ID   KRAB; MATRIX.
AC   PS50805;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Krueppel-associated box (KRAB) profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7639000; R2=0.0101528; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6999.3315430; R2=3.5798817; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=664; H_SCORE=9376; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=467; H_SCORE=8671; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,24,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,36,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-30,-7,-4,-26,11,-10,-33,19,-26,-13,0,-17,0,27,-7,-13,-23,-20,-17,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-16,-13,-26,-16,11,-9,-20,-7,-16,-4,-7,-13,-16,-19,-20,1,-3,0,-11,-5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,19,-30,28,27,-30,-17,34,-33,0,-23,-16,10,-10,10,-3,-3,-13,-30,-33,-6,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-17,-26,-17,-7,-9,-24,-7,-12,9,5,1,-11,-24,-1,38,-17,-10,-9,-20,-6,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,42,-30,-20,-4,-30,24,-24,-16,0,-4,16,11,-4,-10,-26,-26,-16,29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,17,-37,-20,4,-23,22,-23,-3,0,-10,45,16,-3,-10,-27,-20,-10,31;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-23,77,-30,-27,-11,-30,-27,-15,-30,1,-8,-23,-37,-27,-27,-16,-10,-4,-41,-21,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-20,-10,-7,-17,-20,-20,-13,-10,-17,-13,-7,24,-10,-13,10,29,-10,-30,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,6,-26,-20,3,-27,24,-20,-7,0,-17,25,52,-7,-10,-23,-20,-10,12;
MA   /M: SY='N'; M=11,2,-20,-12,-13,-14,-12,-12,5,-13,-8,-4,12,-17,-10,-16,1,-3,-1,-27,-14,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,30,-23,20,21,-23,-7,7,-23,3,-27,-20,39,-13,7,0,7,-3,-30,-37,-20,14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-13,-30,-13,-13,13,-27,47,-10,-10,-7,0,-10,-27,-3,-7,-17,-13,-17,9,59,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-23,-4,3,-23,-13,-6,-27,22,-26,-13,3,-14,7,30,7,0,-17,-27,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,26,-17,13,0,-20,0,3,-20,-3,-30,-20,43,-17,0,-3,20,7,-23,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,36,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,24,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=17,-23,-10,-27,-23,-7,-20,-27,16,-17,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,33,-27,-13,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-20,-18,-17,12,13,-17,-20,-20,-16,-13,-4,-20,-21,-17,5,-4,-13,-16,-6,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-27,-34,-27,37,-34,-11,18,-24,10,7,-20,-26,-24,-20,-20,-10,8,6,35,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-20,-14,-4,-12,-23,-11,-3,-11,7,3,-10,-17,8,-7,-3,11,-6,-24,-7,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-13,-17,-13,17,-16,-16,-10,-17,-10,-10,-3,-17,-17,-13,13,19,-4,-20,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-13,-13,-10,-7,-16,-17,-4,-16,1,-4,-6,-16,-10,-13,12,21,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,23,-17,-11,-20,-24,-11,-30,9,-20,-14,-7,-27,-4,35,-10,-10,-16,-31,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,17,-37,-20,4,-23,22,-23,-3,0,-10,45,16,-3,-10,-27,-20,-10,31;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,42,-30,-20,-4,-30,24,-24,-16,0,-4,16,11,-4,-10,-26,-26,-16,29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=11,-16,-29,-14,-4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16,55,-10,-20,-3,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-13,-19,-16,-4,-19,-20,9,-20,8,2,-16,-23,-16,-16,2,4,17,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-17,-30,-23,3,-26,-16,23,-20,27,31,-26,-26,-16,-16,-20,-7,22,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-30,30,29,-33,-17,-4,-33,21,-27,-20,7,-7,10,7,-4,-10,-26,-30,-16,19;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-17,-27,-17,-7,-10,-23,-7,-13,9,4,0,-10,-23,0,39,-17,-10,-10,-20,-7,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-30,6,25,-30,-20,39,-27,3,-20,-6,4,-10,30,3,-4,-14,-30,-27,-2,26;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-30,-9,5,-21,5,-16,-9,-12,-11,-8,-6,-13,-6,-16,-6,-13,-12,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='H'; M=7,-14,-23,-21,-14,-13,-20,13,5,-17,-2,4,-7,-17,-7,-17,-7,-10,1,-23,-1,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-26,-4,20,-22,-20,3,-9,3,-6,14,-7,-10,25,0,-7,-10,-16,-23,-10,22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-23,-8,1,-19,7,-17,-12,-11,-13,-9,-11,-17,-11,-14,-4,-10,-2,-27,-20,-5;
MA   /M: SY='T'; M=18,-4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,32,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,3,-30,7,24,-27,-20,27,-30,18,-24,-10,3,-10,13,11,-7,-13,-26,-26,-4,17;
MA   /M: SY='P'; M=11,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,56,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_SEQ_WITH: PS50806;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=KRAB;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00119;
DO   PDOC50805;
//