ID   TRBD; MATRIX.
AC   PS50886;
DT   01-NOV-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   tRNA-binding domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=107;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=102;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3383000; R2=0.0240740; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5564.4296875; R2=3.7626865; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=319; H_SCORE=6765; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; H_SCORE=6215; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-6,-3,-22,-2,-8,-5,-11,-12,-14,-12,-10,-10,-6,-10,-14,-13,-6,-6,-11,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-10,-23,-14,-10,11,-20,-14,-7,-12,-7,-7,-7,-8,-16,-12,-6,-4,-7,-16,-1,-12;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-23,-1,7,-24,-12,-10,-15,-1,-17,-11,-2,-6,5,-6,4,-3,-13,-25,-16,5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-12,-23,-14,-7,-7,-20,-15,-8,1,-7,-3,-10,-9,-6,-1,-6,-2,-5,-21,-7,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-11,-22,-11,-9,-12,-15,-14,-1,-12,3,0,-11,-16,-10,-11,-8,-4,1,-26,-11,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-28,21,8,-28,-1,-7,-28,0,-24,-19,6,-4,-3,-7,-1,-9,-24,-29,-17,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-35,-28,19,-33,-25,28,-27,22,15,-24,-26,-26,-23,-20,-8,24,-16,4,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-16,-21,-16,-10,-13,-24,-14,-3,7,-7,-1,-11,-21,-5,19,-7,-3,7,-25,-10,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-31,-27,8,-30,-27,25,-22,12,9,-24,-26,-26,-21,-11,1,32,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=17,-11,-15,-15,-17,-24,34,-21,-25,-17,-21,-15,-6,-18,-17,-20,4,-10,-14,-22,-25,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-28,-4,10,-19,-21,-7,-23,25,-18,-9,-4,-13,6,25,-9,-8,-16,-19,-7,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-21,-22,-14,-5,-27,-19,13,-10,13,10,-18,-22,-13,-9,-15,-6,14,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-24,9,22,-27,-13,-3,-26,13,-25,-16,6,-8,12,6,8,-2,-21,-30,-16,17;
MA   /M: SY='V'; M=9,-19,-2,-25,-19,-11,-21,-24,7,-11,-2,1,-17,-21,-17,-14,-6,-3,16,-26,-13,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,5,19,-20,-18,-4,-17,3,-16,-11,-2,-10,8,-4,-3,-6,-16,-21,-9,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-30,0,7,-24,-17,-10,-23,13,-23,-14,-4,12,2,10,-6,-8,-20,-26,-16,2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-9,-26,-12,-11,-7,-24,47,-6,-15,-6,5,0,-22,-4,-9,-12,-14,-8,-26,11,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-36,-3,12,-29,-20,-15,-22,-3,-27,-19,-13,61,-3,-13,-7,-8,-29,-30,-26,1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-25,13,10,-26,3,1,-28,4,-26,-18,22,-14,2,1,3,-6,-27,-31,-18,5;
MA   /M: SY='A'; M=26,-3,-12,-9,-6,-19,-4,-15,-14,-7,-17,-13,0,-11,-6,-14,17,10,-5,-26,-16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-28,30,17,-30,-13,7,-32,10,-26,-20,16,-12,8,9,0,-8,-27,-33,-15,11;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-23,1,4,-22,-14,-1,-22,26,-23,-8,6,-12,5,18,-3,-6,-16,-22,-9,4; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-19,-29,-19,7,-28,-20,18,-28,43,17,-27,-28,-19,-20,-25,-9,9,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-24,-17,-12,6,-23,0,-3,-8,1,0,-7,-22,-8,-4,-11,-6,-6,-12,12,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-16,-24,-18,-9,-28,-21,11,-3,1,4,-17,-23,-14,-1,-13,-6,18,-25,-9,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-22,27,-26,-19,0,-28,-23,-3,-25,9,-1,-21,-29,-22,-22,-13,-5,3,-30,-11,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-25,-4,7,-22,-20,-9,-15,11,-15,-6,-3,-12,10,6,-2,0,-12,-20,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-33,-28,5,-32,-28,32,-25,21,14,-27,-28,-26,-22,-17,-5,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-29,46,20,-33,-12,5,-33,2,-27,-23,18,-11,6,-5,0,-8,-29,-34,-14,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-14,-22,-20,2,-26,-23,12,-19,8,4,-17,-22,-20,-19,-9,1,15,-23,-5,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-29,-1,-11,-30,50,-16,-36,-14,-28,-19,3,-18,-13,-16,0,-17,-28,-23,-27,-12;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-16,10,12,-17,-9,-4,-17,5,-15,-11,4,-3,4,0,2,-1,-14,-19,-11,8; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