ID RT_POL; MATRIX. AC PS50878; DT 01-OCT-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=178; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=173; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0494502; R2=0.0204990; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=315; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=218; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=-7,2,-8,3,19,-21,-18,-7,-21,0,-14,-14,1,-13,3,-4,0,-5,-19,-32,-17,11; MA /M: SY='H'; M=-7,-5,-24,-7,-4,-18,-4,3,-12,-8,-16,-8,3,-18,-5,-3,0,-7,-10,-28,-11,-6; MA /M: SY='R'; M=-10,-3,-22,-8,-7,-13,-18,-8,-8,7,-9,-4,5,-22,-5,15,-8,-5,-4,-27,-11,-7; MA /M: SY='R'; M=-14,-9,-30,-10,7,-18,-26,4,-5,0,-8,-1,-5,-14,8,9,-10,-11,-9,-24,-6,4; MA /M: SY='H'; M=-9,-6,-23,-10,-3,-12,-18,3,-5,-7,-4,3,1,-18,-1,0,-3,-5,-8,-28,-7,-4; MA /M: SY='G'; M=-7,-3,-27,-2,-6,-22,7,-14,-29,1,-25,-17,-1,-16,-6,1,1,-3,-21,-8,-13,-6; MA /M: SY='Y'; M=-10,-12,-27,-13,-5,-5,-26,-9,-3,-5,-8,-5,-11,-2,-6,-10,-6,4,-7,-12,10,-9; MA /M: SY='G'; M=-2,-8,-26,-10,-8,-18,8,-8,-24,1,-19,-11,-4,-17,-1,3,-2,-5,-18,-14,-5,-6; MA /M: SY='P'; M=-8,-11,-27,-9,-1,-21,-19,-15,-17,6,-17,-11,-8,17,-3,4,-3,1,-16,-26,-16,-4; MA /M: SY='P'; M=-9,-4,-26,1,6,-9,-19,-13,-17,-10,-13,-14,-7,11,-8,-13,-1,0,-16,-26,-13,-2; MA /M: SY='A'; M=15,6,-18,-4,-6,-21,2,-10,-19,0,-20,-14,13,-14,-6,-7,7,2,-14,-27,-19,-6; MA /M: SY='F'; M=-16,-27,-29,-29,-19,24,-26,-19,-6,-17,4,-3,-22,-9,-21,-8,-22,-13,-10,12,8,-19; MA /M: SY='K'; M=-4,-9,-24,-11,-8,-10,-20,-9,-7,4,-9,-5,-7,-9,-7,-3,-9,-6,-6,-16,2,-9; MA /M: SY='P'; M=-10,0,-27,-3,-2,-21,-17,15,-20,-8,-23,-13,6,20,-3,-9,1,4,-23,-32,-11,-6; MA /M: SY='A'; M=13,-7,-16,-13,-12,-18,11,-15,-15,-12,-15,-5,-3,-14,-9,-15,12,7,-8,-26,-18,-10; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-9,-1,-26,-9,-10,-22,13,-22,-10,-6,1,5,16,-7,-10,-17,-23,-16,0; MA /M: SY='I'; M=-6,-29,-18,-32,-27,2,-31,-24,32,-23,22,20,-26,-26,-22,-21,-18,-6,32,-24,-4,-26; MA /M: SY='R'; M=-16,-17,-24,-20,-12,12,-24,-11,-13,8,-8,-4,-10,-23,-11,25,-13,-9,-5,-12,2,-12; MA /M: SY='L'; M=-1,-16,-20,-24,-18,6,-21,-14,11,-20,18,13,-11,-23,-15,-17,-15,-7,4,-20,-3,-17; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,31,-21,-1,-29; MA /M: SY='P'; M=-11,-8,-34,0,2,-26,-20,-16,-19,-1,-19,-14,-12,43,-7,-10,-11,-10,-23,-28,-21,-5; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='P'; M=-10,-2,-32,-1,5,-29,-17,-11,-25,21,-30,-15,1,26,1,7,-7,-9,-25,-26,-19,1; MA /M: