ID   CAP_GLY_2; MATRIX.
AC   PS50245;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   CAP-Gly domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3912000; R2=0.0139045; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2675.9406738; R2=1.5437037; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=584; H_SCORE=3577; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=440; H_SCORE=3355; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-28,54,-17,-38,-11,-28,-18,0,-20,-15,-4,-2,-18,-28,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='P'; M=3,-9,-24,-6,9,-22,-18,-16,-13,-6,-16,-13,-12,20,-5,-13,0,0,-10,-28,-20,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-16,-18,-10,-8,-27,-22,13,-14,1,1,-16,-18,-15,-16,-2,9,21,-29,-10,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-28,15,22,-30,-15,11,-27,-1,-25,-16,3,5,13,-5,4,-6,-27,-32,-14,16;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-11,-23,-16,-15,8,-8,-16,-10,-18,-3,-7,-4,-7,-19,-16,-7,-1,-11,-19,-6,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-9,-25,-10,-3,-24,-3,-12,-20,13,-19,-8,-5,-16,3,12,-5,-9,-11,-21,-15,-1;
MA   /M: SY='P'; M=6,-1,-27,1,3,-29,-13,-14,-23,8,-24,-16,-6,19,-3,-5,-3,-7,-19,-26,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-21,-23,-26,-19,-1,-23,-10,13,-14,5,18,-20,-7,-11,-17,-14,-7,8,-14,6,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-38,-37,-29,34,-24,-20,-11,-22,-8,-11,-31,-30,-24,-19,-31,-21,-18,91,37,-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,3,-28,-24,-1,-27,-21,12,-21,8,4,-23,-27,-22,-21,-12,-5,18,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-29,1,-34,-29,37,-26,20,16,-26,-26,-24,-24,-17,-6,35,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-30,24,47,-33,-18,2,-30,8,-22,-18,3,-3,24,0,0,-10,-30,-30,-18,35;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-26,-30,-21,13,-29,-14,11,-25,32,11,-30,-30,-18,-18,-30,-13,1,12,18,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,14,-26,25,2,-18,-19,-9,-13,-13,6,-8,-2,-19,-9,-14,-13,-10,-12,-31,-11,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=9,6,-20,2,16,-23,-11,-8,-20,5,-18,-15,5,-8,3,-3,6,2,-16,-27,-18,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-35,-1,9,-28,-17,-12,-21,-6,-29,-20,-5,60,-4,-14,-5,-8,-30,-32,-27,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-13,-22,-21,-16,8,-25,-14,5,-15,11,3,-6,-23,-15,-5,-12,-1,0,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,22,-25,11,0,-20,-9,51,-25,-5,-25,-11,37,-20,5,0,1,-9,-30,-35,-2,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,41,-30,58,17,-37,-11,0,-39,4,-29,-27,17,-11,1,2,-1,-10,-29,-37,-19,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-8,-12,-11,-9,-12,-11,-13,-4,-11,-13,0,-3,-15,-6,-11,19,16,4,-34,-14,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-23,-16,-28,-23,19,-25,-8,8,-20,3,3,-19,-26,-25,-17,-11,-6,18,-17,5,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-11,11,-27,11,14,-27,-16,0,-21,16,-20,-3,7,-11,14,7,-5,-9,-21,-27,-13,14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-13,-18,-18,-13,-11,-25,-19,2,0,-5,-1,-10,-18,-11,3,-2,11,11,-26,-9,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-24,-4,9,-23,-18,-6,-19,15,-19,-9,-3,-14,11,22,0,-4,-12,-26,-13,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,39,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,71,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,4,-30,6,17,-30,-22,-4,-17,14,-18,-7,0,-10,20,6,-6,-10,-18,-24,-12,18;
MA   /M: SY='C'; M=2,-14,44,-24,-21,-15,-24,-26,-11,-21,-11,-11,-13,-24,-20,-23,1,9,-1,-36,-19,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,7,13,-27,-19,-9,-27,16,-24,-16,-1,7,4,12,-3,-1,-22,-27,-16,7;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-14,-4,-6,0,-11,16,-5,-7,-1,0,3,-14,-3,-4,-7,-6,-9,-8,12,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-6,6,-28,-9,-14,-26,-1,-27,-18,-11,44,-3,-2,-7,-11,-28,-27,-25,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-11,-26,-12,-4,-6,-24,-2,-9,6,-4,-1,-11,-19,4,2,-10,-2,-11,-8,16,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-4,-24,-5,-3,-17,-6,24,-21,-8,-19,-7,2,-17,8,-5,4,-1,-20,-21,5,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-23,-25,-20,-5,-10,-19,13,-23,13,12,-15,-21,-15,-20,-11,-8,6,-23,-8,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28,66,-28,-17,3,-27,12,10,-20,-28,-33,-18,-20,-10,2,5,25,-27;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,0,-31,-27,-5,-29,-29,23,-23,6,6,-23,-25,-24,-24,-10,-4,30,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-33,-7,4,-27,-20,-6,-26,18,-24,-11,-6,15,12,30,-8,-10,-24,-23,-16,4;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CAP-Gly;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00045;
DO   PDOC00660;
//