ID   CADHERIN_2; MATRIX.
AC   PS50268;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Cadherins domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8381; R2=0.02192269; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=350; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=259; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-23,-6,-2,-8,-19,-12,-10,-8,-9,-8,-6,-7,-6,-7,-2,2,-8,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-27,-7,2,-21,-18,-7,-15,-3,-17,-9,-8,5,5,-6,-4,-6,-17,-14,-12,3;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-6,-23,-6,-1,-16,-14,-11,-12,-5,-14,-9,-4,-3,-3,-7,1,0,-11,-23,-12,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-24,-12,-6,-13,-19,-16,-5,-9,-11,-7,-9,8,-9,-12,-2,1,-5,-26,-13,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-26,-16,-9,6,-23,0,-8,-2,-7,-3,-12,-15,-4,0,-12,-7,-11,-1,24,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,-4,3,-14,-18,-5,-13,-4,-13,-9,-3,-5,-1,-3,0,1,-11,-24,-7,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-15,-25,-20,1,-13,-21,4,-19,-1,0,-15,-20,-20,-19,-7,-5,8,-20,-7,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-20,-5,4,-14,-16,-7,-14,-1,-15,-10,-1,-13,1,0,6,5,-9,-26,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-19,-31,-25,3,-31,-25,29,-23,16,13,-23,-25,-22,-21,-14,-4,30,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,2,-10,-3,-21,-17,-14,-19,-8,-19,-12,-9,4,-5,-11,-1,-4,-16,-32,-19,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,18,49,-29,-18,-1,-29,9,-21,-19,2,-2,17,0,1,-9,-28,-29,-19,33;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-22,15,3,-22,-1,0,-24,-2,-24,-17,25,-15,0,-2,6,-2,-24,-33,-17,1;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-16,-9,-3,-17,-11,-12,-10,-7,-12,-9,-1,-10,-4,-9,7,4,-6,-28,-15,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-27,-9,-1,-21,-13,-12,-14,-1,-15,-8,-9,10,-3,-4,-5,-7,-13,-26,-17,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-24,-11,-7,-17,-14,-15,-5,-10,-11,-6,-9,3,-9,-13,-4,-4,-3,-27,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-27,-4,-10,-23,25,-12,-27,-11,-25,-16,3,-7,-12,-12,0,-11,-22,-25,-21,-12;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-16,-8,-2,-9,-16,-10,-11,-6,-12,-9,-2,-9,-2,-7,8,14,-7,-22,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: M=-6,-14,-22,-14,-6,-8,-19,-14,-1,-9,-4,-2,-12,-2,-8,-10,-5,-3,-1,-21,-7,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-14,-23,-19,1,-23,-18,21,-16,12,9,-18,-20,-16,-15,-11,-4,23,-18,-3,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-12,-16,-15,-12,-9,-6,-10,-1,-13,2,5,-10,-17,-6,-12,-6,-4,0,-19,-8,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-21,-9,-5,-16,-14,-8,-10,-2,-12,-6,-2,-14,1,2,0,2,-7,-24,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-20,-29,-24,5,-30,-21,24,-21,18,13,-23,-25,-20,-18,-17,-6,22,-20,1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-18,-8,-4,-15,-15,-9,-12,-1,-13,-7,0,-14,-1,-1,5,9,-8,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-14,-20,-12,-16,-10,-17,-2,-10,-7,-5,-12,-13,-10,-16,4,-1,5,-22,-15,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-18,-12,-8,-10,-21,-12,-2,-9,-6,-3,-6,-16,-6,-7,3,12,2,-26,-7,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-19,43,-28,60,19,-37,-11,2,-37,0,-29,-27,18,-10,2,-9,0,-10,-29,-38,-18,10;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-25,-9,0,-21,-14,-11,-16,2,-15,-9,-9,9,-1,-2,-3,-6,-14,-23,-15,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-28,62,20,-37,-10,0,-37,1,-28,-28,18,-9,1,-8,0,-9,-28,-37,-19,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-18,1,4,-15,-14,-10,-8,-5,-5,-6,-4,-12,-2,-6,-2,-1,-7,-24,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-17,-6,-5,-15,4,-10,-15,-7,-14,-10,-3,-1,-7,-8,3,1,-11,-19,-13,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-3,2,-21,0,1,-18,-7,-3,-14,-3,-14,-8,5,-4,2,-3,1,-3,-15,-24,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-23,5,-3,-21,2,1,-21,-6,-23,-15,21,-10,-3,-7,5,-4,-22,-29,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-25,-9,-7,-19,3,-9,-19,-10,-19,-12,-2,-11,-3,-11,1,-6,-18,-9,-12,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-25,-6,1,-20,-13,-8,-