SY='D'; M=-8,14,-26,17,3,-28,-1,-9,-28,0,-28,-20,10,1,-4,-6,5,-1,-23,-32,-20,-1; MA /M: SY='N'; M=-4,2,-21,-2,-5,-22,7,3,-25,-3,-24,-14,10,-15,-4,-4,9,5,-19,-29,-13,-5; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='N'; M=-1,9,-12,2,-4,-13,6,-5,-15,-6,-17,-12,17,-11,-4,-6,11,8,-13,-23,-13,-4; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='F'; M=-13,-26,-26,-31,-23,30,-26,-16,3,-23,4,-1,-20,-26,-22,-19,-16,-9,-3,22,23,-22; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-32,-17,-7,-17,-25,-20,-4,-7,-5,-4,-19,31,-10,-13,-16,-10,-12,-25,-16,-11; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,38,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27; MA /M: SY='V'; M=7,-15,-11,-19,-17,-9,-16,-19,7,-14,-4,3,-13,-19,-14,-15,8,10,19,-30,-13,-16; MA /M: SY='B'; M=-11,12,-22,12,-5,-16,-18,-10,-5,-11,-6,-8,8,-19,-10,-13,-4,0,-4,-33,-13,-8; MA /M: SY='F'; M=-13,-25,-24,-29,-22,28,-15,-18,-1,-24,11,6,-20,-14,-25,-19,-19,-11,-4,-9,5,-22; MA /M: SY='N'; M=-8,10,-5,6,-1,-22,-10,-4,-26,2,-26,-18,17,-19,-1,12,9,1,-20,-36,-18,-2; MA /M: SY='K'; M=-11,-6,-31,-3,10,-24,-9,-4,-25,12,-23,-12,-5,0,10,9,-7,-11,-25,-18,-8,8; MA /M: SY='R'; M=-12,-20,-24,-21,-15,3,-15,-15,-6,-5,6,1,-15,-24,-14,7,-16,-10,-2,-17,-4,-15; MA /M: SY='S'; M=1,3,-17,-1,-8,-8,-12,-12,-7,-12,-14,-11,7,-17,-11,-14,9,2,-3,-29,-12,-9; MA /M: SY='K'; M=-10,-3,-27,-1,-1,-22,-12,-12,-21,19,-16,-8,-4,-17,-2,15,-10,-10,-12,-23,-12,-2; MA /M: SY='M'; M=-4,-9,-26,-14,-7,-15,-8,-11,-3,-6,-6,3,-2,-17,-5,-2,-7,-9,-6,-23,-12,-8; MA /M: SY='T'; M=-7,-2,-19,-7,-2,-4,-18,-11,-12,0,-14,-10,3,-17,-7,2,3,6,-6,-25,-8,-4; MA /M: SY='Q'; M=-9,6,-24,7,19,-26,-19,-2,-18,2,-14,-4,0,-9,21,-2,3,5,-19,-27,-12,20; MA /M: SY='R'; M=-17,-2,-28,1,3,-4,-11,-7,-26,4,-16,-13,-1,-18,-5,18,-8,-11,-20,-18,-6,-2; MA /M: SY='V'; M=-7,-18,-17,-21,-16,6,-24,-19,1,-8,2,0,-14,-22,-17,-3,-6,3,10,-21,-3,-16; MA /M: SY='M'; M=-9,-14,-25,-19,-15,-5,-19,-14,-1,-11,-2,3,-8,-21,-8,-6,-8,-2,-5,2,-2,-12; MA /M: SY='E'; M=-13,-11,-29,-9,7,-9,-23,-8,-16,3,-8,-9,-12,-16,0,5,-12,-7,-17,6,5,3; MA /M: SY='K'; M=-8,-10,-27,-10,-2,-21,-22,-13,-12,22,-17,1,-10,-1,-1,9,-11,-8,-6,-23,-11,-2; MA /M: SY='R'; M=-12,-10,-28,-12,4,-18,-24,-6,-7,9,-5,5,-8,-16,11,15,-12,-10,-10,-21,-8,6; MA /M: SY='L'; M=-4,-17,-18,-22,-17,11,-22,-17,6,-22,23,6,-13,-25,-18,-17,-15,-2,2,-19,-1,-17; MA /M: M=-2,-3,-22,-3,-4,-9,-3,-2,-18,-12,-13,-11,-3,-17,-11,-13,-1,-4,-10,-23,-8,-7; MA /M: