ID   SAP; MATRIX.
AC   PS50800;
DT   01-FEB-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   SAP motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1756001; R2=0.0199757; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1162.7791748; R2=1.5220884; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=317; H_SCORE=1645; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=217; H_SCORE=1493; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-24,-20,-8,5,-27,-11,6,-8,10,8,-18,-22,-11,-9,-17,-9,3,-13,8,-10;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-17,-11,-1,-16,-10,-14,-8,-9,-9,-3,-5,-11,-4,-13,7,11,-4,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-10,-24,-8,-2,-19,-4,-7,-14,-10,-13,-9,-5,-1,-6,-12,3,-4,-14,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-19,-28,-21,9,-25,-13,16,-21,25,23,-23,-26,-15,-16,-18,-6,12,-18,4,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-7,-10,-6,-17,-17,-14,-17,3,-18,-11,-1,-15,-3,8,10,15,-8,-30,-13,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-18,-15,-12,-8,-24,-15,9,-12,0,4,-16,-21,-9,-14,-6,0,15,-23,-3,-11;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-16,-3,2,-20,-9,-4,-20,-5,-23,-16,4,-5,0,-3,21,14,-13,-33,-15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-25,9,23,-22,-17,-6,-21,4,-16,-13,-2,-9,10,-4,-1,-8,-17,-25,-14,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,0,-27,30,-23,-7,0,-14,24,42,-7,-10,-23,-20,-10,14;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-24,17,2,-26,-8,-8,-19,-4,-19,-11,4,-13,0,-8,4,-2,-13,-31,-16,1;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-15,-22,-19,-8,-4,-23,-16,2,-4,5,6,-13,-17,-9,-8,-11,-5,0,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-25,24,-29,-22,-2,-27,-23,2,-28,23,5,-25,-31,-22,-23,-20,-9,3,-29,-11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-26,0,10,-26,-5,-6,-28,16,-26,-14,2,-12,9,18,4,-5,-21,-26,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=2,-4,-22,-4,9,-15,-15,-1,-17,3,-17,-10,-3,-12,5,-2,3,-4,-13,-22,-6,7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-22,-17,-9,-1,-22,-9,-2,-5,5,4,-11,-23,-8,6,-13,-7,0,-19,-1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-26,-16,8,-28,-16,11,-19,30,13,-24,-27,-13,-7,-23,-9,6,-18,0,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-23,0,1,-24,-9,-9,-23,-1,-26,-18,3,10,-1,4,11,2,-18,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-4,-13,-10,-13,-19,-10,-11,-7,-10,-7,-5,-16,-9,-8,7,19,-2,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-21,7,1,-23,-3,9,-23,-6,-26,-16,18,-7,2,-6,13,4,-22,-34,-15,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-5,-19,-11,-6,-18,2,-18,-10,-1,0,-4,5,-1,0,-14,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,0,12,-28,-20,-8,-30,44,-28,-11,0,-11,11,34,-9,-10,-21,-21,-11,11;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-25,-9,2,-26,-16,5,-18,6,-17,-5,-5,-6,16,8,-3,-8,-16,-23,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,0,-25,3,12,-14,-21,3,-12,-3,-6,-7,-2,-16,0,-1,-8,-8,-11,-25,-5,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-20,23,-27,42,23,-28,-28,-19,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-11,-24,-13,-8,-30,-19,15,-19,11,8,-18,-22,-7,-17,-13,-5,10,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-25,15,8,-26,-19,-8,-19,6,-18,-12,2,-12,4,2,-1,1,-13,-29,-13,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-15,-15,-6,-17,-21,-8,-20,16,-12,-7,-7,-22,0,40,-10,-9,-11,-23,-11,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-14,-19,-16,-4,-26,-2,7,-21,12,6,-15,-24,-13,-19,-16,-10,2,-21,4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-21,-10,-6,-14,-17,-11,-10,6,-5,-4,0,-19,-5,9,-6,-2,-6,-24,-11,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-27,10,16,-29,-8,12,-29,10,-25,-13,9,-11,13,4,1,-9,-26,-28,-12,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-20,-26,-23,-18,5,-15,3,-7,-18,0,-2,-17,-24,-14,-15,-16,-13,-7,11,16,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-21,-18,-6,-1,-27,-17,7,-12,10,7,-16,-18,-11,-12,-11,1,7,-23,-5,-9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SAP;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00186;
DO   PDOC50800;
//