17,5,-17,-9,-2,-3,2,5,-1,-1,-14,-25,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-25,-19,-30,-24,11,-26,-22,19,-23,13,8,-21,-23,-23,-21,-13,-5,19,-17,2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-23,-10,-5,-12,-19,-8,-12,1,-13,-7,-4,-10,-3,5,-1,1,-7,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-19,-4,2,-16,-13,-7,-17,1,-19,-12,2,-13,3,4,11,7,-11,-28,-11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-25,-34,-24,4,-33,-24,31,-24,24,17,-22,-23,-19,-22,-21,-9,20,-19,0,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-20,-12,-7,-11,-18,-14,-2,-11,-1,-2,-10,-13,-8,-11,-3,1,0,-26,-10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-25,0,1,-22,4,-8,-23,-4,-19,-13,3,-9,-1,-4,3,-5,-20,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-26,6,1,-27,10,-7,-27,-5,-24,-16,4,-9,0,-7,3,-6,-22,-28,-19,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-25,7,2,-23,-2,-2,-23,-7,-22,-16,8,0,-3,-9,2,-5,-22,-30,-17,-2;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-24,0,3,-23,-5,-12,-17,-7,-18,-13,-5,6,-5,-12,0,-5,-14,-26,-18,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-18,8,4,-19,-5,-4,-17,-2,-15,-11,4,-7,-1,-4,3,-2,-13,-24,-13,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-4,3,-12,4,3,-11,-6,-4,-8,-2,-7,-5,1,-7,0,-3,0,-1,-6,-15,-7,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-21,-2,-3,-19,7,-5,-20,-1,-18,-10,5,-10,-2,1,-1,-7,-17,-20,-14,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-26,-15,-12,-4,-20,-4,-3,-11,-4,1,-5,-18,-7,-9,-12,-8,-8,-3,3,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-31,-24,-38,-28,60,-29,-22,0,-28,9,-1,-24,-30,-34,-20,-24,-13,-2,26,26,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-19,-6,-2,-15,-15,-8,-14,0,-15,-9,0,-14,-2,1,7,9,-8,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-35,-27,0,-35,-27,37,-26,20,17,-23,-23,-21,-25,-18,-7,28,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-24,21,13,-25,-11,3,-24,0,-22,-17,16,-13,4,-3,4,-1,-21,-33,-15,8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-25,-1,4,-22,-16,-10,-19,4,-20,-13,-3,7,0,2,1,3,-16,-27,-14,0;
MA   /M: SY='B'; M=-8,12,-23,12,5,-20,-13,-4,-16,-2,-15,-12,10,-15,-1,-5,0,-3,-14,-30,-13,1;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-16,2,-1,-18,-11,-9,-17,-4,-19,-14,8,-4,-3,-6,12,18,-13,-30,-15,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-26,-6,-13,-25,43,-17,-29,-16,-22,-16,-1,-18,-16,-17,-1,-14,-21,-21,-24,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-11,-23,-13,-9,-9,-22,-13,5,-10,-2,1,-9,-18,-7,-9,-7,-4,4,-17,-5,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-20,-28,-21,0,-29,-22,24,-22,20,12,-20,-23,-18,-18,-15,-4,19,-22,-3,-21; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-15,-10,-5,-9,-18,-9,-11,-3,-12,-7,-2,-16,-3,-3,5,11,-6,-23,-4,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-13,-20,-17,-5,-22,-18,6,-15,5,2,-14,-19,-15,-13,-3,9,10,-26,-7,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-18,-12,-8,-12,-16,-12,-7,-3,-8,-5,-4,-16,-5,-2,2,7,-2,-24,-9,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-25,-5,1,-21,-11,-8,-20,12,-17,-9,-1,-11,1,11,-4,-5,-15,-22,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-26,-8,-3,-21,-8,-12,-16,-3,-19,-11,-5,9,-4,-4,-1,-4,-14,-26,-17,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-30,-21,11,-29,-20,19,-26,34,16,-26,-25,-20,-20,-24,-9,12,-18,1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-28,46,13,-33,-10,-2,-32,0,-24,-23,16,-11,0,-7,0,-7,-25,-36,-18,6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-27,-14,-6,-1,-22,0,-19,12,-11,-6,-6,-21,0,35,-12,-9,-15,-10,8,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-29,14,46,-29,-18,0,-27,8,-17,-16,-1,-3,19,0,-2,-10,-27,-28,-18,33;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-21,-1,10,-20,-16,-6,-15,6,-12,-7,-2,-9,6,1,-1,-1,-12,-24,-12,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-20,-7,-4,-12,-16,-5,-9,2,-11,-4,1,-15,0,2,-3,-2,-8,-20,-4,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-2,6,-24,7,5,-26,-1,-6,-24,1,-23,-16,6,-4,2,-2,5,-4,-20,-28,-18,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-7,-23,-8,0,-12,-20,-6,-8,-3,-9,-4,-5,-16,2,-3,-3,-2,-7,-18,-5,