ID   INTEIN_C_TER; MATRIX.
AC   PS50818;
DT   01-MAY-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Intein C-terminal splicing motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8533000; R2=0.0226396; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=656.6232910; R2=0.7982063; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=290; H_SCORE=888; N_SCORE=7.4; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=250; H_SCORE=856; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-11,-29,-9,-6,3,-23,-5,-14,-1,-13,-10,-10,-2,-9,0,-12,-8,-15,-5,12,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-13,-27,-26,-1,-24,-27,20,-18,7,6,-24,-26,-25,-17,-8,1,34,-27,-9,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-28,-18,-17,29,-28,9,-2,-11,-1,-1,-16,-27,-11,-9,-18,-10,-9,17,55,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-1,33,5,-29,-12,-6,-30,-8,-25,-23,15,-17,-6,-12,4,-3,-22,-41,-21,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-27,-22,3,-30,-24,23,-25,26,13,-24,-25,-21,-21,-18,-4,20,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-18,-1,4,-16,-10,-10,-14,-7,-16,-13,3,-12,-3,-9,11,12,-9,-28,-11,0;
MA   /M: SY='V'; M=3,-18,-3,-21,-22,-8,-21,-25,10,-18,1,0,-17,-24,-22,-19,-4,4,23,-30,-13,-22;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-25,7,15,-17,-19,-7,-21,2,-19,-15,-5,11,0,-6,-6,-9,-21,-21,-9,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-2,10,-17,7,0,-18,5,-1,-18,-2,-18,-12,13,-11,-3,-3,2,-3,-16,-22,-13,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-12,0,-26,1,5,-22,-6,42,-25,-8,-18,-6,5,-16,7,-4,-4,-13,-24,-27,0,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-19,2,-5,-10,-8,-2,-13,-4,-15,-11,27,-20,-5,-2,3,0,-17,-30,-13,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-25,-24,-30,-25,40,-25,-8,5,-22,9,3,-20,-29,-25,-17,-20,-10,0,8,37,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-18,-30,-25,7,-30,-20,24,-24,18,12,-23,-26,-23,-20,-16,-4,25,-21,-1,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-14,-14,-20,-15,-7,-14,-20,1,-15,-2,-3,-12,-17,-13,-17,4,8,8,-23,-11,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-22,1,-3,-17,1,-4,-18,-4,-20,-14,15,-15,-5,-3,1,-6,-17,-22,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-21,-5,-7,-13,14,-8,-19,-9,-17,-12,6,-16,-7,-8,2,-5,-17,-19,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-15,-34,-27,9,-30,-27,27,-27,16,11,-22,-25,-24,-25,-17,-8,22,-20,-1,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-20,-31,-25,8,-30,-24,22,-23,16,11,-25,-23,-24,-21,-17,-5,23,-15,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=5,-15,-9,-20,-18,-7,-21,-23,7,-16,1,-1,-14,-20,-18,-17,3,14,18,-29,-11,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-28,-3,-3,-20,-5,62,-30,-7,-21,-5,6,-19,3,-2,-7,-17,-27,-26,7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,17,3,-23,-3,10,-20,1,-29,-17,52,-19,8,1,9,-1,-30,-37,-19,5;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-11,63,-18,-18,-18,-20,-23,-24,-21,-21,-18,-8,-27,-18,-21,9,8,-8,-44,-24,-18;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /VERSION=5;
DO   PDOC00687;
//