ID DM_2; MATRIX. AC PS50809; DT 01-DEC-2001 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE DM DNA-binding domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1236999; R2=0.0066818; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2648.6804199; R2=4.3341494; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=955; H_SCORE=6788; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=655; H_SCORE=5488; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='Q'; M=14,-7,-21,-11,2,-27,-11,-5,-18,6,-16,-7,-4,-12,18,10,2,-6,-15,-20,-14,9; MA /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='R'; M=-7,-9,-25,-7,7,-17,-11,-8,-19,4,-8,-8,-5,-16,2,17,-5,-8,-15,-24,-14,3; MA /M: SY='N'; M=-3,18,-23,7,-2,-25,12,1,-24,-4,-27,-16,31,-18,4,-5,6,-6,-27,-31,-21,1; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-1,-15,-30,57,-17,-39,-17,-30,-21,3,-18,-17,-18,2,-17,-29,-23,-28,-16; MA /M: SY='V'; M=-7,-16,-21,-15,-2,-10,-26,-14,5,-7,2,2,-16,-20,-4,-5,-9,-5,10,-24,-7,-4; MA /M: SY='K'; M=-6,-16,-25,-16,-7,-15,-25,-17,1,2,-2,2,-15,-7,-3,-4,-12,-6,1,-23,-10,-6; MA /M: SY='S'; M=-1,-10,-16,-12,-11,-13,-16,-15,-1,-5,-13,-6,-3,-19,-9,-2,9,5,8,-32,-14,-11; MA /M: SY='P'; M=-7,-18,-16,-17,-8,-17,-23,-19,-8,-8,-14,-9,-15,14,-10,-6,-8,-5,-8,-22,-16,-12; MA /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-26,-17,4,-28,-17,11,-18,35,14,-24,-28,-15,-3,-25,-9,6,-21,-2,-17; MA /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,8; MA /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-15,-28,54,-13,-35,-15,-30,-20,14,-20,-15,-15,2,-15,-30,-25,-28,-15; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='K'; M=-2,-1,-26,-2,7,-28,-16,-11,-27,37,-28,-11,0,-10,7,20,-2,-5,-17,-22,-12,7; MA /M: SY='R'; M=-13,-11,-14,-10,-3,-23,-19,-9,-27,13,-24,-14,-5,2,1,30,-5,-7,-20,-27,-17,-5; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='Q'; M=-9,-6,-24,-6,1,-7,-19,2,-11,-4,-5,0,-7,-17,4,-1,-6,-7,-13,-17,4,2; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='P'; M=-11,-12,-33,-8,2,-27,-20,-11,-21,7,-24,-11,-10,36,5,7,-7,-6,-24,-25,-19,0; MA /M: SY='Y'; M=-20,-28,-29,-32,-26,47,-28,-5,-3,-20,1,-3,-23,-30,-24,-16,-23,-13,-9,43,51,-24; MA /M: SY='R'; M=-6,-10,-24,-14,-8,-15,-20,-10,-8,9,-8,-3,-3,-19,-3,21,-9,-7,-4,-23,-10,-8; MA /M: SY='D'; M=-13,17,-25,20,13,-19,-16,-3,-21,0,-14,-15,10,-14,0,-5,-3,-3,-20,-29,-10,6; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='T'; M=-4,-2,-15,-6,1,-16,-16,-11,-16,-4,-19,-11,1,4,-2,-8,4,6,-15,-29,-15,-1; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='K'; M=8,-3,-23,-4,12,-24,-14,-11,-22,13,-19,-13,-4,-3,3,6,1,-2,-15,-24,-16,7; MA /M: SY='K'; M=-7,2,-24,0,7,-22,-17,-9,-22,22,-20,-10,4,-12,4,12,0,0,-16,-26,-12,6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='T'; M=-5,-3,-19,-7,-1,-17,-11,-12,-12,-5,-11,-8,-1,-15,-1,-3,4,11,-6,-27,-14,-1; MA /M: SY='L'; M=-10,-19,-21,-22,-16,7,-25,-15,9,-15,24,13,-16,-26,-15,-11,-21,-8,4,-20,-1,-15; MA /M: SY='V'; M=-2,-25,-15,-28,-25,-1,-28,-26,25,-21,12,9,-22,-25,-23,-20,-7,2,32,-28,-8,-25; MA /M: SY='E'; M=3,1,-19,-4,6,-11,-14,-8,-8,-5,-10,-4,3,-15,-3,-9,-1,-4,-6,-27,-13,2; MA /M: SY='E'; M=-11,7,-28,12,21,-23,-18,9,-26,11,-22,-13,2,-10,12,3,-1,-8,-24,-22,-2,16; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='R'; M=-16,-8,-23,-8,0,-16,-16,0,-23,23,-16,-8,0,-16,8,55,-8,-8,-16,-16,-8,0; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='Q'; M=-9,-3,-22,-3,8,-24,-14,3,-18,12,-17,-5,1,-11,27,23,1,-5,-19,-17,-9,16; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='R'; M=-9,-3,-21,-6,-1,-16,-14,-3,-12,10,-14,-6,4,-13,7,23,-2,-4,-11,-19,-9,1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='L'; M=-6,-22,-14,-22,-17,2,-23,-17,16,-15,19,10,-20,-22,-16,-8,-15,-5,18,-18,-4,-17; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='M'; M=-7,-12,-16,-18,-11,-4,-14,-1,8,0,8,35,-12,-13,1,-2,-13,-7,4,-14,-1,-5; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='A'; M=19,0,-16,-8,-5,-20,-4,-9,-17,1,-18,-13,7,-14,-3,5,8,0,-11,-26,-18,-5; MA /M: SY='A'; M=12,-9,-19,-14,-10,-12,-15,-15,1,-15,7,1,-8,-18,-6,-16,-6,-5,-1,-23,-11,-9; MA /M: SY='Q'; M=-11,-1,-28,-3,11,-26,-21,0,-14,9,-13,-3,2,-14,25,11,-6,-9,-19,-23,-10,17; MA /M: SY='V'; M=3,-18,-15,-21,-16,-6,-22,-21,9,-13,6,3,-16,-21,-16,-14,-4,3,16,-27,-10,-16; MA /M: SY='A'; M=14,-14,-18,-20,-10,-5,-15,-16,-3,-10,-3,-2,-11,-16,-6,-13,-1,-3,-1,-18,-7,-8; MA /M: SY='L'; M=-11,-8,-23,-14,-11,-5,-22,-11,4,-9,13,4,-1,-24,-9,-3,-15,-8,-3,-25,-7,-11; MA /M: SY='R'; M=-17,-8,-30,-8,1,-18,-21,-1,-26,32,-21,-9,-2,-18,8,47,-11,-10,-19,-14,1,1; MA /M: SY='R'; M=-15,-2,-27,-5,1,-21,-16,-1,-28,24,-23,-12,8,-18,8,50,-3,-6,-20,-24,-12,1; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=51(48); /POSITIVE=51(48); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=1; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=N_Hulo; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=DNA_BIND; /FT_DESC=DM; CC /VERSION=6; DR G5EEJ1 , DMD10_CAEEL, T; Q9XWN9 , DMD3_CAEEL , T; DR Q18248 , DMD4_CAEEL , T; Q19291 , DMD5_CAEEL , T; DR J7FCF0 , DMR3T_HORSE, T; C0LZJ1 , DMRT1_BOVIN, T; DR Q9PTQ7 , DMRT1_CHICK, T; Q71MM5 , DMRT1_DANRE, T; DR Q9Y5R6 , DMRT1_HUMAN, T; Q9QZ59 , DMRT1_MOUSE, T; DR Q801F8 , DMRT1_ORYLA, T; Q9TT01 , DMRT1_PIG , T; DR P57690 , DMRT1_TRASC, T; P85119 , DMRT1_XENTR, T; DR Q9Y5R5 , DMRT2_HUMAN, T; Q8BG36 , DMRT2_MOUSE, T; DR F6W2R2 , DMRT3_HORSE, T; Q9NQL9 , DMRT3_HUMAN, T; DR Q80WT2 , DMRT3_MOUSE, T; D4A218 , DMRT3_RAT , T; DR Q90WM5 , DMRT3_TAKRU, T; Q5VZB9 , DMRTA_HUMAN, T; DR Q8CFG4 , DMRTA_MOUSE, T; Q96MA1 , DMRTB_HUMAN, T; DR A2A9I7 , DMRTB_MOUSE, T; Q32LE6 , DMRTD_BOVIN, T; DR Q8IXT2 , DMRTD_HUMAN, T; Q8CGW9 , DMRTD_MOUSE, T; DR Q3LH63 , DMT1A_XENLA, T; B7ZS42 , DMT1B_XENLA, T; DR Q8JIR6 , DMT1Y_ORYLA, T; P83758 , DMT3A_DANRE, T; DR Q9DFI0 , DMT3B_DANRE, T; A6QQ94 , DMTA2_BOVIN, T; DR Q5UU75 , DMTA2_DANRE, T; Q96SC8 , DMTA2_HUMAN, T; DR A8TSS9 , DMTA2_MONAL, T; A2A9A2 , DMTA2_MOUSE, T; DR Q6YHU8 , DMTA2_ORENI, T; Q76L87 , DMTA2_ORYLA, T; DR Q4AE28 , DMTA2_TAKRU, T; Q2MJB4 , DMTA2_XENLA, T; DR A4QNP7 , DMTA2_XENTR, T; Q2I327 , DMTA2_XIPMA, T; DR B0I1G7 , DMW_XENLA , T; P23023 , DSX_DROME , T; DR G5ECK3 , MAB23_CAEEL, T; O18214 , MAB3_CAEEL , T; DR Q9PUE0 , DMRT1_ALLMI, P; 3D 1LPV; 4YJ0; PR PRU00070; DO PDOC50809; //