SY='R'; M=-8,-7,-21,-12,-9,-14,-21,-13,-4,3,-11,-4,0,-18,-5,10,0,4,1,-27,-10,-9; MA /M: SY='P'; M=-7,-13,-24,-15,-12,-13,-23,-19,2,-15,-6,-4,-9,13,-14,-17,-5,5,-1,-29,-15,-15; MA /M: SY='N'; M=-6,11,-22,6,-2,-9,-13,11,-21,-3,-19,-12,15,-17,-5,-4,0,-2,-18,-26,-5,-4; MA /M: SY='L'; M=-9,-11,-26,-8,-6,-13,-23,-14,0,-16,7,0,-13,-2,-5,-16,-11,-7,-6,-26,-11,-7; MA /M: SY='Q'; M=-1,-10,-22,-14,-2,-9,-19,-9,-13,3,-7,-3,-7,-16,8,5,-4,-2,-11,-17,-5,3; MA /M: SY='K'; M=-5,-6,-24,-7,-6,-20,-2,-14,-17,2,-17,-10,-1,-5,-7,-3,-1,-5,-12,-27,-17,-7; MA /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; MA /M: SY='F'; M=-12,-24,-23,-26,-19,13,-17,-18,-1,-18,10,2,-19,-15,-21,-8,-17,-10,0,-15,-2,-20; MA /M: SY='K'; M=-5,-8,-27,-7,-2,-25,3,-13,-23,5,-20,-10,-4,-4,1,-1,-2,-8,-20,-24,-17,-1; MA /M: SY='P'; M=-7,-8,-30,-3,7,-28,-5,-12,-27,6,-28,-17,-5,21,0,2,0,-7,-25,-27,-22,1; MA /M: SY='K'; M=-9,5,-26,5,14,-19,-16,-1,-23,18,-24,-14,7,-12,7,9,0,-5,-21,-21,-3,10; MA /M: SY='L'; M=-10,-11,-4,-15,-11,-9,-23,-15,-6,-4,8,1,-9,-25,-11,-5,-17,-9,-6,-27,-9,-11; MA /M: SY='Y'; M=-7,-15,-23,-16,-14,11,-16,-4,-11,-13,-15,-11,-9,-21,-10,-12,4,1,-12,13,24,-12; MA /M: SY='F'; M=-7,-29,-21,-36,-27,44,-25,-23,1,-24,3,-2,-23,-27,-32,-20,-17,-10,4,19,17,-26; MA /M: SY='V'; M=1,-22,-15,-27,-22,-2,-25,-22,19,-19,13,13,-20,-22,-18,-19,-8,4,24,-25,-7,-21; MA /M: SY='K'; M=-7,-9,-21,-10,0,-6,-20,-13,-13,6,-14,-8,-6,-16,-5,6,0,2,-4,-23,-7,-3; MA /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-32,-25,14,-30,-21,23,-26,30,19,-27,-28,-23,-20,-22,-8,20,-19,1,-24; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,36,-25,19,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,38,-25,-5,-29; MA /M: SY='K'; M=-2,-1,-22,-1,5,-25,0,-12,-27,12,-27,-15,3,-11,1,4,9,3,-18,-28,-17,3; MA /M: SY='D'; M=2,7,-23,10,10,-28,-2,-9,-28,7,-26,-18,4,-10,2,-2,8,-3,-19,-29,-19,6; MA /M: SY='C'; M=23,-15,49,-25,-19,-20,-14,-25,-19,-19,-15,-15,-15,-24,-19,-25,1,-5,-5,-34,-25,-19; MA /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24; MA /M: SY='D'; M=-20,27,-28,39,6,-10,-16,-1,-28,-6,-19,-21,8,-16,-8,-12,-6,-10,-22,-22,2,-1; MA /M: SY='S'; M=-4,-2,-18,-5,-2,-18,-12,5,-21,0,-21,-12,5,-14,1,11,16,14,-13,-31,-10,-2; MA /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,35,-24,-4,-29; MA /M: SY='P'; M=-9,-12,-34,-9,-3,-22,-15,-16,-21,-4,-29,-19,-8,39,-7,-11,-5,-8,-26,-7,-17,-7; MA /M: SY='H'; M=-15,-11,-27,-11,-2,-15,-23,23,-13,-3,1,4,-6,-21,11,11,-14,-13,-16,-23,1,2; MA /M: SY='D'; M=-16,25,-29,37,22,-30,-15,14,-29,0,-20,-13,9,-10,6,-6,-4,-11,-25,-34,-12,13; MA /M: SY='E'; M=-10,-9,-29,-5,11,-19,-10,-11,-18,0,-7,-8,-10,0,-1,0,-11,-11,-18,-24,-16,3; MA /M: SY='L'; M=-3,-12,-5,-13,-14,-8,-23,-17,4,-20,13,7,-15,-23,-14,-20,-15,-9,2,-27,-10,-15; MA /M: SY='F'; M=-1,-20,-18,-27,-20,17,-22,-18,7,-21,9,8,-15,-21,-19,-18,-7,1,5,-15,2,-18; MA /M: SY='R'; M=-13,-10,-25,-11,1,-15,-21,-6,-14,13,-5,3,-7,-17,4,26,-10,-4,-11,-22,-8,0; MA /M: SY='K'; M=-10,-14,-28,-15,-2,-9,-26,-18,-2,3,-9,-3,-12,-1,-7,-5,-12,-9,-2,-21,-8,-6; MA /M: SY='L'; M=-12,-24,-23,-25,-19,7,-30,1,14,-23,25,13,-22,-28,-15,-17,-22,-10,7,-14,15,-19; MA /M: SY='K'; M=6,-7,-21,-11,-2,-19,-17,-15,-15,15,-11,-6,-7,-13,-2,5,-3,2,-8,-22,-11,-2; MA /M: SY='K'; M=1,-1,-21,-2,-1,-20,-15,-12,-18,8,-12,-9,-2,-14,-2,7,0,1,-11,-25,-12,-2; MA /M: SY='F'; M=-4,-20,-21,-26,-20,11,-27,-17,11,-13,2,3,-16,-21,-18,-15,-10,-1,11,-11,10,-20; MA /M: SY='L'; M=-7,-19,-23,-23,-18,-5,-16,-21,9,-17,14,6,-15,-21,-15,-16,-13,-1,4,-22,-7,-18; MA /M: SY='K'; M=-5,-11,-25,-11,-4,-18,-19,-16,-8,4,-13,-6,-6,0,-3,-3,0,-2,-7,-27,-13,-5; MA /M: SY='D'; M=-11,5,-28,11,0,-18,-15,-5,-18,-9,-18,-16,2,11,-6,-13,-2,-5,-20,-26,-7,-5; MA /I: I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; MA /M: SY='K'; M=-6,-6,-27,-6,-1,-25,-3,-13,-27,13,-26,-14,-2,1,-1,11,1,-1,-19,-25,-17,-3; MA /M: SY='I'; M=-2,-19,-7,-25,-18,1,-25,-15,6,-18,-2,0,-13,-21,-10,-19,-6,-6,2,-16,4,-15; MA /M: SY='Y'; M=-16,-16,-30,-17,-15,3,-15,15,-7,-7,-7,-2,-10,-24,-7,0,-14,-13,-11,0,31,-15; MA /M: SY='Y'; M=-11,-17,-25,-18,-10,-5,-27,-9,4,-1,6,6,-16,-21,-2,-4,-16,-9,1,-13,9,-7; MA /M: SY='Q'; M=-10,-9,-31,-9,3,-30,-10,-5,-15,0,-17,-4,-5,-1,23,3,-5,-11,-21,-21,-14,11; MA /M: SY='Y'; M=-11,-12,-10,-16,-9,2,-12,-8,-13,-8,-9,-1,-11,-21,-11,-9,-9,-5,-11,-13,6,-10; MA /M: SY='R'; M=-3,3,-22,0,-2,-19,-15,-7,-13,3,-10,-7,4,-18,2,5,-4,-6,-10,-27,-13,-1; MA /M: SY='G'; M=-1,-12,-27,-12,-17,-25,41,-20,-27,-10,-23,-14,-5,-20,-17,-13,-3,-15,-15,-22,-24,-17; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,35,-29,31,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,24,-21,-1,-26; MA /M: SY='P'; M=-11,-21,-38,-13,-3,-17,-21,-20,-18,-12,-25,-18,-20,76,-13,-20,-11,-10,-27,-25,-23,-12; MA /M: SY='Q'; M=-10,-3,-29,-4,14,-34,-20,9,-14,7,-14,8,-3,-11,52,7,-3,-10,-24,-20,-9,33; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='S'; M=2,-14,-18,-14,-11,-9,-11,-17,-9,-15,-15,-12,-8,-18,-10,-14,13,6,-3,-5,-8,-10; MA /M: M=-6,-8,-10,-14,-13,-15,-9,-16,-5,-9,-8,-5,-1,-21,-11,-11,-5,-7,-6,-28,-14,-13; MA /M: SY='L'; M=-7,-27,-22,-28,-22,1,-15,-22,15,-27,29,12,-24,-27,-21,-21,-22,-11,10,-21,-6,-22; MA /M: SY='S'; M=9,-1,-13,-1,-3,-21,9,-11,-23,-11,-30,-20,9,-11,-3,-11,35,15,-13,-37,-21,-3; MA /M: SY='P'; M=2,-13,-27,-9,-2,-25,-14,-18,-18,-10,-26,-18,-11,47,-8,-17,6,4,-19,-31,-25,-8; MA /M: SY='I'; M=-2,-26,-24,-32,-22,14,-28,-24,17,-24,10,5,-19,-9,-22,-24,-15,-8,9,-14,1,-23; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23; MA /M: SY='C'; M=-10,-22,29,-27,-24,10,-27,-18,-6,-24,0,-5,-19,-31,-25,-21,-11,-6,1,-22,2,-24; MA /M: SY='S'; M=3,10,-19,8,4,-26,-7,7,-22,-4,-25,-14,13,-12,10,-6,15,2,-19,-33,-14,6; MA /M: SY='I'; M=-9,-21,-22,-26,-16,10,-26,-17,12,-21,11,6,-14,-21,-10,-17,-9,-5,4,-17,2,-13; MA /M: SY='F'; M=-9,-22,-3,-26,-23,23,-25,-14,1,-20,-2,-3,-18,-28,-24,-17,-7,-3,8,-10,16,-23; MA /M: SY='Y'; M=-9,-15,-21,-20,-16,6,-21,2,4,-10,3,20,-13,-21,-5,-10,-6,2,-1,-8,22,-12; MA /M: SY='S'; M=4,5,-17,4,3,-21,-2,-13,-21,-8,-21,-17,4,-10,-4,-11,18,16,-12,-32,-18,-1; MA /M: SY='D'; M=-5,18,-24,24,6,-26,-14,-9,-23,2,-15,-15,4,-13,-3,-6,-2,-2,-16,-30,-15,1; MA /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-33,-24,3,-31,-20,30,-24,28,28,-25,-25,-17,-21,-22,-9,21,-21,-1,-22; MA /M: SY='E'; M=-11,-8,-8,-5,2,-15,-25,-16,-7,-15,1,-6,-13,-5,-9,-17,-13,-10,-10,-30,-15,-5; MA /M: SY='E'; M=-8,15,-24,16,23,-22,-13,-2,-21,-2,-15,-16,14,-11,5,-5,4,-3,-22,-33,-17,14; MA /M: SY='P'; M=-9,-18,-30,-15,-4,-7,-20,-19,-13,-7,-17,-12,-17,13,-11,-12,-9,-8,-12,-1,-8,-8; MA /M: SY='Y'; M=-12,-21,-21,-22,-18,18,-26,5,3,-19,9,4,-17,-27,-16,-14,-13,-7,2,-9,22,-18; MA /M: SY='R'; M=-10,-13,-25,-14,-2,-4,-23,-13,-5,-1,0,-1,-10,-18,-5,3,-9,-7,-5,-21,-5,-4; MA /M: SY='K'; M=-5,2,-26,4,6,-20,-7,-4,-25,8,-21,-15,0,-14,1,7,0,-7,-19,-19,-5,2; MA /M: SY='F'; M=-7,-15,-24,-19,-13,15,-12,6,-13,-14,-7,-3,-9,-22,-6,-11,-9,-11,-13,-5,15,-9; MA /M: SY='I'; M=-10,-10,-25,-17,-13,0,-24,-16,3,-11,-2,-1,-3,-5,-14,-12,-9,-2,-3,-22,-5,-15; MA /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='L'; M=-3,-26,-23,-30,-21,6,-29,-18,22,-25,27,13,-23,-24,-17,-21,-20,-9,12,-13,8,-21; MA /M: SY='F'; M=-9,-23,-19,-26,-20,17,-25,-11,10,-21,17,11,-21,-26,-18,-16,-14,-5,8,-12,13,-19; MA /M: SY='R'; M=-10,-4,-25,-6,3,-23,-17,-4,-24,18,-21,-10,1,-14,14,34,3,2,-18,-24,-11,6; MA /M: SY='Y'; M=-15,-24,-25,-24,-21,20,-30,2,10,-18,17,8,-24,-30,-15,-14,-22,-9,3,8,45,-21; MA /M: SY='A'; M=16,-16,-13,-24,-17,-9,-14,-16,8,-12,3,16,-16,-17,-11,-16,-2,2,14,-23,-11,-14; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='F'; M=-13,-24,-21,-31,-23,29,-29,-14,11,-22,16,13,-19,-25,-21,-18,-16,-2,6,-6,17,-22; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-30,-23,11,-31,-16,22,-25,32,15,-27,-29,-20,-20,-24,-9,15,-13,12,-23; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-19,-34,-27,12,-32,-25,28,-27,26,15,-26,-28,-25,-22,-20,-7,26,-20,0,-27; MA /M: SY='G'; M=-5,-21,-27,-24,-24,-12,11,-24,4,-25,1,1,-14,-22,-21,-23,-12,-13,3,-21,-14,-24; MA /M: SY='T'; M=11,-5,-10,-10,-8,-14,-10,-17,-9,-11,-16,-12,-1,-13,-8,-13,23,24,2,-33,-16,-8; MA /M: SY='T'; M=-6,-1,-21,1,-3,-17,-18,-15,-12,-4,-11,-10,-5,-4,-8,-8,2,8,-6,-30,-14,-6; MA /M: SY='D'; M=-9,10,-25,13,1,-23,-2,5,-22,-9,-15,-12,9,-17,1,-9,1,-7,-21,-31,-13,1; MA /M: SY='E'; M=-6,-9,-24,-7,9,-17,-22,-11,-3,-2,-6,-3,-9,-14,4,-6,-3,-5,-3,-27,-12,6; MA /M: SY='Q'; M=-9,-5,-26,-10,-1,-19,-23,-9,-4,4,-6,1,-1,-15,11,1,-7,-3,-9,-23,-8,4; MA /M: SY='H'; M=-4,12,-25,8,0,-26,3,22,-27,-6,-24,-13,17,-16,5,-6,1,-10,-26,-29,-11,1; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='A'; M=8,-5,-19,-11,-8,-15,-14,4,-9,-5,-6,-3,-1,-18,-6,-7,-4,-6,-4,-26,-8,-8; MA /M: SY='K'; M=-11,-8,-27,-8,9,-18,-23,-9,-8,11,-9,2,-8,-13,4,11,-10,-9,-6,-24,-10,5; MA /M: SY='T'; M=-5,3,-18,-6,-8,-13,-16,-11,-5,-6,-10,-7,11,-16,-6,-7,7,13,-6,-30,-12,-8; MA /M: SY='F'; M=-14,-20,-25,-24,-15,21,-28,-13,0,-3,3,2,-15,-23,-16,-5,-18,-10,-2,-4,17,-15; MA /M: SY='L'; M=-13,-22,-27,-25,-17,1,-30,-13,13,-10,16,10,-18,-24,-11,-4,-21,-10,5,-13,9,-17; MA /M: SY='E'; M=-4,11,-26,13,20,-28,-14,-4,-28,17,-23,-16,8,-9,8,11,-1,-8,-22,-27,-16,13; MA /M: SY='L'; M=1,-10,-19,-12,0,-10,-21,-16,-5,-8,8,-1,-12,-15,-7,-9,-6,6,-3,-24,-10,-3; MA /M: SY='L'; M=-1,-15,-16,-20,-17,7,-19,-16,6,-20,13,3,-10,-24,-18,-16,-9,-3,6,-22,-4,-17; MA /M: SY='T'; M=-7,-8,-19,-14,-12,-9,-19,-11,1,-7,-2,4,-1,-19,-7,0,-1,5,2,-28,-9,-11; MA /M: SY='N'; M=-14,9,-26,6,0,-14,-5,-1,-24,2,-21,-13,15,-18,4,10,-2,-9,-24,-24,-11,2; MA /M: SY='G'; M=-10,-20,-28,-21,-20,1,6,-2,-15,-21,-7,-6,-14,-25,-19,-17,-15,-17,-12,4,1,-19; MA /M: SY='F'; M=-1,-15,-17,-21,-17,13,-19,-16,3,-20,10,1,-9,-24,-19,-16,-8,-3,3,-19,-2,-17; MA /M: SY='E'; M=-10,-5,-25,0,5,-18,-19,-8,-13,-6,-2,-6,-7,-6,3,-3,-6,-6,-14,-27,-13,3; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='K'; M=-8,0,-23,2,16,-23,-15,-5,-25,23,-22,-12,1,-8,9,21,0,-5,-18,-22,-12,12; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='W'; M=-16,-20,-32,-23,-19,8,-23,2,-6,-17,2,-3,-17,-28,-13,-14,-25,-16,-15,39,27,-16; MA /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-16,-28,55,-13,-36,-16,-30,-20,13,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16; MA /M: SY='L'; M=-5,-27,-7,-34,-25,15,-29,-24,15,-28,19,8,-22,-26,-24,-24,-18,-9,10,-17,1,-25; MA /M: SY='T'; M=-3,-3,-17,-6,-4,-17,-16,0,-15,2,-18,-9,1,-13,-3,-1,11,15,-6,-30,-8,-4; MA /M: SY='V'; M=1,-18,-14,-24,-20,5,-22,-20,9,-17,9,9,-17,-21,-18,-16,-5,10,15,-22,-4,-18; MA /M: SY='N'; M=-8,26,-22,13,0,-22,-3,3,-20,-3,-30,-20,41,-1,-2,-4,10,0,-28,-38,-22,-2; MA /M: SY='E'; M=-5,-4,-26,0,4,-18,-18,-10,-12,-5,-3,-3,-9,-1,-3,-4,-10,-9,-12,-26,-14,-1; MA /M: SY='E'; M=-6,6,-27,9,18,-27,-16,9,-28,16,-23,-13,2,-10,9,12,-4,-10,-22,-26,-11,12; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='T'; M=-6,-7,-17,-14,-12,-8,-23,-1,-3,-14,-2,-2,-4,-15,-9,-12,5,25,0,-28,-3,-12; MA /M: SY='Q'; M=-7,-15,-23,-15,-7,-16,-13,-13,-4,-5,1,3,-14,-21,4,-5,-11,-9,-2,-22,-10,-2; MA /M: SY='R'; M=-4,-13,-24,-17,-11,-14,-23,-3,0,0,-7,1,-8,-17,-6,2,-7,-3,2,-23,-5,-11; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='E'; M=-10,3,-30,7,27,-30,-8,6,-30,13,-24,-14,1,-8,15,5,-3,-12,-28,-25,-14,21; MA /M: SY='E'; M=-7,-1,-26,3,4,-19,-8,-8,-22,-1,-22,-16,-3,4,-3,-7,3,1,-20,-22,-6,-1; MA /M: SY='P'; M=-9,-16,-28,-13,-5,-13,-20,-11,-12,-2,-8,-7,-13,12,-6,-1,-8,-6,-14,-21,-6,-8; MA /M: SY='F'; M=-5,-17,-7,-22,-8,9,-22,-13,-6,-15,3,3,-15,-21,-8,-14,-11,-9,-6,-16,-1,-6; MA /M: SY='P'; M=-9,-3,-24,-2,-5,-17,-16,-11,-11,-7,-11,-10,-1,3,-8,-3,-3,-3,-10,-31,-16,-8; MA /M: SY='W'; M=-20,-34,-36,-37,-29,39,-25,-20,-10,-22,-6,-10,-30,-30,-26,-19,-30,-20,-16,81,37,-24; MA /M: SY='M'; M=-11,-22,-8,-29,-20,6,-27,-15,10,-15,17,22,-20,-25,-14,-13,-20,-10,5,-20,-1,-17; MA /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-18,-29,60,-6,-39,-19,-29,-18,1,-20,-17,-18,-1,-20,-30,-21,-24,-18; MA /M: SY='Y'; M=-10,-24,-23,-28,-23,15,-29,-12,17,-21,9,6,-19,-25,-18,-19,-13,-5,12,-7,21,-23; MA /M: SY='T'; M=0,-6,-15,-12,-12,-10,-16,-16,2,-15,-6,-5,1,-18,-11,-14,10,12,5,-32,-12,-12; MA /M: SY='I'; M=-8,-27,-22,-31,-24,3,-33,-25,29,-27,28,15,-23,-24,-20,-23,-18,-2,21,-22,-2,-24; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=N_Hulo; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Reverse transcriptase; CC /VERSION=3; PR PRU00405; DO PDOC50878; //