ID   GRAM_POS_ANCHORING; MATRIX.
AC   PS50847;
DT   01-MAY-2002 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9159126; R2=0.0060830; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3385.1904297; R2=0.9610918; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=918; H_SCORE=4267; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=590; H_SCORE=3952; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-49; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='L'; M=-97,-99,-115,-107,-70,-116,-98,-62,-108,97,-58,-114,-114,-101,-105,-107,-93,-69,-101,-83;
MA   /M: SY='P'; M=5,-117,-97,-86,-115,-95,-99,-103,-93,-112,-99,-101,127,-95,-104,-24,-87,-105,-109,-112;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-105,48,42,-104,-96,-3,-101,39,-31,-94,25,-95,41,-7,5,3,-33,-110,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-21,-91,-88,-90,-98,-97,-98,-89,-87,-93,-90,-77,-89,-92,-96,-66,120,-81,-118,-96;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-105,-93,-104,-112,104,-99,-119,-98,-115,-104,-9,-98,-96,-105,-32,-96,-112,-104,-107;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='E'; M=2,-102,60,61,-6,-93,-87,-101,-40,-75,-98,36,-94,-79,-41,32,22,-28,-113,-96;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-101,5,42,-106,3,14,-32,30,-103,-96,53,-94,-38,-25,33,32,-52,-113,-97;
MA   /M: SY='D'; M=5,-103,49,4,-101,14,-89,11,-13,-46,-5,30,-30,13,-19,29,4,-64,-110,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-29,-99,-17,9,-61,-38,-20,-25,-19,-50,8,62,7,-39,-90,43,51,-31,-108,14;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-102,1,-19,16,-78,-10,0,-21,7,-17,54,11,5,-13,21,-55,11,-8,-38;
MA   /M: SY='F'; M=3,-102,-27,-61,34,-1,-93,13,-18,28,-81,26,8,-6,-19,-10,-7,-25,10,15;
MA   /M: SY='M'; M=18,-100,-101,-98,28,16,-95,-8,-43,40,53,-32,8,-41,-99,3,20,-80,-100,-28;
MA   /M: SY='T'; M=35,-97,-96,-34,2,-27,9,-36,-39,25,2,-56,6,-32,-96,-17,64,-16,9,-89;
MA   /M: SY='L'; M=33,-99,-107,-102,-16,-20,-102,32,-101,55,-24,-101,-105,-98,-103,-61,19,13,38,-24;
MA   /M: SY='G'; M=37,-100,-104,-101,29,38,-101,4,-101,30,-3,-97,19,-98,-104,-27,-88,24,-101,-88;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='G'; M=24,-105,-104,-105,30,68,-104,-48,-25,9,-91,-93,-105,-101,-105,-36,-22,-21,14,-93; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='L'; M=38,-105,-73,-106,-94,37,-104,-28,-106,42,-1,-101,-109,-101,-108,2,-93,-4,-109,-28; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='T'; M=21,-118,-125,-122,-43,-34,-124,-7,-120,-1,-6,-117,-123,-119,-124,-40,22,20,-130,-113; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-99,-109,-104,31,-16,-98,18,-103,60,63,-102,-107,-98,-103,-3,-24,9,-100,-81;
MA   /M: SY='L'; M=27,-98,-107,-102,13,-16,-99,6,-101,57,36,-100,-105,-97,-102,7,-21,23,-102,-85;
MA   /M: SY='G'; M=39,10,-99,-99,-25,44,-100,-5,-97,22,-12,-90,-100,-95,-102,16,31,4,-106,-94;
MA   /M: SY='L'; M=36,-98,-107,-102,-33,-9,-102,39,-102,54,5,-100,-105,-97,-103,0,-46,19,-104,-89;
MA   /M: SY='G'; M=26,-100,-100,-100,-7,59,-100,-13,-43,19,4,-90,-101,-95,-101,22,-17,12,-105,-94;
MA   /M: SY='G'; M=12,12,-95,-49,-30,78,-98,-29,-97,-7,-94,-85,-99,-94,-103,31,5,-95,-104,-24;
MA   /M: SY='L'; M=42,-98,-104,-99,-83,-63,9,12,-100,59,-17,-98,-104,-95,-101,7,12,0,-106,-44;
MA   /M: SY='F'; M=9,-17,-108,-104,48,7,-98,-1,-44,34,22,-101,-108,-100,-39,-47,-48,40,-95,23;
MA   /M: SY='L'; M=11,-102,-109,-105,14,-1,-100,36,-101,61,-71,-104,-109,-52,-15,-47,-58,-15,-98,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-104,-108,-102,35,-30,-95,21,-15,41,-12,-102,-37,-97,4,-48,-56,10,-6,55;
MA   /M: SY='K'; M=7,-104,-97,-90,-4,15,11,-39,48,-20,-5,-89,-102,-85,43,-22,-4,18,-102,15;
MA   /M: SY='R'; M=-24,-108,-91,-49,-15,-60,-88,-105,68,-49,-94,-28,-101,-15,84,-11,-29,-55,-105,-93;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-109,-33,-80,-29,-37,-86,-109,76,-107,-97,30,-3,-75,75,-33,-90,-105,-105,-36;
MA   /M: SY='R'; M=-55,-110,-87,6,-108,-103,-3,-111,70,-106,-96,-27,-99,7,87,-88,-8,-105,-107,-95;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-112,-5,32,-40,-104,-92,-47,79,-109,-100,-25,-24,-77,46,-91,-43,-105,-110,-100;
MA   /M: SY='N'; M=-56,-112,-12,29,-115,-7,-4,-44,-7,-60,-103,67,-106,34,9,17,-92,-63,-121,-105;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-118,29,-24,-121,-16,14,-116,15,-73,-112,31,-113,-11,-58,25,-25,-24,-130,-112;
MA   /M: SY='K'; M=-120,-137,5,-21,-139,-26,-16,-135,38,-137,-129,0,-128,-108,-17,-7,-116,-38,-143,-128;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-144,-11,-123,-146,-135,-131,-32,19,-140,-134,15,-141,-122,-13,-125,-127,-52,-153,-139;
MA   /M: SY='K'; M=-147,-160,-46,8,-18,-155,-140,-158,9,-155,-150,-30,-149,-129,-24,-140,-39,-155,-157,-143;
MA   /M: SY='H'; M=-162,-174,-60,-70,-164,-170,4,-160,-27,-30,-149,-64,-168,-1,-147,-155,-56,-162,-178,-156;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=MOTIF; /FT_DESC=LPXTG sorting signal;
CC   /VERSION=8;
PR   PRU00477;
DO   PDOC00373;
//