ID   S5_DSRBD; MATRIX.
AC   PS50881;
DT   01-NOV-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   S5 double stranded RNA-binding domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5520999; R2=0.0130968; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4251.0678711; R2=4.5533981; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=531; H_SCORE=6669; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=378; H_SCORE=5972; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-30,-23,-33,-23,28,-30,-18,12,-28,30,11,-27,-30,-24,-19,-27,-11,4,3,16,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-27,10,23,-27,-19,-1,-23,13,-19,-12,1,-9,14,7,-1,-5,-20,-27,-13,18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-29,24,37,-27,-19,2,-26,4,-19,-16,2,-7,12,-4,-2,-10,-24,-28,-12,24;
MA   /M: SY='E'; M=-13,3,-29,7,24,-27,-20,1,-28,24,-23,-13,1,-10,13,24,-6,-10,-23,-25,-13,17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-27,1,-30,-26,29,-22,18,16,-28,-25,-24,-20,-15,-4,35,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-26,2,-32,-24,33,-24,23,22,-26,-26,-21,-22,-19,-7,29,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-25,16,7,-26,-14,-4,-23,8,-21,-13,5,-13,6,0,-1,-4,-17,-27,-12,7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-22,-35,-29,0,-35,-28,39,-25,18,19,-24,-24,-22,-25,-17,-7,34,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-23,2,0,-20,-8,-2,-20,12,-23,-11,19,-16,3,12,2,-2,-19,-28,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-29,-14,-4,-17,-22,-7,-16,13,-12,-4,-8,-5,2,35,-11,-9,-13,-22,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-7,-28,-27,-2,-28,-29,24,-19,7,7,-25,-27,-27,-20,-7,4,40,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-3,-9,-7,2,-25,-14,-7,-16,-4,-19,-9,-1,-12,17,-5,13,9,-13,-29,-15,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-2,8,-28,-19,-8,-30,44,-28,-10,2,-12,10,37,-9,-10,-20,-21,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-20,-13,-12,-24,-13,10,-9,1,13,-16,-20,1,-9,-5,2,15,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-11,-17,-17,-6,-24,-19,4,-13,-3,-2,-11,-18,-16,-13,7,27,17,-29,-8,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,8,-28,12,9,-30,-14,-5,-31,29,-28,-14,5,-11,7,19,-3,-7,-21,-25,-13,7;
MA   /M: SY='G'; M=14,-8,-22,-11,-13,-26,38,-18,-29,-14,-25,-17,-1,-15,-13,-17,8,-8,-19,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-4,10,-26,-20,0,-28,29,-22,-9,0,-15,19,47,-7,-10,-23,-21,-11,12;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-28,-12,-4,-18,-22,-5,-14,17,-13,-4,-1,-19,4,35,-10,-8,-10,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-17,-17,-23,-16,18,-23,-16,3,-18,8,6,-14,-21,-18,-15,-6,5,4,-17,2,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-22,-6,0,-21,-11,-6,-25,14,-24,-13,4,-15,5,30,9,3,-16,-27,-14,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,70,-30,-14,1,-27,10,1,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-1,12,37,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-22,-6,0,-20,-13,-8,-23,15,-22,-12,2,-14,3,21,6,5,-14,-24,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=36,-14,-5,-23,-15,-16,-8,-23,-2,-13,-6,-6,-14,-15,-15,-21,5,0,9,-23,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-19,-31,-23,17,-31,-21,19,-27,29,13,-25,-27,-23,-20,-21,-5,14,-16,6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-23,-14,-27,-25,-3,-27,-25,24,-19,8,11,-21,-25,-23,-19,-7,2,34,-28,-9,-24;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-13,-29,-26,-3,-25,-28,24,-20,9,8,-25,-25,-25,-21,-8,-1,37,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-8,-31,-29,-1,-31,-28