,17,-3,-9,-25,-27,-12,9; MA /M: SY='E'; M=3,-10,-21,-9,6,-13,-16,-15,-7,-10,-4,-7,-11,-6,-6,-13,-1,-1,-4,-26,-14,-1; MA /M: SY='G'; M=-6,-6,-23,-6,-8,-24,15,-8,-27,0,-24,-12,0,-17,-6,-1,0,-10,-19,-24,-15,-8; MA /M: SY='E'; M=-11,19,-16,29,36,-31,-16,-3,-32,2,-24,-23,5,-7,8,-6,2,-8,-27,-35,-21,22; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=K_Hofmann; CC /VERSION=5; DO PDOC00131; //