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-25,-21,-20,27,-29,17,-1,-13,1,1,-18,-29,-13,-11,-18,-10,-7,17,60,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-21,-1,2,-16,-17,-2,-12,-3,-12,-8,4,-15,1,-2,2,4,-10,-28,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-20,-32,-23,10,-29,-23,23,-27,33,16,-26,-27,-22,-21,-23,-8,17,-19,0,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-9,-23,-12,-6,-10,-21,-9,-7,-7,-10,-5,-7,-2,-5,-6,-1,5,-6,-23,-6,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-17,-32,-26,1,-28,-26,28,-23,14,12,-23,-25,-23,-23,-13,-5,29,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-11,-23,-13,-2,-12,-19,-7,-6,-3,-2,1,-10,-17,0,-1,-7,-4,-5,-22,-6,-2;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-11,-24,-18,-11,-13,-23,6,-16,1,-1,-16,-18,-17,-21,0,-1,14,-23,-14,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-18,-12,-5,-14,-17,-14,-7,-4,-9,-5,-5,-14,-3,-3,6,11,-1,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-16,42,-26,52,15,-34,-9,0,-33,0,-28,-26,24,-12,0,-8,3,-5,-27,-39,-19,8;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-2,-22,-4,0,-19,-8,-5,-16,-2,-15,-6,1,-11,1,0,1,-4,-14,-26,-13,0;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,2,-24,2,-4,-25,19,-6,-26,-9,-21,-14,4,-15,-4,-10,2,-10,-20,-24,-19,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-4,-18,-6,-6,-13,-1,-8,-10,-6,-11,-6,1,-10,-4,-6,1,-3,-9,-19,-9,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-24,-6,-1,-15,-12,-6,-15,-2,-17,-10,-6,20,-3,-4,-4,-5,-16,-19,-10,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-25,-6,-5,-22,3,-12,-19,-8,-21,-14,-2,9,-7,-10,1,-4,-17,-26,-19,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-22,-16,-7,-8,-21,-13,-4,-4,3,3,-13,-13,-3,-2,-12,-6,-4,-20,-7,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-18,-1,6,-17,-13,-9,-17,-3,-17,-12,0,-10,1,-5,13,11,-11,-29,-13,3;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-13,-3,-5,-20,2,-11,-20,-8,-21,-15,5,-13,-4,-10,11,3,-15,-29,-16,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-20,-10,-4,-13,-21,-15,-8,-7,-10,-7,-6,-1,-6,-7,4,17,-4,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-11,-10,-16,-13,-14,-5,-17,-7,-14,-8,-6,-7,-17,-12,-16,6,7,0,-27,-15,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-21,-6,-2,-14,-20,-11,-9,-5,-10,-6,-4,-6,-3,-7,3,12,-6,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-14,-31,-25,6,-30,-25,24,-25,24,13,-26,-27,-24,-22,-18,-6,26,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-21,-10,-8,-10,-19,-9,-5,-6,-7,-4,-2,-16,-6,-3,-1,6,-3,-24,-6,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-29,-19,-34,-29,1,-33,-29,36,-25,16,14,-24,-25,-24,-25,-15,-5,36,-24,-5,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-23,-4,-1,-17,-18,-1,-14,4,-15,-7,4,-14,1,5,1,4,-11,-25,-7,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-15,-31,-28,1,-31,-28,31,-23,17,13,-27,-28,-26,-21,-14,-3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-12,5,-14,-6,-12,-25,-14,-6,-14,0,-3,-13,-20,-8,-14,-9,-3,-5,-29,-11,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-29,53,16,-36,-7,-2,-36,0,-28,-26,16,-9,0,-8,1,-9,-28,-37,-19,8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,8,-21,-15,-11,-25,-21,4,-16,-3,-1,-17,-23,-14,-18,-7,-4,11,-30,-13,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-11,34,-22,23,5,-23,-3,7,-22,-1,-28,-20,44,-17,1,-2,8,-2,-27,-38,-19,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-28,44,20,-33,-8,0,-33,0,-25,-23,13,-10,2,-8,1,-8,-26,-35,-18,11;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-18,11,1,-18,-2,13,-20,-1,-23,-14,33,-16,2,0,5,-3,-24,-31,-12,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,-20,-11,-5,-19,-7,-14,-14,-8,-14,-10,-9,7,-8,-11,-1,-5,-12,-23,-17,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-7,2,-29,-19,-18,-21,-8,-28,-19,-17,76,-8,-17,-9,-10,-29,-29,-28,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-18,-14,-4,-11,-22,-13,-1,-4,-6,-1,-10,-17,-4,-4,-5,-1,2,-23,-7,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-21,-32,-23,46,-26,-20,2,-25,7,1,-18,-20,-29,-19,-16,-7,1,-3,14,-24;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Cadherin;
CC   /VERSION=3;
PR   PRU00043;
DO   PDOC00205;
//