,29,-22,12,14,-27,-28,-26,-21,-13,-3,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,46,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,40,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-24,-5,4,-19,-6,0,-25,10,-20,-8,-1,-16,5,13,-5,-10,-21,-20,-7,3;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-27,28,14,-30,-11,2,-29,11,-27,-19,23,-13,7,6,1,-6,-27,-33,-17,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-9,-28,-10,-5,-9,-22,24,-14,2,-10,0,-4,-20,7,11,-10,-9,-16,-13,17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-32,-29,0,-31,-29,32,-22,13,12,-28,-28,-27,-22,-12,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-21,-31,-25,22,-30,-15,16,-23,20,11,-25,-29,-23,-19,-21,-8,14,-5,17,-24;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-19,-21,-14,1,-27,-11,9,-12,1,4,-15,-20,-13,-12,-9,-1,10,-18,3,-15;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-27,-10,-14,-28,45,-18,-34,-7,-27,-17,-1,-17,-13,-11,0,-16,-24,-20,-25,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-10,-6,3,-27,-22,-9,-28,34,-26,-10,-3,-15,4,23,-9,-9,-17,-24,-12,3;
MA   /M: SY='A'; M=38,-6,-12,-12,-8,-21,4,-18,-15,-10,-15,-13,-5,-11,-8,-18,14,2,-5,-24,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-27,3,8,-25,-14,-7,-25,23,-23,-12,5,-11,6,20,-3,-6,-19,-25,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,23,45,-32,-19,1,-29,8,-21,-18,3,-3,22,0,1,-7,-29,-30,-18,33;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-12,-29,-27,-1,-24,-27,23,-20,11,10,-27,-28,-27,-20,-11,-2,38,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-25,-14,-8,-22,-7,-17,-12,-9,-18,-11,-9,15,-7,-10,1,-3,-11,-26,-20,-10;
MA   /M: M=-2,-2,-23,-1,0,-19,-5,-14,-14,-9,-13,-11,-3,-7,-7,-12,0,-1,-10,-28,-17,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-38,-29,1,-37,-28,44,-27,18,19,-21,-22,-20,-26,-18,-8,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-29,-5,9,-25,-18,-1,-26,24,-21,-8,-1,-14,22,35,-6,-10,-22,-20,-10,13;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-29,-2,5,-30,-8,-12,-30,39,-29,-11,0,-11,5,21,-8,-11,-20,-20,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-13,-16,-11,-22,11,-19,-16,-12,-15,-13,-6,-12,-11,-19,11,-1,-6,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-23,-29,-23,-2,-26,-18,24,-19,11,16,-19,-22,-16,-19,-15,-6,19,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-26,-1,8,-19,-20,-11,-9,0,-12,-9,-3,-12,0,-3,-3,-5,-9,-21,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,10,-24,12,5,-21,-14,-5,-16,0,-14,-10,4,-14,1,-5,-2,-6,-14,-26,-9,3;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-3,-20,-12,-21,4,-21,-14,-12,-13,-12,-10,-13,-12,-21,8,-3,-3,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-29,-5,5,-21,-21,-5,-26,36,-24,-9,-1,-14,6,32,-10,-10,-18,-19,-7,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-25,-13,-4,-12,-22,-9,-9,11,2,4,-8,-20,0,14,-16,-9,-9,-21,-6,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,23,-19,11,0,-21,-4,10,-21,-1,-27,-17,37,-17,2,0,13,3,-24,-36,-16,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-34,-25,5,-32,-21,31,-25,28,25,-24,-25,-18,-22,-22,-9,21,-20,0,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-22,-31,-24,0,-32,-16,28,-20,10,16,-20,-23,-17,-18,-15,-7,25,-23,-1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-2,-29,2,11,-20,-19,-8,-22,5,-21,-15,-3,15,1,0,-3,-3,-22,-25,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,3,-33,-30,34,-23,13,12,-27,-27,-28,-23,-13,-3,43,-26,-6,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=S5 DRBM;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00268;
DO   PDOC00505;
//