=-8,13,-26,12,8,-25,-4,1,-23,4,-21,-13,13,-13,3,0,-1,-9,-22,-29,-15,5; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-29,-1,12,-27,-7,-5,-24,12,-20,-10,-1,-12,10,12,-5,-11,-20,-23,-14,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-14,-25,-14,-6,-8,-22,-16,1,-13,-2,-2,-13,-4,-8,-14,-8,-4,-1,-22,-8,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-18,-26,-21,-12,-8,-27,-11,3,3,2,5,-13,-21,-6,13,-16,-9,3,-19,-1,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-25,3,14,-29,-19,1,-18,3,-17,-6,3,-9,30,1,3,2,-21,-26,-12,22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-20,-28,-25,-3,-30,-26,31,-22,9,10,-16,-23,-20,-22,-9,-1,29,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-11,-27,-23,-3,-27,-25,21,-20,7,6,-21,-24,-21,-20,-6,0,29,-28,-9,-23;
MA   /M: SY='C'; M=8,-7,31,-13,-10,-19,-13,-19,-21,-16,-21,-17,-4,-19,-12,-17,16,10,-8,-39,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-27,-8,-13,-29,44,-14,-31,-14,-26,-16,3,-18,-8,-15,3,-14,-25,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-12,-19,-17,-13,-12,-16,-19,6,-16,5,1,-11,-17,-11,-20,-5,-5,5,-23,-12,-13;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-23,-8,-2,-21,-17,-14,-10,0,-15,-9,-6,4,-3,-7,0,0,-7,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-24,12,11,-24,-9,0,-22,6,-25,-16,25,-9,6,1,5,0,-25,-33,-18,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-16,-14,-20,-18,7,-23,-12,3,-14,0,1,-13,-24,-16,-13,-10,-6,7,-13,8,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-6,-26,-8,-8,-4,-20,4,-11,4,-11,-5,-3,-21,-3,11,-8,-7,-10,-9,16,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-25,-4,3,-22,-14,-12,-14,3,-18,-11,-1,2,-2,-3,-1,-4,-12,-27,-17,0;
MA   /I: I=-8; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-17,-2,-8,-12,18,-4,-16,-9,-11,-8,2,-9,-8,-9,-2,-9,-14,-13,-9,-8; D=-8;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-26,-16,-7,-16,-21,-19,0,-10,-7,-4,-16,19,-11,-16,-9,-7,-2,-25,-16,-11; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-10,-19,-8,6,-5,-21,-13,-6,-8,-2,-5,-13,-17,-7,-11,-7,-6,-1,-18,-7,0; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=18,0,-18,0,4,-23,-4,-13,-16,-6,-15,-13,-4,-10,-2,-13,5,-3,-8,-25,-18,1; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-19,-24,-17,5,-26,-15,13,-22,29,14,-19,-23,-16,-16,-19,-5,7,-21,-2,-17; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-25,-20,-10,-10,-27,-16,11,-13,3,6,-19,0,-10,-14,-13,-8,8,-25,-10,-12; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-27,-5,-11,-28,45,-15,-32,-14,-26,-18,4,-18,-12,-16,2,-15,-25,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='A'; M=12,-4,-20,-9,-3,-22,-9,-12,-19,12,-18,-10,0,-13,0,9,2,0,-11,-23,-15,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-23,-14,-5,-6,-23,-6,-7,0,-2,1,-10,-16,-3,1,-8,0,-6,-19,1,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-17,-27,-25,0,-26,-24,24,-22,17,12,-22,-27,-23,-20,-14,-3,28,-26,-7,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-19,-21,-16,-10,-18,-22,1,-18,-5,-4,-16,8,-17,-20,-8,-3,1,-25,-14,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-8,-17,-10,-11,-16,-5,-18,-4,-12,-10,-7,-5,-16,-14,-15,-2,-5,2,-29,-17,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-20,-21,-20,-8,-5,-20,5,-18,7,5,-14,-24,-18,-17,-10,-7,8,-24,-12,-19;
MA   /M: SY='A'; M=3,-10,-8,-13,-13,-9,-15,-18,-3,-16,-2,-5,-9,-18,-15,-18,-2,0,2,-26,-11,-14;
MA   /I: I=-10; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-19,4,-4,-15,-8,-2,-10,1,-16,-10,26,-17,-3,-1,2,1,-13,-30,-14,-4; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-34,-25,10,-34,-23,31,-28,30,18,-25,-26,-21,-23,-23,-9,20,-18,3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-27,-1,9,-26,-11,-11,-25,20,-25,-13,-1,-2,5,8,-2,-5,-19,-24,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-31,-7,5,-27,-18,-16,-19,5,-25,-15,-12,39,-4,-6,-5,-6,-20,-27,-22,-2;
