ID   GOLOCO; MATRIX.
AC   PS50877;
DT   01-APR-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   GoLoco/GPR motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=23;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=21;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5159345; R2=0.0172079; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=904.4058838; R2=0.6058823; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=447; H_SCORE=1175; N_SCORE=8.2; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=348; H_SCORE=1115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-27,7,3,-24,-6,-7,-18,-4,-18,-10,4,-5,1,-4,-1,-5,-18,-29,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-27,24,26,-28,-19,-6,-20,0,-17,-16,2,-9,7,-7,-1,-5,-17,-32,-16,16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-29,37,28,-34,-6,0,-34,2,-26,-23,13,-8,10,-5,1,-10,-30,-33,-20,19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-32,-24,27,-22,-19,11,-27,26,14,-24,-28,-25,-19,-22,-10,8,-12,6,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-19,-30,-22,22,-28,-14,12,-22,24,17,-23,-27,-20,-17,-19,-4,9,-11,12,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-5,21,-24,27,27,-29,-10,-2,-28,1,-25,-22,14,-8,7,-6,8,-3,-24,-35,-20,17;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-21,-28,-20,1,-20,-14,16,-21,27,28,-21,-23,-13,-17,-19,-5,8,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-8,-22,-14,-5,-2,-20,-9,2,-8,4,10,-4,-19,-7,-9,-11,-7,-1,-23,-6,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-4,2,-22,-14,-4,-27,23,-25,-13,6,-16,7,39,3,-2,-18,-26,-13,2;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-9,-23,-19,-4,-22,-3,8,-14,3,18,-17,-23,-11,-14,-8,-2,13,-24,0,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,0,18,-37,-18,9,-18,9,-18,0,0,-9,55,9,0,-9,-27,-18,-9,37; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=8,-7,-5,-9,-10,-21,13,-16,-22,-16,-22,-16,0,-17,-10,-16,18,3,-13,-33,-22,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-19,-3,-3,-24,10,-9,-25,-5,-27,-16,8,-14,2,-1,18,3,-18,-30,-20,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-22,-5,-3,-32,22,-22,-12,0,-20,5,55,-8,-12,-22,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='M'; M=0,-22,-19,-29,-19,0,-21,-12,17,-18,25,33,-22,-22,-9,-16,-18,-8,10,-20,-3,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-16,25,-30,38,34,-33,-16,16,-34,3,-24,-21,10,-7,10,-4,-2,-12,-30,-34,-13,21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,37,-28,53,25,-36,-11,-2,-35,1,-26,-26,14,-8,3,-9,1,-9,-27,-36,-20,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=10,-11,12,-16,-16,-20,6,-21,-20,-17,-19,-15,-6,-20,-16,-19,9,2,-8,-32,-23,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-22,-2,13,-17,-18,-1,-16,-5,-10,-10,-4,-5,2,-4,3,3,-15,-30,-12,6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-25,-24,-13,6,-27,-19,8,-21,16,8,-23,-1,-17,-19,-20,-9,1,-20,-5,-16;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=41(21); /POSITIVE=41(21); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=4;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=GoLoco;
CC   /VERSION=5;
DR   Q95QJ7    , GPR1_CAEEL , T; Q03569    , GPR2_CAEEL , T;
DR   Q86YR5    , GPSM1_HUMAN, T; Q6IR34    , GPSM1_MOUSE, T;
DR   Q9R080    , GPSM1_RAT  , T; P81274    , GPSM2_HUMAN, T;
DR   Q8VDU0    , GPSM2_MOUSE, T; Q9Y4H4    , GPSM3_HUMAN, T;
DR   Q3U1Z5    , GPSM3_MOUSE, T; Q6MG88    , GPSM3_RAT  , T;
DR   Q8IVA1    , PCP2_HUMAN , T; P12660    , PCP2_MOUSE , T;
DR   O14924    , RGS12_HUMAN, T; Q8CGE9    , RGS12_MOUSE, T;
DR   O08774    , RGS12_RAT  , T; O43566    , RGS14_HUMAN, T;
DR   P97492    , RGS14_MOUSE, T; O08773    , RGS14_RAT  , T;
DR   Q9VCX1    , RGS_DROME  , T; P47736    , RPGP1_HUMAN, T;
DR   A2ALS5    , RPGP1_MOUSE, T;
3D   1KJY; 2OM2; 2XNS; 3ONW; 3QI2; 4G5O; 4G5Q; 4G5R; 4G5S; 4JHR;
PR   PRU00097;
DO   PDOC50877;
//