MA   /M: SY='R'; M=2,-6,-22,-9,-3,-22,-7,-9,-21,11,-20,-11,0,-15,2,18,2,-2,-13,-24,-15,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,0,10,-25,-18,-8,-21,24,-23,-11,3,-7,5,16,-5,-6,-16,-25,-14,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-34,-25,14,-30,-20,25,-26,27,22,-24,-25,-20,-21,-22,-9,17,-16,3,-23;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-12,-4,-8,-17,-5,-19,14,-13,-3,-5,-18,2,27,-9,-9,-14,-16,-4,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-6,-17,-27,58,-17,-37,-17,-29,-20,4,-19,-17,-17,1,-17,-29,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-19,-26,-20,7,-27,-17,15,-18,7,5,-21,-25,-20,-15,-12,-4,20,-17,4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-26,-3,8,-15,-23,-12,-7,1,-8,-4,-7,-13,-2,-3,-8,-7,-4,-22,-10,3;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-25,5,19,-19,-19,3,-21,4,-17,-10,4,-13,18,2,-4,-10,-25,-18,-7,18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-24,-13,-21,-27,57,-21,-33,-20,-26,-17,-3,-21,-21,-20,-1,-17,-22,-22,-28,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,1,-22,-3,21,-13,24,54,-21,-21,-3,-12,-21,-10,11,-20,0,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-17,-32,-24,5,-30,-23,25,-26,30,17,-26,-27,-21,-22,-21,-8,20,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-25,41,-30,-25,-2,-29,-25,-2,-29,15,1,-25,-34,-25,-25,-19,-9,3,-32,-13,-25;
MA   /M: SY='S'; M=16,-5,-3,-9,-8,-21,7,-15,-20,-13,-24,-16,1,-14,-7,-15,23,7,-10,-33,-22,-7;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-17,-17,-8,-10,-8,-14,-7,-10,-5,-6,-12,-13,-9,-15,1,-2,-2,-17,-7,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-28,1,10,-23,-8,-10,-20,6,-19,-12,-1,-9,2,2,-2,-8,-17,-25,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-26,18,34,-26,-17,-1,-26,4,-21,-19,5,-3,10,-3,4,-3,-24,-31,-16,21;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-14,-23,-13,-9,-7,-12,-16,1,-17,15,4,-14,-18,-13,-14,-17,-10,-3,-22,-9,-11; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,11,-24,11,-1,-26,20,-8,-27,-8,-23,-17,11,-15,-6,-11,1,-10,-22,-26,-21,-4; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-17,-20,-14,4,-19,-14,11,-15,13,6,-16,-11,-13,-14,-14,-7,6,-12,1,-15; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-16,4,5,-16,-2,-6,-16,-1,-16,-11,2,1,1,-5,5,-2,-14,-19,-12,3; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-13,7,8,-14,-4,-3,-14,1,-13,-10,6,-4,1,-3,4,-1,-12,-18,-11,4; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-19,2,4,-9,-7,-3,-16,4,-14,-9,3,-11,-1,0,-3,-6,-13,-16,-5,1; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-3,5,-21,4,1,-22,-6,-2,-18,-1,-20,-12,9,-16,1,-3,5,-3,-14,-29,-13,1;
MA   /M: M=-5,-2,-21,-1,-6,-13,-14,-11,-8,-8,-6,-6,-4,-19,-8,-7,-3,-3,-2,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-25,-6,-3,-23,18,-15,-25,-3,-21,-13,-3,-16,-7,-7,-1,-11,-16,-23,-20,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,6,-34,-25,32,-28,30,17,-25,-23,-22,-24,-23,-9,22,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-22,-30,-22,6,-28,-18,22,-25,28,17,-24,-24,-18,-20,-22,-9,14,-19,2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-22,-3,8,-15,-18,-12,-8,-5,-7,-6,-5,-13,-1,-8,-1,1,-6,-26,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-24,-25,-17,4,-26,-21,8,-20,14,4,-23,0,-19,-19,-18,-7,4,-20,-6,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-12,10,-32,18,12,-30,-14,-4,-27,-3,-27,-21,3,27,-2,-11,-2,-6,-28,-33,-21,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-28,14,24,-29,-12,-4,-29,10,-24,-17,2,-6,12,4,0,-8,-25,-24,-17,18;
MA   /M: SY='D'; M=-1,9,-24,13,8,-26,3,-6,-25,-6,-22,-17,6,-7,-3,-11,4,-7,-20,-31,-20,2;
MA   /M: SY='V'; M=8,-14,-13,-18,-14,-7,-19,-17,4,-14,0,0,-13,-19,-13,-16,-2,2,9,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-27,-5,3,-23,-18,-14,-13,0,-14,-9,-11,13,-2,-7,-6,-7,-12,-26,-17,-1;
MA   /I: I=-12; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-24,-10,-6,-15,-18,-13,-3,-11,-6,-5,-7,7,-10,-14,-7,-6,-5,-26,-15,-10; D=-12;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-30,-11,-17,-28,55,-19,-34,-17,-26,-16,-2,-17,-16,-18,-2,-18,-26,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-21,10,9,-23,-12,-9,-19,0,-18,-14,5,-10,1,-6,7,8,-13,-31,-16,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-28,2,5,-19,-18,-2,-20,6,-16,-11,1,-3,2,8,-6,-8,-19,-24,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-19,-32,-26,7,-27,-25,24,-24,15,10,-23,-25,-24,-22,-14,-4,26,-20,-1,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-18,-11,-10,-5,-11,-12,-13,-6,-12,-8,-4,-16,-11,-2,0,1,-6,-21,-7,-11;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=tRNA-binding;
CC   /VERSION=5;
PR   PRU00209;
DO   PDOC50886;
//